基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)常用資源課件

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)信息資源基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)信息資源1基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)三大綜述

生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）/PharmacologicalReviews《藥理學(xué)評(píng)論》/臨床微生物學(xué)評(píng)論（ClinicalMicrobiologyReviews）/微生物與分子生物學(xué)評(píng)論（MicrobiologyandMolecularBiologyReviews，MMBR）/，/contents-by-date.0.shtml基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)三大綜述生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalR2生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）/美國(guó)生理學(xué)會(huì)主辦綜述生理學(xué)和生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最近焦點(diǎn)問(wèn)題2004年JCR顯示IF值為33.918，2005年JCR顯示IF值為28.721，居生理學(xué)期刊之首于出版前約3-4周預(yù)先公布將出版的計(jì)劃目次表，出版12個(gè)月后全文免費(fèi)該雜志綜述相當(dāng)于記述某專題研究歷史和最新進(jìn)展的專著。均由世界著名生理學(xué)家撰寫。每篇約兩萬(wàn)字，文中附相應(yīng)的圖表。參考文獻(xiàn)數(shù)百篇，發(fā)表年份跨時(shí)約一個(gè)世紀(jì)。

生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）ht3生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）/除生理學(xué)以外，還涉及綜合自然科學(xué)、綜合醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)基礎(chǔ)綜合（包括解剖、組胚、生化、分子生物、細(xì)胞生物、生物學(xué)、動(dòng)物學(xué)）、臨床醫(yī)學(xué)（包括呼吸病學(xué)、癌癥、循環(huán)等）。在參考文獻(xiàn)下方，提供引用該文的主要論文的題錄信息和全文鏈接。該雜志的綜述論文被其它學(xué)科書刊引用極為廣泛，往往也涉及綜合自然科學(xué)、綜合醫(yī)學(xué)及基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)各學(xué)科。可以說(shuō)，該刊的學(xué)術(shù)影響遍及基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)各學(xué)科和臨床醫(yī)學(xué)許多相關(guān)學(xué)科。

生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）ht4生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）/提供參考文獻(xiàn)、引用該文文獻(xiàn)列表與鏈接，尤其后者只給出其中的精要，主要作用是幫助讀者快速追溯與該文密切相關(guān)的文獻(xiàn)和密切相關(guān)的最新研究，起到為讀者導(dǎo)讀、輔助讀者精讀的作用。生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）ht5生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）/提供文章的可視化引證圖，直觀地反映該文引用其它雜志論文和被其它雜志論文引用的情況，幫助讀者了解該文和刊載該文的雜志與哪些論文和雜志存在著相互影響，進(jìn)而了解學(xué)科間交叉滲透的情況?？扇∨c該文存在引證關(guān)系的文獻(xiàn)記錄集中（以HighWire為統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)源）按被引頻次降序排列的前10、15、20、25、30條引證記錄查看可視圖。圖下提供圖中顯示出來(lái)的引證記錄的題錄信息以及摘要和全文鏈接，或者在圖中直接點(diǎn)擊文獻(xiàn)記錄也可查看這些信息。生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）ht6生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）/生理學(xué)評(píng)論（PhysiologicalReviews）ht7PharmacologicalReviews《藥理學(xué)評(píng)論》/

美國(guó)藥理學(xué)與實(shí)驗(yàn)治療學(xué)會(huì)主辦的綜述雜志。季刊。登載對(duì)當(dāng)前研究熱點(diǎn)問(wèn)題的綜述文章。內(nèi)容包括：生化與細(xì)胞藥理學(xué)、藥物代謝與分布、腎臟藥理學(xué)、神經(jīng)藥理學(xué)、行為藥理學(xué)、臨床藥理學(xué)和毒理學(xué)。2004年JCR顯示IF值為22.837，列藥理學(xué)與藥學(xué)雜志之首.2005年IF值15.689。每一篇綜述都精辟而全面地闡述了藥理學(xué)領(lǐng)域某專題研究的進(jìn)展情況，相關(guān)于專題專著。

PharmacologicalReviews《藥理學(xué)評(píng)論》8微生物與分子生物學(xué)評(píng)論（MicrobiologyandMolecularBiologyReviews，MMBR）/，/contents-by-date.0.shtml

1937年創(chuàng)刊，其前身為《MicrobiologicalReviews》。1992年，更為現(xiàn)名，同時(shí)分出一種臨床綜述刊《ClinicalMicrobiologyReviews》。美國(guó)微生物學(xué)會(huì)主辦。每年4期。評(píng)論涉及微生物學(xué)、免疫學(xué)、分子與細(xì)胞生物學(xué)，為讀者介紹有關(guān)細(xì)菌、病毒、寄生蟲、真菌以及其它真核細(xì)胞生物研究的最新發(fā)現(xiàn)。內(nèi)容范疇有生理學(xué)與酶學(xué)、分子生物學(xué)、遺傳學(xué)、生態(tài)學(xué)、引發(fā)疾病的宿主-寄生蟲關(guān)系、細(xì)胞生物學(xué)、病毒學(xué)。出版12個(gè)月后全文在線免費(fèi)。微生物與分子生物學(xué)評(píng)論（MicrobiologyandM9臨床微生物學(xué)評(píng)論（ClinicalMicrobiologyReviews）/

1988年創(chuàng)刊。美國(guó)微生物學(xué)會(huì)主辦。2004年JCR顯示IF值為10.671，居141種刊第3位。2005年IF值10.443。文獻(xiàn)出版12個(gè)月后全文在線免費(fèi)。

臨床微生物學(xué)評(píng)論（ClinicalMicrobiology10主要學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)及其信息資源AmericanAssociationofAnatomists（AAA）/

美國(guó)解剖學(xué)家協(xié)會(huì)成立于1888年，其成立宗旨是“推動(dòng)解剖科學(xué)的發(fā)展”。目前已成為致力于解剖學(xué)形態(tài)與功能研究的生物醫(yī)學(xué)研究與教育人員的專業(yè)學(xué)術(shù)組織。全世界AAA會(huì)員們既是為各醫(yī)學(xué)院校醫(yī)學(xué)生授課的首發(fā)教育者，同時(shí)又投身成像學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、遺傳學(xué)、分子發(fā)育學(xué)、內(nèi)分泌學(xué)、組織學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、法醫(yī)學(xué)、電子顯微鏡、體質(zhì)人類學(xué)、以及其它領(lǐng)域。主要學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)及其信息資源AmericanAssociati11AAA雜志解剖學(xué)記錄（TheAnatomicalRecord）/legacy/products/subject/life/anatomy/anat_anatrec.html始創(chuàng)于1906年，1908年從美國(guó)解剖學(xué)家協(xié)會(huì)最早的機(jī)關(guān)刊《美國(guó)解剖學(xué)雜志》（1901年創(chuàng)刊）中分離出來(lái)，獨(dú)立刊行至今。自1996年該雜志分為兩部分，分別是：《TheAnatomicalRecordPartA:DiscoveriesinMolecular,Cellular,andEvolutionaryBiology》和《TheAnatomicalRecordPartB:TheNewAnatomist》。每年出版18期。雜志提供有關(guān)生物結(jié)構(gòu)及其功能意義研究的論壇，雜志論文內(nèi)容包括正規(guī)研究報(bào)告、綜述、特殊通信等。AAA雜志解剖學(xué)記錄（TheAnatomicalReco12AAA雜志發(fā)育動(dòng)力學(xué)（DevelopmentalDynamics）/cgi-bin/jhome/38417?CRETRY=1&SRETRY=01901年創(chuàng)刊，創(chuàng)刊刊名為AmericanJournalofAnatomy《美國(guó)解剖學(xué)雜志》（1901-1991），1992年改為現(xiàn)名。現(xiàn)每年出版12期。該雜志的更名充分標(biāo)示著解剖學(xué)研究方向和方法的歷史性轉(zhuǎn)折。更名后，該刊內(nèi)容為發(fā)育生物學(xué)家提供有關(guān)動(dòng)物發(fā)育過(guò)程中形態(tài)出現(xiàn)和控制形態(tài)形成機(jī)理方面的研究成果。AAA雜志發(fā)育動(dòng)力學(xué)（DevelopmentalDynam13美國(guó)生理學(xué)會(huì)（AmericanPhysiologicalSociety，APS）/

美國(guó)生理學(xué)會(huì)是致力于生理科學(xué)教育、科研和信息發(fā)布的非營(yíng)利性組織。成立于1887年?？偛吭O(shè)在馬里蘭州的Bethesda，地處美國(guó)實(shí)驗(yàn)生物學(xué)會(huì)聯(lián)合會(huì)（theFederationofAmericanSocietiesforExperimentalBiology，F(xiàn)ASEB)的園區(qū)內(nèi)，是FASEB的18個(gè)成員學(xué)會(huì)之一。

課堂練習(xí)：APS都主辦哪些雜志（和雜志分輯）？列舉出來(lái)。美國(guó)生理學(xué)會(huì)（AmericanPhysiological14AmericanSocietyforPharmacology&ExperimentalTherapeutics

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美國(guó)藥理學(xué)和實(shí)驗(yàn)治療學(xué)會(huì)成立于1908年，由JohnJ.Abel邀集了18位藥理學(xué)家組建而成。網(wǎng)站“TrainingProgram”欄目下提供有美國(guó)各大學(xué)藥理學(xué)系/院/部及研究所名錄及鏈接，包括本科、研究生、博士和博士后培訓(xùn)系部和研究所的鏈接以及世界各地藥理學(xué)研究生培訓(xùn)項(xiàng)目的名簿鏈接。此外還有豐富的教育資源和藥理學(xué)相關(guān)資源鏈接。

課堂練習(xí)：查該學(xué)會(huì)主要出版物有哪些？它們的內(nèi)容特征？AmericanSocietyforPharmacol15TheAmericanSocietyforBiochemistryandMolecularBiology(ASBMB)/ASBMB/site.nsf

美國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)始建于1906年，學(xué)會(huì)駐址在馬里蘭州的Bethesda，即FASEB園區(qū)內(nèi)?，F(xiàn)有會(huì)員11900人，屬非營(yíng)利性科教組織。其宗旨是“Promotingunderstandingofthemolecularnatureoflifeprocesses”。TheAmericanSocietyforCellBiology(ASCB)/ResearchCollaboratoryforStructuralBioinformatics(RCSB)/index.htmlBiophysicalSociety/

TheAmericanSocietyforBioch16NationalHumanGenomeResearchInstitute(NHGRI)/

美國(guó)國(guó)立人類基因組研究所前身是國(guó)立人類基因組研究中心（theNationalCenterforHumanGenomeResearch，NCHGR)。該中心創(chuàng)建于1989年，使命是在國(guó)際人類基因組計(jì)劃（theInternationalHumanGenomeProject，HGP）中實(shí)施美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院（theNationalInstitutesofHealth，NIH）的任務(wù)。

NationalHumanGenomeResearch17美國(guó)Whitehead生物醫(yī)學(xué)研究所基因組研究中心（TheCenterforGenomeResearchattheWhiteheadInstituteforBiomedicalResearch）()

該中心web服務(wù)器提供以下信息：基因組序列、基因組圖譜、基因組中心的軟件以及該中心的研究人員。其中軟件組中的Primer3程序可自動(dòng)設(shè)置PCR最佳引物，從中可獲得設(shè)計(jì)最佳引物應(yīng)滿足的條件和原則。美國(guó)Whitehead生物醫(yī)學(xué)研究所基因組研究中心（The18AmericanSocietyforMicrobiology，ASM/該學(xué)會(huì)主辦12種雜志（《AntimicrobialAgentsandChemotherapy》、《AppliedandEnvironmentalMicrobiology》、《ClinicalandVaccineImmunology(2006)(前身為ClinicalandDiagnosticLaboratoryImmunology)》、《ClinicalMicrobiologyReviews》、《EukaryoticCell》、《InfectionandImmunity》、《JournalofBacteriology》、《JournalofClinicalMicrobiology》、《JournalofVirology》、《MicrobiologyandMolecularBiologyReviews》、《MolecularandCellularBiology》、《MinireviewCollectionofallJournals》），覆蓋微生物學(xué)所有范疇—從分子與細(xì)胞生物學(xué)到生物醫(yī)學(xué)研究與技術(shù)。這12種雜志構(gòu)成了美國(guó)微生物學(xué)會(huì)的核心資源。所有ASM的出版物都可以通過(guò)http://查閱。

AmericanSocietyforMicrobiol19生物化學(xué)、分子生物學(xué)與遺傳學(xué)大刊生物化學(xué)雜志（JournalofBiologicalChemistry，JBC）CellNatureGenetics自然遺傳學(xué)/ng/index.htmlNaturePublishingGroup(/index.html)出版的Nature系列雜志之一。1992年創(chuàng)刊，月刊。

生物化學(xué)、分子生物學(xué)與遺傳學(xué)大刊生物化學(xué)雜志（Journal20生物化學(xué)雜志（JournalofBiologicalChemistry，JBC）由美國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)（AmericanSocietyforBiochemistryandMolecularBiology,ASBMB,/ASBMB/site.nsf）主辦。1905年創(chuàng)刊。周刊，每年原始研究報(bào)告總印數(shù)達(dá)55000多頁(yè)。有印刷本和電子版兩種刊載載體。原始研究論文經(jīng)同行評(píng)議確認(rèn)對(duì)生物化學(xué)、分子生物學(xué)領(lǐng)域有創(chuàng)新性重要貢獻(xiàn)才能予以發(fā)表。可采用常規(guī)發(fā)表和快速發(fā)表兩種形式。前者錄用率約為15%，后者5%?？焖侔l(fā)表的研究成果要求特別具有新穎性、創(chuàng)造性、重要性并特別吸引讀者。稿件一旦獲準(zhǔn)錄用，將在24小時(shí)內(nèi)進(jìn)入“JBCPapersinPress”在網(wǎng)上公布。相應(yīng)地，如果論文中涉及到新認(rèn)定的生物大分子結(jié)構(gòu)，那么新的結(jié)構(gòu)信息也必須同步錄入ProteinDataBank。生物化學(xué)雜志（JournalofBiologicalC21生物化學(xué)雜志（JournalofBiologicalChemistry，JBC）JBC論文按內(nèi)容分編，主要類目有方法學(xué)、測(cè)序與克隆、酶學(xué)、蛋白與蛋白相互作用、轉(zhuǎn)錄、代謝調(diào)節(jié)與基因表達(dá)、翻譯后修飾、糖生物學(xué)（glycobiology）、蛋白突變分析、轉(zhuǎn)基因與敲除、功能性基因組蛋白質(zhì)組分析、生物信息學(xué)、用流式細(xì)胞計(jì)數(shù)研究細(xì)胞周期與凋亡、RNAi。JBI還設(shè)有小綜述欄目，發(fā)表對(duì)當(dāng)前熱點(diǎn)問(wèn)題的特邀小綜述。2004年JCR顯示該刊IF值為6.355，居上述388種期刊的第43位，2005年IF值5.854。文獻(xiàn)出版后一年全文免費(fèi)。生物化學(xué)雜志（JournalofBiologicalC22NatureGenetics/ng/index.html

NaturePublishingGroup(/index.html)出版的Nature系列雜志之一。1992年創(chuàng)刊，月刊。該雜志發(fā)表遺傳學(xué)高質(zhì)量研究成果，包括人類性征和其它動(dòng)物模型如鼠、蠅、線蟲和酵母菌的基因和功能性基因組的研究。當(dāng)前側(cè)重常見疾病和復(fù)雜疾病的遺傳學(xué)機(jī)理，也側(cè)重通過(guò)實(shí)驗(yàn)干預(yù)研究基因網(wǎng)絡(luò)的功能機(jī)制、結(jié)構(gòu)和演變。具體包括：人類疾病病理中的基因、簡(jiǎn)單與復(fù)雜基因性征的分子分析、癌癥遺傳學(xué)、實(shí)驗(yàn)胚胎學(xué)、基因療法、發(fā)育遺傳學(xué)、基因表達(dá)調(diào)節(jié)、從基因組數(shù)據(jù)中提取功能的策略與技術(shù)、藥物基因組學(xué)、基因組進(jìn)化。

NatureGeneticshttp://www.nat23NatureGenetics/ng/index.html雜志設(shè)有編者述評(píng)、通信(Correspondence)、書評(píng)、新聞與觀點(diǎn)、綜述、短篇通訊(BriefCommunications)、原始論文、讀者來(lái)信（Letters）等欄目。通信(Correspondence)原為L(zhǎng)etterstotheEditor，登載讀者感興趣的問(wèn)題，可以是政策爭(zhēng)論，也可以是由研究論文引發(fā)的問(wèn)題公告，該類文章的原始研究數(shù)據(jù)要求以摘要形式描述。短篇通訊(BriefCommunications)報(bào)告高質(zhì)量且具有廣泛興趣的簡(jiǎn)潔研究成果。讀者來(lái)信（Letters）發(fā)表重要的新的研究成果，但其重要性又較原始論文（Articles）次之。2004年是24.695，均居120種遺傳學(xué)(Genetics&Hereditary)期刊的首位。2005年IF值25.797。

NatureGeneticshttp://www.nat24權(quán)威知識(shí)庫(kù)TheVisibleHumanProject?/research/visible/visible_human.html人類可視化計(jì)劃是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館1986年長(zhǎng)期計(jì)劃的產(chǎn)物，它展現(xiàn)正常的人類男性與女性機(jī)體的全面的、解剖學(xué)上十分詳盡的、三維結(jié)構(gòu)。也包括具有代表性的男性和女性尸體的橫斷面CT、MR和cryosection成像。橫斷間隔男性為一毫米，女性為三分之一毫米。人類可視化計(jì)劃的長(zhǎng)期目標(biāo)是建構(gòu)一個(gè)大型知識(shí)結(jié)構(gòu)體系，在可視圖像與知識(shí)符號(hào)（如機(jī)體部位名稱）之間建立顯而易見的連接。計(jì)劃的承建者是科羅拉多大學(xué)衛(wèi)生科學(xué)中心的人類模擬中心(/sm/chs/)和國(guó)立大氣研究中心(/redirects/404.shtml)。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)TheVisibleHumanProject25權(quán)威知識(shí)庫(kù)虛擬器官庫(kù)VirtualOrganLibrary/Education/virtual_organ_image_library/default.asp由美國(guó)解剖學(xué)家協(xié)會(huì)（/）提供，由其主頁(yè)將鼠標(biāo)置于“Education&TeachingTools”處即見“VirtualOrganImageLibrary”，點(diǎn)擊即進(jìn)入該庫(kù)頁(yè)面。該網(wǎng)頁(yè)提供了豐富的解剖學(xué)圖譜和成像資料的鏈接，每一庫(kù)都包含極為豐富的圖像資料。練習(xí)：該庫(kù)有哪些類圖像庫(kù)？權(quán)威知識(shí)庫(kù)虛擬器官庫(kù)VirtualOrganLibrar26權(quán)威知識(shí)庫(kù)PhysioNet-theresearchresourceforcomplexphysiologicsignals/

“綜合生理學(xué)信號(hào)研究資源”是一個(gè)由波士頓BethIsraelDeaconess醫(yī)學(xué)中心/哈佛大學(xué)、波士頓大學(xué)、麥吉爾大學(xué)和MIT的研究人員，在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的國(guó)立研究資源中心的贊助下，合作開發(fā)的項(xiàng)目。該項(xiàng)目旨在激發(fā)綜合生物醫(yī)學(xué)和生理學(xué)信號(hào)領(lǐng)域的新研究。共有三個(gè)緊密聯(lián)系的組成部分：權(quán)威知識(shí)庫(kù)PhysioNet-theresearchre27權(quán)威知識(shí)庫(kù)-PhysioNet（一）PhysioNetPhysioNet是一個(gè)在線論壇，通過(guò)提供數(shù)據(jù)合作分析以及新算法評(píng)估的設(shè)施來(lái)分發(fā)交換生物醫(yī)學(xué)信號(hào)記錄及其分析的開放使用軟件。除提供PhysioBank數(shù)據(jù)和PhysioToolkit軟件的免費(fèi)電子獲取入口外，PhysioNet還通過(guò)在線指南（PhysioNetTutorial）提供用戶服務(wù)與培訓(xùn)。權(quán)威知識(shí)庫(kù)-PhysioNet（一）PhysioNet28權(quán)威知識(shí)庫(kù)-PhysioBank（二）PhysioBankPhysioBank是一個(gè)大型的逐漸擴(kuò)增的生理學(xué)信號(hào)和相關(guān)數(shù)據(jù)的數(shù)字化記錄文檔，目前包括多參數(shù)的心肺、神經(jīng)和其他生物醫(yī)學(xué)信號(hào)，信號(hào)來(lái)自健康受試者和各種疾病的患者，涉及到的患者疾病包括心臟猝死、充血性心衰、癲癇、步態(tài)不穩(wěn)、睡眠呼吸暫停和衰老。這些數(shù)據(jù)庫(kù)有三類，一類是完全參考數(shù)據(jù)庫(kù)（completedreferencedatabases，Class1），二類是支持已發(fā)表研究的原始數(shù)據(jù)的文檔拷貝，由作者和期刊投交（archivalcopiesofrawdatathatsupportpublishedresearch,contributedbyauthorsorjournals，Class2），第三類是其它來(lái)源數(shù)據(jù)集，包括進(jìn)行中的工作（othercontributedcollectionsofdata,includingworksinprogress，Class3）。作為對(duì)研究團(tuán)體的服務(wù)，第二類和第三類數(shù)據(jù)可通過(guò)PhysioNet獲得。投交的數(shù)據(jù)一經(jīng)接受，都放在第二類和第三類，經(jīng)同行評(píng)議和公眾評(píng)論期后可能轉(zhuǎn)入第一類。

練習(xí)：按數(shù)據(jù)特征例舉介紹這些數(shù)據(jù)庫(kù)。權(quán)威知識(shí)庫(kù)-PhysioBank（二）PhysioBank29權(quán)威知識(shí)庫(kù)《GoodmanandGilman’sThePharmacologicalBasisofTherapeutics》（《古德曼吉爾曼治療學(xué)的藥理學(xué)基礎(chǔ)》）這是一本經(jīng)典的藥理學(xué)名著，被譽(yù)為“藥理學(xué)的藍(lán)色圣經(jīng)”。各論按藥物的藥理學(xué)作用編排。網(wǎng)上可見有售。目前尚未發(fā)現(xiàn)該書有網(wǎng)絡(luò)版。2006年將由McGraw-HillProfessional公司出版第11版，LaurenceBrunton、JohnLazo和KeithParker主編。該書是醫(yī)學(xué)藥理學(xué)名著，反映藥物作用和藥物-疾病相互作用所有重要的最新進(jìn)展。藥理學(xué)領(lǐng)域最受關(guān)注的教科書；最全面的藥理學(xué)信息資源，內(nèi)容涵蓋所有藥物種類和所有器官系統(tǒng)，也包括臨床疾病條目；適時(shí)更新，反映最有重要價(jià)值的新進(jìn)展；增設(shè)新章節(jié)“藥物轉(zhuǎn)運(yùn)”、“藥物代謝”、“藥物基因組學(xué)”；各章末附以臨床概述──主要藥物原型臨床應(yīng)用相關(guān)的基本概念.權(quán)威知識(shí)庫(kù)《GoodmanandGilman’sThe30權(quán)威知識(shí)庫(kù)CHEMINFO:ChemicalInformationResources(WigginsatIndiana)/~cheminfo/印第安娜大學(xué)化學(xué)信息資源有:ChemicalAcronymsDatabase(CAD)–化學(xué)物質(zhì)縮寫詞庫(kù)，共11000多條款目鏈至縮寫詞的全稱；ChemicalReferenceSourcesDatabase(CRSD)–化學(xué)參考材料庫(kù)，其中包括印本參考資源、商業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件；FacultyPublicationsoftheIndianaUniversityDepartmentofChemistry(FACPUB)；IndianaUniversityMolecularStructureCenter(IUMSC)–可溶性晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)及使其可視的Java程序。WHO-GuidetoGoodPrescribinghttp://www.med.rug.nl/pharma/ggp.htm《WHO良方實(shí)踐手冊(cè)》，有圖解和純文本兩種版本。另有《WHO基本藥物標(biāo)準(zhǔn)目錄》2005年14版，《WHO模式處方集》2004年版。權(quán)威知識(shí)庫(kù)CHEMINFO:ChemicalInforma31權(quán)威知識(shí)庫(kù)美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫(kù)（NLMChemicalInformationSIS-specializedinformationservices，/chemical.htmlChemIDplus內(nèi)含逾370，000種化學(xué)物質(zhì)、synonyms、結(jié)構(gòu)、regulatorylistinformation及到其它數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接。該庫(kù)有兩種檢索方式：一是ChemIDplusLite，以化學(xué)物質(zhì)名稱和登記號(hào)來(lái)檢索；二是ChemIDplusAdvanced，以登記號(hào)、化學(xué)物質(zhì)名稱、分子式、結(jié)構(gòu)式、物理和毒理性質(zhì)以及定位和分類數(shù)據(jù)來(lái)檢索和顯示。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館化學(xué)信息數(shù)據(jù)庫(kù)（NLMChem32權(quán)威知識(shí)庫(kù)CenterWatchClinicalTrialsListingService/TrialListings通過(guò)治療部位（人體器官系統(tǒng)）檢索臨床試驗(yàn)項(xiàng)目；ClinicalTrialResults臨床試驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù)庫(kù)；DrugsinClinicalTrials臨床試驗(yàn)藥物數(shù)據(jù)庫(kù)；患者用藥指南和相關(guān)臨床研究信息。TheMerckIndexOnlineSM（LastLoadedonWeb:September13,2005，LastUpdateToBluesheet:June24,2003）/bluesheets/html/bl0304.html世界著名的《默克索引》網(wǎng)絡(luò)版。數(shù)據(jù)庫(kù)的記錄來(lái)自大約800種國(guó)際化學(xué)、生物醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)雜志；30多個(gè)國(guó)家注冊(cè)的專利；圖書；會(huì)議錄；其它標(biāo)準(zhǔn)參考著作。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)CenterWatchClinicalTria33權(quán)威知識(shí)庫(kù)TOXNET/該網(wǎng)站由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館特殊信息服務(wù)部（TheDivisionofSpecializedInformationServices，SIS,/）主持的毒理與環(huán)境衛(wèi)生信息項(xiàng)目（ToxicologyandEnvironmentalHealthInformationProgram，TEHIP,）創(chuàng)建，網(wǎng)站主要提供毒理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、有害化學(xué)物質(zhì)、環(huán)境衛(wèi)生等方面的內(nèi)容。課堂練習(xí)：查看該網(wǎng)站主要資源有哪些？權(quán)威知識(shí)庫(kù)TOXNEThttp://toxnet.nlm34權(quán)威知識(shí)庫(kù)ProteinDataBank,PDB/pdb/PDB是世界上唯一一個(gè)國(guó)際性的處理實(shí)驗(yàn)測(cè)定的高分子三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的倉(cāng)庫(kù)。主要由Rutgers（新澤西州立大學(xué)）和圣地亞哥超型計(jì)算機(jī)中心（加利福尼亞大學(xué)）維護(hù)。其它參與數(shù)據(jù)處理的機(jī)構(gòu)有駐址在英國(guó)的歐洲生物信息研究所大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)組（theEuropeanBioinformaticsInstituteMacromolecularStructureDatabasegroup）和日本大阪大學(xué)的蛋白質(zhì)研究所。權(quán)威知識(shí)庫(kù)ProteinDataBank,PDBht35權(quán)威知識(shí)庫(kù)ExPASyProteomicsServer/蛋白質(zhì)分析專家系統(tǒng)ExPASy（ExpertProteinAnalysisSystem）是瑞士生物信息研究所（SwissInstituteofBioinformatics,SIB）創(chuàng)建的蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)器，用于分析蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)以及2維聚丙烯酰胺凝膠電泳（2-DPAGE）。該系統(tǒng)網(wǎng)站還提供一系列其它軟件工具，如蛋白質(zhì)組學(xué)和序列分析工具、2-DPAGE分析工具、質(zhì)譜分析工具等。權(quán)威知識(shí)庫(kù)ExPASyProteomicsServer36權(quán)威知識(shí)庫(kù)UniProt(UniversalProteinResource)/sprot/UniProt由SIB和EBI(EuropeanBioinformaticsInstitute歐洲生物信息學(xué)研究所http://www.ebi.ac.uk/)的Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫(kù)組開發(fā)而成，包括兩部分，即Swiss-Prot（蛋白質(zhì)知識(shí)庫(kù)）和TrEMBL（對(duì)Swiss-Prot的計(jì)算機(jī)注釋補(bǔ)充）。前者是蛋白質(zhì)序列注釋數(shù)據(jù)庫(kù)，庫(kù)中描述蛋白質(zhì)功能、其域結(jié)構(gòu)、翻譯后修飾我、變異等等。后者是Swiss-Prot的補(bǔ)集，包括所有尚未整合入Swiss-Pro的EMBL核苷酸序列款目的翻譯。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)UniProt(UniversalProtei37權(quán)威知識(shí)庫(kù)DatabaseofMacromolecularMovementswithAssociatedToolsforFlexibilityandGeometricAnalysis/molmovdb/數(shù)據(jù)庫(kù)以影片方式展示蛋白質(zhì)及其它生物大分子的運(yùn)動(dòng)，同時(shí)提供免費(fèi)結(jié)構(gòu)分析軟件工具的鏈接。NDBAtlasofNucleicAcidContainingStructures/atlas/index.html核酸數(shù)據(jù)庫(kù)（NucleicAcidDatabase，/）的核酸結(jié)構(gòu)圖譜。圖像分為放射線圖像和核磁共振圖像兩大類，每一類下都在兩種索引，即“GalleryIndex”和“IndexListing(textonly)”。該圖譜給數(shù)據(jù)庫(kù)中的每個(gè)結(jié)構(gòu)提供圖像及簡(jiǎn)要解說(shuō)。這些圖像從各種視角反映核酸的各種結(jié)構(gòu)。同時(shí)提供實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)等相關(guān)文檔的鏈接。MolecularExpressionsTM/光學(xué)顯微鏡圖片庫(kù)。其“MolecularExpressionsPhotoGallery”包含幾千張全彩光學(xué)顯微鏡下圖片和從圖片庫(kù)中精選出來(lái)的數(shù)字圖像。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)DatabaseofMacromolecula38權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMOMIMTM-OnlineMendelianInheritanceinManTM《在線人類孟德爾遺傳學(xué)》/entrez/query.fcgi?db=OMIM《在線人類孟德爾遺傳》既是在線出版物，同時(shí)又是不斷更新的人類基因與遺傳疾病的目錄。它以《MendelianInheritanceinMan》(McKusick,V.A.:MendelianInheritanceinMan.12thed.,Baltimore:JohnsHopkinsUniversityPress,1998.)為藍(lán)本。OMIM是該書的數(shù)字化數(shù)據(jù)庫(kù)版本，兩者的主要差別是網(wǎng)絡(luò)版每日更新，而印刷版內(nèi)容的更新程度只能體現(xiàn)在最新版本中。另外網(wǎng)絡(luò)版數(shù)據(jù)庫(kù)中除包含文本信息資料外，也包括豐富的MEDLINE鏈接和Entrez系統(tǒng)中的序列記錄鏈接以及其它相關(guān)的NCBI等網(wǎng)站資源的鏈接，印刷版則包含網(wǎng)絡(luò)版中所不具備的序言和附錄等。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMOMIMTM-OnlineMend39權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM全庫(kù)目前收載記錄19048條(2006年8月統(tǒng)計(jì))，主要為（可）遺傳的疾病即遺傳病。人們也把它看作是與人類基因組計(jì)劃相伴的表型數(shù)據(jù)庫(kù)。由約翰?霍金森大學(xué)(JohnsHopkinsUniversity)的VictorA.McKusick主編，NCBI開發(fā)。OMIM中的編號(hào)系統(tǒng)在OMIM中，每一條記錄都給予一個(gè)獨(dú)一無(wú)二的六位數(shù)編號(hào)，其中第一位表示該基因的遺傳方式。以1開頭的號(hào)(100000-)指常染色體(顯性)基因座位或表型(創(chuàng)建于1994年5月15日前)；以2開頭的號(hào)(200000-)指常染色體(隱性)基因座位或表型(創(chuàng)建于1994年5月15日前)；以3開頭的號(hào)(300000-)指X連鎖基因座位或表型；以4開頭的號(hào)(400000-)指Y連鎖基因座位或表型；以5開頭的號(hào)(500000-)指線粒體基因座位或表型；以6開頭的號(hào)(600000-)指常染色體基因座位或表型(創(chuàng)建于1994年5月15日之后)。等位變異體的命名規(guī)則是在其“母”條目的MIM編碼后加小數(shù)點(diǎn)再加一個(gè)獨(dú)一無(wú)二的四位數(shù)變異體編碼。如凝血因子IX編號(hào)為306900.0001-306900.0101，?珠蛋白基因座編號(hào)為141900，鐮狀血紅蛋白編號(hào)為141900.0243。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM全庫(kù)目前收載記錄19048條(2006年40權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMMIM號(hào)前的(*)號(hào)、(#)（+）（%）號(hào)的意義：(*)號(hào)表示某基因座的基因所決定的表型不同于其它任何帶(*)號(hào)記錄所代表的基因座，且該表型的遺傳方式已經(jīng)證實(shí)。一般來(lái)說(shuō)，每個(gè)基因座只創(chuàng)建唯一一個(gè)帶(*)號(hào)的記錄。編碼前無(wú)(*)號(hào)意味著該遺傳方式雖疑為遺傳性但還未經(jīng)證實(shí)，或者還不清楚該基因座是否不同于其它記錄中的基因座。(#)號(hào)表示該記錄為描述性記錄，通常是一種表型的描述性記錄，不代表一個(gè)獨(dú)一無(wú)二的基因座，使用(#)號(hào)的原因在該記錄的第一段闡述，與該表型相關(guān)的基因的討論存在于其它記錄中。在線粒體目錄中，線粒體染色體組37個(gè)基因的記錄標(biāo)以(*)號(hào)，由這些基因中一個(gè)或多個(gè)突變引起的表型的記錄標(biāo)以(#)號(hào)。記錄編號(hào)前的(^)號(hào)意味著該記錄不再存在，原因是它已被刪除或被賦以另一個(gè)MIM號(hào)。（+）表示該條目描述了一個(gè)基因的已知序列和表現(xiàn)型。（%）表示該條目描述了已經(jīng)確認(rèn)的孟德爾表現(xiàn)型或表現(xiàn)型座位，而該表現(xiàn)型座位的分子基礎(chǔ)尚不清楚。條目前無(wú)記號(hào)表示該條目描述了一種其孟德爾基礎(chǔ)雖然疑是但尚未明確或者其與其它條目的分別尚不清楚的一種表現(xiàn)型。（^）號(hào)表示該條目不再存在，原因是被數(shù)據(jù)庫(kù)清除或轉(zhuǎn)為所提示的其它條目。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMMIM號(hào)前的(*)號(hào)、(#)（+）（%）41權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMOMIM基因圖OMIM的基因圖是OMIM中收載的細(xì)胞遺傳學(xué)基因定位。它是一個(gè)獨(dú)立的文檔，以表格形式列出自1號(hào)染色體的p端粒至22號(hào)染色體的q端粒的基因，然后列出X和Y染色體上的基因(也是按從p端粒到q端粒的順序)。并不是所有的OMIM記錄都列入基因圖中，只有那些發(fā)表了細(xì)胞遺傳學(xué)基因定位的文獻(xiàn)才進(jìn)入OMIM基因圖。OMIM基因圖可通過(guò)網(wǎng)絡(luò)和FTP文檔獲得。其網(wǎng)絡(luò)版可通過(guò)基因符號(hào)(如“SOD1”)、染色體定位(如“5”、“1pter”、“Xq”)、或疾病關(guān)鍵詞(如“Alzheimer”)來(lái)檢索。檢索X和Y染色體均需大寫X，Y。檢索時(shí)可以指定幾個(gè)字符，運(yùn)用截詞功能，OMIM將先指定到以這些字符開頭的位置，然后使用“FindNext”鈕來(lái)查找與檢索詞匹配的下一個(gè)記錄。OMIM基因圖一次顯示20條記錄。權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMOMIM基因圖42權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM如果一個(gè)基因只定位于一個(gè)染色體號(hào)而不是特定的細(xì)胞遺傳學(xué)基因片斷，那么該記錄通常顯示在該染色體基因的末端。每條記錄包含：基因在染色體上的位置、基因符號(hào)(也屬于記錄的標(biāo)題)、OMIM記錄的標(biāo)題、MIM記錄編號(hào)、特定基因突變所引起的疾病、說(shuō)明、基因定位的方法、鼠。點(diǎn)擊位置則鏈接到MapViewer顯示該基因在所在基因片斷中的位置及其它臨近基因。點(diǎn)擊MIM記錄編號(hào)則鏈接到相關(guān)的文本資料。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM如果一個(gè)基因只定位于一個(gè)染色體號(hào)而不是特43權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMOMIM病理圖OMIM病理圖是按字順排列的疾病及其相應(yīng)的細(xì)胞遺傳學(xué)定位的列表。該圖也可以通過(guò)網(wǎng)絡(luò)和FTP文檔獲得。OMIM病理圖網(wǎng)絡(luò)版可通過(guò)基因符號(hào)(如“SOD1”)、染色體定位(如“1pter”、“Xq”)、或疾病關(guān)鍵詞(如“Alzheimer”)來(lái)檢索。X和Y染色體需大寫。也可以用數(shù)據(jù)字(如“5”)檢索，但該數(shù)字可能不只出現(xiàn)在位置一欄?；驁D與病理圖的疾病一欄中符號(hào)[]、{}、？及數(shù)據(jù)(1)(2)(3)的意義：某些“非疾病”，即導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)值明顯異常的遺傳變異(如dysalbuminemiceuthyroidalhyperthyroxinemia)用[]括起來(lái)；{}指一些突變實(shí)例，它們導(dǎo)致對(duì)某種特定感染(如白喉、脊髓灰質(zhì)炎)普遍易感、或?qū)е聦?duì)某種感染(間日瘧)經(jīng)常抵抗、防止尼古丁成癮以及其它易感性；？號(hào)置于疾病名稱前相當(dāng)于繪圖狀況的L(繪圖即定位的狀況有四種，它們是C已證實(shí)，至少在兩個(gè)實(shí)驗(yàn)室或幾個(gè)家系中觀察到；P暫定的，基于一個(gè)實(shí)驗(yàn)室或一個(gè)家系中的證據(jù)；I不一致，不同的實(shí)驗(yàn)室結(jié)果不同；L不定，其證據(jù)不如P強(qiáng)，相當(dāng)于“臨時(shí)”)；每種疾病名稱后面的用小括號(hào)括起來(lái)的數(shù)字表明該突變定位為(1)野生型基因定位，(2)已定位的疾病表型本身，(3)二種定位兼有。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMOMIM病理圖44權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM檢索功能:在保持了原有的OMIM檢索系統(tǒng)功能的同時(shí)，Entrez系統(tǒng)提供如下新功能：檢索分三個(gè)層次，即基本檢索、高級(jí)檢索和邏輯組配檢索通過(guò)Index功能可以瀏覽某個(gè)字段的索引來(lái)查找相關(guān)詞匯及包含該詞匯的記錄數(shù)。buildyourqueryonestepatatimeusingthePreviewfunction.使用Limits功能限定檢索字段、染色體號(hào)或記錄類型來(lái)縮檢。History檢索史功能：用AND，OR，NOT等邏輯組配將兩個(gè)或更多檢索式組配。DisplayFormats顯示格式：從多個(gè)顯示格式中選擇一種格式，顯示多個(gè)記錄。Clipboard存儲(chǔ)選擇出來(lái)的記錄。利用Entrez的整合性和交叉互見性查找Entrez其它數(shù)據(jù)庫(kù)中的相關(guān)記錄。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM檢索功能:45權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM檢索示例Entrez中的OMIM能夠解決的問(wèn)題示例：(1)哪些人類基因與高血壓相關(guān)?這些基因中哪些位于17號(hào)染色體?在檢索框中輸入hypertension。點(diǎn)擊Limits。在Chromosome(s)框中點(diǎn)擊選擇chromosome17按Go(建立結(jié)果鏈接頁(yè))注上述檢索出來(lái)的結(jié)果是在記錄文本中提到hypertension的所有記錄，因?yàn)槿笔∏闆r下Entrez檢索所有字段。通過(guò)"SearchinField"框可以限定所要檢索的字段，如標(biāo)題等。(2)列出描述10號(hào)染色體上的基因的OMIM記錄。該題有三種檢索方法：1)自O(shè)MIM主頁(yè)點(diǎn)擊Limits，選擇chromosome10，按Go。2)自O(shè)MIM主頁(yè)在檢索框中輸入10[chr]，按Go。3)自O(shè)MIM主頁(yè)，點(diǎn)擊Preview/Index，在頁(yè)面中部的檢索字段下拉菜單中選擇Chromosome。在檢索輸入框中輸入10。按Preview。點(diǎn)擊"Result"查看檢索出的記錄。權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM檢索示例46權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM(3)列出含有等位基因變異體信息的OMIM記錄。該題有三種檢索方法：1）自O(shè)MIM主頁(yè)點(diǎn)擊Limits。在"OnlyRecordsWith"框中點(diǎn)選AllelicVariants。按Go。2）自O(shè)MIM主頁(yè)點(diǎn)擊Preview/Index，在檢索字段下拉菜單中選擇Properties。在檢索框中輸入allelicvariants，按Preview，點(diǎn)擊"Result"查看檢索結(jié)果。3）自O(shè)MIM主頁(yè)，在檢索框中輸入allelicvariants[prop]，按Go。(4)檢索囊性纖維化跨膜傳導(dǎo)調(diào)節(jié)因子(cysticfibrosistransmembraneconductanceregulator，CFTR)的記錄并通過(guò)Entrez鏈接到相關(guān)的蛋白質(zhì)序列記錄。在檢索框中輸入CFTR或全名。點(diǎn)擊MIM號(hào)602421顯示該記錄。點(diǎn)擊Display鈕旁的下拉菜單擊選擇ProteinLinks，按Display。注Entrez只鏈接到與OMIM記錄引用的出版物有關(guān)的蛋白質(zhì)序列記錄。也可以鏈接到核苷酸序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，使用Entrez中的“relatedsequences”或“relatedstructures”鏈接在這些數(shù)據(jù)庫(kù)中作進(jìn)一步瀏覽。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM(3)列出含有等位基因變異體信息的OMI47權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM(5)查找p53腫瘤蛋白的記錄并鏈接到LocusLink和p53突變數(shù)據(jù)庫(kù)中的信息。在檢索框中輸入p53，按Go。點(diǎn)擊MIM號(hào)191170顯示該記錄。在Display鈕旁的下拉菜單中選擇LinkOuts按Display，然后在相關(guān)鏈接中選擇自己感興趣的進(jìn)一步點(diǎn)擊查閱。從以上實(shí)例可以看出，OMIM的檢索分初級(jí)檢索和高級(jí)檢索兩種檢索方式。前者即在檢索框中輸入一個(gè)或多個(gè)詞語(yǔ)進(jìn)行檢索。后者可以通過(guò)Limits,Preview/Index,History,和Clipboard來(lái)加以限定或編輯檢索策略來(lái)實(shí)施更為專指的檢索。這些檢索功能的明細(xì)請(qǐng)參見PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索方法和OMIMhelp文檔。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM(5)查找p53腫瘤蛋白的記錄并鏈接到L48權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM幾點(diǎn)說(shuō)明OMIM專供與遺傳病有關(guān)的臨床醫(yī)師和其他專業(yè)人員、遺傳學(xué)研究人員和科學(xué)與醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的高級(jí)學(xué)生使用。另外，請(qǐng)注意：（1)如想知道OMIM目前包含多少條記錄，則點(diǎn)擊每日更新的OMIMStatistics.（2)OMIM并沒(méi)有囊括所有遺傳病?？梢暂斎爰膊∶Q來(lái)查看該病是否收入OMIM中。對(duì)于有同義詞的疾病，OMIM自動(dòng)指向同一名稱。（3)OMIM包含以孟德爾方式遺傳的人類基因與遺傳病的記錄。雖然由于歷史或其它原因有幾種染色體異常如21三體和貓叫(cri-du-chat)收入OMIM中，但正常情況下由染色體失常如單體性和三體性染色體引起的遺傳病不收入OMIM。（4)OMIM收載的文獻(xiàn)記錄不如PubMed廣泛，但它提供系統(tǒng)精煉的綜述性信息，對(duì)專業(yè)人員更具參考價(jià)值。

權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIM幾點(diǎn)說(shuō)明49權(quán)威知識(shí)庫(kù)-OMIMGEMDatabase/GEMDatabase/index.asp遺傳學(xué)教育資料（GeneticEducationMaterials，GEM）是一個(gè)可檢索的公共衛(wèi)生遺傳學(xué)政策文件和臨床遺傳學(xué)教育資料的目錄。該網(wǎng)站是美國(guó)國(guó)立新生兒篩檢和遺傳學(xué)資源中心（NationalNewbornScreeningandGeneticsResourceCenter，NNSGRC）的項(xiàng)目，由美國(guó)衛(wèi)