大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤轉(zhuǎn)錄譜比較及印記基因鑒定研究的開題報告

大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤轉(zhuǎn)錄譜比較及印記基因鑒定研究的開題報告開題報告一、研究背景和意義胎盤是母體和胎兒之間的重要交流器官，不僅可以提供營養(yǎng)、氧氣和排泄代謝產(chǎn)物，還可以通過分泌多種激素和生長因子調(diào)節(jié)胎兒和母體的代謝和免疫狀態(tài)。研究胎盤的轉(zhuǎn)錄譜可以揭示其在胎兒生長發(fā)育和母體適應(yīng)妊娠過程中的分子調(diào)控機制。鑒定胎盤印記基因，即只在父或母親的基因中表達的基因，可以幫助確定胎兒遺傳信息的來源，監(jiān)測母體和胎兒的健康狀況。大白豬和二花臉豬是常見的養(yǎng)殖豬種，其產(chǎn)仔數(shù)量和品質(zhì)對養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展至關(guān)重要。然而，這兩個品種在妊娠過程中的胎盤轉(zhuǎn)錄譜和印記基因表達差異仍未被充分研究。本研究旨在借助高通量測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析手段，比較大白豬和二花臉豬胎盤轉(zhuǎn)錄譜的差異，鑒定印記基因并分析其在豬妊娠適應(yīng)性和遺傳調(diào)控中的作用，為育種和豬健康管理提供科學(xué)依據(jù)。二、研究內(nèi)容和方法1.研究內(nèi)容(1)比較大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤轉(zhuǎn)錄譜差異；(2)鑒定大白豬和二花臉豬胎盤中的印記基因；(3)分析印記基因在豬妊娠和遺傳調(diào)控中的作用。2.研究方法(1)實驗動物和樣本采集：選取12頭大白豬和12頭二花臉豬，分別從妊娠后期胎盤中提取RNA樣本。(2)RNA測序和數(shù)據(jù)分析：采用IlluminaHiSeq平臺進行RNA測序，利用STRING、GO和KEGG數(shù)據(jù)庫進行轉(zhuǎn)錄譜分析。通過基因家族、調(diào)節(jié)因子和信號通路分析揭示差異表達基因的生物學(xué)功能。利用DIP-seq技術(shù)鑒定印記基因。(3)實時熒光定量PCR檢測:利用實時熒光定量PCR技術(shù)對轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果進行驗證。三、預(yù)期結(jié)果和創(chuàng)新性(1)比較大白豬和二花臉豬妊娠后期胎盤轉(zhuǎn)錄譜的差異，鑒定差異表達基因和相關(guān)信號通路，為豬生殖管理和育種提供科學(xué)依據(jù)。(2)鑒定大白豬和二花臉豬胎盤中的印記基因，探討其在豬妊娠和遺傳調(diào)控中的作用，為養(yǎng)殖業(yè)健康管理提供理論支持。(3)本研究采用高通量測序技術(shù)和生物信息學(xué)分析手段，為研究胎盤轉(zhuǎn)錄譜差異和印記基因鑒定提供了新思路和新方法，具有一定的創(chuàng)新性。四、研究進度本研究計劃于2021年6月開始，數(shù)據(jù)分析和實驗驗證預(yù)計完成時間為2022年6月，論文撰寫預(yù)計在2022年9月前完成。五、參考文獻1.FowdenAL,ForheadAJ.Endocrineregulationoffeto-placentalgrowth.HormRes.2009;72(5):257-265.2.ChelbiST,VaimanD.Geneticandepigeneticfactorscontributetotheonsetofpreeclampsia.MolCellEndocrinol.2008;282(1-2):120-129.3.TunsterSJ,OddieTH,JohnRM.TheimprintedgeneGrb10isaregulatorofembryonicandplacentalgrowthinmice.BiolReprod.2011;84(1):122-130.4.WangL,Johnson-RestrepoB,ClarkL,etal.Identificationofaplacental-specificIGF-IIgeneanditspotentialroleinfetalgrowth.MolEndocrinol.1999;13(12):2079-2090.6.CuiSS,KongF,WangXY,etal.Identificationandcomparisonofimprinting-relateddifferentiallyexpressedgenes