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文檔簡介
第二章酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)2.1酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)的特點(diǎn)2.1.1酶的基本概念2.1.2酶的穩(wěn)定性及應(yīng)用特點(diǎn)酶是以活力、而不是以質(zhì)量購銷的。酶有不同的質(zhì)量等級(jí):工業(yè)用酶、食品用酶、醫(yī)藥用酶。酶的實(shí)際應(yīng)用中應(yīng)注意,沒有必要使用比工藝條件所需純度更高的酶。經(jīng)典酶學(xué)研究中,酶活力的測定是在反應(yīng)的初始短時(shí)間內(nèi)進(jìn)行的,并且酶濃度、底物濃度較低,且為水溶液,酶學(xué)研究的目的是探討酶促反應(yīng)的機(jī)制。工業(yè)上,為保證酶促反應(yīng)高效率完成,常需要使用高濃度的酶制劑和底物,且反應(yīng)要持續(xù)較長時(shí)間,反應(yīng)體系多為非均相體系,有時(shí)反應(yīng)是在有機(jī)溶劑中進(jìn)行。2.2均相酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)2.2.1酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)基礎(chǔ)可采用化學(xué)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)方法建立酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)方程。對(duì)酶促反應(yīng),有:
式中,
k:酶促反應(yīng)速率常數(shù);
r:酶促反應(yīng)速率;
rA:以底物A的消耗速率表示的酶促反應(yīng)速率;
rP:以產(chǎn)物P的生成速率表示的酶促反應(yīng)速率。對(duì)連鎖的酶促反應(yīng),
2.2.2單底物酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)2.2.2.1米氏方程根據(jù)酶-底物中間復(fù)合物假說,對(duì)單底物酶促反應(yīng),其反應(yīng)機(jī)制可表示為:快速平衡法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:幾點(diǎn)假設(shè):(1)CS>>CE,中間復(fù)合物ES的形成不會(huì)降低CS。(2)不考慮這個(gè)可逆反應(yīng)。(3)為快速平衡,為整個(gè)反應(yīng)的限速階段,因此ES分解成產(chǎn)物不足以破壞這個(gè)平衡。解之,得令則根據(jù)假設(shè)建立動(dòng)力學(xué)方程穩(wěn)態(tài)法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:幾點(diǎn)假設(shè):(1)CS>>CE,中間復(fù)合物ES的形成不會(huì)降低CS。(2)不考慮這個(gè)可逆反應(yīng)。(3)CS>>CE中間復(fù)合物ES一經(jīng)分解,產(chǎn)生的游離酶立即與底物結(jié)合,使中間復(fù)合物ES濃度保持衡定,即。解之,得令則根據(jù)以上假設(shè),可建立如下方程組米氏方程rrmaxrmax/2KmCS圖2-1
酶濃度一定時(shí)底物濃度對(duì)反應(yīng)速率的影響對(duì)米氏方程的討論:當(dāng)CS<<Km時(shí),,屬一級(jí)反應(yīng)。當(dāng)CS>>Km時(shí),,屬零級(jí)反應(yīng)。當(dāng)CS=Km時(shí),。Km在數(shù)量上等于反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度一半時(shí)的底物濃度。雙倒數(shù)法(LinewearBurk):對(duì)米氏方程兩側(cè)取倒數(shù),得
,以作圖,得一直線,直線斜率為,截距為,根據(jù)直線斜率和截距可計(jì)算出Km和rmax。-1/Km1/rmax1/r斜率-Km/rmax1/CS圖2-2雙倒數(shù)法求解Km和rmax
2.2.2.2抑制劑對(duì)酶促反應(yīng)速率的影響失活作用抑制作用
競爭性抑制
非競爭性抑制
競爭性抑制非競爭性抑制EISESI競爭性抑制反應(yīng)機(jī)理:快速平衡法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:
解之,得,式中:采用穩(wěn)態(tài)法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:解之,得式中:非競爭性抑制反應(yīng)機(jī)理快速平衡法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程
解之,得式中:穩(wěn)態(tài)法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:解之,得式中:競爭性抑制非競爭性抑制令可變形為:
可變形為:
令
競爭性抑制非競爭性抑制1/r1/CS1/rmax-1/Km-1/Km’1/r1/CS1/rmax-1/KmCI=0CI
1/rmax’CI=0CI
產(chǎn)物抑制:酶促反應(yīng)中,有時(shí)隨產(chǎn)物濃度提高,產(chǎn)物與酶形成復(fù)合物,阻礙了底物與酶的結(jié)合,從而降低了酶促反應(yīng)的速度。反應(yīng)機(jī)理:
快速平衡法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:解之,得式中:穩(wěn)態(tài)法推導(dǎo)動(dòng)力學(xué)方程:解之,得式中:可見,產(chǎn)物抵制屬于競爭性抵制底物抑制:對(duì)于某些酶促反應(yīng),當(dāng)?shù)孜餄舛容^高時(shí),反應(yīng)速率呈下降趨勢,稱為底物抑制。CSCSr底物抑制反應(yīng)機(jī)理:快速平衡法推導(dǎo)動(dòng)學(xué)方程:解之,得式中:2.2.3多底物酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)一般的多底物酶促反應(yīng)可表示為:這里討論:雙底物雙產(chǎn)物情況反應(yīng)機(jī)制:關(guān)鍵問題:底物A、B哪個(gè)先和酶結(jié)合?
任何一個(gè)都有可能先與酶結(jié)合(隨機(jī)機(jī)制)A先與酶結(jié)合或B先與酶結(jié)合兩底物同時(shí)與酶結(jié)合(可能性極?。╇S機(jī)機(jī)制(分支機(jī)制)EEBEAEABEPQEPEQE(不形成三元復(fù)合物)反應(yīng)模型EAE+A-A-P+P+B-BEQ-Q+QEEG
(EG:修飾過的酶)簡單機(jī)制EEAEAB+A-A+B-BEPQ-Q+QEPE-P+P雙底物酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)
反應(yīng)機(jī)理:解之,得式中:2.3固定化酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)2.3.1固定化酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)基礎(chǔ)2.3.1.1酶的固定化技術(shù)定義酶的固定化技術(shù)是將水溶性的酶分子通過一定的方式,如靜電吸附,共價(jià)鍵等與載體如角叉菜膠、離子交換樹脂等材料制成固相酶的技術(shù)。細(xì)胞的固定化技術(shù):為省去從微生物(或動(dòng)、植物)中提取酶的操作,確保酶的穩(wěn)定性,采用直接固定化微生物細(xì)胞、動(dòng)植物細(xì)胞、組織技術(shù)。
物理吸附法載體結(jié)合法離子結(jié)合法共價(jià)結(jié)合法
交聯(lián)法格子型包埋法微膠囊2.3.1.2酶和細(xì)胞固定化方法交聯(lián)法EOEEOOOE2.3.1.3固定化對(duì)酶性質(zhì)的影響底物專一性的改變穩(wěn)定性增強(qiáng)最適pH值和最適溫度變化動(dòng)力學(xué)參數(shù)的變化2.3.1.4影響固定化酶促反應(yīng)的主要因素
分子構(gòu)象的改變位阻效應(yīng)微擾效應(yīng)分配效應(yīng)(可用Kp
定量描述)鏈接擴(kuò)散效應(yīng)
(可定量描述)分配系數(shù)(Kp)鏈接
分配系數(shù):載體內(nèi)外底物(或其他物質(zhì))濃度之比。
Kp的測定:已知底物濃度(CS0
),體積(V0)的溶液中,放入不含底物的一定體積的載體,并保持適宜條件,當(dāng)達(dá)到平衡時(shí),測定載體外溶液的底物濃度(Cs)。2.3.2固定化酶促反應(yīng)過程分析2.3.2.1外部擴(kuò)散過程以表面固定化酶為例。CSCSS外擴(kuò)散過程分析外擴(kuò)散速率:
達(dá)到平衡時(shí),即
酶促反應(yīng)速率:
N,rrmaxNmax0CSSCS(CSS,rout)NmaxN,rrmax0
CSSCS(CSS,rout)Da準(zhǔn)數(shù):當(dāng)時(shí),過程為外擴(kuò)散控制。當(dāng)時(shí),過程為反應(yīng)控制。式中:表明C*為Da準(zhǔn)數(shù)的函數(shù),即(時(shí),)表明為C*的函數(shù),即
可見,Da準(zhǔn)數(shù)是決定效率因子和比濃度C*的唯一參數(shù),因而是表征傳質(zhì)過程對(duì)反應(yīng)速率影響的基本準(zhǔn)數(shù)。
Da準(zhǔn)數(shù)越小,固定化酶表面濃度越接近于主體濃度CS,越接近于1。Da準(zhǔn)數(shù)越大,固定化酶表面濃度越趨近于零,越小,越趨近于零。
為提高固定化酶外擴(kuò)散效率,應(yīng)設(shè)法減小Da準(zhǔn)數(shù)。減小Da準(zhǔn)數(shù)的措施:
1、降低固定化酶顆粒的粒徑,增大比表面積,但由于粒徑減小會(huì)伴隨壓降增加,因此應(yīng)用中綜合考慮,確定合適的粒徑。
2、使固定化酶表面流體處于湍流狀態(tài)以增大。2.3.2.2內(nèi)部擴(kuò)散過程具有大量內(nèi)孔的球形固定化酶顆粒Rdrr內(nèi)擴(kuò)散效率因子穩(wěn)定狀態(tài)下,對(duì)底物進(jìn)行物料衡算:
流入量-流出量=反應(yīng)量整理,得兩側(cè)同除
,得當(dāng)反應(yīng)符合米氏方程規(guī)律時(shí),故,令,,,上式可轉(zhuǎn)化為無因次形式,得邊界條件:,,該微分方程無解析解,只能用數(shù)值法求解。西勒準(zhǔn)數(shù)()
的物理意義是表面反應(yīng)速率與內(nèi)擴(kuò)散速率之比。對(duì)各類反應(yīng)動(dòng)力學(xué)與固定化酶的形狀,普遍化的的定義式為:引入無因次參數(shù),則無解析解,只有數(shù)值解。
見教材33頁圖2-10
內(nèi)擴(kuò)散效率因子in是和的函數(shù)。
對(duì)
in影響不大,影響
in的主要參數(shù)是西勒準(zhǔn)數(shù)
。如果,則不隨
變化,近似等于1,也就是說沒有內(nèi)部傳質(zhì)阻力,若,則,反應(yīng)為內(nèi)擴(kuò)散所限制。
為提高固定化酶內(nèi)擴(kuò)散效率,應(yīng)設(shè)法減小
。減小
的措施主要是適當(dāng)降低固定化酶顆粒粒徑。外擴(kuò)散過程內(nèi)擴(kuò)散過程
Da準(zhǔn)數(shù)是決定外擴(kuò)散效率的唯一參數(shù)。準(zhǔn)數(shù)是決定內(nèi)擴(kuò)散效率的主要參數(shù)。
Da準(zhǔn)數(shù)定義:西勒準(zhǔn)數(shù)定義:
外擴(kuò)散效率因子定義:
內(nèi)擴(kuò)散效率因子定義:
Da<<1,過程為反應(yīng)控制;
Da>>1,過程為外擴(kuò)散控制<<0.3時(shí),過程為反應(yīng)控制;>>0.3時(shí),過程為內(nèi)擴(kuò)散控制。2.4酶的失活動(dòng)力學(xué)2.4.1未反應(yīng)時(shí)酶的失活動(dòng)力學(xué)2.4.1.1一步失活模型
式中:E—具有活性的酶,D—失活的酶。
kd—失活反應(yīng)速率常數(shù)。建立酶失活動(dòng)力學(xué)方程:
邊界條件:
積分,得幾個(gè)概念:
:一步失活常數(shù):半衰期,當(dāng):時(shí)間常數(shù),三者關(guān)系:2.4.1.2多步失活模型
多步串聯(lián)失活模型:同步失活模型:式中,為失活速率常數(shù)為的酶組分的分率。因此,2.4.1.3溫度對(duì)酶失活的影響式中,
—
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