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文檔簡介
第五節(jié)酶的作用機理一、酶活性中心(activecenter)(一)定義酶活性中心就是酶分子上結(jié)合底物和進行催化反應(yīng)的一定區(qū)域。通常有兩個功能部位:結(jié)合部位(決定專一性)催化部位(決定催化能力)胰凝乳蛋白酶241AAHis57Asp102Ser195酶活性中心特征:1.在酶分子中只占很小一部分;2.酶活性中心是一個三維實體;3.活性中心位于酶分子表面的裂縫中;4.酶活性中心具有柔性。酶其它部位對酶活性的貢獻。
(二)研究酶活性中心的方法1.
酶分子側(cè)鏈基團的化學(xué)修飾法2.
X-射線晶體結(jié)構(gòu)分析法3.
定點突變法
二、酶的專一性(一)酶的專一性類型1.結(jié)構(gòu)專一性A.絕對專一性(absolutespecificity)
只作用于一種底物。
B.相對專一性(relativespecificity)
基團專一性(groupspecificity)
鍵專一性(bondspecificity)2.立體異構(gòu)專一性(stereospecificity)L-氨基酸氧化酶酵母醇脫氫酶(二)幾種蛋白酶的專一性氨肽酶:水解蛋白質(zhì)肽鏈氨基末端的肽鍵羧肽酶:水解蛋白質(zhì)肽鏈羧基末端的肽鍵胃蛋白酶:水解芳香族氨基酸或其他疏水氨基酸殘基氨基端肽鍵。胰蛋白酶:水解堿性氨基酸殘基羧基端肽鍵.胰凝乳蛋白酶:水解芳香族氨基酸或其它具有大的疏水側(cè)鏈氨基酸(Met)殘基羧基端肽鍵。(三)酶的專一性假說1.鎖鑰學(xué)說(Lockandkey)Fisher1894
強調(diào)酶和底物結(jié)構(gòu)(幾何形狀)上的互補性.Fischer鎖與鑰匙學(xué)說:
2.誘導(dǎo)契合(inducedfit)Koshland(1958):酶與底物結(jié)合時,受底物誘導(dǎo)發(fā)生構(gòu)象變化,酶分子上的功能基團進行適宜排列,酶與底物互補契合,進行反應(yīng)。要點:酶分子活性中心不是剛性的,而是具有可塑性。酶在底物的誘導(dǎo)下,產(chǎn)生與底物互補的構(gòu)象。
三、影響酶催化效率的有關(guān)因素底物與酶的鄰近效應(yīng)(proximity)及定向效應(yīng)(orientation)2.底物的形變(distortion)與誘導(dǎo)契合(induced-fit)廣義酸基團廣義堿基團(質(zhì)子供體)(質(zhì)子受體)
His上的咪唑基是酶的酸堿催化作用中最活潑的一個催化功能基團。3.酸堿催化(acid-basecatalysis)
4.共價催化(covalentcatalysis)
通過親核反應(yīng)或親電子反應(yīng),酶和底物形成不穩(wěn)定的共價中間復(fù)合物,降低反應(yīng)活化能,使反應(yīng)加速。親電基團:金屬離子親核基團:咪唑基,巰基,羥基5.金屬離子催化6.多元催化和協(xié)同效應(yīng)7.活性中心疏水微環(huán)境的作用四、酶催化反應(yīng)機制的實例(一)胰凝乳蛋白酶Chymotrypsin(EC3.4.4.5)分子量25kDa。由三個多肽鏈通過兩個二硫鍵連接。分子大?。?14040A.。有多個反平行-折
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