Omnic軟件使用方法初步

1、1. # Omnic軟件使用指南Omnic與系統(tǒng)Omnic是Nicolet公司的在PC機使用最廣泛的窗口軟件平臺上運行的紅外軟件，從開始在Windows3.1上運行的版本的1.0到目前的6.1a，現(xiàn)行的的操作系統(tǒng)Windows98/Me/NT/2000/XP都支持。EZ-Omnic是簡化的軟件，一方面價格比較低，同時更加簡明，容易掌握，雖然功能比較簡單，仍可以滿足先當部分用戶的需求。使用的儀器通訊接口有：LTP（并行口）或PCI卡，部分早一些的儀器使用ISA卡。文件結構Omnic6.0以上版本的缺省的文件分別存在于三個目錄中：C:MyDocumentsOmnic,在其子目錄中分門別類地存放數(shù)據(jù)

2、與參數(shù)等文件，如Spectra存光譜，Param中存設置參數(shù),Quant存定量方法；C:ProgramFilesOmnic，存有驅動與程序文件等，系統(tǒng)的卸載命令在它的子目錄Uninstall中；C:MyDocumentOmnicLib，存放譜庫，包括購買和自建的譜庫。軟件安裝的應用程序除了Omnic外還有BenchDiagnostics,這是一個在系統(tǒng)發(fā)生故障時進行判斷的重要命令，能夠檢查從接口卡到儀器的各個重要部件。它們與PDF文件一起置于ThermoNicolet程序組中，3.啟動Omnic軟件使用下列方法之一啟動0mnic紅外軟件系統(tǒng):1.在Windows98等的桌面上雙擊（或者皿1.

3、# #1. 2.3.從SrartfProgramThermoNicolet0mnic(或者從SrartProgram0mnic5.0OMNIC：E.S.F.5.1)其他，如Win98中的快捷方式啟動。4.Omnic顯示面板：Omnic是一種與窗口軟件充分兼容的軟件，可以顯示一個或多個顯示窗口，當顯示多個窗口時可以選擇平鋪（Tile）或層疊（Cascade）方式，但其中只有一個是活動窗口（被選中的）。光譜圖可以在窗口間拖動、復制與粘貼，而且可以把復制的光譜圖直接粘貼到其他應用程序的文本文件中，為發(fā)表文章或書寫報告帶來方便。在每個顯示窗口中，可以顯示一個到多個光譜圖，最后加入的光譜是自動被選中的，

4、缺省顏色是紅色。有些對光譜進行進一步處理時需要或可以同時處理多個光譜。需要有多個被選中的光譜時，通過按住Ctrl或Shift鍵操作鼠標來增減被選中光譜。標題框在光譜窗口的上面，標題內容為人工輸入，或根據(jù)使用的需要，通過“選項”中所設定的方式中適當選擇自動生成。菜單欄冏0MNIC-|Wlndaw(|Naspectraselected實驗選項表fitEdilCollect里己屛RtodessAraljize蟲1阻/iepoitWindowHdpDefault-TransmissionE)iperimen1y10-20-I)I4按“信息按鈕”或雙擊“標題框”中的標題，打開“選中”光譜的采集和數(shù)據(jù)處理

5、記錄的窗口，在其中的20CO5注釋（Comment）等若干框中，可以輸入文字信息,等若以隨同打印，其它的記錄為非編-0（矚胡輯內容。當顯示多個光譜圖時，按“標題框”右邊的箭頭，顯示出所有譜圖的標題。用鼠標擊標題表（選中）后，用鍵盤上的箭頭鍵可以改變被選中的光譜，同時可以編輯被選中的光譜的標題。按住Ctrl或Shift對標題表或窗口中的光譜點擊鼠標左鍵，可以增加或減少一個或多個被選中的光譜。6圖標工具是用來定義鼠標功能的：1. # #1. # #范圍，坐標，峰高，標注。1. 7“取景窗”中顯示有完整的光譜圖（被選中的），并指明光譜在窗口中的顯示范圍。通過鼠標及與二*二的聯(lián)合使用，可以改變光譜在窗

6、格中光譜的水平方向顯示區(qū)間，另外ic軟件還有幾種調整顯示范圍的方法。8快捷工具圖標的使用使操作更為便捷5數(shù)據(jù)采集設置從Collect下選ExperimentSetup，就打開了它的窗口,從中選擇與采集有關的條件和參數(shù)。也可以調用現(xiàn)有的參數(shù)組文件（.exp）或保存調整選擇好的條件。Collect選項卡中可以選擇：掃描次數(shù)NumberofScans分辨率Resolution光譜格式FinalFormat，矯正Correction，對H20,C02的矯正見附一文件管理FileHandling背景管理BackgroundHandling環(huán)境干擾補償AutomaticAtmosphericSuppres

7、ion光譜預覽PreviewDataCollection,在采集光譜之前需要核實或調整樣品時選用，這一功能對于顯微及某些附件應用時非常有效。2.Bench選項卡，從中可以檢查紅外干涉信號強度并包括:增益Gain,調整紅外干涉信號強度，一般將Max調到28V速度Velocity,取決于檢測器和應用（速度及響應）光闌Aperture，取決于光譜分辨率、光強的調整（也可以使用衰減屏）光譜范圍SpectralRange，可根據(jù)需要變更樣品位置SampleCompartment，對于紅外的系統(tǒng)，在指定它后，一系列其它參數(shù)均可由軟件自動配套完成設置。3.Quality選項卡，通過適當設定需要檢查的各個因素

8、及其程度等，系統(tǒng)在采集過程中即時指示并記錄相關因素的狀態(tài)，用于保證光譜質量。使用時注意，因素及其（量化）程度選擇必須適當，否則軟件不能提供正確的提示。UseSpectralQualityCheck決定是否使用此項功能。4.Advanced選項卡中的參數(shù)選擇中：ZeroFilling用以改善譜圖曲線的連續(xù)性。Apodization變跡（切趾）函數(shù)，在分辨率與信躁比之間權衡。其中Boxcar應用于高分辨率，Blackman-Harris應用于高信躁比，而Happ-Genzel最常用，它兼顧了信躁比和分辨率。SampleSpacing采樣間隔，1自15798CM-1始，2自7899CM-1始，4從3

9、949CM-1始記錄光譜數(shù)據(jù)。PhaseCorrection相位矯正。Low（High）PassFilter低（高）通濾波器轉折頻率。5.Diagnostic選項卡： # 電子部件,分束片與檢測器。 上面五個是診斷圖標，被點擊時顯示出相應信息，但沒有BenchDiagnostic中給出的充分，其中的“V”和“X”分別指示正常和不正常。a）當Viewreferencedetector被選時，窗口中的紅外干涉圖就被參考檢測器的干涉信號取代，其強度一般在12V以上。此信號用于干涉圖峰位控制、Nexus中的濕度檢查和IR檢測器的故障判斷。b）Align，對干涉儀進行自動準直，將儀器調整并保持運行在最佳

10、狀態(tài)。需人工調整干涉儀的系統(tǒng)，如G系列和大部分Impact，沒有此項功能。c）ResetBench，光學臺重置（復位）。d）VerifySmartAccessory,有E.S.P.功能的系統(tǒng)中，對智能附件進行確認（識別）。e）ConfigureBench，光學臺系統(tǒng)設置，輸入光源、分束器、檢測器和與計算機通訊的地址參數(shù)等。對有E.S.P功能的系統(tǒng)軟件會自動設置，一般不需要人為調整，除非有特殊用戶元件。f）CheckDesiccant,干燥狀態(tài)檢查（Nexus系列）。根據(jù)結果，決定干燥劑需要更換與否。在Omnic軟件中（不含EZ），使用MatchSpectrumSetting，按選定光譜圖的實驗

11、條件設置有關數(shù)據(jù)采集的所有參數(shù)，確保光譜的可比性。SpectralQualityReference用來評價儀器狀態(tài)。6背景與樣品數(shù)據(jù)文件的采集根據(jù)上面的順序，用CollectBackgroundCollectSampl的指令進行數(shù)據(jù)采集。在背景管理BackgroundHandling中選擇前兩項之一時，背景要按照所提示的順序采集。選擇第三項時，后面輸入的數(shù)值就是設定的背景有效使用分鐘數(shù)，到時候軟件會提示需要重新采集背景。七.顯示、打印與存盤選擇光譜：采集好的光譜可以以重疊（Overlay）或分層（Stack）的方式顯示到指定的窗格中。最后加入或被點擊的光譜圖是紅色，即“選中的”。顯示范圍（坐標

12、）：其大小可以通過a）DisplayLimits輸入數(shù)值，b）拖動鼠標，c）取景窗（X軸），d）View菜單中Full,Common,Match，Offset-Scale（Y軸），e）Roll/ZoomWindow工具等等來調整。使用FindPeaks或宓標峰位置，用“圖標工具”進行峰高、峰面積測量與標注等等操作。通過打開(Open)、剪切(Cut)、刪除(Clear)、拷貝(Copy)、粘貼(Paste)、保存光譜圖(Save,SaveAs)和保存光譜圖組(SaveGroup)進行文件管理。顯示設置(DisplaySetup)：a)顯示項目，b)注釋方式及項目，c)X軸格式，是否對低波數(shù)范圍

13、擴展或者以波長為單位，d)分層(Stack)顯示光譜的個數(shù)，e)所要顯示有關采樣信息的選項。打?。篴)按照顯示直接打印，b)按照報告模板(ReportTemplate)打印。顯示與打印的有關系統(tǒng)設置在EditOption中選擇。八.數(shù)據(jù)的分析處理轉換：透過(Transmittance)與吸收(Absorbance)之間的轉換。OtherConversions其它轉換，包括漫反射、光聲光譜、反射率的對數(shù)和X軸的波數(shù)/波長轉換。數(shù)據(jù)處理ChangeDataSpacing改變數(shù)據(jù)點的間隔，用以不同分辨率間的比較和處理Derivative導數(shù)光譜SpectralMath數(shù)學運算Multiply乘(某一

14、系數(shù))Add相加(兩個光譜)NormalizeFrequency頻率標準化NormalizeScaleY坐標標準化3Analyze分析FindPeaks峰查找，點擊鼠標設定閾值，靈敏度則與標峰多少有關。Noise噪聲水平測量Average平均值測量(_UsesearchexpertAldrichCondensedPhaseSjListofMatchesLibrarudirectories:C:MyDocumentsOmnichbsAvailablesearchhbranesandgroups:AldrichVaporPhaseSampleHummelPolymerSampleLiOrganic

15、sbyRAMANSampleSigmaBiologicalSampleLiViewselectedgroupcontents:Search光譜檢索ConfiguresearchresultsSearchtype:CorrelationAddDirectory.archlibrariesandgroups:inchVaporPhaseSampleLitHummelPolymerSampleLibra匕口幻八品I路徑/譜庫，建立庫組，選擇檢索類型、內容、家檢索或相關值、絕對值、平導數(shù)和平方導數(shù)。Listcompoundswithmatchvaluesabove:0Maximumnumberofco

16、mpoundsinlist:10IRSpectralInterpretationf光譜解析ShowmatchvaluesStatisticalSpectra統(tǒng)計光譜，取得多個光譜的平均值與偏差點擊Info下的亙二會出現(xiàn)右邊的窗口，解釋可能的對應結構信息。QCCompareQC比對，通過將樣品圖與QC庫中標準品圖比較并以數(shù)字形式的結果說明它們的一致性，用于從原材料到產品的分級分類、品質鑒定，達到量化的質量控制要求。比對的光譜范圍取決于三個因素：a)顯示的范圍，b)QCLibrary光譜范圍，c)LibrarySetup中定義的光譜范圍。LibraryManager譜庫管理，查看譜庫信息，建立和刪

17、除譜庫等在EZOmnic系統(tǒng)中，沒有LibraryManager，代之以CreateLibrary和ViewLibrary。九.報告(Report)Report是Omnic軟件特有的一種數(shù)據(jù)輸出形式。通過模板(Template)的選用和編輯，使用者可以以各種形式打印、存儲報告。報告存儲在Notebook中，以便用各方面信息進行查詢(檢索)。Template調用、編輯模板和新模板創(chuàng)建。Preview/PrintReport預覽、打印報告或另選模版NewNotebook新建Notebook。AddtoNotebook將報告加入Notebook。ViewNotebook查詢、瀏覽和打印Noteboo

18、k和在十.窗口(Window)選擇窗口及其排列，建立新的窗口。NewWindow建新窗口。TileWindows窗口平鋪。CascadeWindows窗口層疊。十一.幫助(Help)Omnic軟件的功能豐富多樣，使用過程中，單擊鼠標右鍵或按F1鍵等啟動靈活的在線幫助。在幫助菜單中提供大量的系統(tǒng)的信息，有儀器整體的介紹，系統(tǒng)的FT-IR理論，樣品測試的操作過程，軟件使用，附件的介紹和使用等等。還有當系統(tǒng)有故障時的提示，對硬件的診斷，等等。十二.其他軟件系統(tǒng)設置(Configuration)在軟件的實際使用中，有些需要和要求可是不同的，這些不同的要求，可以通過不同設置的調用或修改來實現(xiàn)。軟件系統(tǒng)設

19、置的調用與存儲，是從Omnic中的FileOpenConfiguration與SaveConfigurationAs來進行。EditOption,EditMenu,EditToolbar等是對設置進行修改調整。下面是一些實例：.修改初始的文件路徑：EditOption，在Filetab的Derictories框中選擇，例如對于光譜文件目錄，選擇框中Initialspectra，再點擊右邊的SelectPath，選擇新的路徑1后，單擊OK確認。對于Useinitialdirectory/Uselastdirectory的選擇可以將軟件運行當中的光譜文件路徑保持在初始或前面使用過的路徑上。.選擇標

20、注方向：EditOption，在Viewtab的Annotation框中選擇，最后單擊OK確認。.光譜打印線的粗細：EditOption，改變在Printtab的Spectra框中Linethickness的數(shù)值，數(shù)值越大線條越粗。.選擇輸入H2O和CO2的參考光譜：EditOption，單擊在Processtab的Corrections框中H2O或CO2右邊的Browse鍵，之后在打開的Open窗框中選取相應的光譜文件，單擊OK確認。實際使用中要注意采集光譜的參數(shù)和條件，須與實際測量樣品的一致(除了cans)。.選擇顯示窗格中缺省的光譜范圍：EditOption，在Windowtab的X-A

21、xisLimits框中直接鍵入數(shù)值。文件的存儲Omnic軟件提供的光譜存儲有單光譜與光譜組(即多光譜文件*.spg)兩種形式，而對單光譜有提供了多種屬性的選擇，除j*.spa外，常用的還有*.spc等。*.spc是分峰軟件Peaksolve所用形式，*.csv則是將文件儲存為數(shù)組，其每行含有的兩個數(shù)字分別代表波數(shù)和強度，供Omnic系統(tǒng)以外的軟件使用。*.jdx文件是一種更“高級”的文本文件，它有效地利用計算機的存儲空間，成為在國際會議上廣泛采用的“標準”格式。*.csv文件(Comma-SeparateValues)2.881175e+003,4.638804e-0012.883104e+0

22、03,42.885032e+003,52.886960e+003,52.888889e+003,52.890817e+003,62.892746e+003,62.894674e+003,72.896603e+003,72.898531e+003,82.900460e+003,92.902388e+003,12.904317e+003,12.906245e+003,12.908174e+003,12.910102e+003,12.912031e+003,12.913959e+003,12.915888e+003,22.917816e+003,22.919745e+003,22.921673e+0

23、03,22.923602e+003,22.925530e+003,22.927459e+003,2916947e-001201893e-001502175e-001828485e-001200642e-001643446e-001197999e-001897061e-001762876e-001778873e-001090971e+000210047e+000334765e+000465857e+000607575e+000754251e+000903528e+000045945e+000187768e+000316552e+000424041e+000458550e+000428019e+0

24、00297143e+000ecnabrosbAPeakinPolystyrenefilm2.4PolystyrenemeasuredasafilmMonMay1209:13:0819972.20.3752.01.81.61.41.21.00.80.60.42960295029402930292029102900Wavenumbers(cm-1)28902880從數(shù)據(jù)文件使用與管理方便的角度出發(fā)，應考慮多建立子目錄，使用旨即可在當前目錄中直接建立新子目錄，這樣就可以將不同時間、批號、樣品的不同種類或來源等等區(qū)別開，存到不同的路徑當中。Toolbor的使用和編輯為了更加方便地進行操作，Omnic軟

25、件中提供有大量的工具鍵，用鼠標單擊就直接執(zhí)行對應的功能。對于當前|Toolbar中排列著的部分，可以通過Edit-EditToolbar，增加或刪除其中的工具鍵，用鼠標直接從ButtonLibrary中選取所要添加的兼拖入中間的CurrentToobar即可。對于工具鍵的大小、顯示內容和排列的方向、位置，使用者可在該窗口的右邊選擇。有上部的Additem是添加已編制好的宏程序或外部命令等用的。Log（日志）的使用Omnic軟件提供了一種記錄功能：Log，它以流水帳的形式記錄各種操作的結果，作為文本文件儲存，使用RTF作為缺省的擴展名。通過OpenLog和CloseLog來啟動和終止。Edit中

26、其他功能Cut減切，Copy拷貝，Paste粘貼，PasteImage影象粘貼，Clear刪除，SelectAll全選，DeleteAnnotation標注刪除。 Copy（和Cut）操作將選中的光譜數(shù)據(jù)復制到剪貼板，供Paste用。Paste的對象不僅僅是光譜顯示窗口，而且可以是Word、Excel等各種Omnic軟件以外的應用程序。這樣就給儀器使用人員提供了方便，將打印效果完美無缺的光譜圖按照需要的比例、大小直接融入文章和報告當中。6登錄的選用與取消在需要對進入Omnic進行保護性限制時，請選擇EnableOmnicLog-In，輸入字符若干作為口令。需要取消或由于忘記口令時，打開在C:WindowsOmnic32.ini文件，將CUSTOMERINFO中的UseLogin=l改為等于0，用Save命令回存。應用一：克服環(huán)境中H2O與CO2的干擾：Omnic軟件實際應用通常不與樣品光譜信息重疊，所以可結合區(qū)間工具與CO2的吸收峰比較窄，而且位置（2350CM-1附近）StraightLine功能結合將其消除。H2O的扣除則是通過光譜差減，Omnic軟件不但提供專門對的H2O與CO2進行矯正處理功能，而且可以良好的效果。具體步驟是：通過適當?shù)脑O置，在數(shù)據(jù)采集過程中直接自動矯正，得到EditOption