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文檔簡介

1、西 南 農(nóng) 業(yè) 大 學(xué)200 200 學(xué)年第 學(xué)期期末(中)基因組學(xué)課程試題( 1 )卷答 案考試時間考試方式學(xué)生類別人數(shù)適用專業(yè)或科類年級題號一二三四五六七八九十總 分得分簽名一、名詞解釋(每題3分,共24分)1、基因組:是指細(xì)胞中所有的DNA,包括所有的基因和基因間區(qū)域。2、擬基因:是某一基因的非功能性拷貝,通常是因為發(fā)生了突變,其生物信息變得不可解讀。3、轉(zhuǎn)化:是指受體細(xì)胞從環(huán)境中攝取供體細(xì)胞釋放的DNA片段的過程。4、核酸雜交:是指兩個互補或部分互補的核酸分子形成穩(wěn)定的堿基配對雜交體的過程。5、密碼偏倚:指特定生物的基因中并非平均地使用每個堿基密碼子。6、開放閱讀框:編碼蛋白的基因中翻

2、譯成蛋白質(zhì)的那部分序列。7、同源性檢索:將一段DNA或氨基酸序列提交到數(shù)據(jù)庫進(jìn)行序列比對查詢,以判斷所查序列是否與已知基因的序列相同或相似。8、直向同源:指同源基因來源于不同種屬生物之間,它們的共同祖先早于種屬分化。二、選擇題(請將正確答案的代碼填入括號內(nèi),每題2分,共10分)1、C 2、A 3、D 4、B 5、A 三、判斷正誤,并改正(每題3分,共18分)1、錯誤。線粒體基因組一般為環(huán)狀DNA分子。2、錯誤。轉(zhuǎn)導(dǎo)是指通過細(xì)菌噬菌體將小片段DNA從供體菌轉(zhuǎn)移到受體菌的過程。3、錯誤。物理作圖方法主要包括限制酶作圖、熒光原位雜交和序列標(biāo)記位點作圖。4、錯誤。表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)是通過測定cDN

3、A序列得到。5、正確。某一新基因的功能還必須以實驗證據(jù)來證明。6、正確。四、簡答題(每題6分,共36分)1、答:它們的主要區(qū)別包括:(1)原核生物基因組比真核生物基因組要小得多。(2)原核生物的基因數(shù)通常比真核生物的少。(3)原核生物基因組大部分無斷裂基因,而真核生物基因基因一般都含有內(nèi)含子。(4)原核生物基因組一般無重復(fù)序列,真核生物基因組則含了大量的重復(fù)序列。2、答:傳統(tǒng)基因組作圖方法的包括:(1)遺傳作圖:即應(yīng)用遺傳學(xué)技術(shù)構(gòu)建能顯示基因以及其他序列特征在基因組上位置的圖。(2)物理作圖:既應(yīng)用分子生物學(xué)技術(shù)來直接分析DNA分子,從而構(gòu)建能顯示包括基因在內(nèi)的、序列特征的位置圖。3、答:遺傳

4、作圖的DNA標(biāo)記有:(1)限制性酶切片段長度多態(tài)性(RFLP),它是利用限制性內(nèi)切酶消化不同基因組DNA,再電泳轉(zhuǎn)膜,并與標(biāo)記好的目的探針雜交所形成的差異。(2)簡單序列長度多態(tài)性(SSLP):是一系列不同長度的重復(fù)序列在不同基因組間的差異,包括小衛(wèi)星和微衛(wèi)星。(3)單核苷酸多態(tài)性(SNP):是指基因組中存在的單個的堿基突變(點突變)。4、答:鳥槍法測序主要是指首先進(jìn)行單個測序反應(yīng),再將反應(yīng)中得到的短序列通過檢測重疊區(qū)從而推倒出完整的序列的方法。其優(yōu)點在于能相對較快地測定小基因組的序列,并且不需要遺傳或物理圖譜;其主要缺點是從起始序列尋找重疊區(qū)域及構(gòu)建序列重疊群的復(fù)雜性和數(shù)據(jù)分析的限制。5、答

5、:Northern雜交是將某一物種某一組織的RNA印跡到尼龍膜上,再與標(biāo)記的目標(biāo)探針雜交的方法,其主要用來檢驗?zāi)骋荒繕?biāo)序列中是否含有表達(dá)序列或分析目標(biāo)基因表達(dá)的物種、時間、空間和表達(dá)量的差異。6、答:確定基因功能的實驗方法主要包括:(1)基因失活,該方法是功能分析的關(guān)鍵,一般是用一段無關(guān)的DNA將目標(biāo)基因破壞,可以通過將基因的染色體拷貝與一段與靶基因有相同序列的DNA進(jìn)行同源重組來達(dá)到。(2)基因過剩表達(dá),即將目標(biāo)基因克隆入一種特殊的載體,該載體能目標(biāo)基因合成盡可能多的蛋白質(zhì)。通過以上兩種方法處理后,再觀測生物個體的遺傳表型,從而推測目標(biāo)基因的功能。五、論述題(每題12分,共12分)答:(1)

6、家蠶基因組計劃的順利完成。2003-2004年,西南農(nóng)業(yè)大學(xué)和中國科學(xué)院基因組研究所,克服種種困難,以家蠶品種“大造”為材料,構(gòu)建了30個家蠶基因組文庫,完成了近600萬測序反應(yīng);綜合運用數(shù)學(xué)、計算機科學(xué)、物理學(xué)和信息學(xué),完成了家蠶全基因組數(shù)據(jù)組裝以及家蠶全基因組數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析和基因鑒定工作,完成了家蠶全基因組框架圖的繪制;結(jié)合家蠶功能基因組的研究,對家蠶重要功能基因進(jìn)行了具體的功能分析。研究成果發(fā)表于國際頂級科學(xué)雜志Science。(2)家蠶基因組計劃的完成是基礎(chǔ)科學(xué)的一大貢獻(xiàn)。家蠶全基因組框架圖,是全世界第一張家蠶基因組框架圖,也是第一張鱗翅目昆蟲基因組框架圖,是迄今為止我國科學(xué)家獨

7、立完成的用霰彈法測序的最大基因組。所鑒定的18510個基因以及全基因組數(shù)據(jù)庫是目前世界上最完善、功能最強大和收集信息最多的數(shù)據(jù)庫,也是鱗翅目昆蟲中影響最大的一個基因組數(shù)據(jù)庫。家蠶基因組框架圖不但是生物基因組學(xué)的一個杰出成就,也是昆蟲學(xué)的一個里程碑。(3)家蠶基因組計劃的完成是振興傳統(tǒng)蠶絲產(chǎn)業(yè)的重要基礎(chǔ)。家蠶全基因組測序完成之后,我們詳細(xì)研究了參與家蠶重要生物學(xué)性狀決定的功能基因,發(fā)現(xiàn)了家蠶絲腺特異基因、激素調(diào)節(jié)相關(guān)基因、發(fā)育調(diào)控基因、性別調(diào)節(jié)基因和體液免疫因子等。上述幾類重要功能基因的發(fā)現(xiàn),將為我們闡明家蠶繭絲蛋白質(zhì)合成、生長、發(fā)育調(diào)節(jié)、免疫和抗性、性別決定等重要生物性狀的分子機理奠定重要的基礎(chǔ)。這些研究的進(jìn)一步深入,將催生一批高水平的理論研究成果和重要的高新產(chǎn)業(yè)技術(shù),推動家蠶重要經(jīng)濟性狀遺傳機理和改良的研究,進(jìn)而解決產(chǎn)業(yè)重大問題和推動蠶絲產(chǎn)業(yè)進(jìn)步,實現(xiàn)蠶絲產(chǎn)量的提高、性別的人為調(diào)節(jié)、生絲品質(zhì)的改善以及蠶抗病性的提高。 (4)家蠶基因組計劃的完成將促進(jìn)新興絹絲產(chǎn)業(yè)的建立。家蠶蛋白質(zhì)合成的高效性、高等生物蛋白質(zhì)的后修飾加工能力、生產(chǎn)的大規(guī)模低成本優(yōu)勢以及對人畜安全性等,滿足了新一代生物反應(yīng)器的基本要求,有巨大的開發(fā)應(yīng)用潛力。家蠶基因組的完成,將促進(jìn)家蠶生物反應(yīng)器的研究與應(yīng)用,并在生物制藥、食品開發(fā)等新型生物產(chǎn)業(yè)領(lǐng)域有所作為。(5)家蠶基因組計劃的完成是家蠶模式生物

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