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文檔簡介
第頁《分子生物學(xué)》課程教學(xué)大綱課程名稱:分子生物學(xué)(molecularbiology)課程類別:專業(yè)主干課適用專業(yè):生物科學(xué)
考核方式:考試總學(xué)時、學(xué)分:48
學(xué)時
3
學(xué)分
其中實驗學(xué)時:0
學(xué)時一、課程教學(xué)目的本課程是生物工程專業(yè)任選課程。《分子生物學(xué)》是一門近年來發(fā)展迅速并且在生命科學(xué)領(lǐng)域里應(yīng)用越來越廣泛、影響越來越深遠(yuǎn)的一個學(xué)科。從學(xué)科角度來講,分子生物學(xué)涵蓋面非常廣。該課程是研究生物大分子(核酸、蛋白質(zhì))的功能、形態(tài)結(jié)構(gòu)特征及其重要性和規(guī)律性的科學(xué),從分子水平研究生命本質(zhì)。包括核酸/基因組的結(jié)構(gòu)及功能,生物信息的傳遞,分子生物學(xué)的研究方法,基因組與比較基因組學(xué),基因表達(dá)調(diào)控與調(diào)控,以及分子生物學(xué)與人類健康和發(fā)育。另外,將介紹人類基因組計劃、基因芯片、分子雜交等分子生物學(xué)前沿知識。通過本課程的學(xué)習(xí),要求學(xué)生了解分子生物學(xué)的研究方法及發(fā)展?fàn)顩r。系統(tǒng)掌握該課程的基本概念,注意各部分內(nèi)容關(guān)系。對一些關(guān)鍵技術(shù)要求掌握其原理和主要步驟。在對課程融會貫通基礎(chǔ)上,能夠?qū)σ恍┚C合性的問題進(jìn)行分析并提出解決方案。另外與其他學(xué)科的交叉、聯(lián)系也需要掌握。引用一系列分子生物學(xué)研究工作實例,將分子生物學(xué)的基本研究思路和基本研究方法介紹給學(xué)生。本課程以多媒體教學(xué)為主,課堂輔助答疑為輔;結(jié)合網(wǎng)上資源和課程軟件,基本上實現(xiàn)學(xué)生不限時段的網(wǎng)上學(xué)習(xí)、在線交流等功能。二、課程教學(xué)要求通過多媒體教學(xué)的方式,向?qū)W生展示更生動的圖片、動畫以說明復(fù)雜的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理,使學(xué)生接觸到更豐富、更前沿的分子生物學(xué)知識,最終要求學(xué)生:
1
)掌握核酸分子的精細(xì)結(jié)構(gòu)和原核、真核基因組的結(jié)構(gòu)特點;
2
)通過掌握幾個典型的原核、真核基因表達(dá)調(diào)控的例子,深刻了解基因表達(dá)的精細(xì)性、復(fù)雜性和高度可調(diào)控性;
3
)了解基因表達(dá)與生物體不同發(fā)育階段、不同生理機(jī)能的關(guān)系;
4
)掌握分子生物學(xué)研究的基本思路和方法,并能夠活學(xué)活用。1.
理論和知識方面掌握分子生物學(xué)的定義。熟悉分子生物學(xué)研究內(nèi)容。了解分子生物學(xué)簡史。掌握基因的定義和功能、原核生物和真核生物基因特征,熟悉細(xì)胞器和亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)基因特征。掌握基因組的定義,原核生物和真核生物基因組結(jié)構(gòu),熟悉線粒體、葉綠體和細(xì)胞器的基因組結(jié)構(gòu)。了解人類基因組計劃及其在藥學(xué)研究中的應(yīng)用。掌握染色質(zhì)和染色體的化學(xué)成分及組成、染色質(zhì)和染色體的功能。掌握原核和真核生物DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄翻譯的特點。了解轉(zhuǎn)座子的結(jié)構(gòu)分類和結(jié)構(gòu)特征、轉(zhuǎn)座效應(yīng)、原核生物和真核生物的轉(zhuǎn)座子,了解轉(zhuǎn)座子機(jī)制,了解逆轉(zhuǎn)錄病毒和逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。掌握蛋白質(zhì)合成的機(jī)制、蛋白質(zhì)合成后的加工。了解蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)運機(jī)理。掌握原核生物基因表達(dá)調(diào)控機(jī)理、掌握乳糖操縱子和色氨酸操縱子基因結(jié)構(gòu)及表達(dá)調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。熟悉λ噬菌體基因組及表達(dá)調(diào)控。了解其他操縱子基因結(jié)構(gòu)及表達(dá)調(diào)控。掌握真核生物基因結(jié)構(gòu)與基因調(diào)控方式。掌握基因表達(dá)與DNA甲基化。了解免疫球蛋白基因。了解真核生物的其他重要系統(tǒng)的基因調(diào)控。了解DNA病毒、RAN病毒和反轉(zhuǎn)錄病毒的特征、結(jié)構(gòu)及復(fù)制。2.
能力、技能方面掌握質(zhì)粒的遺傳學(xué)類型、質(zhì)粒DNA特性,熟悉細(xì)菌質(zhì)粒和真核生物質(zhì)粒。掌握遺傳重組。了解遺傳重組在分子生物學(xué)中的應(yīng)用。掌握基因工程原理及基本操作。了解基因克隆的應(yīng)用。三、先修課程生物化學(xué)、遺傳學(xué)、分子生物學(xué)、高等數(shù)學(xué)四、課程教學(xué)重、難點總體重點:從總體上講,本課程以DNA的結(jié)構(gòu)和功能,基因的表達(dá)(蛋白質(zhì)的合成),基因的調(diào)控為重點,使學(xué)生對之有較為系統(tǒng)的了解??傮w難點:從總體上講,基因表達(dá)的三大過程即基因DNA的復(fù)制過程、轉(zhuǎn)錄過程和翻譯過程是本課程的難點,這一章除了要求學(xué)生有較強(qiáng)的生物化學(xué)和遺傳學(xué)的基礎(chǔ)知識外,還要對整個DNA和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能體現(xiàn)的整個流程有一個整體的概念,因此在授課的過程中,首先要對各個過程進(jìn)行詳細(xì)的解說,使學(xué)生有一個整體上的了解,然后分別重點介紹其中的分子水平的機(jī)制。另外,分子生物學(xué)方法日新月異,更新速度較快,而且大量研究方法是針對某一個比較大的研究目標(biāo)而設(shè)定的,方法兩章也是難點,因此在教學(xué)過程中可以適當(dāng)取舍,同時對重要的基本方法一定要講解清楚,對程序復(fù)雜的大方法是學(xué)生了解其基本原理和基因應(yīng)用領(lǐng)域即可。第三個方面,由于分子本身比較抽象,大量的原理和過程需要通過圖片、動畫形式予以突破。五、課程教學(xué)方法與教學(xué)手段課堂講授,啟發(fā)式教學(xué),多媒體演示,最好在能上網(wǎng)的教室中進(jìn)行。六、課程教學(xué)內(nèi)容第一章緒論(3學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)
分子生物學(xué)的發(fā)展歷史現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展特點。(2)
現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展特點。2.重、難點提示重點:(1)
分子生物學(xué)的發(fā)展歷史以及現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展特點;(2)
分子生物學(xué)的定義、三大原則、四大主要領(lǐng)域,以及DNA重組技術(shù)的概念難點:無。第二章染色體與DNA(3學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)
原核生物和真核生物染色體的組成,DNA復(fù)制的調(diào)控,DNA修復(fù)的類型,真核生物中的轉(zhuǎn)座子及其作用機(jī)制,轉(zhuǎn)座作用的遺傳學(xué)效應(yīng)。(2)DNA的結(jié)構(gòu)、DNA復(fù)制過程。(3)DNA多態(tài)性、replicon、replicationfork、transposon。(4)
原核生物和真核生物DNA復(fù)制的特點,真核細(xì)胞DNA序列分類,轉(zhuǎn)座子的類型及其結(jié)構(gòu)特征(5)
真核生物和原核生物基因組的結(jié)構(gòu)特點,DNA復(fù)制的酶類體系,原核生物和真核生物DNA復(fù)制的特點,轉(zhuǎn)座子的類型及其結(jié)構(gòu)特征。2.重、難點提示重點:(1)
原核生物和真核生物基因組的結(jié)構(gòu)特點。(2)DNA復(fù)制的幾種方式。(3)DNA復(fù)制的酶類體系。難點:(1)
區(qū)分真核生物和原核生物基因組的結(jié)構(gòu)特點。(2)
區(qū)分原核生物和真核生物DNA復(fù)制的特點。第三章生物信息的傳遞(上)從DNA到RNA(3學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)RNA聚合酶的晶體結(jié)構(gòu),DNA轉(zhuǎn)錄循環(huán)理論,“窮追”模型。(2)
抗終止方式,帽子結(jié)構(gòu)的類型,RNA剪接的過程及剪接的分類。(3)RNA的編輯、再編碼及化學(xué)修飾的生物學(xué)意義。(4)
核酶的分類及其作用,RNA在進(jìn)化中的地位。(5)
轉(zhuǎn)錄基本過程,帽子結(jié)構(gòu)、PolyA尾的形成過程,內(nèi)含子剪輯過程,轉(zhuǎn)錄的抑制,轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄起始位點、promoter、terminator、enhancer、SD序列、轉(zhuǎn)錄單元inton、exon、ORF、GU-AG法則、剪接、內(nèi)含子的剪接、可變剪接、單順反子、多順反子、基因、CDS與非編碼區(qū)、RNA的編輯、RNA的再編碼、核酶。2.重、難點提示重點:(1)
轉(zhuǎn)錄過程中相關(guān)概念的掌握。(2)
大腸桿菌RNA聚合酶組成以及如何參與轉(zhuǎn)錄起始,真核生物RNA聚合酶的分類、轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物以及其特性,轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的類型及作用,原核生物和真核生物啟動子的組成。(3)
大腸桿菌的啟動子與終止子如何控制其轉(zhuǎn)錄的起始與終止,增強(qiáng)子的功能、特性;原核生物和真核生物基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游區(qū)結(jié)構(gòu)的差異,真核生物對轉(zhuǎn)錄的影響(即TATA區(qū)和上游啟動子元件的作用),原核生物和真核生物mRNA的特征,帽子結(jié)構(gòu)和PolyA尾的作用及其形成時間,RNA化學(xué)修飾的種類。難點:(1)
大腸桿菌RNA聚合酶組成以及如何參與轉(zhuǎn)錄起始,真核生物RNA聚合酶的分類、轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物以及其特性,轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的類型及作用,原核生物和真核生物啟動子的組成,增強(qiáng)子的功能、特性。(2)
原核生物和真核生物基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游區(qū)結(jié)構(gòu)的差異,真核生物對轉(zhuǎn)錄的影響(即TATA區(qū)和上游啟動子元件的作用),原核生物和真核生物mRNA的特征,帽子結(jié)構(gòu)和PolyA尾的作用及其形成時間,RNA化學(xué)修飾的種類。(3)
大腸桿菌的啟動子與終止子如何控制其轉(zhuǎn)錄的起始與終止。第四章生物信息的傳遞(下)從mRNA到蛋白質(zhì)(5學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)
密碼子與反密碼子配對中的“擺動假說”
。(2)
校正tRNA作用機(jī)制、蛋白質(zhì)的生物學(xué)合成機(jī)制、蛋白質(zhì)合成的抑制、蛋白質(zhì)的降解。(3)
翻譯、同義密碼子、同義突變、無義突變、錯義突變、分子伴侶、信號肽。(4)
真核生物和原核生物核糖體RNA組成及其功能,核糖體中tRNA的結(jié)合位點,核糖體的活性中心。2.重、難點提示重點:(1)
核糖體中tRNA的結(jié)合位點,核糖體的活性中心,蛋白質(zhì)的生物學(xué)合成機(jī)制。(2)
遺傳密碼的性質(zhì),起始密碼子和終止密碼子,tRNA組成和結(jié)構(gòu)上的特點,tRNA的功能和類型,氨酰-tRNA合成酶的作用,核糖體的結(jié)構(gòu)和功能。(3)
蛋白質(zhì)的生物學(xué)合成機(jī)制(過程、起始因子、延伸因子、釋放因子),蛋白質(zhì)前體的加工修飾。難點:(1)
真核生物與原核生物翻譯起始氨基酸、形成翻譯起始復(fù)合物的區(qū)別。(2)
肽鏈的延伸過程,肽鏈的終止。(3)
蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運機(jī)制的分類。第五-六章分子生物學(xué)研究方法(12學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)
重組DNA技術(shù)的發(fā)展史,重組DNA技術(shù)的基本工具,凝膠電泳的類型及制備,基因組DNA文庫的構(gòu)建,mRNA的分離過程,cDNA文庫的構(gòu)建,基因文庫的篩選方法,SNP的檢測技術(shù),cDNA差示分析法、Gateway大規(guī)??寺〖夹g(shù)和基因圖位克隆技術(shù)的原理,蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析技術(shù)。(2)
限制性核酸內(nèi)切酶、載體、電泳遷移率、細(xì)菌轉(zhuǎn)化、基因組DNA文庫、SNP、DNA遺傳標(biāo)記、等位位點、基因型和基因分型、haplotype、基因克隆、蛋白質(zhì)組學(xué)。(3)
核酸凝膠電泳技術(shù)的原理,PCR技術(shù)原理,實時熒光定量PCR分類,TaqMan探針具有的三要素,基因組DNA大片段文庫YAC、BAC文庫的組成及優(yōu)缺點,提高基因組DNA文庫代表性和隨機(jī)性的策略。(4)
總RNA的提取及注意事項,cDNA的合成,cDNA文庫的特點,SNP的分類及應(yīng)用。(5)
基因克隆技術(shù)類型及其適用范圍-重點掌握RACE技術(shù)的原理,雙向電泳技術(shù)的原理,westernblotting的技術(shù)原理、實驗步驟及影響因素。(6)
研究基因功能的常用分子生物學(xué)技術(shù),
基因表達(dá)系列分析技術(shù)、酵母單雜交系統(tǒng)、酵母雙雜交系統(tǒng)、細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)互作技術(shù)、噬菌體展示技術(shù)、蛋白質(zhì)磷酸化分析技術(shù)的原理及應(yīng)用,原位雜交技術(shù)(自學(xué)),體外蛋白質(zhì)互作技術(shù)(自學(xué)),利用酵母鑒定靶基因功能(自學(xué))。2.重、難點提示重點:(1)
核酸凝膠電泳技術(shù)的原理。(2)PCR技術(shù)原理,RACE技術(shù)的原理。(3)westernblotting的技術(shù)原理及實驗步驟。(4)
基因芯片技術(shù)的原理。(5)
基因定點突變技術(shù)的原理、基因敲除技術(shù)的原理。(6)RNAi技術(shù)的原理。難點:(1)cDNA文庫的構(gòu)建。(2)
基因文庫的篩選方法。(3)
新方法如基因表達(dá)系列分析技術(shù)、RNA選擇性剪接、原位雜交技術(shù)、基因定點突變技術(shù)、基因芯片、基因敲除技術(shù)、RNAi技術(shù)等各項技術(shù)原理的理解。第七章基因的表達(dá)與調(diào)控(上)-原核基因表達(dá)調(diào)控模式(9學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)
基因表達(dá)調(diào)控、操作子、弱化子、葡萄糖效應(yīng)(降解物抑制作用)。(2)lac操縱子中的其它問題,trp操縱子弱化機(jī)制的實驗依據(jù),trp操縱子的其它調(diào)控機(jī)制,雙啟動子的生理功能。(3)
依據(jù)表達(dá)模式蛋白質(zhì)的分類,原核生物基因表達(dá)的特點,原核生物基因表達(dá)調(diào)控的表現(xiàn),原核生物基因表達(dá)調(diào)控的類型與特點,乳糖操縱子、色氨酸操縱子組成及基因調(diào)控的機(jī)制。(4)
轉(zhuǎn)錄水平上的其它調(diào)控方式,轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。(5)
其它操縱子。2.重、難點提示重點:(1)
原核生物基因表達(dá)調(diào)控的類型與特點。(2)
乳糖操縱子、色氨酸操縱子基因調(diào)控的機(jī)制。難點:(1)
乳糖操縱子。(2)
色氨酸操縱子基因調(diào)控的機(jī)制。(3)
阿拉伯糖操縱子。第八章基因的表達(dá)與調(diào)控(下)-真核基因表達(dá)調(diào)控一般規(guī)律(9學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)genefamily,基因擴(kuò)增,基因重排,順式作用元件,反式作用因子。(2)
真核生物基因結(jié)構(gòu)與轉(zhuǎn)錄活性的影響,蛋白質(zhì)磷酸化對基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控,蛋白質(zhì)乙?;瘜虮磉_(dá)的影響,激酶與熱激蛋白對基因表達(dá)的影響。(3)
真核生物基因表達(dá)調(diào)控的特點以及調(diào)控的類型。(4)
真核基因轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要組成,增強(qiáng)子對轉(zhuǎn)錄的影響。(5)
反式作用因子DNA結(jié)合域的5種常見結(jié)構(gòu)及特點,RNA的加工成熟和翻譯水平的基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制。2.重、難點提示重點:(1)
真核基因轉(zhuǎn)錄機(jī)器的主要組成。(2)
反式作用因子DNA結(jié)合域的5種常見結(jié)構(gòu)及特點。(3)RNA的加工成熟和翻譯水平的基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制。難點:RNA的加工成熟和翻譯水平的基因表達(dá)調(diào)控的機(jī)制。第九章疾病與人類健康(1學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容本章內(nèi)容與先修學(xué)科微生物學(xué)有大量重復(fù),定性為自學(xué);相關(guān)內(nèi)容穿插在其他章節(jié)中講述。2.重、難點提示重點:基因治療的主要途徑,用于基因治療的病毒載體應(yīng)具備的基本條件。難點:癌基因的類型,基因治療的主要途徑,用于基因治療的病毒載體應(yīng)具備的基本條件,目前基因治療中常用的非病毒載體。第十章基因與發(fā)育(1學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容本章內(nèi)容與先修學(xué)科遺傳學(xué)有大量重復(fù),定性為自學(xué);相關(guān)內(nèi)容穿插在其他章節(jié)中講述。2.重、難點提示重點:免疫體系發(fā)育及免疫球蛋白基因表達(dá)。難點:免疫體系發(fā)育及免疫球蛋白基因表達(dá)。第十一章基因組與比較基因組學(xué)(2學(xué)時)1.教學(xué)內(nèi)容(1)DNA測序技術(shù)的種類,大規(guī)模DNA序列的拼接,人類基因組計劃的科學(xué)意義,比較基因組學(xué)的應(yīng)用,其它基因組,基因組數(shù)據(jù)的挖掘與分析,基因組數(shù)據(jù)的比較研究。(2)
熒光標(biāo)記物測序法和焦磷酸測序法的原理,鳥槍法測序技術(shù)的原理及優(yōu)缺點。(3)
基因組、基因組學(xué)、功能基因組學(xué)、比較基因組學(xué)、HGP、STS、EST。(4)Sange
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