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第一章蛋白質(zhì)化學(xué)【目的與要求】§1.1蛋白質(zhì)通論§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸第一章蛋白質(zhì)化學(xué)【目的與要求】§1.1蛋白質(zhì)通論§1.2蛋白質(zhì)化學(xué)1.了解蛋白質(zhì)對(duì)生物體的重要意義。2.了解蛋白質(zhì)的分類,掌握蛋白質(zhì)元素組成的特點(diǎn)。3.掌握蛋白質(zhì)的基本構(gòu)成單體:氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),從各氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)上理解氨基酸的分類。4.掌握氨基酸的理化性質(zhì),重點(diǎn)掌握兩性電離與等電點(diǎn)含義、茚三酮反應(yīng)及其應(yīng)用?!材康呐c要求〕蛋白質(zhì)化學(xué)1.了解蛋白質(zhì)對(duì)生物體的重要意義?!材康呐c要求〕蛋白質(zhì)化學(xué)5.掌握蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的概念;了解蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的測(cè)定方法與思路,學(xué)會(huì)分析簡(jiǎn)單多肽的氨基酸順序。6.理解并掌握蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的概念;二級(jí)結(jié)構(gòu)的基本類型:α-螺旋及β-折疊的結(jié)構(gòu)特點(diǎn);了解幾種常見(jiàn)纖維狀蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)特性;了解超二級(jí)結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)域的概念。7.了解蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)、四級(jí)結(jié)構(gòu)的概念及穩(wěn)定因素。蛋白質(zhì)化學(xué)5.掌握蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的概念;了解蛋白質(zhì)一蛋白質(zhì)化學(xué)8.充分理解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系;從核糖核酸酶的變性與復(fù)性實(shí)驗(yàn)理解一級(jí)結(jié)構(gòu)與空間結(jié)構(gòu)的關(guān)系;以細(xì)胞色素C等為例充分理解一級(jí)結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)生物學(xué)功能的關(guān)系;從血紅蛋白與肌紅蛋白的結(jié)構(gòu)特性理解蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與生物學(xué)功能的關(guān)系。9.掌握蛋白質(zhì)的理化性質(zhì):膠體性質(zhì)、兩性電離與等電點(diǎn)、沉淀作用、變性作用以及這些性質(zhì)的生理意義及實(shí)踐意義。10.了解蛋白質(zhì)分離提純的常用方法及基本原理。蛋白質(zhì)化學(xué)8.充分理解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系;從核糖§1.1蛋白質(zhì)通論一.蛋白質(zhì)的生物學(xué)意義(一)蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ)1、是遺傳規(guī)定的具有唯一氨基酸順序的多肽鏈,在生命過(guò)程中起著關(guān)鍵的作用?!?.1蛋白質(zhì)通論一.蛋白質(zhì)的生物學(xué)意義(一)蛋白質(zhì)§1.1蛋白質(zhì)通論一.蛋白質(zhì)的生物學(xué)意義(一)蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的物質(zhì)基礎(chǔ)2、生物體內(nèi)的蛋白質(zhì)是除水以外,機(jī)體組織中最多的組分,占人體干重的45%,占細(xì)菌干重的50~70%?!?.1蛋白質(zhì)通論一.蛋白質(zhì)的生物學(xué)意義(一)蛋白質(zhì)§1.1蛋白質(zhì)通論(二)蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能1.作為生物催化劑:在體內(nèi)催化各種物質(zhì)代謝反應(yīng)的酶幾乎都是蛋白質(zhì)。2.調(diào)節(jié)代謝反應(yīng):一些激素是蛋白質(zhì)或肽,如胰島素、生長(zhǎng)素。3.運(yùn)輸載體:如紅細(xì)胞中運(yùn)輸O2、CO2要靠Hb(Hemoglobin血紅蛋白)、運(yùn)輸脂類物質(zhì)的是載脂蛋白、運(yùn)鐵蛋白等轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白或叫載體蛋白。4.參與機(jī)體的運(yùn)動(dòng):如心跳、胃腸蠕動(dòng)等,依靠與肌肉收縮有關(guān)的蛋白質(zhì)來(lái)實(shí)現(xiàn),如肌球蛋白、肌動(dòng)蛋白?!?.1蛋白質(zhì)通論(二)蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能1.作為生物§1.1蛋白質(zhì)通論5.參與機(jī)體的防御:
機(jī)體抵抗外來(lái)侵害的防御機(jī)能,靠抗體,抗體也稱免疫球蛋白,是蛋白質(zhì)。6.接受傳遞信息:如口腔中的味覺(jué)蛋白、視網(wǎng)膜中的視覺(jué)蛋白。7.調(diào)節(jié)或控制細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化、遺傳信息的表達(dá)。8.其它:如雞蛋清蛋白、牛奶中的酪蛋白是營(yíng)養(yǎng)和儲(chǔ)存蛋白;膠原蛋白、纖維蛋白等屬于結(jié)構(gòu)蛋白。還有甜味蛋白、毒素蛋白等都具有特異的生物學(xué)功能。
所以,我們不難理解,為什么說(shuō)沒(méi)有蛋白質(zhì)就沒(méi)有生命?!?.1蛋白質(zhì)通論5.參與機(jī)體的防御:機(jī)體抵抗外來(lái)侵害§1.1蛋白質(zhì)通論二、蛋白質(zhì)的分類1.根據(jù)分子形狀分:球狀蛋白質(zhì)、纖維狀蛋白質(zhì)2.根據(jù)功能分:活性蛋白質(zhì)、結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)。3.根據(jù)組成分:(1)簡(jiǎn)單蛋白質(zhì):清蛋白、球蛋白、谷蛋白、醇溶谷蛋白、組蛋白、精蛋白、硬蛋白。(2)結(jié)合蛋白質(zhì):色素蛋白、金屬蛋白、磷蛋白、核蛋白、脂蛋白、糖蛋白?!?.1蛋白質(zhì)通論二、蛋白質(zhì)的分類1.根據(jù)分子形狀分:球§1.1蛋白質(zhì)通論三.蛋白質(zhì)的水解1.酸水解條件:5~10倍的20%的鹽酸煮沸回流16~24小時(shí),或加壓于120℃水解2小時(shí)。優(yōu)點(diǎn):可蒸發(fā)除去鹽酸,水解徹底,終產(chǎn)物為L(zhǎng)-α-氨基酸,產(chǎn)物單一,無(wú)消旋現(xiàn)象。缺點(diǎn):色氨酸破壞,并產(chǎn)生一種黑色的物質(zhì):腐黑質(zhì),水解液呈黑色?!?.1蛋白質(zhì)通論三.蛋白質(zhì)的水解1.酸水解條件:5§1.1蛋白質(zhì)通論2.堿水解條件:4mol/LBa(OH)2或6mol/LNaOH煮沸6小時(shí)。優(yōu)點(diǎn):水解徹底,色氨酸不被破壞,水解液清亮。缺點(diǎn):產(chǎn)生消旋產(chǎn)物,破壞的氨基酸多,一般很少使用。3.蛋白酶水解條件:蛋白酶如胰蛋白酶、糜蛋白酶,常溫37~40℃,pH值5~8。優(yōu)點(diǎn):氨基酸不被破壞,不發(fā)生消旋現(xiàn)象。缺點(diǎn):水解不完全,中間產(chǎn)物多。
蛋白質(zhì)酸堿水解常用于蛋白質(zhì)的組成分析,而酶水解用于制備蛋白質(zhì)水解產(chǎn)物?!?.1蛋白質(zhì)通論2.堿水解條件:4mol/LBa(§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸一.蛋白質(zhì)的元素組成蛋白質(zhì)是有機(jī)化合物,離不開(kāi)C、H、O三種元素,還含有N、P、S、金屬元素等。含量%:50~556~720~2315~170.3~3微量或無(wú)元素組成:CHONS其它蛋白質(zhì)中N是特征元素,且含量恒定,為16%左右,即16克氮/100克蛋白質(zhì),故可以用定氮法測(cè)量蛋白質(zhì)含量,即:每100克蛋白質(zhì)含氮16克,100/16=6.25克蛋白質(zhì)含氮1克。所以,每克樣品含氮量×6.25×100=100克樣品蛋白質(zhì)含量(克%)。
有些蛋白質(zhì)含有其他微量元素:P、Fe、Cu、Mn、Zn、Co、Mo、I等。
§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸一.蛋白質(zhì)的元素組成§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸二、蛋白質(zhì)分子的基本組成單位——氨基酸(一)氨基酸的結(jié)構(gòu)通式:1、構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸均為L(zhǎng)-α-氨基酸。2、除R為H(甘氨酸)外,其余氨基酸均具有旋光性。3、各種氨基酸的區(qū)別在于側(cè)基R基上。從氨基酸的結(jié)構(gòu)通式可以看出:§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸二、蛋白質(zhì)分子的基本組§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(二)氨基酸的構(gòu)型:構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸除甘氨酸外,均含有α-碳原子,在空間各原子有兩種排列方式:L-構(gòu)型與D-構(gòu)型,它們的關(guān)系就像左右手的關(guān)系,互為鏡像關(guān)系,下圖以丙氨酸為例:§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(二)氨基酸的構(gòu)型:§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(三)氨基酸的結(jié)構(gòu)與分類1、按氨基酸分子中羧基與氨基的數(shù)目分:
(1)酸性氨基酸:一氨基二羧基氨基酸,有:天冬氨酸、谷氨酸、(2)堿性氨基酸:二氨基一羧基氨基酸,有:賴氨酸、精氨酸、組氨酸(3)中性氨基酸:一氨基一羧基氨基酸,有:甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸?!?.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(三)氨基酸的結(jié)構(gòu)與分§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸2、按側(cè)基R基的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)分:
(1)脂肪族氨基酸(2)芳香族氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸(3)雜環(huán)氨基酸:脯氨酸、組氨酸3、按側(cè)基R基與水的關(guān)系分:
(1)非極性氨基酸:有甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸、脯氨酸。(2)極性不帶電氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸。(3)極性帶電氨基酸:天冬氨酸、谷氨酸、賴氨酸、精氨酸、組氨酸?!?.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸2、按側(cè)基R基的結(jié)構(gòu)特§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸4、按氨基酸是否能在人體內(nèi)合成分:
(1)必需氨基酸:指人體內(nèi)不能合成的氨基酸,必須從食物中攝取,有八種:賴氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、蘇氨酸。(2)非必需氨基酸:指人體內(nèi)可以合成的氨基酸。有十種。(3)半必需氨基酸:指人體內(nèi)可以合成但合成量不能滿足人體需要(特別是嬰幼兒時(shí)期)的氨基酸,有兩種:組氨酸、精氨酸。§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸4、按氨基酸是否能在人§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸二十種氨基酸的名稱和結(jié)構(gòu)如圖所示:§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸二十種氨基酸的名稱和結(jié)§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸注:二十種氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)支鏈氨基酸:纈氨酸、亮氨酸,異亮氨酸含羥基的氨基酸:絲氨酸、蘇氨酸含硫的氨基酸:半胱氨酸(含巰基)、甲硫氨酸(含硫甲基)含苯環(huán)的氨基酸:苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸含胍基的氨基酸:精氨酸含咪唑基的氨基酸:組氨酸亞氨基酸:脯氨酸含酰胺的氨基酸:天冬酰胺、谷氨酰胺含吲哚基的氨基酸:色氨酸含ε-氨基的氨基酸:賴氨酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸注:二十種氨基酸的結(jié)構(gòu)§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(四)蛋白質(zhì)中不常見(jiàn)的氨基酸羥-脯氨酸、羥-賴氨酸、r-羧基谷氨酸、6-氮-甲基賴氨酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(四)蛋白質(zhì)中不常見(jiàn)的§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(五)非蛋白氨基酸鳥(niǎo)氨酸、胍氨酸、高半胱氨酸、高絲氨酸、β-丙氨酸、γ-氨基丁酸等§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(五)非蛋白氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸三.氨基酸的理化性質(zhì)(一)物理性質(zhì)1.形態(tài):均為白色結(jié)晶或粉末,不同氨基酸的晶型結(jié)構(gòu)不同。2.溶解性:一般都溶于水,不溶或微溶于醇,不溶于丙酮,在稀酸和稀堿中溶解性好。3.熔點(diǎn):氨基酸的熔點(diǎn)一般都比較高,一般都大于200℃,超過(guò)熔點(diǎn)以上氨基酸分解產(chǎn)生胺和二氧化碳。4..旋光性:除甘氨酸外的氨基酸均有旋光性。5.光吸收:氨基酸在可見(jiàn)光范圍內(nèi)無(wú)光吸收,在近紫外區(qū)含苯環(huán)氨基酸有光的吸收。§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸三.氨基酸的理化性質(zhì)(§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(二)化學(xué)性質(zhì)1.氨基酸的兩性電離及等電點(diǎn):氨基酸既含有氨基,可接受H+,又含有羧基,可電離出H+,所以氨基酸具有酸堿兩性性質(zhì)。通常情況下,氨基酸以兩性離子的形式存在,如下圖所示:
§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(二)化學(xué)性質(zhì)1.氨基§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸從上圖可知:氨基酸在酸性環(huán)境中,主要以陽(yáng)離子的形式存在,在堿性環(huán)境中,主要以陰離子的形式存在。在某一pH環(huán)境下,以兩性離子(兼性離子)的形式存在。該pH稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。所以氨基酸的等電點(diǎn)可以定義為:氨基酸所帶正負(fù)電荷相等時(shí)的溶液pH?!?.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸從上圖可知:氨基§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸2.由α-氨基參加的反應(yīng):
(1)與亞硝酸反應(yīng):放出氮?dú)?,氮?dú)獾囊话雭?lái)自氨基氮,一半來(lái)自亞硝酸,在通常情況下測(cè)定生成的氮?dú)獾捏w積量可計(jì)算氨基酸的量,此反應(yīng)可用于測(cè)定蛋白質(zhì)的水解程度。§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸2.由α-氨基參加的反(2)與甲醛的反應(yīng):用過(guò)量的中性甲醛與氨基酸反應(yīng),可游離出氫離子,然后用NaOH滴定,從消耗的堿量可以計(jì)算出氨基酸的含量。此法稱為間接滴定法?!?.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(2)與甲醛的反應(yīng):用過(guò)量的中性甲醛與氨基酸反應(yīng),可游離出§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(3)與2,4-二硝基氟苯(2,4-DNFB)的反應(yīng)(Sanger反應(yīng)):生成黃色的二硝基苯-氨基酸衍生物。(4)與苯異硫氰酸酯(PITC)反應(yīng)(Edman反應(yīng)):生成苯乙內(nèi)酰硫脲-氨基酸。(5)與丹磺酰氯(DNS-Cl)的反應(yīng):生成熒光物質(zhì)DNS-氨基酸。(3)、(4)、(5)反應(yīng)用于蛋白質(zhì)的N-末端的測(cè)定。§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分(3)與2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反應(yīng)NO2FO2N+HN—CH—COOHRNO2O2NHN—CH—COOHR+HF弱堿性DNP-氨基酸§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(3)與2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反應(yīng)NO2FO2N+(4)與異硫氰酸苯酯(PITC)的反應(yīng)—N=C=S+N—CH—COOHHHRPITC—N—C—N—CH—COOHHHRSPTC-氨基酸—N—CHRSNCCOPTH-氨基酸pH8.3無(wú)水HF重復(fù)測(cè)定多肽鏈N端氨基酸排列順序,設(shè)計(jì)出“多肽順序自動(dòng)分析儀”(4)與異硫氰酸苯酯(PITC)的反應(yīng)—N=C=S+Edman(苯異硫氰酸酯法)氨基酸順序分析法實(shí)際上也是一種N-端分析法。此法的特點(diǎn)是能夠不斷重復(fù)循環(huán),將肽鏈N-端氨基酸殘基逐一進(jìn)行標(biāo)記和解離?!?.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸Edman(苯異硫氰酸酯法)氨基酸順序分析法實(shí)際上也是一種H2N—CH—COOH+RNCH3CH3O=S=OCl5-二甲氨基萘磺酰氯(DNS-Cl)pH9.740℃NCH3CH3O=S=OHN—CH—COOHRDNS-氨基酸取代DNFB測(cè)定蛋白質(zhì)N端氨基酸,靈敏度高(5)與丹磺酰氯(DNS-Cl)的反應(yīng)§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸H2N—CH—COOH+RNCH3CH3O=S=§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸3.α-羧基參加的反應(yīng):(1)與堿反應(yīng)成鹽(2)與醇反應(yīng)成酯(3)與酰化試劑反應(yīng)成酰氯§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸3.α-羧基參加的反應(yīng)§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸4.α-氨基與α-羧基共同參加的反應(yīng)(1)與茚三酮的反應(yīng):除脯氨酸與羥脯氨酸外,可與其它氨基酸生成藍(lán)紫色化合物。脯氨酸與羥脯氨酸為黃色化合物。§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸4.α-氨基與α§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸4.α-氨基與α-羧基共同參加的反應(yīng)
(2)成肽反應(yīng):§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸4.α-氨基與α§1.2蛋白質(zhì)的分子組成——氨基酸(1)
Millon反應(yīng):檢測(cè)Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。
Millon試劑:汞的硝酸鹽與亞硝酸鹽溶液。
產(chǎn)物:紅色的化合物。(2)
Folin反應(yīng):檢測(cè)Tyr或含Tyr的蛋白質(zhì)的反應(yīng)。
Folin試劑:磷鉬酸、磷鎢酸混合溶液
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