生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)調(diào)查分析及其利用研究

1、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)調(diào)查分析及其利用研究胡德華,張潔,方平3(中南大學(xué)醫(yī)學(xué)技術(shù)與情報(bào)學(xué)院醫(yī)藥信息系,湖南長(zhǎng)沙410078摘要:從生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)利用的角度調(diào)查分析生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的現(xiàn)狀,為我國(guó)科研人員利用網(wǎng)上生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)以及生物信息中心的開發(fā)提供科學(xué)依據(jù)和參考價(jià)值。研究采用網(wǎng)上調(diào)查的方法,對(duì)法國(guó)生物信息中心In fobiogen 建立維護(hù)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)目錄DBcat 中收錄的511個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行調(diào)查統(tǒng)計(jì),分析其類型分布、國(guó)家分布、更新頻率和獲取方式;在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步利用歐洲分子生物學(xué)信息網(wǎng)(E M Bnet 中30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)利用現(xiàn)狀進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

2、;調(diào)查分析;生物信息學(xué)中圖分類號(hào):TP392;Q81114文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:B 文章編號(hào):1672-5565(2005-01-0022-04收稿日期:2004-08-09;修回日期:2004-10-02作者簡(jiǎn)介:胡德華(1972-,男,畢業(yè)于中南大學(xué)生物醫(yī)學(xué)信息專業(yè),碩士學(xué)位,在讀博士,講師,主要從事生物信息學(xué)研究,發(fā)表論文30余篇,出版教材專著6部。3通訊作者簡(jiǎn)介:方平(1946-,畢業(yè)于武漢大學(xué)圖書館學(xué)系,教授,碩士生導(dǎo)師,主要從事情報(bào)檢索、情報(bào)檢索語(yǔ)言研究。I nvestigate and analyze the bioinformatics databases and their utili

3、zationH U De -hua ,ZH ANGJie ,FANG Ping(Medical Information Development ,Medical Technology and Information ,Center South University ,Hunan Changsha ,410083,P 1R 1China Abstract :T o investigate and analysis the present situation of bioin formatics databases from the view point of their utilization

4、,and to provide evi 2dences and suggestions for the utilization of bioin formatics databases and the development of bioin formatics centers.T otal 511bioin formatics databases were investigated from DBcat developed by in fobiogen in French ,and analyzed their types ,their distributions of country ,u

5、pdate fre 2quency and the available ways.On this base ,The current utilizations of bioin formatics databases of 30national nodes operated by the European M olecular biology netw ork (E M Bnet were studied.K ey w ords :bioin formatics database ;investigation and analysis ;bioin formatics生物信息學(xué)是一門新興的邊緣

6、交叉學(xué)科,它是將信息技術(shù)應(yīng)用到生命科學(xué)的重大前沿研究領(lǐng)域,是當(dāng)今國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn)1。隨著人類基因組計(jì)劃的順利實(shí)施,生物基因組學(xué)的飛速發(fā)展,特別是2000年6月科學(xué)家宣布人類基因組草圖已經(jīng)繪制完成,人類基因組計(jì)劃進(jìn)入后基因組時(shí)代,生命科學(xué)的研究面臨著嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)2,即如何更有效地進(jìn)行巨量生物信息數(shù)據(jù)的檢索與獲取、綜合與分析應(yīng)用。掌握各種生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的使用已成為生物學(xué)和醫(yī)學(xué)工作者的迫切需要。尤其是三大核心生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù):G enBank 核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)3、SWISS -PROT 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)4和PDB 生物大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)5,不僅是全世界從事生命科學(xué)研究的科研人員獲取序列、結(jié)構(gòu)和其他信息的

7、基本來(lái)源,也是他們發(fā)表序列或結(jié)構(gòu)測(cè)定結(jié)果的重要媒介。1調(diào)查對(duì)象與方法1.1調(diào)查對(duì)象本研究以法國(guó)生物信息中心In fobiogen 建立、維護(hù)的生物信息目錄DBcat 和歐洲分子生物學(xué)信息網(wǎng)(E M Bnet 中30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)中的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)為調(diào)查對(duì)象。DBcat 創(chuàng)建于1997年,1999年和2000年連續(xù)兩次在核酸研究報(bào)道過(guò)6,7,目前其收錄生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)500多個(gè)。該目錄是分子生物學(xué)家獲取生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的重要途徑。E M Bnet 始建于1988年,后來(lái)逐步發(fā)展成世界級(jí)的分子生物學(xué)信息網(wǎng),目前已有30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)和10個(gè)專業(yè)節(jié)點(diǎn)8。成員國(guó)節(jié)點(diǎn)由各國(guó)政府指定,托管提供生生物信息學(xué)C

8、hina Journal of Bioin formatics 技術(shù)與方法物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)、軟件和在線服務(wù)、用戶支持和用戶培訓(xùn),承擔(dān)本國(guó)的生物信息學(xué)的研究開發(fā)8。因此成員國(guó)節(jié)點(diǎn)代表著一個(gè)國(guó)家生物信息學(xué)研究開發(fā)和提供服務(wù)的水平。以DBcat和E M Bnet30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)作為調(diào)查對(duì)象的來(lái)源具有較好的代表性、完整性和可靠性。1.2調(diào)查內(nèi)容及方法(1生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的類型分布:將DBcat( http:/w w w.in fobiogen.fr/services/dbcat/中收錄的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)按照其信息內(nèi)容進(jìn)行歸類,探討數(shù)據(jù)庫(kù)當(dāng)前的發(fā)展現(xiàn)狀。(2生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的國(guó)家分布情況:統(tǒng)計(jì)DBcat中

9、所收錄的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的國(guó)家分布情況,探討各個(gè)國(guó)家開發(fā)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的現(xiàn)狀,進(jìn)而反映生物信息學(xué)在各國(guó)的發(fā)展?fàn)顩r。(3生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)更新:統(tǒng)計(jì)DBcat中所收錄的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的更新情況,探討生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的更新頻率,反映數(shù)據(jù)庫(kù)提供信息的新穎程度。(4生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的獲取方式:統(tǒng)計(jì)DBcat 中所收錄的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的獲取方式,探討獲取生物信息數(shù)據(jù)途徑和方法以及難易程度。(5各國(guó)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的利用狀況:統(tǒng)計(jì)分析E M Bnet(歐洲分子生物學(xué)信息網(wǎng)中30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的利用狀況。通過(guò)網(wǎng)上調(diào)查法國(guó)生物信息中心In fobiogen建立、維護(hù)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)目錄

10、DBcat中所收錄的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行調(diào)查分析;在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步利用歐洲分子生物信息網(wǎng)(E M Bnet中30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)統(tǒng)計(jì)分析生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的利用現(xiàn)狀。調(diào)查時(shí)間為2003年5月1028日。2結(jié)果與討論211生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的類型分布生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的類型分布(見(jiàn)表1。表1生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的類型分布類型數(shù)量比例(%Sequence注1(序列21041110G enomic(基因組5811135M apping(圖譜295168Protein structure(蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)183152Literature(文獻(xiàn)438141續(xù)(表1類型數(shù)量比例(%M iscellaneous(其它15329194合

11、計(jì)511100注1Sequence包括DNA占17.03%RNA占5.68%Protein占18.40%。從表1可知,當(dāng)前生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)主要的類型是序列數(shù)據(jù)庫(kù),占總數(shù)的41.10%,包括DNA、RNA 和蛋白質(zhì)等序列數(shù)據(jù)庫(kù)。這主要是因?yàn)樽?998年人類基因組計(jì)劃從基因作圖轉(zhuǎn)向大規(guī)?；驕y(cè)序。此外,一些大的制藥公司為了爭(zhēng)取生物信息學(xué)的制高點(diǎn),也投入巨資進(jìn)行病原學(xué)生物體和疾病基因的測(cè)序。這樣產(chǎn)生了大量的序列數(shù)據(jù)庫(kù),同時(shí)各種模式生物體序列數(shù)據(jù)產(chǎn)生,使得各種序列數(shù)據(jù)庫(kù)趨向?qū)ｉT化、專業(yè)化,二次序列數(shù)據(jù)庫(kù)大量產(chǎn)生。人類基因組計(jì)劃的順利實(shí)施推動(dòng)了其它模式生物基因組研究的發(fā)展9。自1995年第一條完整的嗜血

12、流感桿菌基因組測(cè)序完成以來(lái),基因組數(shù)據(jù)庫(kù)不斷增加10,到2003年,有1000多條病毒和100多條病原微生物完整的基因組測(cè)序完成,至少還有100多條完整的微生物基因組即將測(cè)序完畢,不久將收入到序列數(shù)據(jù)庫(kù)3。專門收錄不同物種的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)也不斷研制和開發(fā)出來(lái)。調(diào)查發(fā)現(xiàn),基因組數(shù)據(jù)庫(kù)占11.35%,達(dá)到58個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)?；驁D譜和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)是生物信息的重要組成部分,基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)日益增多,分別達(dá)到5.68%和3.52%。生命科學(xué)是當(dāng)前研究的熱點(diǎn)學(xué)科,與之相關(guān)的研究文獻(xiàn)大量產(chǎn)生,從表1發(fā)現(xiàn),生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)達(dá)到43個(gè),占8.41%?？傊?隨著生命科學(xué)的不斷發(fā)展和完善,一些新型的專門的

13、二次數(shù)據(jù)庫(kù)不斷開發(fā)出來(lái),滿足生物信息學(xué)發(fā)展的需要。212生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)國(guó)家分布生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)國(guó)家分布(見(jiàn)表2。表2生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)國(guó)家分布國(guó)家數(shù)量比例(%U.S.A(美國(guó)23245140U.K.(英國(guó)7414148France(法國(guó)418102GERM ANY(德國(guó)377124JAPAN(日本326126RUSSIA(俄羅斯112115SWITZER LAND(瑞士112115CANADA(加拿大8115732第1期胡德華,等:生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)調(diào)查分析及其利用研究續(xù)(表2國(guó)家數(shù)量比例(%SWE DE N(瑞典81157BE LG IUM(比利時(shí)81157AUSTRA LIA(澳大利亞611

14、17IT A LY(意大利61117DE NM ARK(丹麥61117其他14個(gè)國(guó)家注2316107合計(jì)511100注2其它14個(gè)國(guó)家:ISRAE L(以色列:5;NORW AY(挪威:4;NE W ZE A LAND(新西蘭:4;C N(中國(guó):3;I NDI A(印度:2;SP AI N(西班牙:2;THE NETHER LANDS(荷蘭:2;FI N LAND(芬蘭:2;ICE LAND(冰島:2;S OUTH AFRIC A (南非:1;G REECE(希臘:1;SC OT LAND(蘇格蘭:1;BRAZI L(巴西:1;MEXIC D (墨西哥:1。從表2發(fā)現(xiàn),生物信息數(shù)據(jù)呈集中離散趨

15、勢(shì),表明世界各國(guó)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)研發(fā)的程度參差不齊。其中美國(guó)創(chuàng)建和維護(hù)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)最多,為232個(gè),占45.40%,其次是英國(guó),74個(gè),占14.48%。以后依次是法國(guó)、德國(guó)、日本,分別占8. 02%、7.24%、6.26%,而巴西、希臘、南非等國(guó)家創(chuàng)建和維護(hù)的數(shù)據(jù)庫(kù)很少。這表明生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的研制開發(fā)主要集中在發(fā)達(dá)的歐美國(guó)家。另一方面,無(wú)論哪一個(gè)國(guó)家,其研發(fā)的數(shù)據(jù)庫(kù)并未占絕對(duì)優(yōu)勢(shì),即使是美國(guó),也未占到50%,因此,各國(guó)應(yīng)大力加強(qiáng)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的交流與合作,共同促進(jìn)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展與完善。我國(guó)擁有豐富的基因信息資源,特別適合生物信息學(xué)研究。但是,我國(guó)研發(fā)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)較少,

16、僅3個(gè),這與我國(guó)生物信息的增長(zhǎng)極不相稱。因此,我國(guó)應(yīng)大力加強(qiáng)生物信息學(xué)研究,研發(fā)具有中國(guó)特色的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),有效地利用和保護(hù)我國(guó)的生物信息學(xué)資源,防止基因?qū)＠麛?shù)據(jù)外流。213生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的更新情況生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的更新情況(見(jiàn)表3。表3生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)更新頻率時(shí)間差數(shù)量比例(%每天254189每周142174每?jī)芍?0120每月163113每周每個(gè)月10120每24個(gè)月122135每12年40178未知注343885171合計(jì)511100注3大多數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有提供更新情況從表3發(fā)現(xiàn),絕大多數(shù)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)未提供更新情況,有438個(gè),占85.71%,每天更新的只有25個(gè),占4.89%,每

17、周更新的只有14個(gè),占2.74%。這表明生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的更新頻率與當(dāng)前生物信息的增長(zhǎng)極不相稱,尚不能及時(shí)滿足廣大科研人員對(duì)生物信息的需求,有待進(jìn)一步加快數(shù)據(jù)庫(kù)的更新頻率。214生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的獲取方式生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的獲取方式(見(jiàn)表4。表4生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的獲取方式方式數(shù)量比例(%E-mail聯(lián)系7815126FTP下載12624166WWW主頁(yè)訪問(wèn)46190122WWW查詢20239153其它相關(guān)站點(diǎn)33465136從表4發(fā)現(xiàn),生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)提供了多種獲取方式,如E-mail聯(lián)系、FTP下載,WWW主頁(yè)訪問(wèn),WWW查詢,相關(guān)站點(diǎn)等,科研人員可以從不同的途徑和方式獲取所需要的信息。其中W

18、WW主頁(yè)訪問(wèn)是最常用的獲取方式,461個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)提供該獲取方式,占90.22%,這種方式最直觀最快捷。其次是相關(guān)站點(diǎn)訪問(wèn),334個(gè),占65.36%。這表明,目前幾乎所有的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)都擁有自己的Internet 地址和主頁(yè)12,提供主頁(yè)訪問(wèn),同時(shí)還提供了許多相關(guān)站點(diǎn)服務(wù)。調(diào)查還發(fā)現(xiàn),許多生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)科研機(jī)構(gòu)和科研人員提供免費(fèi)下載和免費(fèi)查詢服務(wù),分別占24.66%和39.53%。但是鑒于許多數(shù)據(jù)庫(kù)的開發(fā)者面臨經(jīng)濟(jì)緊張的境地,這種免費(fèi)的局面還能維持多久就不得而知。有的數(shù)據(jù)庫(kù),如SWISS-PROT,已開始向商業(yè)用戶每年收取數(shù)千至數(shù)萬(wàn)美元不等的使用費(fèi)。如果一些重要的數(shù)據(jù)庫(kù)向科研機(jī)構(gòu)開始收費(fèi),

19、這對(duì)我國(guó)生物信息學(xué)的發(fā)展非常不利。我國(guó)作為一個(gè)基因信息資源大國(guó),應(yīng)當(dāng)抓緊建設(shè)我國(guó)自有的數(shù)據(jù)庫(kù),在平等的基礎(chǔ)上與國(guó)外共享生物信息資源。2.5各國(guó)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的利用狀況各國(guó)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的利用狀況(見(jiàn)表5。表5E M Bnet中30個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)提供生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)狀況注4節(jié)點(diǎn)UR L數(shù)據(jù)庫(kù)個(gè)數(shù)Austria(奧地利http:/w w /3842生物信息學(xué)第3卷續(xù)(表5節(jié)點(diǎn)UR L數(shù)據(jù)庫(kù)個(gè)數(shù)Belgium(比利時(shí)http:/w w /61Canada(加拿大http:/w w w.cbr.nrc.ca/84Chile(智利http

20、:/w w w.embnet.cl/8China(中國(guó)http:/w w C oba(古巴.cu/113Denma rk(丹麥http:/w w w.biobase.dk/14Finland(芬蘭http:/w w w.csc.fi/m olbio19France(法國(guó)http:/w w w.in fobiogen.fr/7G ermany(德國(guó)http:/genius.embnet.dk fz-heidelberg.de/11Mexico(墨西哥http:/itzamna.cifn.unam.mx/embnet8Netherlands(荷蘭http:/w

21、w w.cmbi.kun.nl/14Nerway(挪威http:/w w /39P oland(波蘭http:/w w w.ibb.waw.pl/342Russia(俄羅斯http:/w w w.genebee.msu.su/55Slovakia(斯洛伐克http:/w w w.embnet.sk/3S witzerland(瑞士http:/w w w.isb-sib.ch/8United K ingdom(英國(guó)http:/w w /11注4根據(jù)調(diào)查發(fā)現(xiàn),有Argentina(阿根廷、Australia(澳大利亞、Brazil(巴西、

22、C olombia(哥倫比亞、Hungary(匈牙利、India(印度、Israel(以色列、Italy(意大利、P ortugal(葡萄牙、S outh A frica(南非、S pain(西班牙、S weden(瑞典等12個(gè)成員國(guó)節(jié)點(diǎn)沒(méi)有提供數(shù)據(jù)庫(kù),或者正在建設(shè)中。歐洲分子生物學(xué)信息網(wǎng)(E M Bnet始建于1988年,作為一個(gè)國(guó)際組織,它在荷蘭注冊(cè),從1996年開始,E M Bnet從8個(gè)成員國(guó)擴(kuò)展到包括歐洲各國(guó)在內(nèi)的30個(gè)國(guó)家,中國(guó)同年加入。目前,E M Bnet擁有30個(gè)成員國(guó)(每個(gè)國(guó)家建立了一個(gè)節(jié)點(diǎn)和10個(gè)專業(yè)節(jié)點(diǎn)。E M Bnet的中國(guó)節(jié)點(diǎn)設(shè)在北京大學(xué)生物信息中心PK UC BI

23、13。調(diào)查統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),E M Bnet中有12個(gè)節(jié)點(diǎn)處于建設(shè)過(guò)程中或未提供相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù),其它18個(gè)節(jié)點(diǎn)提供數(shù)據(jù)庫(kù)的個(gè)數(shù)不等,最多的波蘭提供了342個(gè),最少的也提供了3個(gè)。我國(guó)在生物信息學(xué)數(shù)據(jù)的收集與提供方面作了大量的工作,E M Bnet的中國(guó)節(jié)點(diǎn)現(xiàn)在可提供92個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索與利用,這對(duì)我國(guó)的生物信息學(xué)的發(fā)展起著非常重要的作用。但是與發(fā)達(dá)國(guó)家仍存在較大差距,我們應(yīng)加快生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)引進(jìn)的力度,同時(shí)研制開發(fā)更多的數(shù)據(jù)庫(kù),加速國(guó)內(nèi)信息網(wǎng)絡(luò)建設(shè),提供快捷、方便的數(shù)據(jù)庫(kù)、軟件和在線服務(wù),促進(jìn)我國(guó)生物信息學(xué)的發(fā)展。3結(jié)論(1生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)種類繁多,其主要類型是序列數(shù)據(jù)庫(kù)。(2世界各國(guó)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的

24、研發(fā)程度參差不齊,主要集中在發(fā)達(dá)的歐美國(guó)家。(3生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的更新頻率與當(dāng)前生物信息的增長(zhǎng)極不相稱,應(yīng)大力加快數(shù)據(jù)庫(kù)的更新速度。(4目前幾乎所有的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)都擁有自己的Internet地址和主頁(yè),提供主頁(yè)訪問(wèn),同時(shí)還提供了許多相關(guān)站點(diǎn)服務(wù)。(5世界各國(guó)對(duì)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)利用的程度不一,我國(guó)在生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的收集和提供使用方面做了大量工作,這對(duì)我國(guó)生物信息學(xué)的發(fā)展起著非常重要的作用。參考文獻(xiàn)(References:1秦惠基,胡家榮.生物信息學(xué)的興起與展望J.廣東藥學(xué)院學(xué)報(bào),1999,(1:28-2912孫嘯.生物信息學(xué)揭示生物分子數(shù)據(jù)的內(nèi)涵J.電子商務(wù),1998,(11:10-161

25、3Dennis A.Bens on,Ilene K arsch-M izrachi,David J.Lipman,James Os2tell,and David L.Wheeler.G enBankJ.Nucl.Acids.Res.,2003,31(1:23-2714Brigitte Boeckmann,Am os Bairoch,R olf Apweiler,M arie-Claude Blat2ter,Anne Estreicher,E lisabeth G asteiger,M aria J.M artin,K arine M i2 choud,Claire OD onovan,Isabelle Phan,Sandrine Pilbout,and M ichel Schneider.The SWISS-PROT protein knowledgebase and its supple2 ment T rE M BL in2003J.Nucl.Acids.Res.,2003,31(1:365-3701 5John W estbrook,Zukang Feng,Li Chen,Huanwang Y ang,and Helen M.Berman.