生物信息學(xué)復(fù)習(xí)資料全

歡迎下載內(nèi)容僅供參考一、名詞解釋(31個(gè))信息科學(xué)。狹義：應(yīng)用信息科學(xué)的理論、方法和技術(shù)，管理、分析和利用生物分子數(shù)據(jù)。二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和理論分析的根底上針對(duì)特定的應(yīng)用目標(biāo)而建立的。序列的功能區(qū)域，也可用于研究一組蛋白質(zhì)之間的進(jìn)化關(guān)系。是研究物種進(jìn)化和系統(tǒng)分類(lèi)的一種方法，其常用一種類(lèi)似樹(shù)稱(chēng)為系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。是進(jìn)化保守的并且在其他物種中具有直系同源性。指的是不同物種之間的同源性，例如蛋白質(zhì)的同源性，DNA序列的同源性。〔來(lái)自百度〕FASTADNA苷酸或氨基酸字符串。開(kāi)放閱讀框〔ORF〕：密碼子的閱讀框可編碼完整的多肽鏈，其間不存在使翻譯中斷的終止密碼子。〔來(lái)自百度〕域，折疊得較為嚴(yán)密，各行其功能，稱(chēng)為結(jié)構(gòu)域。位并進(jìn)展罰分，以控制空位插入的合理性cDNAcDNA3’5GeneOntology協(xié)會(huì)：HMM隱馬爾可夫模型：將核苷酸序列看成一個(gè)隨機(jī)序列，DNAMarkov的歸類(lèi)整理和注釋DNA質(zhì)的同一氨基酸位置的一樣的氨基酸成員,可用百分比表示。占的比例。是核酸序列到蛋白庫(kù)中的一種查詢(xún)。先將核酸序列翻譯成蛋白序列是蛋白序列到核酸庫(kù)中的一種查詢(xún)。與BLASTXTblastx：是核酸序列到核酸庫(kù)中的一種查詢(xún)。此種查詢(xún)將庫(kù)中的核酸序列和所查的Tblastx：是核酸序列到核酸庫(kù)中的一種查詢(xún)。此種查詢(xún)將庫(kù)中的核酸序列和所查的6條可能的蛋白序列產(chǎn)生36種比對(duì)陣列?！瞾?lái)自百度〕KEGG：者把基因與表達(dá)信息作為一個(gè)整體網(wǎng)絡(luò)進(jìn)展研究。ChIP-Seq：ChIPDNA分子生物網(wǎng)絡(luò)：PPI號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和遺傳網(wǎng)絡(luò)的角度研究這種相關(guān)性。高通量測(cè)序：一次性對(duì)幾百萬(wàn)到十億條DNA的分析，所以又被稱(chēng)為深度測(cè)序。擬。NCBInr：GT-AGEntrez二、選擇題〔30個(gè)〕mRNAAA.dbESTB.PDBC.OMIMD.HTGSA.NDB數(shù)據(jù)庫(kù)、C.GenBankD.SWISS-PROTPIRA.B.mRNAC.D據(jù)庫(kù)以下哪一項(xiàng)不屬于啟動(dòng)子研究圍？〔〕A.CpG島預(yù)測(cè)、BC.糖基化修飾、D.甲基化檢測(cè)HTGS的含義是〔C〕。A.表達(dá)序列標(biāo)簽、B.序列標(biāo)簽位點(diǎn)、C序列、D.人工合成序列STS的含義是〔〕。A.表達(dá)序列標(biāo)簽、B.序列標(biāo)簽位點(diǎn)、C列、D.人工合成序列HGPCA.B.C.組計(jì)劃、D.水稻基因組計(jì)劃8、以下中屬于一級(jí)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的是：〔〕A.EMBL、B.DDBJ、C.PDB、D.SWISS-PROT9．BLAST教案所程序中，哪個(gè)方法是不存在的？〔〕A.BLASTP、B.BLASTN、C.BLASTX、D.BLASTQ10A.基因進(jìn)化、B.基因數(shù)目、C.基因重復(fù)序列、D.基因組復(fù)制11、以下哪個(gè)選項(xiàng)不是微陣列實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的容？〔〕A.貝葉斯網(wǎng)絡(luò)法、B.對(duì)照組的選擇、C.重復(fù)樣本的使用、D.隨機(jī)化原那么12、構(gòu)建序列進(jìn)化樹(shù)的一般步驟不包括.〔〕A.建立DNA文庫(kù)、B.建立數(shù)據(jù)模型、C.建立取代模型、D.建立進(jìn)化樹(shù)13GenbankWebA.BankIt、B.Sequin、C.VersionD.Matrix14A.PIR、B.Uniprot、C.SWISS-PROT、D.OMIM15A.Genbank、B.GenPept、C.EMBL、D.DDBJ16NCBINCBIA.Retrieve、B.SRS、C.Entrez、D.PIR17、EntrezA.500B.1000C.5000D.1000018A.nnpredictB.PredictProteinC.SingalDD.SingalP19、Bioinformatics的含義是〔〕。A. 生物信息學(xué)、B. 基因組學(xué)、C. 白質(zhì)組學(xué)、D. 表觀(guān)遺傳學(xué)20、目前應(yīng)用于基因芯片表達(dá)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析的主要方法是〔〕。A.卡方檢驗(yàn)、B.相關(guān)分析、C. 聚類(lèi)分析、D. 正態(tài)性分布檢驗(yàn)21NCBIA.UniGeneB.UniProC.UniRef、D. URF22根本局部比對(duì)搜素工具〔A. MegaB. ClustalWC. BLASTD. GCG23、根據(jù)研究發(fā)現(xiàn)，人類(lèi)基因組中真正編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域僅占DNA序列的〔〕。A.1-2%、B.3-5%、C.5-10%、D.10-20%24、被譽(yù)為“生物信息學(xué)之父〞的科學(xué)家是〔〕。A.Dulbecco、B.Sanger、吳瑞、D.25、多序列比對(duì)工具是〔〕。A. BLAST、B. ClustalW、C. Mega、D. GCG26B.C.D.色線(xiàn)條表示27、HTGS的含義是〔〕。A.表達(dá)序列標(biāo)簽、B.序列標(biāo)簽位點(diǎn)、C.高通量基因組序列、D.人工合成序列28、accessionnumberA.登錄號(hào)、B.算法、C.比對(duì)、D.類(lèi)推29EMBLnetA.Query、B.SRS、C.PDB、D.PIR30、數(shù)據(jù)挖掘的四個(gè)步驟不包括以下哪個(gè).〔〕A.數(shù)據(jù)選擇、B.數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換、C.數(shù)據(jù)記錄、D.結(jié)果分析三、是非題〔16個(gè)〕1、生物學(xué)就是實(shí)驗(yàn)科學(xué)，所有的研究結(jié)論從實(shí)驗(yàn)中來(lái)，于實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證。2、比擬是科學(xué)研究中最常見(jiàn)的方法，在生物信息學(xué)研究中，比對(duì)是最常用和最經(jīng)典的研究手段。3、兩個(gè)蛋白質(zhì)序列相似性超過(guò)30%就是同源蛋白。4、蛋白質(zhì)序列相似性指一級(jí)序列中氨基酸殘基一樣。5、蛋白質(zhì)序列相似性指氨基酸殘基具有相似特性.側(cè)鏈基團(tuán)大小電荷性、疏水性等一樣。6、核酸序列相似性指序列中一樣堿基所占的比例。7DNA38DNA69、相似性是指一種很直接的數(shù)量關(guān)系，無(wú)需實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。、相似性是指一種很直接的數(shù)量關(guān)系，也需實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。、不同種屬間的同源序列稱(chēng)為直向同源序列。、不同種屬間的同源序列稱(chēng)為共生同源序列。13、所謂局部比對(duì)，即分析兩個(gè)序列是否有局部序列的相似。14、所謂整體比對(duì)，即找出兩個(gè)序列全長(zhǎng)的最優(yōu)比對(duì)結(jié)果。15、PSI-BLASTBLAST16、PHI-BLASTBLAST四、問(wèn)答題〔15個(gè)〕1、生物信息學(xué)的開(kāi)展經(jīng)歷了哪幾個(gè)階段2、序列的相似性與同源性有什么區(qū)別與聯(lián)系？3、BLASTblastn、blastp、blastx、tblastntblastx什么？4、生物信息學(xué)的主要研究領(lǐng)域。5、初級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)、二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的概念，說(shuō)出幾個(gè)數(shù)據(jù)并說(shuō)明包含什么數(shù)據(jù)。6、簡(jiǎn)述高通量測(cè)序的應(yīng)用圍7、簡(jiǎn)述系統(tǒng)發(fā)生分析步驟8、說(shuō)出至少一種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)和一種可視化工具。9、Entrez集成于哪個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)？主要功能是什么？在應(yīng)用中可以訪(fǎng)問(wèn)哪些子數(shù)據(jù)庫(kù)〔請(qǐng)列舉5個(gè)以上〕？10、試述SWISS-PROT中的數(shù)據(jù)來(lái)源11、分子生物網(wǎng)絡(luò)可以分成哪幾類(lèi)？簡(jiǎn)單介紹。12、常用的蛋白質(zhì)互作數(shù)據(jù)庫(kù)有哪些？13、試述蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的三類(lèi)方法14、國(guó)際上權(quán)威的核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)有那些？15、生物分子數(shù)據(jù)類(lèi)型