NCBI數(shù)據(jù)庫的使用與功能介紹

NCBI數(shù)據(jù)庫—1精選pptNCBI分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫

:///美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)于1988年11月4日建立國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterofBiotechnologyInformation，簡稱NCBI)2精選pptNationalCenterofBiotechnologyInformationNCBI的任務(wù)：建立關(guān)于分子生物學(xué)，生物化學(xué)，和遺傳學(xué)知識的存儲和分析的自動系統(tǒng)實(shí)行關(guān)于用于分析生物學(xué)重要分子和復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和功能的基于計(jì)算機(jī)的信息處理的先進(jìn)方法的研究加速生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用全世界范圍內(nèi)的生物技術(shù)信息收集的合作努力3精選pptNCBI首先創(chuàng)立GenBank數(shù)據(jù)庫，在重點(diǎn)開發(fā)GenBank的同時(shí)，又于1991年開發(fā)了Entrez數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)。該系統(tǒng)整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等數(shù)據(jù)庫的序列信息以及MEDLINE有關(guān)序列的文獻(xiàn)信息，并通過相關(guān)鏈接，將他們有機(jī)地結(jié)合在一起。NationalCenterofBiotechnologyInformation4精選ppt5精選ppt以IL6基因?yàn)槔喝绾尾檎一蛐蛄?、mRNA、Promoter如何查找連續(xù)的mRNA、cDNA、蛋白序列6精選pptMapviewer是NCBI網(wǎng)站上提供的一個(gè)非常有用的尋找基因的工具，通過Mapviewer你可以了解你感興趣基因在基因組中所處的位置、基因序列、內(nèi)含子及外顯子的排列、基因的細(xì)胞遺傳學(xué)圖、EST、SNP等等許多有用的信息。利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、啟動子Promoter7精選ppt利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、啟動子Promoter8精選ppt9精選ppt10精選ppt11精選ppt12精選ppt13精選ppt14精選ppt如何查找連續(xù)的mRNA、cDNA、蛋白序列15精選ppt16精選ppt蛋白序列：mRNA序列：17精選ppt一基因序列：CCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCACCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCACCCCGGAGCGGATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCCACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCTGGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCATAGAGGAACATAAAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAAGAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAACAAAATTGCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTGAGGAAACTGCGGAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATGGATTGAGGCCTCTGGC1、這是哪個(gè)基因？2、編碼的蛋白質(zhì)序列是怎么樣的?3、有沒有保守的功能結(jié)構(gòu)域？4、它的功能是怎樣的？5、有沒有三級結(jié)構(gòu)？18精選ppt19精選pptBLAST可以對核酸和蛋白的多種數(shù)據(jù)庫操作。有幾種比較方法可選擇：Blastp：一個(gè)氨基酸序列與一個(gè)蛋白數(shù)據(jù)庫比較Blastn：一個(gè)核酸序列與一個(gè)核酸數(shù)據(jù)庫比較。Blastx：一個(gè)核酸的所有讀框與一個(gè)蛋白數(shù)據(jù)庫比較，可以用來發(fā)現(xiàn)未知核酸可能的蛋白產(chǎn)物。Tblastn：一個(gè)蛋白序列與翻譯成所有讀框的核酸數(shù)據(jù)庫比較。Tblastx：一個(gè)核酸的六種讀框與一個(gè)核酸據(jù)庫的六種讀框比較，但由于計(jì)算太復(fù)雜在網(wǎng)頁中不能應(yīng)用。20精選ppt21精選ppt22精選ppt23精選ppt24精選pptGeneinfo：17號染色體25精選ppt功能注釋：GeneOntology該基因定位于人體第17條染色體，基因表示符為：NM-001168.2初步的功能分析：細(xì)胞周期，caspase酶的抑制因子等26精選ppt獲取蛋白質(zhì)的序列信息該蛋白質(zhì)中包含142個(gè)氨基酸，序列標(biāo)識符為：NP-001159.227精選ppt獲取FASTA序列28精選pptFinddomain29精選ppt填入蛋白質(zhì)的FASTA序列并提