湖羊高繁殖力相關(guān)基因mRNA表達(dá)水平與多態(tài)性分析的開題報(bào)告

湖羊高繁殖力相關(guān)基因mRNA表達(dá)水平與多態(tài)性分析的開題報(bào)告摘要：湖羊是我國特有的肉、奶雙用羊種，具有繁殖力強(qiáng)、矮小、多產(chǎn)、品質(zhì)優(yōu)異等特點(diǎn)，但其繁殖機(jī)制仍然不完全清楚。本研究旨在探究湖羊繁殖力相關(guān)基因mRNA表達(dá)水平與多態(tài)性之間的關(guān)系，為湖羊的繁殖機(jī)制研究提供新的思路和理論依據(jù)。關(guān)鍵詞：湖羊；繁殖力；基因表達(dá)；多態(tài)性一、研究背景湖羊是我國特有的肉、奶雙用羊種，廣泛分布于湖南、湖北、江西、四川、貴州、云南等地區(qū)。湖羊以其繁殖力強(qiáng)、矮小、多產(chǎn)、品質(zhì)優(yōu)異等特點(diǎn)，備受養(yǎng)殖業(yè)者關(guān)注。當(dāng)前，隨著繁殖生理學(xué)的發(fā)展，人們對于羊的繁殖機(jī)制也越來越關(guān)注。以往的研究主要是針對單個基因的功能進(jìn)行研究，如FSH、LH、GnRH、等基因，但這些基因在不同種群中表現(xiàn)出的作用是不同的，因此，單克隆的基因研究方法難以全面解釋湖羊繁殖特性。近年來，隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和羊基因序列的完整、公開，利用基因組學(xué)和生物信息學(xué)手段對于湖羊繁殖機(jī)制的研究將更加準(zhǔn)確、直觀、全面。二、研究內(nèi)容本研究主要針對湖羊基因組序列中與繁殖力相關(guān)的基因，選取其中的mRNA，分別在孕早期、孕中期、孕晚期等不同時期進(jìn)行采集，并通過RT-qPCR技術(shù)檢測基因mRNA表達(dá)水平的變化趨勢。同時，利用高通量測序技術(shù)構(gòu)建湖羊mRNA文庫，并利用軟件分析mRNA的多態(tài)性，即SNP和InDel位點(diǎn)，以探究這些多態(tài)性與湖羊繁殖力之間的關(guān)系。三、研究意義通過本研究，可以深入了解湖羊繁殖力相關(guān)基因在不同孕期的mRNA表達(dá)水平變化趨勢，并對mRNA多態(tài)性分析結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析，進(jìn)一步分析其對湖羊繁殖力的影響，為湖羊的高效繁殖提供理論支持。四、研究方法1.樣本采集：采集湖羊不同孕期的卵巢、輔助生殖腺和妊娠子宮組織。2.mRNAs提?。翰捎迷噭┖刑崛〗M織總RNA，然后通過Oligo(dT)磁珠富集mRNA.3.RT-qPCR：通過RT-qPCR方法檢測mRNA表達(dá)水平的變化趨勢。4.高通量測序：構(gòu)建湖羊mRNA文庫，并使用IlluminaHiseq平臺，利用軟件分析mRNA的多態(tài)性，包括SNP和InDel位點(diǎn)。五、研究計(jì)劃1.每個孕期采集至少30只湖羊的組織樣本，共計(jì)采集90只左右湖羊組織。2.利用RT-qPCR技術(shù)檢測基因mRNA表達(dá)水平變化趨勢，并通過SPSS軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。3.利用高通量測序技術(shù)構(gòu)建mRNA文庫，并進(jìn)行基因型評估和組系分析，同時運(yùn)用軟件分析得到mRNA的SNP和InDel位點(diǎn)。4.對分析結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析，并討論分析結(jié)果與湖羊繁殖力的關(guān)聯(lián)。參考文獻(xiàn)：1.王英杰，潘華潔，楊筠.柴山羊GPR54基因單核苷酸多態(tài)性對其生殖性能的影響[J].獸類學(xué)報(bào)，2012，32（1）：091-098.2.P.Du，L.Li,C.Qian,etal.Transcriptomicanalysisrevealskeyregulatorsinvolvedinsheepovaryanduterusdevelopment[J].SciRep,2016,6:21642.3.X.Wang,H.Wang,L.Liu,etal.TranscriptomeanalysisrevealstheregulationoffetalandadultLeydigcellsatthe