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文檔簡介
第四講損傷突變與修復(fù)演示文稿當(dāng)前1頁,總共60頁。優(yōu)選第四講損傷突變與修復(fù)當(dāng)前2頁,總共60頁。DNA的損傷、修復(fù)和突變
廣義的修復(fù)系統(tǒng):
?DNA聚合酶的校對(duì)功能(復(fù)制的范疇)?尿嘧啶-N-糖苷酶修復(fù)系統(tǒng)(復(fù)制時(shí)U的滲入、C脫氨氧化成U)?錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)?損傷修復(fù)系統(tǒng)(光復(fù)活、重組修復(fù)、SOS修復(fù)等)
★限制修飾系統(tǒng)-----對(duì)付外源DNA的入侵當(dāng)前3頁,總共60頁。4.1
復(fù)制過程中的錯(cuò)配的修復(fù)
DNAmismatch+-----A------------C---DNApol(ξ=10-8)經(jīng)第二次校正ξ=10-11錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)(MRSMismatchRepairSystem)1、錯(cuò)配修復(fù)堿基來源:校正活性所漏校的堿基使復(fù)制的保真性提高102~103倍當(dāng)前4頁,總共60頁。2、錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)(Mismatchrepairsystem)DNApolymeraseHelicaseSSB外切核酸酶(Ⅰ和Ⅶ)連接酶MCE(mismatchcorrectenzyme)3subunitsmutH,L,SdamgeneDNA腺嘌呤甲基化酶(m6A甲基化酶)掃描新生鏈中錯(cuò)配堿基識(shí)別新生鏈中非m6A的GATC序列酶切含錯(cuò)配堿基的新生DNA區(qū)段
(1)組成當(dāng)前5頁,總共60頁。★DNA合成過程中的甲基化變化DNA中的GATC(palindromicseq.)為m6A甲基化敏感位點(diǎn)平均每2kb左右有一GATCseq.錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)受甲基化的引導(dǎo)當(dāng)前6頁,總共60頁。
甲基化程度的差異a、MutH/MutS掃描識(shí)別錯(cuò)配堿基和鄰近的GATC序列切點(diǎn)--甲基化GATC中
G的5’側(cè)DNAhelicaseII,SSB,exonucleaseI去除包括錯(cuò)配堿基的片段DNApolymeraseIII和
DNAligase填充缺口昂貴的代價(jià)用于保證DNA的準(zhǔn)確性(2)修復(fù)過程當(dāng)前7頁,總共60頁。外切核酸酶Ⅰ切割切點(diǎn)的5’端(錯(cuò)配堿基在切點(diǎn)的5’端)
---------Ⅶ----------3’端(----------------3’端)當(dāng)前8頁,總共60頁。3、尿嘧啶-N-糖苷酶系統(tǒng)(ungsystem
)修復(fù)尿嘧啶的來源:dUTP的滲入胞嘧啶的自發(fā)脫氨氧化當(dāng)前9頁,總共60頁。---TAGC------ATCG------TAGC------ACG---U---TAGC---ung-ase
①GCUAU---TAGC------ACG---AP內(nèi)切酶(Apurinase)②---TAGC------ATCG---DNApolLigase
③當(dāng)前10頁,總共60頁。4.2DNA損傷的修復(fù)一、嘧啶二聚體的產(chǎn)生
類型:TT二聚體()、CC二聚體()、
CT二聚體()TTCCCT相鄰的胸腺嘧啶胸腺嘧啶二聚體CCCCCCCC當(dāng)前11頁,總共60頁。當(dāng)前12頁,總共60頁。PR1、光復(fù)活(photoreactivation)----TT--------AA--------TT--------AA--------TT--------AA--------TT--------AA----
復(fù)制前、不容易出錯(cuò)可見光激活
二、二聚體修復(fù)的機(jī)制400nm藍(lán)光、PR酶
(photo-reactivationenzyme)
光敏裂合酶(photolyase)當(dāng)前13頁,總共60頁。堿基切除修復(fù)2.切除修復(fù)Exision—Repair
復(fù)制前進(jìn)行不易出錯(cuò)UvrA,B,Cgene
內(nèi)切核酸酶(Endonucleases)外切核酸酶(Exonuclease)
DNApolLigase核苷酸切除修復(fù)核苷酸切除修復(fù)當(dāng)前14頁,總共60頁。下頁上頁ABABCABCABCAB螺旋酶Pol?
螺旋酶連接酶切補(bǔ)切封當(dāng)前15頁,總共60頁。3.重組修復(fù)(Recombinative—Repair)后復(fù)制修復(fù)、E.coli的挽回系統(tǒng)E.coli
存活%U.V計(jì)量w.t.UvrA+RecA+
uvra-reca-該系統(tǒng)存在的實(shí)驗(yàn)證據(jù)當(dāng)前16頁,總共60頁。★Rec-A.gene
以某種方式參與DNA損傷修復(fù)?Rec修復(fù)系統(tǒng)比切除修復(fù)系統(tǒng)更有效
目前知道
?Uvr系統(tǒng)負(fù)責(zé)切除二聚體?Rec系統(tǒng)負(fù)責(zé)消除沒有被切除的二聚體可能造成的后果當(dāng)前17頁,總共60頁?!衽cRec-A蛋白引起的重組(strandtransfer)有關(guān)●TTdimer未被修復(fù),僅表現(xiàn)在后代群體中TTdimer
濃度的稀釋●鏈的非準(zhǔn)確轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致突變機(jī)率的增加修復(fù)相關(guān)機(jī)制:當(dāng)前18頁,總共60頁。
重組修復(fù)
(鏈轉(zhuǎn)移修復(fù))
復(fù)制后修復(fù)容易出錯(cuò)RecA,DNApolymeraeligase二聚體后起始RecA
聚合酶、連接酶重組修復(fù)后的損傷位點(diǎn)可由其它機(jī)制進(jìn)一步修復(fù)當(dāng)前19頁,總共60頁。4.易錯(cuò)修復(fù)(SOS修復(fù)SOSrepair)E.coliE.coliE.coliλ8010100mut.100%50%10%
損壞的噬菌體DNA在E.coliA被修復(fù)
E.coli
的SOS修復(fù)能被U.V.誘導(dǎo)(A&B)SOS修復(fù)過程有非常高的突變頻率(易出錯(cuò))ABCUV復(fù)活或W復(fù)活(JeanWeigh)(1)實(shí)驗(yàn)證據(jù)當(dāng)前20頁,總共60頁。(2)SOS修復(fù)機(jī)制SOS修復(fù)--無模板指導(dǎo)的DNA復(fù)制
大劑量的紫外線照射,大量的二聚體產(chǎn)生SOS系統(tǒng)誘導(dǎo),錯(cuò)誤潛伏的復(fù)制超越二聚體而進(jìn)行錯(cuò)誤堿基當(dāng)前21頁,總共60頁。
SOS修復(fù)只是SOS反應(yīng)的一部分RecA在SOS反應(yīng)反應(yīng)中起核心作用RecA與LexA組成調(diào)控環(huán)路DNA損傷
SOSRecA受LexA的部分抑制當(dāng)前22頁,總共60頁。RecA-P;三種功能a、DNA重組活性b、與S.S.DNA結(jié)合活性c、少數(shù)蛋白的proteinase活性當(dāng)DNA正常復(fù)制時(shí)(無復(fù)制受阻,無DNA損傷,無TTdimer)RecA-p不表現(xiàn)proteinase活性當(dāng)前23頁,總共60頁。當(dāng)DNA復(fù)制受阻/DNAdamaged細(xì)胞內(nèi)原少量表達(dá)的RecA-p與S.S,DNA結(jié)合激活RecA-p的proteinase活性修復(fù)損傷LexA-p降解RecA-p高效表達(dá)SOSopen當(dāng)前24頁,總共60頁。當(dāng)DNA復(fù)制度過難關(guān)后SOSrepair是一種錯(cuò)誤傾向性極強(qiáng)的修復(fù)機(jī)制是進(jìn)化中形成的“竭盡全力,治病救人”的措施(正常狀態(tài)下,SOS是關(guān)閉的)RecA-p很快消失LexAgeneonSOSoff當(dāng)前25頁,總共60頁。1、限制-修飾現(xiàn)象(restrictionandmodificaion)50年代初Luria(T偶數(shù)噬菌體)Bertani(λ)
Weigle(P2噬菌體)4.3
限制和修飾當(dāng)前26頁,總共60頁。結(jié)論:?菌體限制修飾系統(tǒng)中的限制性內(nèi)切酶能將外來DNA切斷?菌體本身的DNA可受甲基化酶的保護(hù)
兩者稱為限制-修飾作用
*E.coliK菌株和B菌株各有自己的限制修飾系統(tǒng)*E.coliC菌株沒有細(xì)菌借助于限制-修飾系統(tǒng)來區(qū)別自己DNA和外源DNA當(dāng)前27頁,總共60頁。
自己DNA:限制模式相同的DNA
同株系的不同個(gè)體DNA、寄生于其中的質(zhì)粒和噬菌體居民DNA(residentDNA):同一個(gè)細(xì)胞內(nèi)的不同類型的DNA,包括細(xì)胞DNA,質(zhì)粒DNA,噬菌體DNA等當(dāng)前28頁,總共60頁。2、限制-修飾系統(tǒng)
根據(jù)其特征分為兩大組(三大類)當(dāng)前29頁,總共60頁。
●
染色體突變(Chromosomemutation
)chromosomenumber
chromosomestructure
●核苷酸突變(dNtpointmutation)
突變(mutation):可以通過復(fù)制而遺傳的DNA結(jié)構(gòu)的任何永久性改變遺傳狀態(tài)4.4
突變類型當(dāng)前30頁,總共60頁。
突變體(mutant):攜帶突變的生物個(gè)體或群體或株系
突變基因(mutantgene):存在突變位點(diǎn)的基因野生型基因(wildtypegene):表示方法表現(xiàn)型Arg+Arg-
基因型arg+arg-
野生型正性狀當(dāng)前31頁,總共60頁。1、從突變作用來源上定義自發(fā)突變--自然界的突變劑或偶然復(fù)制錯(cuò)誤誘變--人為使用突變劑★
堿基異構(gòu)式引起DNA復(fù)制過程的錯(cuò)誤-----自發(fā)突變
堿基異構(gòu)式
A(amino氨基)A(imino亞氨基)
C(a)C(i)
G(keto酮式)G(enol烯醇式)
G(k)
G(e,i)
T(keto)
T(enol-2’)orT(enol-4’)
當(dāng)前32頁,總共60頁。堿基異構(gòu)式引起DNA復(fù)制的錯(cuò)配
G(k)C(a)
正確配對(duì)A(a)
T(k)
錯(cuò)誤配對(duì)G(k)
T(e)
A(a)
C(i)
A(i,anti)A(a,syn)A(i,anti)G(k,syn)
G(e,i,anti)G(k,syn)G(e,i,anti)A(a,syn)
A(i)
C(a)
G(e)
T(k)
當(dāng)前33頁,總共60頁。A(a)
T(k)
A(a,anti)
T(k,anti)
C(i)
C(a,anti)
A(a)
A(i,anti)
堿基異構(gòu)式引起DNA的錯(cuò)配突變
C(i)
C(a)G(k,syn)
G(k,syn)
G(k,anti)G(k)當(dāng)前34頁,總共60頁。2、從序列改變多少上定義單點(diǎn)突變(pointmutation)(點(diǎn)突變)
多點(diǎn)突變(multiplemutation)點(diǎn)突變---堿基替代、堿基插入、堿基缺失●堿基替代(conversion)轉(zhuǎn)換(transition)PyPy
PuPu
顛換(transvertion)
PyPu
當(dāng)前35頁,總共60頁?!窈塑账崛笔Щ虿迦耄╠Ntdeletionorinsertion
)=3xdNt
±nxAminoacid
=3xdNt
移框(Framshift
)
移框突變(frameshiftmutation):一個(gè)或兩個(gè)堿基的插入或缺失,或扁平堿性染料分子插入,又叫移碼突變3、從對(duì)閱讀框的影響上定義當(dāng)前36頁,總共60頁。Examplesofdeletionmutations
當(dāng)前37頁,總共60頁。4、從對(duì)遺傳信息的改變上定義(點(diǎn)突變)同義突變:沒有改變產(chǎn)物氨基酸序列的密碼子錯(cuò)義突變:堿基序列的改變引起了氨基酸序列的改變(中性突變、滲漏突變)無義突變:堿基的改變使代表某種氨基酸的密碼子變?yōu)榈鞍缀铣傻慕K止密碼子●堿基替代對(duì)遺傳信息的改變
---同義突變
GAA→GAGGlu當(dāng)前38頁,總共60頁。---錯(cuò)義突變
GAA→AAALys---無義突變
GAA→TAA(stop)
無義突變類型UAA(Oc)赭石型(Ocher)UAG(Am)琥珀型(amber)UGA(Opal)乳石型(Opal)當(dāng)前39頁,總共60頁。5、從突變的表達(dá)類型上定義---非條件型突變:
---條件型突變:
突變的表現(xiàn)=突變基因型+誘導(dǎo)條件
(光,溫敏感不育)
6、從突變效應(yīng)上定義正向突變回復(fù)突變:使突變體所失去的野生型性狀得到恢復(fù)的第二次突變真正的原位回復(fù)突變很少大部分為第二點(diǎn)的回復(fù)突變----抑制突變當(dāng)前40頁,總共60頁。7、突變位點(diǎn)存在于負(fù)責(zé)基因調(diào)控的序列中
*
在啟動(dòng)子區(qū)域時(shí):
啟動(dòng)子上升突變:增強(qiáng)啟動(dòng)子對(duì)轉(zhuǎn)錄的發(fā)動(dòng)作用的突變啟動(dòng)子下降突變:*在操作子上或調(diào)節(jié)基因上組成型突變:產(chǎn)生組成型表達(dá)方式的操作子突變或調(diào)節(jié)基因的突變突變的操作子不能被阻遏蛋白所識(shí)別調(diào)節(jié)基因突變不能產(chǎn)生有活性的阻遏蛋白
兩者之一都使結(jié)構(gòu)基因失去了負(fù)向控制
當(dāng)前41頁,總共60頁。1、抑制突變發(fā)生的部位基因內(nèi)抑制突變:抑制突變發(fā)生在正向突變的基因中基因間抑制突變:抑制突變發(fā)生在正向突變基因外的其它基因中wildtypemutant(表現(xiàn)型)正向突變(lowF.)回復(fù)突變(verylowF.正向的1/10)4.5回復(fù)突變(抑制突變)當(dāng)前42頁,總共60頁。間接抑制突變:不恢復(fù)正向突變基因蛋白質(zhì)產(chǎn)物的功能,而是通過改變其它蛋白質(zhì)的性質(zhì)或表達(dá)水平而補(bǔ)償原來突變?cè)斐傻娜毕?從而恢復(fù)野生型2、野生表型恢復(fù)作用的性質(zhì)直接抑制突變:通過恢復(fù)或部分恢復(fù)原來突變基因產(chǎn)物蛋白質(zhì)的功能而恢復(fù)野生表型當(dāng)前43頁,總共60頁。
3、回復(fù)突變的分子機(jī)制a)AGC(Ser)ACC(Thr)AGC(Ser)b)AGC(Ser)AGG(Arg)AGT(Ser)c)AGC(Ser)AGG(Arg)GGG(Gly)ifSer≈Gly當(dāng)前44頁,總共60頁。
(1)基因內(nèi)抑制突變(Intragenicsuppression)第二位點(diǎn)引起的基因內(nèi)校正密碼子間兩次錯(cuò)義突變的互補(bǔ)4、抑制突變的分子機(jī)制錯(cuò)義突變移框突變錯(cuò)義突變?cè)斐梢吧捅硇偷膯适В糠衷蛟谟谟绊懙降鞍踪|(zhì)的空間結(jié)構(gòu)(正負(fù)電荷、疏水作用)當(dāng)前45頁,總共60頁。a、靜電作用當(dāng)前46頁,總共60頁。b、疏水作用當(dāng)前47頁,總共60頁。---UGG174----------GGA210---(w.t.)(K)(G)回復(fù)突變(C)
(G)----UGG174-----------GGA210--------UGG174----------GGA210--------UGC174-----------GAA210----活性結(jié)構(gòu)無活性結(jié)構(gòu)CA無活性結(jié)構(gòu)
(K)(E)當(dāng)前48頁,總共60頁。
移框突變的抑制突變(基因內(nèi)第二點(diǎn)的插入或缺失)當(dāng)前49頁,總共60頁。(2)基因間的抑制突變無義突變---無義抑制突變錯(cuò)義突變---錯(cuò)義抑制突變移框突變---移框抑制突變
發(fā)生在
tRNA基因或與tRNA功能相關(guān)的基因上當(dāng)前50頁,總共60頁。a、基因間的無義抑制突變(Nonsensesuppressor)野生型UAG、UGA、UAA---三種無義抑制50%赭石型無義抑制tRNA產(chǎn)生的幾率很低,且抑制效率很低當(dāng)前51頁,總共60頁。AGAUCUArgGlyGGACCUUCUGlyCCUGlyb、基因間的錯(cuò)義抑制突變(Missensesuppressor)Gly當(dāng)前52頁,總共60頁。c、基因間移框抑制突變總結(jié):基因內(nèi)和基因間的錯(cuò)義(無義)、移框抑制突變均由相應(yīng)的錯(cuò)義(無義)、移框突變抑制當(dāng)前53頁,總共60頁。本節(jié)小結(jié)基因內(nèi)的抑制突變基因間的抑制突變直接抑制突變間接抑制突變分子機(jī)制基因內(nèi)的抑制突變基因間的抑制突變錯(cuò)義無義移碼錯(cuò)義移碼當(dāng)前54頁,總共60頁。1、堿基類似物(Baseanalog)2-氨基嘌呤2-Aminopurine5-溴尿嘧啶5-BromineUracilOOBrNH24.6突變劑和突變生成當(dāng)前55頁,總共60頁。5-BrU:G:A
烯醇式enolBrOHHOBr
酮式KetoHOAGCTTCCTATCGAAGGATAGCTBCCTATCGAAG
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