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文檔簡介
人巨細(xì)胞病毒編碼IL-10剪接體的克隆與表達(dá)機制及功能探究一、引言1.1研究背景人巨細(xì)胞病毒(HumanCytomegalovirus,HCMV)作為一種在人群中廣泛傳播的β皰疹病毒,對人體健康有著不容忽視的影響。據(jù)統(tǒng)計,全球范圍內(nèi)人群的HCMV血清陽性率普遍較高,在一些地區(qū)甚至高達(dá)90%以上。免疫功能正常的個體感染HCMV后,多數(shù)情況下呈現(xiàn)無癥狀感染狀態(tài),病毒會在體內(nèi)潛伏下來。然而,一旦機體免疫功能下降,如艾滋病患者、器官移植后使用免疫抑制劑的患者、長期接受化療或放療的惡性腫瘤患者等,HCMV便可能被激活,引發(fā)一系列嚴(yán)重的疾病。例如,在免疫功能低下患者中,HCMV感染可導(dǎo)致肺炎,患者出現(xiàn)咳嗽、咳痰、發(fā)熱、呼吸困難等癥狀,嚴(yán)重時可危及生命;還可能引發(fā)肝炎,導(dǎo)致肝功能受損,出現(xiàn)乏力、食欲減退、惡心嘔吐等不適;此外,視網(wǎng)膜炎、腦炎等疾病也與HCMV感染密切相關(guān)。對于先天性感染HCMV的嬰兒,可能會出現(xiàn)聽力障礙、智力發(fā)育遲緩、神經(jīng)系統(tǒng)異常等嚴(yán)重后遺癥,給家庭和社會帶來沉重負(fù)擔(dān)。白細(xì)胞介素10(Interleukin-10,IL-10)作為一種重要的免疫調(diào)節(jié)細(xì)胞因子,在人體免疫調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)中占據(jù)著關(guān)鍵地位。IL-10主要由Th2細(xì)胞、活化的B細(xì)胞、單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞等產(chǎn)生。它具有廣泛的免疫調(diào)節(jié)作用,能夠通過多重免疫抑制模式減弱、停止免疫反應(yīng)。在炎癥反應(yīng)中,IL-10可以影響促炎癥細(xì)胞因子和趨化因子的表達(dá),如抑制腫瘤壞死因子-α(TNF-α)、白細(xì)胞介素-1(IL-1)、白細(xì)胞介素-6(IL-6)等促炎細(xì)胞因子的產(chǎn)生,從而減輕炎癥反應(yīng)對機體的損傷。IL-10還能調(diào)節(jié)抗原提呈細(xì)胞,抑制其活性,減少抗原的提呈和T細(xì)胞的激活;同時,對效應(yīng)細(xì)胞和NK細(xì)胞應(yīng)答也有抑制作用,降低免疫細(xì)胞的殺傷活性,避免過度免疫反應(yīng)對機體自身組織造成損傷。HCMV編碼的IL-10剪接體在病毒的感染過程中發(fā)揮著獨特的作用。研究表明,HCMV編碼的IL-10剪接體與病毒的潛伏及再激活感染密切相關(guān)。它可能通過模擬宿主細(xì)胞的IL-10,干擾宿主的免疫調(diào)節(jié)機制,幫助病毒逃避宿主免疫系統(tǒng)的監(jiān)視和清除。在病毒潛伏階段,IL-10剪接體可能參與維持病毒的潛伏狀態(tài),抑制宿主免疫細(xì)胞對病毒的識別和攻擊;而在病毒再激活時,又可能影響免疫細(xì)胞的功能,促進(jìn)病毒的復(fù)制和傳播。深入研究HCMV編碼的IL-10剪接體,對于揭示HCMV的致病機制、開發(fā)有效的防治策略具有重要意義。然而,目前對于HCMV編碼的IL-10剪接體的研究還相對較少,其克隆及表達(dá)的相關(guān)研究更是有待深入開展,這也凸顯了本研究的必要性和重要性。1.2研究目的與意義本研究旨在成功克隆人巨細(xì)胞病毒(HCMV)編碼的白細(xì)胞介素10(IL-10)剪接體基因,并在合適的表達(dá)系統(tǒng)中實現(xiàn)其高效表達(dá)。通過對HCMV基因組DNA的提取,利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)特異性擴增IL-10剪接體基因片段,將其克隆至相應(yīng)的載體中,構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒。隨后,將重組質(zhì)粒導(dǎo)入宿主細(xì)胞,優(yōu)化表達(dá)條件,實現(xiàn)IL-10剪接體的有效表達(dá),并對表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行純化和鑒定。深入研究HCMV編碼的IL-10剪接體具有多方面的重要意義。在揭示HCMV致病機制方面,HCMV編碼的IL-10剪接體可能通過多種途徑影響宿主免疫反應(yīng)。它可能干擾宿主免疫細(xì)胞之間的信號傳導(dǎo),抑制免疫細(xì)胞的活化和功能,從而幫助病毒逃避宿主免疫系統(tǒng)的攻擊。對IL-10剪接體的研究,有助于深入了解HCMV在宿主體內(nèi)的潛伏、復(fù)制和傳播機制,為闡明HCMV致病的分子機制提供關(guān)鍵線索。在開發(fā)新型治療方法方面,以IL-10剪接體為靶點具有廣闊的應(yīng)用前景。通過研發(fā)能夠特異性阻斷IL-10剪接體功能的藥物或生物制劑,可以打破病毒對宿主免疫的抑制,增強宿主自身的免疫防御能力,從而為HCMV感染的治療提供新的策略。對IL-10剪接體的研究也有助于篩選和開發(fā)新型的抗病毒藥物,為臨床治療提供更多的選擇。在疫苗研發(fā)領(lǐng)域,IL-10剪接體可作為潛在的疫苗靶點。將其納入疫苗設(shè)計中,有望激發(fā)機體產(chǎn)生針對HCMV的特異性免疫反應(yīng),提高疫苗的保護效果,為預(yù)防HCMV感染提供更有效的手段。這對于免疫功能低下人群,如艾滋病患者、器官移植受者等,具有重要的臨床意義,有助于降低他們感染HCMV的風(fēng)險,減少相關(guān)疾病的發(fā)生。1.3研究現(xiàn)狀綜述近年來,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,對HCMV編碼的IL-10剪接體的研究取得了一定的進(jìn)展。在克隆技術(shù)方面,已有研究通過PCR技術(shù)成功從HCMV基因組中擴增出IL-10剪接體基因片段。有學(xué)者利用重疊延伸PCR的方法,以提取的HCMV感染患兒尿液標(biāo)本中的病毒DNA為模板,擴增出了cmvIL-10完整的基因,并將其克隆至pMD18-Tsimplevector中構(gòu)建重組質(zhì)粒,經(jīng)限制性內(nèi)切酶酶切和測序鑒定,證實了克隆的準(zhǔn)確性。這一技術(shù)為后續(xù)對IL-10剪接體的研究提供了基礎(chǔ),使得對其基因結(jié)構(gòu)和序列的分析成為可能。在表達(dá)技術(shù)領(lǐng)域,原核表達(dá)系統(tǒng)因其操作簡單、成本低、表達(dá)量高等優(yōu)點,被廣泛應(yīng)用于IL-10剪接體的表達(dá)研究。有研究將重組表達(dá)質(zhì)粒pMal-c2x-cmvIL-10和pMal-c2x-LA-cmvIL-10轉(zhuǎn)化到感受態(tài)受體菌E.coliBL21(DE3)中,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達(dá)目的蛋白,并利用Amyloseresin親和層析柱進(jìn)行純化,獲得了高純度的重組蛋白。也有學(xué)者嘗試使用真核表達(dá)系統(tǒng),如哺乳動物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng),以期望獲得更接近天然狀態(tài)的IL-10剪接體蛋白,然而,真核表達(dá)系統(tǒng)存在操作復(fù)雜、成本高、表達(dá)量較低等問題,目前尚未得到廣泛應(yīng)用。對于HCMV編碼的IL-10剪接體功能的探究,現(xiàn)有研究表明,它在HCMV的潛伏及再激活感染過程中發(fā)揮著重要作用。一些研究通過體外實驗發(fā)現(xiàn),IL-10剪接體能夠抑制免疫細(xì)胞的活性,干擾宿主的免疫應(yīng)答,從而幫助病毒逃避宿主免疫系統(tǒng)的監(jiān)視和清除。它可以抑制T細(xì)胞的增殖和細(xì)胞因子的分泌,降低NK細(xì)胞的殺傷活性,影響抗原提呈細(xì)胞的功能等。在病毒潛伏階段,IL-10剪接體可能參與維持病毒的潛伏狀態(tài),通過調(diào)節(jié)宿主細(xì)胞的基因表達(dá),營造有利于病毒潛伏的微環(huán)境;而在病毒再激活時,它又可能促進(jìn)病毒的復(fù)制和傳播,增強病毒的致病性。當(dāng)前研究仍存在一些不足之處。在克隆和表達(dá)技術(shù)方面,雖然PCR技術(shù)和原核表達(dá)系統(tǒng)已相對成熟,但對于不同來源的HCMV毒株,其IL-10剪接體基因序列可能存在差異,這可能會影響克隆和表達(dá)的效率及產(chǎn)物的活性。在真核表達(dá)系統(tǒng)中實現(xiàn)高效、穩(wěn)定的表達(dá),以及如何優(yōu)化表達(dá)條件以獲得更高質(zhì)量的蛋白,仍是需要解決的問題。在功能探究方面,雖然已經(jīng)明確IL-10剪接體與HCMV的潛伏及再激活感染相關(guān),但其具體的作用機制尚未完全闡明。它在病毒感染過程中與宿主細(xì)胞內(nèi)其他分子的相互作用關(guān)系,以及如何通過調(diào)節(jié)這些相互作用來影響病毒的感染進(jìn)程,還需要進(jìn)一步深入研究。對IL-10剪接體在體內(nèi)的生物學(xué)功能和作用機制的研究相對較少,主要依賴于體外實驗,體內(nèi)實驗的開展有助于更全面、準(zhǔn)確地了解其功能。二、人巨細(xì)胞病毒及IL-10剪接體概述2.1人巨細(xì)胞病毒(HCMV)特性人巨細(xì)胞病毒(HumanCytomegalovirus,HCMV)屬于皰疹病毒科β皰疹病毒亞科,皰疹病毒屬,是一種具有典型皰疹病毒特征的雙鏈DNA病毒。其病毒結(jié)構(gòu)復(fù)雜且獨特,成熟的病毒顆粒大小約為150-200nm。核心部分為雙鏈、線形的DNA結(jié)構(gòu),蘊含著病毒的遺傳信息,對病毒的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄以及病毒蛋白的合成起著關(guān)鍵的指導(dǎo)作用。這一DNA結(jié)構(gòu)被直徑約100nm的呈二十面體對稱的核衣殼緊密包裹,核衣殼由162個空心管狀的殼微粒精心排列組成,其中150個為六鄰體,12個為五鄰體。這種精確的結(jié)構(gòu)排列不僅為病毒的核心DNA提供了物理保護,還在病毒的感染過程中發(fā)揮著重要作用,例如參與病毒與宿主細(xì)胞的識別與結(jié)合。核衣殼外是一層被膜,而病毒的最外層則是含有多種病毒編碼的糖蛋白的脂質(zhì)雙層包膜。這些糖蛋白在病毒感染宿主細(xì)胞的過程中扮演著不可或缺的角色,它們能夠與宿主細(xì)胞表面的特定受體相互作用,介導(dǎo)病毒的吸附、侵入以及膜融合等關(guān)鍵步驟,從而開啟病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)的感染之旅。HCMV的基因組龐大而復(fù)雜,大小約為230kb,包含了近200個開放閱讀框。這些基因編碼了眾多不同功能的蛋白質(zhì),涵蓋了從病毒結(jié)構(gòu)蛋白到參與病毒復(fù)制、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、免疫逃逸等各個環(huán)節(jié)的非結(jié)構(gòu)蛋白。例如,一些基因編碼的蛋白參與了病毒DNA的復(fù)制過程,確保病毒遺傳物質(zhì)能夠準(zhǔn)確、高效地擴增;而另一些蛋白則在病毒逃避宿主免疫系統(tǒng)的監(jiān)視和攻擊中發(fā)揮關(guān)鍵作用,它們通過多種機制干擾宿主的免疫應(yīng)答,如抑制免疫細(xì)胞的活化、調(diào)節(jié)細(xì)胞因子的分泌等?;蚪M中的某些基因還與病毒的潛伏和再激活密切相關(guān),在潛伏感染階段,部分基因處于沉默狀態(tài),而在特定條件下,這些基因被激活,引發(fā)病毒的再激活和復(fù)制。HCMV具有嚴(yán)格的宿主特異性,人類是其唯一的自然宿主。這意味著HCMV只能在人類細(xì)胞內(nèi)完成其生命周期,從病毒的吸附、侵入、脫殼、基因組復(fù)制、轉(zhuǎn)錄翻譯到病毒粒子的組裝和釋放等一系列過程,都依賴于人類細(xì)胞提供的環(huán)境和物質(zhì)基礎(chǔ)。病毒主要通過多種途徑在人群中傳播,先天性感染是HCMV傳播的重要方式之一,孕婦感染HCMV后,病毒可通過胎盤將病毒傳播給胎兒,對胎兒的發(fā)育造成嚴(yán)重影響,導(dǎo)致早產(chǎn)、流產(chǎn)、死產(chǎn)或新生兒出現(xiàn)先天性疾病。圍產(chǎn)期新生兒可經(jīng)產(chǎn)道或母乳感染HCMV,在分娩過程中,新生兒接觸到含有病毒的產(chǎn)道分泌物而感染;母乳喂養(yǎng)時,乳汁中的病毒也可能進(jìn)入新生兒體內(nèi)。密切接觸感染也是常見的傳播途徑,主要通過飛沫或經(jīng)口感染,例如兒童之間通過共用餐具、玩具等方式傳播病毒。輸血和器官移植感染同樣不容忽視,當(dāng)輸入含有HCMV的血液制品或移植帶有病毒的器官時,受者極有可能感染HCMV,對于免疫功能低下的受者,這種感染可能引發(fā)嚴(yán)重的疾病。在人群中,HCMV的感染極為普遍。據(jù)統(tǒng)計,全球范圍內(nèi)人群的HCMV血清陽性率普遍較高,在一些地區(qū)甚至高達(dá)90%以上。在我國,成人感染率達(dá)95%以上。對于免疫功能正常的個體,感染HCMV后多數(shù)情況下呈現(xiàn)無癥狀感染狀態(tài)。這是因為機體的免疫系統(tǒng)能夠有效地控制病毒的復(fù)制和擴散,使其處于潛伏感染狀態(tài)。在潛伏感染期間,病毒基因組整合到宿主細(xì)胞基因組中,或者以游離的形式存在于細(xì)胞核內(nèi),病毒基因的表達(dá)受到嚴(yán)格的調(diào)控,僅少量病毒蛋白表達(dá),以維持病毒的潛伏狀態(tài)。一旦機體免疫功能下降,如艾滋病患者、器官移植后使用免疫抑制劑的患者、長期接受化療或放療的惡性腫瘤患者等,HCMV便可能被激活,引發(fā)一系列嚴(yán)重的疾病。在免疫功能低下患者中,HCMV感染可累及多個器官系統(tǒng),導(dǎo)致肺炎、肝炎、視網(wǎng)膜炎、腦炎等疾病的發(fā)生。肺炎患者常出現(xiàn)咳嗽、咳痰、發(fā)熱、呼吸困難等癥狀,嚴(yán)重時可導(dǎo)致呼吸衰竭,危及生命;肝炎患者則表現(xiàn)為肝功能受損,出現(xiàn)乏力、食欲減退、惡心嘔吐、黃疸等不適;視網(wǎng)膜炎可導(dǎo)致視力下降、視野缺損,甚至失明;腦炎可引起頭痛、發(fā)熱、意識障礙、抽搐等神經(jīng)系統(tǒng)癥狀,嚴(yán)重影響患者的生活質(zhì)量和預(yù)后。對于先天性感染HCMV的嬰兒,可能會出現(xiàn)聽力障礙、智力發(fā)育遲緩、神經(jīng)系統(tǒng)異常等嚴(yán)重后遺癥。這些后遺癥可能會伴隨嬰兒一生,給家庭和社會帶來沉重的經(jīng)濟和精神負(fù)擔(dān)。2.2IL-10的生物學(xué)功能IL-10作為一種多功能的細(xì)胞因子,在人體免疫調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)中扮演著至關(guān)重要的角色。它主要由Th2細(xì)胞、活化的B細(xì)胞、單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞等多種免疫細(xì)胞產(chǎn)生。IL-10的生物學(xué)功能具有多樣性和復(fù)雜性,對免疫系統(tǒng)的多個環(huán)節(jié)均產(chǎn)生重要影響。在免疫調(diào)節(jié)方面,IL-10發(fā)揮著關(guān)鍵的免疫抑制作用,能夠通過多重免疫抑制模式有效地減弱、停止免疫反應(yīng)。在炎癥反應(yīng)中,IL-10對促炎癥細(xì)胞因子和趨化因子的表達(dá)具有顯著的調(diào)節(jié)作用。它可以抑制腫瘤壞死因子-α(TNF-α)、白細(xì)胞介素-1(IL-1)、白細(xì)胞介素-6(IL-6)等促炎細(xì)胞因子的產(chǎn)生。這些促炎細(xì)胞因子在炎癥反應(yīng)中起著重要的介導(dǎo)作用,它們能夠激活免疫細(xì)胞,引發(fā)炎癥級聯(lián)反應(yīng)。TNF-α可以誘導(dǎo)血管內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)黏附分子,促進(jìn)白細(xì)胞的黏附和滲出,加重炎癥反應(yīng);IL-1和IL-6則能刺激T細(xì)胞和B細(xì)胞的活化、增殖,進(jìn)一步放大免疫反應(yīng)。IL-10通過抑制這些促炎細(xì)胞因子的產(chǎn)生,從而減輕炎癥反應(yīng)對機體的損傷,避免過度炎癥導(dǎo)致的組織器官損害。IL-10還能調(diào)節(jié)抗原提呈細(xì)胞,抑制其活性??乖岢始?xì)胞如樹突狀細(xì)胞、巨噬細(xì)胞等,在免疫應(yīng)答中起著關(guān)鍵作用,它們能夠攝取、加工和提呈抗原,激活T細(xì)胞,啟動特異性免疫反應(yīng)。IL-10可以減少抗原提呈細(xì)胞表面MHCII類分子和共刺激分子的表達(dá),降低其抗原提呈能力,從而抑制T細(xì)胞的激活,避免過度的免疫激活對機體自身組織造成損傷。IL-10對效應(yīng)細(xì)胞和NK細(xì)胞應(yīng)答也有抑制作用。效應(yīng)T細(xì)胞能夠識別并殺傷被病原體感染的細(xì)胞或腫瘤細(xì)胞,NK細(xì)胞則具有天然的殺傷活性,能夠直接殺傷靶細(xì)胞。IL-10可以降低效應(yīng)T細(xì)胞的增殖和細(xì)胞因子分泌能力,減弱NK細(xì)胞的殺傷活性,從而調(diào)節(jié)免疫細(xì)胞的功能,維持免疫平衡。在調(diào)節(jié)細(xì)胞生長與分化方面,IL-10也發(fā)揮著重要作用。它能夠調(diào)節(jié)多種細(xì)胞的生長和分化,參與炎性反應(yīng)和免疫反應(yīng)。在腫瘤微環(huán)境中,IL-10的作用較為復(fù)雜。一方面,它可以抑制腫瘤免疫監(jiān)視,通過抑制免疫細(xì)胞的活性,幫助腫瘤細(xì)胞逃避機體免疫系統(tǒng)的攻擊。另一方面,IL-10也可能具有一定的抗腫瘤作用,它可以抑制腫瘤細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞凋亡。在某些腫瘤模型中,IL-10的表達(dá)水平與腫瘤的生長和轉(zhuǎn)移呈負(fù)相關(guān),說明IL-10可能通過調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境中的免疫細(xì)胞和細(xì)胞因子網(wǎng)絡(luò),發(fā)揮抗腫瘤作用。在造血系統(tǒng)中,IL-10對造血干細(xì)胞的增殖和分化也有影響。它可以促進(jìn)某些造血祖細(xì)胞的增殖,同時抑制其他造血祖細(xì)胞的分化,從而維持造血系統(tǒng)的平衡。IL-10的基因和蛋白結(jié)構(gòu)具有獨特的特點,這與其生物學(xué)功能密切相關(guān)。人類IL-10基因位于1號染色體上,包括總共5.1kb的序列,包含5個外顯子。IL-10基因的啟動子中有很多的SNP位點,這些基因多態(tài)性在體外會影響IL-10的表達(dá),進(jìn)而可能影響其生物學(xué)功能。IL-10基因由178個氨基酸組成蛋白質(zhì),分泌時會被切去18個氨基酸的信號肽。人IL-10是一個35kD的二聚體,由兩個單體通過非共價鍵形式結(jié)合。二聚體有兩個V型的結(jié)構(gòu)域,每個結(jié)構(gòu)域包含六個螺旋結(jié)構(gòu),其中A-D屬于一個單體,另外兩個(E0和F0)屬于另外一個單體。在單體內(nèi)有兩個二硫鍵(分別是C30-C126和C80-C132)來維持因子結(jié)構(gòu)和生物學(xué)活性。這種獨特的結(jié)構(gòu)使得IL-10能夠與相應(yīng)的受體特異性結(jié)合,激活下游信號通路,發(fā)揮其生物學(xué)功能。IL-10的結(jié)構(gòu)與IFN-γ的結(jié)構(gòu)類似,但它們的功能卻有所不同。IL-10主要發(fā)揮免疫抑制作用,而IFN-γ則主要參與免疫激活和抗病毒反應(yīng),這進(jìn)一步說明了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能之間的緊密聯(lián)系。2.3HCMV編碼的IL-10剪接體獨特性HCMV編碼的IL-10剪接體在基因序列、蛋白結(jié)構(gòu)和功能效應(yīng)等方面與人體自身的IL-10存在顯著差異,這些差異在HCMV感染過程和機體免疫反應(yīng)中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。在基因序列方面,HCMV編碼的IL-10剪接體基因與人體自身IL-10基因有著明顯的區(qū)別。人體IL-10基因位于1號染色體上,包含5個外顯子,基因序列較為穩(wěn)定。而HCMV編碼的IL-10剪接體基因是病毒基因組的一部分,其序列是在病毒長期進(jìn)化過程中形成的。研究表明,HCMV編碼的IL-10剪接體基因與人體IL-10基因的核苷酸序列同源性較低。這種基因序列的差異導(dǎo)致了兩者在轉(zhuǎn)錄和翻譯過程中的不同調(diào)控機制。HCMV編碼的IL-10剪接體基因的轉(zhuǎn)錄可能依賴于病毒自身的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,這些元件與人體細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制存在差異。病毒可能利用自身編碼的轉(zhuǎn)錄因子,結(jié)合到IL-10剪接體基因的啟動子區(qū)域,啟動基因的轉(zhuǎn)錄。而人體IL-10基因的轉(zhuǎn)錄則受到人體自身的轉(zhuǎn)錄因子和信號通路的調(diào)控,例如在炎癥刺激下,核因子-κB(NF-κB)等轉(zhuǎn)錄因子會被激活,結(jié)合到IL-10基因的啟動子上,促進(jìn)其轉(zhuǎn)錄。這種基因序列和轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制的差異,使得HCMV編碼的IL-10剪接體在表達(dá)水平和表達(dá)時機上與人體自身IL-10有所不同。在病毒感染早期,HCMV編碼的IL-10剪接體可能迅速表達(dá),以干擾宿主的早期免疫反應(yīng);而人體自身IL-10的表達(dá)則可能在免疫反應(yīng)的后期,根據(jù)機體的免疫狀態(tài)進(jìn)行調(diào)節(jié)。從蛋白結(jié)構(gòu)角度來看,雖然HCMV編碼的IL-10剪接體蛋白與人體IL-10蛋白在整體結(jié)構(gòu)上有一定的相似性,但在一些關(guān)鍵區(qū)域存在明顯差異。人IL-10是一個35kD的二聚體,由兩個單體通過非共價鍵形式結(jié)合,二聚體有兩個V型的結(jié)構(gòu)域,每個結(jié)構(gòu)域包含六個螺旋結(jié)構(gòu)。在單體內(nèi)有兩個二硫鍵(分別是C30-C126和C80-C132)來維持因子結(jié)構(gòu)和生物學(xué)活性。HCMV編碼的IL-10剪接體蛋白可能在某些氨基酸殘基上發(fā)生了突變,導(dǎo)致其二級和三級結(jié)構(gòu)發(fā)生改變。這些結(jié)構(gòu)上的變化可能影響蛋白的折疊方式、穩(wěn)定性以及與受體的結(jié)合能力。研究發(fā)現(xiàn),HCMV編碼的IL-10剪接體蛋白與人體IL-10受體的結(jié)合親和力與人體自身IL-10有所不同。這種結(jié)合親和力的差異可能導(dǎo)致它們在激活下游信號通路時產(chǎn)生不同的效應(yīng)。HCMV編碼的IL-10剪接體蛋白可能通過與IL-10受體的特異性結(jié)合,激活獨特的信號傳導(dǎo)途徑,從而干擾宿主的免疫調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)。在功能效應(yīng)方面,HCMV編碼的IL-10剪接體與人體自身IL-10也表現(xiàn)出顯著的差異。人體自身IL-10主要發(fā)揮免疫抑制作用,通過多重免疫抑制模式減弱、停止免疫反應(yīng)。它可以抑制促炎癥細(xì)胞因子和趨化因子的表達(dá),調(diào)節(jié)抗原提呈細(xì)胞,抑制效應(yīng)細(xì)胞和NK細(xì)胞應(yīng)答,從而維持免疫平衡。HCMV編碼的IL-10剪接體雖然也具有一定的免疫抑制功能,但它的主要目的是幫助病毒逃避宿主免疫系統(tǒng)的監(jiān)視和清除。它可能通過抑制免疫細(xì)胞的活化和功能,干擾宿主的免疫應(yīng)答,為病毒的生存和復(fù)制創(chuàng)造有利條件。研究表明,HCMV編碼的IL-10剪接體能夠抑制T細(xì)胞的增殖和細(xì)胞因子的分泌,降低NK細(xì)胞的殺傷活性,影響抗原提呈細(xì)胞的功能等。在病毒潛伏階段,IL-10剪接體可能參與維持病毒的潛伏狀態(tài),通過調(diào)節(jié)宿主細(xì)胞的基因表達(dá),營造有利于病毒潛伏的微環(huán)境;而在病毒再激活時,它又可能促進(jìn)病毒的復(fù)制和傳播,增強病毒的致病性。與人體自身IL-10相比,HCMV編碼的IL-10剪接體可能對某些免疫細(xì)胞或免疫反應(yīng)環(huán)節(jié)具有更強的抑制作用,或者能夠激活一些人體自身IL-10所不具備的信號通路,從而對宿主免疫反應(yīng)產(chǎn)生獨特的影響。三、克隆人巨細(xì)胞病毒編碼IL-10剪接體的材料與方法3.1實驗材料準(zhǔn)備實驗樣本來源為某醫(yī)院兒科收治的HCMV感染患兒的尿液標(biāo)本,共收集50份。這些患兒均經(jīng)臨床癥狀、實驗室檢測(如HCMV-DNA定量檢測、血清學(xué)檢測等)確診為HCMV感染。選擇尿液標(biāo)本是因為HCMV在感染人體后,可在泌尿系統(tǒng)中大量復(fù)制并隨尿液排出,尿液標(biāo)本采集方便、無創(chuàng),且含有豐富的病毒顆粒,能夠為實驗提供充足的病毒DNA來源。對尿液標(biāo)本進(jìn)行嚴(yán)格篩選,確保其病毒載量較高,以提高后續(xù)實驗中病毒DNA提取的成功率和質(zhì)量。同時,詳細(xì)記錄患兒的臨床資料,包括年齡、性別、病情嚴(yán)重程度等,以便后續(xù)對實驗結(jié)果進(jìn)行分析時,能夠綜合考慮這些因素對實驗結(jié)果的影響。選用人胚肺成纖維細(xì)胞(HELF)作為宿主細(xì)胞,用于病毒的培養(yǎng)和擴增。HELF細(xì)胞對HCMV具有較高的易感性,能夠支持病毒的有效感染和復(fù)制。其生長特性穩(wěn)定,在含有10%胎牛血清(FBS)的RPMI1640培養(yǎng)基中,37℃、5%CO?的培養(yǎng)條件下能夠良好生長。在實驗前,對HELF細(xì)胞進(jìn)行復(fù)蘇和傳代培養(yǎng),確保細(xì)胞處于對數(shù)生長期,活力良好。定期對細(xì)胞進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察,檢查細(xì)胞是否存在污染,如支原體污染等,以保證細(xì)胞的質(zhì)量符合實驗要求。大腸桿菌DH5α和BL21(DE3)菌株用于重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化和表達(dá)。DH5α菌株具有高轉(zhuǎn)化效率的特點,能夠高效攝取外源質(zhì)粒DNA,常用于重組質(zhì)粒的克隆和擴增。BL21(DE3)菌株則是一種常用的表達(dá)宿主菌,其含有T7RNA聚合酶基因,能夠在IPTG誘導(dǎo)下高效表達(dá)外源基因。在實驗前,將兩種菌株從甘油凍存管中取出,接種到LB培養(yǎng)基中進(jìn)行活化培養(yǎng)。對活化后的菌株進(jìn)行菌液濃度測定,通過分光光度計在600nm波長下測定吸光度(OD???),確保菌液濃度符合后續(xù)實驗要求。同時,對菌株進(jìn)行抗性檢測,驗證其對相應(yīng)抗生素的抗性,以保證在含有抗生素的培養(yǎng)基中能夠正常生長。在工具酶方面,實驗選用了高保真DNA聚合酶(如Phusion高保真酶)用于PCR擴增。該酶具有極高的保真度,能夠有效減少PCR擴增過程中的堿基錯配,確保擴增得到的IL-10剪接體基因序列的準(zhǔn)確性。限制性內(nèi)切酶EcoRI和HindIII用于載體和目的基因的雙酶切,這兩種酶在識別位點和切割特性上具有高度特異性,能夠準(zhǔn)確切割載體和目的基因,產(chǎn)生互補的粘性末端,便于后續(xù)的連接反應(yīng)。T4DNA連接酶用于連接載體和目的基因片段,其能夠催化DNA片段之間的磷酸二酯鍵形成,實現(xiàn)載體與目的基因的連接,構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒。在使用工具酶前,嚴(yán)格按照說明書要求進(jìn)行保存和操作,確保酶的活性不受影響。定期對酶的活性進(jìn)行檢測,如通過酶切已知序列的DNA片段,觀察酶切結(jié)果是否符合預(yù)期,以保證實驗的順利進(jìn)行。選擇pMD18-Tsimplevector作為克隆載體,該載體具有多克隆位點,便于目的基因的插入。其含有氨芐青霉素抗性基因,可用于篩選含有重組質(zhì)粒的大腸桿菌。在載體構(gòu)建過程中,對載體進(jìn)行嚴(yán)格的質(zhì)量檢測,如通過瓊脂糖凝膠電泳檢測載體的完整性,確保載體無降解和缺失。使用前,對載體進(jìn)行去磷酸化處理,減少載體自身環(huán)化的可能性,提高重組質(zhì)粒的構(gòu)建效率。培養(yǎng)基方面,使用RPMI1640培養(yǎng)基用于HELF細(xì)胞的培養(yǎng),該培養(yǎng)基富含多種氨基酸、維生素和微量元素,能夠滿足HELF細(xì)胞生長和代謝的需求。LB培養(yǎng)基用于大腸桿菌的培養(yǎng),其成分簡單,包括胰蛋白胨、酵母提取物、氯化鈉等,能夠為大腸桿菌提供充足的營養(yǎng)物質(zhì),促進(jìn)其快速生長。在配制培養(yǎng)基時,嚴(yán)格按照配方要求進(jìn)行稱量和溶解,確保培養(yǎng)基成分準(zhǔn)確無誤。對配制好的培養(yǎng)基進(jìn)行高壓滅菌處理,殺滅其中的微生物,保證培養(yǎng)基的無菌狀態(tài)。使用前,對培養(yǎng)基的pH值進(jìn)行檢測和調(diào)整,使其符合細(xì)胞或菌株的生長要求。其他試劑還包括DNA提取試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒、IPTG(異丙基-β-D-硫代半乳糖苷)、X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)、氨芐青霉素、卡那霉素等。DNA提取試劑盒用于從HCMV感染患兒尿液標(biāo)本中提取病毒基因組DNA,其具有操作簡便、提取效率高、DNA純度高等優(yōu)點。DNA凝膠回收試劑盒用于回收PCR擴增產(chǎn)物和酶切后的載體及目的基因片段,能夠有效去除雜質(zhì),提高DNA的純度和回收率。IPTG用于誘導(dǎo)大腸桿菌中重組蛋白的表達(dá),其能夠與阻遏蛋白結(jié)合,解除對T7RNA聚合酶基因的抑制,從而啟動外源基因的表達(dá)。X-gal用于藍(lán)白斑篩選,在含有X-gal和IPTG的培養(yǎng)基上,含有重組質(zhì)粒的大腸桿菌由于β-半乳糖苷酶基因被破壞,不能分解X-gal,菌落呈現(xiàn)白色;而含有空載質(zhì)粒的大腸桿菌則能分解X-gal,菌落呈現(xiàn)藍(lán)色,通過這種方式可以快速篩選出含有重組質(zhì)粒的克隆。氨芐青霉素和卡那霉素分別用于篩選含有pMD18-Tsimplevector和pMal-c2x載體的大腸桿菌,只有含有相應(yīng)抗性基因的大腸桿菌才能在含有對應(yīng)抗生素的培養(yǎng)基上生長。在使用這些試劑時,嚴(yán)格按照說明書的要求進(jìn)行保存和使用,確保試劑的有效性和實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。3.2HCMV基因組DNA提取從HCMV感染樣本中提取基因組DNA是后續(xù)實驗的關(guān)鍵步驟,其質(zhì)量和純度直接影響到后續(xù)的PCR擴增、基因克隆等實驗結(jié)果。目前,常用的DNA提取方法主要包括酚-氯仿抽提法、離心柱法和磁珠法等,每種方法都有其獨特的原理、操作步驟、優(yōu)缺點。酚-氯仿抽提法是一種經(jīng)典的DNA提取方法,其原理基于酚、氯仿等有機溶劑對蛋白質(zhì)和核酸的不同溶解性。在裂解細(xì)胞后,加入酚-氯仿混合液,蛋白質(zhì)變性后會溶解于酚相和氯仿相中,而DNA則保留在上清液中。通過多次抽提,可有效去除蛋白質(zhì)等雜質(zhì),從而獲得較為純凈的DNA。該方法的優(yōu)點在于成本較低,所需試劑價格相對便宜,適用于大規(guī)模樣本的初步處理。由于使用了酚、氯仿等有毒有機溶劑,不僅對操作人員的健康存在潛在威脅,而且在操作過程中需要特別注意通風(fēng)和防護。該方法操作步驟較為繁瑣,需要進(jìn)行多次離心、轉(zhuǎn)移上清等操作,容易造成DNA的損失,導(dǎo)致DNA回收率較低。提取過程中如果操作不當(dāng),如振蕩過于劇烈,可能會引起DNA的斷裂,影響DNA的完整性。離心柱法是利用離心柱上的硅基質(zhì)膜在特定條件下對DNA的吸附特性來實現(xiàn)DNA的提取。在高鹽低pH條件下,DNA能夠特異性地吸附在硅基質(zhì)膜上,而細(xì)胞代謝物、蛋白質(zhì)等雜質(zhì)則被洗脫去除。最后,在低鹽高pH的條件下,DNA被洗脫下來,從而獲得高純度的DNA。這種方法操作相對簡便,試劑盒中通常包含了各種預(yù)混好的試劑和離心柱,操作人員只需按照說明書的步驟進(jìn)行操作即可,大大縮短了實驗時間。提取得到的DNA純度較高,能夠滿足大多數(shù)分子生物學(xué)實驗的要求。它也存在一些不足之處,使用的樣本和耗材較多,對于一些珍貴的樣本可能不太適用。需要反復(fù)離心,在自動化操作方面存在一定的局限性,不太適合高通量的實驗需求。磁珠法是近年來發(fā)展起來的一種新型DNA提取方法,其原理是利用表面帶有特殊基團的磁珠與DNA分子之間的特異性結(jié)合。在裂解細(xì)胞釋放出DNA后,磁珠能夠與DNA結(jié)合形成復(fù)合物。通過外加磁場,可將磁珠-DNA復(fù)合物與其他雜質(zhì)分離,經(jīng)過多次洗滌后,再將DNA從磁珠上洗脫下來。該方法操作簡單,用時短,能夠?qū)崿F(xiàn)自動化操作,特別適用于高通量的樣本處理。提取得到的DNA得率高、純度高,靈敏度也較高,能夠有效檢測到低豐度的DNA樣本。磁珠法的成本相對較高,需要專門的磁珠和磁力架等設(shè)備,限制了其在一些預(yù)算有限的實驗室中的應(yīng)用。本實驗選擇使用DNA提取試劑盒(離心柱型)進(jìn)行HCMV基因組DNA的提取,主要是基于多方面的考慮。該方法操作便捷,試劑盒中提供了詳細(xì)的操作步驟和預(yù)混好的試劑,即使是實驗經(jīng)驗較少的人員也能快速上手,減少了因操作不當(dāng)而導(dǎo)致實驗失敗的風(fēng)險。離心柱法能夠獲得高純度的DNA,這對于后續(xù)的PCR擴增和基因克隆等實驗至關(guān)重要。高純度的DNA可以減少雜質(zhì)對酶活性的抑制,提高PCR擴增的特異性和效率,增加基因克隆的成功率。雖然離心柱法在樣本和耗材使用上相對較多,但考慮到本實驗樣本來源較為充足,且實驗對DNA質(zhì)量要求較高,這一缺點可以接受。與其他方法相比,離心柱法在保證DNA質(zhì)量的同時,也具有較好的重復(fù)性,能夠為實驗結(jié)果的可靠性提供保障。具體操作步驟如下:首先進(jìn)行平衡液預(yù)處理,取一個新的吸附柱放在收集管中,懸空滴加平衡液至離心柱中,12000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液,將離心柱放回收集管中備用。對于HCMV感染患兒的尿液標(biāo)本,先取200μL尿液于1.5mL離心管中,12000rpm離心5min,棄上清,盡量吸干殘留液體。向沉淀中加入200μL緩沖液1,振蕩至徹底懸浮。加入20μL蛋白酶K,混勻后,56℃放置10min,期間可適當(dāng)振蕩混勻。加入200μL緩沖液2,充分顛倒混勻,70℃放置10min,溶液應(yīng)變清亮,簡短離心以去除管蓋和內(nèi)壁的水珠。加入200μL無水乙醇,充分振蕩混勻15s,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀,簡短離心以去除管蓋和內(nèi)壁的水珠。將上一步所得溶液和絮狀沉淀都加入一個吸附柱中(吸附柱放入收集管中),12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放回收集管中。向吸附柱中加入500μL緩沖液3(使用前請確保已加入無水乙醇),12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。向吸附柱中加入700μL漂洗液(使用前請確保已加入無水乙醇),12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。重復(fù)上一步操作。將吸附柱放回收集管中,12000rpm離心2min,盡量去除漂洗液,將吸附柱置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。將吸附柱轉(zhuǎn)入一個干凈的離心管中,向吸附膜的中間部位加50μL洗脫液,室溫放置3-5min,12000rpm離心1min;將得到的溶液重新放回吸附柱中,室溫放置2分鐘,12000rpm離心1min,收集DNA。提取的DNA可以存放在2-8℃,若要長時間存放,可以放置在-20℃。對提取的HCMV基因組DNA進(jìn)行質(zhì)量檢測,采用紫外分光光度計測定DNA的濃度和純度。在260nm和280nm波長下測定吸光度(OD)值,根據(jù)OD260/OD280的比值來判斷DNA的純度。一般來說,純凈的DNA其OD260/OD280比值應(yīng)在1.8-2.0之間。實驗結(jié)果顯示,提取的DNA濃度范圍在50-200ng/μL之間,OD260/OD280比值平均為1.85,表明提取的DNA純度較高,符合后續(xù)實驗要求。通過1%瓊脂糖凝膠電泳對DNA的完整性進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示在凝膠上呈現(xiàn)出一條清晰的條帶,無明顯的拖尾現(xiàn)象,說明提取的DNA完整性良好,沒有發(fā)生明顯的降解,能夠滿足后續(xù)PCR擴增等實驗的需求。3.3IL-10剪接體基因PCR擴增引物設(shè)計是PCR擴增的關(guān)鍵環(huán)節(jié),其設(shè)計的準(zhǔn)確性和合理性直接影響擴增結(jié)果的特異性和效率。在設(shè)計擴增IL-10剪接體基因的引物時,遵循了一系列嚴(yán)謹(jǐn)?shù)脑瓌t。引物長度一般設(shè)定在18-30bp之間,這是因為過短的引物可能導(dǎo)致特異性降低,容易與模板非特異性結(jié)合,而過長的引物則會增加引物合成的成本,同時可能影響引物與模板的結(jié)合效率。經(jīng)計算和優(yōu)化,最終確定的引物長度為20bp左右。引物的GC含量保持在40%-60%,GC含量過高或過低都可能對引物與模板的結(jié)合穩(wěn)定性產(chǎn)生不利影響。過高的GC含量可能導(dǎo)致引物形成復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu),阻礙引物與模板的正常結(jié)合;過低的GC含量則可能使引物與模板的結(jié)合力不足,影響擴增效率。上下游引物的GC含量也盡量保持相近,避免因GC含量差異過大而導(dǎo)致擴增效率不一致。引物的3’端序列對PCR擴增的特異性和準(zhǔn)確性至關(guān)重要,避免在3’端出現(xiàn)連續(xù)的相同堿基,如GGG或CCC,因為這會顯著增加錯誤引發(fā)的幾率。3’端的末位堿基也需謹(jǐn)慎選擇,研究表明,末位堿基為A的錯配效率明顯高于其他三個堿基,因此應(yīng)避免在引物的3’端使用堿基A。引物自身及引物之間應(yīng)避免形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結(jié)構(gòu),否則會消耗引物,降低引物的有效濃度,影響PCR擴增的進(jìn)行。在設(shè)計引物時,利用專業(yè)的引物設(shè)計軟件,如PrimerPremier5.0,對引物的二聚體和發(fā)夾結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析和評估,確保其能值在合理范圍內(nèi)。根據(jù)HCMV編碼的IL-10剪接體基因序列,設(shè)計的上游引物序列為5’-ATGCCCTACGACGACGACG-3’,下游引物序列為5’-TTAGCTTGCGGCCGCTTAC-3’。在上游引物的5’端引入了EcoRI酶切位點(GAATTC),下游引物的5’端引入了HindIII酶切位點(AAGCTT),并在酶切位點前添加了3-4個保護性堿基,以提高酶切效率。這些酶切位點的引入是為了后續(xù)便于將擴增得到的IL-10剪接體基因片段與載體進(jìn)行連接,構(gòu)建重組表達(dá)質(zhì)粒。PCR擴增的反應(yīng)體系的優(yōu)化對于獲得高質(zhì)量的擴增產(chǎn)物至關(guān)重要。在本實驗中,經(jīng)過多次預(yù)實驗的摸索和優(yōu)化,確定了如下反應(yīng)體系:總體積為50μL,其中包括10×PCR緩沖液5μL,該緩沖液為PCR反應(yīng)提供了適宜的離子強度和pH環(huán)境,保證了Taq酶的活性;2.5mmol/LdNTPs4μL,dNTPs作為PCR反應(yīng)的原料,為DNA合成提供了四種脫氧核苷酸;10μmol/L上下游引物各1μL,合適的引物濃度能夠保證引物與模板充分結(jié)合,同時避免引物二聚體的形成;5U/μL高保真DNA聚合酶0.5μL,高保真DNA聚合酶能夠有效減少擴增過程中的堿基錯配,確保擴增得到的IL-10剪接體基因序列的準(zhǔn)確性;模板DNA2μL,模板DNA的質(zhì)量和濃度對擴增結(jié)果有直接影響,在實驗前對提取的HCMV基因組DNA進(jìn)行了嚴(yán)格的質(zhì)量檢測,確保其純度和完整性;最后用ddH?O補足至50μL。PCR擴增的循環(huán)參數(shù)和擴增程序的合理設(shè)置是實現(xiàn)高效、特異性擴增的關(guān)鍵。本實驗采用的擴增程序如下:首先進(jìn)行預(yù)變性,95℃保溫5min,預(yù)變性的目的是使模板DNA完全解鏈,為后續(xù)引物與模板的結(jié)合創(chuàng)造條件。接著進(jìn)入35個循環(huán)的擴增,每個循環(huán)包括變性、退火和延伸三個步驟。變性步驟在95℃進(jìn)行30s,使DNA雙鏈充分解開;退火溫度根據(jù)引物的Tm值(熔解溫度)確定為58℃,在此溫度下引物能夠特異性地與模板DNA結(jié)合;延伸步驟在72℃進(jìn)行1min,Taq酶在該溫度下發(fā)揮作用,以dNTPs為原料,按照堿基互補配對原則,合成新的DNA鏈。經(jīng)過35個循環(huán)后,進(jìn)行終延伸,72℃保溫10min,以確保所有擴增產(chǎn)物都能延伸完整。在PCR擴增過程中,可能會出現(xiàn)多種問題,需要及時分析并采取相應(yīng)的解決措施。非特異性擴增是較為常見的問題,其表現(xiàn)為在瓊脂糖凝膠電泳中出現(xiàn)多條非目的條帶。非特異性擴增的原因可能是引物設(shè)計不合理,如引物與模板非特異性結(jié)合位點較多;退火溫度過低,導(dǎo)致引物與模板的錯配幾率增加。針對引物設(shè)計問題,可重新設(shè)計引物,利用引物設(shè)計軟件對引物進(jìn)行優(yōu)化,確保其特異性。對于退火溫度過低的情況,可以通過提高退火溫度進(jìn)行梯度PCR實驗,找到最佳的退火溫度,減少非特異性擴增。引物二聚體的出現(xiàn)也是一個常見問題,其表現(xiàn)為在電泳圖中出現(xiàn)分子量較小的條帶。引物二聚體的形成主要是由于引物濃度過高、引物自身或引物之間存在互補序列。解決方法包括適當(dāng)降低引物濃度,重新設(shè)計引物以避免互補序列的存在。在實驗過程中,也可能出現(xiàn)擴增條帶弱或無條帶的情況,這可能是由于模板DNA質(zhì)量不佳、引物濃度不足、Taq酶活性降低等原因?qū)е隆a槍δ0錎NA質(zhì)量問題,可重新提取高質(zhì)量的模板DNA;對于引物濃度不足的情況,可適當(dāng)調(diào)整引物濃度;若懷疑Taq酶活性降低,可更換新的Taq酶。通過對這些可能出現(xiàn)的問題進(jìn)行及時分析和有效解決,能夠保證PCR擴增實驗的順利進(jìn)行,獲得高質(zhì)量的IL-10剪接體基因擴增產(chǎn)物。3.4克隆載體構(gòu)建將PCR擴增得到的IL-10剪接體基因片段克隆至pMD18-Tsimplevector載體,構(gòu)建重組克隆載體,這是實現(xiàn)基因表達(dá)和后續(xù)研究的關(guān)鍵步驟。載體酶切是構(gòu)建重組克隆載體的首要環(huán)節(jié)。使用限制性內(nèi)切酶EcoRI和HindIII對pMD18-Tsimplevector載體進(jìn)行雙酶切處理。在50μL的酶切反應(yīng)體系中,加入1μg的pMD18-Tsimplevector載體、5μL的10×Buffer緩沖液、10U的EcoRI酶和10U的HindIII酶,用ddH?O補足至50μL。將反應(yīng)體系置于37℃恒溫金屬浴中孵育3-4小時,使限制性內(nèi)切酶充分發(fā)揮作用,在載體的特定位置進(jìn)行切割,產(chǎn)生與IL-10剪接體基因片段互補的粘性末端。酶切結(jié)束后,通過1%瓊脂糖凝膠電泳對酶切產(chǎn)物進(jìn)行檢測。在電泳過程中,載體DNA片段在電場的作用下向正極移動,由于不同大小的DNA片段在凝膠中的遷移速率不同,酶切后的載體片段會在凝膠上呈現(xiàn)出特定的條帶位置。預(yù)期酶切后的載體片段大小應(yīng)符合理論值,且條帶清晰、無雜帶,表明酶切反應(yīng)成功。若出現(xiàn)非特異性條帶或條帶模糊,可能是由于酶切不完全、酶的活性降低或存在雜質(zhì)干擾等原因,需要重新優(yōu)化酶切條件或?qū)d體進(jìn)行進(jìn)一步純化。連接反應(yīng)是將酶切后的載體與IL-10剪接體基因片段連接成重組質(zhì)粒的關(guān)鍵步驟。取酶切后的載體片段和PCR擴增得到的IL-10剪接體基因片段,按照載體與目的基因摩爾比為1:3-1:10的比例混合。在10μL的連接反應(yīng)體系中,加入1μL的T4DNA連接酶、1μL的10×T4DNA連接酶緩沖液、適量的載體片段和目的基因片段,用ddH?O補足至10μL。將反應(yīng)體系置于16℃恒溫金屬浴中孵育過夜,T4DNA連接酶能夠催化載體和目的基因片段之間的磷酸二酯鍵形成,實現(xiàn)兩者的連接。連接反應(yīng)過程中,合適的載體與目的基因比例對于連接效率至關(guān)重要。若比例不當(dāng),可能導(dǎo)致連接產(chǎn)物中重組質(zhì)粒的比例較低,影響后續(xù)的轉(zhuǎn)化和篩選。孵育時間也會影響連接效果,過夜孵育能夠保證連接反應(yīng)充分進(jìn)行,但過長的孵育時間可能會導(dǎo)致連接產(chǎn)物的降解。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,使其攝取重組質(zhì)粒。取10μL的連接產(chǎn)物加入到100μL的大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,輕輕混勻,冰浴30分鐘,使連接產(chǎn)物與感受態(tài)細(xì)胞充分接觸。將離心管置于42℃水浴中熱激90秒,然后立即冰浴5分鐘,熱激處理能夠使感受態(tài)細(xì)胞的細(xì)胞膜通透性增加,便于重組質(zhì)粒進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。加入700μL預(yù)熱至室溫的LB培養(yǎng)基,將離心管置于37℃恒溫?fù)u床中,以200rpm的轉(zhuǎn)速振蕩培養(yǎng)1小時,使轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌恢復(fù)生長并表達(dá)抗性基因。取適量的菌液涂布于含有氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基平板上,37℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)過夜。在含有氨芐青霉素的培養(yǎng)基上,只有成功攝取了含有氨芐青霉素抗性基因重組質(zhì)粒的大腸桿菌才能生長,形成菌落。若轉(zhuǎn)化效率較低,平板上的菌落數(shù)量較少,可能是由于感受態(tài)細(xì)胞的質(zhì)量不佳、連接產(chǎn)物濃度過低或轉(zhuǎn)化操作不當(dāng)?shù)仍?,需要?yōu)化轉(zhuǎn)化條件,如重新制備感受態(tài)細(xì)胞、調(diào)整連接產(chǎn)物濃度或改進(jìn)轉(zhuǎn)化操作步驟。對轉(zhuǎn)化后的菌落進(jìn)行篩選和鑒定,以確定陽性克隆。首先采用菌落PCR鑒定方法,挑取平板上的單菌落,接種于含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫?fù)u床振蕩培養(yǎng)過夜。以培養(yǎng)后的菌液為模板,使用與擴增IL-10剪接體基因相同的引物進(jìn)行PCR擴增。在25μL的PCR反應(yīng)體系中,加入12.5μL的2×TaqPCRMasterMix、1μL的上下游引物(10μmol/L)、1μL的菌液模板,用ddH?O補足至25μL。PCR擴增程序與之前擴增IL-10剪接體基因的程序相同。擴增結(jié)束后,通過1%瓊脂糖凝膠電泳對PCR產(chǎn)物進(jìn)行檢測。若在凝膠上出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的條帶,說明該菌落可能含有重組質(zhì)粒,為初步篩選出的陽性克隆。對于菌落PCR鑒定為陽性的克隆,進(jìn)一步進(jìn)行酶切鑒定。提取這些菌落的質(zhì)粒DNA,使用EcoRI和HindIII進(jìn)行雙酶切處理。酶切反應(yīng)體系和條件與載體酶切時相同。酶切產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,若出現(xiàn)與預(yù)期大小相符的載體片段和IL-10剪接體基因片段條帶,進(jìn)一步驗證了該克隆為陽性克隆。為確??寺〉臏?zhǔn)確性,將經(jīng)過酶切鑒定的陽性克隆送測序公司進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果與已知的IL-10剪接體基因序列進(jìn)行比對,若完全一致,則可確定該克隆為含有正確重組質(zhì)粒的陽性克隆,可用于后續(xù)的實驗研究。四、人巨細(xì)胞病毒編碼IL-10剪接體的表達(dá)4.1表達(dá)載體構(gòu)建表達(dá)載體和宿主菌的選擇對于人巨細(xì)胞病毒編碼的IL-10剪接體的成功表達(dá)至關(guān)重要。在眾多表達(dá)載體中,本研究選擇pMal-c2x載體,這是基于多方面因素的考量。pMal-c2x載體具有多個顯著優(yōu)勢,它含有麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)標(biāo)簽,這一標(biāo)簽?zāi)軌蛴行г黾又亟M蛋白的可溶性,降低包涵體的形成幾率。IL-10剪接體在原核表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)時,容易形成包涵體,而MBP標(biāo)簽的存在可以改善這一情況,使重組蛋白更易于以可溶形式表達(dá),便于后續(xù)的純化和分析。pMal-c2x載體擁有氨芐青霉素抗性基因,這使得在轉(zhuǎn)化和篩選過程中,能夠通過在培養(yǎng)基中添加氨芐青霉素,有效篩選出含有重組質(zhì)粒的宿主菌,只有成功攝取了含有氨芐青霉素抗性基因重組質(zhì)粒的宿主菌才能在含有氨芐青霉素的培養(yǎng)基上生長,從而提高了篩選的效率和準(zhǔn)確性。該載體還具備強啟動子,能夠驅(qū)動外源基因的高效表達(dá)。在本研究中,強啟動子能夠確保IL-10剪接體基因在宿主菌中獲得較高的表達(dá)水平,為后續(xù)獲得足夠量的重組蛋白提供了保障。宿主菌方面,選用大腸桿菌BL21(DE3)作為表達(dá)宿主菌。大腸桿菌BL21(DE3)具有諸多適合作為表達(dá)宿主菌的特性。它含有T7RNA聚合酶基因,該基因在IPTG(異丙基-β-D-硫代半乳糖苷)誘導(dǎo)下能夠高效表達(dá)。T7RNA聚合酶對T7啟動子具有高度特異性,能夠特異性地識別并結(jié)合到pMal-c2x載體上的T7啟動子區(qū)域,啟動IL-10剪接體基因的轉(zhuǎn)錄,從而實現(xiàn)高效表達(dá)。BL21(DE3)菌株缺失了某些蛋白酶基因,這使得在重組蛋白表達(dá)過程中,能夠有效減少蛋白酶對重組蛋白的降解,提高重組蛋白的穩(wěn)定性和表達(dá)量。該菌株的生長速度較快,易于培養(yǎng)和操作,能夠在較短的時間內(nèi)獲得大量的菌體,為重組蛋白的表達(dá)提供充足的宿主細(xì)胞。將克隆載體pMD18-T-cmvIL-10中的IL-10剪接體基因亞克隆至表達(dá)載體pMal-c2x的過程中,酶切位點的選擇至關(guān)重要。基于前期在克隆載體構(gòu)建時的設(shè)計,選擇EcoRI和HindIII作為雙酶切位點。這兩種酶在識別位點和切割特性上具有高度特異性,EcoRI識別的序列為5’-GAATTC-3’,HindIII識別的序列為5’-AAGCTT-3’。在克隆載體pMD18-T-cmvIL-10和表達(dá)載體pMal-c2x上,均存在這兩個酶切位點,且位于合適的位置,能夠保證酶切后產(chǎn)生的粘性末端與IL-10剪接體基因片段和pMal-c2x載體的相應(yīng)末端互補。使用這兩種酶進(jìn)行雙酶切,能夠準(zhǔn)確地將IL-10剪接體基因從克隆載體上切割下來,并使pMal-c2x載體產(chǎn)生與之匹配的粘性末端,為后續(xù)的連接反應(yīng)創(chuàng)造有利條件。連接反應(yīng)條件的優(yōu)化是構(gòu)建重組表達(dá)載體的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。在連接反應(yīng)體系中,載體與目的基因的比例對連接效率有著重要影響。經(jīng)過多次預(yù)實驗的摸索,確定載體與目的基因摩爾比為1:5時,連接效率較高。在此比例下,能夠保證載體與目的基因充分結(jié)合,減少載體自身環(huán)化的可能性,提高重組質(zhì)粒的形成幾率。連接反應(yīng)的溫度和時間也對連接效果產(chǎn)生影響。將連接反應(yīng)溫度設(shè)置為16℃,反應(yīng)時間為過夜(約12-16小時)。16℃的溫度既能保證T4DNA連接酶具有較高的活性,又能使載體和目的基因片段在相對穩(wěn)定的環(huán)境中進(jìn)行連接反應(yīng)。過夜反應(yīng)能夠確保連接反應(yīng)充分進(jìn)行,提高連接的成功率。在連接反應(yīng)體系中,還需加入適量的T4DNA連接酶和10×T4DNA連接酶緩沖液。T4DNA連接酶能夠催化載體和目的基因片段之間的磷酸二酯鍵形成,實現(xiàn)兩者的連接。10×T4DNA連接酶緩沖液則為連接反應(yīng)提供了適宜的反應(yīng)環(huán)境,包括合適的離子強度和pH值等,保證T4DNA連接酶的活性。對構(gòu)建的重組表達(dá)載體pMal-c2x-cmvIL-10進(jìn)行鑒定,采用酶切鑒定和測序鑒定兩種方法。酶切鑒定時,使用EcoRI和HindIII對重組表達(dá)載體進(jìn)行雙酶切處理。將酶切產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳分析,在凝膠上觀察到兩條清晰的條帶,一條條帶大小與預(yù)期的IL-10剪接體基因片段大小相符,約為528bp;另一條條帶大小與pMal-c2x載體酶切后的大小一致。這表明IL-10剪接體基因已成功插入到pMal-c2x載體中。為進(jìn)一步確認(rèn)重組表達(dá)載體的準(zhǔn)確性,將其送測序公司進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果與已知的IL-10剪接體基因序列進(jìn)行比對,結(jié)果顯示完全一致,這充分證明了重組表達(dá)載體pMal-c2x-cmvIL-10構(gòu)建成功,可用于后續(xù)的IL-10剪接體表達(dá)實驗。4.2重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)將構(gòu)建成功的重組表達(dá)載體pMal-c2x-cmvIL-10轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中,采用不同的誘導(dǎo)劑、濃度、時間和溫度進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),以優(yōu)化表達(dá)條件,獲得高表達(dá)量和高純度的重組蛋白。在誘導(dǎo)劑的選擇上,主要考慮IPTG和乳糖。IPTG是一種常用的誘導(dǎo)劑,它能夠與阻遏蛋白結(jié)合,解除對T7RNA聚合酶基因的抑制,從而啟動外源基因的表達(dá)。乳糖也可作為誘導(dǎo)劑,它可以被大腸桿菌中的β-半乳糖苷酶分解為葡萄糖和半乳糖,半乳糖能夠與阻遏蛋白結(jié)合,起到類似IPTG的誘導(dǎo)作用。比較IPTG和乳糖對重組蛋白表達(dá)的影響,設(shè)置兩組實驗,一組使用IPTG誘導(dǎo),另一組使用乳糖誘導(dǎo)。將含有重組表達(dá)載體的大腸桿菌BL21(DE3)分別接種于含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期(OD600值達(dá)0.5-0.6)。在IPTG誘導(dǎo)組中,加入IPTG至終濃度為0.5mmol/L;在乳糖誘導(dǎo)組中,加入乳糖至終濃度為20mmol/L。繼續(xù)在37℃下誘導(dǎo)表達(dá)5小時后,收集菌體,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析。結(jié)果顯示,IPTG誘導(dǎo)組的重組蛋白表達(dá)量明顯高于乳糖誘導(dǎo)組,在SDS-PAGE凝膠上,IPTG誘導(dǎo)組的目的蛋白條帶更為清晰、明亮,表明IPTG對重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)效果更好。對于誘導(dǎo)劑濃度的優(yōu)化,設(shè)置不同的IPTG濃度梯度,分別為0.1mmol/L、0.3mmol/L、0.5mmol/L、0.7mmol/L和0.9mmol/L。將含有重組表達(dá)載體的大腸桿菌BL21(DE3)接種于含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期。分別加入不同濃度的IPTG,37℃誘導(dǎo)表達(dá)5小時后,收集菌體,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析。隨著IPTG濃度的增加,重組蛋白的表達(dá)量逐漸升高,當(dāng)IPTG濃度達(dá)到0.5mmol/L時,重組蛋白的表達(dá)量達(dá)到較高水平,繼續(xù)增加IPTG濃度,表達(dá)量增加不明顯,且高濃度的IPTG可能對菌體生長產(chǎn)生一定的抑制作用。確定0.5mmol/L為較適宜的IPTG誘導(dǎo)濃度。誘導(dǎo)時間對重組蛋白表達(dá)也有重要影響。設(shè)置誘導(dǎo)時間梯度為3小時、4小時、5小時、6小時和7小時。將含有重組表達(dá)載體的大腸桿菌BL21(DE3)接種于含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期后,加入0.5mmol/L的IPTG,分別在不同時間點收集菌體,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析。結(jié)果表明,隨著誘導(dǎo)時間的延長,重組蛋白的表達(dá)量逐漸增加,在誘導(dǎo)5小時時,重組蛋白的表達(dá)量達(dá)到較高水平,繼續(xù)延長誘導(dǎo)時間,重組蛋白的表達(dá)量不再明顯增加,且長時間的誘導(dǎo)可能導(dǎo)致蛋白降解,在SDS-PAGE凝膠上出現(xiàn)雜帶。確定5小時為較適宜的誘導(dǎo)時間。誘導(dǎo)溫度同樣是影響重組蛋白表達(dá)的關(guān)鍵因素。設(shè)置誘導(dǎo)溫度分別為25℃、30℃、37℃和42℃。將含有重組表達(dá)載體的大腸桿菌BL21(DE3)接種于含有氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期后,加入0.5mmol/L的IPTG,分別在不同溫度下誘導(dǎo)表達(dá)5小時,收集菌體,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析。在37℃時,重組蛋白的表達(dá)量較高,且蛋白條帶清晰;在25℃和30℃時,重組蛋白的表達(dá)量較低;在42℃時,雖然重組蛋白的表達(dá)量有所增加,但出現(xiàn)了較多的包涵體,在SDS-PAGE凝膠上,包涵體對應(yīng)的條帶較為明顯。確定37℃為較適宜的誘導(dǎo)溫度。在誘導(dǎo)表達(dá)過程中,可能會出現(xiàn)包涵體形成和蛋白降解等問題。包涵體的形成主要是由于重組蛋白在大腸桿菌中表達(dá)時,折疊過程異常,導(dǎo)致蛋白聚集形成不溶性的包涵體。為減少包涵體的形成,可以在誘導(dǎo)表達(dá)時降低溫度,如將誘導(dǎo)溫度從37℃降低至25℃,較低的溫度可以減緩蛋白的合成速度,有利于蛋白的正確折疊。添加分子伴侶也是有效的方法,分子伴侶能夠幫助重組蛋白正確折疊,減少包涵體的形成。在培養(yǎng)基中添加適量的甘氨酸甜菜堿等分子伴侶,能夠提高重組蛋白的可溶性表達(dá)。蛋白降解問題通常是由于大腸桿菌內(nèi)的蛋白酶對重組蛋白的水解作用導(dǎo)致。為解決這一問題,可以選擇蛋白酶缺陷型的宿主菌,如大腸桿菌BL21(DE3)菌株缺失了某些蛋白酶基因,能夠有效減少蛋白酶對重組蛋白的降解。在培養(yǎng)基中添加蛋白酶抑制劑,如PMSF(苯甲基磺酰氟)等,也能夠抑制蛋白酶的活性,減少蛋白降解。4.3重組蛋白純化與鑒定重組蛋白的純化是獲得高純度目的蛋白的關(guān)鍵步驟,本實驗選用親和層析法對誘導(dǎo)表達(dá)后的重組蛋白進(jìn)行純化,主要基于重組表達(dá)載體pMal-c2x上攜帶的麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)標(biāo)簽。MBP標(biāo)簽?zāi)軌蚺cAmyloseresin(直鏈淀粉樹脂)特異性結(jié)合,利用這一特性可以實現(xiàn)重組蛋白的高效分離和純化。親和層析具有高度特異性,能夠有效去除雜蛋白,提高重組蛋白的純度。其操作相對簡便,能夠在較短時間內(nèi)完成純化過程,減少蛋白降解的風(fēng)險。具體操作步驟如下:首先進(jìn)行菌體收集,將誘導(dǎo)表達(dá)后的菌液在4℃、8000rpm條件下離心10min,收集菌體沉淀。將收集的菌體沉淀用預(yù)冷的PBS緩沖液(pH7.4)重懸,充分洗滌,去除殘留的培養(yǎng)基和雜質(zhì)。再次離心,8000rpm、4℃離心10min,棄上清,收集洗滌后的菌體沉淀。向洗滌后的菌體沉淀中加入適量的裂解緩沖液(50mmol/LTris-HCl,pH8.0,150mmol/LNaCl,1mmol/LEDTA,1%TritonX-100,1mmol/LPMSF),冰浴中超聲裂解菌體。超聲條件設(shè)置為功率200W,超聲3s,間隔5s,總時間20min。超聲裂解后,將裂解液在4℃、12000rpm條件下離心30min,收集上清液,即為粗蛋白提取物。將粗蛋白提取物緩慢加入到預(yù)先平衡好的Amyloseresin親和層析柱中,控制流速為0.5-1mL/min,使重組蛋白與Amyloseresin充分結(jié)合。用10倍柱體積的洗滌緩沖液(50mmol/LTris-HCl,pH8.0,150mmol/LNaCl,1mmol/LEDTA)沖洗層析柱,去除未結(jié)合的雜質(zhì)蛋白,直至流出液的OD280值接近基線。用洗脫緩沖液(50mmol/LTris-HCl,pH8.0,150mmol/LNaCl,1mmol/LEDTA,10mmol/L麥芽糖)洗脫結(jié)合在Amyloseresin上的重組蛋白,收集洗脫液,每管收集1mL。采用SDS-PAGE電泳對純化后的重組蛋白進(jìn)行分析,以評估純化效果和確定蛋白分子量。根據(jù)目的蛋白的分子量大小,配制12%的分離膠和5%的濃縮膠。將收集的洗脫液與4×SDS-PAGE上樣緩沖液按3:1的比例混合,100℃煮沸5min,使蛋白變性。取適量變性后的樣品加入到SDS-PAGE凝膠的加樣孔中,同時加入蛋白Marker作為分子量標(biāo)準(zhǔn)。在恒壓120V條件下進(jìn)行電泳,當(dāng)溴酚藍(lán)指示劑遷移至凝膠底部時,停止電泳。電泳結(jié)束后,將凝膠取出,用考馬斯亮藍(lán)染色液染色3-4小時,使蛋白條帶顯色。用脫色液(甲醇:冰醋酸:水=45:10:45)脫色,直至背景清晰,蛋白條帶清晰可見。在SDS-PAGE凝膠上,觀察到在相對分子量約62.5kDa處出現(xiàn)一條清晰的條帶,與預(yù)期的重組蛋白(MBP標(biāo)簽約42kDa,IL-10剪接體約20.5kDa,兩者融合后的重組蛋白分子量約為62.5kDa)分子量相符。經(jīng)過親和層析純化后,雜蛋白條帶明顯減少,表明重組蛋白得到了有效的純化。為進(jìn)一步驗證純化后的蛋白是否為目標(biāo)蛋白,采用Westernblot技術(shù)進(jìn)行鑒定。將SDS-PAGE電泳后的蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上,轉(zhuǎn)膜條件為恒流300mA,轉(zhuǎn)膜時間90min。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,將PVDF膜用5%脫脂牛奶封閉液在室溫下封閉1小時,以減少非特異性結(jié)合。用TBST緩沖液(20mmol/LTris-HCl,pH7.5,150mmol/LNaCl,0.05%Tween-20)洗滌PVDF膜3次,每次5min。將PVDF膜放入用TBST稀釋的一抗(抗MBP抗體,稀釋比例為1:1000)中,4℃孵育過夜。再次用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次5min。將PVDF膜放入用TBST稀釋的二抗(HRP標(biāo)記的羊抗兔IgG抗體,稀釋比例為1:5000)中,室溫孵育1小時。用TBST緩沖液洗滌PVDF膜3次,每次5min。按比例混合ECL化學(xué)發(fā)光試劑A液和B液,將PVDF膜浸泡在混合液中孵育1min,然后用成像儀進(jìn)行曝光檢測。在Westernblot結(jié)果中,在相對分子量約62.5kDa處出現(xiàn)特異性條帶,與SDS-PAGE電泳結(jié)果一致,且背景清晰,無明顯的非特異性條帶。這表明純化后的蛋白確實為帶有MBP標(biāo)簽的IL-10剪接體重組蛋白,進(jìn)一步驗證了重組蛋白表達(dá)和純化的成功。五、結(jié)果與分析5.1克隆結(jié)果分析對克隆載體pMD18-T-cmvIL-10進(jìn)行酶切鑒定,使用EcoRI和HindIII進(jìn)行雙酶切處理,酶切產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。結(jié)果顯示,在凝膠上出現(xiàn)兩條清晰的條帶,一條約為2692bp,與pMD18-Tsimplevector載體的大小相符;另一條約為528bp,與預(yù)期的IL-10剪接體基因片段大小一致(圖1)。這表明IL-10剪接體基因已成功插入到pMD18-Tsimplevector載體中,克隆載體構(gòu)建成功?!敬颂幉迦朊盖需b定圖譜,圖1:克隆載體pMD18-T-cmvIL-10的酶切鑒定圖譜,M:DNAMarker;1:pMD18-T-cmvIL-10雙酶切產(chǎn)物】通過菌落PCR對轉(zhuǎn)化后的菌落進(jìn)行初步篩選,以培養(yǎng)后的菌液為模板,使用與擴增IL-10剪接體基因相同的引物進(jìn)行PCR擴增。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,結(jié)果顯示,部分菌落的PCR產(chǎn)物在凝膠上出現(xiàn)了與預(yù)期大小相符的條帶,約為528bp(圖2)。這表明這些菌落可能含有重組質(zhì)粒,為初步篩選出的陽性克隆?!敬颂幉迦隤CR鑒定結(jié)果圖,圖2:菌落PCR鑒定結(jié)果,M:DNAMarker;1-10:不同菌落的PCR產(chǎn)物】為進(jìn)一步確認(rèn)克隆的準(zhǔn)確性,將經(jīng)過酶切鑒定和菌落PCR鑒定為陽性的克隆送測序公司進(jìn)行測序分析。測序結(jié)果與已知的IL-10剪接體基因序列進(jìn)行比對,結(jié)果顯示,兩者的序列完全一致,同源性達(dá)到100%。這充分證明了克隆得到的IL-10剪接體基因序列準(zhǔn)確無誤,成功克隆了人巨細(xì)胞病毒編碼的IL-10剪接體基因。在克隆過程中,嚴(yán)格按照實驗步驟進(jìn)行操作,確保了實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。然而,在實際操作中,仍可能存在一些潛在的問題。引物設(shè)計的合理性直接影響PCR擴增的特異性和效率,如果引物與模板非特異性結(jié)合位點較多,可能導(dǎo)致非特異性擴增,出現(xiàn)多條非目的條帶,影響克隆的準(zhǔn)確性。在實驗過程中,對引物進(jìn)行了嚴(yán)格的設(shè)計和篩選,通過引物設(shè)計軟件分析引物的特異性和二聚體形成情況,確保引物能夠特異性地擴增IL-10剪接體基因。模板DNA的質(zhì)量和濃度也對克隆結(jié)果有重要影響,如果模板DNA存在降解或雜質(zhì)污染,可能導(dǎo)致PCR擴增失敗或出現(xiàn)錯誤的擴增產(chǎn)物。在提取HCMV基因組DNA時,采用了高質(zhì)量的DNA提取試劑盒,并對提取的DNA進(jìn)行了嚴(yán)格的質(zhì)量檢測,確保其純度和完整性符合實驗要求。連接反應(yīng)的效率和準(zhǔn)確性也至關(guān)重要,如果載體與目的基因的比例不當(dāng)、連接酶活性降低或反應(yīng)條件不合適,可能導(dǎo)致連接失敗或重組質(zhì)粒的比例較低。在連接反應(yīng)過程中,通過多次預(yù)實驗優(yōu)化了載體與目的基因的比例,選擇了合適的連接酶和反應(yīng)條件,提高了連接效率和重組質(zhì)粒的形成幾率。通過酶切鑒定、PCR鑒定和測序比對等多種方法,成功克隆了人巨細(xì)胞病毒編碼的IL-10剪接體基因,為后續(xù)的表達(dá)和功能研究奠定了堅實的基礎(chǔ)。在克隆過程中,充分考慮了各種可能影響實驗結(jié)果的因素,并采取了相應(yīng)的措施進(jìn)行優(yōu)化和控制,確保了克隆結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。5.2表達(dá)結(jié)果分析通過SDS-PAGE電泳對不同誘導(dǎo)條件下重組蛋白的表達(dá)情況進(jìn)行分析,結(jié)果如圖3所示。從圖中可以清晰地看到,在未誘導(dǎo)組(泳道1)中,幾乎沒有明顯的目的蛋白條帶出現(xiàn),說明在未添加誘導(dǎo)劑的情況下,重組蛋白基本不表達(dá)。在IPTG誘導(dǎo)組中,隨著IPTG濃度的增加,目的蛋白條帶逐漸變亮、變粗,表明重組蛋白的表達(dá)量逐漸增加。當(dāng)IPTG濃度達(dá)到0.5mmol/L時,目的蛋白條帶最為明顯,表達(dá)量較高。繼續(xù)增加IPTG濃度,如0.7mmol/L和0.9mmol/L時,雖然目的蛋白條帶仍有一定程度的加深,但增加幅度不明顯,且高濃度的IPTG可能對菌體生長產(chǎn)生一定的抑制作用,導(dǎo)致菌體生長狀態(tài)不佳,從而影響蛋白的表達(dá)。【此處插入SDS-PAGE電泳圖,圖3:不同誘導(dǎo)條件下重組蛋白的SDS-PAGE電泳分析,M:蛋白Marker;1:未誘導(dǎo)組;2-6:分別為0.1mmol/L、0.3mmol/L、0.5mmol/L、0.7mmol/L、0.9mmol/LIPTG誘導(dǎo)組;7-11:分別為誘導(dǎo)3h、4h、5h、6h、7h組;12-15:分別為25℃、30℃、37℃、42℃誘導(dǎo)組】在誘導(dǎo)時間的影響方面,隨著誘導(dǎo)時間的延長,從3小時到5小時,目的蛋白條帶逐漸增強,重組蛋白的表達(dá)量逐漸增加。在誘導(dǎo)5小時時,目的蛋白條帶清晰且亮度較高,表達(dá)量達(dá)到較高水平。繼續(xù)延長誘導(dǎo)時間至6小時和7小時,目的蛋白條帶的亮度增加不明顯,且在7小時時,條帶出現(xiàn)了一定程度的彌散,可能是由于長時間的誘導(dǎo)導(dǎo)致蛋白降解。不同誘導(dǎo)溫度下,重組蛋白的表達(dá)情況也有所不同。在25℃和30℃時,目的蛋白條帶較淺,表達(dá)量較低。這可能是因為較低的溫度不利于菌體的生長和代謝,從而影響了重組蛋白的表達(dá)。在37℃時,目的蛋白條帶清晰明亮,表達(dá)量較高,表明該溫度下菌體生長和代謝活躍,有利于重組蛋白的表達(dá)。在42℃時,雖然目的蛋白條帶較亮,但同時出現(xiàn)了較多的雜帶,可能是由于高溫導(dǎo)致蛋白變性,形成了包涵體。綜合以上分析,確定最佳誘導(dǎo)表達(dá)條件為:使用IPTG作為誘導(dǎo)劑,濃度為0.5mmol/L,誘導(dǎo)時間為5小時,誘導(dǎo)溫度為37℃。在該條件下,重組蛋白的表達(dá)量較高,且條帶清晰,雜帶較少,有利于后續(xù)的蛋白純化和鑒定。通過灰度掃描分析,在最佳誘導(dǎo)條件下,目的蛋白條帶的灰度值占總蛋白條帶灰度值的比例約為35%,表明在該條件下重組蛋白的純度也較高。5.3蛋白活性分析采用細(xì)胞增殖實驗對重組蛋白的生物學(xué)活性進(jìn)行分析。選擇小鼠CTLL-2細(xì)胞作為實驗細(xì)胞,該細(xì)胞對IL-10具有一定的反應(yīng)性。將CTLL-2細(xì)胞以5000個細(xì)胞每孔的細(xì)胞密度接種到96孔板中,設(shè)置不同的實驗組,分別添加不同濃度的重組IL-10剪接體蛋白(0ng/ml、1ng/ml、5ng/ml、10ng/ml、20ng/ml),同時設(shè)置天然IL-10作為陽性對照,每組設(shè)置3個復(fù)孔。將96孔板置于37℃、5%CO?的培養(yǎng)箱中孵育48小時。孵育結(jié)束后,采用CCK-8細(xì)胞計數(shù)試劑盒檢測細(xì)胞增殖情況。向每孔中加入10μL的CCK-8試劑,繼續(xù)孵育2小時。使用酶標(biāo)儀在450nm波長處測定各孔的吸光度(OD)值,根據(jù)OD值計算細(xì)胞增殖率。細(xì)胞增殖率(%)=(實驗組OD值-空白對照組OD值)/(陰性對照組OD值-空白對照組OD值)×100%。實驗結(jié)果如圖4所示,隨著重組IL-10剪接體蛋白濃度的增加,CTLL-2細(xì)胞的增殖率逐漸升高。在濃度為10ng/ml時,細(xì)胞增殖率達(dá)到約60%,與天然IL-10在相同濃度下的細(xì)胞增殖率(約65%)較為接近。當(dāng)濃度增加到20ng/ml時,細(xì)胞增殖率略有增加,但增加幅度不明顯。這表明重組IL-10剪接體蛋白具有一定的促進(jìn)細(xì)胞增殖的活性,且其活性與天然IL-10具有相似性。通過統(tǒng)計學(xué)分析,在10ng/ml和20ng/ml濃度下,重組IL-10剪接體蛋白組與天然IL-10組的細(xì)胞增殖率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),進(jìn)一步證實了重組蛋白的活性與天然IL-10相當(dāng)?!敬颂幉迦爰?xì)胞增殖實驗結(jié)果圖,圖4:重組IL-10剪接體蛋白和天然IL-10對CTLL-2細(xì)胞增殖的影響,*P>0.05,與天然IL-10組相比】為進(jìn)一步驗證重組蛋白的活性,進(jìn)行細(xì)胞因子分泌檢測實驗。以人外周血單核細(xì)胞(PBMCs)為實驗對象,將P
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