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文檔簡(jiǎn)介
第一節(jié)轉(zhuǎn)錄的概念和轉(zhuǎn)錄模板轉(zhuǎn)錄RNADNA
一、轉(zhuǎn)錄(transcription)以DNA為模板,在RNA聚合酶(RNApolymerase)的作用下合成mRNA,將遺傳信息從DNA分子上轉(zhuǎn)移到mRNA分子上,這一過(guò)程稱為轉(zhuǎn)錄。
生物體以DNA為模板合成RNA的過(guò)程。
第一節(jié)轉(zhuǎn)錄的概念和轉(zhuǎn)錄模板轉(zhuǎn)錄RNADNA1參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:
NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:
DNA酶:
RNA聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol)其他蛋白質(zhì)因子參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:NTP(ATP,UTP,GTP25′···GCAGTACATGTC···3′3′···cgtgatgtacag···5′5′···GCAGUACAUGUC···3′N······Ala·Val·His·Val······C編碼鏈(+)模板鏈(-)mRNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯二、轉(zhuǎn)錄模板
5′···GCAGTACATGTC···3′3′···c3不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription)
在DNA分子雙鏈上某一區(qū)段,一股鏈用作模板指引轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上。不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription45335模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向53模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向5核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)第二節(jié)原核生物基因的轉(zhuǎn)錄一、原核生物的RNA聚合酶核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzym6RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合7酶的連接和裝配亞基
分子量
每分子酶中所含數(shù)目
功能α365122β1506181與底物NTP結(jié)合,延長(zhǎng)多核苷酸鏈β′1556131結(jié)合DNA模板σ702631辨認(rèn)起始位點(diǎn)原核生物的RNA聚合酶β利福平作用部位ω100001未知酶的連接和裝配亞基分子量每分子酶功能α8原核生物一個(gè)轉(zhuǎn)錄區(qū)段可視為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,稱為操縱子(operon),包括若干個(gè)結(jié)構(gòu)基因及其上游(upstream)的調(diào)控序列。
5335結(jié)構(gòu)基因調(diào)控序列RNA-pol模板DNA上結(jié)合RNA聚合酶的部位,稱為啟動(dòng)子(promoter)。二、原核生物啟動(dòng)子原核生物一個(gè)轉(zhuǎn)錄區(qū)段可視為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,稱為操縱子(oper9開(kāi)始轉(zhuǎn)錄TTGACAAACTGT-35區(qū)(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10區(qū)1-30-5010-10-40-205335RNA-pol辨認(rèn)位點(diǎn)(recognitionsite)
55RNA聚合酶識(shí)別區(qū)結(jié)構(gòu)基因33開(kāi)始轉(zhuǎn)錄TTGACA-35區(qū)(Pribnowb101)轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。DNA雙鏈解開(kāi),使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。三、原核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程1)轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:三、原核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程112.DNA雙鏈解開(kāi)1.RNA聚合酶全酶(2ω)與模板結(jié)合3.在RNA聚合酶作用下發(fā)生第一次聚合反應(yīng),形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物RNApol-DNA-pppGpN-OH3轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:5-pppG-OH+
NTP
5-pppGpN
-OH3+ppi轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程:2.DNA雙鏈解開(kāi)1.RNA聚合酶全酶(2ω)122)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)1.亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;
2.在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長(zhǎng)。(NMP)n
+
NTP(NMP)n+1
+PPi2)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)1.亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu)13“轉(zhuǎn)錄泡(transcriptionbubble)”“轉(zhuǎn)錄泡(transcriptionbubble)”14羽毛狀現(xiàn)象在電子顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,可以看到同一DNA模板上,有長(zhǎng)短不一的新合成的RNA鏈散開(kāi)成羽毛狀圖形,這說(shuō)明在同一DNA基因上可以有很多的RNA聚合酶在同時(shí)催化轉(zhuǎn)錄,生成相應(yīng)的RNA鏈。羽毛狀現(xiàn)象在電子顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,可1553DNA原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的羽毛狀現(xiàn)象核糖體RNARNA聚合酶53DNA原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的羽毛狀現(xiàn)象核糖體RNARN16依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止(缺少polyU)非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止3)轉(zhuǎn)錄終止指RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來(lái)不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來(lái)。分類依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止(缺少polyU)3)轉(zhuǎn)錄終171.非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止DNA模板上靠近終止處,有些特殊的堿基序列,轉(zhuǎn)錄出RNA后,RNA產(chǎn)物形成特殊的結(jié)構(gòu)來(lái)終止轉(zhuǎn)錄。1.非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止DNA模板上靠近終止處,有18莖環(huán)(stem-loop)/發(fā)夾(hairpin)結(jié)構(gòu)莖環(huán)(stem-loop)/發(fā)夾(hairpin)結(jié)構(gòu)19莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;使轉(zhuǎn)錄復(fù)合物趨于解離,RNA產(chǎn)物釋放。5′pppG5335RNA-pol莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;5′20ATP2.依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止ATP2.依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止21四、原核生物RNA的轉(zhuǎn)錄后加工1、mRNA
原核生物的mRNA轉(zhuǎn)錄后一般不需要加工,轉(zhuǎn)錄的同時(shí)即進(jìn)行翻譯(半壽期短)。四、原核生物RNA的轉(zhuǎn)錄后加工1、mRNA222.rRNA前體的加工
甲基化作用專一核酸內(nèi)切酶30S前體17StRNA25S專一核酸外切酶16SrRNAtRNA23SrRNA5S
rRNA專一核酸外切酶2.rRNA前體的加工
甲基化作用30S前體17StRNA2233、tRNA前體的加工:原核生物的tRNA轉(zhuǎn)錄后需要加工。包括:(1)由核酸內(nèi)切酶切除前體上3和5端上多余的核苷酸;(2)由核酸外切酶逐個(gè)在3切去附加序列,進(jìn)行修剪。(3)3’端添加CCAOH序列,由核苷酰轉(zhuǎn)移酶催化。(4)核苷的一些特定的堿基和戊糖進(jìn)行修飾。
3、tRNA前體的加工:24一、真核生物的RNA聚合酶
第三節(jié)真核生物基因的轉(zhuǎn)錄一、真核生物的RNA聚合酶第三節(jié)真核生物基因的轉(zhuǎn)錄25TATA盒CAAT盒GC盒
增強(qiáng)子
順式作用元件結(jié)構(gòu)基因-GCGC---CAAT---TATA轉(zhuǎn)錄起始真核生物啟動(dòng)子保守序列二、真核生物基因的啟動(dòng)子
TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子順式作用元件結(jié)26三、真核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程1)轉(zhuǎn)錄起始真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)段比原核生物多樣化,轉(zhuǎn)錄起始時(shí),RNA-pol不直接結(jié)合模板,其起始過(guò)程比原核生物復(fù)雜。三、真核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程1)轉(zhuǎn)錄起始真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)段27轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子順式作用元件(cis-actingelement)1.轉(zhuǎn)錄起始前的上游區(qū)段AATAAA切離加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子順式作用元件(282.轉(zhuǎn)錄因子能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋白質(zhì),現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)數(shù)百種,統(tǒng)稱為反式作用因子(trans-actingfactors)。
反式作用因子中,直接或間接結(jié)合RNA聚合酶的,則稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionalfactors,TF)。2.轉(zhuǎn)錄因子能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋29參與RNA-polⅡ轉(zhuǎn)錄的TFⅡ
參與RNA-polⅡ轉(zhuǎn)錄的TFⅡ303.轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物(pre-initiationcomplex,PIC)真核生物RNA-pol不與DNA分子直接結(jié)合,而需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子才與DNA分子結(jié)合。3.轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物真核生物RNA-pol不與DNA分子直31POL-ⅡTFⅡFⅡAⅡB由RNA-PolⅡ催化轉(zhuǎn)錄的PICPOL-ⅡTFⅡFⅡHⅡETBPTAFTFⅡD-ⅡA-ⅡB-DNA復(fù)合物TATAⅡAⅡBTBPTAFTATAⅡHⅡECTD-PPIC組裝完成,TFⅡH使CTD磷酸化POL-ⅡTFⅡFⅡAⅡB由RNA-PolⅡ催化轉(zhuǎn)錄的PI322)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核膜相隔,沒(méi)有轉(zhuǎn)錄與翻譯同步的現(xiàn)象。RNA-pol前移處處都遇上核小體。轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程中可以觀察到核小體移位和解聚現(xiàn)象。2)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核335------AAUAAA-5------AAUAAA--核酸酶-GUGUGUGRNA-polAATAAAGTGTGTG轉(zhuǎn)錄終止的修飾點(diǎn)55333加尾AAAAAAA······3mRNA3)轉(zhuǎn)錄終止——和轉(zhuǎn)錄后修飾密切相關(guān)。5------AAUAAA-5------AAUAAA34復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別35幾種主要的修飾方式1.剪接(splicing)2.剪切(cleavage)3.修飾(modification)4.添加(addition)四、真核生物RNA轉(zhuǎn)錄后的修飾幾種主要的修飾方式1.剪接(splicing)2.剪切(36(一)mRNA的加工1.首、尾的修飾5端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppGp—)3端加上多聚腺苷酸尾巴(polyAtail)(一)mRNA的加工5端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppG37帽子結(jié)構(gòu)帽子結(jié)構(gòu)385pppGp…5GpppGp…pppGppi鳥苷酸轉(zhuǎn)移酶5
m7GpppGp…甲基轉(zhuǎn)移酶SAM帽子結(jié)構(gòu)的生成5ppGp…磷酸酶Pi5pppGp…5GpppGp…pppGppi鳥苷酸392mRNA的剪接(1)
hnRNA和snRNA核內(nèi)的初級(jí)mRNA稱為雜化核RNA(hetero-nuclearRNA,hnRNA)snRNA(smallnuclearRNA)核內(nèi)的蛋白質(zhì)小分子核糖核酸蛋白體(并接體,splicesome)snRNA2mRNA的剪接(1)hnRNA和snRNA核內(nèi)的40真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開(kāi)但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。斷裂基因(splitegene)CABD編碼區(qū)A、B、C、D非編碼區(qū)真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開(kāi)但又連續(xù)41(2)外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron)外顯子在斷裂基因及其初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上出現(xiàn),并表達(dá)為成熟RNA的核酸序列。內(nèi)含子隔斷基因的線性表達(dá)而在剪接過(guò)程中被除去的核酸序列。(2)外顯子(exon)和內(nèi)含子(intron)外顯子42雞卵清蛋白基因hnRNA首、尾修飾hnRNA剪接成熟的mRNA雞卵清蛋白基因及其轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后修飾雞卵清蛋白基因hnRNA首、尾修飾hnRNA剪接成熟的mRN43雞卵清蛋白成熟mRNA與DNA雜交電鏡示意圖DNAmRNA雞卵清蛋白成熟mRNA與DNA雜交電鏡示意圖DNAmRNA44(二)rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄45S-rRNA剪接18S-rRNA5.8S和28S-rRNArDNA內(nèi)含子內(nèi)含子28S5.8S18S(二)rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄45S-rRNA剪接18S45(三)tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工tRNA前體RNApolⅢTGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNA(三)tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工tRNA前體RNApolⅢTG46RNAaseP、內(nèi)切酶RNAaseP、內(nèi)切酶47tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶、連接酶ATPADPtRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶、連接酶ATPADP48堿基修飾(2)還原反應(yīng)如:UDHU(3)核苷內(nèi)的轉(zhuǎn)位反應(yīng)如:Uψ(4)脫氨反應(yīng)如:AI如:AAm(1)甲基化(1)(1)(3)(2)(4)堿基修飾(2)還原反應(yīng)如:UDHU(3)核苷內(nèi)的49轉(zhuǎn)錄過(guò)程的選擇性抑制劑轉(zhuǎn)錄過(guò)程的選擇性抑制劑50
以病毒RNA為模板,在RNA復(fù)制酶催化下,以四種NTP為底物,按堿基配對(duì)原則,以5’3’方向合成互補(bǔ)鏈的全序列。RNA復(fù)制以病毒RNA為模板,在RNA復(fù)制酶催化下,以四種NT51使用時(shí),直接刪除本頁(yè)!精品課件,你值得擁有!精品課件,你值得擁有!使用時(shí),直接刪除本頁(yè)!精品課件,你值得擁有!精品課件,你值得52使用時(shí),直接刪除本頁(yè)!精品課件,你值得擁有!精品課件,你值得擁有!使用時(shí),直接刪除本頁(yè)!精品課件,你值得擁有!精品課件,你值得53轉(zhuǎn)錄、有義鏈、反義鏈概念;掌握RNA的轉(zhuǎn)錄過(guò)程:起始位點(diǎn)和識(shí)別、起始、延伸、終止;轉(zhuǎn)錄后加工;了解RNA的復(fù)制。
本章重點(diǎn)轉(zhuǎn)錄、有義鏈、反義鏈概念;掌握RNA的轉(zhuǎn)錄54第一節(jié)轉(zhuǎn)錄的概念和轉(zhuǎn)錄模板轉(zhuǎn)錄RNADNA
一、轉(zhuǎn)錄(transcription)以DNA為模板,在RNA聚合酶(RNApolymerase)的作用下合成mRNA,將遺傳信息從DNA分子上轉(zhuǎn)移到mRNA分子上,這一過(guò)程稱為轉(zhuǎn)錄。
生物體以DNA為模板合成RNA的過(guò)程。
第一節(jié)轉(zhuǎn)錄的概念和轉(zhuǎn)錄模板轉(zhuǎn)錄RNADNA55參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:
NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:
DNA酶:
RNA聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol)其他蛋白質(zhì)因子參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:NTP(ATP,UTP,GTP565′···GCAGTACATGTC···3′3′···cgtgatgtacag···5′5′···GCAGUACAUGUC···3′N······Ala·Val·His·Val······C編碼鏈(+)模板鏈(-)mRNA蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄翻譯二、轉(zhuǎn)錄模板
5′···GCAGTACATGTC···3′3′···c57不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription)
在DNA分子雙鏈上某一區(qū)段,一股鏈用作模板指引轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上。不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄(asymmetrictranscription585335模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向53模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄方向轉(zhuǎn)錄方向59核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)第二節(jié)原核生物基因的轉(zhuǎn)錄一、原核生物的RNA聚合酶核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzym60RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合RNA聚合酶全酶在轉(zhuǎn)錄起始區(qū)的結(jié)合61酶的連接和裝配亞基
分子量
每分子酶中所含數(shù)目
功能α365122β1506181與底物NTP結(jié)合,延長(zhǎng)多核苷酸鏈β′1556131結(jié)合DNA模板σ702631辨認(rèn)起始位點(diǎn)原核生物的RNA聚合酶β利福平作用部位ω100001未知酶的連接和裝配亞基分子量每分子酶功能α62原核生物一個(gè)轉(zhuǎn)錄區(qū)段可視為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,稱為操縱子(operon),包括若干個(gè)結(jié)構(gòu)基因及其上游(upstream)的調(diào)控序列。
5335結(jié)構(gòu)基因調(diào)控序列RNA-pol模板DNA上結(jié)合RNA聚合酶的部位,稱為啟動(dòng)子(promoter)。二、原核生物啟動(dòng)子原核生物一個(gè)轉(zhuǎn)錄區(qū)段可視為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,稱為操縱子(oper63開(kāi)始轉(zhuǎn)錄TTGACAAACTGT-35區(qū)(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10區(qū)1-30-5010-10-40-205335RNA-pol辨認(rèn)位點(diǎn)(recognitionsite)
55RNA聚合酶識(shí)別區(qū)結(jié)構(gòu)基因33開(kāi)始轉(zhuǎn)錄TTGACA-35區(qū)(Pribnowb641)轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。DNA雙鏈解開(kāi),使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。三、原核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程1)轉(zhuǎn)錄起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:三、原核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程652.DNA雙鏈解開(kāi)1.RNA聚合酶全酶(2ω)與模板結(jié)合3.在RNA聚合酶作用下發(fā)生第一次聚合反應(yīng),形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物RNApol-DNA-pppGpN-OH3轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:5-pppG-OH+
NTP
5-pppGpN
-OH3+ppi轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程:2.DNA雙鏈解開(kāi)1.RNA聚合酶全酶(2ω)662)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)1.亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;
2.在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長(zhǎng)。(NMP)n
+
NTP(NMP)n+1
+PPi2)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)1.亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu)67“轉(zhuǎn)錄泡(transcriptionbubble)”“轉(zhuǎn)錄泡(transcriptionbubble)”68羽毛狀現(xiàn)象在電子顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,可以看到同一DNA模板上,有長(zhǎng)短不一的新合成的RNA鏈散開(kāi)成羽毛狀圖形,這說(shuō)明在同一DNA基因上可以有很多的RNA聚合酶在同時(shí)催化轉(zhuǎn)錄,生成相應(yīng)的RNA鏈。羽毛狀現(xiàn)象在電子顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,可6953DNA原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的羽毛狀現(xiàn)象核糖體RNARNA聚合酶53DNA原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的羽毛狀現(xiàn)象核糖體RNARN70依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止(缺少polyU)非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止3)轉(zhuǎn)錄終止指RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來(lái)不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來(lái)。分類依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止(缺少polyU)3)轉(zhuǎn)錄終711.非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止DNA模板上靠近終止處,有些特殊的堿基序列,轉(zhuǎn)錄出RNA后,RNA產(chǎn)物形成特殊的結(jié)構(gòu)來(lái)終止轉(zhuǎn)錄。1.非依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止DNA模板上靠近終止處,有72莖環(huán)(stem-loop)/發(fā)夾(hairpin)結(jié)構(gòu)莖環(huán)(stem-loop)/發(fā)夾(hairpin)結(jié)構(gòu)73莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;使轉(zhuǎn)錄復(fù)合物趨于解離,RNA產(chǎn)物釋放。5′pppG5335RNA-pol莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;5′74ATP2.依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止ATP2.依賴Rho因子的轉(zhuǎn)錄終止75四、原核生物RNA的轉(zhuǎn)錄后加工1、mRNA
原核生物的mRNA轉(zhuǎn)錄后一般不需要加工,轉(zhuǎn)錄的同時(shí)即進(jìn)行翻譯(半壽期短)。四、原核生物RNA的轉(zhuǎn)錄后加工1、mRNA762.rRNA前體的加工
甲基化作用專一核酸內(nèi)切酶30S前體17StRNA25S專一核酸外切酶16SrRNAtRNA23SrRNA5S
rRNA專一核酸外切酶2.rRNA前體的加工
甲基化作用30S前體17StRNA2773、tRNA前體的加工:原核生物的tRNA轉(zhuǎn)錄后需要加工。包括:(1)由核酸內(nèi)切酶切除前體上3和5端上多余的核苷酸;(2)由核酸外切酶逐個(gè)在3切去附加序列,進(jìn)行修剪。(3)3’端添加CCAOH序列,由核苷酰轉(zhuǎn)移酶催化。(4)核苷的一些特定的堿基和戊糖進(jìn)行修飾。
3、tRNA前體的加工:78一、真核生物的RNA聚合酶
第三節(jié)真核生物基因的轉(zhuǎn)錄一、真核生物的RNA聚合酶第三節(jié)真核生物基因的轉(zhuǎn)錄79TATA盒CAAT盒GC盒
增強(qiáng)子
順式作用元件結(jié)構(gòu)基因-GCGC---CAAT---TATA轉(zhuǎn)錄起始真核生物啟動(dòng)子保守序列二、真核生物基因的啟動(dòng)子
TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子順式作用元件結(jié)80三、真核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程1)轉(zhuǎn)錄起始真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)段比原核生物多樣化,轉(zhuǎn)錄起始時(shí),RNA-pol不直接結(jié)合模板,其起始過(guò)程比原核生物復(fù)雜。三、真核生物的轉(zhuǎn)錄過(guò)程1)轉(zhuǎn)錄起始真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)段81轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子順式作用元件(cis-actingelement)1.轉(zhuǎn)錄起始前的上游區(qū)段AATAAA切離加尾轉(zhuǎn)錄終止點(diǎn)修飾點(diǎn)外顯子翻譯起始點(diǎn)內(nèi)含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚體轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)TATA盒CAAT盒GC盒增強(qiáng)子順式作用元件(822.轉(zhuǎn)錄因子能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋白質(zhì),現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)數(shù)百種,統(tǒng)稱為反式作用因子(trans-actingfactors)。
反式作用因子中,直接或間接結(jié)合RNA聚合酶的,則稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionalfactors,TF)。2.轉(zhuǎn)錄因子能直接、間接辨認(rèn)和結(jié)合轉(zhuǎn)錄上游區(qū)段DNA的蛋83參與RNA-polⅡ轉(zhuǎn)錄的TFⅡ
參與RNA-polⅡ轉(zhuǎn)錄的TFⅡ843.轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物(pre-initiationcomplex,PIC)真核生物RNA-pol不與DNA分子直接結(jié)合,而需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子才與DNA分子結(jié)合。3.轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物真核生物RNA-pol不與DNA分子直85POL-ⅡTFⅡFⅡAⅡB由RNA-PolⅡ催化轉(zhuǎn)錄的PICPOL-ⅡTFⅡFⅡHⅡETBPTAFTFⅡD-ⅡA-ⅡB-DNA復(fù)合物TATAⅡAⅡBTBPTAFTATAⅡHⅡECTD-PPIC組裝完成,TFⅡH使CTD磷酸化POL-ⅡTFⅡFⅡAⅡB由RNA-PolⅡ催化轉(zhuǎn)錄的PI862)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核膜相隔,沒(méi)有轉(zhuǎn)錄與翻譯同步的現(xiàn)象。RNA-pol前移處處都遇上核小體。轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程中可以觀察到核小體移位和解聚現(xiàn)象。2)轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)過(guò)程與原核生物大致相似,但因有核875------AAUAAA-5------AAUAAA--核酸酶-GUGUGUGRNA-polAATAAAGTGTGTG轉(zhuǎn)錄終止的修飾點(diǎn)55333加尾AAAAAAA······3mRNA3)轉(zhuǎn)錄終止——和轉(zhuǎn)錄后修飾密切相關(guān)。5------AAUAAA-5------AAUAAA88復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的區(qū)別89幾種主要的修飾方式1.剪接(splicing)2.剪切(cleavage)3.修飾(modification)4.添加(addition)四、真核生物RNA轉(zhuǎn)錄后的修飾幾種主要的修飾方式1.剪接(splicing)2.剪切(90(一)mRNA的加工1.首、尾的修飾5端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppGp—)3端加上多聚腺苷酸尾巴(polyAtail)(一)mRNA的加工5端形成帽子結(jié)構(gòu)(m7GpppG91帽子結(jié)構(gòu)帽子結(jié)構(gòu)925pppGp…5GpppGp…pppGppi鳥苷酸轉(zhuǎn)移酶5
m7GpppGp…甲基轉(zhuǎn)移酶SAM帽子結(jié)構(gòu)的生成5ppGp…磷酸酶Pi5pppGp…5GpppGp…pppGppi鳥苷酸932mRNA的剪接(1)
hnRNA和snRNA核內(nèi)的初級(jí)mRNA稱為雜化核RNA(hetero-nuclearRNA,hnRNA)snRNA(smallnuclearRNA)核內(nèi)的蛋白質(zhì)小分子核糖核酸蛋白體(并接體,splicesome)snRNA
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