常用的生物信息學(xué)網(wǎng)址大全

1、常用的生物信息學(xué)網(wǎng)址大全，非常全面      時(shí)間：2006-12-26 13:42:58來(lái)源： 點(diǎn)擊：3398 用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和分析工具網(wǎng)址  數(shù)據(jù)庫(kù)  因特網(wǎng)網(wǎng)址  網(wǎng)上生物信息學(xué)教程 EMBL biocomputing tutorials  http:/www.bio.cam.ac.uk/Embnetut/Gcg/index.html Plant genome dababase tutorial  /pgdic  生物信息學(xué)機(jī)構(gòu)  NCBI

2、 /  International Nucleotide Sequence Database Collaboration.  /collab/ EBI  http:/www.ebi.ac.uk/ USDA  / Sanger Centre  http:/genomic.sanger.ac.uk/ 北京大學(xué)生物信息學(xué)中心    數(shù)據(jù)庫(kù)信息發(fā)布及其它  GenBa

3、nk Release Notes  /genbank/gbrel.txt  dbEST summary report  /dbEST/dbESTsummarv.html  EMBL release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?embl  DDBJ release notes  http:/www.ddbj.nig.ac.jp/ddbjnew/ddbj relnot

4、e.html  Eukaryotic promoter database release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget/dbget2.html  SwissProt release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?swissprot  PIR release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pir  PRF release notes  htt

5、p:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?prf  PDBSTR release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pdbstr  Prosite release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?prosite  PDB release notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pdb  KEGG rele

6、ase notes  http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pathway  核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù)  GenBank  /  dbEST  /dbEST/index.html  dbSTS  /dbSTS/index.html dbGSS  /dbGSS/ind

7、ex.html  Genome (NCBI)  /Entrez/Genome/org.html  dbSNP  /SNP/  HTGS  /HTGS/  UniGene  /UniGene/ EMBL核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù)  http:/www.ebi.ac.uk/embl Genome (EBI)  

8、;http:/www.ebi.ac.uk/genomes/ 向EMBL數(shù)據(jù)庫(kù)提交序列  http:/www.ebi.ac.uk/embl/Submission/webin.html DDBJ  http:/www.ddbj.nig.ac.jp/ Plant R gene database  /rgenes  啟動(dòng)子數(shù)據(jù)庫(kù)  Eukaryotic promoter database  http:/www.epd.isb-sib.ch  http:/www.genome.ad.jp/dbget

9、/dbget2.html  轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(kù) FRANSFAC  http:/transfac.gbf.de ooTFD   蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù) SWISS-PROT或TrEMBL  http:/www.ebi.ac.uk/swissprot/  http:/www.expasy.ch/sprot/ PIR  /pir/ PRF  http:/www.prf.or.jp/ PDBSTR  http:/www.genome.ad.j

10、p/dbget-bin/www bfind?pdbstr-today Prosite  http:/www.expasy.ch/sprot/prosite.html  結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù) PDB  /pdb   NDB  /NDB/ndb.html  / DNA-Binding Protein Database  http:/ndbserver.rutger

11、/NDB/structure-finder/dnabind/index.html NMR Nucleic Acids Database  /NDB/structure-finder/nmr/index.html Protein Plus Database  /NDB/structure-finder/protein/index.html Swiss 3Dimage  http:/www.expasy.ch/sw3d/ SCOP  http

12、:/scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/ CATH  http:/www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/ 酶、代謝和調(diào)控路徑數(shù)據(jù)庫(kù) KEGG  http:/www.genome.ad.jp/kegg/kegg2.html Enzyme Nomenclature Database  http:/expasy.hcuge.ch/sprot/enzyme.html Protein Kinase Resource (PKR)  /kinases/ LIGAND  http:

13、/www.genome.ad.jp/dbget/ligand.html WIT  /WIT/ EcoCyc  http:/ecocyc.PangeaS UM-BBD  /umbbd/  多種代謝路徑數(shù)據(jù)庫(kù)  /stc-95/ResTools/biotools/biotools8.html  基因調(diào)控路徑數(shù)據(jù)庫(kù)(TRANSPATH)  http:/transfac.gbf.de  基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

14、日本水稻基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(RGP)  http:/rgp.dna.affrc.go.jp 華大水稻基因組框架圖   歐洲水稻測(cè)序（第12染色體）  s.fr 擬南芥基因組數(shù)據(jù)庫(kù)   USDA Database  / Demeters Genomes   RiceGenes  /cgi-bin/WebAce/webace?db=ricegene

15、s RiceBlastDB  /cgi-bin/WebAce/webace?db=riceblastdb FlyBase  /.bin/fbidq.html?FBgn0003075 Mouse Genome Informatics  /bin/query_accession?id=MGI:97555 Saccharomyces Genome Database  http:/genome-www

16、./cgi-bin/dbrun/SacchDB?find+Locus+%22PGK1%22 多種基因組數(shù)據(jù)庫(kù)  http:/www.hgmp.mrc.ac.uk/GenomeWeb 文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù) PubMed  /PubMed/ OMIM  /Omim/ Agricola  /ag98/  關(guān)鍵詞為基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)庫(kù)檢索 Entrez  http:/www.ncbi.nlm

17、./Entrez/ Entrez Nucleotide Sequence Search  /Entrez/nucleotide.html Entrez Protein Sequence Search  /Entrez/protein.html Batch Entrez  /Entrez/batch.html Sequence Retrieval System, India  http:/

18、bioinfo.ernet.in:80/srs5/ Sequence Retrieval System, Singapore  .sg:80/srs5/ Sequence Retrieval System, US  :80/srs/srsc Sequence Retrieval System, UK  http:/srs.ebi.ac.uk/ GetEntry Nucleotide & Protein Sequence Search  http:/ft

19、p2.ddbj.nig.ac.jp:8000/getstart-e.html Database Search with Key Words  http:/ftp2.ddbj.nig.ac.jp:8080/dbsearch-e-new.html DBGET/LinkDB  http:/www.genome.ad.jp/dbget/dbget2.html  序列為基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)庫(kù)檢索 BLAST  /BLAST/ FASTA  http:/www2.ebi.ac.uk/fasta3/ BLITZ &#

20、160;http:/www2.ebi.ac.uk/bicsw/ SSearch  rs.fr/bin/ssearch-guess.cgi Electronic PCR  /STS/ Proteome analysis  http:/www.ebi.ac.uk/proteome/  多序列分析 Clustal multiple sequence alignment  :9331/multi-align/Options/clustalw. ht

21、ml BCM  :9331/multi-align/multi-align.html EBI ClustalW analysis  http:/www.ebi.ac.uk 系譜分析 PAUP  /PAUP/ EBI ClustalW analysis  http:/www.ebi.ac.uk GCG package   PHYLIP  /phylip.html MEGA/

22、METREE  /imeg Hennig86  /mes/hennig/software.html GAMBIT  /mcdbio/Faculty/Lake/Research/Programs/ MacClade  /macclade/macclade.html Phylogenetic analysis  /stc-95/Res

23、Tools/biotools/biotools2.html  基因結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析 GENSCAN  /GENSCAN.html GeneFinder  http:/genomic.sanger.ac.uk/gf/gf.shtml   Gene Feature Searches  :9331/ Grail  /Grail-1.3/ GrailEXP  http:/grail.lsd.ornl.g

24、ov/grailexp/ GeneMark  /GeneMark/hmmchoice.html Veil  /labs/compbio/veil.html AAT  /aat.html GENEID  http:/www.imim.es/GeneIdentification/Geneid/geneid_input.html Genlang  

25、/sdong/genlang_home.html GeneParser  /eesnyder/GeneParser.html Glimmer  /labs/compbio/glimmer.html MZEF  /genefinder Procrustes  /software/procrustes/  蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析 Expasy  http:/www.expasy

26、.ch/ Predicting protein secondary structure  :9331/pssprediction/pssp.html Predicting protein 3D Structures  http:/dove.embl-heidelberg.de/3D/ Predicting protein structures  :9331/seq-search/struc-predict.html  其它分析工具和軟件 Putat

27、ive DNA Sequencing Errors Check  http:/www.bork.embl-heidelberg.de/Frame/ MatInspector  http:/www.gsf.de/cgi-bin/matsearch.pl FastM  http:/www.gsf.de/cgi-bin/fastm.pl Web Signal Scan  http:/www.dna.affrc.go.jp/htdocs/sigscan/signal.html BCM Search Launcher  :9331/seq-util/seq-util.html Webcutter   Translate DNA to protein  http:/www.expasy.ch/tools/dna.html ABIM  http