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文檔簡(jiǎn)介

1、植物總蛋白提取及檢測(cè)方法實(shí)驗(yàn)一 植物蛋白提取三氯醋酸-丙酮沉淀法 取1-2克材料于液氮充分研磨,加入10mL預(yù)冷的含10%三氯乙酸(TCA)、0.07%-巰基乙醇(可用DTT代替)的丙酮,充分混合后-20下冰浴過(guò)夜,然后離心(4,40000×g,1h),棄上清。在沉淀中加入10mL預(yù)冷的含0.07%DTT的丙酮,充分混合,-20下放置1h,離心(4,40000×g,1h),重復(fù)該步驟2-3遍。沉淀冷凍干燥蛋白然后分裝放入-80備用。取取純化后的晶體蛋白4.0mg,加入400µl裂解液(1mg蛋白:100µl裂解液)振蕩器上振蕩溶解,然后13200rpm離

2、心15min除雜質(zhì),取上清分裝,每管70µl,-80保存。按20L/mg的比例加入蛋白裂解液(9mol/L尿素,4%CHAPS,1%IPG緩沖液,1%DTT,35 mmol/ L Tris),30水浴1 h,并不時(shí)振蕩,12 000×g 下離心10min。上清液中加入4倍體積的預(yù)冷丙酮,于- 20下放置至少2 h,4 000 ×g 下離心10min,沉淀用水化緩沖液(8 mol/L尿素,2% CHAPS,20mmol/ L DTT,0. 5%IPG緩沖液)溶解,重復(fù)該步驟1 2 遍。樣品溶液存于-75 下或直接用于電泳。用Bradford法在波長(zhǎng)595nm定量蛋白

3、。試劑:1、提取液:含10%TCA和0.07%-巰基乙醇的丙酮。2、裂解液:2.7g尿素0.2g CHAPS溶于3ml滅菌的去離子水中(終體積為5ml),IPGbuffer100µl(35mmol/L tris100µl)使用前再加入1M的DTT 65µl/ml(約50mg,現(xiàn)用現(xiàn)加)。3、液氮。實(shí)驗(yàn)二 紫外吸收法檢測(cè)提取蛋白的濃度一 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?通過(guò)蛋白提取方法熟悉掌握使用酶標(biāo)儀、紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)分析檢測(cè)(或掃描)提取蛋白的濃度二 實(shí)驗(yàn)原理由于蛋白質(zhì)中酪氨酸和色氨酸殘基的苯環(huán)含有共軛雙鍵,因此蛋白質(zhì)具有紫外吸收的性質(zhì),其最大吸收峰在280nm波長(zhǎng)處。在此波長(zhǎng)時(shí),

4、蛋白質(zhì)溶液的吸光度(A280)與其含量成正比關(guān)系,可用作定量測(cè)定。由于核酸在280nm波長(zhǎng)也有光吸收,對(duì)蛋白的測(cè)定有干擾,但核酸的最大吸收峰在260nm處。可同時(shí)測(cè)定280nm和260nm波長(zhǎng)的光吸收,通過(guò)經(jīng)驗(yàn)公式計(jì)算可消除其對(duì)蛋白質(zhì)測(cè)定的影響。酶標(biāo)儀其核心是一個(gè)比色計(jì)或分光光度計(jì),一般要求測(cè)試液的最終體積在250µl以下。其基本工作原理與結(jié)構(gòu)和紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)幾乎完全相同。酶標(biāo)儀是以微孔板為比色容器的比色計(jì),入射光通過(guò)板孔底部進(jìn)入比色液體,利用板的移動(dòng)更換比色對(duì)象。紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)測(cè)定樣品容量大。三 實(shí)驗(yàn)方法、步驟取1mg BSA用1ml超純水溶解,測(cè)定BSA標(biāo)準(zhǔn)曲線及樣品蛋白

5、含量。取 7個(gè)10ml的離心管,首先在5個(gè)離心管中按次序加入0µl,5µl,10µl,15µl,20µl 的BSA溶解液,另2管中分別加入2 µl的待測(cè)樣品溶液,再在每管中加入相應(yīng)體積的純水(總體積為100µl),然后,各管中分別加入5ml的Bradford液,搖勻,置室溫5min后測(cè)定吸光值,在595nm下按由低到高的濃度順序測(cè)定各濃度BSA的OD值,再測(cè)樣品 OD值。以標(biāo)準(zhǔn)蛋白濃度為x軸,OD值為y軸作標(biāo)準(zhǔn)曲線。1234567BSA蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)溶液(µl)0510152022H20(µl)1009590

6、85809898蛋白質(zhì)濃度(mg/ml)00.050.10.150.2A595OD值實(shí)驗(yàn)三 提取蛋白的脫鹽純化處理一 實(shí)驗(yàn)?zāi)康牧私獾鞍踪|(zhì)純化的方法,熟悉掌握蛋白脫鹽處理的純化方法二 實(shí)驗(yàn)原理分離純化某一特定蛋白質(zhì)的一般程序可以分為前處理、粗分離、細(xì)分離三步。(一)前處理分離純化某種蛋白質(zhì),首先要把蛋白質(zhì)從原來(lái)的組織或細(xì)胞中以溶解的狀態(tài)釋放出來(lái)并保持原來(lái)的天然狀態(tài),不丟失生物活性。為此,動(dòng)物材料應(yīng)先提出結(jié)締組織和脂肪組織,種子材料應(yīng)先去殼甚至去種皮以免手單寧等物質(zhì)的污染,油料種子最好先用低沸點(diǎn)的有機(jī)溶劑如乙醚等脫脂。然后根據(jù)不同的情況,選擇適當(dāng)?shù)姆椒?,將組織和細(xì)胞破碎。動(dòng)物組織和細(xì)胞可用電動(dòng)搗碎

7、機(jī)或勻漿機(jī)破碎或用超聲波處理破碎。植物組織和細(xì)胞由于具有纖維素、半纖維素和果膠等物質(zhì)組成的細(xì)胞壁,一般需要用石英砂或玻璃粉和適當(dāng)?shù)奶崛∫阂黄鹧心サ姆椒ɑ蛴美w維素酶處理也能達(dá)到目的。破碎細(xì)菌細(xì)胞壁的常用方法有超聲波破碎,與砂研磨、高壓擠壓或溶菌酶處理等。組織和細(xì)胞破碎后,選擇適當(dāng)?shù)木彌_液把所要的蛋白提取出來(lái)。細(xì)胞碎片等不溶物用離心或過(guò)濾的方法除去。如果所要的蛋白主要集中在某一細(xì)胞組分,如細(xì)胞核、染色體、核糖體或可溶性細(xì)胞質(zhì)等,則可利用差速離心的方法將它們分開(kāi),收集該細(xì)胞組分作為下步純化的材料。如果碰上所要蛋白是與細(xì)胞膜或膜質(zhì)細(xì)胞器結(jié)合的,則必須利用超聲波或去污劑使膜結(jié)構(gòu)解聚,然后用適當(dāng)介質(zhì)提取。

8、(二)粗分級(jí)分離當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)提取液(有時(shí)還雜有核酸、多糖之類)獲得后,將所要的蛋白與其他雜蛋白分離開(kāi)來(lái)。一般用分離用鹽析、等電點(diǎn)沉淀和有機(jī)溶劑分級(jí)分離等方法。這些方法的特點(diǎn)是簡(jiǎn)便、處理量大,既能除去大量雜質(zhì),又能濃縮蛋白溶液。有些蛋白提取液體積較大,又不適于用沉淀或鹽析法濃縮,則可采用超過(guò)濾、凝膠過(guò)濾、冷凍真空干燥或其他方法進(jìn)行濃縮。(三)細(xì)分級(jí)分離樣品經(jīng)粗分級(jí)分離以后,一般體積較小,雜蛋白大部分已被除去。進(jìn)一步純化,一般使用層析法包括凝膠過(guò)濾、離子交換層析、吸附層析以及親和層析等。必要時(shí)還可選擇電泳法,包括區(qū)帶電泳、等電點(diǎn)聚焦等作為最后的純化步驟。用于細(xì)分級(jí)分離的方法一般規(guī)模較小,但分辨率很高。

9、結(jié)晶是蛋白質(zhì)分離純化的最后步驟。盡管結(jié)晶過(guò)程并不能保證蛋白一定是均一的,但是只有某種蛋白在溶液中數(shù)量上占有優(yōu)勢(shì)時(shí)才能形成結(jié)晶。結(jié)晶過(guò)程本身也伴隨著一定程度的純化,而重結(jié)晶又可除去少量夾雜的蛋白。由于結(jié)晶過(guò)程中從未發(fā)現(xiàn)過(guò)變性蛋白,因此蛋白的結(jié)晶不僅是純度的一個(gè)標(biāo)志,也是斷定制品處于天然狀態(tài)的有力指標(biāo)。(四)蛋白質(zhì)分離純化的方法1 根據(jù)分子大小不同的純化方法(1)透析和超過(guò)濾(2)密度梯度離心(3)凝膠過(guò)濾2 利用溶解度差別的純化方法(1)、等電點(diǎn)沉淀和pH控制(2)蛋白質(zhì)的鹽析和鹽溶(3)有機(jī)溶劑分級(jí)分離法(4)溫度對(duì)蛋白質(zhì)濃度的影響3 根據(jù)電荷不同的純化方法(1)電泳(2)聚丙烯酰胺凝膠電泳(

10、3)毛細(xì)管電泳(4)等電聚焦(5)層析聚焦(6)離子交換層析4 利用選擇性吸附的純化方法(1)羥磷石灰層析(2)疏水作用層析5 利用配體的特異生物學(xué)親和力的純化方法親和層析(affinity chromatography)a.凝集素親和層析b.免疫親和層析c.金屬螯合層析d.染料配體層析e.共價(jià)層析三 實(shí)驗(yàn)步驟(具體操作結(jié)合儀器講)AKATA 制備型液相色譜蛋白分析儀純化蛋白步驟首先將提取蛋白溶液抽濾,超聲波(主要是去除溶液中的氣泡);檢查AKATA純化系統(tǒng) Ph探頭,接Ph計(jì),接脫鹽柱(也可系統(tǒng)平衡后接,看說(shuō)明書柱子流速、柱壓)開(kāi)機(jī)(儀器自檢),點(diǎn)開(kāi)Unicorn ,選 default,ok

11、;clear all (即出現(xiàn)流程圖界面);首先將20%乙醇換為超純水(緩沖液);Mannul,點(diǎn)任意選項(xiàng),出現(xiàn)操作對(duì)話框,平衡系統(tǒng);Pump-flow=1.0,execute,(注意:必須先設(shè)定流速,使其形成通路;即有流速時(shí)再作其他操作)。此時(shí)觀察柱壓,柱壓切記0.3Mpa;如果柱壓高,則要更長(zhǎng)時(shí)間洗。柱壓基本穩(wěn)定時(shí),洗泵:pump-pumpwashpurifier-A1 ONB1 ON execute;這項(xiàng)儀器自動(dòng)完成;完成后自動(dòng)恢復(fù)為上一步的狀態(tài);此時(shí)還應(yīng)該注意柱壓。注意中間有多次平衡狀態(tài)出現(xiàn):一種狀態(tài)進(jìn)入另一種狀態(tài)時(shí),一般要平穩(wěn)3個(gè)柱體積;此時(shí)可以洗上樣環(huán);待平衡時(shí)換液:pause,A

12、1-A液B1-B液,continue,然后達(dá)到平衡態(tài);洗泵:pump-pumpwashpurifier-A1 ON B1 ON execute;此時(shí)A泵走A液,B泵走B液 此時(shí)可以安裝脫鹽柱;待穩(wěn)定下來(lái)準(zhǔn)備上樣:將流速降下來(lái),flow=0.5 ,先是load(默認(rèn))狀態(tài)下,將蛋白溶液用注射器打入上樣環(huán)(上樣環(huán)是1ml的,所以一般最多上樣1 ml,否則浪費(fèi));然后為inject狀態(tài),execute,待走出2.5 柱體積時(shí)重新改為load狀態(tài),平衡幾個(gè)柱體積;如果中間需上樣多次,load,execute;pause;加樣后,continue;Inject,execute;同樣圖上顯示2 ml 時(shí)改

13、狀態(tài)為load;此時(shí)出現(xiàn)蛋白峰,在峰上時(shí)接收;平衡后,洗脫。準(zhǔn)備接收純化出的蛋白,流速flow=1.0,gradient;100%B8 min;execucte;待B%20% 時(shí),設(shè)定 pump-outletvalve-feed,executefrac峰收集,0.5 ml,execute;首先出現(xiàn)的是雜蛋白的峰,也可以接收。一般第二個(gè)峰是目的蛋白。不再接收時(shí),F(xiàn)rac=0,execute;pump-outletvalve-wasteF1曲線直到平行,然后再走幾個(gè)柱體積;B液已達(dá)100%,停止走B液:gradient=0 (即0%B);time=0 min ;這時(shí)走A液,沖洗整個(gè)體系;之后,pa

14、use,將A,B液換為20%乙醇continue,洗系統(tǒng);洗泵,步驟同上;洗feed 系統(tǒng);之后feed 改為 wasteF1;取下脫鹽柱;洗上樣環(huán);此時(shí)也會(huì)有柱壓過(guò)高的問(wèn)題,可能是20%乙醇內(nèi)有氣泡造成的。洗好后,end關(guān)閉所有窗口,關(guān)機(jī)。實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,必須將系統(tǒng)清洗后,才能關(guān)機(jī)。四 試劑 1 20%酒精 2 樣品:離心過(guò)濾,10000×g以上,15min3 PBS緩沖液實(shí)驗(yàn)四 雙向電泳分離植物提取蛋白一 實(shí)驗(yàn)?zāi)康恼莆针p向電泳分離蛋白技術(shù),熟悉儀器的操作使用二 實(shí)驗(yàn)原理雙向電泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE),第一向電泳等電聚焦是基于等電點(diǎn)

15、不同而將蛋白粗步分離,第二向SDS-PAGE是基于蛋白質(zhì)分子量不同,而將一向分離后的蛋白進(jìn)一步分離。這樣就可以得到蛋白質(zhì)等電點(diǎn)和分子量的信息。雙向電泳后,進(jìn)行凝膠染色,掃描圖像,利用ImageMaster 2D Platinum 6.0軟件對(duì)2-DE圖譜分析、比較。三 實(shí)驗(yàn)步驟(一)樣品制備1 提取蛋白的溶解取純化后的晶體蛋白4.0mg,加入400µl裂解液(1mg蛋白:100µl裂解液)振蕩器上振蕩溶解,然后13200rpm離心15min除雜質(zhì),取上清分裝,每管70µl,-80保存。2 Bradford法標(biāo)準(zhǔn)蛋白濃度建立測(cè)蛋白含量(見(jiàn)前)(二) 雙向電泳第一向-

16、IEF(雙向電泳中一律使用超純水)1 水化液的制備稱取2.0mg 的DTT,用700µl水化液儲(chǔ)液溶解后,加入8µl 0.05 的溴酚蘭,3.5µl(0.5v/v)IPG buffer(pH 3-10)振蕩混勻,13200rpm離心15min 除雜質(zhì),取上清。在含300µg 蛋白(經(jīng)驗(yàn)值)的樣品溶解液中加入水化液,至終體積為340µl,振蕩器上振蕩混合,13200rpm離心15min除雜質(zhì),取上清。 IPG膠條所需水化液體積膠條長(zhǎng)度(cm)每條需水化體積(µl)7125112001325018350244502 點(diǎn)樣,上膠 分兩次吸取

17、樣品,每次100µl,(11cm膠條,樣品制備液60µl,水化液140µl)按從正極到負(fù)極的順序加入點(diǎn)樣槽兩側(cè),再用鑷子撥開(kāi)Immobiline DryStrip gels(11cm,pH 3-10)膠條,從正極到負(fù)極將膠條壓入槽中,膠面接觸加入的樣品。注意:膠條使用前,要在室溫中平衡30分鐘;加樣時(shí),正極要多加樣,以防氣泡的產(chǎn)生;壓膠時(shí)不能產(chǎn)生氣泡;酸性端對(duì)應(yīng)正極,堿性端對(duì)應(yīng)負(fù)極;樣品加好后,加覆蓋油108ml,兩個(gè)上樣槽必須與底線齊平。3 IPGphor聚焦系統(tǒng)跑膠程序的設(shè)定(跑膠溫度為20) 方式一: S1(30v,12hr,360vhs,step) 50v

18、,5h,250vh S2(500v,1hr,500vhs,step) 100v,5h,500vh S3(1000v,1hr,1000vhs,step) 2000v,0.5h,1000vh S4(8000v,0.5hr, 2250vhs,Grad) 8000v,0.5h,4000vh S5(8000v,5hr,40000vhs,step) 8000v,5h,40000vh共計(jì)44110vhs, 19.5小時(shí),其中S1用于泡脹水化膠條,S2和S3用于去小離子,S4和S5用于聚焦。方式二:溫度20°C最大電流0.05 mA per IPG strip樣品體積350 l (180 mm 長(zhǎng)

19、IPG strip)電壓 時(shí)間30 V10-12 hours(水化)200 V1 hour500 V1 hour500 -> 8000 V30 min8000 V3 hours(IPG 4-7);2 hours (IPG 4-9, 3-10L, 3-10NL)共計(jì)20000vh,19h左右方式三:4 平衡使用前每10ml平衡緩沖液中加入100mg DTT (相當(dāng)于平衡緩沖液I),根據(jù)下表加入適量平衡緩沖液I和溴酚藍(lán)溶液。取出IPG膠條分別放入玻璃管中(支持膜貼著管壁,每個(gè)玻璃管中放入一條IPG膠條),用Parafilm封口,在振蕩儀上振蕩15分鐘,倒掉平衡緩沖液 I。 每10ml平衡緩沖

20、液加入400mg碘乙酰胺 (相當(dāng)于平衡緩沖液II)。根據(jù)下表加入適量平衡緩沖液II和溴酚藍(lán)溶液。用Parafilm封口,在振蕩儀上振蕩15分鐘,倒掉平衡緩沖液 II。IPG膠條平衡液用量膠條長(zhǎng)度(cm)建議平衡液體積(ml)/條溴酚藍(lán)溶液(l)7 2.5-512.5-25 115-1025-50 13 5-1025-5018 105024 1570用鑷子夾出膠條,超純水沖洗后,在濾紙上吸干(膠面,即接觸樣品那一面不能接觸濾紙,如果為18cm的膠條要將兩頭剪去),再以超純水沖洗,濾紙吸干(再次沖洗過(guò)程也可省略),然后用鑷子夾住膠條以正極端(即酸性端)向下,負(fù)極端(即堿性端)向上,放入用來(lái)平衡的試

21、管中(鑷子所夾的是堿性端,酸性端留有溴酚藍(lán)作為標(biāo)記),用平衡液A,平衡液B先后平衡15min。注:平衡時(shí)要注意保持膠面始終向上,不能接觸平衡管壁。(三)雙向電泳第二向-SDS-PAGE 1 配膠根據(jù)第一向IEF電泳時(shí)IPG膠條的大小選擇第二向合適的垂直電泳槽。Ettan DALT II 為大規(guī)模、高通量、高重復(fù)性雙向電泳第二向SDS-PAGE專門設(shè)計(jì)的垂直電泳槽。 同時(shí)進(jìn)行12塊26 x 20cm板膠電泳,適于長(zhǎng)至24cm IPG膠條。其灌膠模具每次最多可灌制14塊膠。通常不需要濃縮膠。12.5%Gel,40ml丙烯酰胺16.7ml1.5M Tris-Cl pH8.810ml10%SDS(十二

22、烷基磺酸鈉)400lAPS220lTEMED(N,N,N',N'-四甲基乙二胺)11l加水至40ml凝膠濃度與其對(duì)應(yīng)的分離范圍膠濃度分離范圍(KD)5% 36-2007.5%24-20010% 14-20012.5% 14-10015% 14-60灌制垂直SDS膠的配方10%T,2.6%C12.5%T,2.6%C15%T,2.6%C丙烯酰胺單體貯存液 33.3ml 41.7ml50ml4×分離膠緩沖液25ml25ml25ml10%SDS1ml1ml1ml去離子水40.2ml31.8ml23.5mlTEMED*33l33 l33 l過(guò)硫酸銨*(10%)500 l500

23、l500 l最終體積100ml 100ml100ml*TEMED和過(guò)硫酸銨在灌膠前再加 2 灌膠將玻璃板洗凈后,室溫晾干,然后,將電泳槽平衡好,玻璃板夾好,再在玻璃板底部涂上凡士林以防漏膠,倒入飽和的正丁醇(或乙醇)壓膠,凝膠后(這時(shí)會(huì)出現(xiàn)三條線),用注射器吸去正丁醇,超純水洗兩次,再用濾紙除水。 3 轉(zhuǎn)移用去離子水潤(rùn)洗IPG膠條一秒鐘,將膠條的邊緣置于濾紙上幾分鐘,以去除多余的平衡緩沖液。將IPG膠條放在位于玻璃板之間的凝膠面上,使膠條支持膜貼著其中的一塊玻璃板,用一薄尺將IPG膠條輕輕地向下推,使整個(gè)IPG膠條下部邊緣與SDS板膠的上表面充分結(jié)合。確保在IPG膠條與板膠之間以及玻璃板與塑料

24、支持膜間無(wú)氣泡產(chǎn)生,上面覆蓋預(yù)熱的0.5%瓊脂糖溶液2ml,使瓊脂糖在5分鐘內(nèi)凝固封膠??蛇x操作:加入分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白。平衡第二次時(shí),在沸水中煮Marker(與等體積的1%瓊脂糖溶液混合),剪兩個(gè)同樣大小的濾紙片,長(zhǎng)度與一向膠條的寬度等同,然后吸取煮好的Marker,轉(zhuǎn)入SDS-PAGE膠面上,保持緊密貼合。4 跑膠電泳槽中裝滿電泳緩沖液,并打開(kāi)溫控系統(tǒng),調(diào)節(jié)溫度為15。 設(shè)定恒定電壓或電流,Phase1:1W,1h、Phase2:10W,5h,跑電泳,共計(jì)6h。當(dāng)溴酚藍(lán)染料遷移到膠的底部邊緣即可結(jié)束電泳。跑好的膠轉(zhuǎn)移到染色盒里固定,準(zhǔn)備染色。SE600系統(tǒng)電泳參數(shù),Constant curre

25、nt,15PhaseCurrentDuration110mA per gel15 min220mA per gelApproximately 5 hEttan Dalt II系統(tǒng)電泳參數(shù),Constant power,20Phase CurrentDuration15w per gel45 min220w per gelApproximately 6 h共5-6個(gè)小時(shí)5 銀染(兩根膠條所用劑量)(銀染特別注意用超純水)(1) 固定30min 無(wú)水乙醇200ml乙酸50ml,用超純水定容至500ml。(2) 敏化30min 無(wú)水乙醇 150ml Na2S2O35H2O 1.5688g (無(wú)水:1

26、g) 無(wú)水乙酸鈉 34g (3H2O:56.4g) 戊二醛 0.65ml (現(xiàn)用現(xiàn)加) 先用水溶解Na2S2O35H2O和乙酸鈉,再加乙醇,最后定容至500ml。(3) 洗滌 5min × 3次。(4) 銀染 20min AgNO3 1.25g 用超純水定容至500ml。(5) 洗滌 1min × 2次(6) 顯影 無(wú)水Na2CO3 12.5g 用超純水定容至500ml 37甲醛 0.2ml,現(xiàn)用現(xiàn)加。(7) 終止 10min EDTA-Na22H2O 7.3g 用超純水定容至500ml。(8) 洗滌 5min × 3次。注:整個(gè)雙向電泳實(shí)驗(yàn)中全部使用超純水,盡量

27、減少離子的影響。(四)掃描電泳圖譜,用ImageMaster 2D Platinum 6.0軟件分析提取蛋白點(diǎn)結(jié)合儀器講解(五)實(shí)驗(yàn)相關(guān)試劑配制1 Bradford 工作液考馬斯亮藍(lán)G-250 10mg,溶于95%的乙醇5ml,加85%的磷酸10ml,蒸餾水加至20ml,過(guò)濾后置4保存,可用6個(gè)月。臨用前,用純水作10倍稀釋。2 裂解液(見(jiàn)前)3.水化液儲(chǔ)液(不含有IPG buffer,DTT,2.5ml)Final concentration AmountUrea(FW 60.06)8M1.2gCHAPS 2%(w/v)0.05g Bromophenol blue 0.002%(w/v)5l

28、Double distilled H2O To 2.5ml分裝貯存于-20。DTT和IPG buffer在用之前加入:每2.5ml 水化液加7mg DTT。如果膠內(nèi)上樣,則樣品液在用之前加入到2.5ml的水化液中。如果需要,尿素的濃度可以調(diào)高到9或者9.8M。4 溴酚藍(lán)儲(chǔ)液Final concentrationAmountBromophenol blue 1%100mgTris-base 50mM60mgDouble distilled H2O To 10ml5 平衡緩沖液(SDS equlibration buffer)(50mM Tris-cl pH8.8,6M Urea,30% glyc

29、erol,2% SDS,bromophenol blue,20ml)Final concentrationAmount1.5M Tris-cl,pH8.8(see solution F)50mM1mlUrea(Fw 60.06)6M7.21gGlycerol(87% v/v)30%(v/v)6.9ml(6.1ml,(99%)SDS(Fw 288.38)2%(w/v)0.4gBromophenol blue0.002%(w/v)4l 1% solutionDouble distilled H2OTo 20ml貯存于-20,這是一個(gè)貯存液,用之前在加DTT或者碘乙酰胺6 丙烯酰胺單體貯存液(30%

30、,Monomer stock solution,100ml)Final concentrationAmountAcrylamide(Fw 71.08)30%30.0gBis-acrylamide(N,N'-methylenebisacrylamide)(Fw 154.17)0.8%0.8gDouble distilled H2OTo 100ml0.45µm的濾紙過(guò)濾后儲(chǔ)存于4避光保存?zhèn)溆谩? 4×分離膠緩沖液(1.5M Tris-HCl, pH8.8,100ml)Final concentrationAmountTris-base(Fw 121.1)1.5M18.2

31、Double distilled H2O80mlHCl(Fw 36.46)Adjust to pH8.8Double distilled H2OTo 100ml用0.45微米的濾紙過(guò)濾,4可保存兩周。 8 10% SDS溶液(10ml)Final concentrationAmountSDS(Fw 288.38)10%(v/v)1.0gDouble distilled H2OTo 10 ml用0.45微米的濾紙過(guò)濾,室溫保存9 10%(w/v)過(guò)硫酸銨溶液(1ml)0.1g過(guò)硫酸銨溶于1ml去離子水中。此溶液需使用前新鮮配制。新鮮的過(guò)硫酸銨會(huì)發(fā)出“咔嚓”聲音。如果沒(méi)有聲音,則需要換新的藥品。1

32、0 電溶緩沖液(SDS electophoresis buffer,25mM Tris,192 mM glycine,0.1%SDS,5 liters) Final concentrationAmountTris base(Fw 121.1)25 mM15.1gGlycine (Fw 75.07)192mM72.1gSDS(Fw 288.38)0.1%(w/v)5.0gDouble distilled H2OTo 5000ml超純水定容5000ml,室溫保存。11 0.5瓊脂糖封膠液(Agrose sealing solution,10ml)Final concentrationAmountS

33、DS electophoresis buffer10mlAgrose (NA or M)0.5%50mgBromophenol blue0.002%(w/v)20l加熱溶解,不要超過(guò)60。附:雙向電泳簡(jiǎn)易實(shí)驗(yàn)步驟:(一)第一向等電聚焦1. 從冰箱中取-20冷凍保存的水化上樣緩沖液(不含DTT、IPG buffer)一小管(1ml/管),置室溫溶解。2. 在小管中加入0.01g DTT、 IPG buffer,各2.5ml,充分混勻。3. 從小管中取出400ml水化上樣緩沖液,加入100ml樣品,充分混勻。4. 從冰箱中取-20冷凍保存的IPG預(yù)制膠條(11cm pH 3-10),室溫中放置10

34、分鐘。5. 沿著聚焦盤或水化盤中槽的邊緣至左而右線性加入樣品。在槽兩端各1cm左右不要加樣,中間的樣品液一定要連貫。注意:不要產(chǎn)生氣泡。否則影響到膠條中蛋白質(zhì)的分布。6. 當(dāng)所有的蛋白質(zhì)樣品都已經(jīng)加入到聚焦盤或水化盤中后,用鑷子輕輕的去除預(yù)制IPG膠條上的保護(hù)層。7. 分清膠條的正負(fù)極,輕輕地將IPG膠條膠面朝下置于聚焦盤或水化盤中樣品溶液上,使得膠條的正極對(duì)應(yīng)于聚焦盤的正極。確保膠條與電極緊密接觸。不要使樣品溶液弄到膠條背面的塑料支撐膜上,因?yàn)檫@些溶液不會(huì)被膠條吸收。同樣還要注意不使膠條下面的溶液產(chǎn)生氣泡。如果已經(jīng)產(chǎn)生氣泡,用鑷子輕輕地提起膠條的一端,上下移動(dòng)膠條,直到氣泡被趕到膠條以外。8. 在每根膠條上覆蓋2-3ml礦物油,防止膠條水化過(guò)程中液體的蒸發(fā)。需緩慢的加入礦物油,沿著膠條,使礦物油一滴一滴慢慢加在塑料支撐膜上。9. 對(duì)好正、負(fù)極,蓋上蓋子。設(shè)置等電聚焦程序。10.聚焦結(jié)束的膠條。立即進(jìn)行平衡、第二向SDS-PAGE電泳,否則將膠條置于樣品水化盤中,-20冰箱保存。(二)第二向SDS-PAGE電泳1.配制10%的丙烯酰胺

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