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中國參與人類基因組計(jì)劃的始末1、人類基因組計(jì)劃是什么人類基因組計(jì)劃HGP(Human Genome Projects),1985年美國科學(xué)家率先提出,1990年正式啟動。美、英、法、德、日和中國科學(xué)家共同參與,總價(jià)值達(dá)30億美元,它旨在為30多億個堿基對構(gòu)成的人類基因組(基因組是一個物種中所有基因的整體組成,人類的基因組約含4萬到10萬個基因,由約30億個堿基對組成,分布在細(xì)胞核的23對染色體中。)精確全基因組測序,從整體水平研究基因的位置、基因的結(jié)構(gòu)與功能和基因互作。全基因組測序(Whole Genome Sequencing),簡稱WGS。“全(whole)”指的就是把物種細(xì)胞里面完整的基因組序列從第1個DNA開始一直到最后一個DNA,完完整整地檢測出來,并排列好,因此這個技術(shù)幾乎能夠鑒定出基因組上任何類型的突變。對于人類來說,全基因組測序的價(jià)值是極大的,它包含了所有基因和生命特征之間的內(nèi)在關(guān)聯(lián)性,技術(shù)含量極高。2、發(fā)起過程l 1984年末,猶他州受美國能源部的委托,主持召開會議,討論DNA重組技術(shù)的發(fā)展及測定人類整個基因組的DNA序列的意義。l 1985年中,美國加州舉行會議,美國科學(xué)家于美國能源部的一次會議中提出HGP草案。 l 1986年中,美國新墨西哥州討論草案的可行性。與此同時,諾貝爾獎獲得者Renato Dulbecco在Science雜志上發(fā)表文章提出“研究人類基因組DNA長達(dá)三億多的堿基對序列,發(fā)現(xiàn)所有人類基因并闡明其在染色體上的位置,以便于在整體上破譯人類遺傳信息”。l 1987年初,美國能源部與國家醫(yī)學(xué)研究院(NIH)撥款550萬美元,年末撥款總額近1.66億美元。同時,美國開始籌建人類基因組計(jì)劃實(shí)驗(yàn)室。l 1989年美國成立“國家人類基因組研究中心”。l 1990年,歷經(jīng)5年辯論之后,美國國會批準(zhǔn)HGP于10月1日正式啟動,擬在15年內(nèi)至少投入30億美元,這項(xiàng)計(jì)劃被譽(yù)為生命科學(xué)界的“登月計(jì)劃”,英法德日相繼參與。l 1993年,美國人類基因組研究中心(CHGR)提出更具體清晰的人類基因組計(jì)劃內(nèi)容:“人類基因組作圖及序列分析;基因的鑒定;基因組研究技術(shù)的建立、創(chuàng)新與改進(jìn);模式生物(主要包括大腸桿菌、酵母、果蠅、線蟲、小鼠、水稻、擬南芥等)基因組的作圖和測序;信息系統(tǒng)的建立,信息的儲存、處理及相應(yīng)的軟件開發(fā);與人類基因組相關(guān)的倫理學(xué)、法學(xué)和社會影響與結(jié)果的研究;研究人員的培訓(xùn);技術(shù)轉(zhuǎn)讓及產(chǎn)業(yè)開發(fā);研究計(jì)劃的外延等幾方面”這些內(nèi)容構(gòu)成了20世紀(jì)到21世紀(jì)最大的系統(tǒng)工程。中國于1999年9月參與,承擔(dān)其中1%的任務(wù),即人類3號染色體短臂上約3000萬個堿基對的測序任務(wù)。中國因此成為參加這項(xiàng)研究計(jì)劃中唯一的發(fā)展中國家。3、主要任務(wù)遺傳圖譜物理圖譜(基因在染色體上的線性排列順序);基因轉(zhuǎn)錄圖譜(編碼序列及其相關(guān)序列表達(dá)模式和調(diào)控的研究);序列圖譜(DNA序列分析技術(shù),有片段分析、堿基分析和翻譯分析)。4、重要意義遺傳病基因研究出現(xiàn)重大突破;后續(xù)出現(xiàn)基因倫理問題,公民更注重于保護(hù)個人及家族基因隱私,防止基因歧視;還有基因?qū)@麊栴},由于人類基因組序列是全人類的共同遺產(chǎn),所以這些序列數(shù)據(jù)是自由共享的不可壟斷的,而新發(fā)現(xiàn)的基因序列應(yīng)用到生產(chǎn)實(shí)踐領(lǐng)域也可以申請相應(yīng)的專利;隨著實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和可利用信息的不斷增加,生物信息學(xué)得以發(fā)展。在研究模式生物,分子實(shí)驗(yàn)機(jī)制等實(shí)驗(yàn)水準(zhǔn)有重大意義;在醫(yī)學(xué)疾病研究、制藥行業(yè)、生物進(jìn)化和生物信息等應(yīng)用生產(chǎn)等方面也有重大意義,在此不再贅述。5、結(jié)果與發(fā)展1999年12月1日,首次完成人體染色體基因完整序列的測定。2000年6月26日,六國科學(xué)家公布人類基因組工作框架圖。2001年2月12日,人類基因組圖譜及初步分析結(jié)果首次公布。2003年4月15日,美、英、德、日、法、中6個國家共同宣布人類基因組序列草圖完成,其中可以應(yīng)用的克隆序列能忠實(shí)地代表常染色體的基因組結(jié)構(gòu),序列錯誤率低于萬分之一,比預(yù)計(jì)提前2年??茖W(xué)家不止一次宣布人類基因組計(jì)劃完工,但推出的均不是全本,2006年5月18日英國自然雜志上發(fā)表了人類最后一個染色體1號染色體的基因測序,它包含的基因數(shù)量最多,共有超過2.23億個堿基對,破譯難度最大。由150名英國和美國科學(xué)家組成的團(tuán)隊(duì)歷時10年,才完成了1號染色體的測序。至此,解讀人體基因密碼的“生命之書”宣告完成。隨后,后基因組時代開始。主要是對功能基因及其相關(guān)模式生物的研究,包括模式生物(包括小鼠、果蠅、線蟲、斑馬魚、酵母等)的基因組計(jì)劃;人類元基因組計(jì)劃(對人體內(nèi)所用共生菌群的基因組進(jìn)行序列測定,并研究與人體發(fā)育和健康相關(guān)基因的功能);國際人類基因組單體型圖計(jì)劃(構(gòu)建人類DNA序列中多態(tài)位點(diǎn)的常見模式,我國參與了10%的測序工作);人類基因組多樣性研究計(jì)劃(對不同人種、民族、人群的基因組進(jìn)行研究和比較)等等而基因與基因間的細(xì)微差異已經(jīng)足以成為能識別群體特異性生物滅絕武器,比如,白種人(高加索人)的基因有的天然存在對艾滋病病毒免疫功能,但在黃種人中還沒有發(fā)現(xiàn)或極為少見。所以在后基因組時代,對已完成基因組測序的物種之間進(jìn)行整體的比較、分析。在整個基因組的規(guī)模上了解基因組和蛋白質(zhì)組的功能意義,結(jié)合生物信息學(xué)會有更大的發(fā)展前景和意義。6、人類基因組計(jì)劃中國部分(1%計(jì)劃)(1)、中國國情中國的基因組研究工作起步晚、基礎(chǔ)差、底子薄并且資金少,與國際上的HGP發(fā)展的驚人速度相比,中間的差距大。(2)、參與過程l 1994年,中國HGP在吳旻、強(qiáng)伯勤、陳竺和楊煥明的倡導(dǎo)下,國家自然科學(xué)基金會和“863”高科技計(jì)劃先后啟動了“中華民族基因組中若干位點(diǎn)基因結(jié)構(gòu)的研究”和“重大疾病相關(guān)基因的定位、克隆、結(jié)構(gòu)和功能研究”。l 1998年,在中國國家科技部的領(lǐng)導(dǎo)下,上海成立了南方基因中心。l 1998年,中國組建了中科院遺傳所。l 1999年,北京成立了北方人類基因組中心。l 1999年6月26日,北方人類基因組中心向美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)的國際人類基因組計(jì)劃(HGP)遞交加入申請。HGP在網(wǎng)上公布中國注冊加入國際測序組織,得到完成人類3號染色體短臂上一個約三千萬個堿基對的測序任務(wù),該區(qū)域約占人類整個基因組的1,標(biāo)志著我國成為繼美、英、日、德、法后第六個加入該組織的國家。l 1999年7月14日,為承擔(dān)1%計(jì)劃,在順義區(qū)政府的支持下,北京華大基因研究中心(華大基因)注冊成立。l 1999年9月1日,國際公共領(lǐng)域測序計(jì)劃接納中國,楊煥明教授領(lǐng)回任務(wù)。l 1999年9月9日,華大基因于上午9時9分9秒在北京空港工業(yè)區(qū)B區(qū)6號樓3層開啟了“1%計(jì)劃”的準(zhǔn)備工作。9月9日亦定為華大基因的慶典日。l 1999年10月1日,在國慶五十周年閱兵儀式開始的同時,1%計(jì)劃的測序儀全面啟動。l 1999年11月10日,1%計(jì)劃被列入國家項(xiàng)目,并確定由華大基因牽頭,國家基因組南方中心、北方中心共同參與。l 1999年11月12日,科技部中國生物工程開發(fā)中心、中科院生命科學(xué)和生物技術(shù)局、“863”計(jì)劃生物領(lǐng)域?qū)<椅瘑T會召開“參加國際人類基因組計(jì)劃并完成1%基因組測序工作”專家討論會,決定“863”計(jì)劃出資3000萬元,中科院出資1000萬元。l 1999年11月29日,科技部下達(dá)對國家人類基因組北、南方研究中心和中國科學(xué)院遺傳所撥款通知,中科院同時下達(dá)專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)。l 2000年4月,中國科學(xué)家宣布:在各方共同努力下,1的測序任務(wù)宣告基本完成,其中50達(dá)到了完成圖的標(biāo)準(zhǔn),中國科學(xué)家在世界上率先拿到了“工作框架圖”。l 2000年6月26日,全部人類基因組的“工作草圖”繪制完畢,提前一年向全世界公布。(3)、參與意義中國承擔(dān)的工作區(qū)域(位于人類3號染色體短臂上),又被稱為“北京區(qū)域”。由于這一區(qū)域約占人類基因組的1,因此中國的HGP簡稱為“1項(xiàng)目”。中國科學(xué)家對“北京區(qū)域”的這一部分進(jìn)行了詳細(xì)分析,共測定了384億個堿基,相當(dāng)于將所負(fù)責(zé)區(qū)域重復(fù)測定12次以上,為按時完成任務(wù),中國科學(xué)家付出了艱辛的努力。大規(guī)模測序正式開始于北京空港工業(yè)區(qū)的一座大樓里,100多人分為兩班,通宵達(dá)旦,停人不停機(jī),每天必須完成20萬個堿基的測序工作。從工作量上看,1的數(shù)量并不算大,但卻意義深遠(yuǎn)。它代表著中國科學(xué)家在這個劃時代的里程碑上,已經(jīng)刻上了中國人的名字,1任務(wù)的完成對中國后續(xù)的其他基因組測序有很大的幫助,比如后來的水稻基因組測序。人類基因組計(jì)劃中還包括若干個模式生物體基因組計(jì)劃,中國重點(diǎn)支持的水稻基因組研究計(jì)劃亦可劃入這一范疇。模式生物體一直就是生命科學(xué)領(lǐng)域研究的基本模型,它們與人類相比基因組結(jié)構(gòu)簡單、單位DNA長度上基因密度高,易于基因的識別。各模式生物體之間的比較性研究將有助于人類基因的結(jié)構(gòu)與功能的闡明。對于在整體水平研究基因的功能,模式生物體地位重要。1999年9月,中國的積極加入成為參與HGP唯一的發(fā)展中國家。作為唯一的發(fā)展中國家,中國的參與使人類基因組計(jì)劃真正成為一項(xiàng)國際合作計(jì)劃,通過參與這一國際合作,中國建立了自己的基因組大規(guī)模測序的全套技術(shù)及科學(xué)技術(shù)隊(duì)伍,為今后生物資源基因組研究奠定了基礎(chǔ)。中國雖然參與時間最晚,但基因組測序能力在當(dāng)年的六個國家中可以名列第四。這向全世界證明:只要目標(biāo)集中,措施有力,中國科學(xué)家有能力參與國際重大科技合作研究,躋身于國際生命科學(xué)前沿,并作出重要貢獻(xiàn)。(4)、前期鋪墊和后續(xù)發(fā)展中國1994年啟動基因測序,現(xiàn)已完成南北方兩個漢族人群和西南、東北地區(qū)12個少數(shù)民族共733個永生細(xì)胞系的建立,這給中華民族的基因研究提供了寶貴的資源,并在多民族基因組多樣性的研究中取得了成就,在致病基因研究中也有所發(fā)現(xiàn)。定名為中華民族基因組結(jié)構(gòu)和功能研究的HGP是“九五”國家最大的資助研究項(xiàng)目之一(700萬元),為中國在21世紀(jì)國際HGP科學(xué)的新一輪競爭中占據(jù)了優(yōu)勢。中國人類基因組學(xué)主要研究的是中華民族的人群,主要是源于6個不同的語系(漢藏、苗瑤、侗傣、阿爾泰、南亞、南島)的56個民族(漢族和55 個正式確定的少數(shù)民族),其中漢族占93.6%,少數(shù)民族大多數(shù)居住于邊疆地區(qū)。中國人群的遺傳學(xué)關(guān)系主要成果:證實(shí)中國人群可分為南、北兩大組,兩者之間有明顯的基因融匯;提出了東亞現(xiàn)代智人可能起源于東南亞、而且與其他各大洲一樣都起源于十至二十萬年前“走出非洲”的群體的觀點(diǎn)。為了縮小差距,中國生命科學(xué)界開始覺醒并提出如下幾點(diǎn):一、盡快收集和利用中國寶貴的多民族基因組資源和遺傳病家系材料,并阻止這些資源盲目流向國外。二、集中人力、物力和財(cái)力,建立互相配套的、集分子遺傳學(xué)、自動化技術(shù)和信息技術(shù)為一體的中心,有效地開展基因測學(xué)工作。三、根據(jù)國情和工作基礎(chǔ),直接進(jìn)行基因組研究中最為關(guān)鍵的部分基因測序識別。同時,由于基因組DNA測序是一項(xiàng)勞動和技能密集性工作,要引進(jìn)技術(shù),培訓(xùn)一支高水平的技術(shù)隊(duì)伍,完全有可能將人類基因組測序的一部分工作吸引到中國。四、充分利用國際基因數(shù)據(jù)庫信息,建立生物信息技術(shù),推進(jìn)中國基因組研究工作,并在基因組轉(zhuǎn)錄順序的認(rèn)識及基因功能推測方面多做工作。五、多渠道籌措資金,在維護(hù)知識產(chǎn)權(quán)的前提下開展國際間合作。在承擔(dān)HGP1%任務(wù)和國際人類單體型圖譜10%任務(wù)之后,中國又開啟了“炎黃一號”計(jì)劃,這是全球第一例中國人標(biāo)準(zhǔn)基因組序列圖譜,也是全球20億黃種人的第一個個人基因序列圖。該項(xiàng)目完成于2007年10月11日,是中國科學(xué)家用新一代測序技術(shù)獨(dú)立完成的100%中國人基因組圖譜。7、總結(jié)人類基因組計(jì)劃是與曼哈頓原子計(jì)劃、阿波羅登月計(jì)劃并稱得人類科學(xué)史上的重大工程。以上這些內(nèi)容只是本人對于中國參與HGP進(jìn)程的一個大致描述,鄙人才疏學(xué)淺,對于其中的具體內(nèi)容未求甚解,僅是百度查閱幾篇文章之后便草草總結(jié)出這些,我的工作肯定還有不足之處,還望老師見諒,但是我通過這些資料的整理,覺得開創(chuàng)這番事業(yè)的科學(xué)工作者們真是了不起,體會到過去二十年的科學(xué)探索歷程實(shí)屬不易,更感生物科學(xué)任重道遠(yuǎn)。(98年我才剛出生)特別引人關(guān)注的是繼美、英、德、日、法之后,中國是參與最
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