突變體庫(kù)反饋信息學(xué)習(xí)教案

1、會(huì)計(jì)學(xué)1突變體庫(kù)反饋突變體庫(kù)反饋(fnku)信息信息第一頁(yè)，共46頁(yè)。安置在不同的質(zhì)粒載體上進(jìn)行操作。第2頁(yè)/共46頁(yè)第二頁(yè)，共46頁(yè)。同源(tn yun)重組第3頁(yè)/共46頁(yè)第三頁(yè)，共46頁(yè)。第4頁(yè)/共46頁(yè)第四頁(yè)，共46頁(yè)。第5頁(yè)/共46頁(yè)第五頁(yè)，共46頁(yè)。 核酸核酸 核苷酸核苷酸 磷酸磷酸 核苷核苷 戊糖戊糖 堿基堿基第6頁(yè)/共46頁(yè)第六頁(yè)，共46頁(yè)。第7頁(yè)/共46頁(yè)第七頁(yè)，共46頁(yè)。第8頁(yè)/共46頁(yè)第八頁(yè)，共46頁(yè)。堿基和核糖（脫氧核糖）通過(guò)(tnggu)糖苷鍵連接形成核苷（脫氧核苷）。核苷：AR, GR, UR, CR（2-脫氧核苷：dAR, dGR, dTR, dCR）H第9頁(yè)/共

2、46頁(yè)第九頁(yè)，共46頁(yè)。核苷（脫氧核苷）和磷酸以磷酸酯鍵連接(linji)形成核苷酸（脫氧核苷酸）。 核苷酸：AMP，GMP，UMP，CMP（2-脫氧核苷酸：dAMP，dGMP，dTMP，dCMP）(A, G, C, T) NH第10頁(yè)/共46頁(yè)第十頁(yè)，共46頁(yè)。核苷酸之間以磷酸二酯鍵（35）連接形成(xngchng)多核苷酸鏈，即核酸（一級(jí)結(jié)構(gòu)）。第11頁(yè)/共46頁(yè)第十一頁(yè)，共46頁(yè)。第12頁(yè)/共46頁(yè)第十二頁(yè)，共46頁(yè)。第13頁(yè)/共46頁(yè)第十三頁(yè)，共46頁(yè)。第14頁(yè)/共46頁(yè)第十四頁(yè)，共46頁(yè)。第15頁(yè)/共46頁(yè)第十五頁(yè)，共46頁(yè)。ABZ外型外型粗短粗短適中適中細(xì)長(zhǎng)細(xì)長(zhǎng)螺旋方向螺旋方向右手

3、右手右手右手左手左手螺旋直徑螺旋直徑2.55nm2.37nm1.84nm堿基軸升堿基軸升0.23nm0.34nm0.38nm堿基夾角堿基夾角32.734.660 每圈堿基數(shù)每圈堿基數(shù) 1110.412螺距螺距2.53nm3.54nm4.56nm堿基傾角堿基傾角1919活性活性次之次之最高最高最低最低第16頁(yè)/共46頁(yè)第十六頁(yè)，共46頁(yè)。增強(qiáng)子捕獲：報(bào)告基因與最小啟動(dòng)子融合，典型的最小啟動(dòng)子，含增強(qiáng)子捕獲：報(bào)告基因與最小啟動(dòng)子融合，典型的最小啟動(dòng)子，含T A T A b o x 及轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，但不能單獨(dú)驅(qū)動(dòng)報(bào)告基因的表達(dá)及轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，但不能單獨(dú)驅(qū)動(dòng)報(bào)告基因的表達(dá)(biod)，若被插入位點(diǎn)附近

4、的增強(qiáng)元件激活，若被插入位點(diǎn)附近的增強(qiáng)元件激活， 則可導(dǎo)致報(bào)告基因的表達(dá)則可導(dǎo)致報(bào)告基因的表達(dá)(biod)。 3. 增強(qiáng)子捕獲(bhu)、啟動(dòng)子捕獲(bhu)和基因捕獲(bhu)第17頁(yè)/共46頁(yè)第十七頁(yè)，共46頁(yè)。啟動(dòng)子捕獲：用不帶啟動(dòng)子的報(bào)告基因，啟動(dòng)子捕獲：用不帶啟動(dòng)子的報(bào)告基因， 隨機(jī)插入染色體中，隨機(jī)插入染色體中， 由插入位點(diǎn)附近基因的啟動(dòng)子啟動(dòng)報(bào)告基因表達(dá)，由插入位點(diǎn)附近基因的啟動(dòng)子啟動(dòng)報(bào)告基因表達(dá)， 通過(guò)檢測(cè)報(bào)告基因是否表達(dá)、通過(guò)檢測(cè)報(bào)告基因是否表達(dá)、 以及以及(yj)報(bào)告基因在生物體中的表達(dá)部位，報(bào)告基因在生物體中的表達(dá)部位， 可以判斷報(bào)告基因插入位置附近是否有基因的啟動(dòng)子存在

5、以及可以判斷報(bào)告基因插入位置附近是否有基因的啟動(dòng)子存在以及(yj)該基該基 因的表達(dá)是否有特異性。因的表達(dá)是否有特異性。第18頁(yè)/共46頁(yè)第十八頁(yè)，共46頁(yè)。基因捕獲：載體的報(bào)告基因之前含一個(gè)或多個(gè)剪切受體序列基因捕獲：載體的報(bào)告基因之前含一個(gè)或多個(gè)剪切受體序列(xli)，報(bào)告基因前也無(wú)啟動(dòng)子，報(bào)告基因前也無(wú)啟動(dòng)子， 只有插在一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位之內(nèi)且方向正確時(shí)才能表達(dá)。只有插在一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位之內(nèi)且方向正確時(shí)才能表達(dá)。第19頁(yè)/共46頁(yè)第十九頁(yè)，共46頁(yè)。第20頁(yè)/共46頁(yè)第二十頁(yè)，共46頁(yè)。第21頁(yè)/共46頁(yè)第二十一頁(yè)，共46頁(yè)。水稻耐淹與深水稻基因(jyn)的克隆和遺傳分析第22頁(yè)/共46頁(yè)第二十二

6、頁(yè)，共46頁(yè)。第23頁(yè)/共46頁(yè)第二十三頁(yè)，共46頁(yè)。第24頁(yè)/共46頁(yè)第二十四頁(yè)，共46頁(yè)。第25頁(yè)/共46頁(yè)第二十五頁(yè)，共46頁(yè)。第26頁(yè)/共46頁(yè)第二十六頁(yè)，共46頁(yè)。Sub1基因在耐淹秈稻(xindo)（IR40931-26）與不耐淹粳稻（Nipponbare）的結(jié)構(gòu)第27頁(yè)/共46頁(yè)第二十七頁(yè)，共46頁(yè)。在淹沒(méi)(ynm)十天和恢復(fù)三天的過(guò)程中對(duì)兩個(gè)親本基因轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行半定量RT-PCR分析第28頁(yè)/共46頁(yè)第二十八頁(yè)，共46頁(yè)。株高的比較(bjio)第29頁(yè)/共46頁(yè)第二十九頁(yè)，共46頁(yè)。 Northern blot analysis，淹沒(méi)恢復(fù)(huf)10天后檢測(cè)第30頁(yè)/共46頁(yè)第

7、三十頁(yè)，共46頁(yè)。將生長(zhǎng)14天的苗完全淹沒(méi)14天，解除(jich)淹沒(méi)后14天的照片第31頁(yè)/共46頁(yè)第三十一頁(yè)，共46頁(yè)。第32頁(yè)/共46頁(yè)第三十二頁(yè)，共46頁(yè)。2. SNORKEL1 與 SNORKEL2第33頁(yè)/共46頁(yè)第三十三頁(yè)，共46頁(yè)。第34頁(yè)/共46頁(yè)第三十四頁(yè)，共46頁(yè)。第35頁(yè)/共46頁(yè)第三十五頁(yè)，共46頁(yè)。深水反應(yīng)（b與c為十葉期的水稻浸沒(méi)(jn mi)兩周后）第36頁(yè)/共46頁(yè)第三十六頁(yè)，共46頁(yè)。d.SK1、SK2的基因結(jié)構(gòu)； e.AP2/ERF；f.SK1、SK2基因的表達(dá)； g.SK1、SK2器官的特異(ty)表達(dá)；h.SK基因的過(guò)表達(dá)實(shí)驗(yàn)。第37頁(yè)/共46頁(yè)第三十

8、七頁(yè)，共46頁(yè)。a.SK1、SK2在洋蔥表皮細(xì)胞的亞細(xì)胞定位b.酵母中的轉(zhuǎn)錄(zhun l)活性分析？第38頁(yè)/共46頁(yè)第三十八頁(yè)，共46頁(yè)。c.植物激素對(duì)SK基因表達(dá)的影響；d.凝膠遷移滯后實(shí)驗(yàn)；e.乙烯(y x)在深水稻中促進(jìn)節(jié)間伸長(zhǎng)（非深水條件）；f.有乙烯(y x)抑制劑的時(shí)節(jié)間的伸長(zhǎng)；g.深水條件下乙烯(y x)含量的測(cè)定。第39頁(yè)/共46頁(yè)第三十九頁(yè)，共46頁(yè)。a.深水條件(tiojin)下C9285中GA1的含量；b. GA在C9285中的應(yīng)答反應(yīng)。第40頁(yè)/共46頁(yè)第四十頁(yè)，共46頁(yè)。a.不同(b tn)品系的深水反應(yīng)；b.不同(b tn)栽培稻與野生稻中的SK基因結(jié)構(gòu)；c.近等基因系中深水反應(yīng)與加性效應(yīng)。第41頁(yè)/共46頁(yè)第四十一頁(yè)，共46頁(yè)。水稻(shudo)育種中的QTL加性效應(yīng)第42頁(yè)/共46頁(yè)第四