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1、真菌學(xué)實(shí)驗(yàn)報(bào)告 一.實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?.1了解真菌形態(tài)的基本特征。 1.2掌握絲狀真菌制片方法。 1.3掌握內(nèi)生真菌的分離方法 1.4掌握真菌的鑒定方法。二.前言: 真菌廣泛分布于地球表面,從高山、湖泊到田野、森林,從海洋、高空到赤道、兩極,到處都有真菌。真菌雖然不在空氣中生長(zhǎng)繁殖,但它的孢子卻成群的漂浮在天空,只要稍微注意你會(huì)發(fā)現(xiàn)人類原來生活在真菌的汪洋大海中。當(dāng)今世界,生物技術(shù)已邁入世界經(jīng)濟(jì)的支柱產(chǎn)業(yè),真菌學(xué)在生物技術(shù)的大潮中得到了長(zhǎng)足的發(fā)展。真菌是原始的真核生物,具有廣泛的多樣性,真菌生長(zhǎng)我繁殖迅速,在很短的時(shí)間內(nèi)就可以得到比動(dòng)物和植物多得多的后代,能夠直接、快速地進(jìn)行遺傳性狀分離的分析。因此

2、,真菌可以作為研究基礎(chǔ)生物學(xué)過程中的一個(gè)重要工具,真菌基因的多樣性以及真菌分子生物學(xué)的發(fā)展,為生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)提供了一個(gè)廣闊的天地。植物的生長(zhǎng)環(huán)境直接影響內(nèi)生真菌的生物多樣性,植物物種的年代越久遠(yuǎn),其生物內(nèi)生真菌的多樣性越豐富:抗病原性能越強(qiáng)的植物,其所含的內(nèi)生真菌具有抗菌活性的可能行就越大;其所含的內(nèi)生真菌有可能產(chǎn)生與植物相同或相似的抗菌無知或產(chǎn)生抗菌活性物質(zhì)可能參與了藥用植物的抗菌過程,本實(shí)驗(yàn)通過植物病原真菌和G+、G-細(xì)菌的抑制實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)莖,根,花,種子或果實(shí)內(nèi)生真菌的代謝產(chǎn)物具有不同程度的抑菌能力,并且對(duì)G+、G-有普片遍的抑菌作用。研究和開發(fā)內(nèi)生真菌的尋找新的抗菌活性物質(zhì)具有廣泛的應(yīng)用前景

3、。三.材料與方法:3.1.1材料:在校園內(nèi)采集銀杏、喜樹、桂花樹樣品包括葉、莖、根、花、種子或果實(shí)。3.1.2.藥品與試劑:葡萄糖、蛋白胨、KH2P043H2O、MgSO47H2O,馬鈴薯、瓊脂。孟加拉紅,青霉素,鏈霉素,甲基藍(lán),蛋白胨,酵母膏,蔗糖,磷酸鹽,葡萄糖,瓊脂條,無菌水等。消毒劑:75%的乙醇,0.1%升汞(HgCl2),次氯酸鈉溶液(含活性氯10%),30%雙氧水。雙蒸水、瓊脂糖,Tris飽和酚、巰基乙醇(- Mercaptoethanol),石英砂,Tris飽和酚,氯仿,異戊醇,無水乙醇,硼酸,冰醋酸,氯化鈉,鹽酸,氫氧化鈉,EDTA,CTAB。3.1.3.培養(yǎng)基:3.1.3.

4、1馬鈴薯、葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基 馬鈴薯汁 1000ml,葡萄糖20g,瓊脂20g (注:取去皮馬鈴薯200克,切成小塊,加水1000毫升煮沸30分鐘,濾去馬鈴薯塊,將濾液補(bǔ)足至1000毫升,加葡萄糖20克,瓊脂15克,溶化后分裝,15磅滅菌30分鐘3.1.3.2察氏瓊脂培養(yǎng)基 蔗糖30g,NaNO3 3g,MgSO4.7H2O 0.5g,KCl 0.5g,F(xiàn)eSO4.7H2O 0.01g,K2HPO4 1g,瓊脂13g,蒸餾水1000ml,自然pH 3.1.3.3沙氏培養(yǎng)基蛋白胨 1g,葡萄糖或麥芽糖 4 g,瓊脂 1.5克,水 100 ml。制法:1將上述物質(zhì)稱好,放入水中煮沸溶解(不必調(diào)PH即

5、有5左右)分中號(hào)試管(約4毫升)包扎,高壓11520分鐘。趁熱斜好,凝固備用。3.1.3.4馬丁氏培養(yǎng)基葡萄糖10g,蛋白胨5g,KH2PO4 1g,MgSO47H2O 0.5g,1%孟加拉紅3.3mL,瓊脂20g, 水 1000mL,pH值自然??股赜梅ㄅc用量:培養(yǎng)基滅菌之后分裝前按鏈霉素40U/mL,青霉素30U/mL用量加入,冷卻到45左右未凝固時(shí)加入抗生素,混勻倒平板。四.方法:4.1.1采樣方法:在校園內(nèi)找到銀杏、喜樹、桂花樹并用刀采集葉、莖、根、皮、種子。4.1.2樣品前處理:分別取根、莖、葉、果實(shí),用洗滌劑在自來水下洗凈。老樹皮用75%酒精進(jìn)行表面消毒后,用鑷子取出,于酒精燈上

6、燒灼15秒至表面焦糊,切成11cm2大小置于PDA固體培養(yǎng)基上。對(duì)于根、莖、葉、果實(shí)按下列程序進(jìn)行表面消毒:75%的酒精漂(浸)洗2-3min無菌水沖洗4-6次0.1%升汞不同的消毒時(shí)間(見表2-2,共設(shè)置7個(gè)梯度)無菌水沖洗4-6次用滅菌濾紙吸干多余水分無菌刀片將材料切成小塊將根、莖的表皮、韌皮部、木質(zhì)部大致分開,并切成0.50.5cm2大小。將果實(shí)的外種皮去掉,消毒之后將內(nèi)種皮去掉。滅菌時(shí),瀝干的植物材料轉(zhuǎn)放到燒杯中,記好時(shí)間,倒入消毒溶液,不時(shí)用玻璃棒輕輕攪動(dòng),以促進(jìn)材料各部分與消毒溶液充分接觸,驅(qū)除氣泡,使消毒徹底。在快到時(shí)間之前1-2分鐘,開始把消毒液傾入一備好的大燒杯內(nèi),要注意勿使

7、材料倒出,傾凈后立即倒入無菌水,輕攪漂洗。滅菌時(shí)間是從倒入消毒液開始,至倒入無菌水時(shí)為止。滅菌液要充分浸沒材料。寧可多用些滅菌液,切勿勉強(qiáng)在一個(gè)體積偏小的容器中使用很多材料滅菌。4.1.3 內(nèi)生菌的分離方法:將上述組織塊置于分離培養(yǎng)基上(每一平皿培養(yǎng)5塊組織塊)于27恒溫培養(yǎng),同時(shí)將上述消毒過程中最后一次沖洗組織塊后的無菌水滴在培養(yǎng)基上平行培養(yǎng),用以檢測(cè)消毒是否徹底。觀察菌絲生長(zhǎng)情況及污染情況。4.1.4純化方法:培養(yǎng)3-4天后及時(shí)采用尖端菌絲挑取法,挑取形態(tài)不同的菌絲或菌落移種到新鮮PDA培養(yǎng)基上。純化3-4次以保證所得菌落為純培養(yǎng)。4.2形態(tài)鑒定方法:4.2.1培養(yǎng)方法:4.2.1.1培養(yǎng)

8、基:查氏培養(yǎng)基、沙氏培養(yǎng)基和PDA培養(yǎng)基。4.2.1.2將4保存菌種活化2次;4.2.1.3將活化菌種分別點(diǎn)種PDA、沙氏、察氏平板,每重復(fù)4.2.1.425恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)7天;4.2.1.5然后進(jìn)行菌落特征描述,取一個(gè)平行進(jìn)行制片(膠帶子粘片法),觀察個(gè)體形態(tài);4.2.1.6另兩個(gè)平行繼續(xù)培養(yǎng)至14天,取出;4.2.1.7重復(fù)步驟4,作為最終描述結(jié)果;4.2.1.8根據(jù)真菌分類鑒定手冊(cè)和相關(guān)資料分析確該菌的歸屬。4.2.2制片方法:膠帶粘貼法:選用在顯微鏡油鏡下觀察細(xì)致不粗糙且粘性好的膠帶。取一小段膠帶從菌落表面的中心向邊緣粘,75%乙醇固定,乳酸石炭酸棉藍(lán)染色液染色,將粘有菌絲的一面向上,

9、蓋上蓋玻片,于顯微鏡下觀察產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)等特征。4.2.3鑒定標(biāo)準(zhǔn):觀察的要點(diǎn):4.2.4菌落宏觀形態(tài):大小:以菌落的直徑(mm)表示。顏色:包括菌落表面和背面的顏色,及色素是否滲入培養(yǎng)基。菌落表面的紋飾:如皺紋、輻射溝紋、同心環(huán)、整個(gè)菌落致密或疏松等。菌落的質(zhì)地:氈狀、毯狀、絨毛狀、棉絮狀、粉粒狀、革質(zhì)狀、有無成束狀或繩狀的氣生菌絲。菌落的高度:扁平、凸起或隆起,及菌落中心部分狀況等。菌落邊緣:全緣、鋸齒狀、樹枝狀等。滲出物:菌落表面有無液滴及液滴的顏色等。4.2.5個(gè)體形態(tài):菌絲的特征:表面性狀(粗糙或光滑),寬度等分生孢子梗:分支情況-簡(jiǎn)單或復(fù)雜,輪生或單生等;長(zhǎng)短;基部粗糙或光滑等。產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)

10、的形態(tài)特征:形狀,大小,著生狀況(位置,單生、互生或成輪生體)分生孢子的形態(tài):形狀,大小,表面狀況,聚集方式(直鏈、斜鏈或聚集成頭)4.3分子生物學(xué)鑒定:4.3.1培養(yǎng)方法:培養(yǎng)基成分與不加瓊脂的PDA固體培養(yǎng)基成分相同。將液體培養(yǎng)基以100mL每瓶分裝至250mL三角瓶中,用8層紗布封口。121,蒸汽滅菌20min。將菌絲致密的真菌接種到液體培養(yǎng)基中,于恒溫振蕩培養(yǎng)箱中27、120rpm培養(yǎng)5-7天。用兩層滅菌紗布過濾菌絲球,用無菌蒸餾水沖洗菌絲球5次,避免培養(yǎng)基中的糖類和蛋白對(duì)DNA提取的影響。40下烘干菌絲,但是不要過于干燥,然后進(jìn)行DNA的提取。4.3.2基因組DNA的提取DNA提取采

11、用CTAB法。CTAB(cetyltriethylammonium bromide,十六烷基三乙基溴化銨)是一種去污劑,可溶解細(xì)胞膜,它能與核酸形成復(fù)合物,在高鹽溶液中是可溶的,當(dāng)降低溶液鹽濃度到一定程度時(shí),從溶液中沉淀,通過離心可將CTAB與核酸的復(fù)合物同蛋白質(zhì)、多糖類物質(zhì)分開,然后將CTAB與核酸的復(fù)合物沉淀溶解于高鹽溶液,再加乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇。CTAB法的好處是能很好地去掉糖類雜質(zhì),提取前期可得到高含量的DNA。4.3.2.1用CTAB法提取材料DNA的具體步驟如下:將CTAB buffer在65水浴鍋中預(yù)熱,研缽用液氮預(yù)冷;4.3.2.2 取0.1g左右菌絲體,在液

12、氮中迅速研磨成粉末后,迅速加入5mL預(yù)熱的提取液及10L-巰基乙醇,混合均勻后把混合液轉(zhuǎn)入1.5mL離心管中700L/管;4.3.2.3 于65水浴保溫0.5-1h,時(shí)間不能超過1.5h。保溫期間要輕輕振搖幾次;4.3.2.4 冷卻至室溫后,加入等體積(700L)的飽和酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),充分混勻后靜置10min。4.3.2.5離心(12000rpm,10min,室溫),去沉淀,將上清液轉(zhuǎn)入干凈離心管中。 4.3.2.6 根據(jù)雜質(zhì)的去除情況重復(fù)步驟4、5數(shù)次,直至無雜質(zhì);4.3.2.7加入等體積氯仿:異戊醇(24:1)抽提一次以去除飽和酚,離心(12000rpm,10min,室

13、溫);4.3.2.8將上清液逐滴加入兩倍體積的-20預(yù)冷無水乙醇,以沉淀出DNA。室溫放置10-20min,可以過夜;4.3.2.9 挑取或離心去上清液(10000 rpm,5min)的方法取出DNA;用75%乙醇洗滌兩次; 37保溫箱中干燥后溶于適量的TE緩沖液中4備用。4.4 所用引物ITS5:GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGITS4:TCCTCCGCTTATTGATATGC4.4.1PCR反應(yīng)條件:4.4.1.1體系:PCR反應(yīng)體系為50L體系,包括:10PCR buffer: 1/10MgCl2 : 1.5mM,dNTPs(dATP、dTTP、dCTP、dGTP): 各20

14、0M,Primer1 0.2M,Primer2 0.2M,Taq酶: 12.5U,DNA模板: 約100ng。4.4.2條件:擴(kuò)增條件預(yù)變性 95 5min變性 95 1min復(fù)性 51 1min 3035個(gè)循環(huán)延伸 72 1min 延伸補(bǔ)齊 72 10min4.4.3測(cè)序方法:送測(cè)序公司。4.4.4序例分析:五結(jié)果及分析:結(jié)果:試驗(yàn)分離到兩種真菌5.1八爪金盤分離到菌種查氏正反照 5.1.1菌落宏觀形態(tài):大?。壕涞闹睆?.2(mm)。顏色:包括菌落表面棕黑色背面灰色,色素滲入培養(yǎng)基。菌落表面的紋飾:如皺紋、整個(gè)菌落致密。菌落的質(zhì)地:氈狀菌落的高度:凸起或隆起。菌落邊緣:鋸齒狀。滲出物:菌落

15、表面無液滴。5.1.2個(gè)體形態(tài):菌絲的特征:表面粗糙。分生孢子梗:分支復(fù)雜,輪生。5.1.3 分子生物學(xué)鑒定通過PCR擴(kuò)增和序列分析,送公司檢測(cè)得到的序列為:TGAAGTTAAAAAGCGTAACAAGGTCTCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACAAGTGACCCCGGTCTAACCACCGGGATGTTCATAACCCTTTGTTGTCCGACTCTGTTGCCTCCGGGGCGACCCTGCCTTCGGGCGGGGGCTCCGGGTGGACACTTCAAACTCTTGCGTAACTTTGCAGTCTGAGTAAACTTAATTAATAAATTAAAACTTTTAAC

16、AACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCACCACTCAAGCCTCGCTTGGTATTGGGCATCGCGGTCCGCCGCGTGCCTCAAATCGACCGGCTGGGTCTTCTGTCCCCTAAGCGTTGTGGAAACTATTCGCTAAAGGGTGTTCGGGAGGCTACGCCGTAAAACAACCCCATTTCTAAGGTTG

17、ACCTCGGATCAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAAAATCGGAGGAA通過blast序列分析得到的結(jié)果為: Distribution of 100 Blast Hits on the Query SequenceSequences producing significant alignments:5.2桂花樹莖分離到PDA正反照 鏡檢:5.2.1菌落形態(tài):大?。壕涞闹睆?2mm。顏色:菌落表面的顏色為棕黃色背面為黃色。菌落表面的紋飾:有皺紋、同心環(huán)、整個(gè)菌落致密。菌落的質(zhì)地:革質(zhì)狀。菌落的高度:扁平。菌落邊緣:全緣。滲出物:菌落表面無液體。5.2.2個(gè)體形態(tài):菌絲的特征:表面光滑分生孢子梗:分支復(fù)雜,輪生,較短,基部粗糙。六 分析:6.1試驗(yàn)中我們發(fā)現(xiàn),同種菌種在不同的培養(yǎng)基上面呈現(xiàn)出不同的菌落形態(tài)特征,如菌落形態(tài)大小、顏色、紋飾、質(zhì)地、高度、邊緣、有無滲出物及其滲出物的顏色等。6.2試驗(yàn)中我們對(duì)各種材料進(jìn)行了菌種分離,用了三種培養(yǎng)基,但由于操作原因和設(shè)備原因,試驗(yàn)中有很多培養(yǎng)基都被污染了。七 實(shí)驗(yàn)總結(jié):7.1植物的生長(zhǎng)環(huán)境直接影響內(nèi)生真菌的生物多樣性,不同植株的內(nèi)生菌種不同,不同環(huán)境中生長(zhǎng)的同種植株的

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