蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析

質(zhì)譜測(cè)試分析博苑蛋白質(zhì)組技術(shù)服務(wù)中心.boyuanbio.蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第1頁!蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定流程樣品酶解酶解片斷一級(jí)質(zhì)譜PMF肽指紋圖譜串聯(lián)質(zhì)譜對(duì)庫(kù)檢索序列數(shù)據(jù)庫(kù)成功鑒定PSMs及后篩選De-novo序列分析未知蛋白蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第2頁!肽指紋圖譜（PMF）鑒定PMF（PeptideMassFingerprinting）是根據(jù)一級(jí)質(zhì)譜（MS）所測(cè)酶解片段的精確分子質(zhì)量鑒定蛋白質(zhì)的一種方法。一般采用MALDI-TOF儀器進(jìn)行。因?yàn)镸ALDI質(zhì)譜圖中的離子一般只帶一個(gè)電荷，比較容易計(jì)算。其原理就是利用了蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)中的多肽質(zhì)量的信息與實(shí)際測(cè)得的質(zhì)量信息進(jìn)行對(duì)比而實(shí)現(xiàn)鑒定。蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第3頁!優(yōu)點(diǎn)與缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn)：是用一級(jí)質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的經(jīng)典方法，算法簡(jiǎn)單，速度快缺點(diǎn)：質(zhì)量相近的多肽增加匹配難度無法實(shí)現(xiàn)混合蛋白的鑒定蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第4頁!優(yōu)點(diǎn)與缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn)：鑒定準(zhǔn)確度更高，可以得到蛋白的序列可以實(shí)現(xiàn)多個(gè)蛋白的鑒定缺點(diǎn)：增加了一步操作算法更復(fù)雜，而且需要更多的操作經(jīng)驗(yàn)蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第5頁!蛋白點(diǎn)編號(hào)蛋白名稱蛋白GI號(hào)串聯(lián)質(zhì)譜匹配的序列理論等電點(diǎn)理論分子量串聯(lián)質(zhì)譜離子得分可信度串聯(lián)質(zhì)譜結(jié)果報(bào)告蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第6頁!蛋白信息查詢一般根據(jù)蛋白名稱可以了解該蛋白的大致功能使用該蛋白的GI號(hào)碼可以到NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)一步查的該蛋白的信息對(duì)于未知蛋白，可以采用BLAST或者其它功能預(yù)測(cè)軟件預(yù)測(cè)該蛋白的功能。蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第7頁!二級(jí)質(zhì)譜鑒定質(zhì)譜儀選擇一級(jí)質(zhì)譜中的一個(gè)峰，讓這些峰所代表的離子高速撞擊質(zhì)譜儀中的惰性氣體，使其肽鍵斷裂，并對(duì)庫(kù)搜索鑒定蛋白質(zhì)。常用MALDI-TOF／TOF儀器進(jìn)行。蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第8頁!串聯(lián)質(zhì)譜結(jié)果報(bào)告從一級(jí)質(zhì)譜圖里選出部分峰做二級(jí)質(zhì)譜一級(jí)質(zhì)譜圖二級(jí)質(zhì)譜圖蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析共11頁，您現(xiàn)在瀏覽的是第9頁!蛋白的選擇一般proteinscore大于60分的結(jié)果或者單個(gè)肽段得分超過30的結(jié)果就比較可信。對(duì)于一次鑒定得到多個(gè)蛋白得分均超過60分的以得分最高的最為可信。也可用根據(jù)proteinscore的C.I.%來判斷，該參數(shù)是一個(gè)可信度的評(píng)價(jià)，一般以超過95%作為鑒定結(jié)果可靠的標(biāo)準(zhǔn)。蛋白質(zhì)組中心-質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析