Medip-seq甲基化測序分析流程

#流程大放送#MeDIP-seq測序知音無限介紹MeDIP-Seq全稱MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,即甲基化DNA免疫共沉淀測序。該種測序方法通過使用 5'-甲基胞嘧啶抗體特異性抓去樣本中甲基化程度高的DNA片段，并對富集的DNA片段進行高通量測序。相對于 BS-seq和RRBS-seq技術(shù)而言，MeDIP-seq技術(shù)以較小的數(shù)據(jù)量和較高的性價比，幫助科研人員檢測基因組上的甲基化區(qū)域。需要注意的是，MeDIP-seq生成DNA甲基化圖譜最小分辨率在 50-100bp左右，無法達到BS-seq和RRBS-seq的單堿基分辨率。該項技術(shù)可用于以下研究1、處于特定時期或特定處理條件下的樣本中，研究樣本中染色體 DNA甲基化模式；2、比較不同細胞、組織、樣本間的 DNA甲基化修飾模式的差異。3、疾病樣本中，與疾病發(fā)生發(fā)展相關(guān)的 DNA甲基化表觀數(shù)據(jù)處理和分析流程圖H?各甥亡甲基牝區(qū)城肓母定畳?濫于區(qū)輦內(nèi)前悄號值整正J H"差異口MA甲基「優(yōu)區(qū)域慣測.—?示例圖片展示Read*denaftyRead*denaftyimvsriout 創(chuàng)阿orni亡regi^na示例圖2DNA甲基化信號在不同類型染色體區(qū)域的分布s-?!<aV；ftIB?4-$口亠^In^s-lr0-SSQ.AS口-S3.45-ENDR^2MJRG2 dr何孤?！?曲的咽/芹F*iwIVaFam5JIlMCtPFE405-示例圖2特定基因區(qū)域內(nèi)甲基化信號展示 [1]N”船料Unique E(6077UnqtiBRe*MeqQmt*U.2S_A上?wUEU護d甲JlguQu示例圖示例圖3基因TSS位點周圍甲基化信號分布特征分類 [1]◎云生信「有實力.不怕比拼"7—J亠I口F s 廠軟著和專利+自建數(shù)據(jù)庫+ 個性化分析模塊團隊成員7用戶數(shù)*第計服務(wù)客戶戶55項,肺癌htemwJunfleaiiceidATabase 超100個卅近100名1。萬+5000名+暢登記頭"n15bttp:cadb.iiiLCTOS“碩博士分2015SR1€6820h昌肉J2http: crosci.com析團隊F2015SR14M86paoicdb.Eiucrosci.ccim2O1SSIU3885^肝疸：http斷時nrbin；n；nih.aovnuhmcd2<M?9733*2O15SR11O5血緒裁殖性狀：htn>www.ncbinlm.nili.floi-pubmfrd20707P28* "扭南芥：http:^T?twnctiirdm.iiUL.fiCivpubmed'21036573^藥物不康反 http:^-^v.ncbi.nkn.Qiti!.gsvpubmed21558322^掃一掃即可獲得更峯原創(chuàng)技術(shù)分辜圖片來源文獻[1].Kim,J.H.,etal..DeepsequencingrevealsdistinctpatternsofD