膜蛋白的提取與分離_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、膜蛋白的提取與分離膜蛋白的分離一、簡(jiǎn)介:1細(xì)胞質(zhì)膜資料1895年,Overton從研究細(xì)胞透性得出"細(xì)胞膜由連續(xù)的脂類物質(zhì)組成H。1925年Gorter&Grendel:用脂單分子膜技術(shù)測(cè)定細(xì)胞膜中脂分子的總面積,提出:"細(xì)胞膜是由雙層脂分子組成"。1935年Danielli&Davson :從測(cè)定膜的表面張力得出細(xì)胞膜的"三明治結(jié)構(gòu)模型",即蛋白質(zhì)一脂-蛋白質(zhì)。1959年Robertson:用電鏡觀察生物膜提出"單位膜模型",將膜的分子結(jié)構(gòu)與超微機(jī)構(gòu)統(tǒng)一起來厚度:2(暗)+3.5(亮)+2 (暗)=7.5細(xì)

2、胞質(zhì)膜的主要功能概括如下:(1) 為細(xì)胞的生命活動(dòng)提供相對(duì)穩(wěn)定的內(nèi)環(huán)境;(2) 選擇性的物質(zhì)運(yùn)輸,包括代謝底物的輸入與代謝產(chǎn)物的排除,其中伴隨著能量的傳遞;(3) 提供細(xì)胞識(shí)別位點(diǎn),并完成細(xì)胞內(nèi)外信息跨膜傳遞;(4) 為多種酶提供結(jié)合位點(diǎn),使酶促反應(yīng)高效而有序地進(jìn)行;(5) 介導(dǎo)細(xì)胞與細(xì)胞、細(xì)胞與基質(zhì)之間的連接;質(zhì)膜參與形成具有不同功能的細(xì)胞表面特化結(jié)構(gòu)。2膜蛋白雖動(dòng)物細(xì)胞主要有9種膜脂,而膜蛋白的種類繁多,多數(shù)膜蛋白分子數(shù)目較少,但卻賦予細(xì)胞膜非常重要的生物學(xué)功能。根據(jù)膜蛋白分離的難易及其與脂分子的結(jié)合方式,膜蛋白可分為兩大 類型:外在膜蛋白、內(nèi)在膜蛋白。(1) 外在膜蛋白為水溶性蛋白,靠離

3、子鍵或其它較弱的鍵與膜表面的蛋 白質(zhì)分子或脂分子結(jié)合,因此只要改變?nèi)芤旱碾x子強(qiáng)度甚至提高溫度 就可以從膜上分離下來,膜結(jié)構(gòu)并不被破壞。(2) 內(nèi)在膜蛋白與膜結(jié)合非常緊密,一般講只有用去垢劑(detergent)使膜解后才可分離出來。獲得大量有生物學(xué)活性的質(zhì)膜蛋白對(duì)我們顯得非常的重要。附注:使用分級(jí)抽提方法獲得的膜蛋白”中只有很少一部分是具備多跨膜區(qū)的整和膜蛋白,膜蛋白,到目前為止,仍然是蛋白組學(xué)的一個(gè) 瓶頸,不管采用2D技術(shù)也好,ICAT乃至 proein microarray都 還不能有效解決這一問題。_、蛋白抽提三、談及蛋白分離,我們想到:超速離心,鹽析法、超濾法、凝膠過 濾法、等電點(diǎn)沉淀

4、法、離子交換層析、親和層析、吸附層析、逆流分 溶、酶解法有時(shí)這些方法常常組合到一起對(duì)特定的物質(zhì)進(jìn)行分離 純化。由于蛋白質(zhì)種類繁多,不同的蛋白質(zhì)由于結(jié)構(gòu)和組成的差異, 其溶解度也各不相同.根據(jù)蛋白質(zhì)的溶解特性,同時(shí)可選擇不同的溶劑 提取,分為水溶液提取和有機(jī)溶劑提取.四、但是針對(duì)膜蛋白的提取與細(xì)胞質(zhì)蛋白,核蛋白提取不同之處在于 它是嵌在膜中的,水溶性不好,基本方法就是用不同的離心速度去掉 胞質(zhì)蛋白等,最后用去污劑把蛋白從膜中釋放出來。膜蛋白分離純化 的重要步驟是選擇適當(dāng)?shù)脑鋈苡帽砻婊钚詣话愠S玫挠心懰猁}, CHAPS一種離子去污劑),Emulgen和Lubrol等表面活性劑。五、1、分離膜蛋

5、白的方法(原則性):六、1)先分離膜,然后提?。蝗邕x用冷熱交替法、反復(fù)凍融法、超聲 破碎法、玻璃勻漿法、自溶法和酶處理法使得細(xì)胞破碎,然后通過剃 度離心得到含有膜蛋白的粗組分。(例如:michaelll液氮研磨組織, 加入勻漿緩沖液及蛋白酶抑制劑。差速離心。蔗糖密度梯度離心。收集37%與41%間的成分,即為質(zhì)膜部分。裂解即可收集膜蛋白)七、2)用特殊的去污劑選擇性的分離。從膜上提取蛋白有許多困難在多數(shù)情況下,都是米用去垢劑將疏水蛋白從其膜結(jié)構(gòu)中溶解下來, 然后將蛋白質(zhì)穩(wěn)定去垢劑的選擇通常是依據(jù)他對(duì)所需要蛋白質(zhì)的提 取效率來確定,但在某些情況下,還要考慮到以后的純化步驟雖然許多膜蛋白必須在去垢劑

6、存在的情況下進(jìn)行純化,但最終仍可能需要除 去去垢劑.這常常會(huì)引起蛋白質(zhì)失活,但如果蛋白質(zhì)是用于測(cè)序的,他 將不是一個(gè)問題如果不是用于測(cè)序的,可考慮使用能夠黏附去垢劑的 疏水珠.許多文獻(xiàn)和生化試劑供應(yīng)商的產(chǎn)品目錄中,都介紹有許多種不同的可用來溶解膜蛋白的去垢劑然而,他們并不是普遍適用的在設(shè)計(jì) 膜蛋白溶解方案時(shí),必須考慮某一去垢劑的特殊性質(zhì).如trit on X-100在280nm處有吸收,如果某蛋白質(zhì)的測(cè)試與280nm處的吸收有關(guān),就 應(yīng)避免使用這類去垢劑.八、將膜制劑與胞質(zhì)蛋白及細(xì)胞核分離后,再進(jìn)一步從細(xì)胞膜制劑中 將所需的膜蛋白增溶下來.這種做法的好處是可以用強(qiáng)烈的去垢劑提 取細(xì)胞骨架的相關(guān)

7、蛋白,而無需考慮胞質(zhì)蛋白、細(xì)胞核成分或染色質(zhì) 成分的混入.使用這種方法所獲得的膜蛋白,無論在種類上還是數(shù)量上,都比酸溶解法所得到的蛋白(5000Da )要多一般提取的膜蛋白 量往往只占膜蛋白總量的不足0.1%,所以充分的膜蛋白的提取,無疑 對(duì)于研究膜蛋白的結(jié)構(gòu)和功能都是非常重要的.第二種方法簡(jiǎn)單,可靠,但有時(shí)含有其他蛋白。一般的都是利用4度時(shí)所有的蛋白質(zhì)原則上 都溶于Trit on X114水溶液,在溫度超過20度時(shí),此溶液分為水相和去 污相;此時(shí)親水性蛋白溶于水相,疏水的膜蛋白溶于去污劑相中。利 用此性質(zhì)可提取膜蛋白。九、3)膜蛋白色譜(Chromatography of MembraneP

8、rotei n, CMP)CMP+分離強(qiáng)疏水性蛋白、多肽混合物的層析系統(tǒng),一般 有去垢劑(如SDS)溶解膜蛋白后形成SDS-融膜蛋白,并由羥基磷灰 石為固定相的柱子分離純化。羥基磷灰石柱具有陰離子磷酸基團(tuán)(P-端),又具有陽(yáng)離子鈣(C-端),與固定相結(jié)合主要決定于膜蛋白的大 小、SDS結(jié)合量有關(guān)。利用原子散射法研究 CAMP的分離機(jī)制發(fā)現(xiàn), 樣品與SDS結(jié)合后在離子交換柱上存在 SDS分子、帶電荷氨基酸與固 定相中帶電離子間的交換,從而達(dá)到分級(jí)分離的目的。十、層析柱提?。▍⒉襟E)十二、4)順序抽提法:根據(jù)細(xì)胞蛋白溶解性的差異,用具有不同溶解 能力的蛋白溶解液進(jìn)行抽提的方法。用Tris堿溶液裂解

9、細(xì)胞提取高溶解性蛋白;把未溶解的pellet用標(biāo)準(zhǔn)液溶解提取高疏水性蛋白;最后 用含復(fù)合表面活性劑的蛋白溶解液,最后可以再次抽提前兩次抽提后 不能溶解的膜蛋白。十三、5)centrifugal protein extraction離心的CellsTriB extractionlOmin vortex, 40 ntervals sonificationIcentrifuge10miai2p000g, 25°CIIcytosolpelletUrea/Thiourea extraction10min vortex. 40 intervals sonificatiancentnfugepel

10、letWmin, 12.000g, 25°Cmembrane fraction 原理:高滲的蛋白裂解液讓細(xì)胞溶漲破裂后,超高速離心評(píng)價(jià):盡管分級(jí)(胞漿和胞膜)之間有清洗的步驟,但是可溶蛋白組分和 膜蛋白組分之間仍然有不少重復(fù)的點(diǎn)該方法相較MOLLOY MP教授在 1998年electrophoresis上發(fā)表的分級(jí)抽提法減去了第一步(用tris抽提 水溶性蛋白)和最后一步(極難溶蛋白),在操作上也作了簡(jiǎn)化,總而言之 是一種不錯(cuò)的方法。(codegreen)6)detergent- based :提取時(shí)先裂解液裂胞膜(選用不同的去污試劑是 關(guān)鍵),梯度離心分離細(xì)胞器(ER),然后分級(jí)抽

11、提方法。例如,去掉 細(xì)胞器之后的DEBRIS就是核膜,再裂解得到核膜蛋白。而膜蛋白是 裂胞膜時(shí)不溶的部分??偟母惺埽杭?xì)胞的量要很充足。之后的定性鑒定常用的方法有雙向免 疫擴(kuò)散、免疫電泳及聚丙稀酰胺凝膠電泳等。純化蛋白質(zhì)濃度的定量 測(cè)定可用雙縮脲法、酚試劑法或紫外光吸收法定量鑒定膜蛋白,方便 迅速。到目前為止,提取膜蛋白仍然是蛋白學(xué)的一個(gè)瓶頸。2、分離膜蛋白的方法(操作)1)分離細(xì)胞膜蛋白的方法:1冰上刮下細(xì)胞后將細(xì)胞溶于有蛋白酶抑制劑的緩沖液A中,于室溫與液氮罐中反復(fù)凍融2次。2 5000轉(zhuǎn)4度離心,驅(qū)除核及未裂解的細(xì)胞。3取上清12000轉(zhuǎn)4度離心10分鐘取沉淀溶于有蛋白酶抑制劑的緩沖液4

12、12000轉(zhuǎn)4度離心10分鐘取沉淀溶于有蛋白酶抑制劑的緩沖液C中提取后測(cè)蛋白濃度,SDS-PAGE電泳,分裝后-20度保存?zhèn)溆?。bufferA:1mMkcl,5mMNacl,3mMMgcl2,50mMHepes,1mMDTT,0.5ug/ml Leupept in, 20uM pmsf(PH=7.4)bufferB:1mMkcl,5mMNacl,3mMMgcl2,50mMHepes,1mMDTT,0.5ug/ml Leupept in, 20uM pmsf(PH=7.4) 1mM EGTAbuffer C : 0.5ug/ml Leupept in, 20uM pmsf,50mMTris-cl

13、(PH=7.0),2) 分離細(xì)胞膜蛋白的方法:1、細(xì)胞放在冰上,去除上清,用 pH7。4的冷磷酸鹽緩沖液洗滌單層 細(xì)胞兩次2、加入 1ml2%TritonX 溶液冰浴 15min3、刮下單層細(xì)胞,4度下10 000g 5min離心4、 溶液37度水浴10min以分離水相和去污劑相,然后37度下2 000g離心5min5、收集水相留作分析6、用500ul冰冷的buffer C溶解去污劑相沉淀,冰浴2min后加溫, 在按步驟6再次離心7、 按步驟8再次抽提去污劑相,用buffer C將洗滌后的去污劑相稀釋 到初始體積&用等量的buffer A分別稀釋水相與去污相,并進(jìn)行免疫沉淀實(shí)驗(yàn) 試劑:

14、1、 2%tritonX114:2%TritonX114 、50mmol/L Tris HCI (pH7。5 )、蛋白酶抑制劑2、緩沖液 A (含0。 5mol/LNaCI 的 RIPA buffer )3、buffer C10mmol/L Tris HCI(pH7.5)150mmol/L NaCl5mmol/L EDTA(PH7.5)3) 分離細(xì)胞膜蛋白的方法:7M urea2M thiourea4%chaps2.5%sb3-101000000個(gè)細(xì)胞,可用此buffer 1ml。冰浴勻漿。冰上置30分鐘。4度高速低溫離心30min。取上清-20保存。4) 分離組織膜蛋白的方法:1、取組織,加

15、入10ml Buffer A于冰上充分勻漿。2、J6-HC離心機(jī)800rpm , 4C離心10min后,所得上清液轉(zhuǎn)入超速離 心管。3、 100000g , 4C離心1hr。棄去上清,沉淀用適量的 Buffer B重懸, 冰上孵育2hr后分裝至EP管,Eppendorf臺(tái)式離心機(jī)10000rpm , 4C離心30min。4、收集所得上清液即為膜組份。Buffer A : 0.32M 蔗糖,5mM Tris-HCI (PH 7.5) , 120mM KCI, 1mMEDTA,1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupept in, 1ug/ml PepstatinA, 1

16、ug/ml Aprotinin。冰上預(yù)冷。Buffer B : 20mM HEPES( PH 7.5),10% 甘油,2% Trit on X-100, 1mMEDTA, 1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/mlPepstatin A, 1ug/ml Aproti nin 。冰上預(yù)冷。5)分離組織膜蛋白的方法:RIPA1XPBS1%NP400.5去氧膽酸鈉0.1%SDS以下用時(shí)加入10mg/ml PMSF 異丙醇(終濃度 10ul/ml)Aprotinin ( 30ul/ml)1000mM Sodium Orthovandate ( 10ul

17、/ml)冰凍組織100mg/細(xì)胞1000000個(gè),可用RIPA buffer 1ml。冰浴勻漿。冰上置30分鐘。4度高速離心30min,20000轉(zhuǎn)低溫離心最佳。取上清-20保存。6)分離細(xì)菌膜蛋白的方法: 于20ml營(yíng)養(yǎng)肉湯中過夜培養(yǎng)細(xì)菌,37C, 200rpm。 10000g、20min、4C離心,去上清。 20ml預(yù)冷的Tris-Mg緩沖液重懸,同樣條件離心,再重懸于預(yù)冷的Tris-Mg緩沖液。 超聲波破碎細(xì)菌。 3000g , 10min、室溫下離心去除未破碎細(xì)菌。小心吸取上清(含有 胞質(zhì)成分和細(xì)菌外被成分)。 超速離心I : 100,000g , 60min , 4C,去除上清(胞質(zhì)

18、成分),收 集細(xì)菌外被成分。 用10ml含2 %的SLS的Tris-Mg緩沖液重懸沉淀物,室溫溫育20-30min。 超速離心II : 70,000g , 60min,室溫沉淀收集外膜蛋白,去除上清 (含細(xì)胞質(zhì)膜)。重復(fù)、兩步。 充分吸除上清,并根據(jù)沉淀體積大小用0.1-0.2 ml的ddH2O重懸沉淀物。根據(jù)公式:蛋白濃度(mg/ml)=1.450 D280-0.740 D260 測(cè)定外膜蛋白濃度,調(diào)節(jié)蛋白濃度至40ug/ul,該蛋白質(zhì)樣品-70 C貯存。 試劑Tris-Mg緩沖液10mM Tris-Cl5mM MgCl2pH 7.3 , 4C保存2%(w/v)十二烷基肌氨酸鈉(SLS)7)

19、 來源于 Methods Enzymology (1974)1. 取一定量酶處理的細(xì)胞,用勻漿器破碎,操作要溫和,使細(xì)胞膜保 持完整。由于水與膜的疏水部分之間有反應(yīng),因此要精確掌握分離介 質(zhì)中的離心強(qiáng)度和滲透壓,以每克細(xì)胞濕重加 40ml介質(zhì)。2. 用 Potter-Elvehiem 勻漿器,桿與壁間間隙 0.50.6 g,14.4kr/min 上下勻漿46次,每次5S。3. 過濾勻漿液,150g離心10min,保留上清,沉淀部分加入50 “介 質(zhì),用勻漿器1kr/min勻漿3次,150g離心10min,沉淀部分再加入上 次勻漿的上清液。4. 合并3次上清液,2kg離心10min,棄上清,沉淀

20、部分溶于100 “介 質(zhì),離心10min,棄上清,留沉淀。5 .將沉淀部分加入70%蔗糖15份,然后分別置于三個(gè)離心管中,上面依次疊加54%、49%、45% , 41% , 37%蔗糖溶液各2、2、5、5、 3份。6. 700kg離心90min,分離介質(zhì)在1.161.18之間形成介面。7. 收集d為1.161.18g/ml之間的細(xì)胞膜,加30倍的介質(zhì)以2.5kg 離心10min,洗滌2次。8. 保存于2.7mmol/L Tris-HCl pH7.5緩沖液中,用于細(xì)胞膜的研究分 析8) 常用的制備粗制質(zhì)膜組分的方法:(所有操作都在4攝氏度下進(jìn)行)1. 在冰冷的勻漿緩沖液中切碎組織塊,倒出血水。用

21、勻漿緩沖液漂洗組織碎塊,并將它們置于冰上,重復(fù)上述操作,直至組織碎成1mm3大小的碎片,且無可見的血。2. 加入5倍(體積比)與組織塊體積的緩沖液,再置于冰浴的Dou nee氏玻璃勻漿器中,抽研10-20次,勻漿組織。3勻漿4攝氏度600g離心10min,上清含細(xì)胞膜、線粒體和細(xì)胞溶膠。 沉淀中有未破碎的細(xì)胞及細(xì)胞核。棄沉淀。4上清4攝氏度8000g離心10min,沉淀線粒體。棄沉淀。5. 上清4攝氏度10000g離心20min,棄上清。6. 用勻漿緩沖液重懸沉淀,繼續(xù)勻漿,再次4攝氏度,10000g離心20min,棄上清。7. 用小體積的適宜緩沖液重新徹底勻漿沉淀。8. 粗制的樣品可于干冰/乙醇中速凍,保存于-80攝氏度。9)用特殊的去污劑選擇性的分離。簡(jiǎn)單,可靠,但有時(shí)

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