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文檔簡介
微生物細(xì)胞經(jīng)濟體系的
運行規(guī)律微生物細(xì)胞新陳代謝的獨立性是靠其廣泛的適應(yīng)性和對養(yǎng)分物質(zhì)的節(jié)省使用即經(jīng)濟性來支撐的。歸根究竟是依靠微生物細(xì)胞嚴(yán)密的代謝調(diào)整〔包括能量代謝和物質(zhì)代謝〕機構(gòu)來支撐的。
一、微生物的細(xì)胞經(jīng)濟體系
二、微生物細(xì)胞的經(jīng)濟構(gòu)造——
微生物代謝的三個子系統(tǒng)
三、微生物的細(xì)胞經(jīng)濟體系的運行一、微生物的細(xì)胞經(jīng)濟體系微生物細(xì)胞是遠(yuǎn)離平衡狀態(tài)的不平衡的開放體系,它能對系統(tǒng)的三個要素〔①能量、②物質(zhì)、③信息〕,自主地進(jìn)展定向的、全面的協(xié)調(diào)。
我們把微生物細(xì)胞作為按特殊經(jīng)濟規(guī)律運行的經(jīng)濟實體來對待,并且把這種按特殊的經(jīng)濟規(guī)律運行的新陳代謝體系叫做細(xì)胞經(jīng)濟體系。
微生物細(xì)胞的獨立存在和自主生存,依靠于微生物細(xì)胞廣泛的適應(yīng)性〔先保證活下來〕和對養(yǎng)分物質(zhì)的節(jié)省使用,即經(jīng)濟性〔爭取在所處環(huán)境條件下更具競爭力〕。適應(yīng)性和經(jīng)濟性都建立在微生物細(xì)胞代謝的變動性上。
但是,微生物代謝的變動是有限度的,它受到細(xì)胞代謝調(diào)整機制的嚴(yán)格標(biāo)準(zhǔn)和嚴(yán)密把握,以保證代謝的持續(xù)。這些代謝調(diào)整的規(guī)律就是細(xì)胞生命活動的“經(jīng)濟法則”,即細(xì)胞經(jīng)濟治理原則,細(xì)胞經(jīng)濟體系按細(xì)胞經(jīng)濟規(guī)律運行。細(xì)胞的遺傳物質(zhì)〔遺傳信息的載體〕是細(xì)胞與環(huán)境對話的指揮中心。微生物的細(xì)胞經(jīng)濟體系是微生物細(xì)胞生命活動的保障體系。這個體系為細(xì)胞對其環(huán)境的適應(yīng)性,細(xì)胞運行的經(jīng)濟性,以及
細(xì)胞的持續(xù)代謝供給保障。細(xì)胞的經(jīng)濟根底細(xì)胞實物構(gòu)造〔指行使細(xì)胞功能的細(xì)胞構(gòu)造〕細(xì)胞經(jīng)濟構(gòu)造〔微生物代謝的三個子系統(tǒng)的總和〕生產(chǎn)力生產(chǎn)關(guān)系細(xì)胞經(jīng)濟根底,最終取決于細(xì)胞的遺傳物質(zhì)和環(huán)境的對話〔細(xì)胞的“藍(lán)圖”和細(xì)胞生命活動的指揮中心的現(xiàn)場指揮〕。二、微生物細(xì)胞的經(jīng)濟構(gòu)造——
微生物代謝的三個子系統(tǒng)對于化能異養(yǎng)型微生物而言,其碳架物質(zhì)的代謝是最根本的代謝,由于碳架物質(zhì)代謝不但為其自身合成供給碳架,而且為自身合成供給了可直接使用的代謝能和復(fù)原力。因此,我們首先以碳架代謝為主線,爭論與微生物細(xì)胞生長直接相關(guān)的初級代謝活動。為了分析問題的便利,把與微生物細(xì)胞生長直接相關(guān)的代謝系統(tǒng)劃分為三個子系統(tǒng),來爭論微生物細(xì)胞的經(jīng)濟構(gòu)造。微生物碳架物質(zhì)的初級代謝大致可分成三個子系統(tǒng),一個分解代謝子系統(tǒng)〔子系統(tǒng)Ⅰ〕和兩個合成代謝子系統(tǒng)〔子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)Ⅲ〕。一、碳架代謝的三個子系統(tǒng)ⅠⅡⅢ碳架ATP分子模塊微生物碳架代謝系統(tǒng)的三個子系統(tǒng)Ⅰ:碳源的分解代謝子系統(tǒng)
Ⅱ:分子模塊的合成代謝子系統(tǒng)
Ⅲ:生物大分子的合成代謝子系統(tǒng)ATP代表代謝能;分子模塊代表氨基酸、核苷酸等參與生物大分子組成的單元化合物;碳架代表PYR、R-5-P、α-KG等前體代謝物。
虛箭頭和實箭頭分別代表代謝系統(tǒng)內(nèi)部的松散的和嚴(yán)密的聯(lián)系。①子系統(tǒng)Ⅰ〔碳源的分解代謝子系統(tǒng)〕
子系統(tǒng)Ⅰ是微生物細(xì)胞用以合成前體代謝物和供給代謝能的碳源分解代謝系統(tǒng)。
這個系統(tǒng)最簡潔直承受外界環(huán)境條件在生理許可范圍內(nèi)的影響。例如,pH條件引起黑曲霉的發(fā)酵轉(zhuǎn)換,pH3時累積檸檬酸,pH6時累積葡萄糖酸,pH10時累積草酸。這個系統(tǒng)之所以易受外界環(huán)境影響,可能是由于碳源的分解代謝有多條途徑可供選擇;此外,可能是由于分解代謝的酶主要分布在細(xì)胞內(nèi)可溶局部和膜上,易受外界條件影響。②子系統(tǒng)Ⅱ〔合成分子模塊的子系統(tǒng)〕
用來合成分子模塊〔buildingblock〕的合成代謝子系統(tǒng)。
分子模塊一般是指用以合成生物大分子的標(biāo)準(zhǔn)單元,譬如用于多糖合成的G-1-P,用于蛋白質(zhì)合成的各種氨基酸,用于RNA和DNA合成的各種核苷酸和脫氧核苷酸,以及用于類異戊二烯化合物合成的異戊烯基焦磷酸等。這個系統(tǒng)的調(diào)整機制主要是負(fù)反響調(diào)整〔包括反響抑制和反響阻遏〕,還有由遺傳因素準(zhǔn)備的、可能消逝酶的缺失〔主要表型是養(yǎng)分缺陷型〕突變株。這些構(gòu)造單位的生物合成途徑大多已弄清晰,總的印象是此系統(tǒng)的調(diào)整機制較為單純。分類學(xué)上屬不同種的微生物的子系統(tǒng)Ⅰ的代謝調(diào)整機制比較接近,而子系統(tǒng)Ⅱ的代謝調(diào)整機制則頗為不同。③子系統(tǒng)Ⅲ〔生物大分子合成代謝子系統(tǒng)〕
生物大分子合成代謝子系統(tǒng)是指細(xì)胞用以生成蛋白質(zhì)、DNA、RNA、各種多糖(同多糖、雜多糖、肽多糖、脂多糖、莢膜多糖等)及類脂〔含類異戊二烯化合物〕等細(xì)胞構(gòu)造物質(zhì)的生物大分子合成代謝子系統(tǒng)。只有當(dāng)以上三個代謝子系統(tǒng)作為一個整體來運行,微生物細(xì)胞才能維持生命循環(huán)。
只有當(dāng)生命循環(huán)得到維持,我們才有可能通過微生物細(xì)胞的生命活動,生產(chǎn)微生物產(chǎn)品。二、三個子系統(tǒng)的相互關(guān)系微生物活細(xì)胞是遠(yuǎn)離平衡狀態(tài)的不平衡的開放體系,微生物細(xì)胞與它所處的環(huán)境不斷地進(jìn)展物質(zhì)、能量和信息的交換。微生物細(xì)胞作為細(xì)胞機器用于工業(yè)生產(chǎn)時,除了要從培育基吸取養(yǎng)分外,還要排出工業(yè)生產(chǎn)的目的產(chǎn)物。分泌能量代謝的副產(chǎn)物(乙醇、乳酸等)ⅠⅡⅢ分泌生物大分子的前體(氨基酸、核酸等)分泌生物大分子(酶、微生物多糖等)碳架ATP分子模塊營養(yǎng)如以下圖三子系統(tǒng)有如下關(guān)系:
子系統(tǒng)Ⅰ生成ATP,子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)Ⅲ使用ATP。但是子系統(tǒng)Ⅰ中ATP如何合成并不嚴(yán)峻影響子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)Ⅲ對ATP的使用。因此可以認(rèn)為子系統(tǒng)Ⅰ與整個合成系統(tǒng)〔子系統(tǒng)Ⅱ加上子系統(tǒng)Ⅲ〕之間的聯(lián)系是較為松散的〔圖中的虛線箭頭〕。子系統(tǒng)Ⅰ生成的前體代謝物的質(zhì)和量猛烈地影響子系統(tǒng)Ⅱ的運行〔見離心途徑匯總圖〕,因此子系統(tǒng)Ⅰ與子系統(tǒng)Ⅱ之間的聯(lián)系是嚴(yán)密的〔實線箭頭〕。而子系統(tǒng)Ⅰ與子系統(tǒng)Ⅲ之間幾乎僅僅通過ATP相聯(lián)系,因此這兩個系統(tǒng)之間的聯(lián)系是松散的〔虛線箭頭〕。分子模塊(如氨基酸)在細(xì)胞內(nèi)通??梢杂坞x狀態(tài)存在,由此推想,子系統(tǒng)Ⅱ與子系統(tǒng)Ⅲ也只是保持松散的關(guān)系〔虛線箭頭〕。綜上所述,子系統(tǒng)Ⅰ和子系統(tǒng)Ⅱ分別與子系統(tǒng)Ⅲ只發(fā)生松散的聯(lián)系,這就是子系統(tǒng)Ⅰ具有相對獨立的運轉(zhuǎn)〔排出能量代謝副產(chǎn)物〕力氣的緣由之一,也是“子系統(tǒng)Ⅰ+子系統(tǒng)Ⅱ”作為一個整體具有相對獨立的運轉(zhuǎn)〔排出分子模塊〕力氣的緣由之一。相對獨立運行的另一個重要緣由是細(xì)胞的分泌機制。子系統(tǒng)Ⅰ相對獨立運轉(zhuǎn)的過程中,細(xì)胞可能分泌乙醇等能量代謝的副產(chǎn)物;“子系統(tǒng)Ⅰ+子系統(tǒng)Ⅱ”相對獨立運轉(zhuǎn)的過程中,細(xì)胞可能分泌氨基酸等分子模塊;三個子系統(tǒng)協(xié)調(diào)運轉(zhuǎn),微生物細(xì)胞生長快速。還有可能分泌酶、多糖、多肽等生物大分子。細(xì)胞分泌代謝產(chǎn)物的同時生長速度放慢。三、微生物的細(xì)胞經(jīng)濟學(xué)
〔microbialcelleconomics〕
經(jīng)濟學(xué)是爭論各種經(jīng)濟關(guān)系和經(jīng)濟活動規(guī)律的科學(xué),是爭論人類社會在各個進(jìn)展階段的活動和各種相應(yīng)的經(jīng)濟關(guān)系,以及經(jīng)濟活動規(guī)律的科學(xué)。
經(jīng)濟活動是人們在確定的經(jīng)濟關(guān)系中〔其中占主導(dǎo)地位的是生產(chǎn)關(guān)系〕,進(jìn)展生產(chǎn)、交換、安排、消費以及與之有親切關(guān)系的活動。在經(jīng)濟活動中,存在以較少的消耗獲得較大經(jīng)濟效益的經(jīng)濟效果問題。
在微生物細(xì)胞的代謝活動中同樣也存在著以較少的養(yǎng)分物質(zhì),獲得較大的生長效益的經(jīng)濟效果問題;在這個意義上,代謝活動也是一種經(jīng)濟活動。經(jīng)濟效果要用價值的尺度來衡量。談到價值,就涉及到價值取向問題。用不同的價值取向?qū)ν粋€事物的效果進(jìn)展評價,結(jié)果不會一樣。微生物細(xì)胞本身的價值取向是加強生存競爭力氣,而工業(yè)發(fā)酵中微生物細(xì)胞機器的價值取向是提高目的產(chǎn)物的生產(chǎn)力氣。因此在工業(yè)發(fā)酵的過程中,需要遵循微生物細(xì)胞經(jīng)濟運行規(guī)律,對微生物的代謝活動進(jìn)展協(xié)調(diào)。有關(guān)價值取向問題:
*微生物細(xì)胞——競爭力氣〔細(xì)胞生長速度和生殖速度〕。
*細(xì)胞機器——生產(chǎn)力氣〔細(xì)胞在發(fā)酵液中累積特定代謝產(chǎn)物的力氣〕。對于本課程定義的典型的工業(yè)發(fā)酵來說,目的產(chǎn)物的累積往往是以犧牲微生物的競爭力氣來實現(xiàn)的,因而,高產(chǎn)突變菌株的生存競爭力氣往往要比動身株差一些。工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn)中為了謀求盡量高的經(jīng)濟效益,必需在保證微生物細(xì)胞的生存利益的根底上,細(xì)心協(xié)調(diào)微生物細(xì)胞的生長和目的產(chǎn)物的累積這兩者的關(guān)系。
微生物細(xì)胞經(jīng)濟學(xué)試圖爭論
①細(xì)胞經(jīng)濟體系的運行規(guī)律
②微生物細(xì)胞各個生命活動階段的代謝活動
③代謝流在代謝網(wǎng)絡(luò)上的流量分布和流淌規(guī)律
④微生物細(xì)胞表達(dá)在不同價值取向上的生產(chǎn)力
⑤微生物細(xì)胞的生產(chǎn)力與細(xì)胞的生產(chǎn)關(guān)系之間的關(guān)系
在物競天擇的根底上建立的微生物細(xì)胞經(jīng)濟體系已經(jīng)經(jīng)受長期的實踐的檢驗,已成為微生物細(xì)胞生命活動的保障體系,為①適應(yīng)性、②經(jīng)濟性和③代謝的持續(xù)性供給保障。自然環(huán)境或人為的培育條件均能依據(jù)不同的價值取向,對細(xì)胞的經(jīng)濟運行進(jìn)展導(dǎo)向。但在細(xì)胞遺傳物質(zhì)沒有變動的狀況下,這種導(dǎo)向只能在有限的范圍內(nèi)進(jìn)展。在遺傳物質(zhì)發(fā)生變動的狀況下,大自然的導(dǎo)向,是指自發(fā)突變加上自然選擇,導(dǎo)致微生物物種的進(jìn)化;人為的導(dǎo)向,就是遺傳改造和定向篩選,導(dǎo)致優(yōu)良的生產(chǎn)菌種的獲得,實現(xiàn)另一種意義上的進(jìn)化。
然而,不管是大自然的導(dǎo)向還是人為的導(dǎo)向,都不能轉(zhuǎn)變微生物細(xì)胞的生存保障規(guī)律?!惨弧臣?xì)胞經(jīng)濟體系的運行
⑴原始型細(xì)胞經(jīng)濟
⑵導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟
⑶細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)
微生物細(xì)胞的生存保障規(guī)律可以概括成:
整體協(xié)調(diào),維持生計微生物細(xì)胞必需按這個生存保障規(guī)律進(jìn)展經(jīng)濟運行,在這個前提下,細(xì)胞經(jīng)濟運行還可以承受細(xì)胞經(jīng)濟杠桿的人為的調(diào)控。
依據(jù)是否承受細(xì)胞經(jīng)濟杠桿的人為的調(diào)控可以把微生物細(xì)胞經(jīng)濟分為:
⑴原始型細(xì)胞經(jīng)濟,
⑵導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟。
⑴原始型細(xì)胞經(jīng)濟原始型細(xì)胞經(jīng)濟體系是這樣一種細(xì)胞經(jīng)濟體系,這種細(xì)胞經(jīng)濟體系還沒有承受人為的經(jīng)濟導(dǎo)向。野生型微生物的細(xì)胞經(jīng)濟體系往往是屬于這個類型的。
原始型細(xì)胞經(jīng)濟是細(xì)胞經(jīng)濟體系的這樣一種運行狀態(tài),這種運行狀態(tài)有利于細(xì)胞生長、生殖和在競爭中獲勝。微生物在生存競爭中進(jìn)化的方向是進(jìn)展其自身的適應(yīng)力氣,提高生存競爭力氣;也就是優(yōu)化細(xì)胞經(jīng)濟運行狀態(tài)。經(jīng)生存競爭而幸存下來的野生型微生物在其所棲身的環(huán)境中是富有競爭力氣的。
假設(shè)要求微生物過量合成某種代謝中間產(chǎn)物,則須對微生物的代謝流進(jìn)展導(dǎo)向。依據(jù)已獲得的代謝分析的信息,應(yīng)用正確的策略,進(jìn)展設(shè)計,然后按準(zhǔn)備對動身株進(jìn)展遺傳改造和隨后的培育條件優(yōu)化,將代謝流導(dǎo)向抱負(fù)的載流路徑。⑵導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟在這種狀況下,細(xì)胞因承受了人為的代謝導(dǎo)向,細(xì)胞經(jīng)濟體系處于承受導(dǎo)向的運行狀態(tài),因此有導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟之稱。盡管以產(chǎn)品為導(dǎo)向的導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟不同于原始型細(xì)胞經(jīng)濟,然而,微生物細(xì)胞總是按整體協(xié)調(diào),維持生計的細(xì)胞經(jīng)濟治理原則實現(xiàn)能量和復(fù)原力的新的平衡,從而保證生命活動以另一種格局持續(xù)進(jìn)展下去。經(jīng)濟活動通過貨幣投入,獲得收益。在微生物細(xì)胞的代謝活動中,存在著以較少的養(yǎng)分物質(zhì),獲得較大的生長效益問題。在這個意義上,微生物的代謝活動也是一種經(jīng)濟活動,微生物細(xì)胞消耗能量〔實際上是以ATP的形式供給代謝能〕,實現(xiàn)生長。因此爭論微生物的代謝,即微生物細(xì)胞的經(jīng)濟運行,必需爭論生長能學(xué)。⑶細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)
為了使微生物的細(xì)胞經(jīng)濟運行狀態(tài)和競爭力氣得到量化。曾經(jīng)以基質(zhì)的得率系數(shù)Yxs為基準(zhǔn),把細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)定義為細(xì)胞增長速率與基質(zhì)消耗速率之比。但是,在進(jìn)展分批培育時,培育基的組成成分是在不斷變化的,細(xì)胞增長速率與不同基質(zhì)的消耗速率都在變化之中,因此這樣的“細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)”難以進(jìn)展同一個水平上的比較。培育基的組成差異是一個質(zhì)的差異,假設(shè)我們將這個質(zhì)的差異換算成量的差異,或許問題就簡潔解決了。這樣,我們試圖將培育基的質(zhì)的差異轉(zhuǎn)換成ATP的量的差異,以ATP得率系數(shù)YxATP為基準(zhǔn),修改細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)。
特引進(jìn)代謝經(jīng)濟系數(shù)(economiccoefficientofmetabolism)的概念,用來描寫細(xì)胞經(jīng)濟體系的經(jīng)濟運行的狀況,以及代謝能對于細(xì)胞生長的經(jīng)濟效果。代謝經(jīng)濟系數(shù),簡稱經(jīng)濟系數(shù),被定義為細(xì)胞增長的速率與ATP的消耗速率之比:
這個經(jīng)濟系數(shù)不但使微生物的細(xì)胞經(jīng)濟運行狀態(tài)和競爭力氣得到了量化,而且可以推算細(xì)胞的代謝本錢。綜上所述,ATP得率系數(shù)YxATP,即合成單位細(xì)胞量所消耗ATP的量[mmolATP〔g細(xì)胞干重〕-1],比細(xì)胞量對基質(zhì)的得率系數(shù)Yxs,即合成單位量的細(xì)胞所消耗的基質(zhì)的量,更能表達(dá)細(xì)胞生長的經(jīng)濟活動的根本特性。所以在分析細(xì)胞的經(jīng)濟活動時,以ATP得率系數(shù)YxATP為基準(zhǔn)比以基質(zhì)的得率系數(shù)Yxs為基準(zhǔn)更能反映經(jīng)濟活動的本質(zhì)。細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)的凹凸取決于分解代謝體系〔子系統(tǒng)Ⅰ〕與兩個生物合成系統(tǒng)〔子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)Ⅲ〕的協(xié)調(diào)運轉(zhuǎn)的狀況。經(jīng)濟系數(shù)凹凸反映各代謝體系之間的聯(lián)系程度、相關(guān)程度和協(xié)調(diào)程度的凹凸。各代謝子系統(tǒng)之間的聯(lián)系越嚴(yán)密,各代謝子系統(tǒng)運轉(zhuǎn)的獨立性就越小,代謝產(chǎn)物的累積就越困難。在這種狀況下,微生物本身能最大限度地生長和生殖,細(xì)胞生產(chǎn)自身的力氣最強。細(xì)胞經(jīng)濟處于富于競爭力氣的運行狀態(tài),細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)最高。〔二)微生物的經(jīng)濟杠桿
⑴外界環(huán)境條件
⑵對代謝產(chǎn)物的分泌力氣
⑶遺傳依據(jù)依據(jù)工業(yè)發(fā)酵的現(xiàn)狀,把依靠化能異養(yǎng)型微生物合成某最終被分泌到胞外的初級代謝產(chǎn)物〔目的產(chǎn)物〕的過程,作為工業(yè)發(fā)酵的典型過程來爭論。
假設(shè)要在發(fā)酵液中獲得大量的目的產(chǎn)物,先決條件是必需有確定量的細(xì)胞存在,而且細(xì)胞的生命活動必需得到維持。在發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)上,分批發(fā)酵的前期是菌種微生物增殖〔細(xì)胞機器的在線制造〕階段。應(yīng)當(dāng)從培育條件上保證菌種微生物的正常增殖,以便為隨后目的產(chǎn)物生成〔細(xì)胞機器的在線運行〕供給足夠的細(xì)胞機器。然后,細(xì)胞機器轉(zhuǎn)入目的產(chǎn)物的生產(chǎn)〔在線運行〕階段。目的產(chǎn)物在發(fā)酵液中的累積,是微生物細(xì)胞按整體協(xié)調(diào)維持生計的生存保障規(guī)律,自動調(diào)低細(xì)胞生長速度,維持生命活動的狀況下實現(xiàn)的。在這個階段,培育條件的轉(zhuǎn)換能調(diào)動菌種微生物高產(chǎn)目的產(chǎn)物的遺傳潛力,從而促成目的產(chǎn)物生產(chǎn)的代謝導(dǎo)向,使微生物細(xì)胞在胞外累積目的產(chǎn)物,獲得發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)的經(jīng)濟效益。這時,由于目的產(chǎn)物〔原來用于生長的代謝中間產(chǎn)物〕的抽出,造成細(xì)胞生長速率的下降和競爭力氣的減弱。細(xì)胞生成速度相對較低,細(xì)胞經(jīng)濟系數(shù)相對較低;目的產(chǎn)物的生成速度相對較高,目的產(chǎn)物生成系數(shù)相對較高。微生物群體的生命活動〔也就是細(xì)胞的經(jīng)濟活動〕,不管是在自然的環(huán)境下還是在人為的培育條件下進(jìn)展,都受到經(jīng)濟杠桿的調(diào)控。在微生物學(xué)中,細(xì)菌的〔群體〕生長曲線反映的單細(xì)胞微生物生長體系中細(xì)胞濃度隨時間的變化規(guī)律〔先后經(jīng)過延遲期、對數(shù)期、平衡期和衰亡期〕,就是細(xì)胞的經(jīng)濟活動受到調(diào)控的結(jié)果;細(xì)菌細(xì)胞自身的生命活動影響其自身的環(huán)境條件,其自身的環(huán)境條件反過來又影響〔調(diào)控〕細(xì)胞自身的生命活動。在工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn)中,人們可以利用經(jīng)濟杠桿對微生物的生長、生殖等新陳代謝過程進(jìn)展調(diào)控。
化能異養(yǎng)型微生物細(xì)胞經(jīng)濟的經(jīng)濟杠桿主要有下面幾種:
⑴外界環(huán)境條件
如pH、溫度、溶解氧及培育基的養(yǎng)分成分。外界環(huán)境首先向子系統(tǒng)Ⅰ〔碳源分解代謝〕施加影響,比方使糖的降解代謝途徑上的代謝流發(fā)生變化,甚至發(fā)生途徑的轉(zhuǎn)換和代謝流的漂移。⑵對代謝產(chǎn)物的分泌力氣
要實現(xiàn)代謝產(chǎn)物在發(fā)酵液中的大量累積,還有一個先決條件是微生物細(xì)胞對這些代謝產(chǎn)物的分泌力氣。假設(shè)這些代謝產(chǎn)物因代謝方面的緣由只在細(xì)胞內(nèi)累積而不分泌,就會影響細(xì)胞的內(nèi)部環(huán)境,直至影響到微生物細(xì)胞的生存。在這種狀況下,旺盛的分泌力氣對微生物細(xì)胞來說是一種解毒機制;對工業(yè)生產(chǎn)來說,細(xì)胞分泌力氣有助于代謝產(chǎn)物的大量生成和在發(fā)酵液中的大量累積。代謝產(chǎn)物的分泌對以各代謝子系統(tǒng)的松散聯(lián)系為根底的有關(guān)子系統(tǒng)的獨立運轉(zhuǎn),也起著特殊重要的作用。③遺傳物質(zhì)
如子系統(tǒng)Ⅱ和Ⅲ〔生物合成〕所涉及的合成代謝途徑的酶和〔或〕調(diào)整機制的遺傳依據(jù)的轉(zhuǎn)變。子系統(tǒng)Ⅱ和Ⅲ的運行,除了受到外界條件的間接影響外,更多地取決于人對菌種的選育和改造。在工業(yè)發(fā)酵過程中,通過經(jīng)濟杠桿原理調(diào)整細(xì)胞機器的在線制造階段和在線運行階段的相對長度和運行狀態(tài),依據(jù)生產(chǎn)需要和微生物菌種的性能適度地調(diào)整培育過程中代謝本錢的分布〔細(xì)胞機器本錢在總本錢中的比例〕。(三)通用代謝物的作用可以在細(xì)胞全局范圍內(nèi)通用的代謝物,通用代謝物〔currencymetabolites〕主要是能量貨幣ATP和以代謝物形式消逝的復(fù)原力NADH和NADPH。它們的作用主要在于調(diào)整代謝流的流量和方向,使途徑成為代謝網(wǎng)絡(luò)整體的一局部。生物合成反響一般都依靠于ATP的供給,假設(shè)ATP供給缺乏,則生物合成受阻,甚至連形成代謝能的降解途徑都不能激活。ATP及其相關(guān)分子ADP、AMP〔三者組成腺苷酸庫〕不但調(diào)整中心〔碳代謝〕途徑的供能反響,還直接參與代謝反響。中心分解代謝過程〔糖酵解和TCA循環(huán)〕為生物合成供給啟動物質(zhì)。然而,就其重要性來說,其調(diào)整作用遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于其參與作用。這些途徑不僅供給前體代謝物,同時也供給代謝能和幫助因子,以滿足根本的合成代謝的需要。因此,此類途徑被稱為無定向代謝途徑,以表示它們在分解代謝和合成代謝中的雙重作用。這些途徑的調(diào)整應(yīng)當(dāng)反映出其雙重功能,即確保碳架物質(zhì)〔carbonskeletons〕正確地、協(xié)調(diào)地流進(jìn)生物合成途徑和產(chǎn)能途徑〔收獲代謝能的途徑〕。嚴(yán)格地說,生物合成途徑與降解途徑的主要區(qū)分在于,用來把握流量的調(diào)整信號的性質(zhì)的不同。假設(shè)糖酵解或TCA循環(huán)僅僅承受能荷調(diào)整,那么在能量供給充分的條件下,通過這些途徑的流量將會硬性地削減。然而,伴隨著ATP再生的削減,這種反響機制也會限制用于生長的中間物的利用率,從而減弱生長。這樣的響應(yīng)仍不能令人滿足,由于培育基養(yǎng)分供給豐富時,生長也會受到限制。為了滿足地調(diào)整一個同時支持兩種功能〔產(chǎn)能和生長〕的過程,已經(jīng)導(dǎo)出了一種微妙的機制。這個機制需要兩類信號的輸入,一類是生物合成中間物水平的信號,另一類是代謝能水平的信號。第一類信號是特定途徑〔通常是嚴(yán)格的合成過程〕的終產(chǎn)物。大量實例說明大多數(shù)生物合成途徑的調(diào)整都包括簡潔反響機制,其中終產(chǎn)物抑制其自身合成的分支途徑的第一步,例如蘇氨酸抑制高絲氨酸脫氫酶,異亮氨酸抑制蘇氨酸脫氨酶,組氨酸抑制磷酸核糖-ATP焦磷酸化酶〔5-磷酸核糖焦磷酸激酶〕,色氨酸抑制鄰氨基苯甲酸合成酶等。其次個信號是嚴(yán)格的分解代謝途徑所特有的,而且是能量代謝的最終的〔或中間的〕產(chǎn)物,也就是Pi、AMP、ADP、ATP、NADH、NADPH,例如產(chǎn)氣腸桿菌的蘇氨酸脫氨酶〔降解酶〕受AMP的激活,銅綠假單胞菌的組氨酸酶〔降解酶〕受Pi的抑制,并且此抑制可被AMP和GDP解除。無定向代謝途徑承受兩種流量把握方式,即終產(chǎn)物的抑制和作為細(xì)胞能量狀態(tài)指示劑的代謝物的活性把握。
當(dāng)兩個信號中任一個信號低時,糖酵解將連續(xù)進(jìn)展;當(dāng)兩者均處于正常范圍時,糖酵解途徑尚能起作用,而通過該途徑的流量減小。固然在一個正在代謝葡萄糖的細(xì)胞中,糖酵解途徑?jīng)Q不會完全關(guān)閉,由于細(xì)胞生命活動需要ATP的持續(xù)供給。就不同前體相互之間的平衡和生物合成對于不同前體的需要而論,12種前體代謝物的形成速率的平衡涉及一個高度簡潔的調(diào)控機制。要進(jìn)展這樣的協(xié)調(diào),除了涉及碳架物質(zhì),還有供能反響必需供給的代謝能〔ATP等〕和復(fù)原力〔NADH和NADPH〕。因此,毫不驚異,這些化合物本身就是代謝網(wǎng)絡(luò)中很多不同位點的變構(gòu)效應(yīng)物。關(guān)于能荷調(diào)整,有描述,并已推導(dǎo)出推算能荷的公式:上式給出了對流量的協(xié)調(diào)把握的能荷的推算公式,式中帶下標(biāo)的c分別表示下標(biāo)對應(yīng)的腺苷酸的濃度。從今式可知,能荷可以在0〔全部AMP〕和1〔全部ATP〕之間變化。一般說來,高能荷抑制補充代謝能的酶系〔例如生物合成酶系〕,同時激活消耗ATP的酶系;反之低能荷則抑制消耗代謝能的酶系,同時激活生成ATP的酶系。在氧化-復(fù)原反響中也有類似的狀況。氧化-復(fù)原反響受到復(fù)原荷〔reductioncharge〕的類似的調(diào)整。吡啶核苷酸作為氫負(fù)離子或復(fù)原力的載體:NAD主要在供能途徑的氧化復(fù)原反響中起作用,NADP通常用于生物合成反響。在供能反響中,NAD+〔氧化型的NAD〕是反響物,而合成反響利用NADPH〔復(fù)原型的NADP〕。因此毫不驚異,在生理條件下大局部NAD在胞內(nèi)是以NAD+的形式存在,而NADP是以NADPH的形式存在??捎梅纸獯x復(fù)原荷〔catabolicreducedcharge〕和合成代謝復(fù)原荷〔anabolicreducedcharge〕來描述細(xì)胞的氧化復(fù)原狀態(tài)。分解代謝復(fù)原荷,縮寫為CRC,其值約為0.03~0.07;合成代謝復(fù)原荷,縮寫為ARC,其值約為CRC的10倍。復(fù)原荷可用下面公式計算:式中帶下標(biāo)的c分別表示下標(biāo)對應(yīng)的吡啶核苷酸的濃度。CRC和ARC分別在協(xié)調(diào)供能反響與生物合成反響的過程中,起著重要作用,盡管對它們的作用的細(xì)節(jié)尚不如對能荷的作用那樣清晰。大局部細(xì)胞中有4個供能反響能生成NADPH,兩個反響在磷酸戊糖途徑,它們分別是6-磷酸葡萄糖脫氫酶〔G6PDH〕和6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶〔G6PDH〕;另外兩個反響在TCA環(huán),它們分別是異檸檬酸脫氫酶〔ID〕和蘋果酸酶〔ME〕。生成的NADPH參與生物合成。CRC和ARC的調(diào)整被認(rèn)為是通過轉(zhuǎn)氫酶而發(fā)生的,該酶催化如下可逆反響:
NADP++NADH←→NADPH+NAD+
這是一個束縛在膜上的酶,它由質(zhì)子運動勢〔proton-motiveforce〕驅(qū)動;因此這個過程只能在能量化了的膜上進(jìn)展,該反響的平衡被認(rèn)為是靠質(zhì)子運動勢來轉(zhuǎn)變
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