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1、-第二位堿基第二位堿基第二位堿基第二位堿基-UCAG第一位堿基UUUU (Phe/F)苯丙氨酸UUC (Phe/F)苯丙氨酸UUA (Leu/L)亮氨酸UUG (Leu/L)亮氨酸UCU (Ser/S)絲氨酸UCC (Ser/S)絲氨酸UCA (Ser/S)絲氨酸UCG (Ser/S)絲氨酸UAU (Tyr/Y)酪氨酸UAC (Tyr/Y)酪氨酸UAA (終止)UAG (終止)UGU (Cys/C)半胱氨酸UGC (Cys/C)半胱氨酸UGA (終止)UGG (Trp/W)色氨酸第一位堿基CCUU (Leu/L)亮氨酸CUC (Leu/L)亮氨酸CUA (Leu/L)亮氨酸CUG (Leu/L
2、)亮氨酸CCU (Pro/P)脯氨酸CCC (Pro/P)脯氨酸CCA (Pro/P)脯氨酸CCG (Pro/P)脯氨酸CAU (His/H)組氨酸CAC (His/H)組氨酸CAA (Gln/Q)谷氨酰胺CAG (Gln/Q)谷氨酰胺CGU (Arg/R)精氨酸CGC (Arg/R)精氨酸CGA (Arg/R)精氨酸CGG (Arg/R)精氨酸第一位堿基AAUU (Ile/I)異亮氨酸AUC (Ile/I)異亮氨酸AUA (Ile/I)異亮氨酸AUG (Met/M)甲硫氨酸(起始)ACU (Thr/T)蘇氨酸ACC (Thr/T)蘇氨酸ACA (Thr/T)蘇氨酸ACG (Thr/T)蘇氨酸
3、AAU (Asn/N)天冬酰胺AAC (Asn/N)天冬酰胺AAA (Lys/K)賴氨酸AAG (Lys/K)賴氨酸AGU (Ser/S)絲氨酸AGC (Ser/S)絲氨酸AGA (Arg/R)精氨酸AGG (Arg/R)精氨酸第一位堿基GGUU (Val/V)纈氨酸GUC (Val/V)纈氨酸GUA (Val/V)纈氨酸GUG (Val/V)纈氨酸GCU (Ala/A)丙氨酸GCC (Ala/A)丙氨酸GCA (Ala/A)丙氨酸GCG (Ala/A)丙氨酸GAU (Asp/D)天冬氨酸GAC (Asp/D)天冬氨酸GAA (Glu/E)谷氨酸GAG (Glu/E)谷氨酸GGU (Gly/G
4、)甘氨酸GGC (Gly/G)甘氨酸GGA (Gly/G)甘氨酸GGG (Gly/G)甘氨酸密碼子反表AlaAGCU,GCC,GCA,GCGLeuLUUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUGArgRCGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGGLysKAAA,AAGAsnNAAU,AACMetMAUGAspDGAU,GACPheFUUU,UUCCysCUGU,UGCProPCCU,CCC,CCA,CCGGlnQCAA,CAGSerSUCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGCGluEGAA,GAGThrTACU,ACC,ACA,ACGGlyGGGU,GGC,GGA,GGGTrpWUGGH
5、isHCAU,CACTyrYUAU,UACIleIAUU,AUC,AUAValVGUU,GUC,GUA,GUG起始AUG終止UAG,UGA,UAA中文名稱英文名稱短寫縮寫纈氨酸ValineVVal酪氨酸TyrosineYTyr色氨酸TryptophanWTrp蘇氨酸ThreonineTThr絲氨酸SerineSSer硒半胱氨酸*SelenocysteineUSec吡咯賴氨酸*PyrrolysineOPyl脯氨酸ProlinePPro苯丙氨酸PhenylalanineFPhe蛋氨酸MethionineMMet賴氨酸LysineKLys亮氨酸LeucineLLeu異亮氨酸IsoleucineIIl
6、e組氨酸HistidineHHis甘氨酸GlycineGGly谷氨酰胺GlutamineQGln谷氨酸Glutamic acid / GlutamateEGlu半胱氨酸CysteineCCys天冬氨酸Aspartic acid / AspartateDAsp天冬酰胺AsparagineNAsn精氨酸ArginineRArg丙氨酸AlanineAAla除此之外,還有一些三字母或單字母符號(hào)可用來(lái)表示未明確定義的縮寫:· Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。· Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。· Xle、J可代表
7、亮氨酸(Leu、L)或異亮氨酸(Ile、I)。· Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。結(jié)構(gòu)編輯以下是標(biāo)準(zhǔn)遺傳密碼所用來(lái)直接合成蛋白質(zhì)的20種氨基酸的結(jié)構(gòu)及表示符號(hào)。·L-丙氨酸(Ala / A) ·L-精氨酸(Arg / R) ·L-天冬酰胺(Asn / N) ·L-天冬氨酸(Asp / D) ·L-半胱氨酸(Cys / C) ·L-谷氨酸(Glu
8、/ E) ·L-谷氨酰胺(Gln / Q) ·甘氨酸(Gly / G) ·L-組氨酸(His / H) ·L-異亮氨酸(Ile / I) ·L-亮氨酸(Leu / L) ·L-賴氨酸(Lys / K) ·L-蛋氨酸(Met / M) ·L-苯丙氨酸(Phe / F)
9、160;·L-脯氨酸(Pro / P) ·L-絲氨酸(Ser / S) ·L-蘇氨酸(Thr / T) ·L-色氨酸(Trp / W) ·L-酪氨酸(Tyr / Y) ·L-纈氨酸(Val / V) ·L-硒半胱氨酸(Sec / U) ·L-吡咯賴氨酸(Pyl / O)主要化學(xué)性質(zhì)編輯以下
10、的分子量是根據(jù)各元素的同位素在自然界的豐度所做的平均值。此外由于形成肽鍵時(shí),會(huì)減少一個(gè)水分子,因此蛋白質(zhì)中單一氨基酸的分子量,比下表數(shù)值少了18.01524 Da。氨基酸分子量(Da)pIpK1(-COOH)pK2(-+NH3)丙氨酸89.094046.012.359.87半胱氨酸121.154045.051.9210.70硒半胱氨酸169.06天冬氨酸133.103842.851.999.90谷氨酸147.130743.152.109.47苯丙氨酸165.191845.492.209.31甘氨酸75.067146.062.359.78組氨酸155.156347.601.809.33異亮氨酸1
11、31.174646.052.329.76賴氨酸146.189349.602.169.06吡咯賴氨酸255.31亮氨酸131.174646.012.339.74蛋氨酸149.207845.742.139.28天冬酰胺132.119045.412.148.72脯氨酸115.131946.301.9510.64谷氨酰胺146.145945.652.179.13精氨酸174.2027410.761.828.99絲氨酸105.093445.682.199.21蘇氨酸119.120345.602.099.10纈氨酸117.147846.002.399.74色氨酸204.228445.892.469.41酪
12、氨酸181.191245.642.209.21支鏈性質(zhì)編輯以下列表中的pKa值,可能與這些氨基酸在蛋白質(zhì)內(nèi)部時(shí)有所不同。氨基酸支鏈?zhǔn)杷詐Ka極性電荷芳香族或脂肪族范德瓦爾斯半徑丙氨酸-CH3X-67半胱氨酸-CH2SHX8.18-酸性-86硒半胱氨酸-CH2SeHX5.73-天冬氨酸-CH2COOH-3.90X酸性-91谷氨酸-CH2CH2COOH-4.07X酸性-109苯丙氨酸-CH2C6H5X-芳香性135甘氨酸-H-48組氨酸-CH2-C3H3N2-6.04X弱堿性芳香性118異亮氨酸-CH(CH3)CH2CH3X-脂肪性124賴氨酸-(CH2)4NH2-10.54X堿性-135吡咯賴
13、氨酸-C12H21N3O3亮氨酸-CH2CH(CH3)2X-脂肪性124蛋氨酸-CH2CH2SCH3X-124天冬酰胺-CH2CONH2-X-96脯氨酸-CH2CH2CH2-X-90谷氨酰胺-CH2CH2CONH2-X-114精氨酸-(CH2)3NH-C(NH)NH2-12.48X堿性-148絲氨酸-CH2OH-X-73蘇氨酸-CH(OH)CH3-X弱酸性-93纈氨酸-CH(CH3)2X-脂肪性105色氨酸-CH2-C8H6NX-芳香性163酪氨酸-CH2-C6H4OHX10.46X-芳香性141基因表達(dá)與生物化學(xué)編輯氨基酸短寫縮寫密碼子在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)頻率(%)對(duì)人類的必需性丙氨酸AAlaGC
14、U, GCC, GCA, GCG7.8-半胱氨酸CCysUGU, UGC1.9-硒半胱氨酸USecUGA-天冬氨酸DAspGAU, GAC5.3-谷氨酸EGluGAA, GAG6.3-苯丙氨酸FPheUUU, UUC3.9X甘氨酸GGlyGGU, GGC, GGA, GGG7.2-組氨酸HHisCAU, CAC2.3-異亮氨酸IIleAUU, AUC, AUA5.3X賴氨酸KLysAAA, AAG5.9X吡咯賴氨酸OPylUAG亮氨酸LLeuUUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG9.1X蛋氨酸MMetAUG2.3X天冬酰胺NAsnAAU, AAC4.3-脯氨酸PProCCU, CCC, CCA
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