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1、    達(dá)斡爾民族X染色體遺傳多態(tài)性與親緣的關(guān)系            作者:時間:2007-11-22 11:36:00                           &#

2、160;                                                 &#

3、160;      作者:侯巧芳 高放 桂宏勝 馬懿 李生斌【摘要】  目的:研究達(dá)斡爾民族X染色體遺傳結(jié)構(gòu)與親屬關(guān)系. 方法: 選擇9個XSTR(DXS6804,DXS7133,DXS101,DXS6789,DXS6799,DXS7423,HPRTB,DXS8378,DXS7132),分析其多態(tài)性分布及與其他群體間的遺傳距離和聚類關(guān)系. 結(jié)果:研究群體中共檢出51種等位基因,頻率分布在0.01610.6935;基因型頻率、雜合度、個體識別率、多態(tài)性信息量等群體遺傳學(xué)指標(biāo)分析顯示,9個STR位點(diǎn)可用于群體遺傳學(xué)研究和法醫(yī)學(xué)應(yīng)用;聚類分

4、析和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析發(fā)現(xiàn)達(dá)斡爾和鄂倫春族有較近的遺傳距離. 結(jié)論:此9個XSTR位點(diǎn)具有較高的個體識別率和多態(tài)性信息量,可用于群體遺傳學(xué)研究、法醫(yī)學(xué)應(yīng)用和疾病連鎖分析. 【關(guān)鍵詞】  X染色體 短串聯(lián)重復(fù)序列 遺傳多態(tài)現(xiàn)象 遺傳距離 達(dá)斡爾族 親屬關(guān)系     0引言    內(nèi)蒙古地區(qū)是我國乃至世界上最大的多民族聚居地,居住著漢族、蒙古族、鄂溫克族、鄂倫春族、達(dá)斡爾族等55個民族(除了珞巴族外),形成了中國最大最豐富的遺傳信息庫,這是世界上任何一個其它地區(qū)無法比擬的. 因此,對研究我國,甚至世界民族的起源、形成、發(fā)

5、展與演變具有非常重要的價值. 在內(nèi)蒙古地區(qū)55個民族中蒙古族、鄂溫克族、鄂倫春族、達(dá)斡爾族四個民族為內(nèi)蒙古地區(qū)的主要少數(shù)民族. 各族群之間相對隔離,有關(guān)民族特有等位基因、基因型及基因頻率的研究資料缺乏. 這無疑會對研究中華民族群體起源、人群遺傳差異、法醫(yī)學(xué)個體識別、民族特有疾病譜等帶來不利的影響1-2. 我們的目的是通過9個XSTR基因標(biāo)記的遺傳學(xué)分析,調(diào)查內(nèi)蒙古地區(qū)達(dá)斡爾民族群體遺傳結(jié)構(gòu)及變化規(guī)律.    1對象和方法    1.1對象樣本取自內(nèi)蒙古自治區(qū),莫力大瓦達(dá)斡爾族自治旗,河扎蘭屯市達(dá)斡爾民族鄉(xiāng)87(男56,女31)例達(dá)斡爾

6、族健康無關(guān)個體. 采取靜脈血2 mL,EDTA抗凝. 每個供血個體均追溯3代以上家族史,以確定其民族代表性.    1.2方法采用Chelex100法,從87例達(dá)斡爾民族群體的健康無關(guān)個體中成功提取基因組DNA,含量在1050 mg/L之間. PCR擴(kuò)增樣本DNA,變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,結(jié)合銀染顯色技術(shù),選用等位基因大小標(biāo)記進(jìn)行分型,觀察染色體STR遺傳標(biāo)記包括DXS6789,DXS101,DXS8378,DXS7132,DXS7133,DXS7423,DXS6804,DXS6799,HPRTB等 9個XSTR位點(diǎn)等位基因分布.  

7、60; 統(tǒng)計學(xué)處理: 統(tǒng)計軟件SPSS 13.0計算各位點(diǎn)基因型頻率和等位基因頻率,2檢驗對基因型頻率(女性)進(jìn)行HW平衡檢驗,并進(jìn)行聚類分析3;Powerstats軟件計算各種法醫(yī)學(xué)應(yīng)用指標(biāo)(包括雜合度、個體識別力、非父排除率等)4. Mega3.0計算遺傳距離,繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹5.    2結(jié)果    2.1達(dá)斡爾族9個XSTR基因位點(diǎn)分型部分結(jié)果如圖1.    2.2達(dá)斡爾族9個XSTR基因位點(diǎn)等位基因頻率9個XSTR位點(diǎn)共檢測出51個等位基因,頻率分布在0.01610.6935之間, 各位點(diǎn)等位基因

8、分布不均一(表1).表1達(dá)斡爾族9個XSTR基因位點(diǎn)等位基因頻率    2.4達(dá)斡爾族9個XSTR基因位點(diǎn)多態(tài)性指標(biāo)統(tǒng)計顯示9個XSTR位點(diǎn)的雜合度(H)、多態(tài)性指標(biāo)(PIC)、個體識別力(PD)均達(dá)到法醫(yī)學(xué)應(yīng)用指標(biāo), 9個XSTR基因位點(diǎn)聯(lián)合構(gòu)成的多態(tài)性指標(biāo)是0.99998(表3). 對基因型頻率(女性)進(jìn)行HW平衡檢驗,結(jié)果顯示,除位點(diǎn)DXS7133之外(P<0.05),其他基因座基因型頻率分布都符合HW平衡定律. 表2達(dá)斡爾族女性9個XSTR基因位點(diǎn)的等位基因型頻率    3討論    3.1

9、達(dá)斡爾民族X染色體STR的遺傳結(jié)構(gòu)在達(dá)斡爾族群體中,9個XSTR位點(diǎn)共檢測出51個等位基因,88個基因型. 在9個XSTR位點(diǎn)中,有四個位點(diǎn)等位基因分布顯著不均,分別是DXS7133, DXS6799, DXS8378和DXS7423. DXS7133位點(diǎn)的等位基因9為高頻,等位基因10和11的頻率為中頻,而等位基因8的頻率為低頻;DXS6799位點(diǎn)的等位基因11為高頻,等位基因10和12的頻率為中頻,而等位基因8, 9, 13的頻率為低頻;DXS8378位點(diǎn)的等位基因9為高頻,等位基因10和11的頻率為中頻,而等位基因8, 12, 13的頻率為低頻; DXS7423位點(diǎn)的等位基因15為高頻,

10、等位基因14為中頻,而等位基因13, 16為低頻. 其余5個位點(diǎn)的等位基因在鄂溫克族人群中分布比較均一.表3內(nèi)蒙古地區(qū)達(dá)斡爾族9個XSTR基因位點(diǎn)多態(tài)性指標(biāo)表4內(nèi)蒙古地區(qū)四個主要少數(shù)民族、西安漢族之間的遺傳距離在9個XSTR位點(diǎn)中,DXS6789位點(diǎn)的多態(tài)性最高(等位基因分布最廣),其次為DXS101, DXS8378和DXS6799,而DXS7133和DXS7423位點(diǎn)的多態(tài)性最低;多態(tài)性指標(biāo)PIC值也印證了這一點(diǎn). 因此,在使用XS7133和DXS7423位點(diǎn)進(jìn)行法醫(yī)學(xué)個體識別時要注意,需要增加其他XSTR位點(diǎn),從而提高個體識別能力6.    3.2民族遺傳差

11、異以及親屬關(guān)系比較本實驗9個XSTR位點(diǎn)基因頻率計算的遺傳距離顯示,鄂倫春族與達(dá)斡爾族之間的遺傳距離較近;而達(dá)斡爾族與鄂溫克族、達(dá)斡爾族與西安漢族之間的遺傳距離較遠(yuǎn). 另外,內(nèi)蒙古地區(qū)蒙古族、鄂溫克族、鄂倫春族、達(dá)斡爾族及西安漢族五個群體之間的等位基因分布差異性比較6-9, 三種方法和結(jié)果相互印證,共同表明所研究達(dá)斡爾族群體與鄂倫春族之間的遺傳關(guān)系相對最近,而與鄂溫克族、蒙古族、漢族遺傳關(guān)系較遠(yuǎn). 該結(jié)果與地理分布、語系分布及民族演變歷史相吻合. 而地理位置相距遙遠(yuǎn)的西安漢族和蒙古族之間有很近的遺傳距離,這表明,親屬關(guān)系在民族間遺傳距離和基因漂流的形成中扮演著比地理位置更為重要的角色10-11

12、.本研究從分子遺傳學(xué)角度闡明內(nèi)蒙古地區(qū)達(dá)斡爾民族的遺傳結(jié)構(gòu)和特色,與語系關(guān)系及民族歷史演變特點(diǎn)相吻合;同時,獲得的X染色體STR遺傳學(xué)數(shù)據(jù)在疾病連鎖分析、遺傳制圖、法醫(yī)學(xué)鑒定等領(lǐng)域有廣闊的應(yīng)用前景.    致謝感謝通木爾,李曉鐘,歐拉,趙君海在樣本采集中的工作;感謝余兵博士給予的實驗指導(dǎo).【參考文獻(xiàn)】  1 Barbaro A, Cormaci P, Barbaro A. XSTR typing for identification casework J. Int Congress Series, 2006, 1288: 513-515.2 Szibor

13、 R, Krawczak M, Hering S, et al. Use of Xlinked markers for forensic purposesJ. Int J Legal Med, 2003,117(2): 67-74.3 黃代新,楊慶恩.卡方檢驗和精確檢驗在HWE檢驗中的應(yīng)用J.法醫(yī)學(xué),2004,20(2):116-119.4 Shin SH, Yu JS, Park SW, et al. Genetic analysis of 18 Xlinked short tandem repeat markers in Korean populationJ.Forensic Sci In

14、t, 2005, 147(1):35-41.5 高雅,金天博,李生斌. 利用3個STR位點(diǎn)多態(tài)性研究云南19個不同民族的遺傳學(xué)關(guān)系J. 中國優(yōu)生與遺傳雜志, 2005, 13(10): 16-19.6 Liu Q, Li S. Patterns of genetic polymorphism at the 10 Xchromosome STR loci in Mongol population J. Forensic Sci Int, 2006, 158 (1):76-79.7 Gu S, Li S. Xchromosome STRs analysis of Ewenke ethnic populationJ. Forensic Sci Int, 2006, 158(1):72-75.8 Ma J, Wang S, Yu J, et al. Ychromosome STR haplotypes of Han ethnic group in Xian (NW China) J. Forensic Sci Int, 2003, 138(13): 123-126.9 李生斌,馮繼東,李雙頂. 中國漢族人群(西安)STR基因掃描與遺傳結(jié)構(gòu)J. 遺傳學(xué)報, 2000,2

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