氨基酸密碼子對(duì)照表

1、精選文檔丙氨酸AlanineA 或 Ala89.079CH 3 -脂肪族類精氨酸ArginineR 或 Arg174.188HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 -堿性氨基酸類天冬酰胺AsparagineN 或 Asn132.104H 2 N-CO-CH 2 -酰胺類天冬氨酸Aspartic acidD 或 Asp133.089HOOC-CH 2 -酸性氨基酸類半胱氨酸CysteineC 或 Cys121.145HS-CH 2 -含硫類谷氨酰胺GlutamineQ 或 Gln146.131H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -酰胺類谷氨酸Glutamic acidE 或 Glu1

2、47.116HOOC-(CH 2 ) 2 -酸性氨基酸類甘氨酸GlycineG 或 Gly75.052H-脂肪族類組氨酸HistidineH 或 His155.141N=CH-NH-CH=C-CH 2 -|_|堿性氨基酸類異亮氨酸IsoleucineI 或 Ile131.160CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )-脂肪族類亮氨酸LeucineL 或 Leu131.160(CH 3 ) 2 -CH-CH 2 -脂肪族類賴氨酸LysineK 或 Lys146.17H 2 N-(CH 2 ) 4 -堿性氨基酸類蛋氨酸MethionineM 或 Met149.199CH 3 -S-(CH 2 )

3、 2 -含硫類苯丙氨酸PhenylalanineF 或 Phe165.177Phenyl-CH 2 -芳香族類脯氨酸ProlineP 或 Pro115.117-N-(CH 2 ) 3 -CH-|_|亞氨基酸絲氨酸SerineS 或 Ser105.078HO-CH 2 -羥基類蘇氨酸ThreonineT 或 Thr119.105CH 3 -CH(OH)-羥基類色氨酸TryptophanW 或 Trp204.213Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -|_|芳香族類酪氨酸TyrosineY 或 Tyr181.1764-OH-Phenyl-CH 2 -芳香族類纈氨酸ValineV 或 Val11

4、7.133CH 3 -CH(CH 2 )-脂肪族類與核苷酸序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表關(guān)鍵詞說明Allele相關(guān)的個(gè)體或菌株含有相同基因的穩(wěn)定的其它形式,該形式區(qū)分于這一位置的現(xiàn)有的序列(和或許其它序列)attenuator存在調(diào)整轉(zhuǎn)錄的終止的DNA區(qū)域,它把握了一些細(xì)菌操縱子的表達(dá); (2)位于啟動(dòng)子和第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因之間，引起轉(zhuǎn)錄的部分終止的序列區(qū)段C_region免疫球蛋白輕和重鏈的恒定區(qū),和T-細(xì)胞受體,和鏈；依據(jù)特定的鏈可包括一個(gè)或多個(gè)外顯子CAAT_signalCAAT盒;位于可能參與RNA聚合酶結(jié)合的真核生物轉(zhuǎn)錄單位的起始點(diǎn)的75bp上游的保守序列的一部分；共有序列GG(C或T)CAAT

5、CTCDS編碼序列;對(duì)應(yīng)于蛋白質(zhì)中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括終止密碼子);特征包括氨基酸概念上的翻譯Conflict在這一位點(diǎn)或區(qū)域,單獨(dú)確定的“相同”序列有所不同D-loop置換環(huán)；線粒體DNA內(nèi)的一個(gè)區(qū)域,其中RNA的短的序列與DNA的一條鏈配對(duì),代替了這一區(qū)域的原始配對(duì)DNA鏈;也用于說明在RecA蛋白質(zhì)催化的反應(yīng)中，侵入的單鏈替代雙鏈DNA的一條鏈的區(qū)域D-segment免疫球蛋白重鏈的多變區(qū),和T-細(xì)胞受體的鏈Enhancer順式-作用序列,它增加了(一些)真核生物啟動(dòng)子的作用,并能在任一方向和與啟動(dòng)子相關(guān)的任何位置處 (上游或下游)起作用Exon編碼剪接mRNA部分的基因

6、組區(qū)域;可以含有5'UTR,全部CDS,和3'UTRGC_signalGC盒;位于真核生物轉(zhuǎn)錄單位起始點(diǎn)上游的保守的富含GC區(qū)域,可以以多重拷貝或任一方向存在;共有序列=GGGCGGgene鑒定為基因的生物學(xué)意義的區(qū)域,并已經(jīng)指定名稱iDNA間插DNA;通過幾種重組中的任何一種能被消退的DNAintron被轉(zhuǎn)錄的DNA區(qū)段,但通過同時(shí)剪接位于其兩側(cè)的序列(外顯子)即可從轉(zhuǎn)錄本內(nèi)部將其除去J_segment免疫球蛋白輕鏈和重鏈的連接區(qū)段,和T-細(xì)胞受體,和鏈LTR長(zhǎng)的末端重復(fù),在確定序列的兩端直接重復(fù)的序列, 類型典型地見于逆轉(zhuǎn)錄病毒中mat_peptide成熟的肽或蛋白質(zhì)的編碼

7、序列;翻譯后修飾之后成熟的或最終的肽或蛋白質(zhì)產(chǎn)物的編碼序列;位置不包括終止密碼子(與相應(yīng)的CDS不同)misc_binding不能用任何其它Binding關(guān)鍵詞(primer_bind或protein_bind)表述的與另一個(gè)組成成分共價(jià)或非-共價(jià)結(jié)合的核酸中的位點(diǎn)misc_difference特征序列與記載中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同關(guān)鍵詞(conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele或modified_base)表述misc_feature不能用任何其它的特征關(guān)鍵詞表述的具有生物學(xué)意義的區(qū)域;新的或少見的特征mis

8、c_recomb任何一般性的,位點(diǎn)特異性的或復(fù)制的重組大事的位點(diǎn),該位點(diǎn)中有不能用其它重組關(guān)鍵詞(iDNA和virion)或來源關(guān)鍵詞的修飾詞(/transposon,/proviral)表述的雙螺旋DNA的斷裂和愈合misc_RNA不能用其他RNA關(guān)鍵詞（prim_transcript,precursor_RNA,mRNA,5'clip,3'clip,5'UTR,3'UTR,exon,CDS, sig_peptide,transit_ _peptide,mat_peptide,intron,polyA_site,rRNA,tRNA,scRNA和snRNA)限定

9、的任何轉(zhuǎn)錄本或RNA產(chǎn)物misc_signal含有把握或轉(zhuǎn)變基因功能或表達(dá)之信號(hào)的任何區(qū)域,所述信號(hào)不能用其他Signal關(guān)鍵詞(promoter,CAAT_signal,TATA_signal,-35_signal,10_signal,GC_signal,RBS,polyA_signal,enhancer,attenuator,terminator,和rep_origin)表述misc_structure不能用其他Structure關(guān)鍵詞(stem_loop和D-loop)表述的任何二級(jí)或三級(jí)結(jié)構(gòu)或構(gòu)象modified_base被指示的核苷酸是經(jīng)修飾的核苷酸,并應(yīng)由被指示的分子(在mod_b

10、ase修飾詞意義中給出)所取代mRNA信使RNA；包括5'非翻譯區(qū)(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)和'非翻譯區(qū)（'UTR）mutation在此位置處，相關(guān)品系的序列中具有突然的，可遺傳的變化N_region在重排的免疫球蛋白區(qū)段之間插入的額外的核苷酸Old_sequence在此位置處，所表述的序列修改了此序列以前的版本PolyA_signal聚腺苷酸化之后內(nèi)切核酸酶裂解RNA轉(zhuǎn)錄本所必需的識(shí)別區(qū)域；共有序列AATAAAPolyA_siteRNA轉(zhuǎn)錄本上的位點(diǎn),通過轉(zhuǎn)錄后聚腺苷酸化該位點(diǎn)將被加上腺嘌呤殘基Precursor_RNA仍不是成熟的RNA產(chǎn)物的

11、任何RNA種類；可包括5'剪切區(qū)(5'clip)，5'非翻譯區(qū)(5'UTR)，編碼序列(CDS，外顯子)，間插序列（內(nèi)含子），3'非翻譯區(qū)（3'UTR）,和3'剪切區(qū)(3'clip)prim_transcript初級(jí)（最初的，未加工的）轉(zhuǎn)錄本；包括'剪切區(qū)（'clip）,'非翻譯區(qū)（'UTR）,編碼序列(CDS,外顯子),間插序列(內(nèi)含子),3'非翻譯區(qū)(3'UTR)和3'剪切區(qū)(3'clip)prim_bind起始復(fù)制,轉(zhuǎn)錄或逆轉(zhuǎn)錄的非共價(jià)的引物結(jié)合位點(diǎn);包括合成的

12、例如PCR引物元件的位點(diǎn)Promoter參與RNA聚合酶的結(jié)合以啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的DNA分子區(qū)域protein_bind核酸上非共價(jià)的蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)RBS核糖體結(jié)合位點(diǎn)repeat_region含有重復(fù)單位的基因組區(qū)域repeat_unit單個(gè)重復(fù)元件rep_origin復(fù)制起點(diǎn);復(fù)制核酸以得到兩個(gè)相同拷貝的起始位點(diǎn)RRNA成熟的核糖體RNA；將氨基酸裝配成蛋白質(zhì)的核糖核蛋白顆粒（核糖體）中的RNA成份S_region免疫球蛋白重鏈的開關(guān)區(qū)；它參與重鏈DNA的重排,導(dǎo)致來自相同B細(xì)胞的不同免疫球蛋白類的表達(dá)Satellite短的基本重復(fù)單位的很多串聯(lián)重復(fù)(相同或相關(guān)的);大多數(shù)具有的堿基組成或其它性質(zhì)

13、與基因組的一般水平不同,這使得它們與大部分(主帶)的基因組DNA分別開來ScRNA小的細(xì)胞質(zhì)RNA;幾個(gè)小的細(xì)胞質(zhì)分子中的任何一個(gè)存在于真核生物的細(xì)胞質(zhì)和（有時(shí)）核中sig_peptide信號(hào)肽編碼序列；被分泌的蛋白質(zhì)的末端結(jié)構(gòu)域的編碼序列；此結(jié)構(gòu)域涉及新生多肽與膜的結(jié)合；前導(dǎo)序列SnRNA小的核RNA；很多小的RNA種類中的任何一個(gè)都被局限于核中；幾個(gè)snRNA參與剪接或其它RNA加工反應(yīng)source鑒定序列中特定范圍的生物來源；此關(guān)鍵詞是強(qiáng)制性的；每一項(xiàng)至少要有一個(gè)跨越整個(gè)序列的單一來源關(guān)鍵詞；每個(gè)序列可允許有一個(gè)以上的來源關(guān)鍵詞stem_loop發(fā)卡結(jié)構(gòu)；由RNA或DNA單鏈的相鄰（反向

14、）互補(bǔ)序列之間的堿基一配對(duì)形成的雙螺旋區(qū)域STS序列標(biāo)記位點(diǎn)：表述基因組上作圖界標(biāo)并能通過PCR檢測(cè)的短的，單拷貝DNA序列；通過測(cè)定STS系列的次序即可作出圖譜的基因組區(qū)域TATA_signalTATA盒；Goldberg-Hogness盒；在每個(gè)真核生物RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄單位起點(diǎn)前約25bp處發(fā)覺的保守的富含AT的七聚體，它可能涉及使酶定位以正確地起始；共有序列TATA（或）（或）terminator或者位于轉(zhuǎn)錄本的末端或者與啟動(dòng)子區(qū)域相鄰的DNA序列，該序列可導(dǎo)致RNA聚合酶終止轉(zhuǎn)錄；也可以是阻抑蛋白的結(jié)合位點(diǎn)transit_peptide轉(zhuǎn)運(yùn)肽編碼序列；核編碼的細(xì)胞器蛋白質(zhì)末端結(jié)構(gòu)域的編

15、碼序列；此結(jié)構(gòu)域參與將蛋白質(zhì)翻譯后運(yùn)送到細(xì)胞器中tRNA成熟的轉(zhuǎn)移RNA,，小的RNA分子（7585個(gè)堿基長(zhǎng)），介導(dǎo)核酸序列翻譯成氨基酸序列unsure作者不能確定此區(qū)域的精確序列V_region免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)，和細(xì)胞受體，和鏈；編碼可變的氨基末端部分；可由Vsegment,D_segment,N_region和J_segment組成V_segment免疫球蛋白輕鏈和重鏈的可變區(qū)段，和T 細(xì)胞受體，和鏈；編碼大多數(shù)可變區(qū)（v_region）和前導(dǎo)肽的最終幾個(gè)氨基酸variation含有來自相同基因的穩(wěn)定突變的相關(guān)系列（例如RFLP，多態(tài)性等），在此（和可能其它）位置處所述相同基因

16、與被表述的不同3clip在加工過程中被切下的前體轉(zhuǎn)錄本3'端大部分區(qū)域3UTP不被翻譯成蛋白質(zhì)的成熟轉(zhuǎn)錄本的'末端區(qū)域（終止密碼子之后）5clip在加工過程中被切下的前體轉(zhuǎn)錄本'端大部分區(qū)域5UTP不被翻譯成蛋白質(zhì)的成熟轉(zhuǎn)錄本的'末端區(qū)域（起始密碼子之前）_ 10 _signalPribnow盒；細(xì)菌轉(zhuǎn)錄單位起點(diǎn)上游約10bp處的保守區(qū)域,它可能參與結(jié)合RNA聚合酶;共有序列=TatAaT_ 35 _signal細(xì)菌轉(zhuǎn)錄單位起點(diǎn)上游約35bp處的保守六聚體；共有序列=TTGACa或TGTTGACA與蛋白質(zhì)序列相關(guān)的特征關(guān)鍵詞表關(guān)鍵詞說明CONFLICT不同的論文

17、報(bào)道了不同的序列VARIANT作者報(bào)道存在序列變體VARSLIC由可選擇的剪接產(chǎn)生的序列變體的表述MUTAGEN經(jīng)試驗(yàn)操作已轉(zhuǎn)變的位點(diǎn)MOD_RES殘基的翻譯后修飾ACETYLATIONN末端或其它AMIDATION通常位于成熟的活性肽的C末端BLOCKED不能被測(cè)定的N或C末端封閉基團(tuán)FORMYLATIONN末端甲硫氨酸的GAMMA-CARBOXY-GLUTAMIC ACIDHYDROXYLATION天冬酰胺，天冬氨酸，脯氨酸或賴氨酸的METHYLATION通常為賴氨酸或精氨酸的PHOSPHORYLATION絲氨酸，蘇氨酸，酪氨酸，天冬氨酸或組氨酸的PYRROLIDONECARBOXYLIC

18、ACID已形成內(nèi)部環(huán)內(nèi)酰胺的N末端谷氨酸SULFATATION通常為酪氨酸的LIPID脂質(zhì)組成成分的共價(jià)結(jié)合MYRISTATE通過酰胺鍵與蛋白質(zhì)成熟形式的N末端甘氨酸殘基或內(nèi)部的賴氨酸殘基結(jié)合的豆蔻酸基團(tuán)PALMITATE通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基或通過酯鍵與絲氨酸或蘇氨酸殘基結(jié)合的棕櫚酸基團(tuán)FARNESYL通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基結(jié)合的法尼基GERANYL-GERANYL通過硫酯鍵與半胱氨酸殘基結(jié)合的香葉基香葉基基團(tuán)GPIANCHOR與蛋白質(zhì)成熟形式末端殘基的羧基相連的糖基磷脂酰肌醇（GPI）基團(tuán)NACYLDIGLYCERIDE原核生物脂蛋白成熟形式的N末端半胱氨酸，所述脂蛋白具有酰胺鍵聯(lián)的脂肪酸和通過酯鍵連接了兩個(gè)脂肪酸的甘油基DISULFID二硫鍵；“FROM”和“TO”終點(diǎn)表示通過一個(gè)鏈內(nèi)二硫鍵連接的兩個(gè)殘基；假如“FROM”和“TO”終點(diǎn)是完全相同的，則二硫鍵是鏈間鍵，而說明書領(lǐng)域示出交聯(lián)的性質(zhì)THIOLEST硫醇酯鍵；“FROM”和“TO”終點(diǎn)表示通過硫醇酯鍵連接的兩個(gè)殘基THIOETH硫醚鍵；“FROM”和“TO”終點(diǎn)表示通過硫醚鍵連接的兩個(gè)殘基CARBOHYD糖基化位點(diǎn)；碳水化物（假如已知）的性質(zhì)在說明書領(lǐng)域給出METAL金屬離子的結(jié)合位點(diǎn)；說明書領(lǐng)域示出金屬的性質(zhì)BIND