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文檔簡介
常有豬病檢測方法常有豬病檢測方法28/28常有豬病檢測方法豬病診斷技術(shù)規(guī)范一、致病性大腸桿菌的檢測引用標(biāo)準(zhǔn)參照NY/T555-2002(動物產(chǎn)品大腸桿菌、糞大腸菌群和大腸桿菌的檢測方法)。范圍適用于豬大腸桿菌病的診斷。檢測方法3.1資料營養(yǎng)肉湯營養(yǎng)瓊脂生化判斷管小白鼠3.2分別培養(yǎng)將收集的肝、脾、心血或腸內(nèi)容物均分別接種伊紅美蘭瓊脂平板(同時接種營養(yǎng)肉湯增菌備用),置37℃培養(yǎng)18~24h。觀察培養(yǎng)特點,挑取黑色有金屬光彩的菌落,用該菌落涂片,革蘭氏染色,鏡檢。如可見到兩端鈍圓并多以單個存在的革蘭氏陰性粗短桿菌,應(yīng)取5~10個典型菌落再接種于TSI瓊脂。同時挑取典型菌落接種營養(yǎng)瓊脂,37℃培養(yǎng)16~18h的菌液用于生化特點判斷。3.3生化判斷挑取上述菌落純培養(yǎng)物接種以下生化培養(yǎng)基和乳糖發(fā)酵管,(36±1)℃培養(yǎng)24h后觀察結(jié)果。靛基質(zhì)試驗:滴加Kovacs氏靛基質(zhì)試劑0.1mL于靛基質(zhì)試驗培養(yǎng)基中混雜,觀察結(jié)果。出現(xiàn)紅色環(huán)的為反應(yīng)陽性;出現(xiàn)黃色環(huán)的為反應(yīng)陰性。甲基紅(MR)試驗滴加甲基紅指示劑0.2mL于MR-VP培養(yǎng)基中混雜,觀察結(jié)果。出現(xiàn)紅色為陽性反應(yīng);出現(xiàn)黃色為陰性反應(yīng)。VP試驗滴加VP試劑甲液0.2mL于MR-VP培養(yǎng)基中混勻,再滴加VP試劑乙液0.1mL混勻,靜置,觀察結(jié)果。b)在15min內(nèi)出現(xiàn)紅色的為陽性反應(yīng);無顏色變化的為陰性反應(yīng)。陰性結(jié)果1h后再觀察一次,出現(xiàn)紅色也為陽性反應(yīng)。枸櫞酸鹽試驗:觀察培養(yǎng)基顏色變化,出現(xiàn)藍(lán)色為陽性反應(yīng);不變色為陰性反應(yīng)。3.4大腸桿菌判斷結(jié)果應(yīng)吻合表1要求。表1大腸桿菌判斷結(jié)果靛基質(zhì)MRVP枸櫞酸鹽判斷++--典型大腸埃希氏桿菌-+--非典型大腸埃希氏桿菌++-+典型檸檬酸鹽桿菌-+-+非典型檸檬酸鹽桿菌+典型產(chǎn)氣桿菌+--+非典型產(chǎn)氣桿菌出現(xiàn)表1的生化反應(yīng)種類時,若是為組織樣品,由此可初步報告為致病性大腸桿菌。若是為糞便,尿液,飼料,飲水,應(yīng)進(jìn)一步做致病性試驗。3.4致病性試驗取經(jīng)營養(yǎng)肉湯37℃培養(yǎng)16~18h后的純化菌株培養(yǎng)液,分別腹腔接種體重20g左右的小白鼠,每株接種2~3只,每只0.3mL(含菌量約為1×1012cfu/mL),同時用相同數(shù)量的小白鼠接種無菌肉湯作比較。飼養(yǎng)觀察、記錄死亡數(shù),并從死亡鼠的心、肝中回收接種菌。在24小時內(nèi)出現(xiàn)死亡的可報告為致病性大腸桿菌。藥敏試驗優(yōu)選瓊脂平板上典型菌落接種營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)中,37℃培養(yǎng)16~18h,菌液用于藥敏試驗。將肉湯培養(yǎng)物(用標(biāo)準(zhǔn)比濁管比較達(dá)相同濁度)稀釋至含菌量為1×109cfu/mL,搖勻后蘸取菌懸液均勻涂布于瓊脂平板上,爾后用無菌鑷子將藥敏片貼附其上,每紙片2~5張,置37℃培養(yǎng)24h后觀察。依照抑菌圈大小來判斷其對藥物的耐受性,選擇敏感藥物。二、沙門氏菌的檢測引用標(biāo)準(zhǔn)參照NY/T550-2002(動物和動物產(chǎn)品沙門氏菌檢測方法)。范圍適用于豬沙門氏菌病的診斷。檢測方法3.1資料賴氨酸脫羧酶(LD)鄰-硝基酚-β-D-半乳糖苷(DNPG)甘露醇糖發(fā)酵管3.2分別培養(yǎng)收集疑似病例的肝、脾、心血或腸內(nèi)容物樣品。無菌剪取肝、脾樣品1g,投入10mLSC增菌液中(血液、糞便樣品可以采合適直接投入10mL增菌液),36±1℃培養(yǎng)18~24h。取一接種環(huán)增菌液劃線接種于DHL瓊脂平板上,36±1℃培養(yǎng)18~24h。觀察平板上菌落生長形態(tài)。沙門氏菌在DHL平板上呈無色半透明,產(chǎn)硫化氫(H2S),菌落中心黑色或幾乎全黑色。3.3生化判斷挑取DHL平板上可疑菌落3~5個,每個菌落先洗入TSI培養(yǎng)基冷凝水中,既而在斜面上劃線接種并高層穿刺接種。再挑取同一菌落依次接種氨基酸脫羧酶發(fā)酵試驗(LD)和ONPG,甘露醇糖發(fā)酵管三支生化管,若菌落偏小,二次挑取菌落有困難,可用接種環(huán)醮取TSI培養(yǎng)基中冷凝水接種其余生化管,36±1℃培養(yǎng)18~24h(挑取菌落后的平板,應(yīng)置于4℃冰箱保留48h以備復(fù)查)。按表1記錄反應(yīng)結(jié)果,比較表2進(jìn)行判斷。凡吻合表2生化反應(yīng)模式,可報告為沙門氏菌。表1生化反應(yīng)結(jié)果判斷生化管TSILDONPGMAN底a斜面b硫化氫第一次顏色黃黃黑紫深黃黃記錄吻合++++++第二次顏色紅紅無黑色黃無色或淡紫黃記錄符號a“底”觀察葡萄糖反應(yīng)。b“斜面”觀察乳糖和蔗糖反應(yīng)。表2生化檢測沙門氏菌屬判斷表序TSIONP斜LDMAN判斷號底硫化氫G面A+-++-+沙門氏菌亞種Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ沙門氏菌亞種Ⅲb、15%ⅢaBa++++++沙門氏菌亞種Ⅲa、Ⅴ、15%Ⅲb、C+-++++15%ⅡDb+-+--+Ec+--+-+少許沙門氏菌亞種Ⅰ少許沙門氏菌亞種ⅠFd++甲型副傷寒沙門氏菌G-+--+-++-非沙門氏菌a含1%硫化氫陽性的大腸埃希氏菌,可加試靛基質(zhì)加以鑒別,其中大腸桿菌陽性,沙門氏菌陰性。賴氨酸陰性的沙門氏菌主要有:甲型副傷寒、傷寒、豬霍亂沙門氏菌孔成道夫變種、雞等。硫化氫陰性的沙門氏菌主要有:甲型副傷寒、傷寒、豬霍亂、豬傷寒、仙臺、貝塔、巴布亞、雞、馬流產(chǎn)、山夫登堡、都柏林登。??芍苯佑茫∣)單因子血清證明,以消除雷極氏普羅菲登斯菌登。藥敏試驗優(yōu)選DHL平板上典型菌落接種營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)中,36±1℃培養(yǎng)16~18h,菌液用于藥敏試驗。將肉湯培養(yǎng)物(用標(biāo)準(zhǔn)比濁管比較達(dá)相同濁度)稀釋至含菌量為1×109cfu/mL,搖勻后蘸取菌懸液均勻涂布于瓊脂平板上,爾后用無菌鑷子將藥敏片貼附其上,每紙片2~5張,置36±1℃培養(yǎng)24h后觀察。依照抑菌圈大小來判斷其對藥物的耐受性,選擇敏感藥物。三、產(chǎn)氣莢膜梭菌的檢測引用標(biāo)準(zhǔn)自定標(biāo)準(zhǔn)。范圍適用于豬產(chǎn)氣莢膜梭菌病的診斷。資料3.1綿羊血瓊脂3.2牛乳培養(yǎng)基。組織染色鏡檢對疑似病例的腸道黏膜涂片,魏氏梭菌呈G+,直桿狀,兩端鈍圓,單在或成雙,無鞭毛,不運動。芽孢大而卵圓,位于菌體中央或近端,多數(shù)菌株可形成莢膜。分別培養(yǎng)可將腸道內(nèi)容物接種血平板,37℃厭氧培養(yǎng)18~24h后觀察。菌落特點:魏氏梭菌在血平板上可形成直徑2~5mm、圓形、邊緣整齊、灰色至灰黃色、表面圓滑半透明、圓屋頂狀菌落,有雙層溶血環(huán)??山?jīng)過鏡檢對形態(tài)進(jìn)一步確定。生化判斷對牛乳培養(yǎng)基的“暴烈發(fā)酵”。腸內(nèi)毒素檢查收集空腸后段或結(jié)腸前段內(nèi)容物,加合適生理鹽水稀釋,經(jīng)離心積淀后取上清液分成兩份,一份加熱(60℃30min)。兩份上清液分別靜脈注射家兔(1~3ml)或小鼠(0.1~0.3ml)。如有毒素存在,不加熱組動物常于數(shù)分鐘至數(shù)小時內(nèi)死亡,而加熱組動物不死亡。報告因為正常人畜腸道內(nèi)存在此菌,并且發(fā)病菌主要靠在腸道內(nèi)產(chǎn)生毒素致病,細(xì)菌自己其實不侵入機(jī)體。因此只有細(xì)菌分別和腸毒素檢查都吻合,并結(jié)合臨床癥狀才能報告產(chǎn)氣莢膜梭菌感染。鑒別A型和C型要靠中和保護(hù)試驗。四、豬痢疾診斷引用標(biāo)準(zhǔn)參照NY/T545-2002。范圍適用于豬痢疾(SD)的實驗室診斷。3糞便中Sh顯微鏡檢查3.1資料器材:顯微鏡,暗視野鏡頭,玻片及蓋玻片,酒精燈等染色液:結(jié)晶紫染色液或稀釋的石炭酸復(fù)紅。樣品:病豬新鮮糞便(含粘)或直腸拭子或大腸內(nèi)容物及黏膜3.2操作方法,水洗,吸干后待檢。懸滴樣品制作:取樣品少許懸于生理鹽水,待檢。每份樣品最少制片2張顯微鏡檢查:染色樣品以油鏡直接觀察,懸滴樣品在暗視野400~1000倍鏡頭下觀察。3.3結(jié)果判斷典型Sh菌體長6μm~8.5μm,呈2~5個密螺旋體,兩端尖銳,呈蛇樣爽朗運動。當(dāng)視野中有數(shù)量(3~5條以上)Sh樣菌體時,在獲培養(yǎng)前,可作為診斷的重要參照。分別培養(yǎng)和判斷4.1資料準(zhǔn)備器材:厭氧培養(yǎng)裝置及使用方法,細(xì)菌學(xué)實驗老例器材,外科手術(shù)器材,微孔濾器0.65μm濾膜。試驗動物:小鼠(20g左右)試劑:PBS(0.01M,pH7.2),生理鹽水,多粘菌素,TSA。樣品:病豬新鮮糞便或大腸粘膜刮取物(含粘液)。對死豬或撲殺豬大腸分段結(jié)扎(每段10cm),分別取出。樣品應(yīng)盡早分別培養(yǎng),也可0~4℃保留4~7d。4.2操作方法樣品種Sh鏡檢將樣品少許摸片染色或作成懸滴標(biāo)本,鏡檢,觀察Sh有無活力。含菌量少且無活力者,則難以分別成功。分別培養(yǎng)直接劃線分別法:即取樣品直接在TSA上劃線接種若干皿。集菌法:先將樣品以生理鹽水或PBS作1:5稀釋,2000r/min,棄去積淀。將上清液再以6000~8000r/min離心20min。取積淀劃線接種TSA若干皿。4.2.2.3稀釋法:將樣品或集菌法的積淀物作10倍梯度稀釋至10-6~10-8。取各梯度稀釋液各1滴,分別劃線接種于TSA上,(每梯度稀釋液最少接種3皿)。接種后的培養(yǎng)皿置厭氧罐內(nèi)進(jìn)行厭氧培養(yǎng)。若上述稀釋液中加入多粘菌素200U/mL~300U/mL,可提高分別率。4.3結(jié)果判斷觀察每隔2~4d開罐檢查一次,共2~4次,觀察有無溶血區(qū)及溶血菌落。致病性Sh呈強(qiáng)β溶血,一般看不見菌落。當(dāng)培養(yǎng)條件合適時,再溶血區(qū)可見到云霧狀菌苔。無害蛇樣螺旋體等呈弱β溶血。移植純化先作溶血區(qū)內(nèi)物質(zhì)涂片,染色鏡檢。如見Sh樣菌體,可在無菌落溶血區(qū)內(nèi)移取小塊瓊脂劃線于TSA若干皿。這樣每隔2天移植一次,一般2~4次后即可純化和保留。豬蛇樣螺旋體判斷溶血試驗將豬蛇樣螺旋體、無害蛇樣螺旋體或毛腸蛇樣螺旋體及被檢菌株,分別劃線于同一TSA上不相同區(qū)內(nèi),經(jīng)48h培養(yǎng)后,觀察比較其溶血程度。腸致病性試驗每菌株最少接種6只小鼠,將小鼠停飼24h后,每只每次灌服1mL(含菌3~5億),次日再灌服一次,15d后剖檢觀察盲腸病變。感染后50%出現(xiàn)腹瀉和病變者,則為致病Sh。五、豬巴氏桿菌病診斷技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)參照NY/T564-2002。范圍適用于豬巴氏桿菌病的檢測。資料3.1改良馬丁氏瓊脂3.2馬丁氏肉湯3.3常用生化培養(yǎng)基。組織染色鏡檢用肝臟組織或心血摸片或純培養(yǎng)物染色呈陰性,瑞氏染色呈兩極濃染的球桿菌。病原分別判斷將瀕死前或死后數(shù)小時內(nèi)以無菌手術(shù)采用病死豬的心血、肝臟組織,接種于改良馬丁氏瓊脂斜面,進(jìn)行分別。培養(yǎng)18~24h后,改良馬丁瓊脂斜面生長純粹的培養(yǎng)物,呈微藍(lán)色菌臺或菌落。馬丁肉湯培養(yǎng)物生長為均勻渾濁,不產(chǎn)生菌膜。生化判斷本菌發(fā)酵葡萄糖、果糖、半乳糖,多數(shù)發(fā)酵蔗糖,不發(fā)酵乳糖、肌醇、菊糖、水楊素及鼠李糖,吲哚試驗和氧化酶試驗陽性。診斷判斷依照臨床癥狀和病理變化,加上涂片染色鏡檢,可對本病作出初步的診斷,但確診要靠病原分別判斷。六、豬鏈球菌病診斷技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)參照GB/T19915.2-2005和GB/T19915.9-2005范圍適用于豬鏈球菌病診斷。資料3.1綿羊血瓊脂組織染色鏡檢對最急性和急性病例,無菌采用集病死豬的心、肝、脾、肺、腎和淋奉迎等組織做觸片,姬姆薩染色,鏈球菌可見較純的單個或成雙的圓形或橢圓形球菌,有少許形成短鏈和長鏈,如見鏈球菌則表示病料中可能含有鏈球菌。病原分別判斷無菌取心、肝、脾、肺、腎或淋奉迎內(nèi)部組織劃線接種一般瓊脂綿羊血平板,36±1℃培養(yǎng)24±2h,若是菌落生長緩慢,可延伸至48±2h后觀察。若是是豬鏈球菌2型,培養(yǎng)24h,在一般瓊脂綿羊血平板形成圓形、微凸、表面光滑、濕潤、邊緣整齊、半透明的菌落,直徑0.3mm~1mm,大多數(shù)菌株呈α溶血,部分菌株產(chǎn)生β溶血。將可疑菌落做革蘭氏染色和過氧化氫酶試驗。本菌為革蘭氏陽性球菌,菌體直徑μl固體培養(yǎng)物以雙球菌為多,少許呈3個~5個排列的短鏈,液體培養(yǎng)物以鏈狀為主,無芽孢,能形成莢膜。本菌過氧化氫酶試驗均為陰性。菌落生長特點、革蘭氏染色、菌體形態(tài)和過氧化氫試驗吻合者,可初步確定為鏈球菌。生化判斷經(jīng)初步判斷后,做5%乳糖、海藻糖、七葉苷、甘露醇、山梨醇、馬尿酸鈉等糖發(fā)酵試驗。7PCR判斷可否為豬鏈球菌2型必要時進(jìn)行豬鏈球菌2型毒力因子PCR檢測。7.1儀器:臺式高速(12000r/min)離心計;DNA擴(kuò)增儀;水浴鍋;穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀和水平電泳槽;電泳凝膠成相解析系統(tǒng);可調(diào)移液器一套,包括1~20μL2支,20~200L1支,200~1000μL1支;與移液器般配的滴頭;1.5mL離心管;0.5mL或0.2mL(與擴(kuò)增儀配套)塑料管。7.2試劑細(xì)菌DNA提取試劑盒×PCRBuffer2引物聚合酶×TAE(保留液)和1×TAE(使用液)瓊脂糖:電泳級7.3PCR引物依照豬鏈球菌2型溶血素基因設(shè)計引物,引物序列以下,其目的片斷長度為495bp。sly1:5’-CCCAAGTTCAAGCCGCATTTA-3’(1542)sly2:5’-GAAGATTGCGAGCATTTCCTG-3’(2036)7.4DNA提取利用對數(shù)生長遠(yuǎn)的液體培養(yǎng)物,嚴(yán)格依照DNA提取試劑盒說明書進(jìn)行。7.5PCR擴(kuò)增反應(yīng)系統(tǒng)25μL:細(xì)菌總DNA5.0μL10pmol/μL的上游引物1.0μL10pmol/μL的下游引物1.0μL2.5mmol/LdNTPs混雜物2.0μL10×PCRBuffer2.5μL25mmol/L的MgCl22.0μL5U的TaqDNA聚合酶0.3μL雙蒸水補(bǔ)至25μL。循環(huán)參數(shù):℃預(yù)變性5min;℃變性1min;℃退火1min;共35個循環(huán),℃延伸1min;℃延伸10min,4℃保留。7.6電泳檢測1.5g瓊脂糖,于100mL電泳緩沖液中加熱,充分溶化,制膠。在電泳槽中加入電泳緩沖液,使液面方才沒過凝膠。取8~10μlPCR擴(kuò)增產(chǎn)物分別和合適加樣緩沖液和CYBgreen混雜后加樣,進(jìn)行電泳。電壓大小依照電泳槽長度來確定,一般控制在3V/cm~5V/cm,電泳時間為30min~35min。將電泳好的凝膠放紫外透射儀或凝膠成像系統(tǒng)上觀察結(jié)果。陽性比較的PCR產(chǎn)物電泳后在495bp的地址上出現(xiàn)一條特異性條帶,陰性比較PCR產(chǎn)物電泳后沒有條帶,試驗結(jié)果成立。在試驗結(jié)果成立的前提下,若是樣品中PCR產(chǎn)物電泳后在495bp的地址上出現(xiàn)一條特異性條帶,判為該菌株含有豬鏈球菌2型溶血素基因。七、副豬嗜血桿菌(Hps)PCR診斷技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)自定標(biāo)準(zhǔn)。范圍副豬嗜血桿菌診斷。資料3.1儀器:臺式高速(12000r/min)離心計;DNA擴(kuò)增儀;水浴鍋;穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀和水平電泳槽;電泳凝膠成相解析系統(tǒng);可調(diào)移液器一套,包括1~20μL2支,20~200L1支,200~1000μL1支;與移液器般配的滴頭;1.5mL離心管;0.5mL或0.2mL(與擴(kuò)增儀配套)塑料管。3.2試劑培養(yǎng)基培養(yǎng)基溶液中溶菌buffer(0.0005%Tween20,0.24mg/mLproteinaseK和0.1mol/LTris,pH8.5)×PCRBuffer2引物×TAE(保留液)和1×TAE(使用液)LoadingBuffer瓊脂糖CYBgreen操作方法4.1鏡檢對從臨床癥狀疑似副豬嗜血桿菌病的發(fā)病仔豬的肺和脾作組織觸片,革蘭氏染色,副豬嗜血桿菌鏡檢呈革蘭氏陰性小球桿菌。4.2分別培養(yǎng)取出患病仔豬病變肺、氣管分泌物、胸水、腹水及脾組織,劃線接種于TSA平板。37℃,5%CO2培養(yǎng)24~48h。副豬嗜血桿菌呈無色、透明、濕潤、圓滑的露珠樣微小菌落,革蘭氏染色呈陰性小球桿菌,老齡培養(yǎng)物呈多形態(tài)(微小桿狀、短鏈狀和長絲狀)。4.3PCR引物設(shè)計HP16S1:5′-GTGATGAGGAAGGGTGGTGT-3′HP16S2:5′-GGCTTCGTCACCCTCTGT-3′該引物擴(kuò)增出編碼16SrRNA的DNA部分片段,長度為822bp。tbpA55:5′-TTAGCCTTGCTCTTCTTAGCC-3′tbpA33:5′-AAGCTTGAAACTAAGGTACTCTAA-3′該引物擴(kuò)增出編碼轉(zhuǎn)鐵結(jié)合蛋白A的DNA部分片段,長度為1.9kb。4.4細(xì)菌DNA提取將TSA平板上典型菌落接種TSB,37℃過夜培養(yǎng),取對數(shù)生長遠(yuǎn)分別菌懸浮于10mmol/LTris/1mmol/LEDTA溶液中,10000r/min離心5min;棄上清,積淀用溶菌buffer重懸;56℃作用30min;最后煮沸15min;12000r/min離心5min;收集上清,-20℃保留備用。注:DNA的提取可以用試劑盒,按試劑盒操作說明進(jìn)行,以節(jié)約時間,減少DNA損失。4.5編碼16SrRNA的DNA部分片段的擴(kuò)增反應(yīng)系統(tǒng)25μL:細(xì)菌總DNA2.0μL10pmol/μL的上游引物1.0μL10pmol/μL的下游引物1.0μL2.5mmol/LdNTPs混雜物2.0μLMg2+緩沖液2.5μL25mmol/L的MgCl21.5μL5U的TaqDNA聚合酶0.3μL雙蒸水補(bǔ)至25μL。循環(huán)參數(shù):℃預(yù)變性5min;94℃變性30s;59℃退火30s;共30個循環(huán),72℃延伸90s;72℃延伸10min。4.6編碼tbpA的DNA部分片段的擴(kuò)增反應(yīng)系統(tǒng)同4.5,循環(huán)參數(shù)為:94℃預(yù)變性5min;℃變性1min;℃退火1min;共30個循環(huán)72℃延伸2min;最后72℃延伸10min。4.7結(jié)果解析與判斷%瓊脂糖凝膠板的制備稱取1g瓊脂糖,加入100mL1×TAE中,加熱融化后,倒入放置在水平臺面上的凝膠盤中,膠板厚5mm左右。依仍舊品數(shù)采用合適的梳子。待凝膠冷卻凝固后拔出梳子(膠中形成加樣空),放入電泳槽中,加1×TAE緩沖液淹沒膠面。加樣6~8μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2~3μL加樣緩沖液和合適CYBgreen混勻后加入一個加樣孔。每次電泳最少加1孔陽性比較的擴(kuò)增產(chǎn)物作為比較,沒有陽性比較的情況下,必然加Marker。電泳電壓80~100V,或電流40~50mA,電泳30~40min。結(jié)果觀察與判斷電泳結(jié)束后,取出凝膠板置于紫外透射儀上,打開紫外燈觀察。如某一待檢樣品擴(kuò)增產(chǎn)物的DNA帶與陽性比較的帶在一條直線上,即他們與加樣孔的距離相同,或依照Marker判斷大小與設(shè)計的大?。?20bp和1.9kb)一致,則該樣品判斷為陽性。診斷判斷同份樣品在2個PCR中全部陽性的才可以判為本豬(群)已經(jīng)感染Hps,依照流行病學(xué)、臨床癥狀和病理變化判斷豬群可否發(fā)病。八、豬生殖與呼吸綜合征(PRRS)PCR檢測技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)自定標(biāo)準(zhǔn)。范圍適用于PRRS的PCR診斷。資料3.1儀器:組織勻漿機(jī);低溫臺式高速(12000r/min)離心計;DNA擴(kuò)增儀;水浴鍋;穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀和水平電泳槽;電泳凝膠成相解析系統(tǒng);可調(diào)移液器一套,包括1~20μL2支,20~200μL1支,200~1000μL1支;與移液器般配的滴頭;1.5mL離心管;0.5mL或0.2mL(與擴(kuò)增儀配套)塑料管。3.2試劑試劑氯仿異丙醇反轉(zhuǎn)錄酶M-MLV(200U/μL)乙醇焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液×PCRBuffer210pmol/L引物50×TAE(保留液)和1×TAE(使用液)LoadingBuffer瓊脂糖Oligo(dT)18(50μmol/L)CYBgreen操作步驟4.1樣品收集取疑似豬的肺臟、淋奉迎和脾臟病變部位組織,-20℃保留備用。4.2樣品辦理取部分組織樣品,磨碎并用0.01MPBS(PH7.2~7.4)稀釋成1:5乳劑(或?qū)⒉×嫌眉舻都舫尚K,放入5mL青霉素小瓶,進(jìn)一步剪碎,按5倍體積的0.01MPBS后,用勻漿機(jī)勻漿),-20℃保留備用或馬上用于RNA提取。4.3RNA的提取取辦理好的稀釋樣品200~300μL,加入700μLTRIZOL試劑,渦懸混勻,在15~30℃溫育2~3min;加入200μL的氯仿,蓋緊管蓋,上下顛倒混勻15s,15~30℃溫育2~3min,2~8℃12000g離心15min;轉(zhuǎn)移水相500μL到一新的離心管中,加入0.5mL的異丙醇,15~30℃作用10min,2~8℃12000g離心10min;棄去上清液,加入75%乙醇1.0mL,振搖,2~8℃7500g離心5min;棄去上清,干燥積淀物(室溫約5min);加入20μLDEPC水溶解,-20℃保留或馬上使用(置冰上)。4.4引物設(shè)計依照文件和PRRSV代表株VR2332和LV設(shè)計了一對引物:PRRSVN1:5′-ATGGCCAGCCAGTCAATCA-3′PRRSVN2:5′-TCGCCCTAATTGAATAGGTG-3′4.5RT整體積為10μL,反應(yīng)系統(tǒng)以下:5×RTbuffer2.0μLdNTP(10mmol/L)0.25μLOligo(dT)180.5μLRNA模板7μL混勻離心,65℃作用10min,冰上冷卻,加入M-MLV(200U/μL)0.25μL,42℃1h,冰上冷卻后作為PCR模板。4.6PCRPCR反應(yīng)整體積為25μL,包括:2條PRRSV引物(10pmol/μL)各1μL++(Mg25mmol/L)1.5μLdNTP(2.5mmol/L)2.0μL10×Buffer2.5μLTaq酶(5U/μL)0.2μL模板cDNA5μL滅菌雙蒸水11.8μL瞬時離心混勻,將PCR反應(yīng)管置于PCR儀內(nèi)。PCR反應(yīng)參數(shù)為:95℃預(yù)變性5min;94℃45min;51℃45min;共35個循環(huán),72℃1min;72℃延伸10min。將PCR產(chǎn)物放4℃保留或馬上做瓊脂糖凝膠電泳,解析PCR產(chǎn)物。4.7結(jié)果解析與判斷%瓊脂糖凝膠板的制備稱取1.5g瓊脂糖,加入100mL1×TAE中,加熱融化后,倒入放置在水平臺面上的凝膠盤中,膠板厚5mm左右。依仍舊品數(shù)采用合適的梳子。待凝膠冷卻凝固后拔出梳子(膠中形成加樣空),放入電泳槽中,加1×TAE緩沖液淹沒膠面。加樣6~8μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2~3μL加樣緩沖液和和合適CYBgreen混勻后加入一個加樣孔。每次電泳最少加1孔陽性比較的擴(kuò)增產(chǎn)物作為比較,沒有陽性比較的情況下,必然加Marker。電泳電壓80~100V,或電流40~50mA,電泳30~40min。結(jié)果觀察與判斷電泳結(jié)束后,取出凝膠板置于紫外透射儀上,打開紫外燈觀察。如某一待檢樣品擴(kuò)增產(chǎn)物的DNA帶與陽性比較的帶在一條直線上,即他們與加樣孔的距離相同,或依照Marker判斷大小與設(shè)計的大?。?00bp或430kb)一致,則該樣品判斷為陽性。診斷判斷PCR檢測結(jié)果陽性,表示該豬(群)已感染PRRSV,依照流行病學(xué)、臨床癥狀和病理變化判斷豬群可否發(fā)病。九、古典豬瘟(CSFV)PCR檢測技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)自定標(biāo)準(zhǔn)。范圍適用于古典豬瘟(CSFV)的PCR診斷。資料3.1儀器:組織勻漿機(jī);低溫臺式高速(13000~20000r/min)離心計;DNA擴(kuò)增儀;水浴鍋;穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀和水平電泳槽;電泳凝膠成相解析系統(tǒng);可調(diào)移液器一套,包括1~20μL2支,20~200μL1支,200~1000μL1支;與移液器般配的滴頭;1.5mL離心管;0.5mL或0.2mL(與擴(kuò)增儀配套)塑料管。3.2試劑試劑氯仿異丙醇反轉(zhuǎn)錄酶M-MLV(200U/μL)乙醇焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液×PCRBuffer210μmol/L引物50×TAE(保留液)和1×TAE(使用液)LoadingBuffer瓊脂糖BSA(0.4mg/mL)CYBgreen操作方法4.1病料收集:可用于檢測的病料包括扁桃體、淋奉迎、脾臟和母豬流產(chǎn)胎兒及死胎(扁桃體、淋奉迎和脾臟),-20℃保留備用。4.2病料辦理:取部分資料0.5~2.0g于無菌研缽,磨碎并用PBS(0.01M,PH7.2~7.4)稀釋成1:5乳劑(或?qū)⒉×嫌眉舻都舫尚K,放入5mL青霉素小瓶,進(jìn)一步剪碎,按5倍體積的PBS后,用勻漿機(jī)勻漿),-20℃保留備用或馬上用于RNA提取。4.3RNA提取取辦理好的稀釋樣品200~300μL,加入700μLTRIZOL試劑,渦懸混勻,在15~30℃溫育2~3min;加入200μL的氯仿,蓋緊管蓋,上下顛倒混勻15s,15~30℃溫育2~3min,2~8℃12000g離心15min;轉(zhuǎn)移水相500μL到一新的離心管中,加入0.5mL的異丙醇,15~30℃作用10min,2~8℃12000g離心10min;棄去上清液,加入75%乙醇1.0mL,振搖,2~8℃7500g離心5min;棄去上清,干燥積淀物(室溫約5min);加入20μLDEPC水溶解,-20℃保留或馬上使用(置冰上)。4.4引物設(shè)計依照華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2004年在Genbank中公開公布的序列DQ127910設(shè)計的引物,產(chǎn)物大小為374bp,引物序列以下:gE1:5'-CCACCCGACGCTACGATTGT-3'gE2:5'-CTGGCATCCATCATTCCCTG-3'4.5RT以提取到的組織總RNA為模板,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,反轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)為20μL。反轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)以下:RNA7μL10μmol/L引物(gE1/gE2)1μL于70℃水浴中5分鐘,爾后室溫冷卻10分鐘;再加入:dNTP(10mM)1μL5×M-MLVbuffer4μLBSA(0.4mg/mL)5μLM-MLV反轉(zhuǎn)錄酶1μL混均后,37℃水浴45-60分鐘。-20℃保留。4.6PCR擴(kuò)增反應(yīng)cDNA5.0μL10×PCRbuffer2.5μLdNTP(2.5mM)2.0μLMgCl2(25mM)1.5μL上游引物(10μmol/L)1.0μL下游引物(10μmol/L)1.0μLTaqDNA聚合酶(5U)0.2μL滅菌雙蒸水1.8μL配好反應(yīng)液后,將PCR反應(yīng)管置于PCR儀內(nèi),循環(huán)參數(shù)以下:95℃5min94℃45min;56℃45min;共35個循環(huán)72℃1min;℃10minPCR產(chǎn)物放4℃保留或馬上做瓊脂糖凝膠電泳,解析PCR產(chǎn)物。4.7結(jié)果解析與判斷%瓊脂糖凝膠板的制備稱取1.5g瓊脂糖,加入100mL1×TAE中,加熱融化后,倒入放置在水平臺面上的凝膠盤中,膠板厚5mm左右。依仍舊品數(shù)采用合適的梳子。待凝膠冷卻凝固后拔出梳子(膠中形成加樣空),放入電泳槽中,加1×TAE緩沖液淹沒膠面。加樣6~8μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2~3μL加樣緩沖液和合適CYBgreen混勻后加入一個加樣孔。每次電泳最少加1孔陽性比較的擴(kuò)增產(chǎn)物作為比較,沒有陽性比較的情況下,必然加Marker。電泳電壓80~100V,或電流40~50mA,電泳30~40min。結(jié)果觀察與判斷電泳結(jié)束后,取出凝膠板置于紫外透射儀上,打開紫外燈觀察。如某一待檢樣品擴(kuò)增產(chǎn)物的DNA帶與陽性比較的帶在一條直線上,即他們與加樣孔的距離相同,或依照Marker判斷大小與設(shè)計的大小(370bp)一致,則該樣品判斷為陽性。診斷判斷若是是在免疫后20d收集的樣品,PCR檢測結(jié)果陽性,表示該豬(群)已感染野毒,依照流行病學(xué)、臨床癥狀和病理變化判斷豬群可否發(fā)病。十、豬微小病毒(PPV)PCR診斷技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)自定標(biāo)準(zhǔn)。范圍適用于豬微小病毒(PPV)病的PCR診斷。資料3.1儀器:臺式高速離心計;DNA擴(kuò)增儀;水浴鍋;穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀和水平電泳槽;電泳凝膠成相解析系統(tǒng);可調(diào)移液器一套,包括1~20μL2支,20~200μL1支,200~1000μL1支;與移液器般配的滴頭;1.5mL離心管;0.5mL或0.2mL(與擴(kuò)增儀配套)塑料管。3.2主要試劑緩沖液%SDS蛋白酶K飽和酚酚:氯仿:異戍醇(25:24:1)氯仿:異戍醇(24:1)純乙醇×PCRBuffer25mmol/LMgCl210μmol/L引物50×TAE(保留液)和1×TAE(使用液)LoadingBuffer瓊脂糖CYBgreen操作步驟:4.1樣品的收集:收集病豬的淋奉迎、脾臟、肝臟置-20℃保留。4.2樣品辦理和DNA提取所采病料經(jīng)組織研磨器充分研磨,按1:5用TEN緩沖液懸浮收集于離心管內(nèi),-70℃屢次凍融3次,7000r/min離心5min。取上清液472.5μl,加入25μl10%SDS和2.5μl的20mg/mL蛋白酶K,50℃水浴搖床上放置2h。加入等量的飽和酚500μl,渦旋20s。離心取上清液,加等量的酚:氯仿:異戍醇(25:24:1)抽提一次。用氯仿:異戍醇(24:1)再抽提一次。用乙醇積淀,真空抽干后加入20μl雙蒸水溶解,-20℃儲藏備用。4.3引物依照GenBank中公開公布的序列,設(shè)計擴(kuò)增豬微小病毒VP2基因部分片段,序列以下:P1:5′-CAGAATCAGCAACCTCAC--3′P2:5′-TGGTCTCCTTCTGTGGTAGG--3′4.4PCR反應(yīng)系統(tǒng)25μl,組成以下:引物各1.0μl25mMMgCl21.μ5ldNTPs2.0μl10×緩沖液2.5μlTaq聚合酶0.2μlDNA模板3.0μl滅菌去離子水13.8μl擴(kuò)増條件為:94℃變性3min,進(jìn)入循環(huán),94℃45s,54℃45s,72℃60s,30個循環(huán)后,72℃延伸10min。4.5結(jié)果解析與判斷%瓊脂糖凝膠板的制備稱取1.5g瓊脂糖,加入100mL1×TAE中,加熱融化后,倒入放置在水平臺面上的凝膠盤中,膠板厚5mm左右。依仍舊品數(shù)采用合適的梳子。待凝膠冷卻凝固后拔出梳子(膠中形成加樣空),放入電泳槽中,加1×TAE緩沖液淹沒膠面。加樣6~8μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2~3μL加樣緩沖液和和合適CYBgreen混勻后加入一個加樣孔。每次電泳最少加1孔陽性比較的擴(kuò)增產(chǎn)物作為比較,沒有陽性比較的情況下,必然加Marker。電泳電壓80~100V,或電流40~50mA,電泳30~40min。結(jié)果觀察與判斷電泳結(jié)束后,取出凝膠板置于紫外透射儀上,打開紫外燈觀察。如某一待檢樣品擴(kuò)增產(chǎn)物的DNA帶與陽性比較的帶在一條直線上,即他們與加樣孔的距離相同,或依照Marker判斷大小與設(shè)計的大小(440bp)一致,則該樣品判斷為陽性。十一、口蹄疫(FMDV)PCR診斷技術(shù)引用標(biāo)準(zhǔn)參照GB/T18935-2003和OIEFMDV參照實驗室的方法NB:VERSIONADOPTEDMAY2006)。范圍適用于FMDVO型和AsiaI型的PCR診斷。樣品收集3.1水泡液和水泡皮:用一次性注射器抽取水泡液,用灼燒的止血鉗封死注射器前端,放入保鮮盒,加冰儲藏送檢;將水泡皮剪下,放入干凈青霉素瓶中,放入保鮮盒加凍儲藏送檢。3.2組織臟器:如血液、淋奉迎、肌肉等。取樣后放入干凈青霉素瓶或干凈食袋中,于保鮮盒內(nèi)加冰儲藏送檢。3.3鼻咽拭子:用滅菌的棉簽收集后,放保鮮袋中加冰儲藏送檢。樣品辦理4.1水泡皮、臟器等:取1-2g用無菌PBS緩沖液(0.04M,pH7.2-7.4)沖洗干凈,剪碎、研磨,用PBS稀釋成1:2~1:5的懸液置4℃冰箱過夜。8000rpm離心5min,取上清液為檢測資料。4.2鼻咽拭子:加入2mLPBS緩沖液,充分?jǐn)D壓,取出棉簽8000rpm離心5min,取上清液。4.3血液、水泡液:血液可直接作檢測資料;水泡液于8000rpm離心5min后取上清,若量太少可合適加入PBS緩沖液。5PCR診斷5.1引物依照Genbank中AsiaIJiangsu株自行設(shè)計引物,片段大小約330bp,序列以下:Asia1:5′-ACTCACCCAGCCCAAGAGCAC-3’Asia2:5′-GCGTGCAAGGGCGGCGAGATC-3’依照武漢大學(xué)在Genbank中公開公布的序列自行設(shè)計,擴(kuò)增片段大小約350bp,序列以下:O1:5′-GTCAAGCCACAGGAACAGG-3′O1:5′-AGAGTTCTTTCTGCCTTCTGAGC-3′5.2RNA提取取辦理好的稀釋樣品200~300μL,加入700μLTRIZOL試劑,渦懸15s混勻,室溫靜止3min;加入200μL的氯仿,蓋緊管蓋,上下顛倒混勻15s,室溫靜止3min,2~8℃20000g離心15min;轉(zhuǎn)移水相500μL到一新的離心管中,加入0.5mL的異丙醇,混勻,室溫靜止10min,2~8℃20000g離心10min;棄去上清液,加入70%乙醇1.0mL,振搖,2~8℃20000g離心10min;棄去上清,干燥積淀物(室溫約5min);加入20μLDEPC水溶解,-20℃保留或馬上使用(置冰上)。5.3RTRNA7μL10μmol/L引物(gE1/gE2)1μL70℃水浴中5min,爾后室溫冷卻10分鐘;再加入:dNTP(10mM)1μL5×M-MLVbuffer4μLBSA(0.4mg/mL)5μLM-MLV反轉(zhuǎn)錄酶1μL混均后,37℃水浴45-60分鐘。-20℃保留。5.4PCR擴(kuò)增反應(yīng)cDNA5.0μL10×PCRbuffer2.5μLdNTP(2.5mM)2.0μLMgCl2(25mM)1.5μL上游引物(10μmol/L)1.0μL下游引物(10μmol/L)1.0μLTaqDNA聚合酶(5U)0.2μL滅菌雙蒸水11.8μL配好反應(yīng)液后,將PCR反應(yīng)管置于PCR儀內(nèi),循環(huán)參數(shù)以下:℃5min℃45min;AsiaI型53℃,O型58℃45min;共35個循環(huán)72℃1min;℃10min。PCR產(chǎn)物放4℃保留或馬上做瓊脂糖凝膠電泳,解析PCR產(chǎn)物。5.5結(jié)果解析與判斷%瓊脂糖凝膠板的制備稱取1.5g瓊脂糖,加入100mL1×TAE中,加熱融化后,倒入放置在水平臺面上的凝膠盤中,膠板厚5mm左右。依仍舊品數(shù)采用合適的梳子。待凝膠冷卻凝固后拔出梳子(膠中形成加樣空),放入電泳槽中,加1×TAE緩沖液淹沒膠面。加樣6~8μLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物和2~3μL加樣緩沖液和合適CYBgreen混勻后加入一個加樣孔。每次電泳最少加1孔陽性比較的擴(kuò)增產(chǎn)物作為比較,沒有陽性比較的情況下,必然加Marker。電泳電壓80~100V,或電流40~50mA,電泳30~40min。結(jié)果觀察與判斷電泳結(jié)束后,取出凝膠板置于紫外透射儀上,打開紫外燈觀察。如某一待檢樣品擴(kuò)增產(chǎn)物的DNA帶與陽性比較的帶在一條直線上,即他們與加樣孔的距離相同,或依照Marker判斷大小與設(shè)計的大?。?30或350bp)一致,則該樣品判斷為陽性。十
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