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文檔簡(jiǎn)介
基因的表達(dá)調(diào)控GeneRegulationPartII:Eukaryotes整理課件第七章真核生物基因的表達(dá)調(diào)控(GeneRegulationinEukaryotes)整理課件主要內(nèi)容第一節(jié)真核生物基因表達(dá)調(diào)控概述第二節(jié)DNA水平的表達(dá)調(diào)控第三節(jié)轉(zhuǎn)錄水平的表達(dá)調(diào)控第四節(jié)其他水平上的表達(dá)調(diào)控整理課件第一節(jié)真核生物基因表達(dá)調(diào)控概述(IntroductionofGeneRegulationinEukaryotes)整理課件一、調(diào)控的細(xì)胞學(xué)基礎(chǔ)
原核生物一般為自由生活的單細(xì)胞有機(jī)體。直接暴露在變化莫測(cè)的環(huán)境中,食物供應(yīng)無保障,只有根據(jù)環(huán)境條件的變化而改變其代謝途徑,才能維持自身的生存和繁衍。因而,營(yíng)養(yǎng)條件和環(huán)境因素是其基因表達(dá)調(diào)控的主要信號(hào)。真核生物主要由多細(xì)胞組成。食物來源和代謝途徑相對(duì)比較穩(wěn)定。但是由于它們多為多細(xì)胞有機(jī)體,在個(gè)體發(fā)育中出現(xiàn)細(xì)胞分化,而不同類型的細(xì)胞在質(zhì)和量上對(duì)蛋白質(zhì)的需求是不同的。因而,激素水平和發(fā)育階段是其基因表達(dá)調(diào)控的主要信號(hào)。原核生物真核生物整理課件真核生物和原核生物細(xì)胞結(jié)構(gòu)的不同,導(dǎo)致其基本生活方式完全不同,所以在基因表達(dá)調(diào)控上各具特點(diǎn)。
對(duì)于原核生物而言,既無充足的能源貯備,又無高等植物制造有機(jī)物的本領(lǐng),也不能象動(dòng)物一樣主動(dòng)獲取食物。因此,調(diào)控是為了適應(yīng)環(huán)境,獲取營(yíng)養(yǎng),達(dá)到生存最優(yōu)化。調(diào)控特點(diǎn)體現(xiàn)一個(gè)“快”字,快速適應(yīng)環(huán)境,獲取營(yíng)養(yǎng),合成必需蛋白質(zhì)、降解不必要成分。這是長(zhǎng)期進(jìn)化,獲得的適應(yīng)應(yīng)變能力。-------適應(yīng)環(huán)境獲取營(yíng)養(yǎng)、解決“溫飽”問題整理課件
真核基因表達(dá)調(diào)控的最顯著特征是程序調(diào)控、按“既定方針辦”。在特定時(shí)間和特定的細(xì)胞中激活特定的基因,從而實(shí)現(xiàn)“預(yù)定”的、有序的、不可逆轉(zhuǎn)的分化、發(fā)育過程,并使生物的組織和器官在一定的環(huán)境條件范圍內(nèi)保持正常生理功能,期間僅極少基因間接或直接受環(huán)境因素的影響。這一特點(diǎn)使真核在千變?nèi)f化的環(huán)境下,主要組織或器官仍能維持正常功能。------“處世不驚”整理課件二、真核生物基因表達(dá)調(diào)控的種類1、根據(jù)基因表達(dá)調(diào)控的性質(zhì)可分為兩大類:第一類是瞬時(shí)調(diào)控或稱為可逆調(diào)控,它相當(dāng)于原核細(xì)胞對(duì)環(huán)境條件變化所做出的反應(yīng)。瞬時(shí)調(diào)控包括某種底物或激素水平升降,及細(xì)胞周期不同階段中酶活性和濃度的調(diào)節(jié)。第二類是發(fā)育調(diào)控或稱不可逆調(diào)控,是真核基因調(diào)控的精髓部分,它決定了真核細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、發(fā)育的全部進(jìn)程。整理課件2、根據(jù)基因表達(dá)調(diào)控在同一事件中發(fā)生的先后次序又可分為:DNA水平的調(diào)控
GeneRegulationatDNAlevel轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
TranscriptionalRegulation轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控
PosttranscriptionalRegulation翻譯水平的調(diào)控
TranslationalRegulation蛋白質(zhì)加工水平的調(diào)控
ProteinmaturationandProcessing整理課件第二節(jié)DNA水平的基因表達(dá)調(diào)控(GeneRegulationatDNAlevel)基因丟失基因擴(kuò)增基因重排DNA甲基化狀態(tài)與調(diào)控染色體結(jié)構(gòu)與調(diào)控整理課件一、基因丟失(Geneloss)在細(xì)胞分化過程中,可以通過丟失掉某些基因而去除這些基因的活性。某些原生動(dòng)物、線蟲、昆蟲和甲殼類動(dòng)物在個(gè)體發(fā)育中,許多體細(xì)胞常常丟失掉整條或部分的染色體,只有將來分化產(chǎn)生生殖細(xì)胞的那些細(xì)胞一直保留著整套的染色體。例如:在蛔蟲胚胎發(fā)育過程中,有27%DNA丟失。在高等動(dòng)植物中,尚未發(fā)現(xiàn)類似現(xiàn)象。
整理課件二、基因擴(kuò)增(Geneamplification)
基因擴(kuò)增是指某些基因的拷貝數(shù)專一性增大的現(xiàn)象。它使得細(xì)胞在短期內(nèi)產(chǎn)生大量的基因產(chǎn)物以滿足生長(zhǎng)發(fā)育的需要,是基因活性調(diào)控的一種方式。例如:非洲爪蟾的卵母細(xì)胞中原有rDNA約500個(gè)拷貝,在減數(shù)分裂Ⅰ的粗線期,基因開始迅速?gòu)?fù)制,到雙線期拷貝數(shù)約為200萬個(gè),擴(kuò)增近4000倍,可用于合成1012個(gè)核糖體,以滿足卵裂期和胚胎期合成大量蛋白質(zhì)的需要。整理課件三、基因重排(genere-arrangement)
將一個(gè)基因從遠(yuǎn)離啟動(dòng)子的地方移到距它很近的位點(diǎn)從而啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄,這種方式被稱為基因重排。通過基因重排調(diào)節(jié)基因活性的典型例子是免疫球蛋白結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)。整理課件免疫球蛋白由B-淋巴細(xì)胞合成,其肽鏈主要由可變區(qū)(V區(qū))、恒定區(qū)(C區(qū))以及兩者之間的連接區(qū)(J區(qū))組成。整理課件人類基因組中免疫球蛋白基因主要片段的數(shù)量比較所有Ig分子都含有兩類輕鏈中的一類,即κ型或λ型。整理課件V、C和J基因片段在胚胎細(xì)胞中相隔較遠(yuǎn)。編碼產(chǎn)生免疫球蛋白的細(xì)胞發(fā)育分化時(shí),通過染色體內(nèi)DNA重組把4個(gè)相隔較遠(yuǎn)的基因片段連接在一起,從而產(chǎn)生了具有表達(dá)活性的免疫球蛋白基因。整理課件四、DNA的甲基化與基因活性調(diào)控DNA甲基化是最早發(fā)現(xiàn)的修飾途徑之一,存在于所有高等生物中。DNA甲基化能關(guān)閉某些基因的活性,而去甲基化則誘導(dǎo)了基因的重新活化與表達(dá)。
DNA甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。整理課件1.DNA甲基化的主要形式DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤(N6-mA)及7-甲基鳥嘌呤(7-mG)。整理課件真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出現(xiàn)在CpG、CpXpG、CCA/TGG和GATC中。其中,CpG二核苷酸通常成串出現(xiàn)在DNA上,因而被稱為CpG島(CpGisland)。它們大多位于結(jié)構(gòu)基因啟動(dòng)子的核心序列和轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),其中有60~90%的CpG被甲基化,。整理課件2、真核生物甲基化酶的分類真核生物細(xì)胞內(nèi)存在兩種甲基化酶活性:日常型(maintenance)甲基轉(zhuǎn)移酶:在甲基化母鏈指導(dǎo)下可使半甲基化的DNA甲基化。例如:DNA復(fù)制之后新鏈的甲基化。從頭合成(denovosynthesis)甲基轉(zhuǎn)移酶:催化未甲基化的CpG成為mCpG,不需要母鏈指導(dǎo),但速度很慢。整理課件日常型甲基轉(zhuǎn)移酶引起的半甲基化DNA的甲基化整理課件3、甲基化抑制基因轉(zhuǎn)錄的機(jī)制DNA甲基化會(huì)導(dǎo)致某些區(qū)域DNA構(gòu)象改變,使染色質(zhì)高度螺旋化,凝縮成團(tuán),直接影響了轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)子區(qū)DNA的結(jié)合效率。DNA的甲基化不利于模板與RNA聚合酶的結(jié)合,從而降低轉(zhuǎn)錄活性。甲基化的CpG可以通過與甲基化CpG結(jié)合蛋白1(MethylCpG-bindingprotein1,MeCP1)的結(jié)合間接影響轉(zhuǎn)錄因子與DNA的結(jié)合。整理課件甲基化對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響整理課件4、DNA甲基化程度與轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子的關(guān)系對(duì)弱啟動(dòng)子來說,少量甲基化就能使其完全失去轉(zhuǎn)錄活性。當(dāng)這類啟動(dòng)子被增強(qiáng)時(shí),即使不去甲基化也可以恢復(fù)其轉(zhuǎn)錄活性。甲基化密度較高時(shí),即使增強(qiáng)后的啟動(dòng)子仍無轉(zhuǎn)錄活性。
甲基化對(duì)轉(zhuǎn)錄的抑制強(qiáng)度與甲基化CpG結(jié)合蛋白因子MeCP1結(jié)合DNA的能力成正相關(guān),甲基化的密度和啟動(dòng)子強(qiáng)度之間的平衡決定了該啟動(dòng)子是否具有轉(zhuǎn)錄活性。整理課件甲基化對(duì)基因轉(zhuǎn)錄影響模式圖整理課件5、DNA甲基化對(duì)基因表達(dá)的其他影響DNA甲基化通過對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的抑制,可直接參與細(xì)胞分化和個(gè)體發(fā)育。隨著細(xì)胞的分化和個(gè)體發(fā)育,當(dāng)需要某些基因保持“沉默”時(shí),它們將迅速被甲基化,若需要恢復(fù)轉(zhuǎn)錄活性,則去甲基化。DNA去甲基化有兩種方式:被動(dòng)途徑:一種核因子可以粘附于上DNA,使粘附點(diǎn)附近的DNA不能被完全甲基化,從而阻斷甲基化酶的作用。主動(dòng)途徑:是由去甲基酶的作用,將DNA的甲基基團(tuán)移去。整理課件五、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)調(diào)控1、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響在細(xì)胞分裂間期的染色質(zhì)的形態(tài)不均勻,根據(jù)其形態(tài)及染色特點(diǎn)可分為2類:常染色質(zhì):呈疏松的環(huán)狀,電鏡下表現(xiàn)為淺染;
異染色質(zhì):呈現(xiàn)凝縮狀態(tài),電鏡下表現(xiàn)為深染。整理課件
轉(zhuǎn)錄發(fā)生時(shí),染色質(zhì)需要在特定的區(qū)域解旋或松弛,導(dǎo)致基因暴露,轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)子區(qū)DNA結(jié)合,起始基因轉(zhuǎn)錄。因此,染色質(zhì)呈疏松或緊密結(jié)構(gòu),即是否處于“活化狀態(tài)”是決定RNA聚合酶能否有效行使轉(zhuǎn)錄功能的關(guān)鍵。整理課件2、組蛋白和核小體對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響組蛋白扮演了非特異性阻遏蛋白的作用。組蛋白與DNA結(jié)合阻止DNA上基因的轉(zhuǎn)錄,去除組蛋白基因又能夠恢復(fù)轉(zhuǎn)錄;核小體結(jié)構(gòu)影響基因轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄活躍的區(qū)域也常缺乏核小體的結(jié)構(gòu)。整理課件第三節(jié)轉(zhuǎn)錄水平的基因表達(dá)調(diào)控(TranscriptionalRegulation)整理課件真核基因表達(dá)調(diào)控主要也是在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行的,受大量特定的順式作用元件(cis-actingelement)和反式作用因子(trans-actingfactor)的調(diào)控。真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控大多數(shù)是通過順式作用元件和反式作用因子復(fù)雜的相互作用來實(shí)現(xiàn)的。引言整理課件一、真核生物的順式作用元件定義:指對(duì)基因表達(dá)有調(diào)節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響與其自身同處在一個(gè)DNA分子上的基因。例如:?jiǎn)?dòng)子、增強(qiáng)子、沉默子等整理課件1、啟動(dòng)子定義:在DNA分子中,RNA聚合酶能夠識(shí)別、結(jié)合并導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄起始的序列。核心啟動(dòng)子和上游啟動(dòng)子元件(Ⅱ類)整理課件2、增強(qiáng)子(Enhancer)定義:指能使與它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯增加的DNA序列。作為基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)元件,增強(qiáng)子通常具有下列性質(zhì):①增強(qiáng)效應(yīng)十分明顯,一般能使基因轉(zhuǎn)錄頻率增加10-200倍;②增強(qiáng)效應(yīng)與其位置和取向無關(guān)。不論增強(qiáng)子以什么方向排列(5′→3′或3′→5′),甚至和靶基因相距3kb,或在靶基因下游,均表現(xiàn)出增強(qiáng)效應(yīng);整理課件③大多為重復(fù)序列,一般長(zhǎng)約50bp,其內(nèi)部常含有一個(gè)核心序列:(G)TGGA/TA/TA/T(G),該序列是產(chǎn)生增強(qiáng)效應(yīng)時(shí)所必需的;④增強(qiáng)效應(yīng)有嚴(yán)密的組織和細(xì)胞特異性,說明增強(qiáng)子只有與特定的蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)錄因子)相互作用才能發(fā)揮其功能;⑤沒有基因?qū)R恍?,可以在不同的基因組合上表現(xiàn)增強(qiáng)效應(yīng);⑥許多增強(qiáng)子還受外部信號(hào)的調(diào)控,如:金屬硫蛋白的基因啟動(dòng)區(qū)上游所帶的增強(qiáng)子,就可以對(duì)環(huán)境中的鋅、鎘濃度做出反應(yīng)。整理課件增強(qiáng)子的作用原理是什么呢?增強(qiáng)子可能有如下3種作用機(jī)制:①影響模板附近的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),導(dǎo)致DNA雙螺旋彎折或在反式因子的參與下,以蛋白質(zhì)之間的相互作用為媒介形成增強(qiáng)子與啟動(dòng)子之間“成環(huán)”連接,活化基因轉(zhuǎn)錄;整理課件②將模板固定在細(xì)胞核內(nèi)特定位置,如連接在核基質(zhì)上,有利于DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶改變DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的張力,促進(jìn)RNA聚合酶在DNA鏈上的結(jié)合和滑動(dòng);③增強(qiáng)子區(qū)可以作為反式作用因子或RNA聚合酶進(jìn)入染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的“入口”。整理課件3、沉默子(Silencer)為負(fù)性調(diào)節(jié)元件,當(dāng)其結(jié)合特異蛋白因子時(shí),對(duì)基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。最早在酵母中發(fā)現(xiàn),可不受序列方向的影響,也能遠(yuǎn)距離發(fā)揮作用。整理課件4、應(yīng)答元件(ResponseElement)能與某個(gè)(類)專一蛋白因子結(jié)合,從而控制基因特異表達(dá)的DNA上游序列稱為應(yīng)答元件(ResponseElement)。含有短的共有序列;在不同基因中,拷貝相似,有時(shí)有多個(gè)拷貝;與轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)距離不固定,一般位于上游元件或增強(qiáng)子內(nèi);熱激應(yīng)答元件(heatshockresponseelement,HSE)糖皮質(zhì)應(yīng)答元件(glucocorticoidresponseelement,GRE)金屬應(yīng)答元件(metalresponseelement,MRE)常見的應(yīng)答元件有:整理課件二、真核生物的反式作用因子反式作用因子是參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的蛋白因子,能直接地或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件上,與順式作用元件一起對(duì)轉(zhuǎn)錄起調(diào)控作用。通過蛋白質(zhì)-DNA,蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是其發(fā)揮功能的基礎(chǔ)。整理課件1、反式作用因子的分類(1)通用反式作用因子:在一般細(xì)胞中普遍存在,主要識(shí)別啟動(dòng)子的核心成分。如識(shí)別TATA框的TBP;識(shí)別GC框的SP1;識(shí)別八聚體核苷酸的Oct-1等;(2)特異反式作用因子:存在于特殊組織與細(xì)胞中的反式作用因子。如:淋巴細(xì)胞中的Oct-2;(3)誘導(dǎo)型因子:與應(yīng)答元件相結(jié)合的反式作用因子。如:與激素應(yīng)答元件GRE結(jié)合的糖皮質(zhì)激素;與熱激應(yīng)答元件特異性結(jié)合的熱激因子(HSF)等。整理課件2、反式作用因子中的功能結(jié)構(gòu)域3個(gè)主要的功能結(jié)構(gòu)域:(1)DNA識(shí)別結(jié)合域(DNA-bindingdomain)與順式作用元件結(jié)合的結(jié)構(gòu)區(qū)域,主要起與DNA結(jié)合的作用。(2)轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域(transcriptionalactivationdomain)
與其他蛋白因子結(jié)合,參與募集啟動(dòng)子結(jié)合蛋白和轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體,控制基因轉(zhuǎn)錄活化的結(jié)構(gòu)區(qū)域。(3)聯(lián)結(jié)區(qū)域(connector)整理課件
反式作用因子的“DNA結(jié)合域”和“活化結(jié)構(gòu)域”是獨(dú)立發(fā)揮作用的。DNA結(jié)合域的功能是把活化結(jié)構(gòu)域“拴在”起始復(fù)合體附近,使之能夠發(fā)揮活化轉(zhuǎn)錄的作用。DNA結(jié)合域和活化結(jié)構(gòu)域之間的“聯(lián)結(jié)區(qū)域”是具有足夠柔性的,這樣無論DNA結(jié)合域所結(jié)合的具體位點(diǎn)在哪里,都能使活化結(jié)構(gòu)域找到其靶蛋白。整理課件整理課件3、反式作用因子中的DNA識(shí)別結(jié)合域反式作用因子是能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(Helix-turn-helix,H-T-H)鋅指(Zincfinger)結(jié)構(gòu)堿性-亮氨酸拉鏈(basic-Leucinezippers)堿性-螺旋-環(huán)-螺旋(basic-helix-loop-helix)整理課件螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(H-T-H)結(jié)構(gòu)該結(jié)構(gòu)域主要包含兩個(gè)或以上α-螺旋區(qū)和螺旋區(qū)中間的轉(zhuǎn)折區(qū)。主要通過一個(gè)靠C端的α-螺旋與DNA雙螺旋大溝結(jié)合。整理課件鋅指(Zincfinger)結(jié)構(gòu)是一種常出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白中的結(jié)構(gòu)。是由一個(gè)含有大約30個(gè)氨基酸的環(huán)和一個(gè)與環(huán)上的4個(gè)Cys或2個(gè)Cys與2個(gè)His配位的Zn構(gòu)成,形成的結(jié)構(gòu)像手指狀。整理課件Cys2/Cys2鋅指Cys2/His2鋅指甾體激素受體SP1,TFⅢA整理課件具有Cys2/Cys2鋅指區(qū)的轉(zhuǎn)錄因子整理課件典型的類固醇激素受體結(jié)構(gòu)示意圖整理課件一些具有Cys2/His2鋅指區(qū)的轉(zhuǎn)錄因子和蛋白質(zhì)整理課件轉(zhuǎn)錄因子SP1(GC盒)、連續(xù)的3個(gè)鋅指重復(fù)結(jié)構(gòu)。整理課件TFIIIA結(jié)構(gòu)域示意圖整理課件堿性-亮氨酸拉鏈α-螺旋結(jié)構(gòu)上每6個(gè)氨基酸就有1個(gè)亮氨酸殘基,這些亮氨酸出現(xiàn)在-螺旋的一個(gè)方向,每?jī)蓚€(gè)蛋白組成一個(gè)二聚體,使亮氨酸相對(duì)排列,形成拉鏈樣結(jié)構(gòu);在拉鏈區(qū)的氨基端有約30個(gè)氨基酸殘基的堿性區(qū)(富含賴氨酸和精氨酸)。此區(qū)的作用是與DNA結(jié)合,它也形成-螺旋。整理課件不同轉(zhuǎn)錄因子的亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)氨基酸組成圖整理課件堿性-螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH)蛋白質(zhì)的C端的氨基酸殘基形成兩個(gè)α-螺旋,中間被非螺旋的環(huán)狀結(jié)構(gòu)隔開,蛋白質(zhì)的N端是堿性區(qū),為DNA結(jié)合區(qū)。堿性-螺旋-環(huán)-螺旋類蛋白通常也是組成二聚體的形式,這才具有結(jié)合DNA的能力。整理課件二聚體bHLH蛋白與DNA結(jié)合模式圖整理課件4、常見的轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域酸性α-螺旋結(jié)構(gòu)域(acidicα–helixdomain)富含谷氨酰胺結(jié)構(gòu)域(glutamine-richdomain)富含脯氨酸結(jié)構(gòu)域(proline-richdomain)一般是DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域以外的30-100氨基酸殘基組成,主要包括以下幾種特征性結(jié)構(gòu):整理課件(1)酸性α-螺旋(acidicα-helix)/帶負(fù)電荷的螺旋結(jié)構(gòu)該結(jié)構(gòu)域含有由酸性氨基酸殘基組成的保守序列,多呈帶負(fù)電荷的親脂性α-螺旋。包含這種結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子有GAL4、GCN4和糖皮質(zhì)激素受體等。(2)谷氨酰胺豐富區(qū)(glutamine-richdomain)SP1是啟動(dòng)子GC盒的結(jié)合蛋白,共有4個(gè)參與轉(zhuǎn)錄活化的區(qū)域,其中最強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄活化域含25%左右的谷氨酰胺。酵母的HAP1、HAP2和GAL2及哺乳動(dòng)物的OCT-1、OCT-2、Jun、AP2和SRF也含有這種結(jié)構(gòu)域。(3)脯氨酸豐富區(qū)(proline-richdomain)CTF家族(包括CTF-1、CTF-2、CTF-3)的C末端與其轉(zhuǎn)錄激活功能有關(guān),含有20-30%的脯氨酸殘基,其它如Oct2、哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)錄因子中也富含這種結(jié)構(gòu)。整理課件幾種常見的轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域整理課件三、真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的模式細(xì)胞是生命活動(dòng)的基本單位。細(xì)胞通過DNA的復(fù)制和細(xì)胞分裂將本身所固有的遺傳信息由親代傳至子代,實(shí)現(xiàn)增殖繁衍。同時(shí),它們還不斷地“感知”環(huán)境變化,并對(duì)環(huán)境變化作出特定的應(yīng)答。整理課件
細(xì)胞應(yīng)答可以分為3個(gè)階段:感知外界信息(信息由細(xì)胞膜至核內(nèi))
染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的改變,相應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子的活化
特定基因的表達(dá)過程問題1:信號(hào)是如何順利通過細(xì)胞膜和核膜的阻隔到達(dá)核內(nèi),從而影響基因表達(dá)的特定區(qū)域?整理課件目前認(rèn)為,細(xì)胞表面受體與配體分子的高親和力特異性結(jié)合,能誘導(dǎo)受體蛋白構(gòu)象變化,使細(xì)胞胞外信號(hào)順利通過質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。受體(Receptor):是細(xì)胞膜上或細(xì)胞內(nèi)能特別識(shí)別生物活性分子并與之結(jié)合的成分。它能把識(shí)別和接受的信號(hào)正確無誤地放大并傳遞到細(xì)胞內(nèi)部,進(jìn)而引起生物學(xué)效應(yīng)的特殊蛋白質(zhì),個(gè)別是糖脂。能與受體呈專一性結(jié)合的生物活性分子則稱為配體。配體(Ligand):整理課件真核細(xì)胞主要跨膜信號(hào)傳導(dǎo)途徑整理課件細(xì)胞表面的三類受體示意圖整理課件胞外信號(hào)通過細(xì)胞膜和核膜的阻隔到達(dá)核內(nèi)后,反式作用因子被活化而特異性的結(jié)合到特定DNA序列(順式作用元件)上。同時(shí),通過自身具有的轉(zhuǎn)錄活化結(jié)構(gòu)域活化其他相關(guān)因子,從而發(fā)揮轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。問題2:反式作用因子是如何被活化呢?整理課件真核生物反式作用因子活性調(diào)節(jié)的主要方式整理課件1、蛋白質(zhì)磷酸化介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)及基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控2、蛋白質(zhì)乙?;瘜?duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響3、激素對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響4、熱激蛋白對(duì)基因表達(dá)的影響5、金屬硫蛋白基因的多重調(diào)控轉(zhuǎn)錄調(diào)控實(shí)例:整理課件第四節(jié)其他水平上的調(diào)控(GeneRegulationontheotherlevels)整理課件在真核生物基因表達(dá)的調(diào)控中,DNA水平和轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控占有十分重要的地位,但其他水平上的調(diào)控也不能忽視。這些調(diào)控包括:RNA的加工成熟、翻譯水平的調(diào)控以及翻譯后水平的調(diào)節(jié)等多個(gè)環(huán)節(jié)的調(diào)控。引言整理課件一、轉(zhuǎn)錄后加工的多樣性真核生物的基因可以按其轉(zhuǎn)錄后的加工方式分為兩大類:簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位和復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位。1、簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位:這類基因只編碼產(chǎn)生一個(gè)多肽,其原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物有時(shí)需要加工,有時(shí)則不需要加工。整理課件第一種簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位:基因沒有內(nèi)含子,mRNA3′末端沒有ploy(A),基本不存在轉(zhuǎn)錄后加工問題。如:組蛋白基因。第二種簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位:基因沒有內(nèi)含子,mRNA不需要剪接,但需要加ploy(A)。如:α-干擾素和許多酵母蛋白質(zhì)基因。第三種簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位:這類基因都有內(nèi)含子,也需要加ploy(A),但加工剪接后只產(chǎn)生一種有功能的mRNA,所以仍然是簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位。如:大多數(shù)核基因。簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位又可以分為3個(gè)亞類:整理課件簡(jiǎn)單轉(zhuǎn)錄單位轉(zhuǎn)錄后加工的3種主要形式整理課件組成型剪接:一個(gè)基因的mRNA前體按一種方式剪接,產(chǎn)生一種mRNA,翻譯成一種蛋白質(zhì)。整理課件2、復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位:其原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物能通過多種不同方式,加工成兩種或兩種以上的mRNA。主要是一些編碼組織和發(fā)育特異性蛋白質(zhì)/多肽的基因。整理課件(1)利用多個(gè)5′端轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)整理課件(2)選用不同的剪接位點(diǎn)產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)可變剪接(選擇性剪接,alternativesplicing):有些基因的mRNA前體,按不同方式剪接,產(chǎn)生兩種以上mRNA,翻譯產(chǎn)生多種蛋白質(zhì)。其實(shí)質(zhì)是5′供體與3′受體剪接點(diǎn)的選擇搭配問題。整理課件大鼠肌鈣蛋白(Torponin)基因在不同的發(fā)育階段以及在不同橫紡肌種類中,由于不同的選擇性剪接產(chǎn)生不同的肌鈣蛋白。整理課件(3)既利用多個(gè)5′端轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),又選用不同的剪接位點(diǎn),產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。整理課件(4)利用多個(gè)ploy(A)位點(diǎn)和不同的剪接位點(diǎn),產(chǎn)生不同的蛋質(zhì)。整理課件(5)無剪接,有多個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)和/或加poly(A)位點(diǎn)的基因。例如:二氫葉酸還原酶基因和酵母乙醇脫氫酶基因都具有不同的5′端和ploy(A)位點(diǎn)。大鼠α-2μ-珠蛋白基因、雞波形蛋白基因和人N-ras基因均含有多個(gè)ploy(A)位點(diǎn),而雞溶菌酶基因和酵母蔗糖酶基因則擁有多個(gè)5′端。整理課件二、翻譯水平的調(diào)控1、mRNA運(yùn)輸控制2、mRNA穩(wěn)定性的調(diào)控3、mRNA結(jié)構(gòu)4、翻譯的起始調(diào)節(jié)5、選擇性翻譯6、翻譯的自我調(diào)節(jié)整理課件1、mRNA運(yùn)輸控制一般來說,合成的mRNA只有大約1/12能被轉(zhuǎn)運(yùn)出核進(jìn)入細(xì)胞質(zhì),50%左右的在核內(nèi)降解,還有一些留在核內(nèi)。換句話說,真核生物可以對(duì)從細(xì)胞核轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)中的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物數(shù)量進(jìn)行調(diào)節(jié),這種調(diào)節(jié)方式被稱為運(yùn)輸控制(TransportControl)。整理課件2、mRNA的穩(wěn)定性與基因表達(dá)調(diào)控真核生物能否長(zhǎng)時(shí)間、及時(shí)利用成熟的mRNA分子翻譯出蛋白質(zhì)以供生長(zhǎng)、發(fā)育的需要,是與mRNA的穩(wěn)定性密切相關(guān)的。高等真核生物細(xì)胞質(zhì)中所有的RNA都要受到降解控制(DegradationControl),不同mRNA降解效率不同。mRNA的選擇性降解主要由于核酸酶和mRNA內(nèi)部結(jié)構(gòu)相互作用的結(jié)果。有時(shí),加入調(diào)節(jié)物可以增加mRNA穩(wěn)定性。整理課件不加入催乳素時(shí),體系中的酪蛋白mRNA在1-2小時(shí)內(nèi)降解50%;而加入催乳素40小時(shí)后,酪蛋白mRNA才降解50%。例子1:催乳素延緩酪蛋白(casein)mRNA的降解整理課件例子2:人鐵蛋白及轉(zhuǎn)運(yùn)鐵蛋白受體mRNA翻譯調(diào)控轉(zhuǎn)鐵蛋白受體(TfR)和鐵蛋白分別負(fù)責(zé)鐵吸收和鐵解毒。這兩個(gè)mRNA上存在鐵應(yīng)答元件(Ironresponseelement,IRE)。IRE與IRE結(jié)合蛋白(IRE-BP)相互作用控制了這兩個(gè)mRNA的翻譯效率。整理課件當(dāng)細(xì)胞缺鐵時(shí),IRE-BP與IRE具有高親和力。IRE-BP與鐵蛋白mRNA的5′非翻譯區(qū)中的IRE結(jié)合,有效地阻止鐵蛋白mRNA的翻譯。與此同時(shí),轉(zhuǎn)鐵蛋白受體mRNA上3′非翻譯區(qū)中的IRE也與IREBP特異結(jié)合,有效地阻止轉(zhuǎn)鐵蛋白受體mRNA的降解,促進(jìn)轉(zhuǎn)鐵蛋白受體蛋白的合成。細(xì)胞高鐵時(shí)細(xì)胞缺鐵時(shí)鐵吸收鐵解毒整理課件3、mRNA的結(jié)構(gòu)(1)mRNA的5′非編碼序列對(duì)翻譯水平的影響5′帽結(jié)構(gòu)是否存在和易于接近eIF-4F的程度對(duì)翻譯效率有著明顯的影響。起始密碼子AUG的位置和其側(cè)翼的序列對(duì)翻譯的效率也有影響。
5′端非翻譯區(qū)的長(zhǎng)度也會(huì)影響到翻譯的效率和起始的精確性,當(dāng)此區(qū)長(zhǎng)度在17-80nt之間時(shí),體外翻譯效率與其長(zhǎng)度變成正比。在5′UTR中存在堿基配對(duì)
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