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文檔簡介
BDFACSCalibur流式細(xì)胞儀
FACS101Handbook
本課程介紹「表面抗原流式分析」有關(guān)之基礎(chǔ)工作原理,如希望進(jìn)一步了解流式細(xì)胞技術(shù)
應(yīng)用,請至本公司網(wǎng)站訂閱FACSinformation電子報(bào)。
如需要本課程手冊,歡迎至本公司網(wǎng)站下載。
如需要免疫熒光染色方法,請至本公司網(wǎng)站下載。
一、BDFACSCalibur基本結(jié)構(gòu)
1.1儀器本體:
1.電源開關(guān):在BDFACSCalibur儀器右側(cè)下方,先啟動儀器本體,再打開計(jì)算機(jī)。
2.光學(xué)系統(tǒng):BDFACSCalibur基本配有一支波長488nm的氯離子雷射
以BDFACSCalibur基本型為例
>FSCDiodc只收488nm波長散射光
>SSCPMT只收488nm波長散射光
>FL1PMT熒光光譜峰值落在綠色范圍(波長515-545nm)
>FL2PMT熒光光譜峰值落在橙紅色范圍(波長564-606nm)
>FL3PMT熒光光譜峰值落在深紅色范圍(波長>650nm)
3.儀器面板:
儀器前方面板的右下方有三個(gè)流速控制鍵、及三個(gè)功能控制鍵。
流速控制:
LO:樣品流速:12?l/min
MED:樣品流速:35?l/min
HI:樣品流速:60?l/min
功能控制:
?RUN:此時(shí)上樣管加壓,使細(xì)胞懸液從進(jìn)樣針進(jìn)入流動室。(正常顯示綠
色;黃色時(shí)表示儀器不正常,請檢查是否失壓。)
?STANDBY:無樣品或暖機(jī)時(shí)之正常位置,此時(shí)鞘液停止流動,雷射功率
自動降低。
?PRIME:去除流動室中的氣泡,流動室施以反向壓力,將液流從流動室沖
入樣品管,持續(xù)一定時(shí)間后,以鞘液回注滿流動室。PRIME結(jié)束,儀器恢
?STANDBY狀態(tài)。
4.儲液箱抽屜:
在主機(jī)左下方之儲液箱抽屜??上蚯袄_,內(nèi)含鞘流液筒、廢液筒、鞘液過濾
器SheathFilter,及空氣濾網(wǎng)Airfilter。請注意氣路減壓閥VENTTOGGLE之位
置。
?鞘液筒:位于抽屜左側(cè),容積4升。裝八分滿鞘液簡,儀器可以運(yùn)行大約3
小時(shí)。筒上裝有液面感應(yīng)器,鞘液用完時(shí),儀器軟件上會有顯示。鞘液筒蓋
上有金屬環(huán)扣,保證鞘液簡密閉。
?廢液筒:位于抽屜右側(cè),容積4升。筒上裝有液面感應(yīng)器,廢液盛滿時(shí),儀
器軟件上會有顯示。注意廢液可能有潛在的生物傳染性。
?鞘液過游器:0.22?m過濾器,去除鞘液中的雜質(zhì),保證進(jìn)入流動室的鞘液
是干凈的。
?氣路減壓閥:沿筋頭方向移動閥門開關(guān),鞘液筒減壓,氣壓恢復(fù)正常。在鞘
液筒添加鞘液時(shí),需要減壓。
?空氣過濾網(wǎng):用于過濾冷卻雷射的空氣。
5.上樣品區(qū):
上樣品區(qū)是樣本管的上樣位置。它包括三個(gè)部分,一個(gè)是進(jìn)樣針
SamplelnjectionTube,將樣本輸入流動室,還有就是支撐架
TubeSupportArrris和液滴存留系統(tǒng)DropletContainmentSystem。
?進(jìn)樣針:是一根不銹鋼管,將細(xì)胞從樣本針中吸入流動室。進(jìn)樣管外有一套
管,是液滴保留系統(tǒng)的一部分。
?支撐架:用于支撐樣本管、并負(fù)責(zé)啟動液滴存留系統(tǒng)。支撐架有三個(gè)位置:
位于樣本管之下的中位,樣本管左側(cè)或右側(cè)。
液滴存留系統(tǒng):系統(tǒng)由支撐架、真空幫浦和外套管組
成。當(dāng)支撐架位于左側(cè)或右側(cè)位置時(shí),真空幫浦就會啟
動,將液體從外管吸入廢液筒內(nèi)。上樣時(shí),須注意將支
撐架位于中位,以避免過多樣品被抽吸到廢液管內(nèi)(當(dāng)
支撐架位于中位,真空幫浦停止工作)。更換樣品時(shí),
讓儀器保持RUN的模式,使得進(jìn)樣針可以反沖;切換到
STANDBY模式前,確保液路已沖洗徹底以免碎片沈積到
流動室中。
1.2Macintosh計(jì)算機(jī)與打印機(jī):
準(zhǔn)備您的細(xì)胞樣品
1.理想樣品濃度調(diào)至1-10X1()5cells/ml?一般實(shí)驗(yàn)只需0.5ml的樣品。
2.細(xì)胞樣品務(wù)必放至BDFALCON352052試管中,否則無法上機(jī)。
3.上機(jī)前務(wù)必去除樣品中之細(xì)胞團(tuán)塊,以防止管路堵塞?可使用附濾網(wǎng)
BDFALCON試管(Cat.No.352235)或35-55.'忡的尼龍篩網(wǎng).
4.供流式分析的樣品是單細(xì)胞懸浮液,而且大部分樣品都需經(jīng)熒光染色。表面抗原
熒光染色的方法大致有兩種:直接免疫熒光、間接免疫熒光染色。研究生可至本
公司網(wǎng)站下載染色方法
?直接免疫熒光染色
?Lysed-No-WashProcedure
?Lysed-And-WashProcedure,SimulTEST&HLA-B27
?PeripheralBloodMononuclearCellProcedure
?LeukemiaandLymphomaProcedurel
?LeukemiaandLymphomaProcedure2,B-cellClonalityAssay
?間接免疫熒光染色
?滴定抗體濃度
?常用試劑
5.如因特殊因素?zé)o法下教上述實(shí)驗(yàn)方法,請e-mail:或。
二、開機(jī)、關(guān)機(jī)標(biāo)準(zhǔn)操作
2.1FACSCalibur開機(jī)
1.開啟細(xì)胞儀電源。
2.開啟其它周邊配備電源,如打印機(jī)及M0機(jī)。
3.開啟計(jì)算機(jī)。
4.確認(rèn)鞘流液筒有八分滿的FACSFIow,確實(shí)旋緊(鞘液筒容量為4L)。
5.將廢液倒掉,并在廢液筒中加入200nli家用漂白水(廢液筒容量為4L)。
6.將減壓閥方向調(diào)在加壓(Pressurize)位置,
7.排除液流管路與過濾器中的氣泡。
8.取下樣品管,執(zhí)行PRIME功能兩次。
9.使用ImIPBS,HIGHRUN兩分鐘。
10.可開始分析樣品。
2.2FACSCalibur關(guān)機(jī)
關(guān)機(jī)前必要?jiǎng)幼鳎呵逑催M(jìn)樣管和外套管,防止進(jìn)樣管堵塞、或有染料殘留。
1.將樣品支持架左移,取2mlFACSCIean(10%Bleach)上樣品,讓儀器的真空
系統(tǒng)抽取約1ml的液體。
2.將樣品支持架回正,按HIRUN,然后讓FACSCIean清洗管路10分鐘。
3.按Standby,取下樣品管,執(zhí)行PRIME功能兩次。
4,取2mleIH2O,重復(fù)上述步驟1-3。
5.注意最后只留約1mldH2O在試管中。
6.按STANDBY五分鐘,使風(fēng)扇冷卻雷射后,關(guān)閉細(xì)胞儀(必要?jiǎng)幼?,以保護(hù)雷
射光源。)
7.倒掉廢液,棄回填200ml漂白水。
8.將減壓閥放在「VENT漏氣」位置。將鞘流液筒充填至八分滿。
9.退出軟件“File"w“Quit”(如有對話選項(xiàng),選擇“Don'tsave”)。確認(rèn)退出
計(jì)算機(jī)中所有BD應(yīng)用軟件,所有數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)己儲存?zhèn)浞荨?/p>
10.關(guān)閉計(jì)算機(jī)?!癝pecial”名“Shutdown”,
三、上機(jī)分析流程
建議首次試機(jī)避免進(jìn)行大量試驗(yàn),僅需準(zhǔn)備下列樣品。
(1)Negativecontrol(不加任何抗體)。
(2)CD3-FITC(FL1單染)。
(3)CD19-PE(FL2單染)。
(4)CD3-FITC/CD19-PE(FL1/FL2雙染)。
3.1Calibur開機(jī)
1.先開啟細(xì)胞儀本體再打開計(jì)算機(jī)。*秘技1:如順序相反,儀器和計(jì)算機(jī)之間無法
建立正常通訊.無法執(zhí)行“cocaecffocytomefer”。解決之道,兩者都關(guān)機(jī)、然后
以正確方式重開。
2.向前拉開儲液箱抽屜,檢查鞘液筒、廢液筒水量,如需充填鞘液,將減壓閥方向
調(diào)在VENT位置(箭頭方向)。
3.儀器會對鞘流液筒打氣加壓,請確認(rèn)筒蓋確實(shí)旋緊。*秘技2:將減壓閥方向調(diào)在
加壓(向前),立置。減壓閥如在VENT(箭頭方向)位置,按RUN功能鍵時(shí)將
顯示橙黃色(表示儀器不正常,請檢查是否失壓),正常為綠色顯示。
3.2開啟CellQuest軟件、編輯實(shí)驗(yàn)文件
4.在蘋果菜單下點(diǎn)擊CELLQuest啟動軟件。桌面會出現(xiàn)一'UntiQed'實(shí)驗(yàn)文件,可
點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)文件的右上角的放大鈕,將實(shí)驗(yàn)文件窗口放大。
5.從工具板中點(diǎn)擊散點(diǎn)圖圖示。在實(shí)驗(yàn)文件的空白區(qū)點(diǎn)擊,拖曳對角線至適當(dāng)大
小,然后放開鼠標(biāo)。出現(xiàn)散點(diǎn)圖對話方框。
6.在出現(xiàn)的散點(diǎn)圖對話方框中點(diǎn)擊PlotSource,選擇Acquisition(收?。?,確認(rèn)X和
丫軸參數(shù)預(yù)設(shè)為FSC-H1024、SSC-H1024.在顏色方框中點(diǎn)擊
MulticolorGatmg(收取樣品時(shí),門內(nèi)細(xì)胞將出現(xiàn)顏色)。點(diǎn)擊OK。此時(shí)實(shí)驗(yàn)
文件會出現(xiàn)FSC/SSC散點(diǎn)圖。
7.說明:散點(diǎn)圖(Dotplot),乂稱二維散點(diǎn)圖是流式分析最常用圖譜,它可以顯示
兩個(gè)獨(dú)立參數(shù)的相互關(guān)系。在圖中,橫坐標(biāo)X軸為為熒光1強(qiáng)度的相對值,單
位是道數(shù),縱坐標(biāo)丫軸則通常表示熒光2或光散射強(qiáng)度的相對值。儀器使用者
可因應(yīng)實(shí)驗(yàn)需求來修改所有圖譜中顯示之參數(shù)。第一圖X和丫軸參數(shù)分別設(shè)為
FSC-H1024.SSC-H1024;第二圖X和丫軸參數(shù)分別設(shè)為FL1-H1024、FL2-
H1024o修改動作為輕擊圖譜上X和丫軸參數(shù),并依需要選擇之(FSC:細(xì)胞
大小,SSC:細(xì)胞折射率,FL1:FITC綠色熒光,F(xiàn)L2:PE橙色熒光,FL3:
PerCP紅色熒光)。
8.從屏幕上方Plcs菜單中選擇DotPlot功能,可復(fù)制一個(gè)同樣大小的散點(diǎn)圖,在
出現(xiàn)的對話方用內(nèi)選擇X軸:FL1-H1024,Y軸:FL2-H1024。點(diǎn)擊0K,
FL1/FL2的散點(diǎn)圖出現(xiàn)。完成后可將重制圖移至原圖右方。
9.在工具板中選擇四象限工具,在FL1/FL2散點(diǎn)圖上拖動Quadrant的中心將它設(shè)
定在(x,y)=(101,101)處,這些象限將指定陰性/陽性區(qū)域。蜜
建立儀器和計(jì)算機(jī)之間通訊
10.從Acquire菜單中選擇ConnecttoCytometer,此時(shí)會出現(xiàn)Acquisitioncontrol
對話方框。如果無法選擇ConnecttoCytomeier,參考秘技#1。如果沒見到
Acquisitioncontrol對話,可到屏幕上方VV/'cdows菜單中選擇
口出E近過壬京美AcquisitionControlWEWW巧巨王
File:
0Setup[Acqui"]f[Sw][-j
ShowAcquisitionControla
儀舞設(shè)置文件
注意:實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)質(zhì)量,取決「最適化儀器設(shè)定文件。儀器設(shè)定文件不能在數(shù)據(jù)收取
后再更改,研究人員必須在第一次就使用正確的儀器設(shè)定文件。儀器設(shè)定文件
(Instrumentsettings),含信號器高壓(Detector7Amps),閾值
(Threshold),熒光補(bǔ)償(Compensation)等儀器條件的組合。一般而言,儀器
設(shè)定的順序?yàn)镈e:ector/Amps-Threshold-Compensationo
11.檢杳現(xiàn)有儀器條件,從Cytometer菜單中選擇
Cytometer,口丘而
Detectors/Amps。出現(xiàn)Detectors/Amps窗口。在Oetectors/Rmps
Detectors/Amps窗口確認(rèn)FSC與SSC為LIN(線Threshold■
性放大),其它FL1-3為LOG(對數(shù)放大),將其Compensation
Status
拖至空白區(qū)。
InstrumentSetting
SortCounters
Time-DelayCalibral
12.從Cytometer菜單中選擇Threshold,出現(xiàn)Threshold窗11在Threshold窗11:
確認(rèn)FSC為設(shè)閾參數(shù),初步確認(rèn)預(yù)設(shè)閾值52。將其拖至空白區(qū)。
13.從Cytometer菜單中選擇Compensation,確認(rèn)所有預(yù)設(shè)數(shù)值皆為零。將其拖至
空白區(qū)。
3.3上樣品、設(shè)置儀器
14.使儀器處于HighRUN,支撐架左移,上陰性對照管樣品,支撐架回位。確認(rèn)
Acquisitioncontrol窗口中與Setup前需打叉或打勾(即不儲存數(shù)據(jù)),點(diǎn)擊
Acquire。
調(diào)節(jié)FSC/SSC探測器(電壓)
15.觀察FSC/SSC圖的變化。FSC電壓(Voltage)預(yù)設(shè)為E00,可調(diào)節(jié)AmpGain
從1.00-9.99使主要細(xì)胞群得以清楚顯示(如細(xì)胞較大,將FSC電壓設(shè)置于
E-1;較小細(xì)胞,將FSC電壓設(shè)置于E01),調(diào)節(jié)SSC電壓使主要細(xì)胞群得以
清楚呈現(xiàn)。調(diào)節(jié)FSC/SSC圖的原則,在于能得到一獨(dú)立離散的細(xì)胞族群,該
細(xì)胞群不與其它族群、細(xì)胞碎片有重迭現(xiàn)象,調(diào)整定位后,點(diǎn)擊
Acquisitioncontrol窗口中的Pause.
Gating圈選
細(xì)胞檢品中,常含有大小不同、性質(zhì)相異的細(xì)胞群體。我們常用前方散射與側(cè)方敵射
的二維位圖,即散射光圖譜(ScatterPlot),來圈選出不同細(xì)胞群的范圍,選擇性顯
示出有意義的細(xì)胞群體,如下圖圈選白血球之淋巴細(xì)胞族群。
16.在工具板中選擇多邊形的Region,在FSC/SSC散點(diǎn)圖上劃定淋巴細(xì)胞R1區(qū)域
(如下圖)。分析樣品時(shí),區(qū)域內(nèi)細(xì)胞應(yīng)會呈現(xiàn)成紅色,可移動或改變形狀來圈選
有意義的細(xì)胞。如果要?jiǎng)h除R1區(qū)域,您可以在工具列中點(diǎn)選Gatesf
Regionlist.以鼠標(biāo)點(diǎn)選R1.再按Delete犍刪除R1|x.域°刪除R1
區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。H
17.選取希望Gate的FL1/FL2散點(diǎn)圖,從Plots菜單中選擇尸0mlafdotpQt。在出現(xiàn)的
對話方框內(nèi),將NoGa招改選G7=R7。點(diǎn)擊0K。
調(diào)節(jié)FL1、FL2的探測器(電壓)
18.點(diǎn)擊AcquisitiorControl窗口中的Restart。在Detector/Amps窗口中調(diào)節(jié)FL1、
FL2的電壓,使Negativecontrol細(xì)胞群
著落在所選直方圖或散點(diǎn)圖之10°-101
處。
19.在Threshold窗口,適當(dāng)?shù)靥岣逨SC閾值>52,以去除碎片或低階噪音。唯需注
意不要切掉主要細(xì)胞族群。
20.點(diǎn)擊Acquisitioncontrol窗口中的Pause、Aborto移去陰性對照管,關(guān)閉
Detector/Amps>Threshold窗口,我們已設(shè)定好有意義細(xì)胞群之自體熒光。
調(diào)節(jié)熒光補(bǔ)償
說明:最適化的最后?步是調(diào)節(jié)光譜重迭。(如是單色熒光實(shí)驗(yàn)可跳過此步驟)如是
2色樣本,必要時(shí)需調(diào)節(jié)FL2-%FL1,FL1-%FL2(若3色樣本,必要時(shí)需調(diào)節(jié)FL2-
%FL1、FL1-%FL2、FL3-%FL2、FL2-%FL3的補(bǔ)償)。
換上單染管。點(diǎn)擊
21.HighRUN,CD3-FITC|j:::::::■Compensation::::::::Ei
Acquisitioncontrol窗口中的Acquire。調(diào)節(jié)FL2-%FL1FL1-0.0|||%FL2
使FITC陽性細(xì)胞在FL1/FL2散點(diǎn)圖的右下象限。補(bǔ)償
Fl2口XA。?口XIAI?KFl1
1L?.叭R1L1
調(diào)節(jié)可通過點(diǎn)擊??來選擇或直接拖動滑標(biāo)上下移動。調(diào)
rL1ZoUn.Une?w/brLion
節(jié)完畢,點(diǎn)擊Acquisitioncontrol窗口中的Pause。
FL3-0.0用%FL2
FL3-O.offi%FL4
中
FL4-(J.Oift%FL3
年
22.移去單染CD3,換上單染CD19-PE管。點(diǎn)擊□::::::::Compensation:.
Acquisitioncontrol窗口中的Restart。調(diào)節(jié)FL1-%FL2FL1-0.3[t|%FL2
使PE+細(xì)胞在FL1/FL2散點(diǎn)圖的左上象限。調(diào)節(jié)完畢,F(xiàn)L2-36.3lt'|%FL1
點(diǎn)擊Acquisitioncontrol窗口中的Pause。FL2-0.0[f|%FL3
FL3-22.6@%FL2
FL3-仇噂%FL4
FL4-氏噂%FL3
23.最后以CD3-FITC/CD19-PE雙染樣
本上機(jī),點(diǎn)擊Acquisitioncontrol窗
口中的Restart,確定三群細(xì)胞工整
垂直。當(dāng)您已完成2色熒光之光譜重
迭時(shí),點(diǎn)擊Acquisitioncontrol窗口
中的Pause.Aborto
24.移去樣本管,換.上dH2O管,讓儀器暫且處于Standby狀態(tài)。關(guān)閉Compensation
窗口。您己完成2色熒光之最適化。
3.4收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
決定儲存細(xì)胞總數(shù)
25.預(yù)設(shè)之「儲存細(xì)胞總數(shù)」為10000。如需修改,從
Acquire菜單中選擇Acquisition&Storage,并在出現(xiàn)
的窗口功,確認(rèn)「Collectioncriteria」從ParameterDescription
10000ofAII,再點(diǎn)擊OK。CustomKeywords
Counters
FriitRpagpntIist...
EditPanels...
QuantiQuest
DisconnectfromCytom
26.找個(gè)檔案匣準(zhǔn)備儲存數(shù)據(jù)。從Acquire菜單中選擇ParameterDescription,出現(xiàn)
ParameterDescription對話方框。點(diǎn)擊Folder,并在隨后出現(xiàn)之對話方框,選
擇FYourFolder]或新建活頁夾,點(diǎn)擊此對話方框的Select'YourFolder'。
27.命名即將儲存之文件名:點(diǎn)擊ParameterDescription對話方框的File,出現(xiàn)文
件名編輯窗口。在CustomPrefix中:輸入文件名,點(diǎn)擊此對話方框的0乩日
期為最常用之文件名系統(tǒng)。
28.Optional:如有需要,可選擇或在P1-
□ParameterDescriptionE
P5后的空格中輸入相關(guān)參數(shù)名。如
Window:untitled
P1:Size,P2:Granularity,P3:Folder:FACStationG.eatFolder:
:
CD3FITCo輸入?yún)?shù)名會存入實(shí)驗(yàn)檔FileNameData.001
SampleID:[
案中,顯示在圖譜上。PatientID:
Comments:
口Panel(IMKLymphD
計(jì)數(shù)器Counters
29.從Acquire菜單中選擇Coucfws.窗口會顯示樣品分析速率、與總數(shù)進(jìn)度。
口?Counters——?京m三—回
TotalEvents:3825------------------
Events/Second:150Reset
ElapsedTime:0:0:24
收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
30.你可以開始收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)了。HIGHRUN,將第一管樣品放到檢測區(qū),在
Acquisitioncontrol窗口中,將匕Setup改成,Setup,此時(shí)CellQuest會自動顯
YourFolder:為資料文件名。點(diǎn)擊“Acquire”便可啟動樣品之分析測定與數(shù)
據(jù)儲存。當(dāng)計(jì)算機(jī)成功地收取足夠數(shù)據(jù),會自動儲存數(shù)據(jù)文件,并會以“嘟”
聲告知,CellQuest會自動升哥附加檔名成。等待下一指示。
31.你可以換上下一管樣品,點(diǎn)擊“Acquire”啟動樣品之分析測定與數(shù)據(jù)儲存。可繼
續(xù)分析直到所有檢品都分析完畢。
3.5實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)之儲存與備份:
32.不建議長期使用硬盤儲存數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),可考慮以燒光盤(如配有CD-RW)、口袋
硬盤(FlashDrive)來備份大量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),以免占用原有硬盤的內(nèi)存,影響數(shù)
據(jù)處理速度??蓪浞莺笾?dāng)?shù)據(jù),拿到另一率果計(jì)算機(jī)或個(gè)人PC進(jìn)行離機(jī)分
析。
33.確認(rèn)所有檔案皆己備份后,以鼠標(biāo)圈選欲刪除數(shù)據(jù),將其拖拉至Trash簡。
退出軟件
34.檢品分析完畢后,記得從屏幕上方File指令欄選擇EditCytometer
New
SaveAs,儲存實(shí)驗(yàn)文件,以備日后使用,不需每次
Open...
重新編輯。Close
SaveFCSFilet.
35.從屏幕上方Cytometer指令欄,選擇Instrumentsetting,出現(xiàn)Instrumentsetting
窗口。點(diǎn)系print打印此次實(shí)驗(yàn)條件,可貼入實(shí)驗(yàn)筆記留底,再點(diǎn)擊Save以儲存
此一實(shí)驗(yàn)的儀器條件,供日后再使用。點(diǎn)系SAVE后會出現(xiàn)文件保存對話方
框,選擇文件目錄及文件名(例:YourFoldsr:/YourSettingl),點(diǎn)擊Save.
點(diǎn)擊Done。
36.檢品分析完畢后,用鼠標(biāo)從屏幕上方Acquire指令欄中,選取
DisconnecttoCytometer以斷絕計(jì)算機(jī)與儀器間之聯(lián)機(jī)。之后如不分析數(shù)據(jù),您
可退出軟件“File"w“Quit”(遇有選項(xiàng)永遠(yuǎn)選擇"Don'tsave”),進(jìn)行關(guān)機(jī)程
序。
管路清洗
37.以2ml10%漂白水取代樣品,將樣品架置于左位以外管吸除約1mL再將樣品
架置于中位HIRUN十分鐘。改用2mlDlwater。重復(fù)上述程序,樣品架上留約
1mlDlwatero按STANDBY五分鐘。
關(guān)主機(jī)、關(guān)計(jì)算機(jī)
四、數(shù)據(jù)分析
FCSIistmode數(shù)據(jù)文件:
說明:FCSIistmode數(shù)據(jù)文件是流式細(xì)胞儀的標(biāo)準(zhǔn)格式檔案(FCS2.0)。該文件含有從流
式細(xì)胞儀收取的平均10,000個(gè)細(xì)胞數(shù)的資料,含有4~6個(gè)參數(shù)。一般軟件無法打開
listmode數(shù)據(jù)文件,需藉助如CellQuest,WinList,WinMDI,等Flow分析軟件,才可開啟、
繪圖、并進(jìn)行分析統(tǒng)計(jì)。
4.1開啟一CellQuest實(shí)驗(yàn)文件
1.從屏幕上方File菜單中選擇New。桌面會出現(xiàn)一'Untitled'實(shí)驗(yàn)文件,可點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)文
件的右上角的放大鈕,將實(shí)驗(yàn)文件窗口放大。
4.2散點(diǎn)圖之統(tǒng)計(jì)分析(雙色)
2從工具板中點(diǎn)擊散點(diǎn)圖圖示。在實(shí)驗(yàn)文件的空白區(qū)點(diǎn)擊,然后拖動對角線至適當(dāng)大
小。Plot拖曳完成后可以在右方看到DotPlot對話框。
3.在DotPlot方框中,PlotSource應(yīng)預(yù)設(shè)為Analysis,可點(diǎn)擊SelectFile鈕,并用隨
后之方框來開啟預(yù)存之SampleFiles,它們的路徑位于MacHD:
BDApplications:CellQuestFolder:SampleFileSo連續(xù)雙擊鼠標(biāo)來打開次目錄,
找到檔案后,點(diǎn)擊Open來開啟NORM001檔案。X與Y參數(shù)項(xiàng)會出現(xiàn)默認(rèn)值一
FSC-H256與SSC-H256,在Color方框中點(diǎn)擊MulticolorGating,確認(rèn)無誤之
后,點(diǎn)擊0K便完成了一個(gè)NORM001的FSC/SSC散點(diǎn)圖。
4.工具板中選擇多角形區(qū)隔工具,將Cursor■移至FSC/SSC散點(diǎn)圖上,并沿,jj
著淋巴球聚落周邊畫出范圍,連點(diǎn)擊兩次可關(guān)閉該區(qū)域。你已完成R1回斗
區(qū)域的界定,我們將以此區(qū)域來圈選淋巴細(xì)胞。(如果要?jiǎng)h除R1區(qū)域,|回
您可以在工具列中點(diǎn)選Gates-Regionlist,以鼠標(biāo)點(diǎn)選R1,再按
Delete鍵刪除R1區(qū)域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。)
5.從Plots菜單中選擇DotPlot可復(fù)制一個(gè)同樣大小的散點(diǎn)圖,屏幕上會出現(xiàn)一
DotPlot對話方框。點(diǎn)擊XParameter?鈕來顯示NORM001檔案中所有的參數(shù)項(xiàng)
(FSC,SSC,FL1,FL2)將X參數(shù)項(xiàng)改成rFL1-H256Gamma-1J,丫參數(shù)項(xiàng)改成
rFL2-H256Gammd-2j。從Gale輸入欄中將NoGale改成G1=R1。
6.點(diǎn)擊0K便完成了一個(gè)以G1圈選的
FL1/FL2散點(diǎn)圖,可將復(fù)制圖移至
原圖右方。NORM001檔案為本組
實(shí)驗(yàn)之陰性對照組,我們將以之來
界定陰性與陽性之界限。
7.從屏幕左列工具板中,選取QuadrantMarker工具,然后在FL1/FL2散點(diǎn)圖中心處
點(diǎn)擊并拖曳至定點(diǎn),一般而言是緊挨著陰性細(xì)胞聚落。
8.FL1/FL2二維散點(diǎn)圖現(xiàn)在被區(qū)隔出四個(gè)象限,欲計(jì)算名象線中細(xì)胞的數(shù)據(jù)數(shù)據(jù),從
屏幕上方Stats菜單中選擇QuadrantStats??梢缘玫皆搱D之四象限統(tǒng)計(jì)結(jié)果。
UL:左上象限,UR:右上象限,LL:左下象限,LR:右下象限
打印報(bào)告、輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值
9.從屏幕上方File菜單中選擇PrintOne,可以打印工作中實(shí)驗(yàn)文件。
10.點(diǎn)選四象限統(tǒng)計(jì)表,從屏幕上方File菜單中選擇Exportstatistics可輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值
至Excel檔案。在出現(xiàn)方框中命名檔案,并決定欲存放檔案匣,點(diǎn)擊Save,,
4.3開啟其它ListModeData
11.如欲接著分析存在同一檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有圖表(文
件中所有圖譜的四角會出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇
NextDataFile,軟件會自動以新檔案來替換現(xiàn)有檔案,您只要確認(rèn)圈選范圍、與
QuadrantMarker的位置是否恰當(dāng),即可打印報(bào)告、或輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值。
12.對于存在不同檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有圖表(文件中所有
圖譜的四角會出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇
ChangeDataFiles,并在隨后出現(xiàn)之對話方框,選擇所在新目錄與欲分析檔案。
點(diǎn)擊OPEN。可調(diào)整圈選區(qū)域,QuadrantMarker陰陽界限,軟件會重新計(jì)算、
統(tǒng)計(jì)報(bào)告。
13.常規(guī)使用之實(shí)驗(yàn)文件(內(nèi)含散點(diǎn)圖、圈選區(qū)格、四象限分界、以及統(tǒng)計(jì)報(bào)告),我們
建議您將它另存新檔File-SaveAs,以備后需,分析其它檔案便輕而易舉。
4.3直方圖之統(tǒng)計(jì)分析(單色)
1.從屏幕上方File菜單中選擇New。桌面會出現(xiàn)一'Untitled'實(shí)驗(yàn)文件,可點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)文
件的右上角的放大鈕,將實(shí)驗(yàn)文件窗口放大。
2.從工具板中點(diǎn)擊散點(diǎn)圖圖示。在實(shí)驗(yàn)文件的空白區(qū)點(diǎn)擊,然后拖曳對角線至適當(dāng)大
小。Plot拖曳完成后可以在右方看到DotPlot對話框。
3.在DotPlot方框中,PlotSourcc應(yīng)預(yù)設(shè)為Analysis,可點(diǎn)擊ScIcctFilc鈕,并用隨后
之方框來開啟預(yù)存之SampleFiles,它們的路徑位于MacHD:BDApplications:
CellQuestFolder:SampleFileSo連續(xù)雙擊鼠標(biāo)來打開次目錄,找到檔案后,點(diǎn)擊
Open來開啟NORM001檔案。X與丫參數(shù)項(xiàng)會出現(xiàn)默認(rèn)值一FSC-H256與SSC-
H256,在Color方框中點(diǎn)擊MulticolorGating,確認(rèn)無誤之后,點(diǎn)擊OK便完成了
一個(gè)NORM001的FSC/SSC散點(diǎn)圖。
4.工具板中選擇多角形區(qū)隔工具,將Cursor移至FSC/SSC散點(diǎn)圖上,并沿>—q―R
著淋巴球聚落周邊畫出范圍,連點(diǎn)擊兩次可關(guān)比該區(qū)域。你已完成R1區(qū)羋4
區(qū)域的界定,我們將以此區(qū)域來圈選淋巴細(xì)胞。(如果要?jiǎng)h除R1區(qū)域,|?忙不
您可以在工具列中點(diǎn)選Gates-Regionlist,以鼠標(biāo)點(diǎn)選R1,再按
Delete鍵刪除R1IX域。刪除R1區(qū)域后,可用繪圖工具板,重畫R1。)
5.從Plots菜單中選擇Histogram,屏幕上會出現(xiàn)一Histogram對話方框。點(diǎn)擊
SelectFile鈕,再點(diǎn)擊Open來開啟NORM001檔案。
說明:直方圖(Histogram)表明一個(gè)參數(shù)與細(xì)胞數(shù)量之間的
關(guān)系,在圖中,橫坐標(biāo)X軸為熒光或光散射強(qiáng)度的相對值,
單位是道數(shù)(channelnumber),縱坐標(biāo)Y軸則通常表示細(xì)
胞出現(xiàn)的頻率,即相對細(xì)胞數(shù)。
6.點(diǎn)擊Parameter鈕來顯示NORM001檔案中所有的參數(shù)項(xiàng),將參數(shù)項(xiàng)改成IFL2-
H256Gamma-2j。從Gate輸入欄中將NoGate改成G1=R1,點(diǎn)擊0K便完成了一
個(gè)以G1圈選的FL2直方圖,圖形的X軸為橙黃色熒光強(qiáng)度,丫軸為細(xì)胞頻率,
NORM001檔案為本組實(shí)驗(yàn)之陰性對照組,我們將以之來界定陰性與陽性之界限。
7.從屏幕左列工具板中,選取HistogramMarker工具,然后在圖的左緣處點(diǎn)擊并拖曳
至定點(diǎn),一般而言是陰性信號的右緣。放開鼠標(biāo)后即完成Marked(M1)。重復(fù)前述
步驟以增畫另一Marker,一般而言M2始自M1的右緣,終于圖的右界。
8.FL2直方圖現(xiàn)在被區(qū)隔出兩個(gè)區(qū)域,欲計(jì)算各區(qū)域中細(xì)胞的數(shù)StatsBatchAcquire
HistogramStats
據(jù)數(shù)據(jù),同'從Stats指令欄中選擇HistogramStatSoK-SStats-
RegionStats
GateStats
QuadrantStats
Edit.
NewExpression
EditExpression
打印報(bào)告、輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值
9.從屏幕上方File菜單中選擇PrintOne,可以打印工作中實(shí)驗(yàn)文件。
10.點(diǎn)選四象限統(tǒng)計(jì)表,從屏幕上方File菜單中選擇Exportstatistics可輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值至
Excel檔案。在出現(xiàn)方框中命名檔案,并決定欲存放檔案回,點(diǎn)擊Save.
4.3開啟其它ListModeData
11.如欲接著分析存在同一檔案匣之系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖曳方式選取所有圖表(文件
中所有圖譜的四角會出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇
NextDataFile,軟件會自動以新檔案來替換現(xiàn)有檔案,您只要確認(rèn)圈選范圍、與
QuadrantMarker的位置是否恰當(dāng),即可打印報(bào)告、或輸出統(tǒng)計(jì)數(shù)值。
12.對于存在不同檔案同方系列檔案,可用鼠標(biāo)以拖電方式詵取所有圖表(文件中所有圖
譜的四角會出現(xiàn)黑色方塊,表示被選擇上),接著從Plots菜單選擇
ChangeDataFiles,并在隨后出現(xiàn)之對話方框,選擇所在新目錄與欲分析檔案。點(diǎn)
擊OPEN??烧{(diào)整圈選區(qū)域,Markers界限,軟件會重新計(jì)算、統(tǒng)計(jì)報(bào)告。
13.常規(guī)使用之實(shí)驗(yàn)文件(內(nèi)含散點(diǎn)圖、圈選區(qū)格、四象限分界、以及統(tǒng)計(jì)報(bào)告),我們
建議您將它另存新檔File-SaveAs,以備后需,分析其它檔案便輕而易舉。
五、錯(cuò)誤信號、疑難排除
5.1儀器狀態(tài)(Status):
在CELLQuest菜單位于Cytometer菜單中。用來
口WWWWWStatus三三三三三"EW
在收取的任何時(shí)候查看流式細(xì)胞儀的運(yùn)行狀態(tài),以
TestPulses:
利解決儀器運(yùn)行中出現(xiàn)的問題。
Status:Standby
狀態(tài):顯示儀器運(yùn)行模式LaserPower:5.15
LaserCurrent:3.78an岷s
NotReady:激光器正在預(yù)熱、鞘液桶空、廢SampleVoltage:10.23
液桶滿。SheathFluid:OK
WasteTank:OK
Ready:樣本管放置在進(jìn)樣區(qū),且支撐臂位于
中位,樣本管加壓,儀器在RUN狀態(tài)。
Standby:儀器在Standby狀態(tài)、或儀器在Run狀態(tài)而無樣本管在進(jìn)樣區(qū)上、
或支撐架位于側(cè)位、或樣本管未完全加壓。Standby時(shí)儀器的雷射電
源降低。
5.2常見故障排除程序
5.2.1樣品試管上不去
>誤用不適合的試管。(請用BDFalcon352052)
>試管支持架需調(diào)整。旋轉(zhuǎn)調(diào)整試管支持架(順時(shí)鐘向卜、逆時(shí)鐘向上)。
>BalSeal磨損。(汰換Balseal)
5.2.2儀器處于NOTREADY狀況
檢查以下情況:
>鞘液筒中的鞘液是否用完。
>廢液筒中的廢液是否已裝滿.
>開機(jī)需要5分鐘時(shí)間預(yù)熱。
>鞘液筒的汶面檢測器連接是否松動、或未連接。
5.2.3儀器處于STANDBY狀況(儀器失壓)
如果儀器未加壓,上樣管放好后,雖然控制面板處于RUN模式,但儀器仍未能達(dá)到
READY狀況,此時(shí)儀器仍處于STANDBY狀況。這可能是由于鞘液筒蓋漏氣、壓力
閥未加壓,樣本管不能被加壓等原因造成的壓力問題。此時(shí),樣本不能良好地進(jìn)入
流動室,無法檢測,
此時(shí),檢查以下情況:
>壓力閥未加壓。
>鞘液筒是否漏氣(蓋緊鞘液筒蓋)。
>樣本管是否有破損。
>上樣針上的Balseal是否己磨損。
>鞘液筒上的藍(lán)色接頭是否連接好。
5.2.4儀器訊號噪聲過高
鞘液過濾器中有氣泡,儀器記錄了氣泡產(chǎn)生的信號,造成了噪聲數(shù)據(jù)的干擾。氣泡
還可以改變樣本流,造成檢測結(jié)果不理想;此時(shí),儀淵需要做PRIME,排除液路中
的氣泡干擾。如果鞘液筒吸干了,應(yīng)該重新裝滿鞘液,然后先取下樣品管進(jìn)行5-10
次PRIME,再換上3mldH2O上樣管HIRUN30分鐘,待鞘液流中的氣泡排除之后,
再進(jìn)行樣本測定。
5.2.5計(jì)算機(jī)屏幕上見不到細(xì)胞顯示
檢查以下情況:
>如果儀器一直處于STANDBY狀態(tài),則檢查SystemStatuso
>如果STATUS窗日顯示READY,則檢查樣本管中細(xì)胞濃度是否夠,上樣前
是否混勻了。
>檢查實(shí)驗(yàn)的Instrumentsettings是否正確。
>檢杳閾值是否設(shè)置過高,導(dǎo)致無法檢測目亦細(xì)胞群。
>檢查CELLQuest軟件Cytometer目錄下的Status窗口,是否己被更新。如
果未更新,說明儀器與計(jì)算機(jī)之間的通訊發(fā)生了故障,此時(shí),應(yīng)關(guān)閉計(jì)算機(jī)
和FACSCalibur,重新打開儀器,繼續(xù)實(shí)驗(yàn)。
>PRIME儀器液流,去除流動室中可能存在的氣泡。若流動室中存在氣泡,可
能使樣本流的位置偏離激光束,導(dǎo)致無細(xì)胞信號。
5.2.6加樣針有鞘液反流
檢查以下情況:
>檢查上樣針外管是否安好,可以將外管旋下,向上推動,重新擰緊。
>更換上樣針上部的。型膠環(huán)。
>檢查液流保存系統(tǒng)的真空幫浦是否工作。如果樣本管支撐架位于旁位時(shí),聽
不到真空幫浦的工作聲音,可能是真空幫浦停了,關(guān)閉FACSCalibur,再啟
動:移開支撐架時(shí),如果馬達(dá)仍然不動,請致電BD客戶服務(wù)部門尋求存
助。
實(shí)驗(yàn)文件1:2ColorACQ
實(shí)驗(yàn)文件2:2ColorANA
表一、常用熒光染劑
測量參數(shù)熒光染劑吸光波長(nm)熒光波長(nm)
標(biāo)示抗體用染劑Fluorescein,FITC490520
Phycoerythrin-R,PE495578
Peridinin-490677
chlorophyll,PerCP
Cy-Chrome495670
PE-TexasRed495620
PE-Cyanine5495670
核酸含量分析EthidiumBromide510(+dsDNA)595
Propidiumlodide536(+dsDNA)623
AcridineOrange480(+DNA)520
440-70(+RNA)650
ThiazoleOrange509(+RNA)533
PyronineY560-562(+dsRNA)565-574
497(+ssRNA)563
細(xì)胞ViabilityPropidiumlodide536623
YOPRO-1480515
AcridineOrange480520
7-AAD
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