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文檔簡介

ICS11.220

B41

備案號:71442-2020DB21

遼寧省地方標(biāo)準(zhǔn)

DB21/T3256—2020

非洲豬瘟病毒等溫擴增快速檢測方法

Loop-mediatedIsothermalAmplification(LAMP)forRapidDetectionforAfrican

SwineFeverVirus

DB21/T3256—2020

非洲豬瘟病毒等溫擴增快速檢測方法

1范圍

本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了非洲豬瘟病毒等溫擴增快速檢測方法的技術(shù)要求。

本標(biāo)準(zhǔn)適用于非洲豬瘟疫病的診斷、監(jiān)測及流行病學(xué)調(diào)查,適用于豬血液、脾臟、淋巴結(jié)、腎臟等

組織樣品中非洲豬瘟病毒核酸的快速檢測。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文

件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。

GB19489實驗室生物安全通用要求

3原理

非洲豬瘟病毒是一種DNA病毒,該檢測方法利用6條特異性引物和具有鏈置換能力的DNA聚合酶,在

等溫環(huán)境下1h內(nèi)完成擴增,用于非洲豬瘟病毒的核酸檢測。

4儀器和器材

4.1高速臺式冷凍離心機(離心范圍0~20000r/min)

4.2冰箱:4℃±1℃冰箱,-20℃±1℃冰箱,-7℃±1℃冰箱

4.3恒溫LAMP擴增儀(型號:Gene-8C)

4.4離心管:15ml離心管、1.5ml離心管和0.2mlPCR專用離心管

4.5微量移液器:1000μl,200μl,100μl,50μl,20μl,10μl,2μl

5試劑和引物

5.1樣品處理劑

5.2ASFV-R-Mix

5.3Bstenzyme

5.4D-I礦物油

5.5陽性對照

5.6陰性對照

注:本技術(shù)規(guī)范中使用的試劑,除另有說明外,所有實驗使用的試劑等級均為不含DNA或DNase的分析純或生化試劑;

所有試劑均用無菌的容器分裝。

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6操作步驟

6.1樣品的采集、前處理、存放與運輸

6.1.1采樣注意事項

采集樣品及樣品前處理過程中應(yīng)戴一次性手套,樣本間不得交叉污染。

6.1.2采樣工具

15ml離心管和1.5ml離心管經(jīng)121±1℃高壓滅菌20min;剪刀、鑷子經(jīng)160℃干熱滅菌2h,無

菌管(真空采血管)。

6.1.3組織病料的采集與前處理

采集疑似非洲豬瘟病毒感染豬的肺臟、肝臟、腎臟、脾臟等組織樣品,用無菌的剪刀和鑷子剪取待

檢樣品約10g于組織勻漿器或研缽中充分勻漿或研磨,加入0.3ml~0.5ml組織懸液混勻,60℃,30min

滅活后,將懸液轉(zhuǎn)入無菌Eppendorf管中,4℃條件下5000r/min離心10min,編號備用。

6.1.4全血及血清樣本的采集與前處理

使用含有抗凝血劑(EDTA-紫色蓋)的無菌管(真空采血管)從耳靜脈或前腔靜脈采集血液3ml~5

ml,60℃,30min滅活后,可直接檢測;若檢測血清,可靜置全血樣本待血清析出后,直接吸取至無

菌Eppendorf管中,60℃,30min滅活后,編號備用。

6.1.5存放與運輸

采集或處理的樣品在2~8℃條件下保存應(yīng)不超過24h;若需長期保存,應(yīng)放置-70℃冰箱,但應(yīng)

避免反復(fù)凍融(凍融不超過3次)。采集的樣品密封后,采用保溫壺或保溫桶加冰密封,在8h之內(nèi)運送

到實驗室檢測。按照《獸醫(yī)實驗室生物安全技術(shù)管理規(guī)范》進行樣品的生物安全標(biāo)識。

6.2樣品DNA的提取

取10μl前處理過的樣本加入無菌1.5ml離心管,加入10μl樣品處理劑,混勻,94℃裂解2min,

瞬時離心,上清即為擴增模板。

6.3核酸擴增

6.3.1吸取22μlASFV-R-Mix和1μlBstenzyme加入同一個PCR管,吸取2μl步驟6.2處理的

核酸擴增模板加至PCR管,混勻,設(shè)置陰陽性對照;

6.3.2吸取10μlD-I礦物油輕輕加至PCR管液面,切勿震蕩混勻;

6.3.3插入到恒溫擴增儀反應(yīng)槽中;

6.3.4設(shè)置恒溫擴增儀器反應(yīng)條件為:65℃反應(yīng)12min,熒光采集周期20s。

7試驗成立條件與結(jié)果判定

7.1試驗成立條件

使用前用陰、陽性對照進行該檢測方法評價,若陽性對照CT值≤40,陰性對照CT值>40,則檢測結(jié)

果有效。

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7.2結(jié)果判定

若CT值≤40,樣品應(yīng)判定為非洲豬瘟病毒核酸陽性;若CT值>40,樣品應(yīng)判定為非洲豬瘟病毒核酸

陰性

8實驗室生物安全要求

按照GB19489實驗室生物安全通用要求執(zhí)行。

3

DB21/T3256—2020

AA

附錄A

(規(guī)范性附錄)

試劑配制

A.1樣品處理劑的制備

量取80mlPBS(0.01mol/L,pH值7.4),加入10μlNP40(乙基苯基聚乙二醇),無菌純化水

定容至100ml,定量分裝,500μl/管,-20℃保存。

A.2ASFV-R-Mix的制備

A.2.1引物合成

根據(jù)非洲豬瘟病毒p72基因片段的保守結(jié)構(gòu)域設(shè)計3對引物,包括1對內(nèi)引物(FIP與BIP)、1對外引

物(F3與B3)和1對環(huán)引物(LF與LB),均由上海生工生物工程股份有限公司合成,序列為:

FIP:5'-TAACGCCACTATGCAGCCCACGGAAGAGCTGAATCTCTATCCT-3'

BIP:5'-CAACATGTGCGAACTTGTGCCACATACCTGGAACGTCTCC-3'

F3:5'-ATAGGTAATGCGATCGGATACA-3'

B3:5'-CCAACAATAACCGCCACGC-3'

LF:5'-TCGCCACGCAAAGATAAGC-3'

LB:5'-AGCCTCGGTGTTGATGCGGATT-3'

A.2.2引物混合物的制備

取3對引物(FIP、BIP、F3、B3、LF和LB)干粉,按引物說明書分別加入適量無菌純化水,溶解混

勻,得到各引物溶液,置-20℃保存。

A.2.3ASFV-R-Mix的配制

稱取2.4gTris,0.37g氯化鉀,0.12g硫酸鎂,100μl吐溫-20,7.029g甜菜堿,溶于80ml

純化水,依次加入終濃度為1.4mmol/LdNTPs溶液、0.2μmol/L外引物溶液、1.6μmol/L內(nèi)引物溶液、

0.8μmol/L環(huán)引物溶液,加入無菌純化水定容至100ml,經(jīng)過0.22μm濾器過濾除菌,分裝至2ml藍(lán)

蓋可立凍存管中,1.1ml/管,-20℃保存。

A.3Bstenzyme的制備

用于制備本試劑盒的Bstenzyme為商品化DNA聚合酶,按使用說明書用純化水稀釋至4×106/L,分

裝至0.5ml白蓋可立凍存管中,100/μl管,-20℃保存。

A.4D-I礦物油

用于制備本試劑盒的D-I礦物油為商品化礦物油,分裝至2ml黃蓋可立凍存管中,500μl/管,

-20℃保存。

A.5陽性對照

采用核酸蛋白質(zhì)分析儀測定陽性質(zhì)控品濃度,計算質(zhì)粒拷貝數(shù),用純化水將其稀釋為103拷貝/μl,

分裝至0.5ml紅蓋可立凍存管中,100μl/管,-20℃保存。

A.6陰性對照

取純化水,分裝至0.5ml綠蓋可立凍存管中,100μl/管,-20℃保存。

4

DB21/T3256—2020

_________________________________

5

DB21/XXXXX—XXXX

前言

本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。

本標(biāo)準(zhǔn)由遼寧省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳提出并歸口管理。

本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:遼寧省農(nóng)業(yè)發(fā)展服務(wù)中心、中國科學(xué)院微生物研究所、洛陽萊普生信息科技有限

公司、遼寧佰瑞生物科技有限公司。

本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:楊作豐、周晨陽、李秀梅、王宏燕、楊利敏、董娜、劉文軍、張皓淳、姚偉、

劉洋、劉近、吳洪濤、任雪建、趙培、李蓉、章春燕、呂園園、陳騰。

本標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布實施后,任何單位和個人如有問題和意見建議,均可以通過來電和來函等方式進行反饋,

我們將及時答復(fù)并認(rèn)真處理,根據(jù)實際情況依法進行評估及復(fù)審。

歸口管理部門通訊地址:遼寧省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳(沈陽市和平區(qū)太原北街2號),聯(lián)系電話

標(biāo)準(zhǔn)起草單位通訊地址:遼寧省動物及產(chǎn)品檢疫中心(沈陽市沈河區(qū)萬柳塘路105號甲),聯(lián)系電

I

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