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文檔簡介
1、PCR原理和基本操作過程2015.12.5臨床146生化實驗小組第一節(jié) PCR技術(shù)原理 聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reation,PCR)是一種DNA體外核酸擴增技術(shù)。該技術(shù)能在短時間內(nèi)將極微量的目的基因或某DNA片段擴增至十萬乃至百萬倍,從極微量的標本中擴增出足量的DNA供分析研究和檢測鑒定。PCR技術(shù)具有特異、敏感、產(chǎn)率高、快速、簡便、重復(fù)性好、易自動化等突出優(yōu)點。 PCR基本原理PCR基本反應(yīng)步驟一、PCR的原理 PCR技術(shù)是一種在體外模擬DNA的復(fù)制過程的核酸擴增技術(shù)。其原理是根據(jù)DNA的半保留復(fù)制,以及DNA分子在體外不同的溫度下雙鏈和單鏈可相互轉(zhuǎn)變的機制,在
2、體外人為地控制反應(yīng)系統(tǒng)的溫度,使雙鏈DNA變性,成為單鏈DNA;其次,單鏈DNA與人工引物鏈在退火過程中配對結(jié)合;最后,在DNA聚合酶的催化作用下,使引物沿單鏈模板延伸為雙鏈DNA,實現(xiàn)DNA的擴增。PCR三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成,即變性、退火、引物延伸。二、三個基本步驟變性(denaturation)-高溫下將模板DNA雙鏈打開 退火(annealing)-引物在較低溫度下以共價鍵結(jié)合到模板DNA互補部位 延伸(extension)-TaqDNA聚合酶作用下,不斷向引物3端添加DNTP,DNA鏈不斷延伸反應(yīng)液中含有所有成分,以溫度變化來控制反應(yīng)階段:反應(yīng)液中含有所有成分,以溫度變化來控制反應(yīng)階段
3、:變性變性95度,退火度,退火55度,延伸度,延伸72度。度。1234522557294時間(min)溫度()適溫延伸3高溫變性1低溫退火2重復(fù)13步2530輪目的DNA片段擴增100萬倍以上DNA雙螺旋DNA單鏈與引物復(fù)性DNA變性形成2條單鏈子鏈延伸DNA加倍PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過程PCR的特點1234522557294時間(min)溫度()適溫延伸3高溫變性1低溫退火2重復(fù)13步2530輪目的DNA片段擴增100萬倍以上DNA雙螺旋DNA單鏈與引物復(fù)性子鏈延伸DNA加倍DNA變性形成2條單鏈模板DNA95變變 性性第一輪擴增第一輪擴增PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過
4、程PCR的特點58引物1引物2DNA引物退退 火火PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過程PCR的特點引物1引物2DNA引物72Taq酶Taq酶延延 伸伸PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過程PCR的特點第1輪結(jié)束95第2輪開始PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過程PCR的特點50TaqTaqTaqTaq72PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過程PCR的特點72第2輪結(jié)束PCR的基本原理PCR反應(yīng)條件PCR過程PCR的特點模板DNA第1輪擴增第2輪擴增第3輪擴增第4輪擴增第5輪擴增第6輪擴增PCR的特點靈敏度高1.皮克(pg=10-12)量級擴增到微克(ug=10-6)水平2. 能從10
5、0萬個細胞中檢出一個靶細胞3.病毒檢測的靈敏度可達3個RFU4.細菌檢測的最小檢出率為3個細菌簡便、快速1.一次性加好反應(yīng)液,24 小時完成擴增2.擴增產(chǎn)物一般用電泳分析對標本的純度要求低u血液、體腔液、洗嗽液、毛發(fā)、細胞、活組織等組織的粗提DNAPCR 的特點第二節(jié)PCR的實驗步驟標準的PCR反應(yīng)體系 10X 擴增緩沖液: 5l 模板DNA: 0.12g 引物: 各0.21mol/L 4種dNTP: 各200mol/L Mg2+: 1.5mmol/L Taq DNA聚合酶: 2.5UddH2O 補齊 總體積: 50lu可以按照比例放大或者縮小體系,不同的可以按照比例放大或者縮小體系,不同的P
6、CR反應(yīng)需要優(yōu)化反應(yīng)需要優(yōu)化u按照實驗方案進行即可按照實驗方案進行即可1.加樣 將上述總體積為50l的反應(yīng)體系加入一無菌0.5ml離心管中2離心 將加入的反應(yīng)物混合均勻后稍離心,加入一滴礦物油覆蓋于反應(yīng)混合物上3擴增 在PCR儀上設(shè)置PCR反應(yīng)參數(shù)(具體數(shù)據(jù)根據(jù)引物和擴增片段的大小而定):94下加熱4分鐘左右;依次94變性1分鐘,45退火1分鐘,72延伸2分鐘,循環(huán)32次左右;72下保溫7分鐘,使反應(yīng)產(chǎn)物擴增充分4PCR擴增產(chǎn)物分析 PCR產(chǎn)物是否為特異性擴增,其結(jié)果是否可靠,必須對其進行嚴格的分析與鑒定,才能得出正確的結(jié)論。產(chǎn)物的分析,可依據(jù)研究對象和目的不同而采用不同的分析方法PCR循環(huán)參數(shù) 94 ,3min;94 ,45s;58 ,1min; 循環(huán)30次72 ,1min;72 ,10min;16 保溫(熱力學(xué)參數(shù))(熱力學(xué)參數(shù)) 94 ,3min;94 ,45s;58 ,1min; 循環(huán)30次72 ,1min;72 ,10min;16 保溫 94 預(yù)變性,3min使DNA雙鏈完全打開退火: 58,1min 溫度由引物長度和GC含量決定。 增加溫度能減
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