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版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)
文檔簡介
DBXX/TXXX—XXXX
江西省醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺技術(shù)規(guī)范第五部分:數(shù)據(jù)治理規(guī)范
1范圍
本規(guī)范規(guī)定了醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺數(shù)據(jù)治理的術(shù)語和定義以及相關(guān)技術(shù)要求,包含數(shù)據(jù)治理框架、元數(shù)
據(jù)管理功能要求、數(shù)據(jù)質(zhì)量管理要求、數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理要求、數(shù)據(jù)安全管理要求、醫(yī)學(xué)自然語言處理技術(shù)
要求、醫(yī)學(xué)語義分析、數(shù)據(jù)分析挖掘引擎等內(nèi)容。
本規(guī)范適用于醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺數(shù)據(jù)采集過程的設(shè)計、開發(fā)、選型和實施,可作為醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺數(shù)
據(jù)采集接入時的評測依據(jù)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T18391.1—2009信息技術(shù)元數(shù)據(jù)注冊系統(tǒng)(MDR)第1部分:框架
GB/T34960.5—2018信息技術(shù)服務(wù)治理第5部分:數(shù)據(jù)治理規(guī)范
GB/T36073-2018數(shù)據(jù)管理能力成熟度評估模型
3術(shù)語和定義
GB/T18391.1—2009、GB/T34960.5—2018、GB/T36073-2018界定的以及下列術(shù)語和定義適用于
本文件。
3.1
數(shù)據(jù)治理datagovernance
數(shù)據(jù)資源及其應(yīng)用過程中相關(guān)管控活動、績效和風險管理的集合。
[GB/T34960.5—2018,定義3.1]
3.2
數(shù)據(jù)管理datamanagement
數(shù)據(jù)資源獲取、控制、價值提升等活動的集合。
[GB/T34960.5—2018,定義3.2]
3.3
數(shù)據(jù)資產(chǎn)dataasset
組織擁有和控制的、能夠產(chǎn)生效益的數(shù)據(jù)資源。
[GB/T34960.5—2018,定義3.3]
1
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3.4
數(shù)據(jù)戰(zhàn)略datastrategy
組織開展數(shù)據(jù)工作的愿景和高階指引。
[GB/T34960.5—2018,定義3.4]
3.5
數(shù)據(jù)架構(gòu)dataarchitecture
數(shù)據(jù)要素、結(jié)構(gòu)和接口等抽象及其相互關(guān)系的框架。
[GB/T34960.5—2018,定義3.5]
3.6
元數(shù)據(jù)metadata
定義和描述其他數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)。
[GB/T18391.1-2009,定義3.2.16]
3.7
主數(shù)據(jù)masterdata
指系統(tǒng)間共享數(shù)據(jù)(例如,患者、醫(yī)療服務(wù)項目、財務(wù)項目、員工信息、醫(yī)療產(chǎn)品服務(wù)商/供應(yīng)商、
固定資產(chǎn)/耗材等相關(guān)數(shù)據(jù))。
3.8
數(shù)據(jù)生存周期datalifecycle
數(shù)據(jù)獲取、存儲、整合、分析、應(yīng)用、呈現(xiàn)、歸檔和銷毀等各種生存形態(tài)演變的過程。
[GB/T34960.5—2018,定義3.7]
3.9
命名實體識別namedentityrecognition
識別文本中具有特定意義的實體,主要包括人名、地名、機構(gòu)名、專有名詞等。
3.10
實體關(guān)系抽取relationextraction
根據(jù)句子語義信息推測實體間的關(guān)系。
3.11
知識圖譜knowledgegraph
用可視化技術(shù)描述知識資源及其載體,挖掘、分析、構(gòu)建、繪制和顯示知識及它們之間的相互聯(lián)系。
3.12
2
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醫(yī)療大數(shù)據(jù)medicalbigdata
在疾病防治過程中產(chǎn)生的與醫(yī)療相關(guān)的海量數(shù)據(jù)的集合。
4縮略語
醫(yī)學(xué)自然語言處理技術(shù)(MNLP)。
5數(shù)據(jù)治理要求
5.1綜述
數(shù)據(jù)治理是組織中涉及數(shù)據(jù)使用的一整套管理行為。數(shù)據(jù)治理的最終目標是提升數(shù)據(jù)的價值,它是
一個管理體系,包括組織、制度、流程、工具,是醫(yī)院實現(xiàn)數(shù)字化轉(zhuǎn)型和數(shù)字戰(zhàn)略的基礎(chǔ)。醫(yī)療機構(gòu)數(shù)
據(jù)治理源于組織的外部監(jiān)管、內(nèi)部數(shù)據(jù)管理及應(yīng)用的需求,應(yīng)滿足如下要求:
——法律法規(guī)、行業(yè)監(jiān)管和內(nèi)部管控等對醫(yī)療機構(gòu)數(shù)據(jù)及其應(yīng)用的安全、合規(guī)的要求;
——醫(yī)療機構(gòu)數(shù)據(jù)產(chǎn)品化、資產(chǎn)化和價值化的要求;
——醫(yī)療機構(gòu)數(shù)據(jù)生存周期管理及應(yīng)用過程中數(shù)據(jù)架構(gòu)、數(shù)據(jù)模型、數(shù)據(jù)標準、數(shù)據(jù)質(zhì)量和數(shù)據(jù)
安全等體系建設(shè)的要求。
——醫(yī)療機構(gòu)“以數(shù)據(jù)為中心、以醫(yī)療機構(gòu)為單位、以能力成熟度為準則”進行數(shù)據(jù)安全治理的
要求。
5.2數(shù)據(jù)治理框架
元數(shù)據(jù)管理、主數(shù)據(jù)管理、數(shù)據(jù)質(zhì)量管理、數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理、數(shù)據(jù)安全管理、數(shù)據(jù)標準管理、數(shù)據(jù)后
結(jié)構(gòu)化管理。
5.3元數(shù)據(jù)管理規(guī)范
5.3.1一般要求
元數(shù)據(jù)是描述數(shù)據(jù)屬性的數(shù)據(jù),是關(guān)于數(shù)據(jù)的組織、數(shù)據(jù)域與關(guān)系的信息。元數(shù)據(jù)分為技術(shù)元數(shù)據(jù)、
業(yè)務(wù)元數(shù)據(jù)、管理元數(shù)據(jù)。應(yīng)提供但不限于如下信息:
——數(shù)據(jù)采集信息:數(shù)據(jù)來源、數(shù)據(jù)采集日志、數(shù)據(jù)依賴關(guān)系、ETL任務(wù)信息;
——數(shù)據(jù)存儲信息:數(shù)據(jù)物理位置、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、數(shù)據(jù)模型;
——數(shù)據(jù)使用信息:數(shù)據(jù)稽核日志、數(shù)據(jù)訪問日志。
5.3.2功能要求
元數(shù)據(jù)管理模塊是大數(shù)據(jù)平臺數(shù)據(jù)治理體系的重要組成部分。元數(shù)據(jù)管理用于定義和維護元數(shù)據(jù),
建設(shè)將貫穿醫(yī)院大數(shù)據(jù)平臺建設(shè)、使用、運營、維護的全過程,應(yīng)提供如下功能:
——支持常見關(guān)系型數(shù)據(jù)庫、大數(shù)據(jù)NoSQL數(shù)據(jù)庫等不同類型數(shù)據(jù)源的數(shù)據(jù)庫信息讀取,自動采
集數(shù)據(jù)源元數(shù)據(jù);
——支持元數(shù)據(jù)列表可視化增、刪、改、查;
——支持元數(shù)據(jù)通過發(fā)布、審批流程后,生成元數(shù)據(jù)接口服務(wù),其它系統(tǒng)或模塊使用元數(shù)據(jù)服務(wù);
——支持數(shù)據(jù)元字典可視化,便于內(nèi)外部更好地了解醫(yī)院數(shù)據(jù)概況;
——提供全局元數(shù)據(jù)查詢檢索,便于快速定位元數(shù)據(jù);
——提供血緣/影響分析功能,便于數(shù)據(jù)維護及問題定位;
3
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——提供元數(shù)據(jù)可視化應(yīng)用,方便終端使用元數(shù)據(jù);
——提供統(tǒng)一的基于元數(shù)據(jù)描述的管理產(chǎn)品,集中管理平臺開放的內(nèi)外部API。
5.4主數(shù)據(jù)管理規(guī)范
5.4.1一般要求
主數(shù)據(jù)是指一組約束和方法用來保證醫(yī)院內(nèi)主題域和多系統(tǒng)間相關(guān)數(shù)據(jù)和跨主題域和系統(tǒng)的相關(guān)
數(shù)據(jù)的實時性、含義和質(zhì)量,以保證醫(yī)院的系統(tǒng)協(xié)調(diào)和復(fù)用正確的業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)(主數(shù)據(jù))。醫(yī)院主數(shù)據(jù)應(yīng)包
括如下類型:
——機構(gòu)主數(shù)據(jù):機構(gòu)信息、科室信息、科室分類、醫(yī)療組信息、員工信息等;
——患者主數(shù)據(jù):個人信息(性別、地址、婚姻狀況、職業(yè)、血型、教育水平)、患者標識類型;
——業(yè)務(wù)主數(shù)據(jù):診斷字典、醫(yī)囑項目、檢查項目、檢驗項目、手術(shù)字典、藥學(xué)項;
——財務(wù)主數(shù)據(jù):收費項目、費用類型、醫(yī)療產(chǎn)品服務(wù)商/供應(yīng)商等。
5.4.2功能要求
主數(shù)據(jù)維護用于檢索、定義、修改、發(fā)布SOA服務(wù)等功能和數(shù)據(jù)質(zhì)量管理,主數(shù)據(jù)管理應(yīng)提供以下
功能:
——主數(shù)據(jù)標準體系管理:定義、維護、檢索數(shù)據(jù)標準,應(yīng)為主數(shù)據(jù)管理和其他信息系統(tǒng)提供值
域服務(wù);
——主數(shù)據(jù)維護:應(yīng)提供主數(shù)據(jù)新增、刪除、檢索功能;
——主數(shù)據(jù)導(dǎo)入導(dǎo)出:應(yīng)提供批量導(dǎo)入和導(dǎo)出;
——主數(shù)據(jù)審核、發(fā)布:需要發(fā)布的主數(shù)據(jù)應(yīng)建立審核流程;
——主數(shù)據(jù)共享:應(yīng)提供主數(shù)據(jù)對外查詢接口及數(shù)據(jù)分發(fā)功能;
——主數(shù)據(jù)監(jiān)控及日志:應(yīng)為跨系統(tǒng)使用主數(shù)據(jù)情況信息提供監(jiān)控以及日志管理功能;
——主數(shù)據(jù)版本管理:應(yīng)提供版本管理工具,支持不同版本切換及對照功能,原始主數(shù)據(jù)版本不
一致應(yīng)對各版本主數(shù)據(jù)做對照。
5.5數(shù)據(jù)質(zhì)量管理規(guī)范
5.5.1一般要求
數(shù)據(jù)質(zhì)量管理包括數(shù)據(jù)采集質(zhì)量管理及數(shù)據(jù)治理質(zhì)量管理,本節(jié)主要對數(shù)據(jù)治理中的質(zhì)量管理進行
約束。
數(shù)據(jù)質(zhì)量管理是通過定義數(shù)據(jù)質(zhì)量效驗規(guī)則,定時效驗大數(shù)據(jù)平臺數(shù)據(jù)治理情況,以識別數(shù)據(jù)質(zhì)量
問題,并定期提供數(shù)據(jù)質(zhì)量評估報告與預(yù)警。數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查應(yīng)包括如下方面:
——完整性:用于核查數(shù)據(jù)局部缺失、信息丟失情況;
——唯一性;用于核查不規(guī)范的重復(fù)數(shù)據(jù);
——準確性:用于核查數(shù)據(jù)采集、處理過程中可能出現(xiàn)的數(shù)據(jù)偏差;
——規(guī)范性:用于核查格式、值域、字典不規(guī)范數(shù)據(jù);
——一致性:用于核查系統(tǒng)、模塊間記錄、編碼、引用不一致。
5.5.2功能要求
在大數(shù)據(jù)平臺建設(shè)中,數(shù)據(jù)質(zhì)量為其提供潔凈、結(jié)構(gòu)清晰的數(shù)據(jù),是大數(shù)據(jù)平臺開發(fā)數(shù)據(jù)產(chǎn)品、提
供數(shù)據(jù)服務(wù)、發(fā)揮大數(shù)據(jù)價值的必要前提,是醫(yī)院數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理的關(guān)鍵因素。高效的數(shù)據(jù)質(zhì)量管理工具
是提高數(shù)據(jù)質(zhì)量的重要途徑,應(yīng)提供如下功能:
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——標準管理:應(yīng)根據(jù)全國信息技術(shù)標準化技術(shù)委員會的指標(GB/T36344-2018ICS35.24.01)
從業(yè)務(wù)規(guī)則規(guī)范性設(shè)定質(zhì)量標準,并提供標準查詢、定制功能;
——規(guī)則管理:應(yīng)提供可視化規(guī)則配置界面,支持對不同數(shù)據(jù)源進行復(fù)雜規(guī)則制定;
——質(zhì)量監(jiān)控:應(yīng)提供監(jiān)控任務(wù)管理界面,支持對不同質(zhì)控規(guī)則設(shè)置具有邏輯關(guān)系的監(jiān)控任務(wù);
——考核指標:應(yīng)根據(jù)數(shù)據(jù)質(zhì)量標準、質(zhì)量規(guī)則、監(jiān)控任務(wù)設(shè)定數(shù)據(jù)質(zhì)量驗證指標和考核辦法;
——質(zhì)量分析:應(yīng)包含數(shù)據(jù)質(zhì)量告警、數(shù)據(jù)質(zhì)量分析報告、不定期數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查等分析方式;
——質(zhì)量提升:應(yīng)提供數(shù)據(jù)補錄、更新工具,包括手工修正及自動修正。
5.6數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理規(guī)范
5.6.1一般要求
數(shù)據(jù)資產(chǎn)化以資產(chǎn)的角度開展數(shù)據(jù)管理工作,有助于多角度、全方位開展數(shù)據(jù)的管理,明確數(shù)據(jù)安
全級別,落實資產(chǎn)責任管理,是實現(xiàn)數(shù)據(jù)變現(xiàn)的必要前提。數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理應(yīng)對數(shù)據(jù)進行分級分類管理,
建立統(tǒng)一管理的數(shù)據(jù)資源池,基于主數(shù)據(jù)、元數(shù)據(jù)實現(xiàn)全生命周期的數(shù)據(jù)流管理。
5.6.2功能要求
數(shù)據(jù)資產(chǎn)的范圍和形式應(yīng)包含醫(yī)院擁有的各類數(shù)據(jù),如表、視圖、接口、程序等。同時,隨著大數(shù)
據(jù)的發(fā)展,還納入各種非/半結(jié)構(gòu)化的數(shù)據(jù)形式,如日志、網(wǎng)頁、圖片、音視頻等。數(shù)據(jù)資產(chǎn)標識是一
個有業(yè)務(wù)含義、分段式、全局唯一的字符串,用來區(qū)分識別數(shù)據(jù)資產(chǎn)的標簽。資產(chǎn)標識包含有資產(chǎn)所屬
業(yè)務(wù)域、資產(chǎn)類型、提供者等信息。數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理應(yīng)提供數(shù)據(jù)全生命周期管理,包括以下內(nèi)容:
——數(shù)據(jù)資產(chǎn)目錄:醫(yī)療衛(wèi)生分類分級標準、業(yè)務(wù)分類、敏感程度分級等;
——數(shù)據(jù)標準化;應(yīng)包括數(shù)據(jù)同趨化處理和無量綱化處理兩個方面;
——數(shù)據(jù)資產(chǎn)運營:應(yīng)從看、選、用、治、評五方面對數(shù)據(jù)資產(chǎn)進行合理配置和有效利用;
——數(shù)據(jù)資產(chǎn)服務(wù):應(yīng)包括數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用管理;
——數(shù)據(jù)資產(chǎn)消費:應(yīng)提供數(shù)據(jù)共享服務(wù)中心;
——數(shù)據(jù)生命周期管理:應(yīng)從數(shù)據(jù)生命周期五階段提供管理功能;
——數(shù)據(jù)資產(chǎn)管理服務(wù):集中提供數(shù)據(jù)資產(chǎn)服務(wù)對接內(nèi)外API。
5.7數(shù)據(jù)安全管理規(guī)范
5.7.1一般要求
統(tǒng)一數(shù)據(jù)治理平臺必須建立完整的信息安全管理措施和技術(shù)方案,加強大數(shù)據(jù)平臺與其它系統(tǒng)之間
的數(shù)據(jù)信息安全管控。
5.7.2功能要求
5.7.2.1安全認證
數(shù)據(jù)治理平臺應(yīng)使用統(tǒng)一的身份認證服務(wù),由系統(tǒng)管理員統(tǒng)一管理運維人員、使用人員權(quán)限,并支
持多重身份認證登錄(短信、郵箱等)。
5.7.2.2權(quán)限管理
數(shù)據(jù)治理平臺應(yīng)采用權(quán)限最小化原則進行權(quán)限授予,且數(shù)據(jù)權(quán)限管理應(yīng)支持文件、表級、字段級、
記錄級分配,實現(xiàn)細粒度最小化的權(quán)限管理機制。對于隱私、敏感數(shù)據(jù)應(yīng)采用更嚴格的權(quán)限審批流程和
管理制度,確保數(shù)據(jù)安全使用。
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5.7.2.3數(shù)據(jù)加密
數(shù)據(jù)加密應(yīng)針對不同的數(shù)據(jù)類型(結(jié)構(gòu)化、非結(jié)構(gòu)化、半結(jié)構(gòu)化)、安全等級,設(shè)置不同的加密算
法。在數(shù)據(jù)存儲上,普通數(shù)據(jù)可以采用明文存儲,敏感數(shù)據(jù)則需要加密后再存儲,并附加校驗碼。在數(shù)
據(jù)傳輸上,應(yīng)部署SSL證書,確保敏感數(shù)據(jù)傳輸過程中的安全性。
5.7.2.4數(shù)據(jù)生存周期管理要求
數(shù)據(jù)生存周期管理用于管理系統(tǒng)中數(shù)據(jù)的流動,覆蓋范圍從數(shù)據(jù)的創(chuàng)建、存儲、到過時被刪除的全
過程。
應(yīng)包含但不限于如下功能:
——支持數(shù)據(jù)重要性等級定義與維護,支持重要性與生存周期關(guān)聯(lián);
——每個重要性等級對應(yīng)的數(shù)據(jù)生存周期設(shè)置,支持根據(jù)周期對數(shù)據(jù)進行禁用、恢復(fù)、刪除等操
作;
5.8數(shù)據(jù)標準管理規(guī)范
5.8.1醫(yī)學(xué)術(shù)語標準化規(guī)范一般要求
5.8.1.1.1術(shù)語網(wǎng)絡(luò)應(yīng)同時具備處理語義和醫(yī)學(xué)邏輯的能力,為深度學(xué)習(xí)解決了冷啟動的難題。深度
學(xué)習(xí)用于以下方面:
——基于上下文環(huán)境以自動的方式對知識進行抽取,結(jié)合LSTM與CRF來實現(xiàn),將知識的抽取視為
根據(jù)文字上下文對文字所扮演概念的角色做序列標注的問題;
——預(yù)測概念之間的各種關(guān)系,包括挖掘概念之間的生成關(guān)系和上下文關(guān)系、同義關(guān)系等。
5.8.1.1.2基于通用的知識圖譜引擎和技術(shù)框架,使用深度學(xué)習(xí)來優(yōu)化已有的知識體系,實現(xiàn)高效術(shù)
語網(wǎng)絡(luò)建設(shè)和知識推理能力。
5.8.1.2術(shù)語映射實現(xiàn)
術(shù)語網(wǎng)絡(luò),應(yīng)整合“語義網(wǎng)絡(luò)”和“本體庫”的特點,同時具備處理語義和醫(yī)學(xué)邏輯的能力,發(fā)展
方向應(yīng)當包括:
——術(shù)語網(wǎng)絡(luò)內(nèi)容(附錄A)。依據(jù)使用的場景特征不同而分為以下四大類別:
藥品庫和檢驗庫,分別基于LOINC(觀測指標標識符邏輯命名與編碼系統(tǒng),Logical
ObservationIdentifiersNamesandCodes)和CFDA藥物信息3.0版本構(gòu)建;
疾病和臨床發(fā)現(xiàn)庫、身體結(jié)構(gòu)庫、腫瘤庫、形態(tài)學(xué)庫,分別基于SNOMED-CT、MedDRA、CMeSH、
ICD-O-3、ICD-10;
心臟超聲庫、心電圖庫、胸片庫、胸部CT庫、腦CT庫、腦電圖庫、乳腺庫等,輔助NLP
的信息抽取和隊列搜索需求;
大量儲備的術(shù)語庫資源,為日后的術(shù)語庫搭建和概念變體處理(標準化映射)做準備,如
SNOMED-CT-Observable、SNOMED-CT-Qualifier、RadLex、CMeSH等。
——每個術(shù)語庫針對其應(yīng)用場景的傾向不同,均有各自特征性的圖式(Schema)和算法邏輯,一
個合格的術(shù)語庫應(yīng)具有以下要求:
術(shù)語庫應(yīng)遵循必要性、專業(yè)性、復(fù)用性的原則;
應(yīng)遵循國際權(quán)威或國內(nèi)通用的指南/準則/術(shù)語標準,如檢驗庫和藥品庫均參照了國際
(LOINC)和國內(nèi)地方各個版本的標準;
術(shù)語庫與所參照的標準不應(yīng)該存在語言障礙,概念表述上不能失真;
6
DBXX/TXXX—XXXX
術(shù)語庫內(nèi)的層級結(jié)構(gòu)必須符合臨床使用習(xí)慣且能形成一定的網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)以滿足豐富的應(yīng)用
場景需求;
不同的術(shù)語庫之間存在較大的互操作性潛能;
結(jié)合術(shù)語網(wǎng)絡(luò)管理系統(tǒng)進行術(shù)語維護和變體處理規(guī)則構(gòu)建。
——可計算性和概念變體處理:根據(jù)真實臨床環(huán)境中的文本書寫表達習(xí)慣,應(yīng)實現(xiàn)概念變體的標
準化映射,克服了語序顛倒,否定對象判斷,不嚴謹表達,醫(yī)學(xué)概念推理等概念變體上的問題。
7
DBXX/TXXX—XXXX
A
A
附錄A
(資料性)
術(shù)語標準集
A.1SNOMED-CT
SNOMEDCT,是一部經(jīng)過系統(tǒng)組織編排的,便于計算機處理的醫(yī)學(xué)術(shù)語集,涵蓋大多數(shù)方面的臨床
信息,包括疾病、所見、操作、微生物、藥物等。采用該術(shù)語集,可以協(xié)調(diào)一致地在不同的學(xué)科、專業(yè)
和照護地點之間實現(xiàn)對于臨床數(shù)據(jù)的標引、存儲、檢索和聚合。同時,它還有助于組織病歷內(nèi)容,減少
臨床照護和科學(xué)研究工作中數(shù)據(jù)采集、編碼及使用方式的變異。
A.2MedDRA
MedDRA是一個內(nèi)容豐富,詳細的醫(yī)學(xué)標準術(shù)語,促進人用醫(yī)療產(chǎn)品國際監(jiān)管信息的共享。ICH的標
準術(shù)語MedDRA適用于所有的醫(yī)療產(chǎn)品注冊以及上市前和上市后的文檔與安全
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