基因表達(dá)譜聚類(lèi)分類(lèi)技術(shù)研究及展望

1、 OEC ?;78!/! 012.8#$ 13 ,71"!5;81$1AB 生物工程學(xué)報(bào) CBB， Q18C!， =1A 反映細(xì)胞實(shí)際情況的基因表達(dá)譜網(wǎng)絡(luò)模型還有很多困難。 如何建立大規(guī)模的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型將是基因表達(dá)譜研究 的重要任務(wù)之一， 也是后基因時(shí)代的主要研究方向之一。我 們?cè)诨蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建上也做了一些探索性工作， 我們的 思路是： 首先將基因表達(dá)譜通過(guò)聚類(lèi)的方法分為不同的功能 模塊， 然后在每個(gè)功能模塊的基礎(chǔ)上構(gòu)建一個(gè)個(gè)小的子網(wǎng)， 最后將這些子網(wǎng)連接起來(lái)， 當(dāng)然， 如何將這些零散的小網(wǎng)連 接起來(lái)， 又讓它們具有生物學(xué)意義的困難是不言而喻的。建 立大規(guī)模的網(wǎng)絡(luò)模型是基因表

2、達(dá)譜研究的另一重要任務(wù)， 是 后基因時(shí)代的主要研究方向之一。 !"# 逆向工程 逆向工程又叫反向模型， 它是從所給的大量基因表達(dá)譜 數(shù)據(jù)中推出未知的潛在的網(wǎng)絡(luò)模型。通過(guò)基因表達(dá)譜聚類(lèi)， 可以抽取有用的信息， 不過(guò)聚類(lèi)技術(shù)只能告訴我們哪些基因 是共同被調(diào)控的， 至于誰(shuí)調(diào)控誰(shuí)， 它就無(wú)能為力了。逆向工 程的目的就是通過(guò)建立一個(gè)反向模型， 來(lái)推導(dǎo)出它們之間的 因果關(guān)系。逆向工程的另一個(gè)重要意義是可以指導(dǎo)生物實(shí) 驗(yàn)的設(shè)計(jì)， 避免生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的盲目性， 提高實(shí)驗(yàn)的針對(duì)性， 降 低成本， 提高效率， 而實(shí)驗(yàn)反過(guò)來(lái)又有利于模型的完善和證 實(shí)。 （參考文獻(xiàn)） $%&%$%(% ! "

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