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文檔簡介

1、DN碾取中各種實驗試劑作用原理1、STE是Tris-Hcl 、EDTA Nacl的混合液。其總體作用是為 DN砒供保護環(huán)境,在此環(huán)境下DNA可以呈穩(wěn)定態(tài),最少限度地受到破壞。Tris.HCl提供緩沖體系,DNAS這一體系中呈穩(wěn)定態(tài)。EDTA是DNAB的抑制劑,可以防止細胞破碎后DNAB降解DNANaCl,有利于DNA的溶解。2、SDS的作用:利用高濃度的陰離子去垢劑 SDS(十二烷基磺酸鈉,Sodium dodecyl sulfate )使DNA與蛋白質分離,在高溫(5565C)條件下裂解細胞,使染色體離析,蛋白變性,釋放出核酸,然后采用提高鹽濃度及降低溫度的方法使蛋白質及多糖雜質沉淀,離心后

2、除去沉淀,3、苯酚的作用:使蛋白質變性,同時抑制了DNase的降解作用。用苯酚處理勻漿液時,由于蛋白與 DNA聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。使用酚的優(yōu)點:1.有效變性蛋白質;2.抑制了 DNase的降解作用。缺點:1.能溶解10-15%的水,從而溶解一部分 poly (A) RNA 2.不能完全抑制 RNase的 活性。Tris酚的顏色,一般為黃色。如果變成粉紅色,說明被氧化,不能再用。4、氯仿的作用克服酚的缺點;加速有機相與液相分層。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的跡量酚。(酚易溶于氯仿中)5、異戊醇:減少蛋白質變性操作過程中產

3、生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從而減少氣泡產生。另外,異戊醇有助于分相,使離心后的上層含DNA的水相、中間的變性蛋白相及下層有機溶劑相維持穩(wěn)定。6、用乙醇沉淀 DNAM,為什么加入單價的陽離子?用乙醇沉淀DNAM,通常要在溶液中加入單價的陽離子,如 NaCl或NaAc, Na+中和DNA 子上的負電荷,減少 DNA分子之間的同性電荷相斥力,而易于聚集沉淀。7.為什么在保存或抽提 DNA±程中,一般采用 TE緩沖液?在基因操作實驗中,選擇緩沖液的主要原則是考慮DNA的穩(wěn)定性及緩沖液成分不產生干擾作用。磷酸鹽緩沖系統(tǒng)(pKa= 7.2)和硼酸系統(tǒng)(pKa=9.24)等雖然也都符合細胞

4、內環(huán)境的生理范圍(pH),可作DNA勺保存液,但在轉化實驗時,磷酸根離子的種類及數量將與Ca2+產生Ca3(PO4)2沉淀,在DN版應時,不同的酶對輔助因子的種類及數量要求不同,有的要求高離子濃度,有的則要求低鹽濃度,采用 Tris-HCl (pKa=8.0)的緩沖系統(tǒng),由于緩沖液是 TrisH+/Tris ,不存在金屬離子的干擾作用,故在提取或保存DNA時,大都采用 Tris-HCl系統(tǒng),而TE緩沖液中的EDT心能穩(wěn)定。8、STE是Tris-Hcl 、EDTA Nacl的混合液。其總體作用是為 DNAj供保護環(huán)境,在此環(huán) 境下DNA可以呈穩(wěn)定態(tài),最少限度地受到破壞。Tris.HCl提供緩沖體

5、系,DNAS這一體系中呈穩(wěn)定態(tài)。EDTA是DNAB的抑制劑,可以防止細胞破碎后DNAB降解DNANaCl,有利于DNA的溶解。9、SDS的作用:利用高濃度的陰離子去垢劑SDS(十二烷基磺酸鈉,Sodium dodecyl sulfate )使DNA與蛋白質分離,在高溫(5565C)條件下裂解細胞,使染色體離析,蛋白變性, 釋放出核酸,然后采用提高鹽濃度及降低溫度的方法使蛋白質及多糖雜質沉淀,離心后除去沉淀,10、苯酚的作用:使蛋白質變性,同時抑制了DNase的降解作用。用苯酚處理勻漿液時,由于蛋白與 DNA聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶。蛋白分子 溶于酚相,而DNA溶

6、于水相。使用酚的優(yōu)點:1.有效變性蛋白質;2.抑制了 DNase的降解作用。缺點:1.能溶解10-15%的水,從而溶解一部分 poly (A) RNA 2.不能完全抑制 RNase的 活性。Tris酚的顏色,一般為黃色。如果變成粉紅色,說明被氧化,不能再用。11、氯仿的作用克服酚的缺點;加速有機相與液相分層。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的跡量酚。(酚易溶于氯仿中)5、異戊醇:減少蛋白質變性操作過程中產生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從而減少 氣泡產生。另外,異戊醇有助于分相,使離心后的上層含DNA的水相、中間的變性蛋白相及下層有機溶劑相維持穩(wěn)定。12、用乙醇沉淀 DNA寸,為什么加入單價的

7、陽離子?用乙醇沉淀DNAM,通常要在溶液中加入單價的陽離子,如 NaCl或NaAc, Na+中和DNA子上的負電荷,減少 DNA分子之間的同性電荷相斥力,而易于聚集沉淀。Tris中文品名:三羥甲基氨基甲烷;氨基丁三醇;緩血酸胺nh2 八。HHO,Tris結構式英文品名:Tris; Tris(Hydroxymethyl)aminomethane英文別名:2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol THAM; Tris base; Trometamol通用 CAS : 77-86-1產品純度:100%(USP藥典級)/ 99.9%(實驗室技術級)產品級別:U

8、SP藥典級,符合USP/EP/cGMP寸藥物賦形劑的要求分子式:NH2c(CH2OH)3分子量:121.14使用用途:生物制藥,體外診斷,個人護理及化妝品原料等保存溫度:常溫密封避光保存TRIS是一種最常用的生物緩沖液,常配成PH值為6.8, 7.4 , 8.0 , 8.8。其PH值隨溫度變化很大。一般來說,溫度每升高一度,PH值下降0.03。1M TRIS-HCl 6.8 和 1.5M TRIS-HCl 8.8 是 SDS-PAGEt常用的試劑。而由TRIS配成的TAE, TBE等是DNA電泳最常用的試劑,TE ( PH8.0)主要用于溶解 DNATE 為 Tris 力口 EDTA稱。緩沖特

9、性:Tris為弱堿,在室溫(25C)下,它的 晅為8.1 ;根據緩沖理論,Tris緩沖 液的有效緩沖范圍在 pH7.0到9.2之間。Tris堿的水溶液pH在10.5左右,一般加入鹽酸 以調節(jié)pH值至所需值,即可獲得該pH值的緩沖液。但同時應注意溫度對于Tris的pKa的影響。衍生緩沖液:由于Tris緩沖液為弱堿性溶液,DNA在這樣的溶液中會被去質子化,從而提高其溶解性。人們常常在Tris鹽酸緩沖液中加入 EDTA制成“TE緩沖液:TE緩沖液被用于DNA勺穩(wěn)定 和儲存。如果將調節(jié)pH值的酸溶液換成乙酸,則獲得“TAE緩沖液” (Tris/Acetate/EDTA ), 而換成硼酸則獲得“ TBE緩沖液” (Tris/Borate/EDTA )。這兩種緩沖液通常用于核酸電泳 實驗中。制備:Tris 可以由兩步反應生成:先由硝基甲烷生成中間體三羥甲基硝基甲烷 (HOCH2)3CNO2,然后再由該中間體還原得到Tris 。用途:Tris緩沖液不僅被廣泛用作核酸和蛋白質白溶劑,還有許多重要用途。

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