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關(guān)于腫瘤的分子生物學(xué)檢驗(yàn)第一頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日2腫瘤標(biāo)志物的研究歷史第1階段(1963-1978):癌胚性抗原1963年Abelev
AFP1965年Gold&Freeman
CEA第2階段(1979-1989):糖鏈抗原為主1980年Koprowski
CA19-9(1116-NS-19-9)1981年Bast
CA125(OC125)第3階段(1990以后):基因標(biāo)志腫瘤基因標(biāo)志第二頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日3一、原癌基因(oncogene,onc)及其表達(dá)產(chǎn)物的作用
1、定義:
原癌基因是指人類或其他動(dòng)物細(xì)胞(以及致癌病毒)固有的一類基因,能誘導(dǎo)細(xì)胞正常轉(zhuǎn)化并使之獲得新生物特征的基因總稱。原癌基因包括病毒癌基因(v-onc)和細(xì)胞癌基因(c-onc)兩種,它們?cè)谡G闆r下以非激活的形式存在,故稱原癌基因。負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動(dòng),包括細(xì)胞增生、生長(zhǎng)因子信號(hào)傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。一旦這類基因發(fā)生某些錯(cuò)誤或功能喪失時(shí),極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因。第三頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日42、特點(diǎn):
(1)v-onc是病毒基因組中特殊的核苷酸序列,能
引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化
(2)c-onc是存在于正常細(xì)胞基因組中的癌基因,
在正常情況下處于靜止或低表達(dá)的狀態(tài),不
僅對(duì)細(xì)胞無(wú)害,而且對(duì)維持細(xì)胞正常功能具
有重要作用,但在異常表達(dá)時(shí),其產(chǎn)物可使
細(xì)胞無(wú)限制分裂
第四頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日5細(xì)胞癌基因與病毒癌基因核酸序列有同源性即它們的DNA序列是相對(duì)應(yīng)的,表達(dá)產(chǎn)物也基本相同第五頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日6細(xì)胞癌基因的作用:
通過(guò)其表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)來(lái)體現(xiàn)的,負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動(dòng),包括細(xì)胞增生、生長(zhǎng)因子信號(hào)傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。
第六頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日7二、癌基因定義:原癌基因在進(jìn)化上高度保守,負(fù)責(zé)調(diào)控正常細(xì)胞的生命活動(dòng),包括細(xì)胞增生、生長(zhǎng)因子信號(hào)傳遞、細(xì)胞周期進(jìn)展、細(xì)胞存活以及DNA轉(zhuǎn)錄等。一旦這類基因發(fā)生某些錯(cuò)誤或功能喪失時(shí),極易導(dǎo)致原癌基因轉(zhuǎn)變?yōu)榭墒拐<?xì)胞轉(zhuǎn)化為腫瘤的轉(zhuǎn)化基因或癌基因第七頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日8三、原癌基因的激活機(jī)制
原癌基因具有正常的生理功能,被激活時(shí)又具有致癌能力,因此研究原癌基因如何被激活是很重要的。
現(xiàn)已證實(shí)
射線輻射
化學(xué)致癌劑
病毒感染
第八頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日9(一)原癌基因點(diǎn)突變(pointmutation)
癌基因在編碼順序的特定位置上的某一個(gè)核苷酸發(fā)生突變,使其表達(dá)蛋白質(zhì)中相應(yīng)的氨基酸發(fā)生變化,從而獲得了轉(zhuǎn)化細(xì)胞的活性mutation第九頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日10(二)原癌基因獲得外源啟動(dòng)子而激活
腫瘤細(xì)胞中原癌基因的表達(dá)水平可以其轉(zhuǎn)錄的mRNA或翻譯產(chǎn)物蛋白質(zhì)的含量來(lái)表示
在原癌基因的上游插入外源性啟動(dòng)子或增強(qiáng)子可激活原癌基因,使其表達(dá)產(chǎn)物增多
病毒的增強(qiáng)子常位于5’端的長(zhǎng)末端重復(fù)序列(1ongterminalrepeat,LTR)內(nèi)。如果增強(qiáng)子插入到原癌基因的附近或遠(yuǎn)處,均使之激活,促使癌基因的表達(dá)比正常表達(dá)增高幾十甚至上百倍
第十頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日11(三)原癌基因甲基化程度降低而激活
DNA分子中的甲基化(methylation)對(duì)阻抑基因的轉(zhuǎn)錄具有重要作用第十一頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日12現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸腺癌和小細(xì)胞肺癌的細(xì)胞中,ras基因的DNA甲基化水平比其鄰近的正常細(xì)胞明顯偏低,提示某些原癌基因是由于甲基化程度降低而激活第十二頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日13(四)原癌基因的拷貝數(shù)增加
基因擴(kuò)增(amplification):
某些癌基因通過(guò)一些機(jī)制在原來(lái)的染色體上復(fù)制多個(gè)拷貝,超出了正常細(xì)胞的癌基因劑量,導(dǎo)致基因產(chǎn)物的增加,從而使細(xì)胞正常功能紊亂
例如:
人視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤:N-myc擴(kuò)增了10-200倍,相應(yīng)的mRNA和蛋白質(zhì)產(chǎn)物也都大量增加第十三頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日14
(五)基因易位或重排使原癌基因激活
基因易位(translocation)
基因重排(rearrangemant):
有些癌基因從其染色體的正常位置轉(zhuǎn)移到另一染色體的某個(gè)位置,由于調(diào)控環(huán)境發(fā)生變化,導(dǎo)致從相對(duì)靜止?fàn)顟B(tài)變成激活狀態(tài),使原癌基因表達(dá)產(chǎn)物顯著增加而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生
第十四頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日15
染色體易位使位于9q34的c-abl基因轉(zhuǎn)移到第22對(duì)染色體上,重排形成bcr-abl融合基因,使表達(dá)增高,蛋白質(zhì)產(chǎn)物也由p145變成p210,其酪氨酸蛋白激酶活性大為增加,導(dǎo)致慢性粒細(xì)胞白血病的發(fā)生
第十五頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日16
四、抑癌基因
抑癌基因(suppressergene)又稱抗癌基因(anti-onc),是存在于正常細(xì)胞內(nèi)的一類可抑制細(xì)胞生長(zhǎng)的基因,并有潛在抑癌作用。當(dāng)這類基因發(fā)生突變、缺失或失活時(shí),可引起細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生
第十六頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日17(一)抑癌基因及其表達(dá)產(chǎn)物
抑癌基因與調(diào)控細(xì)胞分裂和分化過(guò)程相關(guān),可能與生長(zhǎng)因子、某些蛋白激酶類活性密切相關(guān),只是抑癌基因給予細(xì)胞的信號(hào)與原癌基因相反第十七頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日18(二)抑癌基因失活機(jī)理
1、視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤(retino-blastoma,Rb)
(1)特點(diǎn):
★基因組成:27個(gè)外顯子,3-17外顯子區(qū)域是基
因重組和突變的熱點(diǎn)
★編碼:p105的蛋白質(zhì),其有結(jié)合DNA的活性,
可受多種激酶系統(tǒng)催化而發(fā)生磷酸化第十八頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日19
(2)作用:
不同程度磷酸化后,都可使p105活性缺乏或完全消失。非磷酸化的Rb可防止細(xì)胞增殖,當(dāng)DNA腫瘤病毒抗原結(jié)合了非磷酸化的Rb時(shí),Rb的活性就受到抑制,使細(xì)胞轉(zhuǎn)化為無(wú)限增殖狀態(tài),形成腫瘤第十九頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日20對(duì)于大量來(lái)自視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤的Rb基因序列進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)Rb基因完全或部分發(fā)生缺失;另一些Rb腫瘤中,基因完整,但序列分析顯示有一個(gè)突變,它常發(fā)生于剪接點(diǎn)上,由于這一變異導(dǎo)致RbmRNA組裝時(shí)有外顯子被漏掉,因而產(chǎn)生異常Rb蛋白質(zhì)
第二十頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日21
抑癌基因又稱為隱性癌基因
基因1基因2原癌基因MW腫瘤抑癌基因MW
MM腫瘤第二十一頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日22(2)p53基因
★特點(diǎn):17p13,11個(gè)外顯子,10個(gè)內(nèi)含子
★編碼:393個(gè)氨基酸,p53第二十二頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日23★作用:產(chǎn)物能結(jié)合DNA和被磷酸化。
(1)抑制腫瘤細(xì)胞停滯在修復(fù)前期不能進(jìn)入S期復(fù)制DNA而促使細(xì)胞凋亡第二十三頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日24野生型p53的蛋白質(zhì)
p53下調(diào)bcl-2而上調(diào)bax,促進(jìn)細(xì)胞凋亡過(guò)程。向丟失p53等位基因的腫瘤細(xì)胞中導(dǎo)入野生型p53就會(huì)使腫瘤細(xì)胞凋亡第二十四頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日25
正常細(xì)胞的生長(zhǎng)增殖由兩大基因調(diào)控正調(diào)控信號(hào):促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng)和增殖,并且阻止其發(fā)生終末分化—癌基因
負(fù)調(diào)控信號(hào):促進(jìn)細(xì)胞成熟,向終末分化,最后凋亡(apoptosis)—抑癌基因
兩種信號(hào)保持著動(dòng)態(tài)平衡,對(duì)正常細(xì)胞的生長(zhǎng)、增殖、死亡精確地調(diào)控,當(dāng)平衡被破壞,正調(diào)控信號(hào)基因功能過(guò)盛或負(fù)調(diào)控信號(hào)基因失活,導(dǎo)致細(xì)胞增殖調(diào)控的混亂而使細(xì)胞惡變第二十五頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日26
原癌基因的激活
1、ras基因的變異
2.myc基因的變異抑癌基因的失活
1、Rb基因的失活
2、p53基因的失活
3、其他:
BRCA1和BRCA2:與遺傳性高發(fā)乳腺癌相關(guān)的基因,與卵巢癌的發(fā)生也緊密相關(guān)
第二十六頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日27五、檢測(cè)方法:
1、PCR/ASO探針?lè)?PCR-allele-specific
oligonucleotide)
被檢基因片段經(jīng)PCR擴(kuò)增并經(jīng)電泳分離后轉(zhuǎn)移到膜上,分別與經(jīng)標(biāo)記的野生型和突變型靶基因序列的寡核苷酸探針雜交。由于長(zhǎng)度為20個(gè)堿基左右的探針中僅1個(gè)堿基的差異便會(huì)使其Tm值下降5.0~7.5℃,因此通過(guò)嚴(yán)格控制雜交條件,可以使PCR產(chǎn)物與完全互補(bǔ)的探針進(jìn)行雜交,也即野生型序列的產(chǎn)物僅與野生型探針雜交,含突變序列的產(chǎn)物僅與突變探針雜交。根據(jù)有無(wú)雜交信號(hào)可判斷被檢擴(kuò)增片段中是否帶有突變點(diǎn)。
第二十七頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日282、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)分析
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)(PCR—RFLP)分析技術(shù)是在PCR技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的。DNA堿基置換正好發(fā)生在某種限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)上,使酶切位點(diǎn)增加或者消失,利用這一酶切性質(zhì)的改變,PCR特異擴(kuò)增包含堿基置換的這段DNA,經(jīng)某一限制酶切割,再利用瓊脂糖凝膠電泳分離酶切產(chǎn)物,與正常比較來(lái)確定是否變異。應(yīng)用PCR—RFLP,可檢測(cè)某一致病基因已知的點(diǎn)突變,進(jìn)行直接基因診斷,也可以此為遺傳標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析進(jìn)行間接基因診斷。
第二十八頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日293、PCR-SSCP、測(cè)序等單鏈DNA分子具有特定的二級(jí)空間構(gòu)象,取決于該分子本身的堿基組成突變DNA的PCR產(chǎn)物經(jīng)變性后產(chǎn)生與正常DNA空間構(gòu)象不同的兩條單鏈在非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳中時(shí),不同構(gòu)象的單鏈片段具有不同的電泳遷移率,從而能區(qū)別正常與突變的DNA第二十九頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日304、變性梯度凝膠電泳(DGGE)在設(shè)計(jì)引物時(shí)應(yīng)使被擴(kuò)增的靶基因片段的兩端含有不同的Tm值,一端較高,另一端相對(duì)較低。將PCR產(chǎn)物在含有梯度濃度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中進(jìn)行分離,當(dāng)泳動(dòng)至變性劑相應(yīng)濃度的位置時(shí),產(chǎn)物片段中Tm值較低一端的雙鏈被部分變性而解鏈,這種部分解鏈的構(gòu)象致使該片段的電泳遷移率大大降低。由于野生序列與突變序列的PCR產(chǎn)物片段的Tm不同,它們?cè)陔娪具^(guò)程中被部分解鏈的先后不同,經(jīng)過(guò)一定時(shí)間的電泳,可以發(fā)現(xiàn)這些產(chǎn)物片段在凝膠中所處的位置也不同,據(jù)此,可以區(qū)別野生序列片段還是突變序列片段。第三十頁(yè),共三十三頁(yè),2022年,8月28日315、Southern
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