英文醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫檢索課件

0英文醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫檢索1問題的提出阿司匹林能否預(yù)防大腸癌？國內(nèi)專業(yè)文獻(xiàn)檢索結(jié)果文獻(xiàn)結(jié)論不一致很多國內(nèi)文獻(xiàn)摘譯自國外專業(yè)文獻(xiàn)23大綱一、英文數(shù)據(jù)庫概述

二、Pubmed文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)4一、英文數(shù)據(jù)庫概述按專業(yè)可分為：綜合性數(shù)據(jù)庫和專業(yè)數(shù)據(jù)庫。綜合性數(shù)據(jù)庫：三大索引SCI科學(xué)引文索引ISTP科技會(huì)議錄索引EI工程索引WebofScienceEngineeringVillages25一、英文數(shù)據(jù)庫概述專業(yè)數(shù)據(jù)庫：醫(yī)學(xué)領(lǐng)域常用四大索引SCI科學(xué)引文索引(WebofScience)BA生物學(xué)文摘(BIOSISPreview)CA化學(xué)文摘(CAPlus)WebofKnowledgeSciFinderScholarIM醫(yī)學(xué)索引(Medline數(shù)據(jù)庫〕PubmedDialog聯(lián)機(jī)檢索系統(tǒng)6一、英文數(shù)據(jù)庫概述7一、英文數(shù)據(jù)庫概述按收費(fèi)與否，可分為收費(fèi)數(shù)據(jù)庫與免費(fèi)數(shù)據(jù)庫。英文數(shù)據(jù)庫大局部收費(fèi)。免費(fèi)數(shù)據(jù)庫：Pubmed：://medscape:://medscapeGoogleScholar:://scholar.google8GoogleScholar查找國外專業(yè)文獻(xiàn)檢索提問式“colorectalcanceraspirin"時(shí)間限定在“2021年以來〞獲取結(jié)果16，900條結(jié)果9GoogleScholar查找國內(nèi)專業(yè)文獻(xiàn)記錄來源包括ＣＮＫＩ、維普、萬方以及其他網(wǎng)頁信息10二、Pubmed文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)

知識(shí)精要（一）檢索指南（二）11〔一〕、Pubmed知識(shí)精要沿革1資源2檢索途徑4

常用字段3特色512PubmedMedline光盤Medline聯(lián)機(jī)檢索IndexMedicus1997-1983-1964-1879-1.Pubmed沿革1314Medline免費(fèi)檢索效勞Pubmed：://MedscapeHighwire：://15利用Medscape檢索Medline162.Pubmed可獲取資源172.Pubmed可獲取資源〔1〕生物醫(yī)學(xué)期刊論文線索MEDLINE：可獲取1950年以來80多個(gè)國家的5000余種生物醫(yī)學(xué)期刊中的文獻(xiàn)線索。In-processcitations：待標(biāo)引的MEDLINE的前期數(shù)據(jù)庫。Publishersuppliedcitation：出版商提供的文獻(xiàn)，主要是MEDLINE選擇性收錄的期刊中超出收錄范圍的文獻(xiàn)。OLDMEDLINE:1965年以前的記錄1819Pubmed記錄來源標(biāo)識(shí)〔1〕[PubMed–indexedforMedline]

[PubMed-inprocess]

[PubMed-assuppliedbypublisher]20Pubmed記錄來源標(biāo)識(shí)〔2〕免費(fèi)全文213.PubMed記錄的主要字段(P85〕字段標(biāo)識(shí)：字段名稱

AB：AbstractAD：AffiliationALL：AllField

AU：Authors1AU：FirstAuthorFAU：FullAuthorNamePMID：PubMedUniqueIdentifierDP：PublicationDate

字段標(biāo)識(shí)：字段名稱LA：Language

MH：MeSHTerms

MAJR：MeSHMajorTopic

SH：MeSHSubheadings

PT：PublicationType

SO：Source

TA：JournalTitle

TI：TitleTW：TextWords224.PubMed檢索途徑高級(jí)檢索根本檢索23Pubmed高級(jí)檢索限定字段進(jìn)行檢索利用索引選擇提問詞查看并利用已有檢索式進(jìn)行檢索24PubmedMeshDatabase2525

MeSHDatabase:查看并利用主題詞檢索MeSH主題詞檢索是PubMed最具特色的檢索功能之一，能保證較好的查全率和查準(zhǔn)率主題詞對(duì)同一概念的不同表達(dá)方式進(jìn)行了標(biāo)準(zhǔn)主題詞組配副主題詞，使檢索結(jié)果更加專指主題詞的樹狀結(jié)構(gòu)表：可自由調(diào)整檢索策略擴(kuò)展檢索：利用下位詞同時(shí)進(jìn)行檢索，提高查全率限定檢索：將檢索結(jié)果限定在主要主題詞，使檢索結(jié)果更加準(zhǔn)確注意：用MeSH詞檢索時(shí)，只檢索來源于MEDLILNE的文獻(xiàn)，不檢索PubMed其他來源的文獻(xiàn)26JournalsinNCBIDatabases查找期刊詳細(xì)信息并獲取期刊論文查找期刊詳細(xì)信息并獲取期刊論文27PubmedSingleCitationMatcher準(zhǔn)確查找指定論文285.Pubmed特色生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域首選數(shù)據(jù)庫收錄期刊范圍側(cè)重生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域檢索免費(fèi)，并可免費(fèi)獲取局部全文及相關(guān)生物信息學(xué)資源。文獻(xiàn)報(bào)道速度快收錄文獻(xiàn)加工質(zhì)量高，經(jīng)Mesh主題詞標(biāo)引。檢索功能強(qiáng)大，支持自動(dòng)詞語匹配檢索，并提供主題詞檢索、臨床查詢、引文檢索等特色檢索效勞。29檢索詞Mesh轉(zhuǎn)換表期刊名轉(zhuǎn)換表作者索引表經(jīng)過轉(zhuǎn)換后的檢索式Pubmed系統(tǒng)進(jìn)行檢索Details分析29作者姓名轉(zhuǎn)換表PubMed特色：自動(dòng)詞語匹配功能30PubMed自動(dòng)詞語匹配功能舉例：欲查找大腸癌與阿司匹林同時(shí)出現(xiàn)的文獻(xiàn)，輸入“colorectalcanceraspirin〞，系統(tǒng)轉(zhuǎn)換后實(shí)際檢索策略為("colorectalneoplasms"[MeSHTerms]OR("colorectal"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"colorectalneoplasms"[AllFields]OR("colorectal"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"colorectalcancer"[AllFields])AND("aspirin"[MeSHTerms]OR"aspirin"[AllFields])31智能檢索功能不僅能準(zhǔn)確拆分詞，而且能將提問詞轉(zhuǎn)換為MESH詞，并在Mesh字段與全字段同時(shí)進(jìn)行檢索，有效保證文獻(xiàn)的查全和查準(zhǔn)。SearchDetails框詳細(xì)顯示自動(dòng)詞語匹配的實(shí)際檢索式。32查看系統(tǒng)轉(zhuǎn)換后的檢索策略原始提問式系統(tǒng)轉(zhuǎn)換過程系統(tǒng)實(shí)際檢索策略33

問題？

Q：是否可以完全依賴詞語的自動(dòng)詞語匹配功能？

例如：單細(xì)胞Singlecell3334自動(dòng)詞語匹配3435如何防止系統(tǒng)進(jìn)行自動(dòng)詞語匹配？檢索詞加上""〔半角狀態(tài)的雙引號(hào)〕,進(jìn)行強(qiáng)制檢索系統(tǒng)不進(jìn)行自動(dòng)詞語匹配，不擴(kuò)展檢索singlecell直接輸入"singlecell"或者single-cell353636以下情形不進(jìn)行自動(dòng)詞語匹配精確短語匹配,如“kidneyallograft〞截詞檢索,如bacter*連字符時(shí),如kidney-allograftHistory檢索,如#1AND#２字段檢索,如toothache[ti]37〔二〕、Pubmed檢索指南如何查找阿司匹林預(yù)防大腸癌的文獻(xiàn)？1如何查找指定文獻(xiàn)？2381.如何查找阿司匹林預(yù)防大腸癌的文獻(xiàn)？課題分析兩個(gè)主要概念組面阿司匹林〔aspirin)大腸癌(colorectalcancer)如何翻譯英文提問詞？CNKI翻譯助手Google翻譯有道391.如何查找阿司匹林預(yù)防大腸癌的文獻(xiàn)？試檢：Pubmed根本檢索效勞提問詞：colorectalcanceraspirin40獲取檢索結(jié)果〔上〕限定條件進(jìn)行檢索，相當(dāng)于原來的“Limits〞功能自動(dòng)獲取相關(guān)文獻(xiàn)轉(zhuǎn)換顯示格式記錄輸出41獲取檢索結(jié)果〔下〕獲取免費(fèi)全文查找相關(guān)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫查看系統(tǒng)轉(zhuǎn)換后的檢索策略42轉(zhuǎn)換記錄顯示格式AspirinforprophylacticuseintheprimarypreventionAspirinforprophylacticuseintheprimaryprevention43也可單擊題名超鏈進(jìn)入ABSTRACT格式作者單位來源查找刊名全稱44NLMCatalog:獲取刊名全稱45將檢索結(jié)果限定為近5年綜述設(shè)置文獻(xiàn)過濾器查找特定類型文獻(xiàn)過濾條件一經(jīng)選擇持續(xù)起作用已選擇的文件過濾器46?利用主題詞進(jìn)行檢索〔難點(diǎn)〕1.進(jìn)入“MeshDatabase〞界面2.在此界面查找“colorectalcancer(大腸癌)〞對(duì)應(yīng)的主題詞(點(diǎn)擊選定主題詞超鏈，可獲取主題詞詳細(xì)信息〕3.輸入提問框"Addtosearchbuilder"4.找到“aspirin〞對(duì)應(yīng)的主題詞后，“Addtosearchbuilder〞，邏輯運(yùn)算符選擇“And〞5.“searchpubmed〞進(jìn)行檢索6.在檢索結(jié)果界面，點(diǎn)擊選定文獻(xiàn)題名超鏈，進(jìn)行其文摘格式，在此界面下方點(diǎn)擊“PublicationTypes,MeSHTerms,Substances〞選項(xiàng)，獲取主題詞及主要主題詞信息〔注：主要主題詞有“*〞標(biāo)志〕471.進(jìn)入“MeshDatabase〞界面兩種方式進(jìn)入MeshDatabase482.查找主題詞〔上〕定義及主題詞引進(jìn)年代c組配副主題詞添加到檢索框檢索文獻(xiàn)492.查找主題詞〔下〕c加權(quán)檢索c相關(guān)參照擴(kuò)展檢索款目詞：主題詞同義詞或近義詞樹狀結(jié)構(gòu)c上位詞下位詞503.利用主題詞進(jìn)行檢索添加到檢索框檢索文獻(xiàn)(("ColorectalNeoplasms"[Mesh])OR"CecalNeoplasms"[Mesh])AND"Aspirin"[Mesh]514.獲取檢索結(jié)果點(diǎn)擊題名超鏈獲取詳細(xì)信息525.獲取記錄詳細(xì)信息53PublicationTypes,MeSHTerms,Substances：

獲取題錄的文獻(xiàn)類型、主題詞及物質(zhì)信息獲取指定題錄的主題詞信息，其中帶*號(hào)的為主要主題詞54LinkOut：獲取題錄相關(guān)資源獲取全文獲取醫(yī)學(xué)背景知識(shí)獲取相關(guān)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)55利用Linkout獲取醫(yī)學(xué)背景知識(shí)免費(fèi)在線醫(yī)學(xué)百科全書56課題2：如何查找英文原文？方法一：可以利用根本檢索57如何查找中文摘譯的英文原文？1.提取文中關(guān)鍵信息發(fā)表日期：2021年7月16日期刊名：AnnalsofInternalMedicine關(guān)鍵詞：colorectalcancer,aspirin2.訪問Pubmed，確定檢索方法根本檢索SingleCitationMatcher58(1)根本檢索方式aspirincolorectalcancer"annalsofinternalmedicine"2021Q:為什么期刊名annalsofinternalmedicine要加雙引號(hào)？59獲取原文線索60在摘要頁面點(diǎn)擊“Linkout〞61獲取原文62(2)singlecitationmatcher檢索63PubmedSingleCitationMatcherc檢索提問式：Journal:annalsofinternalmedicineData:2021/07/16TitleWords:aspirin64annalsofinternalmedicine[Jour]and2021/07/16[pdat]andaspirin65Pubmed檢索小結(jié)自動(dòng)詞語匹配檢索一般適合檢索經(jīng)驗(yàn)有限的初級(jí)用戶，也適合對(duì)課題做初步檢索。檢索經(jīng)驗(yàn)豐富的用戶，或者對(duì)查全率查準(zhǔn)率有較高要求的檢索課題，需要仔細(xì)分析課題，編制