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文檔簡(jiǎn)介
1、 HDOAtgrp.LAt.grp. w2DMin 糜DMaw 1 'CuCul.-MO2.830 1CuF1.402.8B0Cu0LW2.9E0CuCL4402.360FFQ.352.1,704 vSelect atom group pairfsj to be coriwded:Bonding sphereSelected atcnn 鼻0中 pair: Ou - CliDMin Aj: 1.440DMax A; Z890J| StatisticsDistance:1 calculated756 from statistiGS ;r24?1,r n15選擇哪些是否成鍵更改大小的兩個(gè)B
2、UILD DESSTROY ALL CLL DEGESFill coordi nation spheres可以選擇長(zhǎng)原子。也可以全部長(zhǎng)寫(xiě)名字:右鍵 add add atom labelsAdd Atom LabelsTestContent: Element symbol v Format: FevIrxiiriclLial text:StyleRdatve ixsiUon OUG可國(guó)*0|aAfign<nerit: Centered v Texi size A: 65Color; lAutomatiE I Quse atom's main colorFont,.,Underlin
3、e | |Strike oui OpaqueDestroyDefeult'fbr new labels_ update existing label definibonskJt: Atom symbol * F可以選擇標(biāo)記什么樣的更改,右鍵 edit atom labels3、畫(huà)三維結(jié)構(gòu)圖一維看根本鏈接情況,三維看整體情況。1首先 destroy all2fillsuper 三個(gè)方向上都是兩個(gè)單胞3connectivity 連接4view direct ion picture5設(shè)置原子的顏色,鍵的顏色,半徑等 picturebond designBond Group DcUgns<
4、;Default>Lll - LuCu- FCu- 0Cu- CV4+nin groups81*1 Update bondssave ueraurtI o RpnitrvStle and Lolois OthersHllCancelReset.PC設(shè)置兩個(gè)原子連接的鍵:一個(gè)鍵的兩個(gè)顏色不一樣,原子粗細(xì)很小看不見(jiàn)原子球棍圖原子比鍵大很多。5將金屬和氧連接成多面體。Add PolyhedrdrLigand atom groups;Type of 5plere Generic (spheres from ccmetti/it"< list)OFixwl Win A: 0RMax
5、M: 2.5Apply to; Atoms of selected groups匚己nirsal atom groups:CuF 0Angle epglon deg r used to extend tr.arkgles to higher polygons:I-1 Repine existing pq yhtdrabuildpolyhedralPolyhedron Design設(shè)置多面體顏色,棱顏色,透明度等。6顯示方向Objectscoord in ate systemCoordinate SystemVl 亡 splay oordinats w 詳訴mP Arrowh&adsTl
6、 -17.275Font LegendDisplay legiendPosition:X cm:Kelative to: bottom rightAtomk rarii: fixedRadius cmj;Font size ©n;Border 簡(jiǎn)dtii Gnm):Colcr:Symbols;X;、Legend0,01Automatic(po rt-formattrig) vho nt.Select.,.畫(huà)立體圖:picturerepresentation選擇central,可以看到有直觀三維立體的結(jié)構(gòu),再繼續(xù)微調(diào)數(shù)字。Camera diatanee 等。Picture Repres
7、entationRepresentatio n Projection Lfg hitingProjection:' parallel-,j centralCainera dktarrc# (cm):30Enlargeinent factor0.262171StereoerrabledCancel鍵一端粗一端細(xì)的情況畫(huà)管子看清螺旋孔道兩個(gè)虛擬原子成鍵Insert AtomAtom symbol:K: 2.555MThe 目Be to be inserted will be added to the parameter list as "Dummy atom . Use the
8、Atumic parameter dialog in the Stmcture menur if you want to change the atorn'5 proper ties hereafter.3 Create atom a t current position選中四個(gè)原子,structurein sert atoms插入后,右鍵原子,edit,調(diào)整大小和顏色Buildin sert bo nd,再調(diào)整鍵的大小顏色透明度等。主要虛擬原子要在正中間。看清螺旋結(jié)構(gòu)右鍵 modelstandard更改球棍模型和半球模型選擇任意一個(gè)原子,右鍵select molecules,然后更改
9、顏色。鍵長(zhǎng):右鍵 add bond lebels加上鍵長(zhǎng)數(shù)據(jù)??礆滏I:底端,measure dista nee,分別選中兩個(gè)原子量距離。Mercury 的翻開(kāi),ins ,ris,eif直接拖進(jìn)翻開(kāi) 不對(duì)稱(chēng)單元中的原子:£ Asynwnetr ic ITai tAuto cantr«Fiflkin< Mode Fiakyr匚HStyle :Capped Sticks Colowr: By Element看原子距離:FiflkiMode: Msasurt Aiijles Cle量鍵角:Caeulatepowder patter n看這個(gè)結(jié)構(gòu)的XRD圖,然后再customise中更改條件 在圖中可以直接看到指標(biāo)化信息,鼠標(biāo)直接放上面Powder Pattern SettingsSettingsOKApplyCancelPattern Tick marks Preferred orientation回 Include h
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