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第二部分各章節(jié)習(xí)題及答案蛋白質(zhì)和氨基酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)1、氨基酸的側(cè)鏈對(duì)多肽或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能非常重要。用三字母和單字母縮寫(xiě)形式列出其側(cè)鏈為如下要求的氨基酸:(a)含有一個(gè)羥基。(b)含有一個(gè)氨基。(c)含有一個(gè)具有芳香族性質(zhì)的基團(tuán)。(d)含有分支的脂肪族烴鏈。(e)含有硫。(f)含有一個(gè)在 pH 710 范圍內(nèi)可作為親核體的基團(tuán)或原子,指出該親核基團(tuán)或原子。答:(a)Ser(S), Thr(T),Tyr(Y)(b)Asn(N), Gln(Q) ,Arg(R) ,Lys(K)(c)Phe(F), Trp(W), Tyr(Y),(d)Ile(I), Leu(L), Val(V)(e)Cys(C), Met(M)(f)可以作為親核試劑的側(cè)鏈基團(tuán)或原子有位于 Ser(S),Thr(T)和 Tyr(Y)中的-OH;位于 Cys(C)和 Met(M)中的硫原子,位于 Asp(D)和 Glu(E)中的-COO-;以及位于 His(H)和 Lys(k)中的氮原子。2、一種氨基酸的可解離基團(tuán)可以帶電或中性狀態(tài)存在,這取決于它的 pK 值和溶液的 pH。(a)組氨酸有 3 種可解離基團(tuán),寫(xiě)出相應(yīng)于每個(gè) pK 值的 3 種解離狀態(tài)的平衡方程式。每種解離狀態(tài)下的組氨酸分子的凈電荷是多少?(b)在 pH1、4、8 和 12 時(shí),組氨酸的凈電荷分別是多少?將每一 pH 下的組氨酸置于電場(chǎng)中,它們將向陰極還是陽(yáng)極遷移?答: (a) 、 (b) 見(jiàn)圖3、某種溶液中含有三種三肽:Tyr - Arg - Ser , Glu - Met - Phe 和 Asp - Pro - Lys , - COOH 基團(tuán)的 pKa 為 3.8; -NH3 基團(tuán)的 pKa為 8.5。在哪種 pH(2.0,6.0 或 13.0)下,通過(guò)電泳分離這三種多肽的效果最好?答:pH=6.0 比 pH=2.0 或 pH=13.0 時(shí)電泳能提供更好的分辨率。因?yàn)樵?pH6.0 的條件下每種肽都帶有不同的凈電荷(+1,-1,和 0),而在 pH2.0 的條件下凈電荷分別為+2,+1 和+2,在 pH13.0 的條件下凈電荷分別為-2,-2 和-2。4、利用陽(yáng)離子交換層析分離下列每一對(duì)氨基酸,哪一種氨基酸首先被 pH7 緩沖液從離子交換柱上洗脫出來(lái)。 (a)Asp 和 Lys(b)Arg 和Met(c)Glu 和 Val(d)Gly 和 Leu(e)Ser和 Ala答:(a)Asp(b)Met(c)Glu(d)Gly(e)Ser5、氨基酸的定量分析表明牛血清白蛋白含有0.58的色氨酸(色氨酸的分子量為 204) 。(a)試計(jì)算牛血清白蛋白的最小分子量(假設(shè)每個(gè)蛋白分子只含有一個(gè)色氨酸殘基) 。(b)凝膠過(guò)濾測(cè)得的牛血清白蛋白的分子量為70,000,試問(wèn)血清白蛋白分子含有幾個(gè)色氨酸殘基?答:(a)32,100g/mol(b)26、胃液(pH1.5)的胃蛋白酶的等電點(diǎn)約為 1,遠(yuǎn)比其它蛋白質(zhì)低。試問(wèn)等電點(diǎn)如此低的胃蛋白酶必須存在有大量的什么樣的官能團(tuán)?什么樣的氨基酸才能提供這樣的基團(tuán)?答:COO; Asp, Glu7、已知某蛋白是由一定數(shù)量的鏈內(nèi)二硫鍵連接的兩個(gè)多肽鏈組成的。1.00g 該蛋白樣品可以與25.0mg 還原型谷胱甘肽(GSH,MW307)反應(yīng)。(a)該蛋白的最小分子量是多少?(b)如果該蛋白的真實(shí)分子量為 98240,那么每分子中含有幾個(gè)二硫鍵?(c)多少 mg 的巰基乙醇(MW78.0)可以與起始的 1.00g 該蛋白完全反應(yīng)?答:(a)MW24560;(b)4 個(gè)二硫鍵;(c)6.35mg8、一個(gè)含有 13 個(gè)氨基酸殘基的十三肽的氨基酸組成為:Ala, Arg,2 Asp, 2Glu, 3Gly, Leu, 3Val。部分酸水解后得到以下肽段,其序列由Edman 降解確定,試推斷原始寡肽的序列。(a)Asp - Glu - Val - Gly - Gly - Glu - Ala(b)Val - Asp - Val - Asp - Glu(c)Val - Asp - Val(d)Glu - Ala -Leu - Gly -Arg(e)Val - Gly - Gly - Glu - Ala - Leu (f)Leu - Gly Arg答:該肽鏈的序列可以通過(guò)將肽片段的相同序列重疊排列起來(lái)獲得整個(gè)序列。見(jiàn)圖9、下列試劑和酶常用于蛋白質(zhì)化學(xué)的研究中: CNBr 異硫氰酸苯酯 丹黃酰氯 脲 6mol/LHCl -巰基乙醇 水合茚三酮 過(guò)甲酸 胰蛋白酶 胰凝乳蛋白酶,其中哪一個(gè)最適合完成以下各項(xiàng)任務(wù)?(a)測(cè)定小肽的氨基酸序列。(b)鑒定肽的氨基末端殘基。(c)不含二硫鍵的蛋白質(zhì)的可逆變性。若有二硫鍵存在時(shí)還需加什么試劑?(d)在芳香族氨基酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(e)在蛋氨酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(f)在賴(lài)氨酸和精氨酸殘基側(cè)水解肽鍵。答:(a)異硫氰酸苯酯。 (b)丹黃酰氯。(c)脲;-巰基乙醇還原二硫鍵。 (d)胰凝乳蛋白酶。 (e)CNBr。 (f)胰蛋白酶10、由下列信息求八肽的序列。(a)酸水解得 Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val(b)Sanger 試劑處理得 DNP-Ala。(c)胰蛋白酶處理得 Ala,Arg,Thr 和 Leu,Met,Phe,2Val。當(dāng)以 Sanger 試劑處理時(shí)分別得到 DNP-Ala 和 DNP-Val。(d)溴化氰處理得 Ala,Arg,高絲氨酸內(nèi)酯,Thr,2Val,和 Leu,Phe,當(dāng)用 Sanger 試劑處理時(shí),分別得 DNP-Ala 和 DNP-Leu。答:Ala-Thr-Arg-Val-Val-Met-Leu-Phe蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)和功能1、在結(jié)晶肽的 X-射線(xiàn)研究中,Linus Pauling 和Robert corey 發(fā)現(xiàn)肽鏈中的肽鍵(C-N)長(zhǎng)度(1.32A)介于典型的 C-N 單鍵(1.49A)和 C=N雙鍵(1.27A)之間。他們也發(fā)現(xiàn)肽鍵呈平面狀(與肽鍵相連接的 4 個(gè)原子位于同一個(gè)平面)以及兩個(gè)碳原子彼此呈反式(位于肽鍵的兩側(cè))與肽鍵連接。(a)肽鍵的長(zhǎng)度與它的鍵的強(qiáng)度和鍵級(jí)(是單鍵、雙鍵或三鍵)有什么關(guān)系?(b)從 Pauling 等人的觀(guān)察,就肽鍵旋轉(zhuǎn)能得出什么看法?答:(a)鍵越短其強(qiáng)度越高,而且其鍵級(jí)越高(在單鍵以上) 。肽鍵的強(qiáng)度比單鍵強(qiáng),鍵的特性介于單鍵和雙鍵之間。 (b)在生理溫度下,肽鍵旋轉(zhuǎn)比較困難,因?yàn)樗胁糠蛛p鍵特性。2、羊毛衫等羊毛制品在熱水中洗后在電干燥器內(nèi)干燥,則收縮。但絲制品進(jìn)行同樣處理,卻不收縮。如何解釋這兩種現(xiàn)象?答: 羊毛纖維多肽鏈的主要結(jié)構(gòu)單位是連續(xù)的 -螺旋圈,其螺距為 5.4A。當(dāng)處于熱水(或蒸汽)環(huán)境下,使纖維伸展為具有 -折疊構(gòu)象的多肽鏈。在 -折疊構(gòu)象中相鄰 R 基團(tuán)之間的距離是7.0A。當(dāng)干燥后,多肽鏈重新由 折疊轉(zhuǎn)化為 螺旋構(gòu)象,所以羊毛收縮了。而絲制品中的主要成分是絲心蛋白,它主要是由呈現(xiàn) 折疊構(gòu)象的多肽鏈組成的,絲中的 -折疊含有一些小的、包裝緊密的氨基酸側(cè)鏈,所以比羊毛中的 -螺旋更穩(wěn)定,水洗和干燥其構(gòu)象基本不變。3、人的頭發(fā)每年以 15 至 20cm 的速度生長(zhǎng),頭發(fā)主要是 角蛋白纖維,是在表皮細(xì)胞的里面合成和組裝成繩子。 角蛋白的基本結(jié)構(gòu)單元是 -螺旋。如果 -螺旋的生物合成是頭發(fā)生長(zhǎng)的限速因素,計(jì)算 -螺旋鏈的肽鍵以什么樣的速度(每秒鐘)合成才能解釋頭發(fā)每年的生長(zhǎng)長(zhǎng)度?答:每秒鐘大約需合成 43 個(gè)肽鍵。 (要考慮到 -螺旋的每一圈含有 3.6 個(gè)氨基酸殘基,螺距為0.54nm) 。4、合成的多肽多聚谷氨酸(Glu)n ) ,當(dāng)處在pH3.0 以下時(shí),在水溶液中形成 螺旋,而在pH5.0 以上時(shí)卻為伸展的形態(tài)。(a)試解釋該現(xiàn)象。(b)在哪種 PH 條件下多聚賴(lài)氨酸(Lys)會(huì)形成 -螺旋?答:(a)由可離子化側(cè)鏈的氨基酸殘基構(gòu)成的-螺旋對(duì) pH 值的變化非常敏感,因?yàn)槿芤旱膒H 值決定了側(cè)鏈?zhǔn)欠駧в须姾?,由單一一種氨基酸構(gòu)成的聚合物只有當(dāng)側(cè)鏈不帶電荷時(shí)才能形成 -螺旋,相鄰殘基的側(cè)鏈上帶有同種電荷會(huì)產(chǎn)生靜電排斥力從而阻止多肽鏈堆積成 -螺旋構(gòu)象。Glu 側(cè)鏈的 pKa 約為 4.1,當(dāng) pH 值遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于 4.1(大約 3 左右)時(shí),幾乎所有的多聚谷氨酸側(cè)鏈為不帶電荷的狀態(tài),多肽鏈能夠形成 -螺旋。在 pH 值為 5 或更高時(shí),幾乎所有的側(cè)鏈都帶負(fù)電荷,鄰近電荷之間的靜電排斥力阻止螺旋的形成,因此使同聚物呈現(xiàn)出一種伸展的構(gòu)象。(b)Lys 側(cè)鏈的 pK 為 10.5,當(dāng) pH 值遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于10.5 時(shí),多聚賴(lài)氨酸大多數(shù)側(cè)鏈為不帶電荷的狀態(tài),該多肽可能形成一種 -螺旋構(gòu)象,在較低的 pH 值時(shí)帶有許多正電荷的分子可能會(huì)呈現(xiàn)出一種伸展的構(gòu)象。5、一個(gè) -螺旋片段含有 180 個(gè)氨基酸殘基,該片段中有多少圈螺旋?計(jì)算該 -螺旋片段的軸長(zhǎng)。答:該片段中含有 50 圈螺旋,其軸長(zhǎng)為27nm。6、如何用二氧化碳與水的反應(yīng)來(lái)解釋 Bohr 效應(yīng)?(a)寫(xiě)出由二氧化碳和水形成碳酸氫根的方程式,并解釋 H和 CO2在血紅蛋白氧合中的作用。(b)解釋向休克病人靜脈注射碳酸氫根的生理學(xué)依據(jù)。答:二氧化碳與水的反應(yīng)說(shuō)明了為什么當(dāng) CO2的濃度增加時(shí),同時(shí)會(huì)引起 pH 值下降,迅速進(jìn)行新陳代謝的組織所產(chǎn)生的 CO2pI 時(shí),氨基酸以_離子形式存在。22谷氨酸的 pK1(-COOH)2.19, pK2 (-NH+3 ) = 9.67, pKR(R 基)= 4.25,谷氨酸的等電點(diǎn)為_(kāi)。23天然蛋白質(zhì)中的 螺旋結(jié)構(gòu),其主鏈上所有的羰基氧與亞氨基氫都參與了鏈內(nèi)_鍵的形成,因此構(gòu)象相當(dāng)穩(wěn)定。24將分子量分別為 a(90 000) 、b(45 000) 、c(110 000)的三種蛋白質(zhì)混合溶液進(jìn)行凝膠過(guò)濾層析,它們被洗脫下來(lái)的先后順序是_。25肌紅蛋白的含鐵量為 0.34%,其最小分子量是_.血紅蛋白的含鐵量也是 0.34%,但每分子含有 4 個(gè)鐵原子,血紅蛋白的分子量是_.26一個(gè) -螺旋片段含有 180 個(gè)氨基酸殘基,該片段中有_圈螺旋?該 -螺旋片段的軸長(zhǎng)為_(kāi).二選擇題1在生理 pH 條件下,下列哪種氨基酸帶正電荷?A丙氨酸 B酪氨酸 C賴(lài)氨酸 D蛋氨酸 E異亮氨酸2下列氨基酸中哪一種是非必需氨基酸?A亮氨酸 B酪氨酸 C賴(lài)氨酸 D蛋氨酸 E蘇氨酸3蛋白質(zhì)的組成成分中,在 280nm 處有最大吸收值的最主要成分是:A酪氨酸的酚環(huán) B半胱氨酸的硫原子 C肽鍵 D苯丙氨酸4下列 4 種氨基酸中哪個(gè)有堿性側(cè)鏈?A脯氨酸 B苯丙氨酸 C異亮氨酸 D賴(lài)氨酸5下列哪種氨基酸屬于亞氨基酸?A絲氨酸 B脯氨酸 C亮氨酸 D組氨酸6下列哪一項(xiàng)不是蛋白質(zhì) -螺旋結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)?A天然蛋白質(zhì)多為右手螺旋 B肽鏈平面充分伸展C每隔 3.6 個(gè)氨基酸螺旋上升一圈。 D每個(gè)氨基酸殘基上升高度為 0.15nm.7下列哪一項(xiàng)不是蛋白質(zhì)的性質(zhì)之一?A處于等電狀態(tài)時(shí)溶解度最小 B加入少量中性鹽溶解度增加C變性蛋白質(zhì)的溶解度增加 D有紫外吸收特性8下列氨基酸中哪一種不具有旋光性?ALeu BAla CGly DSer EVal9在下列檢測(cè)蛋白質(zhì)的方法中,哪一種取決于完整的肽鏈?A凱氏定氮法 B雙縮尿反應(yīng) C紫外吸收法 D茚三酮法10下列哪種酶作用于由堿性氨基酸的羧基形成的肽鍵?A糜蛋白酶 B羧肽酶 C氨肽酶 D胰蛋白酶11下列有關(guān)蛋白質(zhì)的敘述哪項(xiàng)是正確的?A蛋白質(zhì)分子的凈電荷為零時(shí)的 pH 值是它的等電點(diǎn) B大多數(shù)蛋白質(zhì)在含有中性鹽的溶液中會(huì)沉淀析出C由于蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)時(shí)溶解度最大,所以沉淀蛋白質(zhì)時(shí)應(yīng)遠(yuǎn)離等電點(diǎn) D以上各項(xiàng)均不正確12下列關(guān)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的敘述,哪一項(xiàng)是錯(cuò)誤的?A氨基酸的疏水側(cè)鏈很少埋在分子的中心部位 B電荷的氨基酸側(cè)鏈常在分子的外側(cè),面向水相C白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)在決定高級(jí)結(jié)構(gòu)方面是重要因素之一 D白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)主要靠次級(jí)鍵維持13列哪些因素妨礙蛋白質(zhì)形成 -螺旋結(jié)構(gòu)?A脯氨酸的存在 B氨基酸殘基的大的支鏈 C性氨基酸的相鄰存在 D性氨基酸的相鄰存在 E以上各項(xiàng)都是14于 -折疊片的敘述,下列哪項(xiàng)是錯(cuò)誤的?A-折疊片的肽鏈處于曲折的伸展?fàn)顟B(tài) B的結(jié)構(gòu)是借助于鏈內(nèi)氫鍵穩(wěn)定的C有的 -折疊片結(jié)構(gòu)都是通過(guò)幾段肽鏈平行排列而形成的 D基酸之間的軸距為 0.35nm15持蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要作用力是:A鹽鍵 B疏水鍵 C氫鍵 D二硫鍵16維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素是:A肽鍵 B二硫鍵 C離子鍵 D氫鍵 E次級(jí)鍵17凝膠過(guò)濾法分離蛋白質(zhì)時(shí),從層析柱上先被洗脫下來(lái)的是:A分子量大的 B分子量小的 C電荷多的 D帶電荷少的18. 下列哪項(xiàng)與蛋白質(zhì)的變性無(wú)關(guān)?A. 肽鍵斷裂 B氫鍵被破壞 C離子鍵被破壞 D疏水鍵被破壞19蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的特征主要取決于下列哪一項(xiàng)?A多肽鏈中氨基酸的排列順序 B次級(jí)鍵C鏈內(nèi)及鏈間的二硫鍵 D溫度及 pH20下列哪個(gè)性質(zhì)是氨基酸和蛋白質(zhì)所共有的?A膠體性質(zhì) B兩性性質(zhì) C沉淀反應(yīng) D變性性質(zhì) E雙縮脲反應(yīng)21氨基酸在等電點(diǎn)時(shí)具有的特點(diǎn)是:A不帶正電荷 B不帶負(fù)電荷 CA 和 B D溶解度最大E在電場(chǎng)中不泳動(dòng)22蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指:A蛋白質(zhì)氨基酸的種類(lèi)和數(shù)目 B蛋白質(zhì)中氨基酸的排列順序C蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的折疊和盤(pán)繞 D包括 A,B 和 C三是非判斷題( ) 1氨基酸與茚三酮反應(yīng)都產(chǎn)生藍(lán)紫色化合物。( ) 2因?yàn)轸然己蛠啺被g的部分雙鍵性質(zhì),所以肽鍵不能自由旋轉(zhuǎn)。( ) 3所有的蛋白質(zhì)都有酶活性。( ) 4-碳和羧基碳之間的鍵不能自由旋轉(zhuǎn)。( ) 5多數(shù)氨基酸有 D-和 L-兩種不同構(gòu)型,而構(gòu)型的改變涉及共價(jià)鍵的破裂。( ) 6所有氨基酸都具有旋光性。( ) 7構(gòu)成蛋白質(zhì)的 20 種氨基酸都是必需氨基酸。( ) 8蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序在很大程度上決定了它的構(gòu)象。( ) 9一氨基一羧基氨基酸的 pI 為中性,因?yàn)?COOH 和-NH2 的解離度相同。( ) 10蛋白質(zhì)的變性是蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)的破壞,因此涉及肽鍵的斷裂。( ) 11蛋白質(zhì)是生物大分子,但并不都具有四級(jí)結(jié)構(gòu)。( ) 12血紅蛋白和肌紅蛋白都是氧的載體,前者是一個(gè)典型的變構(gòu)蛋白,在與氧結(jié)合過(guò)程中呈現(xiàn)變構(gòu)效應(yīng),而后者卻不是。( ) 13.用 FDNB 法和 Edman 降解法測(cè)定蛋白質(zhì)多肽鏈 N-端氨基酸的原理是相同的。( ) 14并非所有構(gòu)成蛋白質(zhì)的 20 種氨基酸的-碳原子上都有一個(gè)自由羧基和一個(gè)自由氨基。( ) 15蛋白質(zhì)是兩性電解質(zhì),它的酸堿性質(zhì)主要取決于肽鏈上可解離的 R 基團(tuán)。( ) 16在具有四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子中,每個(gè)具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈?zhǔn)且粋€(gè)亞基。( ) 17所有的肽和蛋白質(zhì)都能和硫酸銅的堿性溶液發(fā)生雙縮尿反應(yīng)。( ) 18一個(gè)蛋白質(zhì)分子中有兩個(gè)半胱氨酸存在時(shí),它們之間可以形成兩個(gè)二硫鍵。( ) 19鹽析法可使蛋白質(zhì)沉淀,但不引起變性,所以鹽析法常用于蛋白質(zhì)的分離制備。( ) 20蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)就是它的三級(jí)結(jié)構(gòu)。( ) 21維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)最重要的作用力是氫鍵。( )22具有四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),它的每個(gè)亞基單獨(dú)存在時(shí)仍能保存蛋白質(zhì)原有的生物活性。( )23變性蛋白質(zhì)的溶解度降低,是由于中和了蛋白質(zhì)分子表面的電荷及破 壞了外層的水膜所引起的。( )24蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的,肽鏈上每個(gè)肽鍵都參與氫鍵的形成。四問(wèn)答題1什么是蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)?為什么說(shuō)蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)決定其空間結(jié)構(gòu)?2什么是蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)?蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與其生物功能有何關(guān)系?3蛋白質(zhì)的 螺旋結(jié)構(gòu)有何特點(diǎn)?4蛋白質(zhì)的 折疊結(jié)構(gòu)有何特點(diǎn)?5舉例說(shuō)明蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與其功能之間的關(guān)系。6什么是蛋白質(zhì)的變性作用和復(fù)性作用?蛋白質(zhì)變性后哪些性質(zhì)會(huì)發(fā)生改變?7簡(jiǎn)述蛋白質(zhì)變性作用的機(jī)制。8蛋白質(zhì)有哪些重要功能9下列試劑和酶常用于蛋白質(zhì)化學(xué)的研究中:CNBr、異硫氰酸苯酯、丹黃酰氯、脲、6mol/L HCl、-巰基乙醇、水合茚三酮、過(guò)甲酸、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶。其中哪一個(gè)最適合完成以下各項(xiàng)任務(wù)?(1)測(cè)定小肽的氨基酸序列。(2)鑒定肽的氨基末端殘基。(3)不含二硫鍵的蛋白質(zhì)的可逆變性;如有二硫鍵存在時(shí)還需加什么試劑?(4)在芳香族氨基酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(4)在蛋氨酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。(5)在賴(lài)氨酸和精氨酸殘基羧基側(cè)水解肽鍵。10根據(jù)蛋白質(zhì)一級(jí)氨基酸序列可以預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)。假設(shè)有下列氨基酸序列(如圖):1 5 10 15 Ile-Ala-His-Thr-Tyr-Gly-Pro-Glu-Ala-Ala-Met-Cys-Lys-Try-Glu-Ala-Gln-20 25 27Pro-Asp-Gly-Met-Glu-Cys-Ala-Phe-His-Arg(1)預(yù)測(cè)在該序列的哪一部位可能會(huì)出彎或 -轉(zhuǎn)角。(2)何處可能形成鏈內(nèi)二硫鍵?(3)假設(shè)該序列只是大的球蛋白的一部分,下面氨基酸殘基中哪些可能分布在蛋白的外表面,哪些分布在內(nèi)部?天冬氨酸;異亮氨酸;蘇氨酸;纈氨酸;谷氨酰胺;賴(lài)氨酸參考答案:(一)名詞解釋1兩性離子:指在同一氨基酸分子上含有等量的正負(fù)兩種電荷,又稱(chēng)兼性離子或偶極離子。2必需氨基酸:指人體(和其它哺乳動(dòng)物)自身不能合成,機(jī)體又必需,需要從飲食中獲得的氨基酸。3. 氨基酸的等電點(diǎn):指氨基酸的正離子濃度和負(fù)離子濃度相等時(shí)的 pH 值,用符號(hào) pI 表示。4稀有氨基酸:指存在于蛋白質(zhì)中的 20 種常見(jiàn)氨基酸以外的其它罕見(jiàn)氨基酸,它們是正常氨基酸的衍生物。5非蛋白質(zhì)氨基酸:指不存在于蛋白質(zhì)分子中而以游離狀態(tài)和結(jié)合狀態(tài)存在于生物體的各種組織和細(xì)胞的氨基酸。6構(gòu)型:指在立體異構(gòu)體中不對(duì)稱(chēng)碳原子上相連的各原子或取代基團(tuán)的空間排布。構(gòu)型的轉(zhuǎn)變伴隨著共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。7蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。8構(gòu)象:指有機(jī)分子中,不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周?chē)脑有D(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí),不涉及共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會(huì)改變分子的光學(xué)活性。 9蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu):指在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤(pán)繞和折疊的方式。10結(jié)構(gòu)域:指蛋白質(zhì)多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步卷曲折疊成幾個(gè)相對(duì)獨(dú)立的近似球形的組裝體。11蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級(jí)鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。12氫鍵:指負(fù)電性很強(qiáng)的氧原子或氮原子與 N-H或 O-H 的氫原子間的相互吸引力。13蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu):指多亞基蛋白質(zhì)分子中各個(gè)具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。14離子鍵:帶相反電荷的基團(tuán)之間的靜電引力,也稱(chēng)為靜電鍵或鹽鍵。15超二級(jí)結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)分子中相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單位組合在一起所形成的有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。16疏水鍵:非極性分子之間的一種弱的、非共價(jià)的相互作用。如蛋白質(zhì)分子中的疏水側(cè)鏈避開(kāi)水相而相互聚集而形成的作用力。17范德華力:中性原子之間通過(guò)瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子間的力。當(dāng)兩個(gè)原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時(shí),范德華力最強(qiáng)。18鹽析:在蛋白質(zhì)溶液中加入一定量的高濃度中性鹽(如硫酸氨) ,使蛋白質(zhì)溶解度降低并沉淀析出的現(xiàn)象稱(chēng)為鹽析。19鹽溶:在蛋白質(zhì)溶液中加入少量中性鹽使蛋白質(zhì)溶解度增加的現(xiàn)象。20蛋白質(zhì)的變性作用:蛋白質(zhì)分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機(jī)溶劑以及一些變性劑的作用時(shí),次級(jí)鍵遭到破壞導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,但其一級(jí)結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變。21蛋白質(zhì)的復(fù)性:指在一定條件下,變性的蛋白質(zhì)分子恢復(fù)其原有的天然構(gòu)象并恢復(fù)生物活性的現(xiàn)象。22蛋白質(zhì)的沉淀作用:在外界因素影響下,蛋白質(zhì)分子失去水化膜或被中和其所帶電荷,導(dǎo)致溶解度降低從而使蛋白質(zhì)變得不穩(wěn)定而沉淀的現(xiàn)象稱(chēng)為蛋白質(zhì)的沉淀作用。23凝膠電泳:以凝膠為介質(zhì),在電場(chǎng)作用下分離蛋白質(zhì)或核酸等分子的分離純化技術(shù)。24層析:按照在移動(dòng)相(可以是氣體或液體)和固定相(可以是液體或固體)之間的分配比例將混合成分分開(kāi)的技術(shù)。(二)填空題1 氨;羧基; 2 16 ;6.25 3 谷氨酸;天冬氨酸;絲氨酸;蘇氨酸4 苯丙氨酸;酪氨酸;色氨酸;紫外吸收 5 負(fù)極 6 組氨酸;半胱氨酸;蛋氨酸 7 -螺旋結(jié)構(gòu);-折疊結(jié)構(gòu)8 C=O;N=H;氫;0.54nm; 3.6;0.15nm;右9 脯氨酸;羥脯氨酸 10極性;疏水性 11藍(lán)紫色;脯氨酸12肽鍵;二硫鍵;氫鍵;次級(jí)鍵;氫鍵;離子鍵;疏水鍵;范德華力13表面的水化膜;同性電荷 14谷胱甘肽;巰基15增加;鹽溶;減??;沉淀析出;鹽析;蛋白質(zhì)分離16帶電荷量;分子大小;分子形狀;方向;速率 17兩性離子;最小 18FDNB 法(2,4-二硝基氟苯法) ;Edman 降解法(苯異硫氫酸酯法)19沉降法;凝膠過(guò)濾法;SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法(SDS-PAGE 法)20不動(dòng);向正極移動(dòng);向負(fù)極移動(dòng); 21兩性離子;負(fù);223.2223氫鍵;24C;a;b 2516 672; 66 687; 2650 圈;27nm(三) 選擇題1D:5 種氨基酸中只有賴(lài)氨酸為堿性氨基酸,其等電點(diǎn)為 9.74,大于生理 pH 值,所以帶正電荷。2B:人(或哺乳動(dòng)物)的必需氨基酸包括賴(lài)氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、蘇氨酸 8 種,酪氨酸不是必需氨基酸。3A:酪氨酸和苯丙氨酸在 280nm 處的克分子消光系數(shù)分別為 540 何 120,所以酪氨酸比苯丙氨酸有較大吸收,而且大多數(shù)蛋白質(zhì)中都含有酪氨酸。肽鍵的最大吸收在 215nm,半胱氨酸的硫原子在280nm 和 215nm 均無(wú)明顯吸收。4D:在此 4 種氨基酸中,只有賴(lài)氨酸的 R 基團(tuán)可接受氫質(zhì)子,作為堿,而其它 3 種氨基酸均無(wú)可解離的 R 側(cè)鏈。5B:氨基酸的 -碳上連接的是亞氨基而不是氨基,所以實(shí)際上屬于一種亞氨基酸,而其它氨基酸的 -碳上都連接有氨基,是氨基酸。6B:天然蛋白質(zhì)的 -螺旋結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)是,肽鏈圍繞中心軸旋轉(zhuǎn)形成螺旋結(jié)構(gòu),而不是充分伸展的結(jié)構(gòu)。另外在每個(gè)螺旋中含有 3.6 個(gè)氨基酸殘基,螺距為 0.54nm,每個(gè)氨基酸殘基上升高度為0.15nm,所以 B 不是 -螺旋結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)。7C:蛋白質(zhì)處于等電點(diǎn)時(shí),凈電荷為零,失去蛋白質(zhì)分子表面的同性電荷互相排斥的穩(wěn)定因素,此時(shí)溶解度最??;加入少量中性鹽可增加蛋白質(zhì)的溶解度,即鹽溶現(xiàn)象;因?yàn)榈鞍踪|(zhì)中含有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸,所以具有紫外吸收特性;變性蛋白質(zhì)的溶解度減小而不是增加,因?yàn)榈鞍踪|(zhì)變性后,近似于球狀的空間構(gòu)象被破壞,變成松散的結(jié)構(gòu),原來(lái)處于分子內(nèi)部的疏水性氨基酸側(cè)鏈暴露于分子表面,減小了與水分子的作用,從而使蛋白質(zhì)溶解度減小并沉淀。8C:甘氨酸的 -碳原子連接的 4 個(gè)原子和基團(tuán)中有 2 個(gè)是氫原子,所以不是不對(duì)稱(chēng)碳原子,沒(méi)有立體異構(gòu)體,所以不具有旋光性。9B:雙縮脲反應(yīng)是指含有兩個(gè)或兩個(gè)以上肽鍵的化合物(肽及蛋白質(zhì))與稀硫酸銅的堿性溶液反應(yīng)生成紫色(或青紫色)化合物的反應(yīng),產(chǎn)生顏色的深淺與蛋白質(zhì)的含量成正比,所以可用于蛋白質(zhì)的定量測(cè)定。茚三酮反應(yīng)是氨基酸的游離的 -NH 與茚三酮之間的反應(yīng);凱氏定氮法是測(cè)定蛋白質(zhì)消化后產(chǎn)生的氨;紫外吸收法是通過(guò)測(cè)定蛋白質(zhì)的紫外消光值定量測(cè)定蛋白質(zhì)的方法,因?yàn)榇蠖鄶?shù)蛋白質(zhì)都含有酪氨酸,有些還含有色氨酸或苯丙氨酸,這三種氨基酸具有紫外吸收特性,所以紫外吸收值與蛋白質(zhì)含量成正比。10D:靡蛋白酶即胰凝乳蛋白酶作用于酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸的羧基參與形成的肽鍵;羧肽酶是從肽鏈的羧基端開(kāi)始水解肽鍵的外肽酶;氨肽酶是從肽鏈的氨基端開(kāi)始水解肽鍵的外肽酶;胰蛋白酶可以專(zhuān)一地水解堿性氨基酸的羧基參與形成的肽鍵。11A:蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)是指蛋白質(zhì)分子內(nèi)的正電荷桌能總數(shù)與負(fù)電荷總數(shù)相等時(shí)的 pH 值。蛋白質(zhì)鹽析的條件是加入足量的中性鹽,如果加入少量中性鹽不但不會(huì)使蛋白質(zhì)沉淀析出反而會(huì)增加其溶解度,即鹽溶。在等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)的凈電荷為零,分子間的凈電斥力最小,所以溶解度最小,在溶液中易于沉淀,所以通常沉淀蛋白質(zhì)應(yīng)調(diào) pH至等電點(diǎn)。12A:在蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)中,通常是疏水性氨基酸的側(cè)鏈存在于分子的內(nèi)部,因?yàn)槭杷曰鶊F(tuán)避開(kāi)水相而聚集在一起,而親水側(cè)鏈分布在分子的表面以充分地與水作用;蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)是多肽鏈中氨基酸的排列順序,此順序即決定了肽鏈形成二級(jí)結(jié)構(gòu)的類(lèi)型以及更高層次的結(jié)構(gòu);維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的作用力主要是次級(jí)鍵。13E:脯氨酸是亞氨基酸,參與形成肽鍵后不能再與 C=O 氧形成氫鍵,因此不能形成 -螺旋結(jié)構(gòu);氨基酸殘基的支鏈大時(shí),空間位阻大,妨礙螺旋結(jié)構(gòu)的形成;連續(xù)出現(xiàn)多個(gè)酸性氨基酸或堿性氨基酸時(shí),同性電荷會(huì)互相排斥,所以不能形成穩(wěn)定的螺旋結(jié)構(gòu)。14C:-折疊結(jié)構(gòu)是一種常見(jiàn)的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的類(lèi)型,分為平行和反平行兩種排列方式,所以題中 C 項(xiàng)的說(shuō)法是錯(cuò)誤的。在 -折疊結(jié)構(gòu)中肽鏈處于曲折的伸展?fàn)顟B(tài),氨基酸殘基之間的軸心距離為 0.35nm, 相鄰肽鏈(或同一肽鏈中的幾個(gè)肽段)之間形成氫鍵而使結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。15C:蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的兩種主要類(lèi)型是 -螺旋結(jié)構(gòu)和 -折疊結(jié)構(gòu)。在 -螺旋結(jié)構(gòu)中肽鏈上的所有氨基酸殘基均參與氫鍵的形成以維持螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。在 -折疊結(jié)構(gòu)中,相鄰肽鏈或肽段之間形成氫鍵以維持結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定,所以氫鍵是維持蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要作用力。離子鍵、疏水鍵和范德華力在維持蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)和四級(jí)結(jié)構(gòu)中起重要作用,而二硫鍵在穩(wěn)定蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)中起一定作用。16E:肽鍵是連接氨基酸的共價(jià)鍵,它是維持蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的作用力;而硫鍵是 2 分子半胱氨酸的巰基脫氫氧化形成的共價(jià)鍵,它可以存在于2 條肽鏈之間也可以由存在于同一條肽鏈的 2 個(gè)不相鄰的半胱氨酸之間,它在維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)中起一定作用,但不是最主要的。離子鍵和氫鍵都是維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素之一,但此項(xiàng)選擇不全面,也不確切。次級(jí)鍵包括氫鍵、離子鍵、疏水鍵和范德華力,所以次項(xiàng)選擇最全面、確切。17A:用凝膠過(guò)濾柱層析分離蛋白質(zhì)是根據(jù)蛋白質(zhì)分子大小不同進(jìn)行分離的方法,與蛋白質(zhì)分子的帶電狀況無(wú)關(guān)。在進(jìn)行凝膠過(guò)濾柱層析過(guò)程中,比凝膠網(wǎng)眼大的分子不能進(jìn)入網(wǎng)眼內(nèi),被排阻在凝膠顆粒之外。比凝膠網(wǎng)眼小的顆??梢赃M(jìn)入網(wǎng)眼內(nèi),分子越小進(jìn)入網(wǎng)眼的機(jī)會(huì)越多,因此不同大小的分子通過(guò)凝膠層析柱時(shí)所經(jīng)的路程距離不同,大分子物質(zhì)經(jīng)過(guò)的距離短而先被洗出,小分子物質(zhì)經(jīng)過(guò)的距離長(zhǎng),后被洗脫,從而使蛋白質(zhì)得到分離。18A:蛋白質(zhì)的變性是其空間結(jié)構(gòu)被破壞,從而引起理化性質(zhì)的改變以及生物活性的喪失,但其一級(jí)結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變,所以肽鍵沒(méi)有斷裂。蛋白質(zhì)變性的機(jī)理是維持其空間結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的作用力被破壞,氫鍵、離子鍵和疏水鍵都是維持蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的作用力,當(dāng)這些作用力被破壞時(shí)空間結(jié)構(gòu)就被破壞并引起變性,所以與變性有關(guān)。 19A:蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)即蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序決定蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象,因?yàn)橐患?jí)結(jié)構(gòu)中包含著形成空間結(jié)構(gòu)所需要的所有信息,氨基酸殘基的結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)決定了所組成的蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)的類(lèi)型以及三級(jí)、四級(jí)結(jié)構(gòu)的構(gòu)象;二硫鍵和次級(jí)鍵都是維持蛋白質(zhì)空間構(gòu)象穩(wěn)定的作用力,但不決定蛋白質(zhì)的構(gòu)象;溫度及 pH影響蛋白質(zhì)的溶解度、解離狀態(tài)、生物活性等性質(zhì),但不決定蛋白質(zhì)的構(gòu)象。20B:氨基酸即有羧基又有氨基,可以提供氫質(zhì)子也可以接受氫質(zhì)子,所以即是酸又是堿,是兩性電解質(zhì)。由氨基酸組成的蛋白質(zhì)分子上也有可解離基團(tuán),如谷氨酸和天冬氨酸側(cè)鏈基團(tuán)的羧基以及賴(lài)氨酸的側(cè)鏈氨基,所以也是兩性電解質(zhì),這是氨基酸和蛋白質(zhì)所共有的性質(zhì);膠體性質(zhì)是蛋白質(zhì)所具有的性質(zhì),沉淀反應(yīng)是蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)被破壞產(chǎn)生的現(xiàn)象;變性是蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)被破壞后性質(zhì)發(fā)生改變并喪失生物活性的現(xiàn)象,這三種現(xiàn)象均與氨基酸無(wú)關(guān)。21E: 氨基酸分子上的正電荷數(shù)和負(fù)電荷數(shù)相等時(shí)的 pH 值是其等電點(diǎn),即凈電荷為零,此時(shí)在電場(chǎng)中不泳動(dòng)。由于凈電荷為零,分子間的凈電斥力最小,所以溶解度最小。22B:蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,蛋白質(zhì)中所含氨基酸的種類(lèi)和數(shù)目相同但排列順序不同時(shí),其一級(jí)結(jié)構(gòu)以及在此基礎(chǔ)上形成的空間結(jié)構(gòu)均有很大不同。蛋白質(zhì)分子中多肽鏈的折疊和盤(pán)繞是蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的內(nèi)容,所以 B 項(xiàng)是正確的。(四)是非判斷題1錯(cuò):脯氨酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生黃色化合物,其它氨基酸與茚三酮反應(yīng)產(chǎn)生藍(lán)色化合物。2對(duì):在肽平面中,羧基碳和亞氨基氮之間的鍵長(zhǎng)為 0.132nm,介于 CN 單鍵和 CN 雙鍵之間,具有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)。3錯(cuò):蛋白質(zhì)具有重要的生物功能,有些蛋白質(zhì)是酶,可催化特定的生化反應(yīng),有些蛋白質(zhì)則具有其它的生物功能而不具有催化活性,所以不是所有的蛋白質(zhì)都具有酶的活性。4錯(cuò):-碳和羧基碳之間的鍵是 CC 單鍵,可以自由旋轉(zhuǎn)。5對(duì):在 20 種氨基酸中,除甘氨酸外都具有不對(duì)稱(chēng)碳原子,所以具有 L-型和 D-型 2 種不同構(gòu)型,這兩種不同構(gòu)型的轉(zhuǎn)變涉及到共價(jià)鍵的斷裂和從新形成。6錯(cuò):由于甘氨酸的 -碳上連接有 2 個(gè)氫原子,所以不是不對(duì)稱(chēng)碳原子,沒(méi)有 2 種不同的立體異構(gòu)體,所以不具有旋光性。其它常見(jiàn)的氨基酸都具有不對(duì)稱(chēng)碳原子,因此具有旋光性。7錯(cuò):必需氨基酸是指人(或哺乳動(dòng)物)自身不能合成機(jī)體又必需的氨基酸,包括 8 種氨基酸。其它氨基酸人體自身可以合成,稱(chēng)為非必需氨基酸。8對(duì):蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,不同氨基酸的結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)不同,因而決定了多肽鏈形成二級(jí)結(jié)構(gòu)的類(lèi)型以及不同類(lèi)型之間的比例以及在此基礎(chǔ)上形成的更高層次的空間結(jié)構(gòu)。如在脯氨酸存在的地方 -螺旋中斷,R 側(cè)鏈具有大的支鏈的氨基酸聚集的地方妨礙螺旋結(jié)構(gòu)的形成,所以一級(jí)結(jié)構(gòu)在很大程度上決定了蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象。9錯(cuò):一氨基一羧基氨基酸為中性氨基酸,其等電點(diǎn)為中性或接近中性,但氨基和羧基的解離度,即 pK 值不同。10錯(cuò):蛋白質(zhì)的變性是蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的破壞,這是由于維持蛋白質(zhì)構(gòu)象穩(wěn)定的作用力次級(jí)鍵被破壞所造成的,但變性不引起多肽鏈的降解,即肽鏈不斷裂。11對(duì):有些蛋白質(zhì)是由一條多肽鏈構(gòu)成的,只具有三級(jí)結(jié)構(gòu),不具有四級(jí)結(jié)構(gòu),如肌紅蛋白。12對(duì):血紅蛋白是由 4 個(gè)亞基組成的具有 4 級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),當(dāng)血紅蛋白的一個(gè)亞基與氧結(jié)合后可加速其它亞基與氧的結(jié)合,所以具有變構(gòu)效應(yīng)。肌紅蛋白是僅有一條多肽鏈的蛋白質(zhì),具有三級(jí)結(jié)構(gòu),不具有四級(jí)結(jié)構(gòu),所以在與氧的結(jié)合過(guò)程中不表現(xiàn)出變構(gòu)效應(yīng)。13錯(cuò):Edman 降解法是多肽鏈 N 端氨基酸殘基被苯異硫氫酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,經(jīng)層析鑒定可知 N 端氨基酸的種類(lèi),而余下的多肽鏈仍為一條完整的多肽鏈,被回收后可繼續(xù)進(jìn)行下一輪 Edman 反應(yīng),測(cè)定 N 末端第二個(gè)氨基酸。反應(yīng)重復(fù)多次就可連續(xù)測(cè)出多肽鏈的氨基酸順序。FDNB 法(Sanger 反應(yīng))是多肽鏈 N 末端氨基酸與 FDNB(2,4-二硝基氟苯)反應(yīng)生成二硝基苯衍生物(DNP-蛋白) ,然后將其進(jìn)行酸水解,打斷所有肽鍵,N 末端氨基酸與二硝基苯基結(jié)合牢固,不易被酸水解。水解產(chǎn)物為黃色的 N 端 DNP-氨基酸和各種游離氨基酸。將 DNP-氨基酸抽提出來(lái)并進(jìn)行鑒定可知 N 端氨基酸的種類(lèi),但不能測(cè)出其后氨基酸的序列。14對(duì):大多數(shù)氨基酸的 -碳原子上都有一個(gè)自由氨基和一個(gè)自由羧基,但脯氨酸和羥脯氨酸的-碳原子上連接的氨基氮與側(cè)鏈的末端碳共價(jià)結(jié)合形成環(huán)式結(jié)構(gòu),所以不是自由氨基。15對(duì):蛋白質(zhì)是由氨基酸組成的大分子,有些氨基酸的 R 側(cè)鏈具有可解離基團(tuán),如羧基、氨基、咪唑基等等。這些基團(tuán)有的可釋放 H+ ,有的可接受 H+ ,所以使得蛋白質(zhì)分子即是酸又是堿,是兩性電解質(zhì)。蛋白質(zhì)分子中可解離 R 基團(tuán)的種類(lèi)和數(shù)量決定了蛋白質(zhì)提供和接受 H+ 的能力,即決定了它的酸堿性質(zhì)。16對(duì):在具有四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子中,每個(gè)具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈?zhǔn)且粋€(gè)亞基。17錯(cuò):具有兩個(gè)或兩個(gè)以上肽鍵的物質(zhì)才具有類(lèi)似于雙縮脲的結(jié)構(gòu),具有雙縮脲反應(yīng),而二肽只具有一個(gè)肽鍵,所以不具有雙縮脲反應(yīng)。18錯(cuò):二硫鍵是由兩個(gè)半胱氨酸的巰基脫氫氧化而形成的,所以?xún)蓚€(gè)半胱氨酸只能形成一個(gè)二硫鍵。19對(duì):鹽析引起的蛋白質(zhì)沉淀是由于大量的中性鹽破壞了蛋白質(zhì)膠體的穩(wěn)定因素(蛋白質(zhì)分子表面的水化膜及所帶同性電荷互相排斥) ,從而使蛋白質(zhì)溶解度降低并沉淀,但并未破壞蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu),所以不引起變性。根據(jù)不同蛋白質(zhì)鹽析所需的鹽飽和度分段鹽析可將蛋白質(zhì)進(jìn)行分離和純化。20錯(cuò):蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)包括二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)和四級(jí)結(jié)構(gòu)三個(gè)層次,三級(jí)結(jié)構(gòu)只是其中一個(gè)層次。21錯(cuò):維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的作用力有氫鍵、離子鍵、疏水鍵、范德華力以及二硫鍵,其中最重要的是疏水鍵。22錯(cuò):具有四級(jí)結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),只有所有的亞基以特定的適當(dāng)方式組裝在一起時(shí)才具有生物活性,缺少一個(gè)亞基或單獨(dú)一個(gè)亞基存在時(shí)都不具有生物活性。23錯(cuò):蛋白質(zhì)變性是由于維持蛋白質(zhì)構(gòu)象穩(wěn)定的作用力(次級(jí)鍵和而硫鍵)被破壞從而使蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)被破壞并山個(gè)喪失生物活性的現(xiàn)象。次級(jí)鍵被破壞以后,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)松散,原來(lái)聚集在分子內(nèi)部的疏水性氨基酸側(cè)鏈伸向外部,減弱了蛋白質(zhì)分子與水分子的相互作用,因而使溶解度將低。24錯(cuò):蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性是由鏈內(nèi)氫鍵維持的,如 -螺旋結(jié)構(gòu)和 -折疊結(jié)構(gòu)中的氫鍵均起到穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的作用。但并非肽鏈中所有的肽鍵都參與氫鍵的形成,如脯氨酸與相鄰氨基酸形成的肽鍵,以及自由回轉(zhuǎn)中的有些肽鍵不能形成鏈內(nèi)氫鍵。(五) 問(wèn)答題(解題要點(diǎn))1答:蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序。因?yàn)榈鞍踪|(zhì)分子肽鏈的排列順序包含了自動(dòng)形成復(fù)雜的三維結(jié)構(gòu)(即正確的空間構(gòu)象)所需要的全部信息,所以一級(jí)結(jié)構(gòu)決定其高級(jí)結(jié)構(gòu)。2答:蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)分子中原子和基團(tuán)在三維空間上的排列、分布及肽鏈走向。蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)決定蛋白質(zhì)的功能。空間結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)各自的功能是相適應(yīng)的。3答:(1)多肽鏈主鏈繞中心軸旋轉(zhuǎn),形成棒狀螺旋結(jié)構(gòu),每個(gè)螺旋含有 3.6 個(gè)氨基酸殘基,螺距為 0.54nm,氨基酸之間的軸心距為 0.15nm.。(2)-螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定主要靠鏈內(nèi)氫鍵,每個(gè)氨基酸的 NH 與前面第四個(gè)氨基酸的 CO 形成氫鍵。(3)天然蛋白質(zhì)的 -螺旋結(jié)構(gòu)大都為右手螺旋。4答:-折疊結(jié)構(gòu)又稱(chēng)為 -片層結(jié)構(gòu),它是肽鏈主鏈或某一肽段的一種相當(dāng)伸展的結(jié)構(gòu),多肽鏈呈扇面狀折疊。(1)兩條或多條幾乎完全伸展的多肽鏈(或肽段)側(cè)向聚集在一起,通過(guò)相鄰肽鏈主鏈上的氨基和羰基之間形成的氫鍵連接成片層結(jié)構(gòu)并維持結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。(2)氨基酸之間的軸心距為 0.35nm(反平行式)和 0.325nm(平行式) 。(3)-折疊結(jié)構(gòu)有平行排列和反平行排列兩種。5答:蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能從根本上來(lái)說(shuō)取決于它的一級(jí)結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能是蛋白質(zhì)分子的天然構(gòu)象所具有的屬性或所表現(xiàn)的性質(zhì)。一級(jí)結(jié)構(gòu)相同的蛋白質(zhì),其功能也相同,二者之間有統(tǒng)一性和相適應(yīng)性。6答:蛋白質(zhì)變性作用是指在某些因素的影響下,蛋白質(zhì)分子的空間構(gòu)象被破壞,并導(dǎo)致其性質(zhì)和生物活性改變的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)變性后會(huì)發(fā)生以下幾方面的變化:(1)生物活性喪失;(2)理化性質(zhì)的改變,包括:溶解度降低,因?yàn)槭杷畟?cè)鏈基團(tuán)暴露;結(jié)晶能力喪失;分子形狀改變,由球狀分子變成松散結(jié)構(gòu),分子不對(duì)稱(chēng)性加大;粘度增加;光學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,如旋光性、紫外吸收光譜等均有所改變。(3)生物化學(xué)性質(zhì)的改變,分子結(jié)構(gòu)伸展松散,易被蛋白酶分解。7答:維持蛋白質(zhì)空間構(gòu)象穩(wěn)定的作用力是次級(jí)鍵,此外,二硫鍵也起一定的作用。當(dāng)某些因素破壞了這些作用力時(shí),蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象即遭到破壞,引起變性。8答:蛋白質(zhì)的重要作用主要有以下幾方面:(1)生物催化作用 酶是蛋白質(zhì),具有催化能力,新陳代謝的所有化學(xué)反應(yīng)幾乎都是在酶的催化下進(jìn)行的。(2)結(jié)構(gòu)蛋白 有些蛋白質(zhì)的功能是參與細(xì)胞和組織的建成。(3)運(yùn)輸功能 如血紅蛋白具有運(yùn)輸氧的功能。(4)收縮運(yùn)動(dòng) 收縮蛋白(如肌動(dòng)蛋白和肌球蛋白)與肌肉收縮和細(xì)胞運(yùn)動(dòng)密切相關(guān)。(5)激素功能 動(dòng)物體內(nèi)的激素許多是蛋白質(zhì)或多肽,是調(diào)節(jié)新陳代謝的生理活性物質(zhì)。(6)免疫保護(hù)功能 抗體是蛋白質(zhì),能與特異抗原結(jié)合以清除抗原的作用,具有免疫功能。(7)貯藏蛋白 有些蛋白質(zhì)具有貯藏功能,如植物種子的谷蛋白可供種子萌發(fā)時(shí)利用。(8)接受和傳遞信息 生物體中的受體蛋白能專(zhuān)一地接受和傳遞外界的信息。(9)控制生長(zhǎng)與分化 有些蛋白參與細(xì)胞生長(zhǎng)與分化的調(diào)控。(10)毒蛋白 能引起機(jī)體中毒癥狀和死亡的異體蛋白,如細(xì)菌毒素、蛇毒、蝎毒、蓖麻毒素等。9答:(a)異硫氫酸苯酯;(b)丹黃酰氯;(c)脲、-巰基乙醇;(d)胰凝乳蛋白酶;(e)CNBr; (f)胰蛋白酶。10答:(1)可能在 7 位和 19 位打彎,因?yàn)楦彼岢3霈F(xiàn)在打彎處。(2)13 位和 24 位的半胱氨酸可形成二硫鍵。(3)分布在外表面的為極性和帶電荷的殘基:Asp、Gln 和 Lys;分布在內(nèi)部的是非極性的氨基酸殘基:Try、Leu 和 Val;Thr 盡管有極性,但疏水性也很強(qiáng),因此,它出現(xiàn)在外表面和內(nèi)部的可能性都有。四川大學(xué)生物化學(xué)核酸部分考試題(一)名詞解釋1單核苷酸(mononucleotide)2磷酸二酯鍵(phosphodiester bonds)3不對(duì)稱(chēng)比率(dissymmetry ratio)4堿基互補(bǔ)規(guī)律(complementary base pairing)5反密碼子(anticodon)6順?lè)醋樱╟istron)7核酸的變性與復(fù)性(denaturation、renaturation)8退火(annealing)9增色效應(yīng)(hyper chromic effect)10減色效應(yīng)(hypo chromic effect)11噬菌體(phage)12發(fā)夾結(jié)構(gòu)(hairpin structure)13DNA 的熔解溫度(melting temperature Tm)14分子雜交(molecular hybridization)15環(huán)化核苷酸(cyclic nucleotide)(二)填空題1DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)模型是-_于_年提出的。2核酸的基本結(jié)構(gòu)單位是_。3脫氧核糖核酸在糖環(huán)_位置不帶羥基。4兩類(lèi)核酸在細(xì)胞中的分布不同,DNA 主要位于_中,RNA 主要位于_中。5核酸分子中的糖苷鍵均為_(kāi)型糖苷鍵。糖環(huán)與堿基之間的連鍵為_(kāi)鍵。核苷與核苷之間通過(guò)_鍵連接成多聚體。6核酸的特征元素_。7堿基與戊糖間是 C-C 連接的是_核苷。8DNA 中的_嘧啶堿與 RNA 中的_嘧啶堿的氫鍵結(jié)合性質(zhì)是相似的。9DNA 中的_嘧啶堿與 RNA 中的_嘧啶堿的氫鍵結(jié)合性質(zhì)是相似的。 10DNA 雙螺旋的兩股鏈的順序是_關(guān)系。11給動(dòng)物食用 3H 標(biāo)記的_,可使 DNA 帶有放射性,而 RNA 不帶放射性。12B 型 DNA 雙螺旋的螺距為_(kāi),每匝螺旋有_對(duì)堿基,每對(duì)堿基的轉(zhuǎn)角是_。13在 DNA 分子中,一般來(lái)說(shuō) G-C 含量高時(shí),比重_,Tm(熔解溫度)則_,分子比較穩(wěn)定。14在_ _條件下,互補(bǔ)的單股核苷酸序列將締結(jié)成雙鏈分子。15_RNA 分子指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成,_RNA 分子用作蛋白質(zhì)合成中活化氨基酸的載體。16DNA 分子的沉降系數(shù)決定于_、_。17DNA 變性后,紫外吸收_ _,粘度_ _、浮力密度_ _,生物活性將_ _。18因?yàn)楹怂岱肿泳哂衉 _、_ _,所以在_nm處有吸收峰,可用紫外分光光度計(jì)測(cè)定。19雙鏈 DNA 熱變性后,或在 pH2 以下,或在pH12 以上時(shí),其 OD260_,同樣條件下,單鏈 DNA 的 OD260_。20DNA 樣品的均一性愈高,其熔解過(guò)程的溫度范圍愈_。21DNA 所在介質(zhì)的離子強(qiáng)度越低,其熔解過(guò)程的溫度范圍愈_,熔解溫度愈_,所以 DNA 應(yīng)保存在較_濃度的鹽溶液中,通常為_(kāi)mol/L的 NaCI 溶液。22mRNA 在細(xì)胞內(nèi)的種類(lèi)_,但只占 RNA 總量的_,它是以_為模板合成的,又是_合成的模板。 23變性 DNA 的復(fù)性與許多因素有關(guān),包括_,_,_,_,_,等。24維持 DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的主要因素是_,其次,大量存在于 DN

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