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第三章蛋白質(zhì)
蛋白質(zhì)是最基本的生命物質(zhì)之一,是細(xì)胞中含量最豐富、功能最多的生物大分子,它參與動(dòng)物、植物、微生物的幾乎所有生命結(jié)構(gòu)和生命過(guò)程,它在細(xì)胞結(jié)構(gòu)、生物催化、物質(zhì)運(yùn)輸、運(yùn)動(dòng)、防御、調(diào)控以及記憶、識(shí)別等各個(gè)方面起著極其重要的作用。
1第三章蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)是最基本的生命物質(zhì)之一,是細(xì)胞中恩格斯<<自然辨證法>>:
生命是蛋白體存在的方式無(wú)論在什么地方,只要我們遇到生命,我們就會(huì)發(fā)現(xiàn)生命是和某種蛋白體相聯(lián)系的;并且無(wú)論在什么地方,只要我們遇到不處于解體過(guò)程的蛋白體,我們也無(wú)例外地發(fā)現(xiàn)生命。2恩格斯<<自然辨證法>>:2精品資料3精品資料3你怎么稱呼老師?如果老師最后沒有總結(jié)一節(jié)課的重點(diǎn)的難點(diǎn),你是否會(huì)認(rèn)為老師的教學(xué)方法需要改進(jìn)?你所經(jīng)歷的課堂,是講座式還是討論式?教師的教鞭“不怕太陽(yáng)曬,也不怕那風(fēng)雨狂,只怕先生罵我笨,沒有學(xué)問(wèn)無(wú)顏見爹娘……”“太陽(yáng)當(dāng)空照,花兒對(duì)我笑,小鳥說(shuō)早早早……”44一、元素組成:
蛋白質(zhì)主要含有C、H、O、N,有的還含有S、P等,蛋白質(zhì)元素組成與糖、脂不同的是含有N,而且大多數(shù)蛋白質(zhì)含N量相當(dāng)接近,約為15-17%,平均為16%。5一、元素組成:
蛋白質(zhì)主要含有C、H、O、N,
所以在任何生物樣品中,每克N的存在大約表示該樣品含有100/16=6.25g蛋白質(zhì),因此,只要測(cè)定生物樣品中的含N量,就能計(jì)算出蛋白質(zhì)的大致含量。例如測(cè)定100克面粉中含有2gN,說(shuō)明100克面粉里含有2×6.25=12.5g蛋白質(zhì),面粉的蛋白質(zhì)含量=12.5%。6所以在任何生物樣品中,每克N的存在大約表二、蛋白質(zhì)是高分子物質(zhì),結(jié)構(gòu)復(fù)雜,分子量大,一般都在一萬(wàn)以上,蛋白質(zhì)可被酸、堿和酶蛋白催化水解,使蛋白質(zhì)分子斷裂,分子量逐步變小,最后水解成AA。7二、蛋白質(zhì)是高分子物質(zhì),結(jié)構(gòu)復(fù)雜,分子量大,一般都在一萬(wàn)以上例如:在體外加5-10倍20%HCl水解蛋白質(zhì)24hr,即可使蛋白質(zhì)水解成AA。毛發(fā)蛋白6mol/LNaOH溶液中煮沸6hr水解成AA。例:豬毛制備AA,胱氨酸、賴氨酸、精氨酸等8例如:8酶水解:在生物體內(nèi),蛋白質(zhì)主要是在蛋白酶的催化下分解的,在水解過(guò)程中由于水解方法和條件不同,可以得到不同程度的降解物。
蛋白酶蛋白腙酶蛋白胨酶端解酶蛋白質(zhì)蛋白腙蛋白胨多肽20AAM·W104以上-5×103-2×103100以上100左右9酶水解:9單體分子的排列組合10單體分子的排列組合101111第一節(jié)氨基酸12第一節(jié)氨基酸12一氨基酸的分類(一)
非極性AA:這類AA共有8種,包括五種具脂肪烴R基團(tuán)的AA,即:丙氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、甲硫氨酸和色氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸,其中色氨酸和苯丙氨酸含有吲哚環(huán)和苯基、脯氨酸是一種亞氨基酸,這類非極性AA不易溶于水。13一氨基酸的分類(一)
非極性AA:131414
(二)極性氨酸(不帶電荷)
以上七種極性氨酸比非極性AA易溶于水。它們所含的極性R基團(tuán)能參與氫鍵的形成,絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸的極性是由羧基提供的;而天冬酰胺和谷酰胺的極性是由酰胺基產(chǎn)生;半胱氨酸的極性由巰基產(chǎn)生,甘氨酸雖不帶有側(cè)鏈極性基團(tuán),但由于所帶的α-氨基和α-羧基占了整個(gè)分子的大部分,具有明顯的極性,所以也歸納為極性AA一類。15(二)極性氨酸(不帶電荷)151616(三)酸性AA-R基團(tuán)帶負(fù)電荷的AA
因含有第二個(gè)羧基,所以在pH7.0時(shí)具有凈負(fù)電荷。
17(三)酸性AA-R基團(tuán)帶負(fù)電荷的AA17(四)
堿性AA—R基團(tuán)帶正電荷的AA
這三種AA的側(cè)鏈基團(tuán)在pH7.0時(shí)帶有正電荷,賴氨酸的R側(cè)鏈帶有-NH2基,精氨酸帶有具正電荷的胍基;組氨酸具有弱堿性的咪唑基。18(四)
堿性AA—R基團(tuán)帶正電荷的AA18二、氨基酸的分類(一)常見的蛋白質(zhì)氨基酸
按R基團(tuán)的極性可將氨基酸分為四大類:(1)非極性R基團(tuán)氨基酸:8個(gè)
AlaValLeuIleProPheTrpMet(2)極性R基團(tuán)不帶電荷氨基酸:7個(gè)
GlySerThrCysTyrAsnGln
19二、氨基酸的分類(一)常見的蛋白質(zhì)氨基酸(1)非極性R基團(tuán)氨(3)極性R基團(tuán)帶負(fù)電荷氨基酸:2個(gè)
AspGlu(4)極性R基團(tuán)帶正電荷氨基酸:3個(gè)
HisLysArg20(3)極性R基團(tuán)帶負(fù)電荷氨基酸:2個(gè)(4)極性R基氨基酸的結(jié)構(gòu)
脂肪族氨基酸丙氨酸
Alanine21氨基酸的結(jié)構(gòu)脂肪族氨基酸丙氨酸氨基酸的結(jié)構(gòu)纈氨酸
Valine
脂肪族氨基酸22氨基酸的結(jié)構(gòu)纈氨酸氨基酸的結(jié)構(gòu)亮氨酸
Leucine
脂肪族氨基酸-氨基異己酸23氨基酸的結(jié)構(gòu)亮氨酸Leucine氨基酸的結(jié)構(gòu)異亮氨酸Ileucine脂肪族氨基酸-氨基--甲基戊酸24氨基酸的結(jié)構(gòu)異亮氨酸脂肪族氨基酸-氨基--甲基戊酸2氨基酸的結(jié)構(gòu)脯氨酸
Proline
亞氨基酸25氨基酸的結(jié)構(gòu)脯氨酸Proline氨基酸的結(jié)構(gòu)
芳香族氨基酸苯丙氨酸Phenylalanine-氨基--苯基丙酸26氨基酸的結(jié)構(gòu)芳香族氨基酸苯丙氨酸-氨基-氨基酸的結(jié)構(gòu)芳香族氨基酸色氨酸TryptophanTrp-氨基--吲哚基丙酸27氨基酸的結(jié)構(gòu)芳香族氨基酸色氨酸-氨基--吲哚基丙氨基酸的結(jié)構(gòu)甲硫氨酸(蛋氨酸)Methionine
含硫氨基酸-氨基--甲硫基丁酸28氨基酸的結(jié)構(gòu)甲硫氨酸(蛋氨酸)Methionine氨基酸的結(jié)構(gòu)甘氨酸
Glycine極性不帶電荷脂肪族氨基酸29氨基酸的結(jié)構(gòu)甘氨酸極性不帶電荷29氨基酸的結(jié)構(gòu)絲氨酸
Serine
極性不帶電荷含羥基氨基酸30氨基酸的結(jié)構(gòu)絲氨酸Serine極性不帶電荷含羥基氨氨基酸的結(jié)構(gòu)蘇氨酸
Threonine極性不帶電荷含羥基氨基酸-氨基--羥基丁酸31氨基酸的結(jié)構(gòu)蘇氨酸Threonine極性不帶電荷-氨基酸的結(jié)構(gòu)半胱氨酸
Cysteine極性不帶電荷含硫氨基酸-氨基--巰基丙酸32氨基酸的結(jié)構(gòu)半胱氨酸Cysteine極性不帶電荷-氨基酸的結(jié)構(gòu)極性不帶電荷芳香族氨基酸酪氨酸Tyrosine-氨基--對(duì)羥苯基丙酸33氨基酸的結(jié)構(gòu)極性不帶電荷酪氨酸-氨基--對(duì)羥苯基丙酸3氨基酸的結(jié)構(gòu)天冬酰胺AsparagineAsn極性不帶電荷含酰胺氨基酸34氨基酸的結(jié)構(gòu)天冬酰胺Asparagine極性不帶電荷34氨基酸的結(jié)構(gòu)谷酰胺
GlutamineGln極性不帶電荷含酰胺氨基酸35氨基酸的結(jié)構(gòu)谷酰胺Glutamine極性不帶電荷氨基酸的結(jié)構(gòu)天冬氨酸Aspartate
極性帶負(fù)電酸性氨基酸36氨基酸的結(jié)構(gòu)天冬氨酸Aspartate極性帶負(fù)電36氨基酸的結(jié)構(gòu)谷氨酸
Glutamate極性帶負(fù)電酸性氨基酸37氨基酸的結(jié)構(gòu)谷氨酸Glutamate極性帶負(fù)電3氨基酸的結(jié)構(gòu)極性帶正電荷堿性氨基酸精氨酸
Arginine38氨基酸的結(jié)構(gòu)極性帶正電荷精氨酸Arginine38氨基酸的結(jié)構(gòu)組氨酸
Histidine極性帶正電荷堿性氨基酸39氨基酸的結(jié)構(gòu)組氨酸Histidine極性帶正電荷39氨基酸的結(jié)構(gòu)賴氨酸
Lysine極性帶正電荷堿性氨基酸40氨基酸的結(jié)構(gòu)極性帶正電荷40AA的結(jié)構(gòu)總結(jié):含S的AA:Met,Cys含苯環(huán)的AA:Phe,Tyr,Trp含羥基的AA:Ser,Thr,Tyr酸性AA:Asp,Glu堿性AA:Arg,Lys,His41AA的結(jié)構(gòu)總結(jié):含S的AA:酸性AA:41424243434444第二十一種蛋白質(zhì)氨基酸:硒代半胱氨酸SelenocysteineSeveralenzymes(forexample,glutathioneperoxidase,tetraikiodothyronine5'deiodinaseandformatedehydrogenase)containtheunusualaminoacid45第二十一種蛋白質(zhì)氨基酸:45第二十一種AA1996年,發(fā)現(xiàn)第21種天然氨基酸硒半胱氨酸(硒代半胱氨酸)半胱氨酸硒半胱氨酸46第二十一種AA1996年,發(fā)現(xiàn)第21種天然氨基酸半胱氨酸硒半47474848第二十二種蛋白質(zhì)氨基酸:49第二十二種蛋白質(zhì)氨基酸:49甲胺甲基轉(zhuǎn)移酶50甲胺甲基轉(zhuǎn)移酶5051515252吡咯賴氨酸:Pyl
53吡咯賴氨酸:Pyl53吡咯賴氨酸在產(chǎn)甲烷菌的甲胺甲基轉(zhuǎn)移酶中發(fā)現(xiàn),是目前已知的第22種參與蛋白質(zhì)生物合成的氨基酸,與標(biāo)準(zhǔn)氨基酸不同的是,它由終止密碼子UAG的有義編碼形成.與之對(duì)應(yīng)的在產(chǎn)甲烷菌中也含有特異的吡咯賴氨酰-tRNA合成酶(PylRS)和吡咯賴氨酸t(yī)RNA(tRNAPPy1).tRNAPy1具有不同于經(jīng)典tRNA的特殊結(jié)構(gòu).產(chǎn)甲烷菌通過(guò)直接途徑和間接途徑這兩種途徑生成吡咯賴氨酰-tRNAPy1(Pyl-tRNAPy1),它還可能通過(guò)mRNA上的特殊結(jié)構(gòu)以及其他還未發(fā)現(xiàn)的機(jī)制,控制UAG編碼成為終止密碼子或者吡咯賴氨酸。54吡咯賴氨酸在產(chǎn)甲烷菌的甲胺甲基轉(zhuǎn)移酶中發(fā)現(xiàn),是目前已知的第2(五)稀有aa和非蛋白aa55(五)稀有aa和非蛋白aa55
AA同一分子中含有-NH2和COOH、-COOH可釋放H+變成-COO-、-NH2接受H+變成正離子。
二、氨基酸的兩性性質(zhì)和等電點(diǎn)56二、氨基酸的兩性性質(zhì)和等電點(diǎn)56實(shí)驗(yàn)證明:氨基酸在水溶液和結(jié)晶都是以兩性離子形式存在。
57實(shí)驗(yàn)證明:氨基酸在水溶液和結(jié)晶都是以兩性離子形式存在。57
依照酸、堿質(zhì)子理論,酸是質(zhì)子的供體,堿是質(zhì)子的受體:
氨基酸在水中即起酸的作用(供體),也起堿的作用(質(zhì)子的受體)
因此氨基酸是兩性電解質(zhì)。58依照酸、堿質(zhì)子理論,酸是質(zhì)子的供體,堿是質(zhì)59596060
物質(zhì)的解離常數(shù)是用滴定的曲線的實(shí)驗(yàn)方法求得,畫出曲線。當(dāng)1mol丙氨酸溶于水時(shí),pH=6用氫氧化鈉滴定,得曲B。加入酸堿在使得丙氨酸凈電荷等于0時(shí),丙氨酸所帶正,負(fù)電荷相等,這時(shí)的pH值就是丙氨酸等電點(diǎn),pI的概念:兩性電解質(zhì)所帶正負(fù)電荷相等時(shí)的pH值,pI。
pI=兩性離子狀態(tài)兩側(cè)的pK’值之和的一半(2.34+9.69)/2=6.02。61物質(zhì)的解離常數(shù)是用滴定的曲線的實(shí)驗(yàn)方法求得,畫出
6262酸性氨基酸,堿性氨基酸的pI計(jì)算?63酸性氨基酸,堿性氨基酸的pI計(jì)算?63氨基酸中的可解離基團(tuán)側(cè)鏈基團(tuán)的可以解離時(shí),其表觀解離常數(shù)用pKP表示。64氨基酸中的可解離基團(tuán)側(cè)鏈基團(tuán)的可以解離時(shí),其表觀解離常數(shù)用p不同物質(zhì)解離曲線65不同物質(zhì)解離曲線65兩性離子兩側(cè)的pK之和的一半
中性的AA的PI=(pK1+pK2)/2酸性AA:Glu、Asp、pI=(pK1+pKR)/2堿性AA:Arg、Lys、His、
pI=(pK2+pKR)/2
AA等電點(diǎn)的計(jì)算66兩性離子兩側(cè)的pK之和的一半AA等電點(diǎn)的計(jì)算66
中性AA的等電點(diǎn)不是pH7,而都是小于7,在pH6.0左右,Val=5.96,Ala=6.02,Ser=5.68,這是因?yàn)锳A中羧基的解離度大于氨基的解離度。低于等電點(diǎn)的pH溶液,AA帶正電。高于等電點(diǎn)的pH溶液,AA帶負(fù)電。67中性AA的等電點(diǎn)不是pH7,而都是小于7
pH>pI時(shí),氨基酸帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極移動(dòng)。
pH=pI時(shí),氨基酸凈電荷為零
pH<pI時(shí),氨基酸帶正電荷,在電場(chǎng)中向負(fù)極移動(dòng)。
6868
三、氨基酸的光學(xué)性質(zhì)69三、氨基酸的光學(xué)性質(zhì)69Conventionfromorganicchemistry70Conventionfromorganicchemis
生物體內(nèi)組成蛋白質(zhì)的AA都是L-型,除甘氨酸以外。只在少數(shù)細(xì)菌細(xì)胞壁上發(fā)現(xiàn)D-型。71生物體內(nèi)組成蛋白質(zhì)的AA都是L-型,除甘氨酸72721.
含有不對(duì)稱碳原子的aa具有旋光性。右旋(+):Ala、Gln、Asp…
左旋(-):Trp、Phe、Ser、Pro…AA的比旋光度是基本的物理常數(shù)之一,其值取決于AA側(cè)鏈,也受溶液pH值的影響。731.
含有不對(duì)稱碳原子的aa具有旋光性。737474757576762.
吸收光譜
20種氨基酸都沒有可見光的光吸收,而色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸含有苯環(huán),在紫外區(qū)顯示,特征的吸收光譜,Pr一般最大光吸收在280nm。因此可以用紫外法測(cè)定蛋白質(zhì)含量。772.
吸收光譜
20種氨基酸都沒有可見光的光7878
(一)a-氨基參加的反應(yīng)1.
與亞硝酸反應(yīng):AA的a-氨基與其它一級(jí)胺一樣能與亞硝酸反應(yīng),生成相應(yīng)的羥酸和N2在標(biāo)準(zhǔn)條件下測(cè)定生成的N2↑,計(jì)算氨基酸的量。四、氨基酸的化學(xué)反應(yīng):79(一)a-氨基參加的反應(yīng)四、氨基酸的化學(xué)反應(yīng):792.
烴基化反應(yīng):-NH2上的一個(gè)H原子可被烴基取代a:Sanger反應(yīng)
2,4-二硝基氟苯(DNFB)在弱減溶液中發(fā)生親核芳環(huán)取代反應(yīng)生成2,4-二硝基苯基氨基酸,英國(guó)的Sanger用這個(gè)反應(yīng)來(lái)鑒定多肽N-未端的氨基酸,用以測(cè)定多肽或蛋白質(zhì)的AA排序。802.
烴基化反應(yīng):-NH2上的一個(gè)H原子可被烴基取代8081818282b.與苯異硫氰酸酯(PITC)在弱堿條件下形成相應(yīng)的苯氨基硫甲酰(PTC)衍生物,與酸發(fā)生環(huán)化生成PTH-aa,這是著名的Edman降解,進(jìn)行多肽鏈N-未端氨基酸的測(cè)定。
現(xiàn)在根據(jù)此原理設(shè)計(jì)出了”蛋白質(zhì)順序測(cè)定儀”。Edman反應(yīng)83b.Edman反應(yīng)8384848585氨基酸的鑒定、分離純化PTH-AA86氨基酸的鑒定、分離純化PTH-AA863.
脫氨基反應(yīng):aa經(jīng)氨基酸氧化酶催化脫去a-氨基而變成酮酸。873.
脫氨基反應(yīng):871.
成鹽和成酯反應(yīng):
當(dāng)羧基變成酯類后羧基的化學(xué)反應(yīng)即被保護(hù),而氨基的反應(yīng)被加強(qiáng),這就是為什么氨基酸的酰基化需要在堿性溶液中進(jìn)行的原因。(二)a-羧基參加的反應(yīng)88(二)a-羧基參加的反應(yīng)882.
脫羧基反應(yīng):aa在生物體內(nèi)經(jīng)aa脫羧酶作用,放出二氧化碳并生成相應(yīng)的一級(jí)胺。3.成酰胺反應(yīng):AA與氨作用可形成氨基酸的酰胺,為生物體儲(chǔ)NH3的主要反應(yīng)。動(dòng)、植物體內(nèi)的Gln、Asn可以這種反應(yīng)形成。892.
脫羧基反應(yīng):aa在生物體內(nèi)經(jīng)aa脫羧酶作用,放出二氧(三)a-氨基和a-羧基共同參加的反應(yīng):(1)
茚三酮反應(yīng):
茚三酮在弱酸性溶液中與a-氨基酸共熱,引起氨基酸氧化脫氨、脫羧反應(yīng),最后茚三酮與反應(yīng)產(chǎn)物氨和還原茚三酮發(fā)生作用,生成紫色物質(zhì)。
90(三)a-氨基和a-羧基共同參加的反應(yīng):(1)
茚三酮
水合茚三酮+2NH3+還原茚三酮生成藍(lán)紫色物質(zhì)。
91水合茚三酮+2NH3+還原茚三酮生成藍(lán)紫色物質(zhì)(2)成肽反應(yīng):
92(2)成肽反應(yīng):92
非a-羧基,如谷氨酸、天門冬氨酸的中a-羧基既可與其它NH2形成肽鍵。93非a-羧基,如谷氨酸、天門冬氨酸的中a-羧基既可與其它9494這三個(gè)肽是谷氨酰、半胱氨酰、甘氨酸簡(jiǎn)稱谷胱甘肽,用G-SH表示。谷胱甘肽是一些酶的輔酶,這個(gè)Glu就是由非a-羧基形成的肽鏈,在谷胱甘肽中SH是暴露在外面的,是一個(gè)比較活躍的基因,這個(gè)SH基又可與另一個(gè)谷胱甘肽結(jié)合起來(lái)成為氧化型的谷胱甘肽。防止過(guò)氧化物的積累,參與氧化還原。95這三個(gè)肽是谷氨酰、半胱氨酰、甘氨酸簡(jiǎn)稱谷胱甘肽,用G-SH表氧化型谷胱甘肽用代號(hào)G-S-S-G表示
2→G-SH====G-S-S-G96氧化型谷胱甘肽用代號(hào)G-S-S-G表示96I'vegotmuchproteintoday!第二節(jié)
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)97I'vegotmuchprotein第二節(jié)
蛋白質(zhì)是由許多氨基酸通過(guò)肽鏈連接形成的生物大分子,20種AA以不同的數(shù)目、比例和排列順序構(gòu)成了成千上萬(wàn)種不同的蛋白質(zhì),其分子量在10,000以上,結(jié)構(gòu)極其復(fù)雜。下面對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同層次進(jìn)行討論。
98蛋白質(zhì)是由許多氨基酸通過(guò)肽鏈連接形成的生物大分子,2
一級(jí)結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)肽鏈中氨基酸的排列順序和連接方式,也叫化學(xué)結(jié)構(gòu)。氨基酸的連接方式:一個(gè)AA的
-氨基與另一AA的
-羧基經(jīng)脫水成肽鏈連接的。一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)99一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)99氨基酸殘基100氨基酸殘基100
肽的數(shù)目是根據(jù)氨基酸殘基的數(shù)目決定的。一個(gè)八肽有8個(gè)AA殘基,由七個(gè)肽鏈連接,十個(gè)以下的肽叫寡肽,超過(guò)10個(gè)AA殘基的肽叫多肽。因?yàn)槎鄠€(gè)AA以肽鏈連接的是一條鏈,所以也叫多肽鏈。101肽的數(shù)目是根據(jù)氨基酸殘基的數(shù)目決定的。10
蛋白質(zhì)里的肽鏈由100-300個(gè)AA殘基組成。但也有例外,如鐵氧還蛋白只有6000道爾頓,大約只有60個(gè)AA殘基組成。102蛋白質(zhì)里的肽鏈由100-300個(gè)AA殘基組成。胰島素激活圖103胰島素激活圖103
第一個(gè)測(cè)定蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的是胰島素,由51個(gè)AA殘基組成,由A、B兩條肽鏈組成,A鏈?zhǔn)怯?1個(gè)AA殘基組成的21肽鏈,B鏈?zhǔn)怯?0個(gè)AA殘基組成的30肽,A、B鏈之間由兩個(gè)二硫鍵連接起來(lái),一個(gè)二硫鍵是A的第七位cys和B鏈的第七位cys,另一個(gè)是A19-B20兩個(gè)cys的SH基形成的,除此之外,21肽的A鏈內(nèi)的第6個(gè)與第11位的cys又形成一個(gè)鏈內(nèi)二硫鍵,所以,胰島素分子的一級(jí)結(jié)構(gòu)有二個(gè)鏈間二S鍵和一個(gè)鏈內(nèi)二硫鍵,共有三個(gè)二硫鍵。
104第一個(gè)測(cè)定蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的是胰島素,由51個(gè)AA殘基二級(jí)結(jié)構(gòu):多肽鏈借助H鍵沿一維方向具有規(guī)則重復(fù)的構(gòu)象。如
-螺旋,β-折疊。二、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)105二、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)105構(gòu)型:
是指在立體異構(gòu)體中取代原子或基因在空間的取向,一個(gè)C原子和四個(gè)不同的基團(tuán)相連時(shí),只可能有兩種不同的空間排列,這兩種不同的不同的空間排列稱為不同的構(gòu)型,如果沒有共價(jià)鏈的破裂是不能互變的。D-構(gòu)型,L-構(gòu)型。1.構(gòu)型、構(gòu)象:106構(gòu)型:1.構(gòu)型、構(gòu)象:106107107Conventionfromorganicchemistry108Conventionfromorganicchemis構(gòu)象:
是指這些取代基團(tuán)在空間的排布,可能形成的不同的立體結(jié)構(gòu),這種空間位置的改變,并不涉及共價(jià)鏈的破裂。109構(gòu)象:109110110例如:乙烷如果兩個(gè)CH3基的C-C單鏈完全可以自由旋轉(zhuǎn),將產(chǎn)生無(wú)數(shù)種分子構(gòu)象,但交叉型的構(gòu)象最穩(wěn)定,它是乙烷分子存在的主要構(gòu)象。111例如:乙烷111(R,R)isomer(S,S)isomer112(R,R)isomer(S,S)isomer112雙鍵不能自由旋轉(zhuǎn)113雙鍵不能自由旋轉(zhuǎn)1132.肽鍵平面
1142.肽鍵平面
114兩個(gè)肽平面以一個(gè)Cα為中心發(fā)生旋轉(zhuǎn)115兩個(gè)肽平面以一個(gè)Cα為中心發(fā)生旋轉(zhuǎn)115116116★多肽鏈可以看成由Cα串聯(lián)起來(lái)的無(wú)數(shù)個(gè)酰胺平面組成117★多肽鏈可以看成由Cα串聯(lián)起來(lái)的無(wú)數(shù)個(gè)酰胺平面組成117肽鏈中的肽平面118肽鏈中的肽平面118
在肽鏈的主鏈中,只有Ca-N,(φ),Ca-C2(ψ)是單鍵,可以自由旋轉(zhuǎn),所以多肽鏈可以形成特定的構(gòu)象。如φ,ψ取不同的角度就構(gòu)成不同的構(gòu)象,肽鏈的構(gòu)象就用這兩個(gè)構(gòu)象角描述。119在肽鏈的主鏈中,只有Ca-N,(φ),Ca-C2
實(shí)際上一個(gè)天然的蛋白質(zhì)多肽鏈在一定條件下,只有一種式很少幾種構(gòu)象,而且相當(dāng)穩(wěn)定,這是因?yàn)橹麈溕先种皇请逆溇唠p鏈性質(zhì)不能旋轉(zhuǎn),此主連上還有側(cè)鏈,其大小及帶電情況不同。它們?cè)趩捂溞D(zhuǎn)時(shí)產(chǎn)生空間位阻和靜電效應(yīng),制約著大量的構(gòu)象形成。120實(shí)際上一個(gè)天然的蛋白質(zhì)多肽鏈在一定條件下,只
天然的蛋白質(zhì)一般都含有
-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角和自由卷曲等,其中最主要的是
-螺旋、β-折疊。3.二級(jí)結(jié)構(gòu)121天然的蛋白質(zhì)一般都含有-螺旋、β-折疊、β-
-螺旋結(jié)構(gòu)。
122-螺旋結(jié)構(gòu)。
122DamagedHumanHair123DamagedHumanHair123角蛋白keratin的結(jié)構(gòu)特征124角蛋白keratin的結(jié)構(gòu)特征124(1)a-螺旋結(jié)構(gòu)的主要特征如下:a.肽鏈中的肽平面繞Ca相繼旋轉(zhuǎn),二面角各自取同一數(shù)值,Φ=-57°、ψ=-48°,即形成具有周期性規(guī)則的構(gòu)象。多肽鏈可以按右手方向式或左手方向盤繞形成右手螺旋式左手螺旋。每隔3.6個(gè)氨基酸殘基,螺旋上升一圈;每圈間距0.54nm,即每個(gè)氨基酸殘基沿螺旋中心軸上升1.5nm,螺旋上升時(shí),每個(gè)氨基酸殘基沿軸旋轉(zhuǎn)100°。125(1)a-螺旋結(jié)構(gòu)的主要特征如下:a.肽鏈中的肽平α螺旋特性氫鍵取向與主軸基本平行右旋,3.6個(gè)氨基酸一個(gè)周期,螺距0.54nm第n個(gè)AA(NH)與第n-4個(gè)AA(CO)形成氫鍵,環(huán)內(nèi)原子數(shù)13。126α螺旋特性氫鍵取向與主軸基本平行右旋,3.6個(gè)氨基酸一個(gè)周期肽平面的相疊形成α螺旋127肽平面的相疊形成α螺旋127
遇上pro就會(huì)中斷或拐彎,a-亞基引起沒有多余的H形成H鍵。
128
128b.螺旋體中所有氨基酸殘基側(cè)鏈都伸向外側(cè),鏈中的全部C=O和N-H幾乎都平行于螺旋軸,每個(gè)氨基酸殘基的N-H與前面第四個(gè)氨基酸殘基的C=O形成H鍵,肽鏈上所有的肽鍵都參與了氫鍵的形成,因此a-螺旋相當(dāng)穩(wěn)定,螺旋體內(nèi)氫鏈形成示意如下:129b.螺旋體中所有氨基酸殘基側(cè)鏈都伸向外側(cè),鏈中的全部C=130130131131c.天然蛋白質(zhì)中絕大多數(shù)都是右手-
-螺旋,左手螺旋只在少數(shù)蛋白質(zhì)中發(fā)現(xiàn),例如嗜熱菌蛋白酶中有一很短的左手
-螺旋,Asp-Asn-Gly-Gly組成。a-螺旋是二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式,其次a、β、折疊。132c.天然蛋白質(zhì)中絕大多數(shù)都是右手--螺旋,左手螺旋只在133133Theproteinkeratinisthechiefstructuralcomponentsofhair,scales,horn,wool,nailsandfeathers.134TheproteinkeratinisthechiRNaseA135RNaseA135獅子捕獲穿山甲無(wú)奈堅(jiān)硬外殼無(wú)法入口136獅子捕獲穿山甲無(wú)奈堅(jiān)硬外殼無(wú)法入口136如圖H鍵連接,鋸齒狀的片層結(jié)構(gòu)。
(2)蛋白質(zhì)的β折疊結(jié)構(gòu)137(2)蛋白質(zhì)的β折疊結(jié)構(gòu)137138138(a)a-螺旋結(jié)構(gòu)的肽鏈?zhǔn)蔷砬陌魻罱Y(jié)構(gòu),而β折疊結(jié)構(gòu)的肽鏈幾乎是完全伸展的,整個(gè)肽鏈成一種折疊的形式。β折疊結(jié)構(gòu)與a-螺旋結(jié)構(gòu)相比有如下特點(diǎn)139(a)a-螺旋結(jié)構(gòu)的肽鏈?zhǔn)蔷砬陌魻罱Y(jié)構(gòu),而β折疊結(jié)構(gòu)的肽(b)β-折疊結(jié)構(gòu)是肽鏈與肽鏈之間形成氫鍵,a-螺旋是鏈內(nèi)形成氫鏈。140(b)β-折疊結(jié)構(gòu)是肽鏈與肽鏈之間形成氫鍵,a-螺旋是鏈內(nèi)形(c)β-折疊有兩種類型,一為平行式,即肽鏈的所有N端都在同一端,另一類為反平行式,即相鄰兩條肽鏈的方向相反,一條為N端,另一條為C端。
141(c)β-折疊有兩種類型,一為平行式,即肽鏈的所有N端都在同β-轉(zhuǎn)角也叫做β-回折,即肽鏈回折180°,使得AA殘基的C=O與第四個(gè)AA殘基的>N-H形成氫鍵。
(3)β-轉(zhuǎn)角142β-轉(zhuǎn)角也叫做β-回折,即肽鏈回折180°,使得AA殘基的(4)無(wú)規(guī)則卷曲(randomcoil)沒有確定性的肽鏈構(gòu)象,但仍是緊密有序的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),通過(guò)主鏈間及主鏈與側(cè)鏈間氫鍵維持其構(gòu)象。分兩類:143(4)無(wú)規(guī)則卷曲(randomcoil)沒有確定性的肽鏈(1)緊密環(huán)(compactloop):肽鏈主體結(jié)構(gòu)卷曲成一端開放的環(huán)狀象希臘字母Ω,又稱Ω環(huán);肽鏈由6-16個(gè)殘基組成;Gly、Pro、Asn、Asp、Ser和Tyr較常見。由于親水性氨基酸殘基較多,故常位于蛋白質(zhì)分子表面;殘基側(cè)鏈可堆積在環(huán)內(nèi)通過(guò)疏水作用或氫鍵等形成緊密的結(jié)構(gòu);可能與蛋白質(zhì)的識(shí)別功能有關(guān)。144(1)緊密環(huán)(compactloop):肽鏈主體結(jié)構(gòu)卷曲成(2)連接條帶(connectionstraps):各種連接條帶的長(zhǎng)度、走向不規(guī)則,在蛋白質(zhì)肽鏈的卷曲、折疊過(guò)程中具有明確的結(jié)構(gòu)作用;連接條帶主鏈C=O和NH間一般不形成氫鍵;常位于分子表面,殘基常帶電荷或具有極性,能與介質(zhì)水形成氫鍵;功能:連接條帶往往參與形成蛋白質(zhì)的一些結(jié)合或酶的活性位點(diǎn)。145(2)連接條帶(connectionstraps):各種(5)超二級(jí)結(jié)構(gòu):
二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。
146(5)超二級(jí)結(jié)構(gòu):146147147角蛋白keratin的結(jié)構(gòu)特征148角蛋白keratin的結(jié)構(gòu)特征148149149150150151151152152153153154154Repeatedusageofapattern155Repeatedusageofapattern155156156157157158158159159160160161161丙酮酸激酶結(jié)構(gòu)162丙酮酸激酶結(jié)構(gòu)162Lysozyme163Lysozyme163磷酸丙糖異構(gòu)酶結(jié)構(gòu)164磷酸丙糖異構(gòu)酶結(jié)構(gòu)164結(jié)構(gòu)域:
在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,多肽鏈進(jìn)一步卷曲折疊成相對(duì)獨(dú)立,近似球形的組裝體。165結(jié)構(gòu)域:165166166167167抗體輕鏈的結(jié)構(gòu)域168抗體輕鏈的結(jié)構(gòu)域168StructuraldomainsinthepolypeptidetroponinC,(肌鈣蛋白)twoseparatecalcium-bindingdomains169Structuraldomainsinthepoly
多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,主鏈構(gòu)象和側(cè)鏈構(gòu)象相互作用,進(jìn)一步盤曲折疊形成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)即為三級(jí)結(jié)構(gòu)。
三、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)170多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,主鏈構(gòu)象和側(cè)鏈構(gòu)象171171Hexokinase的結(jié)構(gòu)172Hexokinase的結(jié)構(gòu)1721.兩個(gè)Cys殘基的-SH經(jīng)氧化作用而形成的二硫鍵維持蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的作用力1731.兩個(gè)Cys殘基的-SH經(jīng)氧化作用而形成的二硫鍵維持蛋白2.氫鍵:
是發(fā)生于多肽鏈中負(fù)電性很強(qiáng)的氮原子或氧子的孤對(duì)電子與N-H或O-H的氫原子間的相互吸引力。氫鍵雖是弱鍵,但在蛋白質(zhì)分子中數(shù)量極大,在維多和促進(jìn)蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)形成中起著極其重要的作用。1742.氫鍵:1743.范德華力:
一為引力,一為斥力,引力產(chǎn)生于極性基團(tuán)之間和極性基團(tuán)與非極性基團(tuán)之間,這種作用力雖然很弱,但可以累加。兩個(gè)極團(tuán)之間距離太近,產(chǎn)生排斥力。范德華引力在維持蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)上具有一定的作用,特別是側(cè)鏈基團(tuán)與介質(zhì)水分子之間的相互作用,有助于蛋白質(zhì)高級(jí)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。1753.范德華力:1754.疏水鍵:
由疏水基團(tuán)之間的相互作用形成的疏水力。主要是介質(zhì)水分子對(duì)疏水基因的排斥所形成。1764.疏水鍵:1765.離子鍵:
也稱鹽鍵。它是正電荷與負(fù)電荷之間的一種靜電相互作用。1775.離子鍵:1776.酯鍵:AA殘基的-OH與另-AA的COOH脫水形成酯鍵。1786.酯鍵:1787.配位鍵:
兩個(gè)原子之間由單方面提供共用電子對(duì)形成的共價(jià)鍵稱為配位鍵,Pr中含有的金屬離子以配位鍵相連。1797.配位鍵:179由兩條或兩條以上具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈聚合而成有特定三維結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)構(gòu)象叫做蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。四級(jí)結(jié)構(gòu)是由具有一、二、三級(jí)結(jié)構(gòu)的幾個(gè)亞基或叫亞單位構(gòu)成,亞基之間有的是相同的,有的是不相同的。
四、蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)180由兩條或兩條以上具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈聚合而成有特定三維結(jié)例如:
血紅蛋白(hemoglobin),它是血液中紅細(xì)胞的主要成分,具有運(yùn)輸O2和CO2的功能,由相同的兩個(gè)a亞基和兩個(gè)β亞基組成的四聚體,如果單獨(dú)的a-鏈或單獨(dú)的β鏈則沒有運(yùn)輸O2或CO2的作用。181例如:181182182
這種由不同亞基構(gòu)成的四級(jí)結(jié)構(gòu)如血紅蛋白稱作不均一的四級(jí)結(jié)構(gòu),由相同亞基構(gòu)成的四級(jí)結(jié)構(gòu)叫做均一的四級(jí)結(jié)構(gòu),離子鍵也參與四級(jí)結(jié)構(gòu)的形成。維系蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)的亞基間的化學(xué)鍵主要是二硫鍵和疏水力,其次氫鍵,范德華引力。183這種由不同亞基構(gòu)成的四級(jí)結(jié)構(gòu)如血紅蛋白稱作不DNA和蛋白質(zhì)的相互作用也是四級(jí)結(jié)構(gòu)184DNA和蛋白質(zhì)的相互作用也是四級(jí)結(jié)構(gòu)184二氧化碳的運(yùn)輸185二氧化碳的運(yùn)輸185186186187187核磁共振確定蛋白質(zhì)分子在溶液中的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)188核磁共振確定蛋白質(zhì)分子在溶液中的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)188189189190190191191Hemoglobin的四級(jí)結(jié)構(gòu)192Hemoglobin的四級(jí)結(jié)構(gòu)192蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的總結(jié)193蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的總結(jié)193蛋白質(zhì)幾種不同的立體結(jié)構(gòu)表示法194蛋白質(zhì)幾種不同的立體結(jié)構(gòu)表示法194X-Ray衍射決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象195X-Ray衍射決定蛋白質(zhì)空間構(gòu)象195第三節(jié)蛋白質(zhì)的性質(zhì)Biochemistry196第三節(jié)蛋白質(zhì)的性質(zhì)Biochemistry196一蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)
由于蛋白質(zhì)分子量很大,蛋白質(zhì)在水溶液中形成直徑1-100nm的顆粒,本身又具有電荷,因而具有膠體溶液的特征。如布朗運(yùn)動(dòng)以及不能透過(guò)半透膜等性質(zhì),常常可利用超濾和透析等方法去掉小分子物質(zhì)以達(dá)到純化蛋白質(zhì)的作用。197一蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)由于蛋白質(zhì)分子量很大,蛋
穩(wěn)定蛋白質(zhì)水溶液的因素:(1)水膜:AA極性基團(tuán),如NH3+、COO-、OH、SH、CONH等易吸附水分子,在蛋白質(zhì)顆粒外面形成一層水化層。(2)電荷:在非等電狀態(tài)時(shí),蛋白質(zhì)帶同種電荷相互排斥。
蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)198穩(wěn)定蛋白質(zhì)水溶液的因素:蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)198----------++++++++++H2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2O蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)的膠體結(jié)構(gòu)199----------++++++++++H2OH2OH2OH
可溶性蛋白質(zhì)表面分布著大量極性AA,對(duì)水有很高的親和力,通過(guò)水合作用在蛋白質(zhì)顆粒外面形成一層水化層,1g蛋白可結(jié)合0.3-0.5g水,同時(shí)這些顆粒帶有電荷,因而蛋白質(zhì)溶液是相當(dāng)穩(wěn)定的膠體。200可溶性蛋白質(zhì)表面分布著大量極性AA,對(duì)水有二、蛋白質(zhì)的酸堿性質(zhì)蛋白質(zhì)分子由氨基酸組成,在蛋白質(zhì)分子中保留著N-末端,C-末端以及側(cè)鏈上的各種功能團(tuán)。因此,蛋白質(zhì)化學(xué)和物理化學(xué)性質(zhì)有些是與氨基酸相同的,例如:側(cè)鏈上功能團(tuán)的化學(xué)反應(yīng),分子的兩性電解質(zhì)等。
201二、蛋白質(zhì)的酸堿性質(zhì)201
蛋白質(zhì)也是一類兩性電解質(zhì),能和酸or堿起反應(yīng),在蛋白質(zhì)內(nèi),可解離基團(tuán)主要來(lái)自側(cè)鏈上的功能團(tuán):-NH+3,-COO-,-OH,-SH,-COOH,-咪唑基,-胍基。202蛋白質(zhì)也是一類兩性電解質(zhì),能和酸or堿起反應(yīng)
在一定pH條件下,蛋白質(zhì)呈酸性or堿性,在酸性溶液中帶正電,堿性溶液中帶負(fù)電。當(dāng)溶液在其一定pH值時(shí),使特定的蛋白質(zhì)分子所帶正負(fù)電荷相等,成為兩性離子,在電場(chǎng)中既又向陽(yáng)極也不向陰極移動(dòng),此時(shí)溶液的pH值即為該蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(pI)。203在一定pH條件下,蛋白質(zhì)呈酸性or堿性,在
蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)和蛋白質(zhì)所含氨基酸的種類和數(shù)目有關(guān),主要是含酸性AA和堿性AA的比例有關(guān)。204蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)和蛋白質(zhì)所含氨基酸的種類和數(shù)目
在電場(chǎng)中,蛋白質(zhì)分子在高于pI時(shí)堿性溶液中,帶負(fù)電、向正極移動(dòng),在低于pI時(shí)的酸性溶液中帶正電,向負(fù)極移動(dòng),這種泳動(dòng)現(xiàn)象稱電泳。+-++-205在電場(chǎng)中,蛋白質(zhì)分子在高于pI時(shí)堿性溶液中,帶負(fù)
不同帶電性質(zhì)和不同大小、形狀的蛋白質(zhì)分子在電場(chǎng)中泳動(dòng)方向和速度不同,因此可用電泳的方法分離、純化和制備、鑒定蛋白質(zhì)。206不同帶電性質(zhì)和不同大小、形狀的蛋白質(zhì)分子在電
同時(shí)在等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)以兩性離子形式存在,凈電荷為零,很不穩(wěn)定,不能與H2O分子結(jié)合,極易結(jié)合成較大的聚集體而沉淀析出,因此常用蛋白質(zhì)等電點(diǎn)時(shí)溶解度最小的性質(zhì)來(lái)分離和純化蛋白質(zhì)。207同時(shí)在等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)以兩性離子形式存在,凈
如果加入適當(dāng)?shù)脑噭┦沟鞍踪|(zhì)使去水化層or處于等電點(diǎn)狀態(tài),蛋白質(zhì)的膠體溶液不再穩(wěn)定,并產(chǎn)生聚集沉淀。這是分離純化蛋白質(zhì)最常用的方法。
三、蛋白質(zhì)沉淀反應(yīng)
208如果加入適當(dāng)?shù)脑噭┦沟鞍踪|(zhì)使去水化層or處于等電點(diǎn)1.鹽析法:
向蛋白質(zhì)溶液中加入大量的中性鹽,使蛋白質(zhì)脫去水化層而聚集沉淀。鹽析沉淀一般不引起蛋白質(zhì)的變性。半飽和的硫酸銨沉淀球蛋白、飽和的硫酸銨沉淀清蛋白。沉淀蛋白質(zhì)的方法有以下幾種:209沉淀蛋白質(zhì)的方法有以下幾種:209溶解度鹽濃度鹽溶鹽析210溶解度鹽濃度鹽溶鹽析210----------++++++++++H2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2O蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)的膠體結(jié)構(gòu)211----------++++++++++H2OH2OH2OH2.有機(jī)溶劑沉淀法:
向蛋白質(zhì)溶液中加入一定量有機(jī)溶劑,引起蛋白質(zhì)脫去水化層,使之沉淀,如果蛋白質(zhì)溶液的pH值在等電點(diǎn),加入這類試劑更易引起沉淀。2122.有機(jī)溶劑沉淀法:212----------++++++++++H2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2O蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)的膠體結(jié)構(gòu)213----------++++++++++H2OH2OH2OH3.重金屬鹽沉淀法:當(dāng)溶液pH大于等電點(diǎn)時(shí)蛋白質(zhì)顆粒帶負(fù)電荷,這樣它就容易與重金屬離子(Hg2+、Pb2+、Cu2+、Ag+等)結(jié)成不溶性鹽而沉淀。誤服重金屬鹽的病人可口服大量牛奶、豆?jié){等蛋白質(zhì)進(jìn)行解救就是因?yàn)樗芎椭亟饘匐x子形成不溶性鹽(勞動(dòng)保護(hù)牛奶解釋)。
2143.重金屬鹽沉淀法:2144.生物堿試劑沉淀法:
蛋白質(zhì)在酸性溶液中帶正電,能與生物堿試劑,如苦味酸、單寧酸或三氯乙酸等作用而析出沉淀。2154.生物堿試劑沉淀法:2155.加熱變性沉淀法:幾乎所有的蛋白質(zhì)都因加熱變性而凝固。少量鹽類促進(jìn)蛋白質(zhì)凝固,當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)處于等電點(diǎn)時(shí),加熱凝固最完全和最迅速,大豆蛋白質(zhì)的濃溶液加熱并點(diǎn)入少量鹽鹵(MgCl2),制取豆腐,這是成功地應(yīng)用加熱變性沉淀蛋白質(zhì)的一個(gè)例子。2165.加熱變性沉淀法:2166.等電點(diǎn)pH溶解度pI2176.等電點(diǎn)pH溶解度pI217
蛋白質(zhì)分子在受到外界一些物理因素如熱、高壓、紫外線照射或化學(xué)因素如有機(jī)溶劑:脲、酸、堿等的影響時(shí),分子構(gòu)象發(fā)生變化,溶解度降低,生物活性喪失,一些物理、化學(xué)性質(zhì)改變,這些變化都不涉及到一級(jí)結(jié)構(gòu)的改變,即肽鏈的共價(jià)鍵并未斷裂、二硫鍵也不斷裂,蛋白質(zhì)分子的這一類變化,統(tǒng)稱為蛋白質(zhì)的變性作用(Denaturation)。
四、蛋白質(zhì)的變性218四、蛋白質(zhì)的變性218復(fù)性:如果引起變性的因素比較溫和,蛋白質(zhì)構(gòu)象僅僅是有些松散時(shí),當(dāng)除去變性因素后,蛋白質(zhì)可緩慢地重新自發(fā)折疊恢復(fù)原來(lái)的構(gòu)象,叫復(fù)性。例:血紅蛋白酸變性加堿中和恢復(fù)2/3
水揚(yáng)酸鈉除去全部恢復(fù)胃蛋白酶pH8.5pH5.4(24-48hr)恢復(fù)219復(fù)性:219
在蛋白質(zhì)的分析工作中,常常利用某些氨基酸或某些特殊結(jié)構(gòu)與某些試劑產(chǎn)生顏色反應(yīng)來(lái)進(jìn)行定性和定量測(cè)定。五、蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)220五、蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)2201.雙縮脲反應(yīng)雙縮脲是兩分子脲加熱放出一分子NH3而得的產(chǎn)物。堿性溶液中能與CuSO4反應(yīng),產(chǎn)生紅紫色絡(luò)合物。蛋白質(zhì)中含有許多與雙縮脲相似的肽鍵。用于蛋白質(zhì)和肽的定性定量。2211.雙縮脲反應(yīng)221米隆反應(yīng):
蛋白質(zhì)分子的酪aa羥基與米隆試劑反應(yīng),產(chǎn)生紅色化合物。米隆試劑為硝酸、亞硝酸、硝酸汞、亞硝酸汞的混合物。最初產(chǎn)生的有色物質(zhì)可能為羥苯的亞硝酸基的衍生物,經(jīng)變位作用變成顏色更深的鄰醌肟,最終與永鹽作用形成穩(wěn)定的紅色化合物(結(jié)構(gòu)還不了解)。222米隆反應(yīng):222
蛋白質(zhì)的色氨酸,酪氨酸酚基能將福林試劑中的磷鉬酸和磷鎢酸還原成藍(lán)色化合物(鉬蘭和鎢蘭的混合物),這一反應(yīng)常用來(lái)測(cè)定微量蛋白質(zhì)。2.酚試劑反應(yīng):2232.酚試劑反應(yīng):2233.茚三酮反應(yīng)(同AA反應(yīng))2243.茚三酮反應(yīng)(同AA反應(yīng))224六、蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定
蛋白質(zhì)分子量很大,它的分子量范圍在6000到100萬(wàn),或者更大一些,蛋白質(zhì)的分子量大小過(guò)去不用單位。后來(lái)為了紀(jì)念原子學(xué)說(shuō)的創(chuàng)始人JohnDalton,國(guó)際生化文獻(xiàn)中多用dalton(道爾頓)一詞作為分子量的單位。dalton是原子質(zhì)量單位,即氫原子的質(zhì)量,等于1.0000。
225六、蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定蛋白質(zhì)分子量很大,它的分子
例:溶菌酶
MW14,30014,300dalton14.3kdalton14.3kd
226例:溶菌酶226(一)
沉降法:離心機(jī)227(一)
沉降法:離心機(jī)227228228
類似洗衣機(jī)脫水沉降常數(shù):每單位離心力場(chǎng)中沉降速度s=v/(r×
2)v:沉降速度r×2:離心力(r:離心半徑;:角速度)
每一種蛋白質(zhì)在一定條件下均有一個(gè)s,大多數(shù)蛋白質(zhì)的在1x10-13—200x10-13之間,書寫不便。
229類似洗衣機(jī)脫水229
為了紀(jì)念超離心機(jī)法創(chuàng)始人瑞典蛋白質(zhì)化學(xué)家T.Svedberg,國(guó)際上采用了所謂Svedberg單位作為沉降常數(shù)的單位:1Svedberg=10-13cm.sec-1dyne-1.g-1
那么蛋白質(zhì)沉降常數(shù)
1-200Svedberg=1-200S例:牛血清白蛋白
4.4x10-13=4.4Svedberg=4.4S
其它的生物大分子也有其沉降常數(shù)。230
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