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W細(xì)胞分化與基因表達(dá)調(diào)控第1頁/共64頁2.細(xì)胞分化特點(diǎn):①細(xì)胞分化是穩(wěn)定單向演變的,一般來說是不會(huì)逆轉(zhuǎn)的;②分化的方向和程序都是預(yù)見確定的,例鱗翅目,雙翅目昆蟲的變態(tài)發(fā)育,幼蟲體節(jié)中有不同的成蟲盤(or稱器官芽)人工誘發(fā)使果蟲蠅某個(gè)成蟲盤突變,羽化后將出現(xiàn)某種organ畸變,如“觸角足”,現(xiàn)已知成蟲盤的細(xì)胞分化由一系列的“同源異源盒型基因”hemeobox基因Hoxs調(diào)控。③細(xì)胞生理狀態(tài)常隨分化程度而改變:例分化程度增多,對(duì)電離輻射的耐受能力亦增強(qiáng)。第2頁/共64頁二、細(xì)胞分化中發(fā)育潛能變化:
1.
發(fā)育潛能的演變規(guī)律:多能干細(xì)胞→單能干細(xì)胞→終末分化細(xì)胞。全能性(totipotenuy)→多能性(pluripotercy)→單能性(rwonopoency)。動(dòng)物個(gè)體發(fā)育中隨著細(xì)胞分化程度深入使其發(fā)育潛能逐漸變窄,變專一性。例成熟紅細(xì)胞是高度分化,是發(fā)育到盡頭了,因此稱為終端分化細(xì)胞or稱特化細(xì)胞。第3頁/共64頁
2.發(fā)育潛能演變機(jī)制的探討:weismann根據(jù)馬蛔蟲及小麥,癭蚊胚胎中發(fā)現(xiàn)chr消減現(xiàn)象(chromosomediminutin),提出“體細(xì)胞分化是由于遺傳特質(zhì)丟失造成的,每一種組織只保留了其專有遺傳物質(zhì)”的學(xué)術(shù)觀點(diǎn)。20世紀(jì)60-70年代,植物組織體外培養(yǎng)能發(fā)育成完整植株,證實(shí)高度分化的植物組織細(xì)胞仍keep全能性,亦證明,細(xì)胞分化過程中并沒有丟失遺傳物質(zhì)。3.發(fā)育潛能與動(dòng)物克?。篶lone:無性繁殖系 cloning無性繁殖(純系)方式第4頁/共64頁三、胞核移植證實(shí)了animal特化細(xì)胞的細(xì)胞核,仍保持全能性:
動(dòng)物成體上高度分化細(xì)胞整體已不具備全能性,但其細(xì)胞核仍保持有該物種遺傳特性必須的全套基因組,即細(xì)胞核仍具有全能性的遺傳基礎(chǔ)。2個(gè)有關(guān)的認(rèn)識(shí)論難點(diǎn):①既然動(dòng)物特化細(xì)胞的細(xì)胞核仍保持有全能性,那么為什么說動(dòng)物的發(fā)育潛能都是隨著細(xì)胞分化的深入而越變?cè)秸??②既然?dòng)物特化細(xì)胞的細(xì)胞核仍保持著全能性,那么又為什么動(dòng)物特化細(xì)胞的整體卻表現(xiàn)為喪失了全能性呢?第5頁/共64頁四、細(xì)胞分化與基因時(shí)空表達(dá):
1.差別基因表達(dá)和基因時(shí)空表達(dá):同一個(gè)體中不同組織(tissue)細(xì)胞進(jìn)行細(xì)胞分化的進(jìn)程與方向的決定,歸根結(jié)底就是在于嚴(yán)格按照一定的遺傳程序發(fā)生了差別基因表達(dá)。·管家基因(housekeeping基因);·奢侈基因(huxury基因)—組織特異性基因。通常結(jié)構(gòu)基因都是受著嚴(yán)格的時(shí)空表達(dá)調(diào)控,從而導(dǎo)致基因組完成相同的不同組織細(xì)胞的顯形(phenotype)上發(fā)生差異變化,引起細(xì)胞分化,這被稱為差別基因表達(dá)(differentialgeneexpress)。e.g.:成人血紅蛋白是22,胚胎是22,胎兒是2r2。
第6頁/共64頁這種基因時(shí)空表達(dá)調(diào)控的實(shí)質(zhì),是由有限的少量調(diào)控蛋白以組合調(diào)控方式來順序啟動(dòng)眾多特異細(xì)胞的分化,即關(guān)鍵調(diào)控蛋白先啟動(dòng)部分特異基因的表達(dá)(express),誘導(dǎo)部分細(xì)胞分化,而被啟動(dòng)的基因表達(dá)產(chǎn)物又成為其他基因的調(diào)控啟動(dòng)因子,從而誘導(dǎo)更多的細(xì)胞走向分化,最終由這種級(jí)聯(lián)方式啟動(dòng)分化構(gòu)成有序的三維細(xì)胞群體,導(dǎo)致了器官(organ)形成,e.g.:對(duì)果蠅眼基因轉(zhuǎn)導(dǎo)入早期發(fā)育細(xì)胞,居然誘導(dǎo)其腿部形成了眼。理論推算,n個(gè)調(diào)控蛋白的組合調(diào)控可級(jí)聯(lián)啟動(dòng)2n個(gè)分化細(xì)胞類型。
第7頁/共64頁2.細(xì)胞分化程度與基因時(shí)空表達(dá)的關(guān)系:
高度分化細(xì)胞:盡管其細(xì)胞核中仍具有完整的基因,但依照基因時(shí)空表達(dá)的程序表,它還能發(fā)生差別基因表達(dá)的可能性已極少了。所以該特化細(xì)胞的發(fā)育潛能已變得十分有限了。
第8頁/共64頁五、細(xì)胞質(zhì)在細(xì)胞分化中的重要作用:
1.動(dòng)物特化細(xì)胞全能性喪失的原因:細(xì)胞全能性——細(xì)胞核全能性+細(xì)胞質(zhì)全能發(fā)育base眾多試驗(yàn)證明了動(dòng)物特化細(xì)胞本身的細(xì)胞質(zhì)是喪失了發(fā)育潛能的,只有細(xì)胞核移植到具有全能性發(fā)育潛能的卵細(xì)胞質(zhì)中,才有了能實(shí)現(xiàn)整個(gè)雜交細(xì)胞的全能性,這就是該問題的癥結(jié)。第9頁/共64頁2.動(dòng)物卵細(xì)胞質(zhì)對(duì)細(xì)胞分化的調(diào)控胚胎學(xué)家發(fā)現(xiàn)受精卵中,從動(dòng)物極到植物極之間的卵細(xì)胞質(zhì)呈現(xiàn)分區(qū)現(xiàn)象,其中物質(zhì)的不均一性決定了隨后卵裂細(xì)胞的不同分化命運(yùn)?!Q定子 ·性細(xì)胞決定子生殖質(zhì)、極質(zhì)3.細(xì)胞分化決定子的分子性質(zhì):細(xì)胞分化決定子實(shí)質(zhì)是來源于母體的遺傳調(diào)控。信息是貯存在成熟卵母細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)中的多種類型的隱蔽mRNA(maskedmRNA)(大量存在多copy)。第10頁/共64頁4.隱蔽mRNA的特點(diǎn):是早在受精之前的卵母細(xì)胞階段轉(zhuǎn)錄合成而貯存;貯存中的隱蔽mRNA無活性(與蛋白質(zhì)結(jié)合,以RNP存在,無活性)受精引起胞內(nèi)的Na+濃度改變,誘導(dǎo)隱蔽mRNA激活;各種類型的maskedmRNA在卵細(xì)胞質(zhì)中是不均一分布的定位貯存,所以卵裂后不同子細(xì)胞的細(xì)胞分化方向也各有不同,顯然決定細(xì)胞分化方向的初始信息儲(chǔ)存于卵細(xì)胞中,卵裂后的各個(gè)細(xì)胞所攜帶信息已開始有所不同,這種差別又通過胚胎細(xì)胞誘導(dǎo)作用,旁分泌信號(hào)分子(細(xì)胞生長分子因子)對(duì)其他細(xì)胞產(chǎn)生級(jí)聯(lián)效應(yīng),信息被不斷修飾成為精細(xì)復(fù)雜的分化指令,最終指導(dǎo)產(chǎn)生分化各異的細(xì)胞type。第11頁/共64頁六、細(xì)胞之間相互作用對(duì)細(xì)胞分化的影響:1.細(xì)胞位置效應(yīng),群體效應(yīng),其分化與所處位置有關(guān)聯(lián);2.胚胎誘導(dǎo);3.激素對(duì)細(xì)胞分化的調(diào)控。eg1蛙的幼體發(fā)育變態(tài)(甲狀腺素)eg2昆蟲幼蟲→蛹→成蟲的變態(tài)發(fā)育(保幼,脫皮激素)七、環(huán)境與細(xì)胞分化的影響:新生嬰兒表現(xiàn)的各種type的先天畸形,其病因約只有10%左右是因遺傳因素,而其余的則是因環(huán)境因素or是因環(huán)境與遺傳共同作用所致,涉及的環(huán)境因素有:營養(yǎng)脅迫,瘟疫、病原菌傳染,有毒化學(xué)物質(zhì)、射線輻射等。致畸的關(guān)鍵敏感時(shí)期是懷孕頭三個(gè)月。第12頁/共64頁
八、再生現(xiàn)象(植物及低等動(dòng)物):蚯蚓等再生能力較強(qiáng),再生現(xiàn)象實(shí)質(zhì)也是細(xì)胞分化的一種特殊形式。1.再生是來源于創(chuàng)傷面的去分化細(xì)胞:去分化(dedifferentiation),再分化(redifferentiation)。2.再生現(xiàn)象的啟示:某些動(dòng)物細(xì)胞在特定條件下,某細(xì)胞分化是可能逆轉(zhuǎn),即由終端分化→去分化→再分化。第13頁/共64頁
九、克隆動(dòng)物研究的意義(人為條件下的再生):1.首次證實(shí)了哺乳動(dòng)物成體的特化細(xì)胞的細(xì)胞核仍保持有發(fā)育全能性,英國Roshin研究所嘗試以成體乳腺細(xì)胞的細(xì)胞核移植來探索clone動(dòng)物這種無性繁殖途徑的研究背景及研究目的是為了用此技術(shù)來擴(kuò)展轉(zhuǎn)基因動(dòng)物的生物學(xué)效應(yīng)。2.首次成功證實(shí)了哺乳動(dòng)物特化細(xì)胞的發(fā)育潛能是有可能在人為條件下發(fā)生逆轉(zhuǎn)分化的,并探索了實(shí)現(xiàn)去分化——再分化的實(shí)驗(yàn)技術(shù)?!ひ岳漯囸I休克處理法,使供核細(xì)胞進(jìn)入Go期狀態(tài),實(shí)現(xiàn)去分化?!ひ噪娒}沖融合法,激活移植卵啟動(dòng),實(shí)現(xiàn)再分化。第14頁/共64頁3.證實(shí)了動(dòng)物clone并不是100%的復(fù)制,clone≠copy:
“A”親本是細(xì)胞核供詳,“B”親本是“卵細(xì)胞質(zhì)受體”,“C”親本是供胚胎發(fā)育的子宮環(huán)境的“代理母親”。4.顯示出clone動(dòng)物技術(shù)的可應(yīng)用范圍尚待深入考察:
“多莉”單clone的未老先衰的現(xiàn)象,證實(shí)了端粒DNA序列消減速率控制著細(xì)胞的衰老速率。第15頁/共64頁第二節(jié)癌細(xì)胞在致癌因子作用下,某些細(xì)胞發(fā)生轉(zhuǎn)化,不再進(jìn)行正常分化和衰亡,而造成了不受調(diào)控的惡性增殖細(xì)胞,即癌細(xì)胞(cancer細(xì)胞),實(shí)質(zhì)是分化程序異常的細(xì)胞。第16頁/共64頁一、癌細(xì)胞的主要特征:1.無限增殖;2.喪失接觸抑制性能;3.癌細(xì)胞之間粘著性減弱,其侵潤性和擴(kuò)散性,能通過血液循環(huán)和淋巴途徑轉(zhuǎn)換;4.易被外源凝聚素所凝聚,癌細(xì)胞上的外源凝集素受體(糖蛋白質(zhì))數(shù)量增多;5.體外培養(yǎng)時(shí),粘壁性能降低(可懸浮培養(yǎng));6.細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)紊亂,mRNA轉(zhuǎn)錄譜系和蛋白表達(dá)譜系改變(癌細(xì)胞外形,出現(xiàn)變形);7.膜抗原發(fā)生變化(躲避免疫監(jiān)視);8.對(duì)外源性生長因子需求量降低,自分泌(在低血清和無血清培養(yǎng)液中生長)。第17頁/共64頁二、致癌因素:1.物理致癌因子,輻射射線;2.化學(xué)致癌因子,誘變劑;3.生物致癌因子:腫瘤virus:既有DNAvirus,又有RNAvirus,但并非所有病毒致癌?!つ承┥锾烊怀煞趾蜕x產(chǎn)物:蘇鐵青,黃樟素,黃曲霉素,巴豆油,兒茶酚,吡咯烴,生物堿等。第18頁/共64頁三、細(xì)胞癌基因&抑癌基因:
1.癌基因:現(xiàn)已知人類基因組中有近百種細(xì)胞癌基因,or稱原癌基因,這些基因其實(shí)在正常細(xì)胞之中并不起致癌作用,而是與細(xì)胞生長&分化有關(guān)的重要功能基因,但如果有致癌因子誘導(dǎo),造成這些原癌基因被激活,即引起癌基因突變,or在基因前插入強(qiáng)啟動(dòng)子,or是引起了原癌基因的擴(kuò)增,或是引起了原癌基因的染色體區(qū)段發(fā)生了重排,都可能導(dǎo)致這些原癌基因的產(chǎn)物發(fā)生異常表達(dá),從而導(dǎo)致了細(xì)胞癌變。第19頁/共64頁2.抑癌基因與基因突變Ras:
現(xiàn)還已知人類基因組中有另一類型的基因,這類基因具有抑制細(xì)胞癌變特化的作用,被稱為抑癌基因,這類基因也是細(xì)胞中正常的重要基因,但若出現(xiàn)這類基因的2個(gè)等位基因都丟失和失活時(shí)也可以發(fā)生細(xì)胞癌變。抑癌基因是細(xì)胞增殖過程中正常負(fù)調(diào)控因子,其編碼的蛋白質(zhì)在細(xì)胞周期的檢驗(yàn)上起阻止周期進(jìn)程的作用,如果抑癌基因缺失or失活時(shí)則導(dǎo)致細(xì)胞周期失控,過度增殖而發(fā)生細(xì)胞癌變。第20頁/共64頁第三節(jié)基因表達(dá)的調(diào)控基因:是染色體上具有遺傳效應(yīng)的一段DNA序列,為一個(gè)轉(zhuǎn)錄單位,并通過表達(dá)對(duì)表型產(chǎn)生專一性效應(yīng)。基因表達(dá):
DNA編碼的遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄和翻譯轉(zhuǎn)化為特定蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)信息,從而表現(xiàn)出細(xì)胞和生物體的某種遺傳性狀?;虮磉_(dá)的控制:任何影響轉(zhuǎn)錄和翻譯過程的啟動(dòng),關(guān)閉和速率的因素及其作用稱作基因表達(dá)的控制。第21頁/共64頁
一、轉(zhuǎn)錄前水平的調(diào)控:通過改變DNA序列和染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)來影響基因表達(dá)的過程。(一)染色質(zhì)丟失:某些原生動(dòng)物,線蟲和甲殼類動(dòng)物在個(gè)體發(fā)育過程中,體細(xì)胞會(huì)發(fā)生染色質(zhì)丟失現(xiàn)象,只有以后分化形成生殖細(xì)胞的部分細(xì)胞才保持完整的基因組。
第22頁/共64頁
例:四膜蟲含一個(gè)大核(營養(yǎng)核)和一個(gè)小核(生殖核),小核為生殖核,無轉(zhuǎn)錄活性,大核由小核發(fā)育而來,在發(fā)育的過程中發(fā)生多處染色質(zhì)斷裂,并刪除大約10%基因組DNA,剩下的基因才成為表達(dá)型基因,表現(xiàn)出轉(zhuǎn)錄的活性。高等真核生物(動(dòng)、植)無基因丟失現(xiàn)象,各類核都具有經(jīng)過去分化和再分化而發(fā)育成完整個(gè)體的潛在能力,即含全部基因,稱核的全能性。第23頁/共64頁(二)基因擴(kuò)增:指細(xì)胞內(nèi)某些特定基因的拷貝數(shù)專一性地大量增加的現(xiàn)象。例如:兩棲類和昆蟲的卵母細(xì)胞,需要1012個(gè)核糖體大量合成蛋白,需要專一性的擴(kuò)增rRNA基因(rDNA)非洲爪蟾體細(xì)胞rDNA有500拷貝,在卵母細(xì)胞期拷貝擴(kuò)增為2百萬個(gè),以滿足胚胎發(fā)育的需要。第24頁/共64頁(三)基因重排:脯乳動(dòng)物可產(chǎn)生106—108種不同的抗體,由B-淋巴細(xì)胞分化期間發(fā)生基因組重建,產(chǎn)生抗體的多樣性??贵w由兩條輕鏈(L)重鏈(H)組成:
Kλ
輕鏈基因片段有四類:L:前導(dǎo)片段
V:可變片段2005J:連接片段
C:恒定片段重鏈基因片段有五類:L:前導(dǎo)片段
V:可變片段200D:多樣性片段12J:連接片段5C:恒定片段8第25頁/共64頁第26頁/共64頁
抗體的基因組有三個(gè)獨(dú)立的多基因族:兩個(gè)編碼輕鏈,一個(gè)編碼重鏈。淋巴細(xì)胞受抗原刺激分化為漿細(xì)胞時(shí),胚原型DNA發(fā)生基因重排表達(dá)型DNA:重鏈基因族先重排:一個(gè)D片段與一個(gè)Jh片段連接,Vh片段與DJh片段連接VhDJh。當(dāng)Vh基因經(jīng)重排連接到恒定區(qū)增強(qiáng)子附近即可開始表達(dá)。
第27頁/共64頁K輕鏈需經(jīng)過Vk、Jk連接,形成可變區(qū),再與Ck片段構(gòu)成有轉(zhuǎn)錄活性的完整K輕鏈基因。如果K輕鏈重排失敗,則λ鏈基因開始重排,而在產(chǎn)生λ鏈的細(xì)胞中,兩個(gè)K位點(diǎn)均已重排過。通常每個(gè)B-細(xì)胞只表達(dá)重鏈或輕鏈的一個(gè)等位基因產(chǎn)物,稱等位基因排斥作用。第28頁/共64頁
基因重排是基因差別表達(dá)的一種控制方式,通過上述的拼接機(jī)制而實(shí)現(xiàn)。如小鼠:重鏈基因重排數(shù):
Vh數(shù)200*D數(shù)12*Jh數(shù)5*V-D接點(diǎn)機(jī)動(dòng)性10*D-J接點(diǎn)機(jī)動(dòng)性10=120萬種。輕鏈基因重排數(shù):
Vk數(shù)200*Jk數(shù)5*V-J接點(diǎn)機(jī)動(dòng)性10=1萬種。重鏈、輕鏈再任意組合能產(chǎn)生108以上種不同的抗體。第29頁/共64頁(四)染色體結(jié)構(gòu)與基因活性:染色體的結(jié)構(gòu)與基因的轉(zhuǎn)錄活性有密切的關(guān)系:
1.
基因失活:活躍轉(zhuǎn)錄的基因全部位于常染色質(zhì)中,處于異染色體中的基因則不表達(dá)。①異染色化:雌性脯乳動(dòng)物有兩條χ染色體,其中一條發(fā)生異染色化而凝聚,所含基因以可遺傳方式失活,在進(jìn)行配子發(fā)生時(shí),又回復(fù)為常染色質(zhì)狀態(tài)。②位置效應(yīng)(擴(kuò)散效應(yīng)):果蠅、小鼠、玉米等生物中,常染色質(zhì)基因由于染色體重排改變位置而處于異染色質(zhì)區(qū)附近時(shí),基因的轉(zhuǎn)錄活化也受到抑制。染色體上的異染色質(zhì)化過程有擴(kuò)增效應(yīng),愈接近異染色質(zhì)區(qū)的基因的位置效應(yīng)愈強(qiáng)。第30頁/共64頁2.染色質(zhì)活化:在活化的過程中,核小體可能被解開,或無核小體結(jié)構(gòu)(如活躍轉(zhuǎn)錄的rRNA基因)。從而使RNA聚合酶能夠轉(zhuǎn)錄染色質(zhì)的DNA。用DNaseI降解,有基因表達(dá)活性的染色質(zhì)DNA比沒有基因表達(dá)活性的染色質(zhì)DNA要敏感很多,說明活化染色質(zhì)對(duì)DNaseI有優(yōu)先敏感性。
第31頁/共64頁DNaseI超敏感位點(diǎn)是100-200bp的DNA序列特異暴露的染色質(zhì)的區(qū)域,是起始轉(zhuǎn)錄的必要條件。調(diào)節(jié)蛋白可識(shí)別并修飾染色質(zhì)的局部區(qū)域,觸發(fā)解聚,使染色質(zhì)變?yōu)槭杷傻摹盎罨毙问?,區(qū)段含數(shù)萬bp的DNA。已暴露的活性染色質(zhì)區(qū)域由調(diào)節(jié)蛋白與基因轉(zhuǎn)錄的順序作用元件相互作用,進(jìn)一步影響基因活性。第32頁/共64頁(五)染色體DNA甲基化和去甲基化與基因活性:動(dòng)物DNA中,2-7%的胞嘧啶C被甲基化修飾,異染色體DNA(衛(wèi)星DNA)明顯。有兩種酶參與修飾:
①維持性甲基化酶:在甲基化DNA模板指導(dǎo)下,使對(duì)應(yīng)部分甲基化。②構(gòu)建性甲基化酶:對(duì)非甲基化的DNA行甲基化修飾。
甲基化主要發(fā)生在CG二核苷酸對(duì):5’……mCpG……3’5’……mCpG……3’3’…..GpCm……..5’3’……GpC………5’
完全甲基化半甲基化第33頁/共64頁限制性內(nèi)切酶:MspⅠ切割CCGG,不論是否甲基化;HpaⅡ只切割未甲基化的CCGG。用上述酶檢測DNA序列,發(fā)現(xiàn)非活躍轉(zhuǎn)錄基因的DNA甲基化程度普遍高于活躍轉(zhuǎn)錄的基因,而甲基化DNA在基因活化后通常伴隨失去許多甲基基團(tuán)。
DNA甲基化對(duì)基因表達(dá)可能有兩種作用:(1)
甲基化影響DNA與蛋白酶的相互識(shí)別與作用;(2)
甲基化影響DNA構(gòu)象,如形成Z-DNA。第34頁/共64頁二、轉(zhuǎn)錄水平上的基因調(diào)控:轉(zhuǎn)錄水平上的基因調(diào)控是真核細(xì)胞基因調(diào)控的主要環(huán)節(jié)。原核生物有操縱子及其緊密連鎖的基因。真核生物的轉(zhuǎn)錄受基因控制的順式作用元件、反式作用因子的各自影響及兩者的相互作用。第35頁/共64頁
(一)基因作用的順式元件(DNA序列所含的控制因子):是兩種DNA序列:
啟動(dòng)子和增強(qiáng)子,與蛋白編碼區(qū)連鎖,被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合。原核只由一種RNA聚合酶催化;
真核由三種RNA聚合酶催化:RNA聚合酶Ⅰ:rRNA(28s,5.8s,18s)前體核仁中合成RNA聚合酶Ⅱ:mRNA核基質(zhì)中合成RNA聚合酶Ⅲ:小RNA(tRNAs,5sRNA,snRNAs)核基質(zhì)中合成
第36頁/共64頁1.啟動(dòng)子:
通過RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子分析,得出啟動(dòng)子共同模式:(1)TATA(識(shí)別)框:位于基因轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游-25附近,富含AT的共有序列(TATAATAAT)。保證轉(zhuǎn)錄精確起始。(2)上游啟動(dòng)子成份(UPE):上游-75附近的CAAT框,共有序列(GGTCCAATCT)及幾百個(gè)bp的啟動(dòng)子成分。能結(jié)合特定的轉(zhuǎn)錄因子,控制轉(zhuǎn)錄起始頻率。第37頁/共64頁2.增強(qiáng)子:
是能夠增強(qiáng)與之相連的基因轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控序列,通過結(jié)合特定的轉(zhuǎn)錄因子或影響DNA構(gòu)象而實(shí)現(xiàn)。位于上游的200bp處包括兩個(gè)72bp的串聯(lián)重復(fù)序列,其作用有三個(gè)顯著的特征:(1)具遠(yuǎn)程效應(yīng),同一條DNA上,在啟動(dòng)子上、下游都可;(2)需要特定的蛋白因子參與;(3)大多數(shù)增強(qiáng)子具有組織特異性,少數(shù)能在各種類型的細(xì)胞中發(fā)揮作用。第38頁/共64頁(二)基因調(diào)控的反式作用因子:是各種基因控制蛋白,作用于順式作用元件的靶位點(diǎn)上(特異核甘酸序列):①.通用轉(zhuǎn)錄因子:結(jié)合在TATA框上,如TFⅡA、TFⅡB等蛋白因子。②.轉(zhuǎn)錄控制因子:結(jié)合在UPE(上游啟動(dòng)子成分)特異核酸序列上的蛋白質(zhì)因子。1.
反式作用因子必備的兩種能力:(1)必需識(shí)別、定位在特殊基因的增強(qiáng)子、啟動(dòng)子和其它調(diào)控元件中的特異性靶序列。(2)要能夠與RNA聚合酶或其它轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合而行使功能。第39頁/共64頁2.反式作用蛋白質(zhì)因子的特點(diǎn):(1)均為球蛋白.以二聚體形式發(fā)生作用,結(jié)合在DNA特異的核甘酸序列上,有些是異源二聚體。(2)這些基因調(diào)控蛋白具有不同的功能區(qū)域:①DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域;②轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域。第40頁/共64頁
類固醇激素受體家族中,受體蛋白能使細(xì)胞通過激活(正調(diào)控)或(負(fù)調(diào)控)特定基因?qū)Ω鞣N脂溶性激素作出應(yīng)答反應(yīng):①這些受體蛋白具有一個(gè)中心DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,約由100個(gè)氨基酸組成,形成一系列鋅指結(jié)構(gòu),負(fù)責(zé)識(shí)別特異DNA序列;②轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域定位在N-末端;③這些固醇類激素受體都含有一個(gè)特定的激素結(jié)合結(jié)構(gòu)域,位于C-末端。第41頁/共64頁(a)反式作用蛋白質(zhì)的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域具有一些典型的結(jié)構(gòu)模式:α-螺旋-轉(zhuǎn)角-α-螺旋;鋅指;亮氨酸拉鏈;螺旋-環(huán)-螺旋;甾化合物和酸滴等結(jié)構(gòu)模式。由100以內(nèi)個(gè)氨基酸組成。(b)基因控制蛋白的轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域一般由20-100個(gè)氨基酸組成,含有許多帶負(fù)電荷的α-螺旋,激活轉(zhuǎn)錄的水平與靜電荷數(shù)有關(guān)。增強(qiáng)凈電荷能提高激活轉(zhuǎn)錄的水平。第42頁/共64頁例:糖皮質(zhì)激素受體的三個(gè)結(jié)構(gòu)域:①結(jié)合DNA結(jié)構(gòu)域;②結(jié)合激素結(jié)構(gòu)域;③激活轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)域。甾類激素進(jìn)入細(xì)胞與受體結(jié)合→受體構(gòu)象改變并被激活→活化的激素-受體復(fù)合物→對(duì)DNA親和力大大增加→進(jìn)入細(xì)胞核后與增強(qiáng)子糖皮質(zhì)激素反應(yīng)元件(GRE)的特異共有序列(GGTACANNNTGTTCT)結(jié)合,激活啟動(dòng)子而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄。第43頁/共64頁(3).有些反式作用蛋白質(zhì)因子經(jīng)物理或化學(xué)因素誘導(dǎo)后才具有活性:如熱誘導(dǎo)、磷酸化、與配基結(jié)合。如果蠅的熱激活轉(zhuǎn)錄因子(HSTF)經(jīng)熱誘導(dǎo)后才能與特異DNA序列結(jié)合而促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。
第44頁/共64頁(4)在基因轉(zhuǎn)錄的控制中涉及很多蛋白質(zhì)與DNA、蛋白質(zhì)之間復(fù)雜的相互作用,激活和阻遏效應(yīng)的綜合影響形成一個(gè)基因控制元件的凈效應(yīng)。環(huán)化學(xué)說:DNA不同位點(diǎn)上結(jié)合的蛋白因子通過DNA形成環(huán)化結(jié)構(gòu)而發(fā)生相互作用,蛋白起作用以調(diào)節(jié)基因的轉(zhuǎn)錄活性。第45頁/共64頁
(5).有些基因調(diào)控蛋白可與幾個(gè)不同序列的DNA結(jié)合位點(diǎn)相結(jié)合。一種順式作用元件又可作為多種反式作用蛋白因子的作用靶位點(diǎn),使基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)具有靈活性。第46頁/共64頁
三、轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控:轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控決定了mRNA種類和數(shù)量,但轉(zhuǎn)錄出的是hnRNA多是前體,需修飾、加工、選擇性拼接和運(yùn)輸,轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控也是重要環(huán)節(jié)。第47頁/共64頁(一)
hnRNA的修飾加工:真核生物細(xì)胞內(nèi)編碼蛋白質(zhì)的基因是以單個(gè)基因?yàn)檗D(zhuǎn)錄單位,且許多編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因是不連續(xù)的基因,有居間序列。DNAhnRNA(核內(nèi)高分子量不均一RNA)修飾加工、選擇性拼接有功能的成熟mRNA選擇性運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞質(zhì)中翻譯成蛋白質(zhì)。
hnRNA的修飾加工:①5’端帽子的形成②3’端附加多聚A尾巴第48頁/共64頁hnRNA和mRNA都有5’端7-甲基鳥嘌呤核苷(m7GpppN)的帽子結(jié)構(gòu)。因甲基化程度不同,帽子在同種,不同種生物的mRNA中都可以不同。加帽過程在轉(zhuǎn)錄終止前以完成。功能:①增加mRNA的穩(wěn)定,保護(hù)其免被5’外切核酸酶的攻擊。②帽子結(jié)構(gòu)為核糖體對(duì)mRNA的識(shí)別提供信號(hào)。第49頁/共64頁mRNA都帶有末端多聚(A)尾巴,是轉(zhuǎn)錄后在3’端由特異性核酸內(nèi)切酶先切除一段,然后由polyA聚合酶完成多聚腺苷化。
PolyA的長度在細(xì)胞核內(nèi)是相當(dāng)一致的,為200~250個(gè)核苷酸。但mRNA到達(dá)細(xì)胞質(zhì)中polyA的長度就不再一致了,變化于30~250之間??赡芘cmRNA從核孔輸出有關(guān)。在hnRNA的加工過程中,hnRNA始終和蛋白質(zhì)形成hnRNP顆粒。
第50頁/共64頁(二)mRNA前體的選擇性拼接:①不連續(xù)基因中的居間序列稱“內(nèi)含子”;②被內(nèi)含子隔開的基因序列稱“外顯子”。都被轉(zhuǎn)錄至hnRNA中,
RNA拼接:切除內(nèi)含子,把外顯子連接起來,產(chǎn)生成熟的mRNA分子:
(5’)外顯子↓GT…內(nèi)含子…AT↓外顯子(3’)
供體拼接點(diǎn)受體拼接點(diǎn)
這是核結(jié)構(gòu)基因普遍存在的序列。第51頁/共64頁內(nèi)含子精確切除需要:①mRNA前體中的特異的識(shí)別信號(hào);②特定因子識(shí)別這些信號(hào)。特定因子可能是核內(nèi)小分子mRNA與Pr.的復(fù)合物snRNP。多為尿嘧啶含量較高的U-snRNP。兩種拼接方式:①組成型拼接:直接去除內(nèi)含子,將外顯子拼接成成熟的mRNA→一種蛋白質(zhì)產(chǎn)物。②可調(diào)控的選擇性拼接:外顯子有多種拼接方式,可產(chǎn)生不同的成熟mRNA→不同的蛋白質(zhì)。第52頁/共64頁
細(xì)胞類型特異性蛋白質(zhì)的合成是真核細(xì)胞分化的重要特征之一,產(chǎn)生蛋白質(zhì)多樣性的分子機(jī)制:①多基因家族中各成員在特定細(xì)胞中,在一定的生理?xiàng)l件下:“選擇性表達(dá)”。(如抗體)②同一基因,原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA通過mRNA前體的“選擇性拼接”而產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。此方法產(chǎn)生一套結(jié)構(gòu)相關(guān),功能相似的蛋白質(zhì),稱“蛋白質(zhì)異形體”。
第53頁/共64頁
(三)mRNA的選擇性運(yùn)輸:運(yùn)至細(xì)胞質(zhì)的成熟mRNA只占核內(nèi)hnRNA總量的1/20,一些基因的轉(zhuǎn)錄活性與其在細(xì)胞中mRNA的拷貝數(shù)不成正比例,生長細(xì)胞與靜止細(xì)胞中的hnRNA轉(zhuǎn)錄速率差不多,但前者細(xì)胞質(zhì)中mRNA的含量和種類比后者要多得多,這些說明細(xì)胞在不同情況下有選擇地將不同的hnRNA加工成mRNA,并將它們運(yùn)到胞質(zhì)。第54頁/共64頁例:海膽的選擇性加工運(yùn)輸:海膽囊胚細(xì)胞中大約有20,000種不同序列的hnRNA:其中有13,000種被加工成mRNA。海膽成體腸細(xì)胞中有25,000種hnRNA,只有3,000種加工成mRNA。第55頁/共64頁四、翻譯和翻譯后加工水平的調(diào)控真核生物在翻譯水平上的調(diào)控普遍是控制mRNA的穩(wěn)定性和mRNA翻譯起始的控制,是一種快速調(diào)控基因表達(dá)的方式。第56頁/共64頁(一)mRNA的穩(wěn)定性:
mRNA穩(wěn)定性的變化可以控制基因表達(dá):細(xì)菌不穩(wěn)定,mRNA半壽期約3分鐘。真核細(xì)胞:①β-珠蛋白的mRNA半壽期約10h以上。②有些只要30分鐘,如生長因子,是編碼細(xì)胞內(nèi)調(diào)控蛋白的mRNA,不穩(wěn)定的mRNA的3’端非翻譯區(qū)已含有一段富含A和U的核苷酸序列。影響mRNA穩(wěn)定性:①3’端特殊信號(hào)序列②細(xì)胞外信號(hào)的影響。如激素第57頁/共64頁激素作用:①促進(jìn)特定基因的轉(zhuǎn)錄;②影響mRNA的穩(wěn)定性來調(diào)控翻譯,從而影響細(xì)胞的生理活動(dòng)。例1:牛奶中含有大量的酪蛋白:泌乳激素→酪蛋白的mRNA的半壽期增長30-50倍,使mRNA濃度增加100倍,從而使酪蛋白翻譯(合成)量大增。
第58頁/共64頁例2:增加細(xì)胞內(nèi)鐵的濃度導(dǎo)致兩種現(xiàn)象:①轉(zhuǎn)鐵蛋白受體的mRNA穩(wěn)定性降低,轉(zhuǎn)鐵蛋白受體合成減少,以減少細(xì)胞鐵的輸入;②
細(xì)胞鐵蛋白的合成增加,以結(jié)合多余的鐵。上述兩種反應(yīng)都是由一種“鐵敏感調(diào)節(jié)蛋白”所介導(dǎo)
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