蛋白質(zhì)組學系列講座03蛋白質(zhì)組學案例分享

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知識金牌應用案例1解螺旋|陪伴

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Label-free

quantitative

proteomic

profiling

of

colon

cancer

cells

identifies

acetyl-CoAcarboxylase

alpha

as

antitumor

target

of

Citrus

limon-derivednanovesicles應用非標記定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)在結(jié)腸癌細胞系中研究發(fā)現(xiàn)乙酰輔酶A羧化酶a是檸檬中提取的納米囊泡的抗腫瘤靶點實驗樣本：人結(jié)腸癌細胞系主要技術(shù)：LFQ發(fā)表期刊：Journal

of

Proteomics影響因子：3.91知識金牌應用案例1定量蛋白:1738差異蛋白:24上調(diào)蛋白:8下調(diào)蛋白:16差異蛋白篩選標準：

Fold

change(FC)≥±2p-value<0.05Unique

peptides

≥

±

2應用DAVID數(shù)據(jù)庫對上調(diào)蛋白進行功能聚類；String數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn)上調(diào)蛋白PAK1和CDC37均參與細胞應激反應。應用DAVID數(shù)據(jù)庫對下調(diào)蛋白進行功能聚類；解螺旋|陪伴

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知識金牌應用案例1應用Reactome

數(shù)據(jù)庫對下調(diào)蛋白信號通路分析；發(fā)現(xiàn)其參與DHCR24、DDHD1、以及ACACA介導的脂代謝DDHD1、ACACAFC

=

?

23.87;

P

=

4.35E-07.腫瘤細胞特異性基質(zhì)細胞解螺旋|陪伴

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知識金牌應用案例1ACACA特異性誘導腫瘤細胞凋亡，抑制腫瘤細胞生長。ACACA通過抑制MAPK信號通路抑制細胞增長，并通過BAD因子促進細胞凋亡。解螺旋|陪伴

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知識金牌應用案例2解螺旋|陪伴

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Lysine

Malonylation

Is

Elevated

inType

2

Diabetic

Mouse

Models

and

Enriched

in

MetabolicAssociated

Proteins2型糖尿病小鼠模型中賴氨酸丙二?；缴险{(diào)，并且代謝相關(guān)蛋白表達量升高。實驗樣本：小鼠肝臟組織

主要技術(shù)：修飾蛋白質(zhì)組學發(fā)表期刊：Mol

Cell

Proteomics影響因子：6.54知識金牌應用案例2在WT

和db/db

鼠的肝臟組織中檢測賴氨酸的7種?；揎椩赪T、db/db

以及ob/ob

鼠的肝臟組織中檢測賴氨酸丙二?；疞C-MS/MS

鑒定蛋白賴氨酸丙二?；稽c解螺旋|陪伴

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應用案例2丙二?；鞍踪|(zhì)組學檢測定量蛋白：268個。丙二?；稽c：573個。應用String數(shù)據(jù)庫分析丙二?；鞍椎南嗷プ饔?。KEGG信號通路分析發(fā)現(xiàn)db/db鼠中參與糖和脂肪酸代謝的丙二?；鞍妆磉_量升高。知識金牌解

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