生物信息學(xué)李霞市公開(kāi)課金獎(jiǎng)市賽課一等獎(jiǎng)?wù)n件

第一章DNA、RNA和

蛋白質(zhì)序列信息資源

DNA、RNAAndProteinSequenceInformationResources中國(guó)醫(yī)科大學(xué)趙雨杰

第1頁(yè)生物信息學(xué)（bioinformatics）

在生命科學(xué)研究中發(fā)展起來(lái)一門由分子生物學(xué)與計(jì)算機(jī)信息處理技術(shù)相結(jié)合，以計(jì)算機(jī)為研究工具對(duì)生物信息進(jìn)行獲取、處理、儲(chǔ)存、傳輸、分析、模擬和解釋交叉學(xué)科。第2頁(yè)生物信息學(xué)研究?jī)?nèi)容它利用數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)和軟件技術(shù)對(duì)大量積累生物大分子序列數(shù)據(jù)進(jìn)行比較和分析，揭示出生物大分子分子結(jié)構(gòu)、功效和進(jìn)化關(guān)系以及基因組組成與基因表示等生物學(xué)事件對(duì)生命活動(dòng)影響。

第3頁(yè)生物信息學(xué)研究重點(diǎn)主要表示在基因組學(xué)（genomics）和蛋白質(zhì)組學(xué)（proteomics）兩方面。它從核酸和蛋白質(zhì)序列出發(fā)，分析序列中與結(jié)構(gòu)、功效相關(guān)生物信息表示。第4頁(yè)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)生物信息學(xué)中各類數(shù)據(jù)庫(kù)幾乎覆蓋了生命科學(xué)各個(gè)領(lǐng)域，如核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)，蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)，蛋白質(zhì)、核酸、多糖三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)，基因組數(shù)據(jù)庫(kù)，文件數(shù)據(jù)庫(kù)和其它種類數(shù)據(jù)庫(kù)。第5頁(yè)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)分類

生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)種類繁多，就當(dāng)前來(lái)看，大致能夠分為四個(gè)大類：

1.基因組數(shù)據(jù)庫(kù)；

2.核酸和蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)序列數(shù)據(jù)庫(kù)；

3.生物大分子（主要是蛋白質(zhì)）三維空間結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)；

4.依據(jù)以上三類數(shù)據(jù)庫(kù)和文件資料為基礎(chǔ)構(gòu)建二次數(shù)據(jù)庫(kù)。也稱專門數(shù)據(jù)庫(kù)、專業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)或?qū)Ｓ脭?shù)據(jù)庫(kù)。一次數(shù)據(jù)庫(kù)第6頁(yè)第二節(jié)核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)

Section2NucleicAcidsequenceDatabases自20世紀(jì)80年代第一個(gè)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)建立以來(lái)，核酸數(shù)據(jù)庫(kù)快速發(fā)展。在互聯(lián)網(wǎng)上不但有核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)，還出現(xiàn)了基因組相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)、基因表示數(shù)據(jù)庫(kù)、人類基因突變及疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、進(jìn)化相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)及其它與核酸相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)。第7頁(yè)三大核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)GenBankEMBLDDBJ

第8頁(yè)特殊類型核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)：非編碼RNA數(shù)據(jù)庫(kù)（ncRNA）；表示序列標(biāo)簽數(shù)據(jù)庫(kù)（dbEST）；序列標(biāo)簽位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)（dbSTS）；miRBase；tRNAdb等。第9頁(yè)基因組相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)：人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（HGD）；基因組序列數(shù)據(jù)庫(kù)（GSDB）；基因組在線數(shù)據(jù)庫(kù)（GOLD）等。第10頁(yè)核酸三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)：核苷酸三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（NDB）；普納大學(xué)核酸結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（BNASDB）等。第11頁(yè)基因表示數(shù)據(jù)庫(kù)：基因表示庫(kù)（GEO）；斯坦福微陣列數(shù)據(jù)庫(kù)（SMD）；ArrayExpress；CGED；GXD；BodyMap等。第12頁(yè)人類基因突變及疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)：人類基因變異數(shù)據(jù)庫(kù)（HMGD）、人類遺傳雙等位基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)（HGBASE）、人類孟德?tīng)栠z傳在線（OMIM）、國(guó)際單體型計(jì)劃（HapMap）、人類單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)（dbSNP）、腫瘤基因數(shù)據(jù)庫(kù)（TGDB）、疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫(kù)（GAD）、癌癥基因數(shù)據(jù)庫(kù)（CGAP）、人類表觀遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)（HEP）、人類DNA甲基化與癌癥數(shù)據(jù)庫(kù)（MethylCancer）等。第13頁(yè)一、GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank（）是一個(gè)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)，該數(shù)據(jù)庫(kù)中包含了已經(jīng)公開(kāi)30萬(wàn)余種不一樣物種生物核酸序列，這些數(shù)據(jù)主要起源于全世界不一樣試驗(yàn)室和大規(guī)模測(cè)序計(jì)劃項(xiàng)目。

第14頁(yè)GenBank是含有目錄和生物學(xué)注釋核酸序列綜合數(shù)據(jù)庫(kù)，由美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館國(guó)家生物技術(shù)信息中心構(gòu)建、維護(hù)和管理。該中心位于美國(guó)馬里蘭國(guó)家健康研究所（NIH）。GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)序列數(shù)據(jù)起源于序列發(fā)覺(jué)者提交序列、批量提交表示序列標(biāo)簽（expressedsequencetag,EST）、基因組測(cè)序序列（genomesurveysequence,GSS）和其它測(cè)序中心提供高通量數(shù)據(jù)，還包含美國(guó)專利商標(biāo)局提供已發(fā)表專利序列數(shù)據(jù)。第15頁(yè)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)天天與歐洲分子生物學(xué)試驗(yàn)室核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)（EuropeanMolecularBiologyLaboratoryNucleotideSequenceDatabase，EMBL）和日本DNA數(shù)據(jù)庫(kù)（DNADataBankofJapanDDBJ）進(jìn)行數(shù)據(jù)交換，以確保數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)容在全世界范圍同時(shí)性。第16頁(yè)在NCBI（）主頁(yè)上提供了進(jìn)入GenBank路徑、相關(guān)檢索和分析服務(wù)。經(jīng)過(guò)NCBI檢索系統(tǒng)（Entrez）能夠進(jìn)入GenBank。Entrez檢索程序整合了主要DNA和蛋白序列數(shù)據(jù)分類學(xué)、基因組、圖譜、蛋白結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)（功效）域信息，還包含相關(guān)PubMed生物醫(yī)學(xué)文件信息。BLAST程序提供GenBank和其它序列數(shù)據(jù)庫(kù)中序列相同性搜索服務(wù)。

第17頁(yè)（一）GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)1.依據(jù)序列物種起源分類2.Genbank統(tǒng)計(jì)和分類2.1表示序列標(biāo)簽(EST)2.2序列標(biāo)簽位點(diǎn)(STS)、基因組勘測(cè)序列(GSS)和環(huán)境樣品序列(ENV)2.3高通量基因組(HTG)和高通量cDNA(HTC)序列2.4全基因組鳥(niǎo)槍測(cè)序序列(WGS)2.5轉(zhuǎn)錄組鳥(niǎo)槍組合序列第18頁(yè)（一）GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)3.特殊統(tǒng)計(jì)類型3.1第三方注釋（TPA）3.2GenBankCON統(tǒng)計(jì)較小統(tǒng)計(jì)組合統(tǒng)計(jì)第19頁(yè)（二）構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)1．直接電子提交1.1使用BankIt提交1.2使用Sequin和tbl2asn提交1.3條形碼序列提交2.序列標(biāo)識(shí)符和統(tǒng)計(jì)號(hào)第20頁(yè)（三）檢索GenBank數(shù)據(jù)1.Entrez系統(tǒng)（）2.與測(cè)序計(jì)劃?rùn)z索相關(guān)序列統(tǒng)計(jì)（）3.BLAST序列相同性搜索（）4.用FTP獲取GenBank（）第21頁(yè)二、EMBL數(shù)據(jù)庫(kù)EMBL建立于1980年，EMBL核苷序列數(shù)據(jù)庫(kù)（http://）是歐洲主要核苷序列搜集單位，歐洲生物信息中心EBI（即EMBL在德國(guó)海德堡站點(diǎn)）維護(hù)這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)。核苷數(shù)據(jù)來(lái)自基因組測(cè)序中心、世界各地科學(xué)家、歐洲專利局、以及與合作搭檔DDBJ(Japan)和GenBank(USA)交換數(shù)據(jù)。第22頁(yè)三、DDBJ數(shù)據(jù)庫(kù)日本DNA數(shù)據(jù)庫(kù)（DDBJ）是在亞洲唯一核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)，是搜集研究者公認(rèn)測(cè)定核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)，而且發(fā)放給數(shù)據(jù)提交者國(guó)際認(rèn)證核酸序列編號(hào)。因?yàn)镈DBJ天天將搜集數(shù)據(jù)與EMBL-Bank/EBI和GenBank/NCBI進(jìn)行交換，使得三個(gè)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)幾乎在任何時(shí)候都享受相同數(shù)據(jù)。DDBJ主要搜集來(lái)自日本研究者取得序列數(shù)據(jù)，但也搜集數(shù)據(jù)和發(fā)放編號(hào)給任何其它國(guó)家研究者。第23頁(yè)四、其它主要核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)dbEST：dbEST是GenBank中一個(gè)子數(shù)據(jù)庫(kù)，包含起源于不一樣物種表示序列數(shù)據(jù)和表示序列標(biāo)簽序列其它信息。ncRNAdb：非編碼RNA（non-codingRNAncRNA）數(shù)據(jù)庫(kù)意在提供非編碼RNA序列和功效信息。miRBase：miRBase序列數(shù)據(jù)庫(kù)主要存放已發(fā)表微小RNA（microRNAmiRNA)序列和注釋數(shù)據(jù)庫(kù)。第24頁(yè)第三節(jié)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

Section3ProteinSequenceDatabase

伴隨分子生物學(xué)發(fā)展，人們?nèi)〉昧嗽絹?lái)越多關(guān)于蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)和功效信息。世界各國(guó)生物學(xué)家和計(jì)算機(jī)科學(xué)家合作利用這些信息構(gòu)建了蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)（二維凝膠電泳數(shù)據(jù)庫(kù)）、信號(hào)傳導(dǎo)及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、DNA和蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)等蛋白質(zhì)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)。

第25頁(yè)慣用蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)：PIRMIPSSwiss-Prot第26頁(yè)蛋白質(zhì)功效、結(jié)構(gòu)域和蛋白質(zhì)家族相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)：PROSITEInterProPfamProDomSMART等第27頁(yè)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)：PDBBioMagResBankSWISS-MODELRepositoryModBaseCATHSCOPReLiBaseTOPSSWISS-3DIMAGEBioImage等第28頁(yè)蛋白質(zhì)二維凝膠電泳數(shù)據(jù)庫(kù)：WORLD-2DPAGEPhoretixlinks第29頁(yè)信號(hào)傳導(dǎo)及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)：DIPINTERACTProNetKEGGCANSITESPADCSNDB等第30頁(yè)DNA和蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)：DPInteract蛋白質(zhì)翻譯后修飾相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)：O-GlycBase、PhosphoBase、RES蛋白質(zhì)等蛋白質(zhì)第31頁(yè)一、PIR數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白質(zhì)信息庫(kù)（PIR）（）是一個(gè)支持基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)檢索和科學(xué)研究綜合公共生物信息學(xué)資源。PIR是由美國(guó)國(guó)家生物醫(yī)學(xué)基金會(huì)（NBRF）于1984年建立，幫助研究者確認(rèn)和解釋蛋白序列信息數(shù)據(jù)庫(kù)。PIR無(wú)償為科學(xué)界提供包含蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)（PSD）在內(nèi)蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)和分析工具。第32頁(yè)P(yáng)IR信息庫(kù)資源第33頁(yè)P(yáng)IR主要數(shù)據(jù)庫(kù)：1.UniProt-通用蛋白質(zhì)資源庫(kù)2.iProClass-蛋白質(zhì)知識(shí)整合數(shù)據(jù)庫(kù)3.PIRSF-蛋白質(zhì)家族分類系統(tǒng)4.iProLINK-蛋白質(zhì)文件、信息和知識(shí)整合數(shù)據(jù)庫(kù)第34頁(yè)1.UniProt-通用蛋白質(zhì)資源庫(kù)UniProt（）是存放和鏈接其它蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)資源庫(kù)，而且是蛋白質(zhì)序列和含有綜合功效注釋目錄中心資源庫(kù)。使用UniprotKB能夠檢索準(zhǔn)確、可靠蛋白綜合信息。使用UniRef能夠降低冗余，加速序列相同性搜索。使用UniParc能夠檢索存檔序列和它們起源數(shù)據(jù)庫(kù)。第35頁(yè)2.iProClass-蛋白質(zhì)知識(shí)整合數(shù)據(jù)庫(kù)iProClass（）提供來(lái)自90多個(gè)生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)大量整合數(shù)據(jù)，包含蛋白ID圖譜服務(wù)、UniProtKB編注蛋白質(zhì)摘要描述和篩選UnParc數(shù)據(jù)庫(kù)蛋白質(zhì)序列。使用iProClass能夠檢索最新蛋白質(zhì)綜合信息，包含：功效、轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、相互作用、家族分類、基因和基因組、功效注釋標(biāo)準(zhǔn)體系（ontology）、文件和分類學(xué)信息。使用iProClass還能夠檢索ID圖譜、蛋白質(zhì)詞典和相關(guān)序列。第36頁(yè)3.PIRSF-蛋白質(zhì)家族分類系統(tǒng)PIRSF（）分類系統(tǒng)概要敘述家族特征，如家族名稱、分類分布、分級(jí)和功效域結(jié)構(gòu)，以及家族組員，包含功效、結(jié)構(gòu)、傳導(dǎo)通路、功效注釋標(biāo)準(zhǔn)體系（ontology）和家族分類。利用這些信息能夠取得蛋白質(zhì)準(zhǔn)確功效或預(yù)測(cè)功效和該蛋白質(zhì)所屬家族組員共有其它特征。第37頁(yè)4.iProLINK-蛋白質(zhì)文件、信息和知識(shí)整合數(shù)據(jù)庫(kù)iProLINK（）提供相關(guān)注釋內(nèi)容文件、蛋白質(zhì)名稱詞典和其它有利于文件挖掘人文語(yǔ)言處理技術(shù)開(kāi)發(fā)信息、數(shù)據(jù)庫(kù)校正、蛋白質(zhì)名稱標(biāo)識(shí)和功效注釋標(biāo)準(zhǔn)體系（ontology）。使用iProLINK能夠取得描述蛋白質(zhì)統(tǒng)計(jì)文本文件資源，在UniProtKB統(tǒng)計(jì)（生物詞典）中加入蛋白質(zhì)或基因命名圖譜，取得用于開(kāi)發(fā)文本挖掘算法注釋數(shù)據(jù)集、挖掘蛋白質(zhì)磷酸化（RLIMS-P）文件和取得蛋白質(zhì)功效注釋標(biāo)準(zhǔn)體系（ontology）（PRO）信息。第38頁(yè)二、MIPS數(shù)據(jù)庫(kù)慕尼黑蛋白質(zhì)序列信息中心（MIPS）（），它重點(diǎn)工作是基因組生物信息學(xué)，尤其重視基因組信息系統(tǒng)分析，包含應(yīng)用生物信息學(xué)方法注釋基因組、表示分析和蛋白質(zhì)組學(xué)方面研究。MIPS支持和維護(hù)一系列基因組數(shù)據(jù)庫(kù)以及系統(tǒng)，能夠提供細(xì)菌、真菌和植物基因組比較分析服務(wù)。在該站點(diǎn)提供基因組分析工具、數(shù)據(jù)庫(kù)檢索系統(tǒng)、表示分析、蛋白相互作用等網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。

第39頁(yè)三、其它主要蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)：PRINTSPfam第40頁(yè)（一）PRINTSPRINTS（）是蛋白基序指紋圖綜合數(shù)據(jù)庫(kù)，每個(gè)指紋圖都是使用數(shù)據(jù)掃描程序ADSP或VISTAS序列分析軟件包重復(fù)優(yōu)化后定義。數(shù)據(jù)庫(kù)中有兩種類型指紋圖，依據(jù)指紋圖復(fù)雜性分為簡(jiǎn)單和復(fù)合指紋圖：簡(jiǎn)單指紋圖基本上是單一基序，而復(fù)合指紋圖包含多個(gè)基序。

第41頁(yè)（二）Pfam蛋白質(zhì)普通是由一個(gè)或多個(gè)功效區(qū)域組成，這些功效區(qū)域通常稱作域（domain）。在不一樣蛋白質(zhì)中不一樣域以不一樣組合出現(xiàn)，造成在自然界發(fā)覺(jué)各種多樣組成成份蛋白質(zhì)。識(shí)別出現(xiàn)在蛋白質(zhì)中域能夠了解蛋白質(zhì)功效。Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)（）是一個(gè)大蛋白質(zhì)域家族集合，每個(gè)家族是用多序列比對(duì)和隱馬模型（HMMs）分析結(jié)果代表。第42頁(yè)第四節(jié)NCBI與EBI

Section4NCBIandEBI一、NCBI介紹二、EBI介紹第43頁(yè)一、NCBI介紹作為一個(gè)國(guó)家分子生物學(xué)信息資源，NCBI使命是開(kāi)發(fā)新信息技術(shù)，幫助了解控制健康和疾病基本分子和遺傳過(guò)程。尤其是，NCBI擔(dān)負(fù)建立存放和分析分子生物學(xué)、生物化學(xué)和遺傳學(xué)知識(shí)自動(dòng)系統(tǒng)；提供研究和醫(yī)學(xué)界使用方便數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件；努力協(xié)調(diào)搜集國(guó)內(nèi)外生物技術(shù)信息；執(zhí)行分析生物學(xué)主要分子結(jié)構(gòu)和功效先進(jìn)研究方法。第44頁(yè)二、EBI介紹歐洲生物信息學(xué)研究所（EMBL-EBI），是歐洲分子生物學(xué)試驗(yàn)室（EMBL）一部分，EMBL-EBI維護(hù)世界上最廣泛分子數(shù)據(jù)庫(kù)。EMBL-EBI是在全球范圍內(nèi)，努力協(xié)調(diào)搜集和傳輸生物學(xué)數(shù)據(jù)歐洲節(jié)點(diǎn)，EMBL-EBI許多數(shù)據(jù)庫(kù)是生物學(xué)家們熟知，包含：EMBL-Bank（DNA和RNA序列）、Ensemble（基因組）、ArrayExpress（基于微陣列基因表示數(shù)據(jù)）、UniProt（蛋白質(zhì)序列）、InterPro（蛋白家族、域和基序）、Reactome（傳導(dǎo)通路）和ChEBI（小分子），新資源幫助研究者不但了解組成生物體分子部件，還了解這些部件是怎樣組合組成系統(tǒng)。

第45頁(yè)三、經(jīng)過(guò)EntrezGene從NCBI獲取序列信息Entrez主要是用于NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)綜合、基于文本搜索和檢索系統(tǒng)。Entrez綜合了科學(xué)文件、DNA和蛋白序列數(shù)據(jù)、3D蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)域數(shù)據(jù)、種群研究數(shù)據(jù)集、表示數(shù)據(jù)、完整基因組組裝和分類學(xué)信息，形成一個(gè)緊密鏈接系統(tǒng)。它用于搜索NCBI鏈接數(shù)據(jù)庫(kù)檢索系統(tǒng)。第46頁(yè)Entrez檢索系統(tǒng)子數(shù)據(jù)庫(kù)第47頁(yè)（一）EntrezGene檢索EntrezGene檢索到統(tǒng)計(jì)提供關(guān)鍵鏈接，將圖譜、序列、表示、結(jié)構(gòu)、功效、索引文件和同源數(shù)據(jù)鏈接在一起組成關(guān)鍵鏈接。用定義序列、已知圖譜定位和從表型信息推測(cè)基因，為基因分配特有標(biāo)識(shí)符。這些標(biāo)識(shí)符在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中通用，能夠用于注釋更新跟蹤和相關(guān)信息跟蹤。EntrezGene用NCBI參考序列（RefSeqs）覆蓋了基因組，還被整合到NCBIEntrez和E-Utilities系統(tǒng)索引、查詢和檢索中。

第48頁(yè)NCBI檢索首頁(yè)檢索窗口數(shù)據(jù)庫(kù)

選項(xiàng)下拉菜單第49頁(yè)檢索欄（for）輸入“IL-2human”

第50頁(yè)（二）EntrezGene統(tǒng)計(jì)顯示格式當(dāng)進(jìn)行檢索時(shí)，檢索結(jié)果以摘要（summary）格式顯示，每頁(yè)可顯示多條統(tǒng)計(jì)，摘要顯示每條統(tǒng)計(jì)前有一個(gè)選擇框，能夠選擇哪些統(tǒng)計(jì)需要顯示。顯示內(nèi)容還包含首選名稱標(biāo)志、完整全名、雙單詞物種名稱（在方括號(hào)中）、基因組定位和基因編號(hào)。假如基因在已命名質(zhì)粒上，那么作為基因定位將給出質(zhì)粒名稱。右側(cè)Links能夠關(guān)聯(lián)到顯示相關(guān)Entrez統(tǒng)計(jì)，查對(duì)希望顯示統(tǒng)計(jì)，選擇灰色查詢條目中顯示選項(xiàng)，能夠顯示希望顯示相關(guān)統(tǒng)計(jì)。第51頁(yè)EntrezGene檢索結(jié)果摘要格式顯示頁(yè)面

第52頁(yè)EntrezGene全文匯報(bào)頁(yè)面（前部分）第53頁(yè)EntrezGene全文匯報(bào)頁(yè)面（后部分）第54頁(yè)

IL2mRNANucleotide數(shù)據(jù)庫(kù)統(tǒng)計(jì)檢索結(jié)果顯示界面

第55頁(yè)（三）Nucleotide數(shù)據(jù)庫(kù)統(tǒng)計(jì)顯示格式

Nucleotide數(shù)