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37Real-timefluorescencequantitativeRT-PCR/PCRdetectiontechniqueforfoot-and-mouthdiseasevirus,bovineviraldiarrheavirusandrhinotracheitisvirusinaerosoloflarge-scalecattlefarms2021-12-27發(fā)布I本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起1規(guī)模化牛場氣溶膠中口蹄疫病毒、牛病毒性腹瀉病毒和牛傳染性鼻氣管炎病毒實(shí)時熒光定量RT-PCR/PCR檢測技術(shù)規(guī)程GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格GB/T27401實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范動物4縮略語AGI:全玻璃液體沖擊式采樣器25.1除非另有說明,在檢測中使用的試劑均為分析純,水應(yīng)符合GB/T5.2體積比25:24的酚:氯仿溶液,應(yīng)2℃~8℃保存見A.1。5.3體積比24:1的氯仿:異戊醇溶液,應(yīng)2℃~8℃保存見A.2。5.7TE緩沖液,配制見A.6。錄B。6.4冰箱,2℃~8℃和-20℃兩種。應(yīng)用空氣微生物采樣箱,使用國際標(biāo)準(zhǔn)的AGI采集樣本。樣品采集后立即用1%甲醛溶液滅活處理。3所提取物為氣溶膠采集液,可能含有病毒。操作者必須帶口罩和一次性手套,RNA提取盡量在人少),可采用經(jīng)驗(yàn)證的病毒RNA提),13000r/min、15min,取上),可采用經(jīng)驗(yàn)證的病毒核酸提取試劑盒,按照試劑盒使用說明書提避免移液器取樣損失,建議按n+1個反應(yīng)配制,計算好各試劑的使用量,加入一適當(dāng)體積小管中,充分4在樣品處理區(qū)進(jìn)行。分別向上述PCR管中加入樣本核酸提取步驟中制備的RNA溶液5μL和9結(jié)果判定9.1結(jié)果分析條件的設(shè)定9.2質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)9.3結(jié)果判定檢測通道均無Ct值,且無特征性擴(kuò)增曲線,9.3.3可疑5溶液配制取Tris-飽和酚有機(jī)相(下層溶液)50mL和氯仿48mL混勻,2℃~8℃保存。取氯仿48mL和異戊醇2mL混勻,2℃~8℃保存。稱取6.055gTris置于100mL燒杯中,加A.40.5mol/LEDTA(pH加0.1%DEPC水定容至50mL,高壓滅菌后,降至室溫,4℃保存。A.72mol/LNaAc(PH5.6ATGACACAGGAAAACATTCCFermentasRevertAidTMFirstStrandcDNASynthesisKit說明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄cDNA。以cDNA為模板7/30sec,72℃/30sec,33個循環(huán);第三階段,72℃/5min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,回收目的取牛病毒性腹瀉病毒細(xì)胞培養(yǎng)物200μL,參照7.2.1提取病毒RNA,RNA按照FermentasReverFirstStrandcDNASynthesisKit說明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄cDNA。以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)液見序結(jié)果BLAST比對同B.3,正確的重組質(zhì)粒命名為pEAST-T3-BVDV,作為檢測牛病毒性腹瀉病毒的陽性質(zhì)B.5牛傳染性鼻氣管炎病毒陽性質(zhì)粒標(biāo)取牛傳染性鼻氣管炎病毒的細(xì)胞培養(yǎng)物200μL,參照7.2.2提取病毒DNA。以牛傳染性鼻氣管炎病載體克隆、重組質(zhì)粒篩選、DNA測序及測序結(jié)果BLAST比對同B.3,正確的重組質(zhì)粒為陽性,將其命名為pEAST-T3-IBRV,作為檢測牛傳染性鼻氣管炎病毒的陽性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)8空氣微生物采樣箱,Porton空氣微生物采樣器,三),設(shè)備安裝:首先安裝三腳架,空氣微生物采樣器放置高度為距地面1.5m,將30mL滅菌氣口上,另一端連接到Porton空氣微生物采樣器收集參數(shù):采用液體沖擊式采樣方式,采樣流量為12.5L/min,采樣時間為30min。樣品的滅活處理與分裝:氣溶膠采樣器采集結(jié)束后,直接將30mL樣本收集到50mL離心管內(nèi),采樣送往有條件的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行熒光定量PCR檢測,采集的兩份樣品,一份用于直接檢測,另一份-20℃保存氣溶膠現(xiàn)場采集完畢后,立
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