
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
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
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第五章病毒與原核生物的遺傳學(xué)分析優(yōu)點(diǎn):生活周期短單倍體,無(wú)顯隱性關(guān)系研究方法簡(jiǎn)單靈敏度高第一節(jié)細(xì)菌和病毒研究的遺傳學(xué)意義第二節(jié)
噬菌體(病毒)的遺傳學(xué)分析二、噬菌體雜交與基因定位噬菌體的雜交方法:混合感染(復(fù)感染、雙重感染)重組合重組頻率=x100%
重組合+親組合例:
1955年Kaiser的λ噬菌體實(shí)驗(yàn)
+++xsmico1雜交
s:小噬菌斑,mi:微小噬菌斑,co1:中央渾濁小點(diǎn)的噬菌斑。
類(lèi)型數(shù)目合計(jì)百分比s-co1co1-mis-mi+++sco1mi975724189990.8s+++co1mi3032622.9√√sco1+++mi61511125.3√
√s+mi+co1+513180.86
√
√
合計(jì)20913.766.168.2作圖:
3.766.16sco1mi8.2+2x0.86=9.92第三節(jié)細(xì)菌的遺傳分析1928年Griffith的實(shí)驗(yàn)1928年Griffith發(fā)現(xiàn)肺炎雙球菌的轉(zhuǎn)化現(xiàn)象。1944年Avery證實(shí)轉(zhuǎn)化因子是DNA。轉(zhuǎn)化(transformation):外源DNA通過(guò)細(xì)胞吸收過(guò)程進(jìn)入細(xì)胞,并使其發(fā)生遺傳改變的過(guò)程。感受態(tài)(competence):細(xì)胞具有吸收外源DNA能力的生理狀態(tài)。
有些細(xì)菌在生長(zhǎng)過(guò)程中會(huì)自發(fā)地產(chǎn)生感受態(tài),如肺炎雙球菌,枯草桿菌等;有些細(xì)菌不會(huì)自發(fā)地產(chǎn)生感受態(tài),必需經(jīng)特殊處理才可產(chǎn)生感受態(tài),如大腸桿菌。遺傳轉(zhuǎn)化的機(jī)理
利用轉(zhuǎn)化進(jìn)行基因定位遺傳轉(zhuǎn)化的轉(zhuǎn)化因子一般在10000~20000bp之間,因此當(dāng)兩個(gè)基因連鎖(注意:這里的連鎖與真核生物的連鎖不完全一樣),他們被同時(shí)轉(zhuǎn)化(共轉(zhuǎn)化)的頻率要遠(yuǎn)高于不連鎖的基因利用共轉(zhuǎn)化的特點(diǎn),可以對(duì)連鎖的基因進(jìn)行基因定位。例:Nester利用枯草桿菌trp2+his2+tyr1+DNA為供體,對(duì)trp2-his2-tyr1-進(jìn)行轉(zhuǎn)化。利用轉(zhuǎn)化進(jìn)行基因定位實(shí)驗(yàn)(例子):
Nester利用枯草桿菌trp2+his2+tyr1+DNA為供體,對(duì)trp2-his2-tyr1-進(jìn)行轉(zhuǎn)化Hfr菌株當(dāng)F因子重組在宿主細(xì)胞染色體上時(shí),F(xiàn)因子仍然可以發(fā)生轉(zhuǎn)移,此時(shí)的轉(zhuǎn)移可推動(dòng)宿主基因的轉(zhuǎn)移,因此這種菌株稱(chēng)為高頻重組菌株(highfrequenceofrecombination,Hfr)F因子推動(dòng)染色體的轉(zhuǎn)移是以F因子的一端開(kāi)始,沿F因子所處位置的相反方向進(jìn)行轉(zhuǎn)移,F(xiàn)因子最后才轉(zhuǎn)移。所以染色體在F因子的推動(dòng)下發(fā)生的轉(zhuǎn)移具有一定的方向和順序。1954年利用Hfr菌株的染色體轉(zhuǎn)移特征(方向性和順序性),進(jìn)行了E.coli染色體的基因定位。
Hfr:thr+leu+AzsT1slac+gal+strs(供體)F-:thr-leu-AzrT1rlac-gal-strr(受體)讓兩種細(xì)胞混合,37℃水浴一定時(shí)間后取樣,組織搗碎機(jī)中斷雜交,而后涂布在含Str的基本培養(yǎng)基上,考察供體基因在受體細(xì)胞出現(xiàn)的時(shí)間及順序(基因轉(zhuǎn)移的時(shí)間及順序)。E.coli的染色體圖E.coli的基因定位主要以中斷雜交的方法進(jìn)行的,所以E.coli的染色體圖是以分鐘作單位的。非中斷雜交與基因定位(重組作圖)利用F因子可以推動(dòng)染色體到受體細(xì)胞中的特點(diǎn),將要考察的基因全部轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞中,然后考察各種基因型出現(xiàn)的頻率,根據(jù)重組值計(jì)算公式計(jì)算重組值,進(jìn)行作圖。為保證要考察的基因全部轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞中,選擇性標(biāo)記必需處于轉(zhuǎn)移的末斷。細(xì)菌基因重組的特征:與真核生物相比,原核生物的基因重組有兩個(gè)特征,一是必需發(fā)生偶數(shù)次交換,細(xì)菌細(xì)胞才可存活;二是由于染色體不完整或選擇培養(yǎng)的關(guān)系,野生的重組子才可存活,所以相反的重組子不出現(xiàn)。F’因子與性導(dǎo)附加體:具能游離于染色體外而獨(dú)立存在,又可重組于染色體上的遺傳因子稱(chēng)為附加體。F因子是一種附加體。當(dāng)F因子從染色體上切離時(shí),可能發(fā)生不準(zhǔn)確切離而帶有宿主的部分基因,這種游離的F因子稱(chēng)為F’因子。F’因子的轉(zhuǎn)移可以導(dǎo)致F’因子上宿主基因的轉(zhuǎn)移。1952年,Lederberg&Zinder在進(jìn)行U型管實(shí)驗(yàn)時(shí)發(fā)現(xiàn)。轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction):利用噬菌體(病毒)為媒介,將一個(gè)細(xì)胞(供體)的遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞(受體)中去的過(guò)程。一般性(普遍性)轉(zhuǎn)導(dǎo)指供體細(xì)胞所有基因具有同等機(jī)會(huì)被進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo)的過(guò)程。通常能夠進(jìn)行普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的噬菌體是烈性噬菌體,他們感染細(xì)菌細(xì)胞后,在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制,最后導(dǎo)致細(xì)胞裂解。在裂解過(guò)程中,供體細(xì)胞DNA降解。噬菌體包裝時(shí)可能以很低的頻率發(fā)生錯(cuò)誤而將供體細(xì)胞DNA誤為噬菌體自身DNA進(jìn)行包裝。當(dāng)這個(gè)噬菌體感染另一個(gè)細(xì)胞(受體),從而將供體DNA轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞中,完成轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程。利用轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象可以進(jìn)行基因定位:噬菌體包裝供體DNA?xí)r,要求DNA片段的大小必須與噬菌體DNA大小相當(dāng),才可進(jìn)行包裝。因此當(dāng)兩個(gè)基因連鎖時(shí),這兩個(gè)基因被同時(shí)轉(zhuǎn)導(dǎo)(共轉(zhuǎn)導(dǎo)、并發(fā)轉(zhuǎn)導(dǎo))的可能性比不連鎖基因大得多。因此利用共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率的大小可以進(jìn)行基因定位。
x=(1-d/L)3
或d=L(1-3√x
)
x:兩基因的共轉(zhuǎn)導(dǎo)頻率;d:兩基因間的物理距離,單位與L相同。
L:轉(zhuǎn)導(dǎo)DNA的平均長(zhǎng)度,即轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體DNA大小。例:轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體P1,基因組大小為80kb。供體:E.colisupC+trpA+pyrF+受體:E.colisupC-trpA-pyrF-以supC為選擇性標(biāo)記結(jié)果:1.supC+trpA+pyrF+
36
2.supC+trpA+pyrF-
114
3.supC+trpA-pyrF+
0
4.supC+trpA-pyrF-453順序:根據(jù)3知3基因的順序?yàn)閟upC
trpA
pyrF距離:supC-trpA共轉(zhuǎn)導(dǎo)類(lèi)型是1和2,頻率是0.25,距離為29.6kb。
supC-pyrF共轉(zhuǎn)導(dǎo)類(lèi)型是1和3,頻率是0.06,距離為48.7kb。根據(jù)E.coli染色體全長(zhǎng)3.0x106bp推算,每分鐘DNA長(zhǎng)度約30kb。因此上述距離分別為1分鐘和1.6分鐘。
supC1.0trpA0.6pyrF局限性(特異性、特殊性)轉(zhuǎn)導(dǎo)
指轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體幾乎只轉(zhuǎn)導(dǎo)特定的少數(shù)幾個(gè)基因的現(xiàn)象。局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)一般由溫和噬菌體介導(dǎo)。如λ噬菌體只轉(zhuǎn)導(dǎo)gal基因及bio基因。局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率較高,可達(dá)10-3,而普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的頻率一般為10-5~10-7第一節(jié)基因的概念一基因的概念及其發(fā)展
(一)遺傳因子由1866年孟德?tīng)柼岢?/p>
(二)染色體是基因載體由1910年Morgan證實(shí)
1926Morgan發(fā)表《基因論》
一個(gè)基因一個(gè)酶1941Beadle,Tatum提出(三)DNA是遺傳物質(zhì)
1944年,Avery證明遺傳學(xué)GENETICS第一節(jié)基因的概念一基因的概念及其發(fā)展
(一)遺傳因子由1866年孟德?tīng)柼岢?/p>
(二)染色體是基因載體由1910年Morgan證實(shí)
1926Morgan發(fā)表《基因論》
一個(gè)基因一個(gè)酶1941Beadle,Tatum提出(三)DNA是遺傳物質(zhì)
1944年,Avery證明遺傳學(xué)GENETICS(四)基因是一段有功能的DNA序列
DNA雙螺旋模型1953年Watson和Crick提出遺傳中心法則1957年Crick提出順?lè)椿パa(bǔ)試驗(yàn)1957年Benzer提出:順?lè)醋尤?lián)遺傳密碼的破譯Nirenberg等1961-67年:70年代:可移動(dòng)基因的證實(shí)、隔裂基因和重疊基因的發(fā)現(xiàn)等。近代基因的概念:基因是一段有功能的DNA序列,是一個(gè)遺傳功能單位,其內(nèi)部存在有許多的重組子和突變子。突變子:指改變后可以產(chǎn)生突變型表型的最小單位。
重組子:不能由重組分開(kāi)的基本單位。(五)操縱子模型:1961年FJacob和Monod提出,這一學(xué)說(shuō)闡明了基因調(diào)控在乳糖利用中所起的作用。遺傳學(xué)GENETICS(六)跳躍基因和斷裂基因的發(fā)現(xiàn)基因組:對(duì)于一個(gè)二倍體高等生物而言,能維持配子或配子體正常功能的最低數(shù)目的一套染色體就稱(chēng)為一個(gè)基因組。
B.McClintock最早提出可跳動(dòng)基因的觀點(diǎn).轉(zhuǎn)座子:可以從一條染色體跳到另一條染色體上的DNA片段.
斷裂基因:基因中DNA序列不連續(xù),其中被一些不編碼序列所隔開(kāi).遺傳學(xué)GENETICS二基因的類(lèi)別用其相互關(guān)系
(一)結(jié)構(gòu)基因:指為蛋白質(zhì)氨基酸編碼的基因。
(二)rRNA基因和tRNA基因:只轉(zhuǎn)錄、不翻譯的基因。
(三)啟動(dòng)子和操縱子基因:不轉(zhuǎn)錄、不翻譯,與相關(guān)物結(jié)合,對(duì)轉(zhuǎn)錄起調(diào)控作用的基因。三基因和DNA
DNA(1)
染色體蛋白質(zhì)(1.5-2.5)組蛋白(1)RNA(0.05)非組蛋白(0.5-1.5)基因大?。?00-6000bp;遺傳學(xué)GENETICS遺傳學(xué)GENETICS第二節(jié)重組測(cè)驗(yàn)一擬等位基因擬等位基因:例如:果蠅眼色:紅色:+
杏紅色:Wa
白色:W
其它色
P
杏紅眼♀X
白眼♂
Wa/Wa
W/Y
F1
杏紅眼
F2
杏紅眼白眼紅眼
1/1000可能原因:A:基因突變
B:基因內(nèi)重組因?yàn)榛蜃匀煌蛔兟屎艿停?0-6)因此,基因突變被排除遺傳學(xué)GENETICS
P杏紅眼♀X白眼♂
Wa+
+WWa+Y↓F1
杏紅♂X杏紅眼♀
Wa+
Wa+
Y+W↓?F2
杏紅眼杏紅杏紅白眼
紅眼
Wa+
Wa+
Wa+
W
+Wa++WYY
基因內(nèi)重組
++
WaW
配子++
++
WaW
WaW
Wa+
或
Y或Wa+Y比較:F1
杏紅♀基因型紅眼♀基因型
Wa+
反式WaW
順式
+W+
+→遺傳學(xué)GENETICS由于排列方式不同而表型不同的現(xiàn)象稱(chēng)為順?lè)次恢眯?yīng).擬等位基因:將緊密連鎖基因的功能性等位基因,但不是結(jié)構(gòu)性的等位基因稱(chēng)為擬等位基因.遺傳學(xué)GENETICS二噬菌體突變型1噬菌體形態(tài)變型2
宿主范圍突變型:3
條件致死突變型:表4-1野生型與幾種突變型的區(qū)別類(lèi)型不同大腸桿菌平板上噬菌斑表型BK()S野生型小噬菌斑小噬菌斑小噬菌斑
rI大噬菌斑小噬菌斑小噬菌斑
rII大噬菌斑無(wú)噬菌斑(致死)小噬菌斑rIII大噬菌斑小噬菌斑小噬菌斑遺傳學(xué)GENETICS
1噬菌體雜交實(shí)驗(yàn)
r47r+Xr+r104
B10-610-2
BK()親組合:r47r+、r+r10,r+r+
重組合:r+r+、r47r104,共525共370
2重組值的計(jì)算
重組值=重組噬菌斑數(shù)X100%總噬菌斑數(shù)三Benzer的重組測(cè)驗(yàn)=0.0141%=在K()上生長(zhǎng)的噬菌斑數(shù)X2X100%在B上生長(zhǎng)的噬菌斑數(shù)=370X102X2X100%
525X106遺傳學(xué)GENETICS遺傳學(xué)GENETICS遺傳學(xué)GENETICS第三節(jié)互補(bǔ)試驗(yàn)rIIA+BXrIIAB+
一互補(bǔ)試驗(yàn)的概念和原理
1互補(bǔ)試驗(yàn)的概念:
rIIA+BrIIAB+
EcoliK()EcoliK()rIIA+BrIIAB+遺傳學(xué)GENETICS
2互補(bǔ)試驗(yàn)的原理
表型有無(wú)功能互補(bǔ)結(jié)論反式:A+BAB+反式:
A+BAB+
3互補(bǔ)試驗(yàn)方法——斑點(diǎn)測(cè)試法4互補(bǔ)試驗(yàn)的意義突變型-屬同一順?lè)醋右吧停珜俨煌樂(lè)醋舆z傳學(xué)GENETICS遺傳學(xué)GENETICS二順?lè)醋樱ɑ颍?順?lè)丛囼?yàn):指將兩個(gè)擬突變分別處于順式和反式,根據(jù)其表型確定兩個(gè)突變是否是同一基因的試驗(yàn)。
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