蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)組學(xué)

1、會計(jì)學(xué)1蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)組學(xué)蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)組學(xué) 基因組基因組 轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄組 蛋白組蛋白組The study of proteins expressed by genomesCompletion of the sequencing of the 1st draft of human genome indicates there are approximately 250,000 proteins in the human genomeOnly 2-5% of proteins in human genome have been identifiedExpression proteomics(表達(dá)蛋

2、白組學(xué)表達(dá)蛋白組學(xué))The study of global changes in protein expressionProteomicsCell-map proteomics（細(xì)胞圖譜蛋白組學(xué)）（細(xì)胞圖譜蛋白組學(xué)）The systematic study of protein-protein interactions through the isolation of protein complexesv雙相電泳技術(shù)（two dimensional electrophoresis gel 2D）v“雙向”高效柱析法: 分子篩柱層析分子篩柱層析 反向柱層析反向柱層析v質(zhì)譜分析 ( MS): 輔助

3、激光解析輔助激光解析/離子化離子化(matrix- assisted laser disorption / ionization) ; 電噴霧離子化（電噴霧離子化（electrospray ionization ESI）v生物信息學(xué)蛋白組研究的三個(gè)主要步驟：蛋白組研究的三個(gè)主要步驟：Separation of individual proteins by 2-D polyacrylamide gel electrophoresis (2-D PAGE)Identification by mass spectrometry or N- terminal sequencing of individ

4、ual proteins recovered from the gelStorage, manipulation, and comparison of the data using bioinformaticsMASS SPECMALDI-TOFSWISS-PROT/ TrEMBL蛋白組學(xué)研究過程蛋白組學(xué)研究過程SWISS PROT/TrEMBLMicroMassABIBruker樣品樣品樣品制備樣品制備2維電泳維電泳純化和點(diǎn)樣純化和點(diǎn)樣質(zhì)譜測序質(zhì)譜測序數(shù)據(jù)庫分析數(shù)據(jù)庫分析 成像成像u1975年，OFarrell et al 發(fā)明了雙向電泳技術(shù)。u 能檢測到3000-4000種總蛋白，最大可達(dá)

5、到一萬種u一個(gè)細(xì)胞有5000-6000種不同蛋白，人體有250種細(xì)胞，每 個(gè)細(xì)胞表達(dá)300-400種自身特有蛋白v分類：分類：輔助激光解析/離子化&電噴霧離子化v原理：原理：樣本分子離子化后,根據(jù)不同離子間質(zhì)荷比 (m/e )差異,分離樣本,確定分子量介質(zhì)輔助的激光解吸/離子化生物信息學(xué)生物信息學(xué)生物信息學(xué)在基因組學(xué)生物信息學(xué)在基因組學(xué)/蛋白質(zhì)組學(xué)的研究中起重要作用。包括數(shù)據(jù)的輸?shù)鞍踪|(zhì)組學(xué)的研究中起重要作用。包括數(shù)據(jù)的輸入、儲存、加工、索取以及數(shù)據(jù)庫之間的聯(lián)系。入、儲存、加工、索取以及數(shù)據(jù)庫之間的聯(lián)系。數(shù)據(jù)處理需要設(shè)計(jì)各種特殊軟件，對數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析，不同的數(shù)據(jù)庫之?dāng)?shù)據(jù)處理需要設(shè)計(jì)各種

6、特殊軟件，對數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析，不同的數(shù)據(jù)庫之間要有高效自動的應(yīng)答。間要有高效自動的應(yīng)答。數(shù)據(jù)庫要有嚴(yán)密管理。蛋白質(zhì)組比基因組具有更大的復(fù)雜性。數(shù)據(jù)庫要有嚴(yán)密管理。蛋白質(zhì)組比基因組具有更大的復(fù)雜性?；蚪M學(xué)基因組學(xué)/蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展促使生物信息學(xué)迅速發(fā)展。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展促使生物信息學(xué)迅速發(fā)展。例如用生物信息學(xué)對質(zhì)譜得到的肽指紋圖譜例如用生物信息學(xué)對質(zhì)譜得到的肽指紋圖譜（peptide-mass fingerprinting）分析出了一個(gè)新的在進(jìn)化過程中保守的模序分析出了一個(gè)新的在進(jìn)化過程中保守的模序（motif），它對蛋白質(zhì)的，它對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能具有重要意義。用分子建模結(jié)構(gòu)和功能具有重要意義。用分子建模（molecular modelling）u1975年，OFarrell