ch3 醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息檢索基礎(chǔ)

1、醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索第三章第三章 醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息檢索基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息檢索基礎(chǔ) 內(nèi)容提要第一節(jié)第一節(jié) 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 一、數(shù)據(jù)庫的類型一、數(shù)據(jù)庫的類型 二、數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)二、數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu) 三、文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的檢索途徑三、文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的檢索途徑 第二節(jié)第二節(jié) 檢索語言檢索語言 一、信息組織方法一、信息組織方法 二、檢索語言的概念二、檢索語言的概念 三、檢索語言的類型三、檢索語言的類型 四、常用的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索語言四、常用的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索語言內(nèi)容提要第三節(jié)第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù) 一、文獻(xiàn)檢索方法一、文獻(xiàn)檢索方法 二、文獻(xiàn)檢索技術(shù)二、文獻(xiàn)檢索技術(shù) 第四節(jié)第四節(jié) 文獻(xiàn)檢索策略文獻(xiàn)檢索策略 一、文獻(xiàn)

2、檢索步驟一、文獻(xiàn)檢索步驟 二、檢索效果的評價二、檢索效果的評價 三、檢索策略的調(diào)整三、檢索策略的調(diào)整 教學(xué)基本要求能夠敘述檢索語言基本知識、文獻(xiàn)檢索策略構(gòu)建步驟、檢索方法與技術(shù)。熟悉數(shù)據(jù)庫的類型和結(jié)構(gòu)，文獻(xiàn)檢索途徑，MeSH、中圖法的使用。了解檢索語言等方面的基本知識，檢索效果評價。第一節(jié) 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 一、數(shù)據(jù)庫的類型數(shù)據(jù)庫的類型（一）按對信息收錄的（一）按對信息收錄的學(xué)科范圍學(xué)科范圍劃分劃分1.綜合性數(shù)據(jù)庫 Web of Science、CNKI、萬方2.專業(yè)性數(shù)據(jù)庫 PubMed、BIOSIS、CBM3.專題性數(shù)據(jù)庫 GenBank、中國藥物專利數(shù)據(jù)庫第一節(jié) 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

3、 （二）按收錄（二）按收錄信息內(nèi)容信息內(nèi)容的類型不同劃分的類型不同劃分1.文獻(xiàn)型數(shù)據(jù)庫(書目型和全文型)literature database2.數(shù)值型數(shù)據(jù)庫 numerical database3.事實(shí)型數(shù)據(jù)庫 fact database4.圖像數(shù)據(jù)庫 image database5.多媒體數(shù)據(jù)庫 multimedia databaseThe Visible Human Project第一節(jié) 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 二、數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu) 從用戶的角度看，數(shù)據(jù)庫主要由文檔、記錄和字段三個層次構(gòu)成。 數(shù)據(jù)庫通常由若干個文檔（file）組成，每個文檔又由若干條記錄（record）組成，每條記

4、錄則包含若干字段（field）。 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫中：文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫中：一篇文獻(xiàn)一篇文獻(xiàn) 即即 一條記錄，篇名、一條記錄，篇名、作者、刊名、主題詞等作者、刊名、主題詞等 即即 字段字段 第一節(jié) 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 三、文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的檢索途徑三、文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的檢索途徑 檢索系統(tǒng)主要依信息的各項(xiàng)特征來編排，形成不同的檢索途徑。 檢索途徑是檢索系統(tǒng)提供的檢索入口。 常用的檢索途徑：主題詞途徑、關(guān)鍵詞途徑、分類途徑、題名途徑、著者途徑等。 第二節(jié) 檢索語言一、信息組織方法一、信息組織方法信息組織方法是指將信息按一定規(guī)律進(jìn)行有序排列的方法。 1.形式信息組織法：號碼法、物名法、引證關(guān)系法、時序法、地序法、專用代碼法

5、等。 2.內(nèi)容信息組織法：分類法、主題法。 3.效用信息組織法：權(quán)值組織法、特色組織法、重要性遞減組織法、概率組織法。 第二節(jié) 檢索語言二、檢索語言的概念二、檢索語言的概念 檢索語言（retrieval language）又稱文獻(xiàn)存儲與檢索語言、標(biāo)引語言等，是信息檢索系統(tǒng)存儲與檢索過程中共同使用的一種專用語言，是在文獻(xiàn)檢索領(lǐng)域中用來描述文獻(xiàn)特征和表達(dá)信息檢索提問的一種專用語言。 三、檢索基本原理三、檢索基本原理經(jīng)選擇經(jīng)選擇的信息的信息主題主題分析分析標(biāo)引標(biāo)引語言語言表達(dá)表達(dá)文獻(xiàn)文獻(xiàn)特征特征標(biāo)識標(biāo)識經(jīng)確立經(jīng)確立的課題的課題主題主題分析分析檢索檢索語言語言表達(dá)表達(dá)文獻(xiàn)文獻(xiàn)需求需求標(biāo)識標(biāo)識信息信息集

6、合集合詞表詞表存儲存儲檢索檢索檢索檢索結(jié)果結(jié)果匹配匹配第二節(jié) 檢索語言三、檢索語言的類型三、檢索語言的類型 非規(guī)范化語言規(guī)范化語言第二節(jié) 檢索語言檢索語言可按照是否規(guī)范來分類：l 規(guī)范化語言：對文獻(xiàn)檢索用語的概念加以人工控制和規(guī)范，對同義詞、近義詞、多義詞等進(jìn)行規(guī)范化處理，一個概念僅用一個詞表達(dá)。如主題詞、分類號艾滋病AIDS獲得性免疫缺陷綜合征 l 非規(guī)范化語言（自然語言）：關(guān)鍵詞 keyword、 文本詞 textword第二節(jié) 檢索語言四、常用的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索語言四、常用的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索語言 （一）中國圖書館分類法 中國圖書館分類法簡稱中圖法，是目前國內(nèi)最常用的一種等級體系分類法。以科學(xué)分類

7、和知識分類為基礎(chǔ)，結(jié)合文獻(xiàn)內(nèi)容特點(diǎn)及形式特征進(jìn)行分門別類、逐層深入的邏輯劃分和系統(tǒng)排列的分類法。 將學(xué)科劃分為5個基本部類、22個基本大類 。 第二節(jié) 檢索語言（二）醫(yī)學(xué)主題詞 醫(yī)學(xué)主題詞（Medical Subject Headings，簡稱MeSH）是NLM編制的世界醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最權(quán)威、最常用的一部規(guī)范化的、可擴(kuò)充的動態(tài)敘詞表。主要用途： PubMed數(shù)據(jù)庫（Medline；IM） 中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫（CBM） 其他部分?jǐn)?shù)據(jù)庫、搜索引擎第二節(jié) 檢索語言（二）醫(yī)學(xué)主題詞1. MeSH詞的種類（1）敘詞（descriptor）：又稱主題詞(subject heading) （2）款目詞（ent

8、ry term）：又稱入口詞 （3）限定詞（qualifier）：又稱副主題詞(subheading)（4）特征詞（check tag）主題詞樹形結(jié)構(gòu)（類目）：大類 Anatomy A Organisms B Diseases C Chemicals and Drugs D Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment E Psychiatry and Psychology F Phenomena and Processes G Disciplines and Occupations H Anthropology

9、, Education, Sociology and Social Phenomena I Technology, Industry, Agriculture J Humanities K Information Science L Named Groups M Health Care N Publication Characteristics V Geographicals Z 主題詞：能代表文獻(xiàn)內(nèi)容實(shí)質(zhì)的經(jīng)過嚴(yán)格規(guī)范化的專業(yè)名詞術(shù)語或詞組 特點(diǎn)：規(guī)范性、唯一性、動態(tài)性 高血壓高血壓/ /治療治療 關(guān)鍵詞：從文獻(xiàn)中抽出來的、有實(shí)質(zhì)內(nèi)容的、未經(jīng)或略經(jīng)規(guī)范化了的名詞術(shù)語以及增添的相關(guān)概念詞，屬于

10、自然語言 高血壓高血壓 AND AND （治療（治療 OR OR 處理）處理） 舉例：阿司匹林引起的消化性潰瘍的治療主題詞途徑與關(guān)鍵詞途徑第二節(jié) 檢索語言（二）其他醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索語言 1. 國際疾病分類法 ICD 2. 國際系統(tǒng)醫(yī)學(xué)術(shù)語集 SNOMED第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù) 一、文獻(xiàn)檢索方法 1.檢索工具法 2.瀏覽法 3.引文追蹤法 4.綜合法 第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)二、文獻(xiàn)檢索技術(shù) 1布爾邏輯檢索（boolean logical searching） 2截詞檢索(truncation searching) 3限定檢索（limit searching

11、） 4詞組檢索（phrase searching） 5擴(kuò)展檢索（expanded searching） 6位置檢索（position searching） 7 加權(quán)檢索（weighting searching) 8 相關(guān)信息檢索（related information searching） 1布爾邏輯檢索 與（AND）、或（OR）、非（NOT） A or B A and B A not BA or B A and B A not B第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)例如，查找例如，查找“動物的乙肝病毒（不要人的）動物的乙肝病毒（不要人的）”的文獻(xiàn)的文獻(xiàn) 查找查找“胰島素治療糖尿病胰島

12、素治療糖尿病”的文獻(xiàn)的文獻(xiàn) 查找查找所有關(guān)于所有關(guān)于“肺肺腫瘤腫瘤”的文獻(xiàn)的文獻(xiàn) 布爾邏輯運(yùn)算符的運(yùn)算布爾邏輯運(yùn)算符的運(yùn)算順序順序一般為：一般為： （）NOTANDOR 但有些數(shù)據(jù)庫不按照這個次序，如PubMed第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)例：維生素例：維生素C C或維生素或維生素E E對糖尿病患者腎臟的對糖尿病患者腎臟的保護(hù)作用保護(hù)作用（維生素C or 維生素E）and 糖尿病 and 腎 2截詞檢索、通配符檢索l無限截詞 * ：代表有或無若干個字符，可以檢索詞根相同但詞尾不同的檢索詞。 例：gene*l有限截詞 ? ：代表有或無一個字符，可以檢索單復(fù)數(shù)、英美不同拼寫方式等檢

13、索詞 。 例：wom?n 乙？肝第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù) 3限定檢索可以將檢索詞限制在特定的字段中，限制符多為 in、=、 等。 例：張學(xué) in AU AU=張學(xué) zhang xau第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)4. 詞組檢索（精確檢索） 精確檢索精確檢索（exact searching）：檢索結(jié)果必須含：檢索結(jié)果必須含有與檢索提問式完全相同（包括次序）的字串，即有與檢索提問式完全相同（包括次序）的字串，即完全匹配。完全匹配。在許多系統(tǒng)中用在許多系統(tǒng)中用引號引號來表示，如檢索來表示，如檢索“Acute Pancreatitis”； 模糊檢索模糊檢索（fuzzy

14、 searching）：可能是將檢索詞拆：可能是將檢索詞拆分后進(jìn)行檢索，也可能檢索到與檢索詞意義相近的分后進(jìn)行檢索，也可能檢索到與檢索詞意義相近的同義詞的結(jié)果同義詞的結(jié)果。如檢索。如檢索Acute Pancreatitis，可檢，可檢索出索出Acute necrotizing Pancreatitis、Acute gallstone Pancreatitis等。等。第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)5. 擴(kuò)展檢索：檢索系統(tǒng)向查詢中加入與檢索詞詞義相關(guān)的詞，如同義詞、下位詞等。擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率。 如：輸入如：輸入 “ “甲流甲流”，擴(kuò)展檢索，系統(tǒng)可同時，擴(kuò)展檢索，系統(tǒng)可同時檢索

15、檢索 豬流感、甲型豬流感、甲型H1N1H1N1流感、流感、A A型流感型流感第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)6. 位置檢索（鄰近檢索） 記錄級：記錄級： andand 字段級：字段級： withwith 子字段或自然句：子字段或自然句：samesame 詞位置：詞位置：near3near3第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)加權(quán)檢索加權(quán)檢索7. 加權(quán)檢索（weighing searching）不僅檢索提問詞是否存在，而且計算提問詞的權(quán)值，權(quán)值之和超過閾值的 記錄 才能在數(shù)據(jù)庫中被檢出來。在某些數(shù)據(jù)庫中表現(xiàn)為僅檢索主要概念主題詞，如MEDLINE；而有些數(shù)據(jù)庫表現(xiàn)為詞頻檢索，

16、如中國學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)庫。8.相關(guān)信息檢索： related articles related records similar pages cited paper citing paper第三節(jié) 文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)文獻(xiàn)檢索方法與技術(shù)相關(guān)信息反饋檢索第四節(jié) 文獻(xiàn)檢索策略文獻(xiàn)檢索策略 一、一、文獻(xiàn)檢索步驟文獻(xiàn)檢索步驟1分析檢索課題，明確檢索要求2選擇檢索工具，確定檢索方法 3. 選定檢索途徑、檢索詞，制訂檢索策略式4. 評價檢索結(jié)果，優(yōu)化檢索策略 5. 文獻(xiàn)篩選，獲取原始文獻(xiàn) 如何獲取原始文獻(xiàn)？ 網(wǎng)絡(luò)下載從數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果從數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果直接下載直接下載從免費(fèi)全文庫下載從免費(fèi)全文庫下載 本館館藏 聯(lián)

17、合目錄/館際互借 醫(yī)知網(wǎng) 外地朋友幫助下載 向原文作者索取第四節(jié) 文獻(xiàn)檢索策略文獻(xiàn)檢索策略 二、檢索效果的評價二、檢索效果的評價1.信息檢索評價 一般包括檢索系統(tǒng)評價和檢索效果評價。 2.查全率與查準(zhǔn)率 是評價檢索效果的兩個重要指標(biāo)。 兩者之間存在著相反的相互依賴關(guān)系。 應(yīng)依具體課題需求，合理調(diào)節(jié)查全率和查準(zhǔn)率。查全率 recall sensitive查準(zhǔn)率 precision specific 查全率查全率R=R=檢出的相關(guān)信息量檢出的相關(guān)信息量/ /信息庫中相關(guān)信信息庫中相關(guān)信息總量息總量 100% 100% 查準(zhǔn)率查準(zhǔn)率P P = = 檢出的相關(guān)信息量檢出的相關(guān)信息量/ /檢出信息總檢出信息總量量 100%100%如：如：60/10060/100，60/12060/120文獻(xiàn)檢索效果評價文獻(xiàn)檢索效果評價第四節(jié) 文獻(xiàn)檢索策略文獻(xiàn)檢索策略 三、檢索策略的調(diào)整三、檢索策略的調(diào)整1.擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率可以采用的方法：(1)增加各種形式的自由詞（如同義詞、全稱簡稱等相關(guān)詞）進(jìn)行檢索，使用OR算符；(2)減少AND（如減少次要概念）或NOT的使用次數(shù)；(3)由詞組檢索變模糊檢索；(4)用截詞檢索；(5)調(diào)整限定的字段；(6)適當(dāng)放寬限定條件；(7)使用其他檢索系統(tǒng)進(jìn)行檢索；(8)使用更多的檢索途徑進(jìn)