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文檔簡介
ICS11.220
B41
備案號:71442-2020DB21
遼寧省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB21/T3256—2020
非洲豬瘟病毒等溫擴增快速檢測方法
Loop-mediatedIsothermalAmplification(LAMP)forRapidDetectionforAfrican
SwineFeverVirus
DB21/T3256—2020
非洲豬瘟病毒等溫擴增快速檢測方法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了非洲豬瘟病毒等溫擴增快速檢測方法的技術(shù)要求。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于非洲豬瘟疫病的診斷、監(jiān)測及流行病學(xué)調(diào)查,適用于豬血液、脾臟、淋巴結(jié)、腎臟等
組織樣品中非洲豬瘟病毒核酸的快速檢測。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB19489實驗室生物安全通用要求
3原理
非洲豬瘟病毒是一種DNA病毒,該檢測方法利用6條特異性引物和具有鏈置換能力的DNA聚合酶,在
等溫環(huán)境下1h內(nèi)完成擴增,用于非洲豬瘟病毒的核酸檢測。
4儀器和器材
4.1高速臺式冷凍離心機(離心范圍0~20000r/min)
4.2冰箱:4℃±1℃冰箱,-20℃±1℃冰箱,-7℃±1℃冰箱
4.3恒溫LAMP擴增儀(型號:Gene-8C)
4.4離心管:15ml離心管、1.5ml離心管和0.2mlPCR專用離心管
4.5微量移液器:1000μl,200μl,100μl,50μl,20μl,10μl,2μl
5試劑和引物
5.1樣品處理劑
5.2ASFV-R-Mix
5.3Bstenzyme
5.4D-I礦物油
5.5陽性對照
5.6陰性對照
注:本技術(shù)規(guī)范中使用的試劑,除另有說明外,所有實驗使用的試劑等級均為不含DNA或DNase的分析純或生化試劑;
所有試劑均用無菌的容器分裝。
1
DB21/T3256—2020
6操作步驟
6.1樣品的采集、前處理、存放與運輸
6.1.1采樣注意事項
采集樣品及樣品前處理過程中應(yīng)戴一次性手套,樣本間不得交叉污染。
6.1.2采樣工具
15ml離心管和1.5ml離心管經(jīng)121±1℃高壓滅菌20min;剪刀、鑷子經(jīng)160℃干熱滅菌2h,無
菌管(真空采血管)。
6.1.3組織病料的采集與前處理
采集疑似非洲豬瘟病毒感染豬的肺臟、肝臟、腎臟、脾臟等組織樣品,用無菌的剪刀和鑷子剪取待
檢樣品約10g于組織勻漿器或研缽中充分勻漿或研磨,加入0.3ml~0.5ml組織懸液混勻,60℃,30min
滅活后,將懸液轉(zhuǎn)入無菌Eppendorf管中,4℃條件下5000r/min離心10min,編號備用。
6.1.4全血及血清樣本的采集與前處理
使用含有抗凝血劑(EDTA-紫色蓋)的無菌管(真空采血管)從耳靜脈或前腔靜脈采集血液3ml~5
ml,60℃,30min滅活后,可直接檢測;若檢測血清,可靜置全血樣本待血清析出后,直接吸取至無
菌Eppendorf管中,60℃,30min滅活后,編號備用。
6.1.5存放與運輸
采集或處理的樣品在2~8℃條件下保存應(yīng)不超過24h;若需長期保存,應(yīng)放置-70℃冰箱,但應(yīng)
避免反復(fù)凍融(凍融不超過3次)。采集的樣品密封后,采用保溫壺或保溫桶加冰密封,在8h之內(nèi)運送
到實驗室檢測。按照《獸醫(yī)實驗室生物安全技術(shù)管理規(guī)范》進行樣品的生物安全標(biāo)識。
6.2樣品DNA的提取
取10μl前處理過的樣本加入無菌1.5ml離心管,加入10μl樣品處理劑,混勻,94℃裂解2min,
瞬時離心,上清即為擴增模板。
6.3核酸擴增
6.3.1吸取22μlASFV-R-Mix和1μlBstenzyme加入同一個PCR管,吸取2μl步驟6.2處理的
核酸擴增模板加至PCR管,混勻,設(shè)置陰陽性對照;
6.3.2吸取10μlD-I礦物油輕輕加至PCR管液面,切勿震蕩混勻;
6.3.3插入到恒溫擴增儀反應(yīng)槽中;
6.3.4設(shè)置恒溫擴增儀器反應(yīng)條件為:65℃反應(yīng)12min,熒光采集周期20s。
7試驗成立條件與結(jié)果判定
7.1試驗成立條件
使用前用陰、陽性對照進行該檢測方法評價,若陽性對照CT值≤40,陰性對照CT值>40,則檢測結(jié)
果有效。
2
DB21/T3256—2020
7.2結(jié)果判定
若CT值≤40,樣品應(yīng)判定為非洲豬瘟病毒核酸陽性;若CT值>40,樣品應(yīng)判定為非洲豬瘟病毒核酸
陰性
8實驗室生物安全要求
按照GB19489實驗室生物安全通用要求執(zhí)行。
3
DB21/T3256—2020
AA
附錄A
(規(guī)范性附錄)
試劑配制
A.1樣品處理劑的制備
量取80mlPBS(0.01mol/L,pH值7.4),加入10μlNP40(乙基苯基聚乙二醇),無菌純化水
定容至100ml,定量分裝,500μl/管,-20℃保存。
A.2ASFV-R-Mix的制備
A.2.1引物合成
根據(jù)非洲豬瘟病毒p72基因片段的保守結(jié)構(gòu)域設(shè)計3對引物,包括1對內(nèi)引物(FIP與BIP)、1對外引
物(F3與B3)和1對環(huán)引物(LF與LB),均由上海生工生物工程股份有限公司合成,序列為:
FIP:5'-TAACGCCACTATGCAGCCCACGGAAGAGCTGAATCTCTATCCT-3'
BIP:5'-CAACATGTGCGAACTTGTGCCACATACCTGGAACGTCTCC-3'
F3:5'-ATAGGTAATGCGATCGGATACA-3'
B3:5'-CCAACAATAACCGCCACGC-3'
LF:5'-TCGCCACGCAAAGATAAGC-3'
LB:5'-AGCCTCGGTGTTGATGCGGATT-3'
A.2.2引物混合物的制備
取3對引物(FIP、BIP、F3、B3、LF和LB)干粉,按引物說明書分別加入適量無菌純化水,溶解混
勻,得到各引物溶液,置-20℃保存。
A.2.3ASFV-R-Mix的配制
稱取2.4gTris,0.37g氯化鉀,0.12g硫酸鎂,100μl吐溫-20,7.029g甜菜堿,溶于80ml
純化水,依次加入終濃度為1.4mmol/LdNTPs溶液、0.2μmol/L外引物溶液、1.6μmol/L內(nèi)引物溶液、
0.8μmol/L環(huán)引物溶液,加入無菌純化水定容至100ml,經(jīng)過0.22μm濾器過濾除菌,分裝至2ml藍(lán)
蓋可立凍存管中,1.1ml/管,-20℃保存。
A.3Bstenzyme的制備
用于制備本試劑盒的Bstenzyme為商品化DNA聚合酶,按使用說明書用純化水稀釋至4×106/L,分
裝至0.5ml白蓋可立凍存管中,100/μl管,-20℃保存。
A.4D-I礦物油
用于制備本試劑盒的D-I礦物油為商品化礦物油,分裝至2ml黃蓋可立凍存管中,500μl/管,
-20℃保存。
A.5陽性對照
采用核酸蛋白質(zhì)分析儀測定陽性質(zhì)控品濃度,計算質(zhì)粒拷貝數(shù),用純化水將其稀釋為103拷貝/μl,
分裝至0.5ml紅蓋可立凍存管中,100μl/管,-20℃保存。
A.6陰性對照
取純化水,分裝至0.5ml綠蓋可立凍存管中,100μl/管,-20℃保存。
4
DB21/T3256—2020
_________________________________
5
DB21/XXXXX—XXXX
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2009給出的規(guī)則起草。
本標(biāo)準(zhǔn)由遼寧省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳提出并歸口管理。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:遼寧省農(nóng)業(yè)發(fā)展服務(wù)中心、中國科學(xué)院微生物研究所、洛陽萊普生信息科技有限
公司、遼寧佰瑞生物科技有限公司。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:楊作豐、周晨陽、李秀梅、王宏燕、楊利敏、董娜、劉文軍、張皓淳、姚偉、
劉洋、劉近、吳洪濤、任雪建、趙培、李蓉、章春燕、呂園園、陳騰。
本標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布實施后,任何單位和個人如有問題和意見建議,均可以通過來電和來函等方式進行反饋,
我們將及時答復(fù)并認(rèn)真處理,根據(jù)實際情況依法進行評估及復(fù)審。
歸口管理部門通訊地址:遼寧省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳(沈陽市和平區(qū)太原北街2號),聯(lián)系電話
標(biāo)準(zhǔn)起草單位通訊地址:遼寧省動物及產(chǎn)品檢疫中心(沈陽市沈河區(qū)萬柳塘路105號甲),聯(lián)系電
話
I
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