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文檔簡介
主要內(nèi)容:介紹核酸的分類和化學(xué)組成,重點(diǎn)討論DNA和RNA的結(jié)構(gòu)特征,初步認(rèn)識核酸的結(jié)構(gòu)特征與其功能的相關(guān)性;介紹核酸的主要理化性質(zhì)和核酸研究的一般方法。第三章核酸化學(xué)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸核酸的發(fā)現(xiàn)和研究歷史1869
Miescher從膿細(xì)胞的細(xì)胞核中分離出了一種含磷酸的有機(jī)物,當(dāng)時(shí)稱為核素(nuclein),后稱為核酸(nucleicacid)1944
Avery等通過肺炎球菌轉(zhuǎn)化試驗(yàn)證明DNA是遺傳物質(zhì)1953
Watson和Crick提出DNA結(jié)構(gòu)的雙螺旋模型1958
Crick提出遺傳信息傳遞的中心法則70年代建立DNA重組技術(shù)80年代以后
分子生物學(xué)、分子遺傳學(xué)等學(xué)科突飛猛進(jìn)發(fā)展,實(shí)施人類基因組計(jì)劃(HGP)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
1869年Miescher博士論文工作中測定淋巴細(xì)胞蛋白質(zhì)組成時(shí),發(fā)現(xiàn)了不溶于稀酸和鹽溶液的沉淀物,并在所有細(xì)胞的核里都找到了此物質(zhì),故命名核質(zhì)(Nuclein)。核酸研究簡史1879年Kossel經(jīng)過10年的努力,搞清楚核質(zhì)中有四種不同的組成部分:A,T,C和G。1889年Altman建議將核質(zhì)改名為“核酸”,并且已經(jīng)認(rèn)識到“核質(zhì)”乃“核酸”與蛋白質(zhì)的復(fù)合體。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸1944年Avery重做1928年Griffith的細(xì)菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),證明DNA是遺傳物質(zhì)。1952年Hershey&Chase的噬菌體感染實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明DNA是遺傳物質(zhì)。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
核酸功能、分類和分布
脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA):遺傳信息的貯存和攜帶者,生物的主要遺傳物質(zhì)。在真核細(xì)胞中,DNA主要集中在細(xì)胞核內(nèi),線粒體和葉綠體中均有各自的DNA。原核細(xì)胞沒有明顯的細(xì)胞核結(jié)構(gòu),DNA存在于稱為類核的結(jié)構(gòu)區(qū)。每個(gè)原核細(xì)胞只有一個(gè)染色體,每個(gè)染色體含一個(gè)雙鏈環(huán)狀DNA。
核糖核酸(ribonucleicacid,RNA):主要參與遺傳信息的傳遞和表達(dá)過程,細(xì)胞內(nèi)的RNA主要存在于細(xì)胞質(zhì)中,少量存在于細(xì)胞核中,病毒中RNA本身就是遺傳信息的儲存者。另外在植物中還發(fā)現(xiàn)了一類比病毒還小得多的侵染性致病因子稱為類病毒,它是不含蛋白質(zhì)的游離的RNA分子,還發(fā)現(xiàn)有些RNA具生物催化作用(ribozyme)。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
第一節(jié)核酸的組成成份一、核酸組成核蛋白蛋白質(zhì)核酸
核苷酸(n個(gè))磷酸核苷戊糖:核糖/脫氧核糖堿基:嘌呤/嘧啶生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(一)、化學(xué)組成1、堿基嘧啶堿胞嘧啶C胸腺嘧啶T尿嘧啶U嘌呤堿腺嘌呤A鳥嘌呤G2、戊糖核糖脫氧核糖生物化學(xué)簡明教程第三章核酸基本堿基結(jié)構(gòu)和命名嘌呤嘧啶Adenine
(A)Guanine
(G)Cytosine(C)Uracil(U)Thymine(T)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸核糖和脫氧核糖生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(二)、核苷(核糖+堿基)戊糖C-1上的羥基與嘧啶堿上的N-1或嘌呤堿的N-9連接而成的糖苷鍵(三)、核苷酸(核苷+磷酸)5‘-磷酸酯,類型有:AMP、GMP、CMP、UMP、dAMP、dGMP、dCMP、dTMP生物化學(xué)簡明教程第三章核酸PPPPPPPP常見(脫氧)核苷酸的結(jié)構(gòu)和命名鳥嘌呤核苷酸(GMP)尿嘧啶核苷酸(UMP)胞嘧啶核苷酸(CMP)腺嘌呤核苷酸(AMP)脫氧腺嘌呤核苷酸(dAMP)脫氧鳥嘌呤核苷酸(dGMP)脫氧胞嘧啶核苷酸(dCMP)脫氧胸腺嘧啶核苷酸(dTMP)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸幾種稀有核苷酸假尿苷(
)二氫尿嘧啶(DHU)AmCH3CH3H3Cm26GHH5生物化學(xué)簡明教程第三章核酸堿基、核苷、核苷酸的關(guān)系
NitrogenousbasePentosesugarHOCH2HOHDoxyribose(inDNA)HOCH2HOOHRibose(inRNA)PhosphatePyrimidinesCytosineThymineUracilCUTPurihesAdenineGuanineAG生物化學(xué)簡明教程第三章核酸第二節(jié)脫氧核糖核酸的結(jié)構(gòu)一、DNA的一級結(jié)構(gòu)1、定義---各核苷酸殘基沿多核苷酸鏈排列的順序。2、特征:3’-5’磷酸二酯鍵3、核酸的表示方法:線條式、文字式、字母式生物化學(xué)簡明教程第三章核酸DNA的一級結(jié)構(gòu)
DNA分子中各脫氧核苷酸之間的連接方式(3′-5′磷酸二酯鍵)和排列順序叫做DNA的一級結(jié)構(gòu),簡稱為堿基序列。一級結(jié)構(gòu)的走向的規(guī)定為5′→3′。不同的DNA分子具有不同的核苷酸排列順序,因此攜帶有不同的遺傳信息。
5′3′生物化學(xué)簡明教程第三章核酸DNA一級結(jié)構(gòu)的表示法5′3′結(jié)構(gòu)式5′3′
p
p
p
pOH3′ACTG1′線條式5′
ACTGCATAGCTCGA3′字母式生物化學(xué)簡明教程第三章核酸第三節(jié)DNA的空間結(jié)構(gòu)(一)、DNA的二級結(jié)構(gòu)Watson和Crick于1952年提出的
雙螺旋結(jié)構(gòu)模型1、雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的主要證據(jù)X—光衍射數(shù)據(jù)、堿基成對的原則生物化學(xué)簡明教程第三章核酸生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(1)DNA分子由兩條多聚脫氧核糖核苷酸鏈(簡稱DNA單鏈)組成。兩條鏈沿著同一根軸平行盤繞,形成右手雙螺旋結(jié)構(gòu)。螺旋中的兩條鏈方向相反,即其中一條鏈的方向?yàn)?′→3′,而另一條鏈的方向?yàn)?′→5′。1、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(2)嘌呤堿和嘧啶堿基位于螺旋的內(nèi)側(cè),磷酸和脫氧核糖基位于螺旋外側(cè)。堿基環(huán)平面與螺旋軸垂直,糖基環(huán)平面與堿基環(huán)平面成90°角。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(3)螺旋橫截面的直徑約為2nm,每條鏈相鄰兩個(gè)堿基平面之間的距離為0.34nm,每10個(gè)核苷酸形成一個(gè)螺旋,其螺矩(即螺旋旋轉(zhuǎn)一圈)高度為3.4nm。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(4)雙螺旋的力是鏈間的堿基對所形成的氫鍵。堿基的相互結(jié)合具有嚴(yán)格的配對規(guī)律,A-T,G-C結(jié)合,這種配對關(guān)系,稱為堿基互補(bǔ)。AT間形成兩個(gè)氫鍵,GC間三個(gè)氫鍵。在DNA分子中,嘌呤堿基的總數(shù)與嘧啶堿基的總數(shù)相等。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(5)、大溝和小溝生物化學(xué)簡明教程第三章核酸3、維持雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素堿基堆積力、氫鍵等4、DNA雙螺旋的種類
*總結(jié)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
氫鍵
堿基堆集力
磷酸基上負(fù)電荷被胞內(nèi)組蛋白或正離子中和
堿基處于疏水環(huán)境中DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定因素
生物化學(xué)簡明教程第三章核酸螺旋類型ABZ外型寬而短適中細(xì)長螺旋方向右手右手左手直徑2.6nm2.0nm1.8nm螺距2.8nm3.4nm4.5nm每匝螺旋堿基對數(shù)目111012堿基對與中心軸傾角19’1’9’大溝狹,很深寬,很深平坦小溝很寬,淺狹,很深很狹,深生物化學(xué)簡明教程第三章核酸DNA雙螺旋構(gòu)象的類型A-DNAZ-DNAB-DNA生物化學(xué)簡明教程第三章核酸第四節(jié)DNA的三級結(jié)構(gòu)在細(xì)胞內(nèi),由于DNA分子與其它分子(主要是蛋白質(zhì))的相互作用,使DNA雙螺旋進(jìn)一步扭曲形成的高級結(jié)構(gòu).生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
超螺旋結(jié)構(gòu)負(fù)超螺旋正超螺旋*真核生物中DNA和蛋白質(zhì)如何組成染色單體的結(jié)構(gòu)?核小體:組蛋白+DNA生物化學(xué)簡明教程第三章核酸組蛋白與DNA的結(jié)合生物化學(xué)簡明教程第三章核酸真核生物染色體DNA組裝不同層次的結(jié)構(gòu)
DNA(2nm)核小體鏈(11nm,每個(gè)核小體200bp)纖絲(30nm,每圈6個(gè)核小體)突環(huán)(150nm,每個(gè)突環(huán)大約75000bp)玫瑰花結(jié)(300nm,6個(gè)突環(huán))螺旋圈(700nm,每圈30個(gè)玫瑰花)染色體(1400nm,
每個(gè)染色體含10個(gè)玫瑰花200bp)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸第六節(jié)RNA的結(jié)構(gòu)和功能一、RNA的分類及功能1、核糖體RNA(rRNA)蛋白質(zhì)生物合成的場所-核糖體的主要成分2、轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)轉(zhuǎn)移活化的氨基酸3、信使RNA(mRNA)轉(zhuǎn)錄DNA上的遺傳信息,并指導(dǎo)蛋白質(zhì)的生物合成生物化學(xué)簡明教程第三章核酸二、RNA的結(jié)構(gòu)1、一級結(jié)構(gòu)2、空間結(jié)構(gòu):RNA是短的含不完全螺旋區(qū)的多核苷酸單鏈*tRNA的三葉草型二級結(jié)構(gòu)*tRNA的倒L型三級結(jié)構(gòu)生物化學(xué)簡明教程第三章核酸RNA的一級結(jié)構(gòu)
RNA分子中各核苷之間的連接方式(3′-5′磷酸二酯鍵)和排列順序叫做RNA的一級結(jié)構(gòu)OHOHOH5′3′
RNA與DNA的差異
DNA
RNA糖脫氧核糖核糖堿基AGCTAGCU不含稀有堿基含稀有堿基生物化學(xué)簡明教程第三章核酸第七節(jié)核酸的性質(zhì)
一、一般性質(zhì)自然狀態(tài)、溶解性、粘度、沉降行為、酸性二、紫外吸收性質(zhì):在260nm處有一最大吸收峰值生物化學(xué)簡明教程第三章核酸DNA的紫外吸收光譜天然DNA變性DNA核苷酸總吸收值1232202402602800.10.20.30.4波長(nm)光吸收123生物化學(xué)簡明教程第三章核酸三、核酸的變性和復(fù)性(一)、變性1、定義----2、引起變性的原因3、熔點(diǎn)Tm及影響Tm值的因素(二)、復(fù)性*分子雜交(三)、降解生物化學(xué)簡明教程第三章核酸分子雜交的原理示意圖
不同來源的DNA單鏈間或單鏈DNA與RNA之間只要有堿基配對的區(qū)域,在復(fù)性時(shí)可形成局部雙螺旋區(qū),稱核酸分子雜交(hybridization)制備特定的探針(probe)通過雜交技術(shù)可進(jìn)行基因的檢測和定位研究。實(shí)例:southern印跡法生物化學(xué)簡明教程第三章核酸核酸的變性、復(fù)性和雜交變性(加熱)探針雜交(緩慢冷卻)復(fù)性(緩慢冷卻)
變性:在物理、化學(xué)因素影響下,DNA堿基對間的氫鍵斷裂,雙螺旋解開,這是一個(gè)是躍變過程,伴有A260增加(增色效應(yīng)),DNA的功能喪失。
復(fù)性:在一定條件下,變性DNA單鏈間堿基重新配對恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu),伴有A260減?。p色效應(yīng)),DNA的功能恢復(fù)。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸Tm:熔解溫度(meltingtemperature)Polyd(A-T)DNAPolyd(G-C)
DNA的變性發(fā)生在一個(gè)很窄的溫度范圍內(nèi),通常把熱變性過程中A260達(dá)到最大值一半時(shí)的溫度稱為該DNA的熔解溫度,用Tm表示。
Tm的大小與DNA分子中(G+C)的百分含量成正相關(guān),測定Tm值可推算核酸堿基組成及判斷DNA純度。某些DNA的Tm值60801001.01.41.2100%A260t\0CTmTmTm123123生物化學(xué)簡明教程第三章核酸第八節(jié)核酸的序列測定(一)、sanger雙脫氧鏈終止法
Cambridge的F.
Sanger在1977年發(fā)明用雙脫氧鏈終止法測定單鏈DNA的序列。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸反應(yīng)體系組成:待測單鏈DNA,模板,引物,四種dNTP(其中一種用32P/35S標(biāo)記)終止劑(ddNTP),DNA聚合酶
Sanger發(fā)明:兩次獲得諾貝爾獎(jiǎng)分別得到ddAddTddGddC結(jié)尾的片段生物化學(xué)簡明教程第三章核酸補(bǔ)充核酸的衍生物一、ATP類化合物的生理功能1、體內(nèi)RNA、DNA合成的原料2、參與能量代謝3、參與特定的代謝過程4、作為輔酶的結(jié)構(gòu)成分二、環(huán)狀核苷酸cAMP----第二信使生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
5′-NMP5′-NDP5′-NTPN=A、G、C、U
5′-dNMP5′-dNDP5′-dNTPN=A、G、C、T腺苷酸及其多磷酸化合物
AMPAdenosine
monophosphate
ADPAdenosine
diphosphate
ATPAdenosine
triphosphate生物化學(xué)簡明教程第三章核酸生物化學(xué)簡明教程第三章核酸酵母tRNAAla
的二級結(jié)構(gòu)
DHU環(huán)IGC反密碼子反密碼環(huán)氨基酸臂可變環(huán)TψC環(huán)CCAAla3′5′生物化學(xué)簡明教程第三章核酸生物化學(xué)簡明教程第三章核酸α雙螺旋:Waston-Crick模型的主要內(nèi)容是:DNA分子是由2條多核苷酸鏈組成,每條鏈都圍繞同一中心軸形成螺旋,兩條鏈方向相反,即一條鏈中的磷酸二酯鍵連接的核苷酸方向?yàn)椋怠?′,另一條鏈則為3′5′,兩條鏈中所含的堿基在雙螺旋內(nèi)側(cè)通過氫鍵形成互補(bǔ)的堿基對(A=T,G=C),每一堿基對位于同一平面上,并垂直于對稱軸,相鄰堿基對螺旋36度,即每10個(gè)堿基對旋轉(zhuǎn)360度,相鄰堿基之間距離為0.34nm,雙螺旋之間距離為2nm。生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
生物化學(xué)簡明教程第三章核酸腺苷(AR)脫氧胞苷(dCR)β1’,N9-糖苷鍵β1’,N1-糖苷鍵β1’β1’N9N1生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
“稀有核苷”是由“稀有堿基”所生成的核苷。假尿苷(ψ)β1’,C5-糖苷鍵β1’C5生物化學(xué)簡明教程第三章核酸生物化學(xué)簡明教程第三章核酸
超螺旋結(jié)構(gòu)負(fù)超螺旋:給予DNA的扭曲張力有利于DNA解旋,(使DNA越擰越松)負(fù)超螺旋
右旋生物化學(xué)簡明教程第三章核酸正超螺旋:給予DNA的扭曲張力使DNA纏繞得更緊,(使DNA越擰越緊)正超螺旋
左旋生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(1)氨基酸接受區(qū)
包含有tRNA的3’-末端和5’-末端,3’-末端的最后3個(gè)核苷酸殘基都是CCA,A為核苷。氨基酸可與其成酯,該區(qū)在蛋白質(zhì)合成中起攜帶氨基酸的作用。
(2)反密碼區(qū)
與氨基酸接受區(qū)相對的一般含有7個(gè)核苷酸殘基的區(qū)域,其中正中的3個(gè)核苷酸殘基稱為反密碼生物化學(xué)簡明教程第三章核酸(3)二氫尿嘧啶區(qū)
該區(qū)含有二氫尿嘧啶。(4)TC區(qū)
該區(qū)與二氫尿嘧啶區(qū)相對,假尿嘧啶核苷—胸腺嘧啶核糖核苷環(huán)(TC)由7個(gè)核苷酸組成,通過由5對堿基組成的雙螺旋區(qū)(TC臂)與tRNA的其余部分相連。除個(gè)別例外,幾乎所有tBNA在此環(huán)中都含有TC。(5)可變區(qū)
位于反密碼區(qū)與TC區(qū)之間,不同的tRNA該區(qū)變
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