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文檔簡介

使用 TANSFAC數(shù)據(jù)庫查詢特定轉(zhuǎn)錄因子已知的結(jié)合位點(diǎn)TANSFAC是德國生物工程研究所開發(fā)的真核生物基因調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫,是當(dāng)今世界上最大的轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫,包括順式元件、基因、轉(zhuǎn)錄因子、細(xì)胞來源、分類和調(diào)控位點(diǎn)核甘酸分布6個(gè)子庫。TANSFAC 5.4版本收錄有4774種轉(zhuǎn)錄因子蛋白信息,結(jié)合位點(diǎn)信息11537個(gè),以及相關(guān)基因1928個(gè),參考文獻(xiàn)9095條,對(duì)于順式元件的分析功能非常強(qiáng)大?,F(xiàn)在的版本TANSFAC 6.0應(yīng)該包含更多信息。1.其主頁:。進(jìn)入主頁后先注冊(cè),登錄。點(diǎn)擊TANSFAC進(jìn)入數(shù)據(jù)庫。2.點(diǎn)擊SEARCH,進(jìn)入SEARCH頁后點(diǎn)擊factor3.選擇factor name,輸入待查轉(zhuǎn)錄因子名稱,例如:sp14點(diǎn)擊人類的sp15.進(jìn)入sp1的頁面, 點(diǎn)擊BS,點(diǎn)擊sp1下游基因的GENE accession no,如G000193BS條目解釋為Binding SITEG000193的頁面

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