科研技能教程單元課03GraphPad Prism 7 作圖教程

GraphPad

Prism

7作圖教程科研技能 單元課

03針對特定科研技能的專項突破科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程主要功能與界面介紹單維度分組柱形/散點圖二維度分組柱形圖課程目錄143折線圖2解

螺

旋

|

陪

伴

醫(yī)

生

科

研

成

長生存曲線5科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程主要功能與界面介紹GraphPad

Prism主要功能數(shù)據(jù)表格界面與Excel相似，可以將數(shù)據(jù)錄入后保存一個GraphPad

Prism文件里可包含多個數(shù)據(jù)表和圖。即可以將同一文章或課題的數(shù)據(jù)歸在一個文件里，方便管理可作多種類型的數(shù)據(jù)圖，基本滿足科研需求線圖（XY）

?

單維度分組圖（Column）提供數(shù)據(jù)分析功能基本統(tǒng)計：均值、標(biāo)準(zhǔn)差、標(biāo)準(zhǔn)誤等基本分析：t檢驗、正態(tài)分布、線相關(guān)分析等二維度分組圖（Grouped）生存曲線（Survival）整體比例（Parts

of

whole）01拼課vx：pinkkke科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程1雙擊GraphPad

Prism圖標(biāo)，打開軟件.2彈出窗口中可選擇需要制作的圖表類型。主菜單欄快捷菜單欄查看使用說明（教程）本教程是基于GraphPad

Prism

7.0版本選擇圖的主要類型從已有數(shù)據(jù)/文件中打開示例數(shù)據(jù)?？捎糜诰毩?xí)顯示所選圖類型的數(shù)據(jù)和圖 樣式主要功能與界面介紹選擇待輸入數(shù)據(jù)的形式在線更新取消按鈕創(chuàng)建按鈕02拼課vx：pinkkke科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程主要功能與界面介紹單維度分組柱形/散點圖生存曲線二維度分組柱形圖課程目錄1435折線圖2解

螺

旋

|

陪

伴

醫(yī)

生

科

研

成

長科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程折線圖示例：文獻(xiàn)：PMID:26565812；Fig

3C示例解讀：4個組別，分別是MGC-803對照、MGC-803CISD2過表達(dá)、SGC-7901對照、SGC-7901過表達(dá)；每個組別檢測了0、1、2、3、4、5天的數(shù)據(jù)，每個數(shù)據(jù)有3個重復(fù)。模擬數(shù)據(jù)03科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程①選擇“XY”類型②選擇數(shù)據(jù)輸入形式：X：X軸數(shù)據(jù)形式選擇numbersY：Y軸數(shù)據(jù)形式選擇輸入重復(fù)數(shù)據(jù)，示例數(shù)據(jù)中是3個重復(fù)， 這里填上重復(fù)數(shù)“3”③點擊“Creat”按鈕，創(chuàng)建數(shù)據(jù)表1在開始頁面中選擇作圖類型。①②數(shù)字?jǐn)?shù)字和誤差值日期時間（hh:mm:ss）單值，無重復(fù)有重復(fù)，需輸入重復(fù)個數(shù)已統(tǒng)計好的值和誤差相關(guān)性線性回歸—斜率比較非線性回歸，單相指數(shù)衰減劑量反應(yīng)—X軸取劑量的對數(shù)值計算標(biāo)準(zhǔn)曲線范圍內(nèi)的未知值X列輸入的數(shù)據(jù)可識別為日期X列輸入的數(shù)據(jù)可識別為時間其他實例數(shù)據(jù)，下拉列表選擇③⑴均值，標(biāo)準(zhǔn)差，重復(fù)個數(shù)⑵均值，標(biāo)準(zhǔn)誤，重復(fù)個數(shù)⑶均值，%變異系數(shù)，重復(fù)個數(shù)⑷均值，標(biāo)準(zhǔn)差⑸均值，標(biāo)準(zhǔn)誤，⑹均值，%變異系數(shù)⑺均值（或中位數(shù)），+/-誤差⑻均值（或中位數(shù)），上/下限⑴⑵⑶⑷⑸⑹⑺⑻SD：Standard

Deviation，標(biāo)準(zhǔn)差。SEM：Standard

Error

of

Mean，樣 本平均數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差。CV：變異系數(shù)，相當(dāng)于SD/Mean。 如果輸入此項，prism會自動生成SD 誤差棒。XY圖上，每一點都是由一個X值和一個Y值定義的折線圖04科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程第②步選擇不同的數(shù)據(jù)輸入方式，建立的數(shù)據(jù)表格式也會不一 樣。如Y的3種方式，數(shù)據(jù)表格式如下：⑴X軸數(shù)據(jù)區(qū)Y軸數(shù)據(jù)區(qū)Y軸，每組僅有1列空格…Y軸，每組有3列空格，表 示3個重復(fù)Y軸，每組有3列空格，分 別用于填寫均值、SD值、 重復(fù)個數(shù)N⑵⑶折線圖05科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程數(shù)據(jù)表和作圖界面本工作簿里有效工作表 列表，可建立多個數(shù)據(jù) 表數(shù)據(jù)表數(shù)據(jù)表信息分析結(jié)果表圖排版布局左方導(dǎo)航欄可連接至不同的表格，點擊加 粗的“表格名稱”，可訪問對應(yīng)的表格。隱藏或顯示側(cè)方導(dǎo)航欄整體瀏覽所有圖/表下方導(dǎo)航欄上一或下一表格點擊可在當(dāng)前類型的不同表格里切換在當(dāng)前和上一操作頁面間切換顯示有連接關(guān)系的表格，如數(shù)據(jù) 表和對應(yīng)的圖標(biāo)數(shù)據(jù)表，對應(yīng)左方導(dǎo)航欄的“Data Tables”下的被選中表格信息表，對應(yīng)左方導(dǎo)航欄的“Info” 下被選中的表格分析結(jié)果，對應(yīng)左方導(dǎo)航欄的

“Results”下被選中的表格圖表，對應(yīng)左方導(dǎo)航欄的“Graphs” 下被選中的表格組圖表，對應(yīng)左方導(dǎo)航欄的

“Layouts”下被選中的表格當(dāng)前鼠標(biāo)指針的坐標(biāo)放大/縮小視圖選中表格，右鍵，可修改表格名稱， 方便區(qū)分不同的表格折線圖06例如：科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程2輸入數(shù)據(jù)。X軸名稱Y軸各組名稱X軸數(shù)據(jù)Y軸各組數(shù)據(jù)折線圖以1

中第②步選擇第⑵種方案為例，其他兩種操作大同小異，請學(xué)員們自己練習(xí)。07科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程折線圖3

點擊左方導(dǎo)航欄“Graphs”里跟數(shù)據(jù)表格同名稱的表格，如數(shù)據(jù)表是“MTT”，則這里點擊“MTT”；在彈出窗口中選擇圖的樣式，點擊“OK”。可以修改圖的大類作圖預(yù)覽可以修改統(tǒng)計方式95%

CI：95%置信區(qū)間range：范圍，即最大值-最小值。geometric

mean：幾何平均數(shù)。Median：中位數(shù)這兩種圖的區(qū)別在于，前者是用3次重復(fù)的均值作圖， 后者是3次重復(fù)的每次重復(fù)都作圖，因此有3條線。08科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程圖例位置修改。X軸標(biāo)題默認(rèn)為數(shù)據(jù)表里已填寫的X軸title， 也可以鼠標(biāo)點擊一下，另行修改生成的圖，標(biāo)題默認(rèn)為數(shù)據(jù)表格的“名稱”。數(shù)據(jù)表名稱和與之相連各表的名稱以及圖表的標(biāo)題是動態(tài)相連的，當(dāng)數(shù)據(jù)表名稱修改后，跟它相鏈接的圖表名稱和圖表標(biāo)題也會自動改名。如 Data

Tables里“Data

1”改名為“MTT”，與之相連的Graphs里的“Data

1”自動跟著改名為“MTT”，圖表標(biāo)題頁改為“MTT”。作圖的點是軟件自動計算出來的均值。默認(rèn)上下標(biāo)的方式，標(biāo)記了每個點誤差棒（±SD值）。4折線圖①選中圖例②將圖例移動至作圖區(qū)空白處，覺得鼠標(biāo)拖拽移動不到位，還可以用上下左右按鍵進(jìn)行微調(diào)09科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程輸入過的內(nèi)容如果是以前有輸入過，軟件會有記憶，再輸入 的時候會浮出記憶列表，方便直接選擇輸入標(biāo)題修改。①鼠標(biāo)點擊一下Y坐標(biāo)軸標(biāo)題，即可輸入或修改Y坐標(biāo)軸標(biāo)題。②鼠標(biāo)點擊一下圖表標(biāo)題，按delete刪掉5折線圖①②10科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程曲線格式修改（1）。雙擊作圖區(qū)（除圖例外的任意位置），在彈出窗口中進(jìn)行如下設(shè)置：①②③折線圖6如果雙擊某條曲線，則彈出的窗口里，“Data

set”里是這條曲線對應(yīng)的組別①下單菜單里選擇MGC-803-vector組②Shape改為黑色實心方形③改為1/2

pt，即線條粗細(xì)改細(xì)一點版本不同，默認(rèn)的設(shè)置可能會不一樣，按作圖設(shè)置一下即可11科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程曲線格式修改（2）。⑥⑦⑤④⑧折線圖7④下單菜單里選擇MGC-803-CISD2組⑤Shape改為空心方形⑥Color改為白色⑦Border

thickness改為1/2pt⑧Thickness改為1/2

pt⑨下單菜單里選擇SGC-7901-vector組⑩Thickness改為1/2

pt?Pattern改為虛線⑩⑾⑨12科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程⒂⒄⑿⒃⒁⒀⒅折線圖8

曲線格式修改（3）。?下單菜單里選擇SGC-7901-CISD2?Shape改為空心三角形?Color改為白色?Borderthickness改為1/2

pt?Thickness改為1/2

pt?Pattern改為虛線?點擊“OK”按鈕13科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程14坐標(biāo)軸修改（1）。雙擊X坐標(biāo)軸，在彈出窗口中進(jìn)行如下設(shè)置：①取消勾選②改為5.5③改為1各項設(shè)置的解釋請見下頁折線圖9⑧點擊OK④點擊Left

Yaxis⑤取消勾選⑥改為700⑦改為100科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程文字格式修改。①按住Ctrl+A，選中所有文字；或單擊需要修改的文字②在上方的Text工具盒里可以對文字的大小、字體、加粗、斜體等進(jìn)行設(shè)置選擇需要修改的文字在實際應(yīng)用時，圖的文字大小、字體等格式一般可以等組圖時再進(jìn)行統(tǒng)一的設(shè)置，大小折線圖10折線圖作圖完成選中所有文字15科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程坐標(biāo)軸獨立格式修改：雙擊坐標(biāo)軸，即會彈出坐標(biāo)軸屬性框，可對各項屬性修改。⑴⑵⑶⑷⑸⑹⑴橫向菜單欄，依次為整體、X軸、Y軸、右方（次要）Y軸、標(biāo)題與字體⑵自動決定坐標(biāo)軸范圍和刻度間隔，默認(rèn)勾選。如果需要修改坐標(biāo)軸范圍和刻度間隔，需要取消勾選此項⑶坐標(biāo)軸范圍，即坐標(biāo)軸起點值和終點值⑷刻度屬性設(shè)置，可分別對刻度的方向、標(biāo)簽位置和傾斜角度以及刻度的長度進(jìn)行設(shè)置⑸刻度間隔⑹可設(shè)置在特定的位置增加額外的刻度或在某刻度處畫水平線。如設(shè)置在Y=300的地方畫一水平線，標(biāo)簽顯示為“Tripling”：刻度方向刻度長度標(biāo)簽位置和傾斜角度數(shù)據(jù)顯示方式?小數(shù)位數(shù)主要刻度間隔刻度起始位置兩個主要刻度之間次要刻度點數(shù)前面是根據(jù)模仿示例的格式設(shè)置的演示。下面介紹一下剛剛這些屬性框，都可以進(jìn)行哪些方面的設(shè)置?？潭茸钚≈悼潭茸畲笾悼潭葮邮奖壤?，如可選擇轉(zhuǎn)化為對數(shù)刻度這個功能一般在熱圖或IC50檢測實驗里用的比較多折線圖1116科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程坐標(biāo)軸整體格式修改：點擊坐標(biāo)軸屬性框上方菜單欄中的第一個選項，可對坐標(biāo)軸的共同屬性進(jìn)行修改，完成設(shè)置后點擊“OK”。⑴XY軸相交的位置⑵圖的形狀，如橫向長方形（默認(rèn)），縱向長方形，正方形或自定義等（可通過在下方直接輸入坐標(biāo)軸的長度進(jìn)行設(shè)置）以及圖形在頁面中的位置⑶坐標(biāo)軸的線條粗細(xì)、顏色以及作圖區(qū)顏色、頁面背景顏色設(shè)置⑷邊框設(shè)置：默認(rèn)無邊框；坐標(biāo)軸是否隱藏；大小網(wǎng)格設(shè)置⑴⑵⑶⑷圖的位置設(shè)置在距離頁面左邊緣6.08cm處圖的位置設(shè)置在距離頁面底部邊緣11.85cm處軟件的界面比較友好，各選項下拉菜單很容易理解,因為內(nèi)容太多，本教程無法一一細(xì)說 ，大家可自行在軟件上試試折線圖1217科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程13標(biāo)題與字體格式修改：點擊上方菜單欄中的“Titles&Fonts”選項，可對坐標(biāo)軸的標(biāo)題和字體等格式進(jìn)行修改，完成設(shè)置后點擊“OK”⑴標(biāo)題格式設(shè)置Show

Graph

Title:是否顯示標(biāo)題Font…：字體格式設(shè)置，也可以從頂部快捷方式設(shè)置Distance

from

top

of

graph:標(biāo)題的位置距離圖的頂部的距離⑵圖坐標(biāo)軸標(biāo)題設(shè)置Direction：Y坐標(biāo)軸標(biāo)題的方向設(shè)置⑶坐標(biāo)軸標(biāo)簽字體和位置的設(shè)置⑴⑵⑶折線圖18科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程14作圖區(qū)的修改：雙擊作圖區(qū)，彈出屬性窗口，完成設(shè)置后點擊“OK”⑴⑵⑶⑷⑸⑹⑺⑻⑼⑴橫向菜單欄，這里只介紹第一個“Appearance”，其余兩項很少用到⑵選擇需要設(shè)置的組別⑶數(shù)據(jù)作圖數(shù)據(jù)選擇。我們前面選擇了均值和SD，這里可以切換成其他⑷數(shù)據(jù)標(biāo)志顏色、形狀、大小等設(shè)置⑸設(shè)置是否顯示數(shù)據(jù)點的垂直線，一般不顯示⑹設(shè)置是否顯示error

bars，即±SD以及其顏色，線條粗細(xì)，線條類型等⑺是否顯示連線(數(shù)據(jù)點之間的連線)⑻是否顯示線下填充⑼其他設(shè)置:可設(shè)置數(shù)據(jù)線的樣式需要設(shè)置哪一項，勾選前面的復(fù)選框，然后再進(jìn)行該項設(shè)置折線圖19科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程主要功能與界面介紹單維度分組柱形/散點圖生存曲線二維度分組柱形圖課程目錄1435折線圖2解

螺

旋

|

陪

伴

醫(yī)

生

科

研

成

長科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組柱形圖示例：文獻(xiàn)：PMID:26565812；Fig

1C單維度分組柱形圖適合于比較簡單分組的數(shù)據(jù)，各組間的變化或差異，每組可以有1到多個重復(fù)只有Y軸方向上有數(shù)據(jù)，X軸方向沒有；或相反示例解讀：qPCR檢測了6株細(xì)胞里CISD2的mRNA水平模擬數(shù)據(jù)20科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程1選擇“File”→“New”→“New

Data

Table

and

Graph…”，新建一個數(shù)據(jù)表Prism里可以建立多個表格，方便把同一個項目里的不同實驗數(shù)據(jù)放在一起管理“New

Project

File”是新建一個prism文件單維度分組柱形圖21科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程2在彈出窗口中進(jìn)行如下設(shè)置：單維度分組柱形圖①選擇“Column”類型。②選擇重復(fù)數(shù)據(jù)項③點擊“Create”，創(chuàng)建表格只能選擇一種類型①②③同一列的數(shù)據(jù)為重復(fù)值（即獨立重復(fù)）組別間為配對或有關(guān)聯(lián)的（如不同時間點等）已統(tǒng)計好的值和誤差以列變量做頻數(shù)分析或柱狀圖非配對t檢驗配對t檢驗單樣本t檢驗單因素方差分析重復(fù)測量單因素方差分析感受性曲線22科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程3輸入數(shù)據(jù)5彈出窗口，默認(rèn)設(shè)置即可，點擊“OK”單維度分組柱形圖可以看到，新建的表格里，沒有“X軸”的數(shù)據(jù)，全是Y軸可以給表格重新命名4點擊Graphs目錄下對應(yīng)的圖表23科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程6點擊Y坐標(biāo)軸標(biāo)題，輸入標(biāo)題單維度分組柱形圖7點擊圖標(biāo)標(biāo)題，按delete鍵刪除；點擊X

Title，按delete鍵刪除其實到這一步圖就可以用了，下面再根據(jù)示例的格式做一些個性化偏好設(shè)置。24科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組柱形圖8

在作圖區(qū)雙擊鼠標(biāo)，彈出的屬性框里選擇全部組別，進(jìn)行統(tǒng)一格式設(shè)置①“Data

set”里選擇“Change

ALLdatasets”②Fill選擇黑色③Bordercolor，邊框顏色，選擇黑色④誤差棒的線條粗細(xì)，選1

ptBorder，邊框線條粗細(xì)，這里不用設(shè)置，因為我們選擇了填充黑色，因此框線看不到Fill

pattern勾選的話可以在Desigh里選擇花式填充的樣式①②③④25科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組柱形圖9點擊“Graph

Settings”，可對柱子間距進(jìn)行調(diào)整柱子間距，改為100%第一根前/最后一根后柱子的空隙 長度調(diào)整后，柱子的粗細(xì)和間隔都會有所變化26科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程調(diào)整柱子的寬度單維度分組柱形圖①②①單擊X坐標(biāo)軸線②鼠標(biāo)放在X坐標(biāo)軸線末端，待鼠標(biāo)變成雙向箭頭狀時，可通過左右拉動軸線，調(diào)節(jié)X軸線的長度1027科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組柱形圖11雙擊Y坐標(biāo)軸，在彈出的屬性框里設(shè)置Y坐標(biāo)軸刻度的方向默認(rèn)是在左邊，示例里是在右邊。再“All

ticks”的“Ticks

direction”里選擇“right”，即可把刻度設(shè)置在Y軸線的右邊改為Right28科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組柱形圖12點擊“Titles&Fonts”，在“Axes→titlesNumbering

andlabeling”里設(shè)置Y坐標(biāo)軸標(biāo)題和標(biāo)簽距離坐標(biāo)軸線的距離，點擊“OK”。調(diào)節(jié)Y軸標(biāo)題離軸線的距離改成1調(diào)節(jié)Y軸標(biāo)簽離軸線的距離默認(rèn)是0。改成0.15柱形圖作圖完成29科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程13不連續(xù)坐標(biāo)軸的設(shè)置和應(yīng)用。當(dāng)數(shù)據(jù)中有值相差比較大的時，需要設(shè)置不連續(xù)坐標(biāo)軸，以清楚顯示各部分的數(shù)據(jù)情況。假設(shè)本例中的數(shù)據(jù)變?yōu)椋簡尉S度分組柱形圖有2組數(shù)據(jù)與其他組數(shù)據(jù)大小差距太大，導(dǎo)致值比較小組別 的柱子可能看不清楚這種情況，可以通過將Y坐標(biāo)軸設(shè)置為不連續(xù)坐標(biāo)軸，分別顯示大小兩類數(shù)據(jù)30科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程14不連續(xù)坐標(biāo)軸的設(shè)置步驟。單維度分組柱形圖雙擊Y坐標(biāo)軸，彈出窗口里，進(jìn)行如下設(shè)置：設(shè)置下半坐標(biāo)軸范圍設(shè)置上半坐標(biāo)軸范圍選擇二段（有需要時可選擇三段，中間雙豎線可以選垂直或傾斜）31科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組散點圖示例：文獻(xiàn)：PMID:26565812；Fig

1A單維度分組散點圖適合于簡單分組的數(shù)據(jù)，即數(shù)據(jù)組僅由一個方案定義，在數(shù)據(jù)表 中每一列定義一個數(shù)據(jù)組，在行向量上沒有分組；每組可以有多個相互間是獨立或 非獨立的數(shù)據(jù)，作圖時用點來顯示每個數(shù)據(jù)的位置；可直觀的看到每組數(shù)據(jù)的分布 情況和統(tǒng)計情況示例解讀：CISD2在37例癌旁組織和409例腫瘤組織中的表達(dá)差異模擬數(shù)據(jù)32科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程1選擇“File”→“New”→“New

Data

Table

andGraph…”，新建一個數(shù)據(jù)表。單維度分組散點圖2彈出的窗口里選擇作圖類型。可以根據(jù)需要給表格重新命名①選擇“Column”類型②選擇輸入的數(shù)據(jù)類型為獨立重復(fù)類型③點擊“Create”，完成表格創(chuàng)建①②③33科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組散點圖3在表格里輸入數(shù)據(jù)后，點擊下方導(dǎo)航欄中的Graph視圖按鈕，選擇散點圖，點擊“OK”。34科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組散點圖4刪除標(biāo)題、x坐標(biāo)軸標(biāo)題；將Y坐標(biāo)軸標(biāo)題改為“Expression

of

CISD2

in

TCGA

sets”。坐標(biāo)軸標(biāo)題比較長時，可以用回車鍵換行35科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組散點圖5雙擊作圖區(qū)任意空白位置，在彈出屬性框中對散點圖進(jìn)行格式設(shè)置。①下單菜單里選擇Adjacent組②顏色選擇深藍(lán)色③Size改為2號大?、芟聠尾藛卫镞x擇Tumor組⑤Shape改選擇成實心圓形；Size改為2號大?、揞伾x擇紅色⑦點擊OK當(dāng)Symbols的Color修改后，Error

bars的顏色自動變?yōu)橄嗤念伾纠杏捎跀?shù)據(jù)比較多（腫瘤組織組別有407個），因此數(shù)據(jù)點的size設(shè)置更小（1號）②③④⑤⑥⑦①36科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程單維度分組散點圖6雙擊X坐標(biāo)軸，在彈出屬性框中將標(biāo)簽的傾斜度改為水平，點擊“OK”。散點圖完成37科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程主要功能與界面介紹單維度分組柱形/散點圖生存曲線二維度分組柱形圖課程目錄1435折線圖2解

螺

旋

|

陪

伴

醫(yī)

生

科

研

成

長科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程二維度分組柱狀圖示例：文獻(xiàn)：PMID:26565812；Fig

3D模擬數(shù)據(jù)二維度分組二維度分組散點圖適合于二重分組的數(shù)據(jù)，即數(shù)據(jù)分組具有雙向變量，每一列定義 一個組別，每一行也定義一個組別示例解讀：兩個細(xì)胞株里，過表達(dá)CISD2前后，細(xì)胞克隆形成能力的變化簡單分組38科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程1新建一個數(shù)據(jù)表，選擇“Grouped”類型，數(shù)據(jù)3次重復(fù)，點擊Create建立數(shù)據(jù)表。二維度分組柱狀圖數(shù)據(jù)為單個重復(fù)數(shù)據(jù)為多個重復(fù)已統(tǒng)計好的值和誤差39科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程2在表格里輸入數(shù)據(jù)后，點擊Graph視圖。二維度分組柱狀圖3彈出窗口里確認(rèn)選擇了第一個樣式（“交錯并聯(lián)”式），點擊“OK”。可以根據(jù)需要給表格重新命名數(shù)據(jù)點作圖柱狀圖熱圖三相圖40科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程輸入Y坐標(biāo)軸，刪除圖的標(biāo)題和X坐標(biāo)軸標(biāo)題；將圖例移動至作圖區(qū)上方，圖例字體加粗。4二維度分組柱狀圖②③④①單擊Y坐標(biāo)軸標(biāo)題輸入“Colony

number”②分別單擊或選中圖表標(biāo)題“Colony”和“XTile”，按delete鍵刪除這兩個標(biāo)題③選中兩個圖例，點擊頂部“Text”工具框里的加粗按鈕，將字體設(shè)置為粗體④分別選中兩個圖例，將其移動至作圖區(qū)上方⑤雙擊X坐標(biāo)軸，在彈出窗口中設(shè)置X軸標(biāo)簽為水平放置①②基本完成，下面按照示例的格式進(jìn)行個性化設(shè)置（這些設(shè)置可設(shè)可不設(shè)）⑤41科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程5雙擊作圖區(qū)任意空白處，在彈出屬性框里對各組數(shù)據(jù)的圖形格式進(jìn)行設(shè)置二維度分組柱狀圖①Data

set下單菜單里選擇Vector組②Fill改為白色③Pattern改為純色填充，Border改為1/2pt④Thickness改為1/2

pt⑤Data

set下單菜單里選擇CISD2組⑥Fill改為黑色⑦Border選擇1/2

pt（當(dāng)Fill選擇純黑色時，這里Pattern可以不改）⑧Thickness改為1/2

pt⑨點擊“OK”②③④①⑤⑥⑦⑧⑨42科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程6二維度分組柱狀圖設(shè)置柱子的粗細(xì)鼠標(biāo)單擊X坐標(biāo)軸，指針移動到末端，待指針變 成雙向箭頭時，拖動鼠標(biāo)，將X坐標(biāo)軸縮短一點43科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程7二維度分組柱狀圖設(shè)置柱子之間的間距，雙擊作圖區(qū)調(diào)出屬性窗口：①點擊圖形設(shè)置選項②設(shè)置組內(nèi)柱子間距為柱子寬度的100%，組間距離為300%③點擊“OK”②橫向（水平）③設(shè)置基線位于Y軸某個值的位置隱藏基線（本例中沒有設(shè)置基線，因此這里是否勾選不會有差別）設(shè)選擇子縱向或橫向縱向

?基線設(shè)置自動①出現(xiàn)空白值時處理方式組內(nèi)柱子間距，如本例中這里的組內(nèi)是指MGC-803的vecto組和CISD2組組間距離，即本例中MGC-803與SGC-7901的間距第一根柱子前留距最后一根柱子前留距圖例形狀矩形正方形44科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程8雙擊Y坐標(biāo)軸，在屬性框里設(shè)置刻度方向向右，點擊“OK”二維度分組柱狀圖二維度分組柱狀圖完成45科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程二維度分組柱狀圖疊加柱狀圖的制作方法1：在

3

選擇亞類時，選擇疊加柱狀圖即可方法2：在作圖的任意階段，可點擊頂部菜單欄中的的快捷鍵，改變圖形的亞類（彈出的窗口跟3

是一樣的）46科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程主要功能與界面介紹單維度分組柱形/散點圖生存曲線圖二維度分組柱形圖課程目錄1435折線圖2解

螺

旋

|

陪

伴

醫(yī)

生

科

研

成

長科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程示例：文獻(xiàn)：PMID:26565812；Fig

2D模擬數(shù)據(jù)生存曲線對于生存曲線，隨訪時間、在隨訪時間上的生存狀態(tài)以及影響因子（如基因表達(dá)） 是必要因素生存曲線不僅可以用于生存率的比較，也可以用于其他結(jié)局事件是二分類變量的分 析，如是否復(fù)發(fā)，是否轉(zhuǎn)移等示例解讀：CISD2低表達(dá)和高表達(dá)患者生存率比較47科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程1

將表達(dá)數(shù)據(jù)按中位數(shù)區(qū)分高低表達(dá)：①用公式=MEDIAN(C2:C161)返回表達(dá)值的中位數(shù)。C2:C161即表達(dá)數(shù)據(jù)的范圍。返回結(jié)果是-0.237②用公式=IF(C2<$H$1,“Low”,“High”)對表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行高低分組。即當(dāng)C2<H1單元格返回的中位數(shù)時，返回Low，否則，則返回High。這里H1單元格用了絕對引用，所謂絕對引用即當(dāng)公式填充到其他單元格時，所引用的H1單元格不會發(fā)生變動。絕對引用的方法是在單元格的行號和/或列符前加上美元符號“$”。往下填充公式即可。PS：也有用平均值區(qū)分的，中位數(shù)用的比較多。還有一種做法是按表達(dá)高低，選高表達(dá)的1/3（或1/4）數(shù)據(jù)視為高表達(dá)，低表達(dá)的1/3（或1/4）數(shù)據(jù)視為低表達(dá)，中間的

1/3（1/2）數(shù)據(jù)不作圖。生存曲線2將生存狀態(tài)轉(zhuǎn)化為可讀數(shù)據(jù)0和1③可以用if函數(shù)公式：=IF(D2=“Alive”,0,1)。判斷D2單元格的值為

“Alive”時，返回0，否則返回1Alive為0，Dead為1也可用excel的列篩選功能，選擇Alive的數(shù)據(jù)，在新列“生存status”中，填充0，在Dead對應(yīng)的行中，填充1①②③①②48科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程3① 在excel中，用篩選功能篩選low的數(shù)據(jù)②

將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存時間Overall

Survival

Follow

upTime(Months)復(fù)制到GraphPadPrism中的X列；將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存狀態(tài)（0和1數(shù)據(jù)）復(fù)制到GraphPad

Prism中的A列；③

X列標(biāo)題標(biāo)記為Survival

time(months)；A列標(biāo)記為Lowexpression

of

CISD2；B列標(biāo)記為High

expression

ofCISD2④ 在excel中，用篩選功能篩選High的數(shù)據(jù)⑤

將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存時間Overall

Survival

FollowupTime(Months)復(fù)制到GraphPadPrism中的X列；將篩選出來的數(shù)據(jù)，生存狀態(tài)（0和1數(shù)據(jù)）復(fù)制到GraphPad

Prism中的B列生存曲線數(shù)據(jù)輸入③①②④49⑤科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程5坐標(biāo)軸修改生存曲線4點擊數(shù)據(jù)視圖，選擇生存曲線樣式，點擊“OK”以小數(shù)顯示以百分?jǐn)?shù)顯示誤差棒的格式圖例設(shè)置①②③⑤⑥① 雙擊X軸標(biāo)簽②

在彈出的屬性窗口中取消勾選“Automaticallydetermine

the

rangeand

interval”選項，設(shè)置X軸最大值為100（根據(jù)最大隨訪時間設(shè)置）③ 設(shè)置X坐標(biāo)軸刻度間隔值為20④ 點擊“Left

Y

axis”選項卡⑤ 設(shè)置Y坐標(biāo)軸最大值為1⑥ 設(shè)置Y坐標(biāo)軸刻度間隔為0.2，點擊“OK”按鈕④50科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程6坐標(biāo)軸修改生存曲線①②③⑤⑥④①

雙擊作圖區(qū)，在彈出窗口的“Appearance”選項卡中，選擇Low

expression組②

設(shè)置圖例顏色③

設(shè)置線條顏色④ 組別改選擇為High

expression組⑤

設(shè)置圖例顏色⑥

設(shè)置線條顏色，點擊下方“OK”按鈕51科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程生存曲線7文字修改③①②①

選中圖例，將圖例移動至作圖區(qū)的空白處② 點擊Y坐標(biāo)軸標(biāo)題，修改標(biāo)題內(nèi)容③

點擊圖標(biāo)標(biāo)題，修改圖標(biāo)標(biāo)題內(nèi)容④

按Ctrl+A鍵，選中全部，將字體統(tǒng)一為12號字體生存曲線作圖完成52科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程折線圖數(shù)據(jù)的變化趨勢比較柱狀圖單維和二維的數(shù)據(jù)差異比較生存曲線因素（如基因表達(dá)）與預(yù)后的關(guān)系小結(jié)：GraphPad

Prism可簡單便捷地實現(xiàn)科研數(shù)據(jù)處理和作圖課程彩蛋利用GraphPad

Prism

7制作熱圖通過高通量分析獲得的差異表達(dá)分子列表，熱圖是一種常見的文章數(shù)據(jù)展現(xiàn)形式千聊直播配套語音教學(xué)內(nèi)容作圖神器Prism的零基礎(chǔ)教學(xué)53科研技能單元課GraphPad

Prism

7作圖教程示例：文獻(xiàn)：PMID:26565812；Fig

1B模擬數(shù)據(jù)：20例配對的癌旁和腫瘤組織中某分子表達(dá)檢測值熱圖示例解讀：在16例配對的癌旁和腫瘤組織中，CISD2這個分子